פרוטוקולים אלו מתארים כיצד לאפיין את הארגון ותפקוד החסימה של צמתקי מחיצה מקופלים באפיתל העוברי של דרוזופילה.
מאמר שיטה
פרוטוקולים אלו מתארים כיצד לאפיין את הארגון ותפקוד החסימה של צמתקי מחיצה מקופלים באפיתל העוברי של דרוזופילה.
מטרת הפרוטוקולים הללו היא להעריך את הארגון ותפקוד המחסום של צמתים מקפלים (pSJs) ברקמות אפיתל שמקורן באקטודרמלי של עוברי דרוזופילה. pSJ יוצר מחסום חוסם על הקרום הצידי של רקמות אקטודרמליות כולל האפידרמיס, בלוטות הרוק, קנה הנשימה והמעי האחורי, הדומה פונקציונלית לצומת ההדוק ברקמות החולייתנים. בדרוזופילה זוהו 30 חלבונים הנדרשים להיווצרות pSJs. חלבוני הליבה של pSJ ממוקמים בתחילה לאורך הממברנה הלטרלית אך מתעשרים בעוצמה באזור הצידי האפיקלי של הצומת, ממש בסיסי לצומת ההדבקות, בשלב 16 של העובר. בשלב המאוחר ה-15 של העובר, לרקמות אלו יש צומת חסימה מתפקדת לחלוטין. מאמר זה יתאר פרוטוקולי צביעת חיסון וחדירות צבע שניתן להשתמש בהם לחקירת הארגון והתפקוד של pSJ בעוברים נשלטים ועוברים מוטנטיים. שימוש מוצלח בפרוטוקולים אלו יכול לשמש להדגמת פונקציית החסימה של pSJs, ולבדוק האם גן לא ידוע מקודד רכיב מרכזי של המחבר.
תפקיד קריטי של רקמות אפיתל הוא להפריד אזורים מובחנים בתוך האורגניזם. יצירת סביבות ייחודיות אלו חיונית לתפקוד האיברים ולהגנה על האורגניזם מאיומים חיצוניים. הצומת החסימה שנוצרת בין תאי האפיתל אחראית להקמה ולשימור סביבות אלו על ידי מניעת זרימה פארא-תאית של מומסים בין הצד האפיקלי והבסיסי של האפיתל 1,2. אצל אורגניזמים של חולייתנים, הצומת החסימה נקראת החיבור הצמוד, בעוד שבחסרי חוליות כמו Drosophila melanogaster 1,3 היא מכונה צומת הספטה (SJ). ישנם שני סוגים של SJ בפרוקי רגליים, המובחנים על ידי התפלגות הרקמות שלהם ומבנה אולטרה-סטרוקטיבי4. צמתים ספטיים מקופלים (pSJs) נמצאים ברקמות שמקורן אקטודרמלית כגון האפידרמיס, בלוטות הרוק, קנה הנשימה והמעי האחורי. הם מאופיינים באופן אולטרסטרוקטוריאלי על ידי מערך דמוי סולם של חומר צפוף אלקטרונים במרחב החוץ-תאי בין התאים, שנמצא ממש בסיסי לצומת הדבקים 3,5. לעומת זאת, מחלקות ספט חלקות (sSJ) נמצאות ברקמות שמקורן אנדודרמלית כמו צינורות המעי האמצעי ומאלפיגיאן, ואינם מראים ספטות צפופות אלקטרונים בין תאים6.
מחקרים גנטיים בדרוזופילה זיהו 30 חלבונים הנדרשים למבנה ולתפקוד של pSJ וזיהו חלבונים נוספים השוהים בצומת אך לא נראה שיש להם תפקיד בהקמה או בתחזוקתם (נבדקב-7). מהניתוחים הללו, מדענים חילקו חלבוני SJ לשלוש קטגוריות. חלבוני הליבה של SJ נמצאים בצומת ונדרשים להקמה ותחזוקה של החיבור. שבעה עשר חלבונים זוהו כחלבוני ליבת pSJ, כולל Coracle (Cora), Neurexin IV, Macroglobulin-Complement-related (Mcr), Kune-kune ו-ATPase alpha 8,9,10,11,12. תשעה חלבונים זוהו כחלבוני pSJ נלווים הנדרשים להקמה ו/או לתחזוקה של המחבר, אך אינם בהכרח שוכנים בצומת. מחלקה זו כוללת חלבונים כמו Rab5, Rab11 ו-Coiled 13,14. לבסוף, חלבוני ה-pSJ מתמקמים ב-pSJ אך ניתנים להחלפה להקמה ותחזוקה של הצומת. דוגמאות לארבעת חברי הקבוצה כוללות את Discs Large ו-Fasciclin III15,16.
הקמת pSJ שלם פונקציונלית היא תהליך רב-שלבי שמתחיל באמצע העובר כאשר כל חלבוני הליבה של pSJ מתבטאים במלואם. חלק מהגנים המרכזיים של pSJ מתבטאים באופן אימהי, אך כולם מראים ביטוי זיגוטי חזק בשלב12-17. בשלב 12, חלבוני הליבה של pSJ מתמקמים לאורך כל הממברנה הלטרלית. בשלבים 13-16, חלבוני הליבה של pSJ עוברים אנדוציטוזה ואז ממוחזרים חזרה לממברנה הצדדית באזור ה-pSJ. תהליך זה דורש חלבוני עזר של pSJ, כולל Rab5 ו-Rab1114. בשלב 16, חלבוני הליבה של ה-pSJ ממוקמים באופן הדוק באזור ה-pSJ לאורך הממברנה הצדדית. בהתאם לתצפיות אלו, פונקציית החסימה המלאה של החיבור מתרחשת בשלב המאוחר 15 של העובר12. הדבר מוצג בצורה הטובה ביותר באמצעות בדיקת חדירות צבע. לפני יצירת הצומת, חרוז דקסטרן של 10 קילו-דלטון המסומן בסמן פלואורסצנטי כמו רודאמין יכול לעבור דרך המרחב הפרתאלי בין התאים. אם הדקסטרון המסומן מוזרק לתוך ההמוקול, הוא יצטבר במהירות אל הלומן של אפיתל צינורי כגון קנה הנשימה, בלוטת הרוק והמעי האחורי. לאחר שה-pSJ מתוח פיזיולוגית בסוף שלב 15, הדקסטרון המוזרק מוגבל לצד הבסיסי של האפיתל ואינו יכול להצטבר בלומן (התחום האפיקלי) של איברים אלו.
חלבוני pSJ ליבה חולקים תכונה אופיינית שבה כל חלבון pSJ ליבה דורש נוכחות של כל שאר חלבוני הליבה pSJ למיקום תת-תאינכון 18,19. תלות זו ביצירת pSJ היא תכונה מגדירה של חלבוני הליבה של pSJ והיא הבסיס לפרוטוקולים המוצגים במאמר זה. מוטציות בגנים הליבה או העזר של pSJ מובילות לקטלניות עוברית ומאופיינות במיקום לא נכון של חלבוני pSJ ליבה אחרים לאורך הממברנה הלטרלית בעוברים בשלב 16, במקום להיות ממוקמים בצפיפות באזור האפיקלי הטבעי שלהם. לעומת זאת, מוטציות בגנים תושבי pSJ אינן מובילות לאי-מיקום של חלבוני הליבה של pSJ15. ההפרעה התפקודית של ה-pSJ במוטציות הגנטיות הליבתיות והנלוות של ה-pSJ מתגלה על ידי הצטברות דקסטרון מסומן של 10 kDa בלומן של קנה הנשימה, בלוטות הרוק או המעיים האחוריים בעוברים מוטנטים בשלב 16 או 17. לבסוף, המאפיין המבדיל בין חלבון ליבה לחלבון pSJ משני הוא המיקום התת-תאי שלהם. חלבוני הליבה של pSJ קשורים באופן הדוק ל-pSJ לאחר היווצרותם, בעוד שחלבוני pSJ משניים קריטיים להרכבת החיבור אך אינם בהכרח שוכנים בצומת. הדוגמאות הטובות ביותר לחלבוני pSJ משניים הן Rab5 ו-Rab11. שניהם חלבונים ציטופלזמיים המסייעים בהעברת מטען מממברנת הפלזמה לאנדוזומים מוקדמים וממחזרים את האנדוזומים ואז חזרה לממברנתהפלזמה 14. כדי להבחין האם חלבון pSJ פוטנציאלי חדש הוא רכיב ליבה או חלבון משני, בדרך כלל מועיל ליצור נוגדן ספציפי או לבטא חלבון רקומביננטי מסומן פלואורסצנטית, כדי לקבוע היכן חלבונים אלו מתמקמים בנקודות שונות בתהליך הבשלת ה-pSJ.
מטרת הפרוטוקולים הללו היא להבחין באופן חד-משמעי בין חלבוני pSJ פוטנציאליים לבין חלבוני pSJ המקומיים. מספר מחקרים חשפו תפקידים נוספים שאינם אוקלאודיים לחלבוני pSJ במהלך ההתפתחות, כולל תפקידים במורפוגנזה ובקוטביות האפיקלית-בסיסית 17,20,21,22. ככל שהעניין בביולוגיה של pSJ גובר ויותר חלבוני pSJ פוטנציאליים מזוהים, הפרוטוקולים הפשוטים והקלים לפרשנות המוצגים כאן יסייעו לחוקרים לאפיין נכון את ארגון ה-pSJ ואת פונקציות החסימה של חלבונים אלה. בספרות תוארו גישות ניסיוניות נוספות רבות לאפיון חלבוני pSJ, כולל התאוששות פלואורסצנציה לאחר הלבנה (FRAP) ומיקרוסקופיית אלקטרוני העברה 6,23. למרות שגישות אלו לעיתים קרובות מאוד שימושיות, מבחן הצבעה החיסונית המוצגת כאן מספק המחשה מהירה של מיקום חלבוני pSJ ללא שיטות אולטרה-מבניות יקרות וגוזלות זמן, בעוד שבדיקת חדירות הצבע מציעה קריאה פונקציונלית של שלמות ה-pSJ שאינה ניתנת להשגה באמצעות הדמיה בלבד. בנוסף, ניתן לבצע בדיקות אלו באמצעות ציוד מעבדה סטנדרטי כגון מיקרוסקופ פלואורסצנציה איכותי ומערכת מיקרו-הזרקה בסיסית. יש לציין כי בדיקות אלו מותאמות לניתוח עוברי דרוזופילה שלב 16 ואינן מתאימות להערכת ארגון או תפקוד של sSJs.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. הבמה של עוברים
2. קיבוע וצביעת חיסון של עוברים
3. הדמיה וניתוח נתונים של עוברים עם צבעי חיסון
4. הכנה להזרקת צבע
5. הרכבת עוברים והזרקת צבע
6. דימות וניתוח נתונים
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הפרוטוקולים המוצגים כאן משמשים לחקר ארגון ותפקוד pSJ ברקמות אקטודרמליות בעוברי דרוזופילה בשלב 16. פרוטוקולים אלו חלים רק על pSJ ואינם יכולים לשמש לחקירת sSJs. מוטציה בגן שגורמת לכישלון למקם חלבוני pSJ אחרים באזור ה-pSJ בעוברים בשלב 16 וליצור צומת חסימה בשלב 16 היא או בגן הליבה של pSJ או בגן pSJ משני. ההבדל העיקרי בין השניים הוא האם החלבון המקודד ממוקם תת-תאית ל-pSJ לאחר שנוצר צומת פונקציונלי בעוברים מסוג פראי. במקרה כזה, החלבון יסווג כחלבון pSJ ליבה. כדי להדגים עיקרון זה, אנו מראים תחילה...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כאן אנו מציגים פרוטוקול לזיהוי חלבוני pSJ ליבה ועזר באמצעות שני בדיקות פשוטות יחסית שניתן לבצע במעבדות צנועות עם יכולות מיקרוסקופ פלואורסצנטי. המבחן הראשון בוחן את הארגון המולקולרי של ה-pSJ באפיתל מקוטב בוגרים באמצעות הדמיה קונפוקלית של עוברים מוטנטים קבועים. הבדיקה השנייה בודקת את שלמות פונקציית החסימה של ה-pSJ על ידי הזרקת מולקולות דקסטרן מסומנות בצבע של 10 kDa לעוברים חיים בשלב 16. הפשטות של הפרוטוקולים הללו והעובדה שפגם בארגון ובפונקציה של pSJ הוא אבחנתי מלא למוטציות הליבה והנלוות, ה...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי עניינים לחשוף.
אנו מודים למרכז המלאי לדרוזופילה של בלומינגטון על הסטודנטים שבהם השתמשו במחקר זה. אנו מודים לבנק Developmental Studies Hybridoma על הנוגדנים ששימשו במחקר. אנו גם מודים למחלקה לביולוגיה באוניברסיטת קייס ווסטרן ריזרב על השימוש בסטריאוסקופ הפלואורסצנציה Leica MZ10F שלהם לגנוטיפינג ובשלב של עוברים לדיסקציה ולמיקרוסקופ הפלואורסצנציה ההפוכה DMi8 לניסויי הזרקת צבע. אנו מודים להלן זלץ, פרופסור לגנטיקה ומדעי הגנום, בית הספר לרפואה של CWRU, על סיפוק המיקרומניפולטור ועל ששלפה כמה מהמחטים ששימשו בניסוי הזרקת הצבע שהוצג במחקר זה. הפרויקט נתמך על ידי מענק מקרן המדע הלאומית (IOS 2111069) ל-REW.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צינור קפילרי למחטים (Boro 1 X 0.5/סיבים) | FHC | 30-30-1 | |
| מיקרוסקופ קונפוקלי | לייקה | Stellaris 5 | |
| זכוכית כיסוי 22 x 22 עובי להזרקות | פישר סיינטיפיק | 12-540-B | |
| זכוכית כיסוי בגודל 22 על 30 בעובי 1.5 לצילום | קורנינג | 2980-233 | |
| צינור תרבית לצביעת חיסון (6 x 50 מ"מ) | פישר סיינטיפיק | 14-958-A | |
| כלוב איסוף עוברים | ג'נסי סיינטיפיק | 59-100 | |
| סטריאומיקרוסקופ פלואורסצנטי | לייקה | MZ10 F | |
| נפט הלוקרבון (700) | ג'נסי סיינטיפיק | 59-131 | |
| הפטן | פישר סיינטיפיק | H350-4 | |
| מיקרוסקופ פלואורסצנציה הפוך | לייקה | DMi8 | |
| סלסלות רשת לפרק עוברים | ג'נסי סיינטיפיק | 46-101 | |
| מתנול | פישר סיינטיפיק | A412-4 | |
| מיקרומניפולטור | נארישיגה | MN151 | |
| שקופיות מיקרוסקופ | פישר סיינטיפיק | 12-544-2 | |
| מושך מחט | כלי דיוויד קופף | דגם 720 | |
| סרום חמור רגיל | ג'קסון אימונו-רסיירץ' | 017-000-121 | |
| רשת ניילון (120 מיקרומטר) | ג'נסי סיינטיפיק | 57-102 | |
| עדשת אובייקטיבית HC PL FLUOTR 10X/0.32 PH 1 | לייקה | 11506537 | |
| עדשת אובייקטיבית HC PL APO 10x/0.40 CS2 | לייקה | 15506407 | |
| עדשת אובייקטיבית HC PL APO 40x/1.30 CS2 | לייקה | 15506358 | |
| לוחות פטרי בגודל 60 x 15 מ"מ | קורנינג | 351007 | |
| נדנד פלטפורמה | גלוב סיינטיפיק | GTR-FS | |
| נוגדן ראשוני (קורקל) | DSHB | C566.9 | |
| נוגדן ראשוני (קורקל) | DSHB | C615.16 | |
| נוגדן ראשוני (E cadherin) | DSHB | DCAD2 | |
| נוגדן ראשוני (Mcr) | מעבדת מחלקה, CWRU | הפוליקלונל של חזיר הים | |
| רודאמין מסומן דקסטרן של 10 קילו-דלטון | גשושיות מולקולריות | D1824 | |
| נוגדן משני (אנטי-חזיר חמור Cy3) | ג'קסון אימונו-רסיירץ' | 706-165-148 | |
| נוגדן משני (אנטי-עכבר לחמור Cy2) | ג'קסון אימונו-רסיירץ' | 715-225-151 | |
| נוגדן משני (Cy5 נגד עכברוש לחמור) | ג'קסון אימונו-רסיירץ' | 712-175-150 | |
| שייקר שולחן | ניו ברונסוויק סיינטיפיק | רעידת פלטפורמה C2 | |
| טגוספט (מתיל 4-הידרוקסיבנזואאט) | TCI | H0216 | |
| טריטון X-100 | פישר סיינטיפיק | BP151500 | |
| בקבוקים לקיבוע (20 מ"ל בקבוקוני נוזל סינטילציה של WHEATON) | פישר סיינטיפיק | 03-341-73C | |
| Whatman 3MM נייר כרומטוגרפיה | פישר סיינטיפיק | 05-716-6H | |
| <מניות חזקות>זבובים | <חזק>גנוטיפ מלא | <חזק>מספר מניות | <חזק>מקור |
| COR4 | w*; P{neoFRT}43D cora4/CyO | 52232 | BDSC |
| W1118 | w[1118] | 5905 | BDSC |
| <חזק>פתרון | <חזק>מתכון | ||
| 10x PBS | מערבבים 90 גרם NaCl, 20 גרם Na2HPO4, ו-8.3 גרם NaH2PO4.H2O ו-dH20 ל-1L. לסנן את הסינון. מדלל ל-1X עם dH2O לשלבים של שטיפה בצביעת חיסונים. | ||
| 10% פתרון טריטון X-100 | מערבבים 1 מ"ל טריטון X-100 עם 9 מ"ל dH2O על נדנדה בפלטפורמה עד להמיסה. אחסן בטמפרטורת החדר. | ||
| 50% אקונומיקה | ערבבו 10 מ"ל אקונומיקה מסחרית (7.5% נתרן היפוכלוריט) עם 10 מ"ל מים לפני דקוריון עוברים. | ||
| צלחות מיץ תפוחים | להרתיח 15 גרם אגר דרוזופילה ב-725 מ"ל dH2O. הוסיפו 25 גרם סוכר ו-250 מ"ל מיץ תפוחים וערבבו עד שמתערבבים. תן לתמיסה להתקרר ל-55 מעלות צלזיוס ואז להוסיף 1.3 גרם טגוספט ולערבב בעדינות. שופכים לפלטות פטרי בגודל 60 על 15 ותנו להתקרר. חנות ב-4C. | ||
| פתרון חסימה | מערבבים 9.8 מ"ל של 1X PBS עם 100 אול של 10% טריטון X-100 ו-100 אולם של סרום נורמלי דונקי בצינור קוני של 15. | ||
| תמיסת שטיפת עוברים | הכינו 10X תמיסת שטיפת עובר על ידי ערבוב 70 גרם NaCl ו-2 מ"ל טריטון X-100 ל-1 ליטר dH2O. מדלל ל-1X עם dH2O לתמיסה עובדת. | ||
| תיקון | חממו מראש 10 מ"ל של 1X PBS במיקרוגל. הוסף 0.4 גרם ו-nbsp; של פאראפורמלדהיד ופיפט לערבוב. הוסיפו 10 אולטר של 14N NaOH כדי להאיץ את ההתמוססות. הנח על בלוק חום של 90 מעלות עד שהוא נמס. ברגע שאין פאראפורמלדהיד מוצק, הוסף 10 אולטר של 14N HCL כדי לכוון את ה-pH לנייטרלי. תמיד כדאי ללבוש חלוק מעבדה, כפפות וגוגל כשמשתמשים בפארפורמלדהיד. | ||
| מדיית הרכבה | מערבבים 9 מ"ל גליצרול ו-1 מ"ל של בסיס 1M Tris pH 8.0. הוסף 0.05 גרם n-פרופיל-גלאט, מערבבים וחממים כדי להמיס. Aliquot 0.5 מ"ל לתוך צינורות אפנדורף. | ||
| תמיסת רודמין דקסטרן | הכינו תמיסת צבע טרייה על ידי המסה של 10 kDa דקסטרן מסומן ברודמין ל-1 מ"ג/מ"ל ב-0.5M נתרן פוספט, pH 7.5 ו-5 מילימטר אשלגן כלוריד. | ||
| משחת שמרים | ערבבו 50 גרם שמרים מסחריים (כוכב אדום) עם קמצוץ סוכרוז וכמות מים מספקת להכנת משחה סמה. חנות ב-4C. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה