פוטומטריית סיבים היא אחת הטכניקות הנפוצות ביותר לתיעוד פעילות סידן באוכלוסיות עצביות במוח העמוק. כאן, אנו מתארים פרוטוקול להדמיה דו-צבעונית רב-אתרית מותאמת אישית של פעילות סידן ואותות פלואורסצנטיים דינמיים אחרים מאוכלוסיות עצביות במוח העמוק בעכברים.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
פוטומטריית סיבים היא אחת הטכניקות הנפוצות ביותר לתיעוד פעילות סידן באוכלוסיות עצביות במוח העמוק. כאן, אנו מתארים פרוטוקול להדמיה דו-צבעונית רב-אתרית מותאמת אישית של פעילות סידן ואותות פלואורסצנטיים דינמיים אחרים מאוכלוסיות עצביות במוח העמוק בעכברים.
פוטומטריה סיבית, הקלטה נרחבת של אותות דרך כבל סיב אופטי, היא שיטה שימושית לרישום פעילות סידן מקבוצות נוירונים במכרסם הנע בחופשיות. במיוחד, שיטה זו הופכת את המיקוד באוכלוסיות קטנות של נוירונים גנטיים באזורים גחניים ופחות נגישים במוח לבעיה ניתנת לפתרון, שכן עדיין קשה לתעד ברזולוציה תאית. טכניקה זו יכולה להיות מורחבת להקלטה ממספר אתרים בו-זמנית באמצעות גישה מרובת סיבים משולבת, ויכולה למקד סוגי תאים מרובים באמצעות אסטרטגיות גנטיות בכל אתר מתועד. כאן, אנו מספקים פרוטוקול לבניית והכנסת מערכי רב-סיבים מותאמים אישית למיקוד ברשת ההתנהגות החברתית של העכבר (עד 12 אתרים). פרוטוקול זה מפרט את ההליכים הכירורגיים הנדרשים למיקוד מוצלח של אתרים מרובים באמצעות מערכי רב-סיבים מותאמים אישית שלנו והגישה הוויראלית להעברת אינדיקטורים פלואורסצנטיים ירוקים ואדומים של פעילות סידן להדמיה סימולטנית של שתי אוכלוסיות עצביות מזוהות גנטית בכל אתר. אנו מראים כיצד להקליט מאזורים אלו באמצעות מערכת מצלמת CMOS (CMOS) הזמינה מסחרית במהלך התנהגות חברתית. בנוסף, פרוטוקול זה מדגים שיטות לבקרת איכות ומפרט צינור עיבוד מקדים לתיקון רעש ותקנון. לבסוף, נדון ביישומים פוטנציאליים של הכלי כדי לחשוף ממצאים חדשים על רשתות מוח בקנה מידה גדול.
פוטומטריית סיבים, ההקלטה המונית של אותות פלואורסצנטיים באמצעות כבלי סיבים אופטיים, הפכה לטכניקה עוצמתית למדידת פעילות אוכלוסיות עצבית באזורים עמוקי המוח. לעיתים קרובות, אזורים אלו אינם נגישים בקלות באמצעות מיקרואנדוסקופיה או גישות אלקטרופיזיולוגיות מסורתיות 1,2,3. מטרה מרכזית במדעי המוח המערכתיים העכשוויים היא לזהות ולפענח את החישובים המשמשים רשתות מוח בקנה מידה גדול, ספציפי לסוגי תאים, המעורבות ביצירת התנהגות. גשושי נוירופיקסל וטבעות רב-סיבים מסחריות מצטיינים בהקלטה מאוכלוסיות עצביות מיושרות ליניארית 4,5,6,7, בעוד שהדמיה קורטיקלית רחבת שדה מספקת כיסוי מצוין של דינמיקת הקורטקס השטחית 8,9. עם זאת, הקלטה בו-זמנית מאוכלוסיות עצביות תת-קורטיקליות מפוזרות במרחב אך מחוברות פונקציונלית נותרה מאתגרת טכנית 5,10,11,12. יתרה מזאת, בעוד שניתן למקד מבנים רבים במוח העמוק באמצעות מספר פרולים חד-סיביים לפוטומטריה, גישה זו מוגבלת לאוכלוסיות עצביות המרוחקות מספיק זו מזו כדי להשתיל מספר פרולים12. מערכי פוטומטריה מולטי-סיבים מותאמים אישית מתמודדים עם פער זה על ידי אפשרות הקלטות סימולטניות מאזורים תת-קורטיקליים רבים בבעלי חיים חופשיים עם מגבלות מינימליות, ומספקים חלון ייחודי לתיאום ברמת הרשת במהלך התנהגויות מורכבות.
רשת ההתנהגות החברתית (SBN) מייצגת מערכת אידיאלית לחקירת דינמיקות רשתות מוח בקנה מידה גדול. ה-SBN הוא מערך מבנים תת-קורטיקליים, מחובר ומשומר אבולוציונית, המעורבים ביצירת התנהגות חברתית, אשר זוהה בכל מחלקות החולייתנים 13,14,15. מבנים אלו כוללים, אך לא מוגבלים ל, המחיצה הצדדית, האזור הפרה-אופטי, גרעין המיטה של הסטריה טרמינליס, גרעיני ההיפותלמוס הקדמיים והוונטרומדיאליים, האמיגדלה המדיאלית, הגרעין אקומבנס, והאפור הפריאקוודוקטלי 13,14,15. בתוך SBN, אוכלוסיות עצביות ספציפיות המוגדרות על ידי סמנים מולקולריים ממלאות תפקידים קריטיים בוויסות התנהגות חברתית. נוירונים SBN ɣ-אמינובוטיריק חומצה-ארגיים (GABAergic) (המסומנים על ידי ביטוי של מוביל GABA הוזיקולרי, או VGAT) ונוירונים גלוטמטרגיים (המסומנים על ידי ביטוי של מוביל הגלוטמט הוזיקולרי, או VGlut) מייצגים את סוגי התאים המעוררים והמעכבים העיקריים ברשת וסביר שהם ממלאים תפקידים דיסוציאליים בוויסות הפעולה החברתית 16,17,18,19 . מעבר למערכות הנוירוטרנסמיטרים הקלאסיות הללו, איתות הורמוני המין ממלא תפקיד קריטי בתפקוד הרשת. לדוגמה, התנהגויות חברתיות רבות של גברים ונשים דורשות ביטוי של קולטני אסטרוגן אלפא, ופעילות בנוירוני SBN המבטאים קולטנים אלה מניעה באופן סיבתי את ההתנהגויותהללו 16,20,21,22,23,24,25,26 . בנוסף, אוכלוסיות עצביות SBN מועשרות בליגנדים וקולטנים של מערכות נוירומודולטוריות רבות, כולל דופמין, ארגינין וזופרסין, אוקסיטוצין, אופיאטים, טאכיקינין, נוירופפטיד Y, פרולקטין, אורקסין, פפטיד הקשור לאגוטי, מלנוקורטינים, קיספפטין והורמון משחרר גונדוטרופין 17,18,19,27,28,29,30,31, והתקדמות אחרונה בחיישנים מקודדים גנטית מאפשרת כיום מעקב אחר רבות מהמולקולות המגוונות הללו 32,33,34,35,36,37,38. מכיוון שאוכלוסיות העצבים של SBN מפוזרות במרחב במבנים תת-קורטיקליים, הכנות ניסיוניות מסורתיות (למשל, אלקטרופיזיולוגיה חוץ-תאית, דימות פני שטח קורטיקלי, וגישות מוקדמות יותר לפוטומטריה רב-סיבית) אינן מצליחות ללכוד את דינמיקת הפעילות הרגעית ברשת המוח הרחבה הזו. עם זאת, על ידי ניטור דינמיקת סידן באוכלוסיות עצביות מוגדרות גנטית לצד דפוסי שחרור נוירומודולטורים, פלטפורמות פוטומטריה רב-אתרים מותאמות אישית יכולות לחשוף אילו סוגי תאים ומולקולות איתות ספציפיים מקודדים תכונות מסוימות של התנהגות חברתית, ולספק תובנות מכניות חדשניות.
כאן פיתחנו פלטפורמה מותאמת אישית לפוטומטריית סיבים דו-צבעונית, שמאפשרת הקלטה סימולטנית מ-12 אזורי מוח בעכברים הפועלים בחופשיות. באמצעות גישה זו, ביצענו הקלטות פוטומטריה דו-צבעוניות של פעילות סידן מ-22 אוכלוסיות עצביות מזוהות, המפוזרות על פני 11 אזורי מוח SBN, לצד מדידות של תנודות דופמין בגרעין האקומבנס באמצעות חיישן DA מבוסס הפעלה GPCR (GRAB-DA1m)33 (טבלה 1). פרוטוקול זה (איור 1) מפרט את בניית מערכי מולטיפייבר מותאמים אישית, הליכים כירורגיים למיקוד באתרים מרובים במוח העמוק, אסטרטגיות העברת וירוס לביטוי אינדיקטורים כפולים של סידן (GCaMP39 ו-RCaMP40), איסוף נתונים באמצעות מערכת פוטומטריה סיבים מבוססת מצלמת CMOS מסחרית, שיטות בקרת איכות, וצינור עיבוד מוקדם לתיקון רעש וסטנדרטיזציה של אותות. חשוב לציין, צינור הקדם-עיבוד שלנו כולל הקלטות בקרה איזוסבסטיות באורכי גל שמאפשרות לנו לבצע תיקון ארטיפקטים בתנועה. אנו נוקטים בגישה מבוססת רגרסיה41 לתיקון ארטיפקטים בתנועה, תוך הבטחת נאמנות האות במהלך התנהגויות חברתיות נמרצות כמו רכיבה או קרבות. מכיוון ששיטת הפוטומטריה הרב-סיבית המותאמת שלנו יכולה בו-זמנית לנטר פעילות המפוזרת הן במבנים פרוקסימליים והן במבני מוח עמוק רחוקים, תוך שמירה על ספציפיות סוג התא של ההקלטות באמצעות מיקוד גנטי42,43, היא מציעה יתרונות משמעותיים על פני גישות חלופיות לתיעוד דינמיקת פעילות עצבית ברשתות מוח עמוקות בקנה מידה גדול.
פרוטוקול זה מתאים באופן מיטבי לניסויים הדורשים הקלטות סימולטניות מאזורים תת-קורטיקליים מפוזרים במרחב (≥4 אתרים) בבעלי חיים חופשיים, במיוחד כאשר חוקרים דינמיקה ברמת רשת בין סוגי תאים מוגדרים גנטית או מעקב אחר שחרור נוירומודולטורים לצד פעילות עצבית. הגישה חשובה במיוחד ללימוד התנהגויות טבעיות הכוללות תנועה נמרצת (למשל, אינטראקציות חברתיות), שבהן צינור תיקון פריטי התנועה שלנו מבטיח נאמנות אות. עם זאת, חוקרים המחפשים רזולוציה של תא יחיד, הבחנה בין אותות סומטיים לאקסונליים, או הקלטות מאזורים קורטיקליים שטחיים עשויים למצוא גישות חלופיות (למשל, מיקרוסקופיה מיניאטורית, נוירופיקסלים או הדמיה רחבת שדה) מתאימות יותר. שיקולים מעשיים מרכזיים כוללים מורכבות ניתוחית, הצורך בייצור מערך רב-סיבים מותאם אישית, והקמת תשתית חומרים נדרשת (יכולות הדפסה תלת-ממדית, כלי סיבים אופטיים).
הערה: פרוטוקול זה נבדק ואומת באמצעות עכברים בוגרים בגילאי 8–25 שבועות. העכברים אוחסנו בטמפרטורה של 21–26 מעלות צלזיוס ולחות של 30%-70% במחזור אור כהה-אור הפוך של 12 שעות (כיבוי: 10:00 בבוקר; ON: 22:00). הניסויים התקיימו אך ורק במהלך השלב הפעיל הסובייקטיבי (האפל). אוכל ומים סופקו בחופשיות. כל ההליכים לבעלי חיים אושרו על ידי ועדת הטיפול והשימוש בבעלי חיים של אוניברסיטת פרינסטון והיו בהתאם לסטנדרטים של המכונים הלאומיים לבריאות.
1. מערך רב-סיבים וייצור חוטי פאץ' (איור 1A)

2. ניתוח (איור 1B)
3. הדמיית סידן רב-אזורית, דו-צבעונית (איור 1C)
4. עיבוד נתונים (איור 1D, קובץ משלים 9)


כדי להקליט בו-זמנית עד 12 אזורי מוח של SBN, בנינו מערך רב-סיבים מותאם אישית בהתאם לפרוטוקול הנ״ל. לאחר ההחלמה מהניתוח, העכברים נרשמו במהלך אינטראקציה חברתית (איור 5). בכל הניסויים, עכברים זכרים שנבדקו ב-CD1 הורשו לקיים אינטראקציה עם עכברי Balb/c זכרים בכלוב הבית שלהם. השתמשנו בעכברי Vgat-Cre לביטוי jRCaMP1b40 בנוירונים GABAergic באופן תלוי Cre ב-11 אזורי SBN במוח, GCaMP6f39 בתאים שאינם GABAergic באופן ללא Cre,45 באזורים באותם אזורים במוח, ו-GRAB-DA1m33 ב-Nucleus accumbens42 (טבלה 1). אישור היסטולוגי של מיקוד סיבים ניתן למצוא בפרסומים הקודמים שלנו42,43. כאן ניסינו לבדוק את ביצועי שיטות שונות לתיקון ארטיפקטים בתנועה. באופן ספציפי, השווינו את היעילות של שימוש: (1) מסנן חציוני בלבד; (2) רגרסיית לאסו עם רגולריזציה L1 באמצעות אותות איזוסבסטיים של אותו סיב בלבד (גישת מנבא יחיד) 11 ו-(3) רגרסיית לאסו באמצעות אותות איזוסבסטיים מכל הסיבים כמנבאים (גישה מרובת מנבאים) 41,42 (איור 4A). חשוב לציין כי שיטות מבוססות לאסו מתקנות את האות הגולמי באמצעות אות פלואורסצנטי בלתי תלוי בפעילות שנוצר בתגובה לנורית LED בתדר איזוסבסטי (415 ננומטר), בעוד שהחלקת מסנן חציונית אינה מתחשבת באות הבלתי תלוי בפעילות.
הערכנו תיקון תנועה באמצעות שני מדדים שונים: רעש בתדר גבוה מוחלט ורעידות. רעש בתדר גבוה הוגדר כסטיית התקן של הנגזרת הראשונה של האות, המשקפת את עוצמת התנודות המהירות באות. ג'יטר הוגדר כמקדם השונות של נגזרת האות, המשקף את עוצמת השונות של האות בין פריימים לפריים ביחס לממוצע הנגזרת של האות. מצאנו ששתי הגישות המבוססות על לאסו (מנבא יחיד ומנבא מרובי) עקפו משמעותית את מסנן החציון בהפחתת רעש בתדר גבוה וגם ג'יטר, כאשר תיקון רב-מנבא עלה במעט על תיקון מנבא יחיד (איור 4C–D; רעש בתדר גבוה, n=414 עבור 23 אותות ב-18 מפגשי הקלטה: בדיקת Kruskal-Wallis, H = 501.9420, p < 0.001; מבחני Mann-Whitney U לאחר הוק עם תיקון בונפרוני: רגרסיה מוחלקת לעומת רגרסיה באתר יחיד ***p < 0.001, רגרסיה חלקה מול רב-אתרית***p < 0.001, אתר יחיד מול ריבוי אתרים **p = 0.0073; ג'יטר: מבחן קרוסקאל-ווליס, H = 495.6685, עמוד < 0.001; בדיקות Mann-Whitney U לאחר הוק עם תיקון בונפרוני: רגרסיה מוחלקת לעומת רגרסיה באתר יחיד ***p < 0.001, רגרסיה מוחלקת מול רב-אתרים***p < 0.001, אתר יחיד מול ריבוי אתרים ***p = 0.0006). באופן ספציפי, הגישה של רב-מנבא (תוך שימוש בכל האיזוסבסטיים הסיבים) הראתה יתרונות לאותות ערוץ אדום (RCaMP): 5 מתוך 12 אותות אדומים הציגו רעש שאריתי נמוך משמעותית לעומת תיקון מנבא יחיד (n = 18 הקלטות לאזור). עבור ג'יטר, BNST (t-test, t = 5.42, ***p < 0.001), POA (t-test, t = 2.68, *p = 0.011), AH (t-test, t = 2.66, *p = 0.012), ו-PAG (מבחן Mann-Whitney U, U = 279, ***p < 0.001) הראו עליונות רב-חזאית. לרעש בתדר גבוה, BNST (מבחן Mann-Whitney U, U = 285, ***p < 0.001), POA (מבחן Mann-Whitney U, U = 292, ***p < 0.001), AH (t-test, t = 7.10, ***p < 0.001), PAG (t-test, t = 13.72, ***p < 0.001), ו-LHb (t-test, t = 5.47, ***p < 0.001) הראו עליונות רב-מחזיקים. אותות הערוץ הירוק (GCaMP) לא הראו הבדלים משמעותיים בין שתי גישות הלאסו בכל 12 האזורים עבור מדדי רעש של ג'יטר או תדר גבוה (כולם p>0.05, לרשימת הבדיקות הסטטיסטיות המלאה ראו טבלה 3). דבר זה מצביע על כך שבפוטומטריה דו-צבעית, שילוב מידע איזוסבסטי חוצה ערוצים משפר את תיקון התנועה לאותות אדומים, ככל הנראה משום שאיזוסבסטיקה בערוץ ירוק מספקת מידע תנועה נקי יותר. נתונים אלו מראים שתיקון ארטיפקטים בתנועה באמצעות שיטות רגרסיה מבוססות איזוסבסטיקה עולה משמעותית על גישות סינון פשוטות, כאשר רגרסיה רב-ערוצית מספקת יתרונות ייחודיים להקלטות דו-צבעוניות.

איור 1. הקלטה מרשת ההתנהגות החברתית באמצעות פוטומטריית סיבים דו-צבעונית רב-אתרית. (א) ייצוג סכמטי של אופן בניית מערך רב-סיבים. (ב) ייצוג סכמטי של תהליך הניתוח. (ג) ייצוג סכמטי של ניסויים בהדמיית סידן דו-צבעונית. (D) דוגמה לשימוש באות איזוסבסטי לחישוב אות מתוקן תנועה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 2. תמונות של הליכים מרכזיים לייצור וניתוח. (א) חבל פאץ' מיוצר מוכן לשימוש להקלטה. (B) מערך רב-סיבים הממוקם בתוך מחזיק סטריאוטקטי מותאם אישית עם מקדח בגודל 0.25 מ"מ x 5.5 מ"מ ממוקם מעל חור סיב. (ג) מערך רב-סיבים עם ניקוי כל חורי הסיבים ואגוזי משושה מודבקים פנימה. (ד) חיתוך סיב באמצעות כתב סיב. (ה) מערך רב-סיבים עם כל הסיבים מודבקים ומודבקים על דיסק ליטוש מותאם אישית. (ו) תצוגה מוגדלת של איך ליישר ולהבריג את מחבר הפצ'קורד למערך הרב-סיבים. (G) מערך רב-סיבי מובנה מלא עם פינים מודבקים במקומם. (H) עכבר מחובר למסגרת סטריאוטקטית עם חתך בקרקפת שנחשף את הגולגולת. (I) מערך רב-סיבים מיוצר המחובר למניפולטור הסטריאוטקטי כדי לתמרן את מערך הסיבים במהלך הניתוח. (J) מבט מוגדל של מערך הרב-סיבים שמוורד למוח. (K) מערך רב-סיבים מורד במלואו ומחובר לגולגולת עם מלט דנטלי. (L) מערך רב-סיבים על בעל חיים שמחובר היטב לכבל התיקון לפני ההקלטה. (M) תצוגה מורחבת של בעל חיים בכלוב עם כבל טלאים מחובר לפני ו/או במהלך ההקלטה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 3. הפרדה ספקטרלית. דוגמאות עקבות המדגימות חיתוך ספקטרלי מינימלי בין מדדי סידן. אותות GCaMP6f (כחולים) מראים הפעלה חזקה במהלך עירור של 470 ננומטר אך תגובה זניחה לגירוי של 560 ננומטר. אותות jRCaMP1b (אדום) מציגים דפוס הפוך עם הפעלה חזקה מ-560 ננומטר אך תגובה מינימלית להארה של 470 ננומטר. (א) אותות GCaMP6f ו-jRCaMP1b מוקלטים בו-זמנית עם תאורה של 470 ננומטר בלבד. (B) זהה ל-(a), אך עם תאורה של 560 ננומטר בלבד. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 4. השוואה בין שיטות שונות לעיבוד אותות רב-סיבים. (א) סכמטי המציג תיקון מבוסס רגרסיה רב-אתרית של אות פוטומטריה. גישה זו כוללת שלבי עיבוד עוקבים שבהם כל האותות האיזוסבסטיים הזמינים ב-415 ננומטר ממופים ליניארית לכל אות תלוי סידן. רכיבי התנועה החזויים מחסרים מהאות הזה כדי להפיק את הקריאה הסופית של הפעילות. אותות ΔF/F עם ציון z משני אותות עם נוכחות חזקה של ארטיפקטים תנועה. (B) מלמעלה למטה: אות איזוסבסטי מאותו סיב/ערוץ הדמיה המציג ארטיפקטים של תנועה, אות RCaMP מוחלק בלבד (משמאל) או GCaMP (ימין) (מסונן חציון, ירוק), אותו סיב/אות מתוקן רגרסיה בערוץ הדמיה (ציאן), אות מתוקן רגרסיה מרובה סיבים (כחול). (C) שמאל: ציון רעש בתדר גבוה ממוצע לכל אות מוקלט (n = 21 מפגשים). רעש בתדר גבוה מחושב כסטיית התקן של הנגזרת הראשונה של כל אות. ציוני רעש מוצגים עבור 1) אות מתוקן בסיס אך לא מתוקן (אפור), 2) אות מתוקן בסיסית וסינון חציוני (ורוד), 3) אות מתוקן ברגרסיה בסיסית וסיב יחיד עם החלקת סביצקי-גולאי (ציאן), ו-4) אות מתוקן רגרסיה בסיסית ורב-סיבים עם החלקת סביצקי-גולאי (כחול). מרכז: אחוז ממוצע של רעש שהוסר באמצעות רגרסיה של החלקה בלבד, סיב יחיד או רב-סיבי, מצטבר על כל 23 האותות. אחוז הרעש שהוסר מחושב כחלק מהרעש בתדר גבוה הנובע מתיקון ביחס לרמת הרעש הכוללת באות הגולמי המתוקן על בסיס הבסיס. הנתונים מדווחים כממוצע ± SEM (מבחן Kruskal-Wallis, H = 501.9420, p < 0.001; מבחני Mann-Whitney U לאחר הוק עם תיקון בונפרוני: רגרסיה מוחלקת מול אתר יחיד ***p < 0.001, רגרסיה מוחלקת מול רב-אתרי***p < 0.001, אתר יחיד לעומת ריבוי אתרים **p = 0.0073). מימין: אחוז האותות שבהם רעש בתדר גבוה שונה סטטיסטית לאחר תיקון מבוסס רגרסיה סיבי יחיד לעומת ריבוי סיבים, המופרדים לפי סוג האות. עבור כל אחד מ-23 האותות, רמות הרעש לאחר תיקון באתר יחיד הושוו לרמות רעש לאחר תיקון רב-אתרים, באמצעות בדיקות t עצמאיות (אם מחולקות בדרך כלל) או בדיקות Mann-Whitney U (חלופה לא-פרמטרית). מקטעים כחולים מציינים אותות שבהם תיקון ריבוי אתרים גרם לרעש נמוך משמעותית מתיקון באתר יחיד (p < 0.05). מקטעים אפורים מצביעים על אותות ללא הבדל משמעותי בין שיטות התיקון. מקטעי ציאן מצביעים על אותות שבהם תיקון באתר יחיד גרם לרעש נמוך משמעותית. E: Vgat- GCaMP6f. DA: תפוס-דה. I: Vgat+ jRCaMP1b. (D) זהה ל-(C) אך מציגה שונות מפריים לפריים (ג'יטר), מחושבת כנגזרת של מקדם השונות של כל אות (מבחן Kruskal-Wallis, H = 495.6685, p < 0.001; בדיקות Mann-Whitney U לאחר הוק עם תיקון בונפרוני: רגרסיה מוחלקת מול אתר יחיד ***p < 0.001, רגרסיה מוחלקת מול רב-אתרים***p < 0.001, אתר יחיד מול רב-אתרים ***p = 0.0006). לרשימה מלאה של בדיקות סטטיסטיות ותוצאות ראו טבלה 3. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 5. תצוגה מרובת אתרים של פוטומטריית סיבים דו-צבעית. אותות מייצגים ממספר סוגי מדדים שהוקלטו בו-זמנית במהלך התנהגות חברתית (בדיקת תושב-פולש, תקופת כניסת הפולש). עקבות מראים GCaMP6f (נוירונים Cre-שליליים) לא מנורמלים ולא מנותקים בבסיס אך לא מתוקנים בתנועה, jRCaMP1b (נוירונים GABAergic Vgat-Cre+), ו-GRAB-DA1m (חיישן דופמין בגרעין אקומבנס) באתרי רשתות התנהגות חברתית באותו בעל חיים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
טבלה 1. קואורדינטות וירוס ואורכי סיבים לכל אזור מוחי של רשת התנהגות חברתית ממוקדת. אנא לחצו כאן להורדת הטבלה הזו.
טבלה 2. השוואה בין שיטות תיקון חפצי תנועה לפוטומטריית סיבים רב-אתרים. עקרונות בסיסיים, מקרי שימוש אופטימליים, יתרונות ומגבלות של שיטות תיקון ארטיפקטים לתנועה הבאות: רגרסיה ליניארית פשוטה, רגרסיית לאסו עם רגולריזציה L1 (בגישת רב-מנבאים), מודלים גנרטיביים בייסיאניים, קנה מידה מבוסס תדר, וריבועים מינימליים משוקללים באופן איטרציוני. אנא לחצו כאן להורדת הטבלה הזו.
טבלה 3. פרטים ותוצאות המבחנים הסטטיסטיים ששימשו באיור 4. אנא לחצו כאן להורדת הטבלה הזו.
קובץ משלים 1. קובץ הדפסה תלת-ממדי עבור מחבר Patchcord.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ תיק משלים 2. 3D תיק הדפסה עבור מחבר Patchcord ללא חורים.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 3. 3D קובץ הדפסה עבור אביזר קידוח סטריאוטקטי.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 4. תכנית פוליש מותאמת אישית.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ 5. 3D דפוס משלים למערך פוטומטריה רב-אתרים המיועד ל-12 אתרי SBN.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 6. 3D קובץ הדפסה עבור מערך פוטומטריה מרובה אתרים ללא חורים שמכוונים לאתרים המכוונים אליו.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
תיק משלים 7. קובץ קונפיגורציה של DAQ עבור תוכנת DAQ.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 8. קובץ קידוד ויזואלי למערכת פוטומטריה.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 9. קוד פייתון המשמש בפרוטוקול שלב 4 ולהשוואות מתוקנות ארטיפקטים בתנועה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
פוטומטריית סיבים היא טכניקה שימושית וחסכונית לתיעוד פעילות סידן באוכלוסייה מאזורים עמוקים במוח או סוגי תאים ספציפיים בבעל חיים הנע בחופשיות3. הקלטה ממספר אזורים במוח בו זמנית מאפשרת למשתמש להשוות את הדינמיקות בין אזורים או הקרנות במהלך התנהגות טבעית או הכנות ראש-קבועות 5,7,12. כאן, אנו מפרטים שיטות להקליט בשני צבעים מעד 12 אזורי מוח ברחבי "רשת ההתנהגות החברתית" התת-קורטיקלית של המוח, באמצעות מערך סיבים מותאם אישית ומערכת מצלמה מסחרית. להלן נדון בצעדים קריטיים ביישום שיטה זו, שינויים אפשריים ואסטרטגיות פתרון תקלות, וחשיבותה וכן במגבלות ביחס לגישות הקיימות.
הפרוטוקול כולל שלושה שלבים עיקריים. ראשית, ייצור מערך רב-סיבים ו-patchcord דורש קידוח חלקים מותאמים אישית בהדפסה תלת-ממדית בקואורדינטות סטריאוטקטיות, ולאחר מכן הכנסת סיבים, ליטוש ובקרת איכות כדי להבטיח ≥75% יעילות העברת אור. יישור קידוח מדויק (סבילות ±0.03 מ"מ) וליטוש יסודי הם קריטיים. כשלים נפוצים כוללים יעילות העברת אור נמוכה (<75%) וחסימת חורי סיבים. יעילות נמוכה נובעת בדרך כלל מפגיעות סיבים במהלך חיתוך או ליטוש לא נכון. הפתרונות כוללים אימות שכל קצה סיב אינו פגום תחת מיקרוסקופיית Brightfield לפני ההחדרה (שלב 1.1.6.2), ליטוש מחדש באמצעות התקדמות הגריט המלאה (6 מיקרון → 0.01 מיקרון, שלב 1.1.6.1), והבטחת חד להב החוצץ. כדי לשפר את קצב התפוקה, מעבדות יכולות ליישם שינויים בזרימת עבודה כגון חיתוך סיבים מותאמים אישית באמצעות שלבי תרגום מדויקים או מערכות חיתוך מבוססות לייזר (שלב 1.2.4). יצרני הדפסת תלת-ממד מסחריים עם מערכות מדויקות מאוד יכולים להפחית את הצורך בקידוח ידני (שלבים 1.1.3–1.1.4, שלב 1.2.3), אם כי דיוק המידות עשוי להשתנות בין האצוות.
שנית, השתלה כירורגית כוללת יישור גולגולת (סבילות ±0.03 מ"מ), הזרקות ויראליות ב-11–12 אתרים, והשתלת מערך רב-סיבי ואחריה קיבוע מלט. דיוק הכוונה נפגע כאשר רמת הגולגולת חורגת מהסבילות. ניתן להקל על כך על ידי מדידת גובה הצליל במספר נקודות קדמיות-אחוריות במרחק 8.25 מ"מ זו מזו ומדידת גלגול במיקומים צדדיים של ±2.0–2.5 מ"מ, תוך הבטחת ייצוב מלא של מוטות האוזניים. בועות אוויר במיקרופיפטות הזרקת וירוסים מונעות העברה מדויקת ומחייבות להתחיל מחדש את הכנת המיקרופיפטות (שלב 2.9). במהלך השתלת מערך רב-סיבים, יש להימנע ממגע מלט עם קצות הסיבים על ידי בניית פירמידות מלט ממשטח הגולגולת כלפי מעלה (שלבים 2.10.3–2.10.5) ומתן זמן ייבוש מספק (≥15 דקות).
שלישית, הקלטה ועיבוד נתונים כוללים סנכרון מצלמה באמצעות מערכת DAQ, כיול הספק LED (0.1 mW פלט/סיב, 1.2 mW פלט/12 סיבים), ועיבוד מוקדם של אותות עם בקרות איזוסבסטיות. צינור תיקון התנועה שהוצג כאן משתמש ברגרסיית Lasso, שמתאימה מאוד לתצורות חיזוי רב-ערוציות, משום שהיא מכווצת אוטומטית את החיזויים הלא אינפורמטיביים לעבר האפס, תוך שמירה רק על אלו שתורמים משמעותית לתיקון ארטיפקטים. תכונה זו הופכת אותה ליתרון מיוחד בפוטומטריה דו-צבעית: על ידי הכללת אותות איזוסבסטיים משני הערוצים האדומים והירוקים כמנביאים, Lasso מנצל באופן סלקטיבי את הערוצים הנושאים מידע תנועה אמיתי, ומניב הפחתת רעש טובה בהרבה באותות ערוץ אדום (RCaMP) בהשוואה לתיקון סיב זהה בלבד (איור 4C–D). מכיוון שלסו מזהה אוטומטית את החיזויים המידעיים ביותר, מומלץ מאוד להשתמש בכל הערוצים האיזוסבסטיים הזמינים כקלט. עם זאת, רגרסיית לאסו היא אחת מכמה שיטות תיקון תקפות; חלופות כוללות מודל בייסיאני גנרטיבי46, קנה מידה מבוסס תדירות47, וריבועים מינימליים משוקללים מחדש (IRLS)48, שכולם ככל הנראה מניבים הפחתת ארטיפקטים דומה, עם הנחיות יישום שמופיעות בטבלה 2. איכות אות ירודה מתמשכת למרות עיבוד מקדים אופטימלי ככל הנראה מעידה על בעיות חומרה או ניתוח, ויש לבחון מחדש את השלבים 1–2
מעבר לשיקולים פרוצדורליים אלו, פוטומטריה דו-צבעונית מציבה אתגרים טכניים נוספים הקשורים להפרדה ספקטרלית. שיקול קריטי בפוטומטריה דו-צבעונית הוא ניהול חפיפה ספקטרלית בין מדדי סידן ירוק ואדום. בעוד שהסרה מוחלטת של חיתוך ספקטרלי היא אתגר בשל ספקטרום פליטה חופף של GCaMP ו-RCaMP, הגישה שלנו למולטיפלקסינג בזמן עם עירור LED משולב (470 ננומטר ל-GCaMP, 560 ננומטר ל-RCaMP, 415 ננומטר איזוסבסטי) ומסנני פליטת פס אופטימליים מפחיתים משמעותית את הבעיה הזו. בפועל, אנו מבחינים במינימום של דיבור צולב: גירוי של 470 ננומטר מעורר פעילות זניחה בערוץ האדום, ולהפך עבור גירוי של 560 ננומטר בערוץ הירוק (איור 3). חוקרים המודאגים מחפיפה ספקטרלית שאריתית יכולים לייעל את המערכות שלהם על ידי בחירת מסנני פליטה עם מעבר פס צר עם הפרדה ספקטרלית מקסימלית בהתבסס על שילובי האינדיקטורים הספציפיים שלהם.
בהשוואה לגישות אחרות להקלטות עצביות בקנה מידה גדול, פוטומטריית סיבים דו-צבעונית מרובת אתרים מציעה יתרונות משמעותיים רבים. ראשית, בעוד שפוטומטריית סיב יחיד 1,2,3, הקלטות חוץ-תאיות עכשוויות 4,6, או גישות דימות משטח קורטיקלי 8,9 מוגבלות לאזור מוחי אחד או במרחב מוגבל (למשל, במשטח הקורטיקלי), עיצוב ההדפסה התלת-ממדי המותאם אישית שאנו משתפים כאן מאפשר מיקוד של עד 12 אזורי מוח בכל מקום במוח באמצעות סיבים אופטיים של 200 מיקרון. לשם השוואה, פרולים 5,7 הזמינים מסחרית תומכים רק בסיבים אופטיים של 100 מיקרון ומוגבלים גם לקבוצת אזורים מוגבלים במוח שנמצאים ישירות בטנדרל למערך הליניארי של הפרול. לגבי מיקוד והקלטה מאזורים ספציפיים במוח, הפשרה העיקרית היא בין קוטר הסיבים לשדה הראייה של מערכת הפוטומטריה. מערכי ריבוי הסיבים המודפסים בתלת-ממד המצוידים בסיבים של 200 מיקרון מתעדים משטחים גדולים יותר בכל אתר בהשוואה לטבעות רב-סיבים מסחריות. בפרוטוקול הנוכחי, שדה הראייה של המצלמה במערכת הפוטומטריה מגביל את ההקלטה ל-12 סיבים אופטיים ב-200 מיקרון. מגבלה זו ניתנת להתגבר על ידי הקטנת קוטר הסיבים ל-100 מיקרון עבור עד 60 סיבים או על ידי בניית מערכת פוטומטריה מותאמת אישית עם מטרת מצלמה גדולה יותר.
לבסוף, פלטפורמת פוטומטריית סיבים דו-צבעונית זו שימשה למעקב אורך אחר דינמיקת פעילות עצבית של שתי אוכלוסיות עצביות מובחנות גנטית ב-11-12 אזורי מוח. באמצעות אסטרטגיית ההוצאה של Cre-in/Cre המבטאת RCaMP תלויה ב-Cre ו-ECaMP ללא Cre באוכלוסיות SBN בעכבר Vgat-cre, הוכח כי גם ניסיון אגרסיבי וגם תצפית מקדמים דפוסים משותפים של דינמיקת פעילות SBN רחבה במהלך אינטראקציות חברתיות הגנתיותעתידיות 42. באמצעות אותה אסטרטגיה ויראלית בעכבר Esr1-cre לרישום נוירונים אלפא של קולטני אסטרוגן שמביעים ולא מבטאים נוירונים, דפוסי התנהגות חברתיים ספציפיים לטריטוריה נקשרו לשינוי מהיר ורגיש להורמונים של קוד פעולה חברתית רחב-SBN, מה שהגביר פעילות קשורה להתנהגות באזור הבית43. הבדלים ספציפיים לטריטוריה בהתנהגות ובקידוד הרשת דורשים טסטוסטרון מחזורי בעכברים זכרים. בעוד שמחקרים אלו השתמשו בגישה ויראלית ובקו Cre יחיד, מחקרים עתידיים יכולים להרחיב שיטות אלו באמצעות גישות ויראליות מצטלבות, אינדיקטורים של סידן מבוטאים גנטית, או מדווחים פלואורסצנטיים של איתות נוירומודולטור וניורופפטיד.
המימון היה מ-NIH K99MH135212 (ל-E.M.G.), NIH F32MH126562 (ל-E.M.G.), DP2MH126375 (ל-A.L.F.), NIH R01MH126035 (ל-A.L.F.), NYSCF (ל-A.L.F.), קרן סימונס (SCGB) (ל-A.L.F.), קרן קלינגנשטיין (ל-A.L.F.), ומלגת אלפרד פ. סלואן (ל-A.L.F.), קרן מקנייט (A.L.F). מכון אלן (A.L.F). A.L.F. הוא חוקר רוברטסון מטעם קרן תאי הגזע של ניו יורק.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| מקדח #76 | עיר מקדח | #76 | |
| מקדח #78 | עיר מקדח | #78 | |
| מקדח #92 | עיר מקדח | #92 | |
| 0.01 & mu; דפי ליטוש גריט | ThorLabs | LFCF2 | |
| מקדחים בגודל 0.25 מ"מ x 5.5 מ"מ | עיר מקדח | מוצר מותאם אישית | מקדח 0.25 x 5.5 מ"מ, יצר קשר עם החברה לבנייה |
| 1 & mu; דפי ליטוש גריט | ThorLabs | LF1D | |
| 12 פאצ'ורד הסתעפות סיבית | העדשה הדורית | CustomBBP(12)_200/220/3000-0.37 _5m_SMA-12xCL_LAF | |
| 200 & mu; סיב אופטי M | ThorLabs | FT200UMT | |
| 3 & mu; דפי ליטוש גריט | ThorLabs | LF3D | |
| 30 & mu; דפי ליטוש גריט | ThorLabs | LF30D | |
| 6 & mu; דפי ליטוש גריט | ThorLabs | LF6D | |
| תפר נספג | אתיקון | J421H | |
| תיעוד אדפטיבי של ריבועים מינימליים מעונשים בעונש אדפטיבי | גוגל | לא זמין | https://code.google.com/archive/p/airpls/ |
| פיני דיבל מפלדת סגסוגת | מקמאסטר-קאר | 98381a983 | |
| מצלמות התנהגות | טלדיין FLIR | בלאקפליי S | |
| בונסאי | קרן התוכנה בונסאי | גרסה 2.9.0 | |
| מיקרוסקופ ברייטפילד | לייקה | ES2 | |
| מהדקי בולדוג | FineScienceTools | 18038-45 | |
| DAQ | מחשוב מדידה | DAQ מסדרת MC USB-200 | |
| תוכנת DAQ | מחשוב מדידה | DAQami | |
| תרגיל | Kopf Instruments | מקדח סטריאוטקסי דגם 1911 | |
| חותך סיבים | ThorLabs | XL411/CLVB | |
| מערכת פוטומטריית סיבים | נוירופוטומטריקה | FP3002 | |
| מדריך למערכת פוטומטריית סיבים | נוירופוטומטריקה | לא זמין | מדריך לאחסון דף אינטרנט: https://neurophotometrics.com/documentation |
| כתב סיבים | ThorLabs | S90C | |
| מפשט סיבים | ThorLabs | T10S13 | |
| מלקחיים עדינים | FineScienceTools | 11252-00 | |
| מספריים עדינים | FineScienceTools | 14084-08 | |
| ברגי הנעה G5 | אתר ההפקה הפתוח של Ephys | OEPS-7105 | |
| מברג G5 | אתר ההפקה הפתוח של Ephys | OEPS-7121 | |
| GCaMP6f | מעבדת הנדסה נוירולוגית ויראלית PNI | EF1a-Cre מחוץ ל-GCaMP6f-WPRE-hGHpA | |
| GRAB-DA | אדג'ין | hSyn-GRAB_DA1m-WPRE-hGHpA | |
| כרית חימום | ציוד רפואי אדרויט | HTP-1500 | |
| מערכת חימום | קנט סיינטיפיק | RT-0515 | |
| איזופלוראן | קובטרוס | 29405 | |
| jRCaMP1b | אדג'ין | pAAV.Syn.Flex.NES-jRCaMP1b.WPRE.SV40 | |
| אגוזי משושה מברונזה M0.6 | MetricScrews.us | 21614 | |
| מגיבים וכלים של מלט מטאבונד | פארקל | S380 | |
| הדפסות תלת-ממד שרף דמויי MicroFine ABS | ProtoLabs | מוצר מותאם אישית | ראו קבצי קוד משלימים 1-3, 5, 6 |
| מזרק ננוליטר | חברת דרומונד המדעית | ננו-ג'קט II | מזרק ננוליטר |
| לוחות שעווה של פארפין | אמקור | ParaFilm M סרט מעבדה רב-תכליתי | |
| פיפטר | תרמופישר סיינטיפיק | 4641310N | |
| ליטוש פאק | סדנת מכונות במחלקת הפיזיקה של אוניברסיטת פרינסטון | מוצר מותאם אישית | ראו קובץ קוד משלים 4 |
| פאוורמטר | ThorLabs | PM100D | |
| משחה אופטית של פורלובה | דקרה | P1490-1 | |
| פייתון | קרן התוכנה של פייתון | לא זמין | |
| צינור פלסטיק רך לטאצ'קורד | מקמאסטר-קאר | 3774N4 | |
| ספינוויו | טלדיין FLIR | גרסה 1.25.0.52 | תוכנת הדמיה השולטת במצלמות ההתנהגות |
| מסגרת סטריאוטקטית | Kopf Instruments | דגם 1900 | |
| תיעוד TMAC | לא זמין | לא זמין | קוד TMAC: https://github.com/Nondairy-Creamer/tmac |
| צינורות למסגרת סטריאוטקטית | סן-גובן | E-3603 | |
| אידוי | קנט סיינטיפיק | VetFlo Vaporizer |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה