$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
השפעות סיבתיות גנטיות של פנוטיפים של תאי חיסון על טיפול הורמונלי
לאחר הוצאת גורמי בלבול פוטנציאליים והיעדר פליאוטרופיה אופקית (P > 0.05), בוצע ניתוח MR דו-דגמי להערכת ההשפעות הסיבתיות של פנוטיפים של תאי החיסון על הסיכון לטיפול בשיטת ההורמונ. עבור כל פנוטיפ תאי חיסון ששימש כחשיפה, חושב סטטיסטיקת F כדי להעריך את עוצמת המשתנים האינסטרומנטליים. כל המכשירים עברו את הסף המקובל של F > 10, מה שמעיד על הטיית מכשיר חלשה במינימום. סטטיסטיקות F מפורטות עבור תכונות החיסון המרכזיות הנדונות בטקסט הראשי מסופקות בטבלה המשליחה 2. בסך הכול, 32 פנוטיפים הקשורים למערכת החיסון הראו קשרים משמעותיים עם סיכון לטיפול מהוטה (P < 0.05) (איור 1). החוסן של ממצאים אלו נתמך בניתוחי גרף פיזור (איור משלים 2A,B) וניתוחי רגישות בשיטת השארת אחד החוצה (איור משלים 3A,B).
מבין הממצאים העיקריים, הפנוטיפ של טרג הראה את המעורבות הנרחבת ביותר, כאשר CD3 על CD39+ מפריש Treg (OR = 1.063; CI 95%: 1.023–1.105; P = 0.002) ו-CD39+ Treg מופעל ב-Treg מופעל (OR = 1.081; CI 95%: 1.008–1.161; P = 0.030) שהפכו לתכונות מרכזיות הקשורות לסיכון שקיבלו עדיפות לאחר מכן לניתוח גישור. בשלבי הבגרות של תאי T, CD3 על CM CD8br הראה את גודל ההשפעה הגדול ביותר בין התכונות הקשורות לסיכון (OR = 1.094; רווח סמך 95%: 1.040–1.150; P < 0.001), בעוד ש-TD DN (CD4⁻CD8⁻) AC הראה אסוציאציה מגן בולטת (OR = 0.930; רווח בר-סמך 95%: 0.881–0.982; P = 0.009). בקרב פנוטיפים של תאי B, תת-קבוצות תאי המיאלואידים המבטאים HLA-DR הראו באופן עקבי השפעות מעלילות סיכון, כאשר HLA DR על CD33dim HLA DR+ CD11b⁻ הגיע ל-OR = 1.095 (רווח בר-סמך 95%: 1.032–1.162; P = 0.003). תוצאות מלאות בכל שש קטגוריות תאי החיסון: שלבי cDC, Treg, שלבי הבשלה של תאי T, TBNK, מונוציטים, תאי B ותאי מיאלואיד מסוכמות באיור 1.
ניתוחי רגישות אישרו עוד יותר את התוצאות. לא זוהתה ראיות משמעותיות להטרוגניות ופליאוטרופיה אופקית בהתבסס על הערכות סטטיסטיות רלוונטיות (טבלה משלימה 3 וטבלה משלימה 4). תוצאות אלו אושרו על ידי ניתוח "השאר-אחד-בחוץ".
ההשפעות הסיבתיות של טיפול הורמונלי על תאי מערכת החיסון
התוצאות הראו כי HT קשור באופן חיובי סיבתית לשני תכונות חיסוניות: תא ה-T הרגולטורי Scing CD4 (1.143: 1.023-1.277; P = 0.018) ותאי מדכא מונוציטיים שמקורם במיאלואיד (1.373: 1.058-1.782; P = 0.017). לעומת זאת, HT היה קשור סיבתית שלילית ל-4 תכונות חיסוניות: תאי T רגולטורי CD4 מופעלים (0.818: 0.679-0.987; P = 0.036), תא T רגולטורי מופעל CD4+ (0.790: 0.676-0.924; P = 0.003), תא T רגולטורי CD4 מופעל ומנוחה (0.871: 0.780-0.974; P = 0.015) ותאי T CD25++ CD4+ (0.855: 0.747-0.980; P = 0.017) (איור 2). ממצאים אלו מצביעים על קשר הדדי בין מצב ההפעלה של HT ל-Treg, שעשויים לשקף שיקום חיסוני מונע מחלה. גרפים של פיזור (איור משלים 4) ושיטת "השאר-אחד-בחוץ" (איור משלים 5) אישרו את יציבות התוצאות. ניתוחי רגישות אישרו גם את התוצאות. עוצמת התוצאות הללו אושרה על ידי הערכות של הטרוגניות וריבוי אופקי (טבלה משלימה 5 וטבלה משלימה 6). מסקנות אלו נתמכות בניתוח "השאיר אחד-בחוץ".
השפעות סיבתיות גנטיות של מטבוליטים בפלזמה על טיפול הורמונלי
לאחר בחירת משתנים אינסטרומנטליים מתאימים והוצאת אי-איזון בשרשרת ומכשירים חלשים, זוהו סך הכל 34,843 SNPs הקשורים למטבוליטים בפלזמה, כאשר הסטטיסטיקה המינימלית של F הגיעה ל-19.50 (טבלה משלימה 7). באמצעות שיטת IVW, נמצא באופן ראשוני כי 9 מטבוליטים בפלזמה קשורים סיבתית לטיפול הורמלי. מתוכם, 4 מטבוליטים היו קשורים באופן חיובי לסיכון מוגבר לטיפול ב-HT: יחס גלוקוז למלטוז (1.195: 1.082-1.319; P < 0.001), חומצה טאורוכולית (1.190: 1.073-1.321; P = 0.001), 5-הידרוקסימתיל-2-פורואילקרניטין (1.127: 1.046-1.215; P = 0.002), ו-C5 (1.120: 1.032-1.215; P = 0.006) (טבלה 1).
לעומת זאת, 5 מטבוליטים עשויים להיות קשורים שלילית לסיכון לטיפול בהורמון, כולל ארגותיונין (0.958: 0.927-0.990; P = 0.010), יחס קרניטין לפרופיונילקרניטין (C3) (0.895: 0.825-0.970; P = 0.007), יחס אדנוזין 5'-דיפוספט (ADP) ל-N-אצטילנוראמינט (0.890: 0.823-0.963; P = 0.004), יחס ארגינין לגלוטמט (0.882: 0.802-0.968; P = 0.009), ו-1-(1-אניל-פאלמיטויל)-2-לינולואיל-GPE (p-16:0/18:2) (0.873: 0.798-0.955; P = 0.003).
ניתוחי רגישות אישרו גם את התוצאות. עוצמת התוצאות הללו אושרה על ידי הערכות של הטרוגניות ורב-אופקי (טבלה משלימה 8 וטבלה משלימה 9). מסקנות אלו נתמכות בניתוח "השאיר אחד-בחוץ".
תיווך הסיכון לתאי החיסון לטיפול חומי באמצעות מטבוליטים בפלזמה
בהתבסס על פנוטיפים של תאי חיסון ומטבוליטים בפלזמה שזוהו בעבר, יושמה אסטרטגיית MR דו-מדגימות להערכת השפעות מתווכות פוטנציאליות. בשלב הראשון נערכו ניתוחי MR תוך שימוש ב-32 פנוטיפים של תאי חיסון כחשיפה ו-9 מטבוליטים של פלזמה כתוצאות, וחשפו 12 קשרים סיבתיים משמעותיים הכוללים 10 פנוטיפים של תאי חיסון ו-8 מטבוליטים בפלזמה, עם הערכות אפקט מתאימות β1 מתאי חיסון למטבוליטים. מתוכם, זוהה הקשר המשמעותי ביותר בין CD3 על תאי Treg מפרישים CD39+ לבין רמות C5 (1.050: 1.016-1.085; P = 0.004). בשלב השני, C5 טופל כחשיפה ו-HT כתוצאה. בוצעו ניתוחי MR, כולל זיהוי חריגות MR-PRESSO והערכות להטרוגניות ופליאוטרופיה אופקית. לא זוהו SNPs חריגים או ראיות להטרוגניות או פליאוטרופיה (טבלה 2), מה שמאפשר לנו להעריך את ההשפעה הסיבתית ממטבוליט הפלזמה ל-HT (β2) (איור משלים 6).
בשלב האחרון של ניתוח ה-MR, נערכו ניתוחי תיווך כדי להבהיר האם ההשפעה הסיבתית של פנוטיפים של תאי חיסון על HT מתווכת באמצעות מטבוליטים בפלזמה. התוצאות הראו כי רמות מוגברות של C5 שימשו כמתווכת במסלול המקשר בין CD3 על תאי Treg שמפרישים CD39+ לסיכון גבוה יותר לפתח HT (איור 7 ו-3 משלים). זיהוי חריגים, הטרוגניות ובדיקות פליאוטרופיה MR-PRESSO לא הראו SNPs מוטים ולא סימנים להטרוגניות או פליאוטרופיה אופקית (טבלה 3, טבלה משלימה 10, וטבלה משלימה 11). מתוכם, השיעור המתווך ברמות C5 היה 8.89% (2.34% עד 15.4%) (P = 0.008). לבסוף, בוצעו ניתוחי MR הפוכים בתיווך כדי לבחון בקפדנות הנחות כיווניות. לגבי מטבוליטים לתאי מערכת החיסון, MR הפוך (רמות C5 ל-CD3 על CD39+ מפרישה Treg) לא הראה השפעות סיבתיות משמעותיות (IVW P > 0.05 לאחר תיקון בונפרוני), התומכת בחד-כיווני (טבלה 4). עבור שיטת שימור למטבוליטים, MR הפוך (רמות HT ל-C5) לא חשף קשרים סיבתיים (IVW P > 0.05 לאחר תיקון בונפרוני), מה שתומך בכיוון המשוער (טבלה 5). בהינתן ההשפעה הכוללת המתונה והיעדר ראיות הדדיות ב-MRI דו-כיווני, יש לראות תוצאות תיווך אלו כחוקריות.
בדיקת ציטומטריית זרימה CD3+CD4+CD25+CD39+ זיהוי Treg
כדי לאמת את ממצאי ניתוח המטבולומיקה, בוצעה אימות ניסויי במבחנה כדי להעריך את מאפייני הביטוי של CD39+ Treg והפלזמה C5. ציטומטריית זרימה שימשה לכימות תאי Treg (CD3⁺CD4⁺CD25⁺) ותת-הקבוצות CD39⁺ (CD3⁺CD4⁺CD25⁺CD39⁺) בדם היקפי של מטופלים עם HT ובקרות בריאות. כפי שמוצג באיור 4A–C, שני תאי ה-Treg (CD3⁺CD4⁺CD25⁺) ו-CD39⁺ Treg היו גבוהים משמעותית בקרב מטופלי HT בהשוואה לאנשים בריאים (P < 0.001). פרופיל מטבולומי ממוקד בפלזמה באמצעות ספקטרומטריית מסה טנדם הראה שרמות C5 היו גבוהות משמעותית בקבוצת ה-HT (P < 0.001, איור 4D). בנוסף, ניתוח המתאם של פירסון חשף קשר חיובי בין רמות C5 בפלזמה לבין תדירות תת-הקבוצה של CD39⁺Treg (איור 4E), בהתאם למסלול CD39⁺Treg-C5-HT המשוער שזוהה על ידי MR. עם זאת, העיצוב החתך וגודל המדגם הקטן מונעים הסקה סיבתית בלבד מהנתונים הללו.
זמינות נתונים:
סטטיסטיקות הסיכום של מחקר אסוציאציה גנומי רחב (GWAS) לדלקת בלוטת התריס של השימוטו התקבלו מקטלוג GWAS (ebi-a-GCST90018855; https://gwas.mrcieu.ac.uk/). סטטיסטיקות סיכום של תכונות תאי החיסון נאספו מקטלוג GWAS (ebi-a-GCST90001391 ל-ebi-a-GCST90002121; https://www.ebi.ac.uk/gwas/). נתוני GWAS של מטבוליט הפלזמה התקבלו מקטלוג GWAS (GCST90199621-GCST90201020; https://www.ebi.ac.uk/gwas/studies/GCST90199621-90201020). הנתונים התומכים בממצאי מחקר זה מסופקים בקובץ המשלים 1.

איור 1: תרשים יער המציג את ההשפעות הסיבתיות של תכונות תאי החיסון על דלקת בלוטת התריס השימוטו. תרשים יער המסכם את ההשפעות הסיבתיות של כל תכונות תאי החיסון שנבדקו במחקר זה על דלקת בלוטת התריס (HT). קיצורים: nsnp, מספר הפולימורפיזמים של נוקלאוטידים בודדים (SNPs); pval, ערך P; OR, יחס סיכויים; CI, מרווח ביטחון. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 2: תרשים יער המציג את ההשפעות הסיבתיות של דלקת בלוטת התריס של השימוטו על פנוטיפים של תאי החיסון. תרשים יער המסכם את ההשפעות הסיבתיות של HT על פנוטיפים שונים של תאי החיסון. קיצורים: nsnp, מספר SNPs; pval, ערך P; OR, יחס סיכויים; CI, מרווח ביטחון. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 3: תרשים יער המראה את אפקט התיווך על איזווולרילקרניטין (C5) בפלזמה בין CD39+ לדלקת בלוטת התריס של השימוטו. גרף יער המסכם את ההשפעות הסיבתיות של פלזמה C5 המתווכות את הקשר בין CD39+ ל-HT. קיצורים: OR, יחס סיכויים; CI, מרווח ביטחון. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 4: ביטוי של תאי T רגולטוריים CD39+ ורמות איזווולרילקרניטין (C5) בפלזמה אצל מטופלים עם דלקת בלוטת התריס השימוטו. (א) אסטרטגיית שער ציטומטריית זרימה עבור T רגולטורי (Treg; תאי CD3+CD4+CD25+) ותאי Treg של CD39+. (B) רמות תאי Treg כוללות. (C) רמות תאי Treg CD39+. (D) רמות איזווולרילקרניטין (C5) בפלזמה שנמדדות באמצעות ספקטרומטריית מסה טנדם. (ה) ניתוח קורלציה פירסון בין רמות איזווולרילקרניטין (C5) בפלזמה לבין שיעור תאי ה-Treg של CD39+. קיצורים: SSC-A, אזור פיזור צדדי; FSC-A, אזור פיזור קדמי; FSC-H, גובה פיזור קדמי. P < 0.001 לעומת ביקורת בריאה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
טבלה 1: השפעות סיבתיות של תשעה מטבוליטים פלזמתיים הקשורים באופן מובהק לדלקת בלוטת התריס של השימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה 2: השפעה סיבתית של רמות איזווולרילקרניטין (C5) על דלקת בלוטת התריס השימוטו (β₂). אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה 3: השפעה סיבתית של תאי T רגולטוריים CD3+CD39+ על דלקת בלוטת התריס בהשימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה 4: השפעה סיבתית של רמות איזווולרילקרניטין (C5) על תאי T רגולטוריים CD3+CD39+. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה 5: ההשפעה הסיבתית של דלקת בלוטת התריס של השימוטו על רמות איזווולרילקרניטין (C5). אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 1: עיצוב מחקר וזרימת עבודה אנליטית. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 2: תרשימי פיזור המציגים הערכות סיבתיות לקשרים בין 32 תכונות תאי חיסון לבין דלקת בלוטת התריס האשימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 3: ניתוחים של Leave-one-Out המעריכים את עמידות ההשפעות הסיבתיות של 32 תכונות תאי חיסון על דלקת בלוטת התריס השימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 4: תרשימי פיזור המציגים את ההשפעות הסיבתיות של דלקת בלוטת התריס של השימוטו על שישה פנוטיפים של תאי חיסון. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 5: ניתוחי Leave-one-out המעריכים את עמידות ההשפעות הסיבתיות של דלקת בלוטת התריס של השימוטו על שישה פנוטיפים של תאי חיסון. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 6: קשר סיבתי בין רמות איזווולרילקרניטין (C5) לסיכון לדלקת בלוטת התריס בהשימוטו. (א) תרשים יער המראה את ההשפעה הסיבתית של רמות איזווולרילקרניטין (C5) על סיכון לטיפול בהורמה (β₂). (B) תרשים פיזור המציג את הערכת ההשפעה הסיבתית עבור כל SNP על סיכון ל-HT. (ג) תרשים משפך להערכת הטרוגניות של הערכות אקראיות מנדליאניות (MR) להשפעה של רמות C5 על סיכון לטיפול ב-HT. (ד) ניתוח השארת אחד החוצה שמראה כי הערכת הסיכון הכוללת לא הושפעה באופן מהותי מאף SNP בודד. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
איור משלים 7: קשר סיבתי בין תאי T רגולטוריים CD3+CD39+ לסיכון לדלקת בלוטת התריס של השימוטו. (א) תרשים יער המראה את ההשפעה הסיבתית הכוללת של תאי T רגולטוריים CD3+CD39+ על סיכון ל-HT. (B) תרשים פיזור המציג את הערכת ההשפעה הסיבתית עבור כל SNP על סיכון ל-HT. (ג) תרשים משפך להערכת הטרוגניות של הערכות MR להשפעה של תאי T רגולטוריים CD3+CD39+ על סיכון ל-HT. (ד) ניתוח השארת אחד החוצה שמראה כי הערכת הסיכון הכוללת לא הושפעה באופן מהותי מאף SNP בודד. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 1: מאפייני מערכי הנתונים של מחקרי אסוציאציות גנומיים עבור מטבוליטים של פלזמה בניתוח אקראי מנדלי. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 2: מאפייני משתנים אינסטרומנטליים (SNPs) וסטטיסטיקות F עבור פנוטיפים מרכזיים של תאי חיסון המשמשים כחשיפות בניתוח אקראי מנדלי. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 3: הערכת פליאוטרופיה עבור ניתוחי אקראיות מנדליים של פנוטיפים של תאי חיסון בדלקת בלוטת התריס בהשימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 4: הערכת הטרוגניות לניתוחי אקראיות מנדליים של פנוטיפים של תאי חיסון בדלקת בלוטת התריס של השימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 5: הערכת פליאוטרופיה לניתוחי אקראיות מנדליים של דלקת בלוטת התריס בהאשימוטו על פנוטיפים של תאי חיסון. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 6: הערכת הטרוגניות לניתוחי אקראיות מנדליים של דלקת בלוטת התריס בהאשימוטו על פנוטיפים של תאי חיסון. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 7: פולימורפיזמים חד-נוקלאוטידיים הקשורים למטבוליטים בפלזמה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 8: הערכת פליאוטרופיה לניתוחי רנדומיזציה מנדלית של מטבוליטים בפלזמה בדלקת בלוטת התריס בהשימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 9: הערכת הטרוגניות לניתוחי אקראיות מנדליים של מטבוליטים בפלזמה בדלקת בלוטת התריס בהשימוטו. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 10: הערכת פליאוטרופיה לניתוחי תיווך של קשרים בין פנוטיפ תאי חיסון לקשרי דלקת בלוטת התריס של השימוטו באמצעות מטבוליטים בפלזמה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
טבלה משלימה 11: הערכת הטרוגניות לניתוחי תיווך של קשרי פנוטיפ תאי חיסון וקשרי דלקת בלוטת התריס של השימוטו באמצעות מטבוליטים בפלזמה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
קובץ משלים 1: נתונים התומכים בממצאי מחקר זה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.