הצהרת אתיקה
מחקר זה היה מחקר חיידקים חוץ-גופיים ולא כלל משתתפים אנושיים, נבדקים בבעלי חיים או חומרים שמקורם במטופלים. לכן, לא נדרשו אישור ועדת ביקורת מוסדית ואישור אתיקה של בעלי חיים.
הערכת פירוק AO7 במערכת פנטון המסייעת בוויטמין C
כדי להעריך את השפעת ויטמין C על ההתנהגות החמצונית הנצפית של תגובת פנטון, נעשה שימוש בפירוק חומצי תפוז 7 (AO7) כקריאה כימית עקיפה של פעילות חמצונית. בדיקה זו אינה מכמת במפורש מיני חמצן ריאקטיביים בודדים. הכנתי 100 מ"ל תמיסת AO7 ב-5 מ"ג/ליטר והתאמתי את התמיסה ל-pH 3. הוספתי H₂O₂ ו-FeSO₄ לריכוזים הסופיים של 2.2 mM ו-0.055 mM, בהתאמה. הוספתי ויטמין C או כבולוס יחיד בתחילת התגובה או בשיטת מינון בת שלושה שלבים. לניסוי המינון-תגובה, נעשה שימוש ביחס מולרי של Vc: Fe2⁺ של 0, 0.12, 0.24, 0.48, 2, 4, 6 ו-8, התואמים לריכוזי ויטמין C הסופיים של 0, 0.0066, 0.0132, 0.0264, 0.110, 0.220, 0.330 ו-0.440 מ"מ, בהתאמה, כאשר FeSO₄ משמש ב-0.055 מ"מ. בתנאי התוספת בת שלושה שלבים, חילקו את אותה כמות ויטמין C לשלושה אליקווטים שווים והוספו אליקו אחד ב-3, 5 ו-7 דקות לאחר תחילת התגובה. לדוגמה, ביחס Vc:Fe2⁺ של 0.48, הוספתי ויטמין C ב-0.0088 מ"מ לכל אליקווט, מה שנותן ריכוז כולל סופי של 0.0264 מ"מ.
ערבבתי את תמיסת התגובה ברציפות בחושך במשך 10 דקות תוך שמירה על טמפרטורה מתחת ל-30 מעלות צלזיוס. אספתי דגימות של 2 מ"ל לפני ואחרי התגובה. מדד את הספיגה ב-483 ננומטר באמצעות ספקטרופוטומטר UV-Vis, וחישוב את קצב ההתדרדרות AO7 באמצעות משוואה 1:
קצב התדרדרות (%) = [(A₀ − A₁) / A₀] × 100% (1)
כאן, A₀ מייצג את הספיגה של הדגימה לפני התגובה, בעוד A₁ מייצג את הספיגה של הדגימה לאחר התגובה.
הערכת אות פלואורסצנציה קשור ל-OH באמצעות גלאי TA
כדי להעריך אותות פלואורסצנציה הקשורים לרדיקלי הידרוקסיל באותם תנאים חומציים במבחנה ששימשו בניסויים האנטיבקטריאליים, הוקם מערכת כימית ללא תאים המשתמשת בדי-סודיום טרפתלטלט (TA, 1 mM) כגלאי פלואורסצנציה. בדיקה זו שימשה כאינדיקטור יחסי להיווצרות מוצר הקשור ל-OH ולא פורשה ככימות מוחלט של יצירת רדיקלי הידרוקסיל. נכללו שבע קבוצות: (1) ריק (1 mM TA רק בבופר תגובה), (2) H₂O₂ בלבד, (3) Fe2⁺ בלבד, (4) Vc בלבד (תוספת מדורגת), (5) פנטון קונבנציונלי (Fe2⁺ + H₂O₂), (6) פנטון בסיוע ויטמין C עם תוספת בולוס Vc (Fe2⁺ + H₂O₂ + Vc, בולוס), ו-(7) פנטון בסיוע Vc עם תוספת מדורגת של Vc (Fe2⁺ + H₂O₂ + Vc, מדרגתית). בתנאי החיבור בשלב שלבי, Vc הוכנס ב-3, 5 ו-7 דקות לאחר תחילת התגובה באליקוואטים שווים, בעוד שתנאי הבולוס קיבל את אותה כמות כוללת של Vc כמו תוספת בודדת.
אליקווטים נאספו לאורך תקופת תגובה של 10 דקות, הוסבו מיד לבסיסים עם NaOH כדי לדכא תגובות רדיקליות נוספות ולייצב פלואורסצנציה, ונשמרו בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס לפני המדידה. עוצמת הפלואורסצנציה של המוצר שמקורו ב-TA נמדדה באמצעות קורא מיקרופלט (Ex/Em: 315/425 ננומטר). יצירת רדיקלים באה לידי ביטוי בעוצמת פלואורסצנציה לאחר חיסור ריק ושימשה כאינדיקטור יחסי ליצירת רדיקלים. בוצעו לפחות שלושה ניסויים עצמאיים, והנתונים הוצגו כפרופילי זמן-מסלול והשוואות נקודות קצה לאחר 10 דקות.
הערכת ביצועים אנטיבקטריאליים באמצעות ספירת מושבות
זני H. pylori אוחסנו בטמפרטורה של −80 °C במרק עירוי לב מוחי (BHI) שהכיל 25% גליצרול. הזן העיקרי ששימש לבדיקת ספירת המושבות הראשית, מבחן חילוץ, בדיקת התאבכות מטריצה, צביעת פלואורסצנציה חיה/מתה, וניתוח מיקרוסקופ אלקטרוני סורק היה H. pylori G27. לפני כל ניסוי, חיידקים הועברו על לוחות אגר דם קולומביה ודגרו במשך 3 ימים בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס בתנאים מיקרואירופיליים שכללו 5% O₂, 10% CO₂ ו-85% N₂2.
בדיקת ספירת מושבות בזן הראשוני
השתמשו במניין יחידת יצירת מושבות (CFU) להערכת פעילות אנטיבקטריאלית בתנאי טיפול שונים. כלל את הקבוצות הבאות: קבוצת ביקורת לא מטופלת, H₂O₂ בלבד, ויטמין C בלבד, תגובה קונבנציונלית של פנטון, ותגובה בסיוע ויטמין C. אם קבוצה של Fe2⁺ בלבד לא נכללה בניסוי המקורי, יש להימנע מפרשנות הבדיקה הראשית כהפרדה מלאה של השפעות ברזל בלבד מהשפעות חמצון בתגובת פנטון. נקטף H. pylori מתורבתים ומחזיר את החיידקים לסליין פיזיולוגי. כווננו את הצפיפות האופטית ב-600 ננומטר (OD₆₀₀) ל-0.5, והעבירו את המתלה לסליין פיזיולוגי המכיל 3 mM אוריאה מותאמים ל-pH 3. הוספתי H₂O₂, FeSO₄ וויטמין C בהתאם לקבוצת הטיפול שהוקצה. השתמשו בריכוזים סופיים של 2.2 mM H₂O₂ ו-0.055 mM FeSO₄. בטיפול בסיוע ויטמין C בפנטון, הוספתי ויטמין C בשלושה אליקוטים שווים ב-3, 5 ו-7 דקות, עם ריכוז סופי כולל של 0.0264 מ"מ.
לאחר 10 דקות טיפול, כל דגימה דוללה מיד פי 100 בתמיסת מלח מפופר פוספט (PBS, pH 7.4) כדי לנטרל את ההשעיה החומצית ולהפחית את העברת המחמצנים והברזל שנותרו לשלב הציפוי. ציפוי את השעיין החיידקי המדולל על לוחות אגר דם קולומביה ודגרו בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס במשך 3 ימים בתנאים מיקרואירופיליים של 5% O₂, 10% CO₂ ו-85% N₂. ספירת CFU וחישבתי פעילות אנטיבקטריאלית כ-log₁₀ הפחתה CFU ביחס לביקורת שלא טופלה באמצעות משוואה 2:
log10 הפחתת CFU = log10 (בקרת CFU) − log10(CFU טופל) (2)
מבחן חילוץ
כדי לבדוק האם הפעילות האנטיבקטריאלית של מערכת פנטון המסייעת בוויטמין C קשורה לזמינות ברזל ותהליכים הקשורים לרדיקלים, בוצעו ניסויי חילוץ באמצעות דפרוקסמין (DFO) ככילטור ברזל ותיוריאה כאוסף רדיקלי הידרוקסילי. DFO או תיוראה נוסף לטיפול החיידקי 5 דקות לפני הוספת FeSO₄ ו-H₂O₂. DFO ותיוריאה שימשו בריכוזים סופיים של 100 מיקרומום ו-5 מ"מון, בהתאמה.
שש קבוצות ניסוי נכללו: קבוצת ביקורת לא מטופלת, פנטון בעזרת ויטמין C, פנטון בסיוע ויטמין C עם DFO, פנטון עם ויטמין C עם תיאוראה, DFO בלבד, ותיוריאה בלבד. כל שאר הפרמטרים הניסיוניים, כולל pH, רקע מליחה/אוריאה, ריכוז H₂O₂, ריכוז FeSO₄, לוח זמנים למינון ויטמין C, משך טיפול, דילול/ניטרול לפני הציפוי ותנאי הדגירה, היו זהים לאלו ששימשו במבחן ספירת המושבה הראשונית. הפעילות האנטיבקטריאלית נמדדה על ידי ספירת CFU והובאה לידי ביטוי כהפחתה של log₁₀ CFU ביחס לביקורת שלא טופלה.
אימות מולטי-סטריין
כדי לספק תמיכה מוגבלת בזן הצולב להשפעה האנטיבקטריאלית שנצפתה בזן הראשוני, מבחן ספירת המושבות יושם עוד על שני זני ייחוס נוספים של H. pylori , ATCC 43504 ו-ATCC 26695. לכל זן נכללו שלוש קבוצות ניסוי: ביקורת לא מטופלת, תגובת פנטון קונבנציונלית, ותגובת פנטון בסיוע ויטמין C עם תוספת מדורגת של ויטמין C. התנאים וההליכים הניסיוניים היו זהים לאלו ששימשו בבדיקת ספירת המושבות הראשונית. הפעילות האנטיבקטריאלית הובאה לידי ביטוי כהפחתה של log₁₀ CFU ביחס לבקרה שלא טופלה עבור כל זן. כל ניסוי בוצע עם n = 3 שכפולים ביולוגיים עצמאיים, והנתונים הוצגו כנקודות נתונים בודדות עם סטיית תקן ממוצעת ±.
בדיקת התאבכות מטריצית
כדי להעריך האם רכיבי מטריצה אורגניים יכולים להחליש את הפעילות האנטיבקטריאלית של מערכת פנטון בסיוע ויטמין C, הוקם מודל הפרעות חלבון באמצעות אלבומין בסרום בקר (BSA). BSA נכללה בריכוזים סופיים של 0, 1 ו-3 g· L⁻1. בכל ריכוז BSA, נכללו שלוש קבוצות ניסוי: (1) ביקורת לא מטופלת, (2) פנטון קונבנציונלי (Fe2⁺ + H₂O₂), ו-(3) פנטון בסיוע ויטמין C עם תוספת מדורגת של ויטמין C. הבדיקה בוצעה באמצעות הזן הראשוני תחת אותו פרוטוקול שתואר במבחן ספירת המושבה הראשונית, עם תנאי pH זהים, רקע של מי מלח/אוריאה, ריכוזי תגובה, משך טיפול (10 דקות) ונהלי ציפוי. הפעילות האנטיבקטריאלית הובאה לידי ביטוי כהפחתה של log₁₀ CFU ביחס לביקורת שלא טופלה בכל ריכוז BSA. כל ניסוי בוצע לפחות שלוש פעמים באופן עצמאי. ההשוואה העיקרית התמקדה בשאלה האם מצב פנטון המשופר נשאר עליון, או לפחות לא חלש יותר, ממצב פנטון הקונבנציונלי בתנאים המכילים חלבון.
צביעת פלואורסצנציה חיה/מת חיידקית
לאחר הטיפול, השעון החיידקי דולל פי 100 ב-PBS כפי שתואר לעיל, כדי להפחית את ההעברה החומצית והחמצנית שנותרה. צנטריפוגה את המתלה ב-1,800 × גרם למשך 10 דקות בטמפרטורת החדר וזרקתי את הסופרנטנט. הושעה מחדש את הכדור החיידקי ב-200 מיקרוליטר של מי מלח פיזיולוגיים. הוספתי SYTO9 ויודיד פרופידיום (PI) לריכוזים הסופיים של 6 מיקרומום ו-30 מיקרומון, בהתאמה. דגמתי את המתלה בחושך במשך 20 דקות בטמפרטורת החדר. הנחתי 5–10 מיקרוליטר מהמתלה החיידקי המוצבע על מחסנית זכוכית נקייה וכיסיתי אותה בכיסוי. תמונות פלואורסצנציה נרכשות באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנציה עם תעלות פלואורסצנציה ירוקות ואדומות בתנאי חשיפה זהים לכל קבוצות הטיפול. לכד לפחות שלושה שדות שנבחרו באקראי עבור כל קבוצה. השתמשתי בתמונות כהוכחה ויזואלית איכותית לדפוסי צביעה חיים/מתים ולא כמדידה כמותית של חיוניות חיידקים.
ניתוח מורפולוגיה חיידקית באמצעות מיקרוסקופיית אלקטרונים סורקת
לאחר הטיפול, דגימות החיידקים נאספו וקיבעו בגלוטראלדהיד 2.5% שהוכן בבופר פוספט של 0.1 מ' (pH 7.4) בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס למשך 12 שעות. לאחר הקיבעון, הדגימות נשטפו עם בופר פוספט להסרת קיבוע שאריתי. הדגימות יובשו ברצף בתמיסות אתנול מדורגות של 50%, 70%, 90% ו-100%. לאחר ההתייבשות, בוצעה ייבוש בנקודה קריטית. הדגימות היבשות הורכבו על עמודי SEM וצופו בשכבת זהב דקה של כ-10 ננומטר. מורפולוגיית החיידקים נבדקה באמצעות מיקרוסקופ אלקטרונים סורק במתח מואץ של 5 קילו-וולט. תמונות מייצגות צולמו בהגדלה נמוכה וגבוהה לכל קבוצת טיפול. תמונות SEM שימשו כתצפיות מורפולוגיות איכותיות ולא כראיות כמותיות למנגנון נזק מוגדר.
ניתוח סטטיסטי
ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות גרסה 10.0 של GraphPad Prism. כל הניסויים הכמותיים בוצעו עם n = 3 שכפולים ביולוגיים עצמאיים, והנתונים מוצגים כסטיית תקן ממוצעת ± (SD). לבדיקות פלואורסצנציה של TA, בוצעו השוואות סטטיסטיות בין קבוצות טיפול מרובות באמצעות ניתוח שונות חד-כיווני (ANOVA) ואחריו מבחן השוואות מרובות של טוקי. לבדיקות ספירת מושבות בזן הראשוני הכולל מספר מצבי טיפול, בוצעו השוואות סטטיסטיות באמצעות ANOVA חד-כיווני ואחריו מבחן השוואות מרובות של טוקי. לבדיקות חילוץ, בוצעו השוואות בין קבוצות באמצעות ANOVA חד-כיווני, ואחריה מבחן ההשוואות המרובות של דאנט, כאשר קבוצת פנטון בסיוע ויטמין C הוגדרה כהפניה. לניסויי אימות צולב מוגבלים, הושוו הפחתות log₁₀ CFU בין קבוצות פנטון קונבנציונליות וקבוצות פנטון בסיוע ויטמין C בכל זן באמצעות מבחן t דו-זנבי לא מזווג. בבדיקות התאבכות מטריצה, בוצעה ANOVA דו-כיווונית עם טיפול וריכוז BSA כגורמים, כולל מונח האינטראקציה. השוואות זוגיות בין טיפולים בכל ריכוז BSA בוצעו באמצעות מבחן ההשוואות המרובות של שידאק. המובהקות הסטטיסטית הוגדרה כ-P < 0.05. רמות המובהקות מצוינות כ-*p < 0.05, ** P < 0.01, ***P < 0.001, ו-****p < 0.0001.