מיטוכונדריה ממלאה תפקיד מרכזי בתפקוד התאים ובהומאוסטזיס. מיטוכונדריה היא המניעים העיקריים למטבוליזם תאי, ומווסת יצירת ATP באמצעות פוספורילציה חמצנית. הם גם משמשים כאברונים איתותיים שמכתיבים את גורל התא על ידי ויסות מסלולי אפופטוטיה, וכן כאותות ROS ו-Ca+2 1. לכן, תפקוד לקוי של המיטוכונדריה עלול להוביללמחלות נוירודגנרטיביות, שריריות וכלי דם שונות. למרות התפקיד הקריטי של המיטוכונדריה בהתקדמות המחלה, הערכת תפקוד המיטוכונדריה יכולה להיות פולשנית, יקרה ומוגבלת.
מדדים מרכזיים לתפקוד המיטוכונדריה, כגון קצב צריכת חמצן, פוספורילציה חמצונית ופעילות של קומפלקסים שונים בשרשרת העברת האלקטרונים (ETC), נמדדים באמצעות רספירומטריה. ה-ETC מורכב מארבעה קומפלקסים (I–IV) המשובצים בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה (IMM). קומפלקסים אלו, בעזרת קו-אנזימים אחרים, מעבירים אלקטרונים מסובסטרטים מצומצמים, כגון NADH ו-FADH2, למקבל האלקטרונים הסופי, O2, שהופך למים. רוב בדיקות הספירומטריה העכשוויות, כמו Seahorse ו-Orobros O2k, דורשות עיבוד רקמות, מה שמגביל את יישמתן למחקר תרגומי 4,5. מדידת פוטנציאל ממברנה מיטוכונדריאלית (MMP) היא שיטה נוספת להערכת תפקוד לקוי של המיטוכונדריה, המשתמשת בפלואורופורים ליפופיליים קטיוניים, כגון JC-1, יחד עם הדמיה מיקרוסקופית, כאשר הפיצוץ של מיטוכונדריה (בריאה) ובלתי מזווגת (פגועה) עם אורכי גל שונים6. עם זאת, בדיקות אלו יכולות להיות בעלות רגישות נמוכה5. הצבע עצמו יכול גם להיות בעל ציטוטוקסיות גבוהה בריכוזים גבוהים5. לבסוף, בדומה למדידות רספירומטריה, גם טכניקה זו דורשת עיבוד רקמה. טכניקות מבוססות ספקטרוסקופיה שימשו לאחרונה כשיטות לא פולשניות להערכת בריאות המיטוכונדריה. לדוגמה, ספקטרוסקופיית תהודה מגנטית זרחן (P-MRS), שיטה שמעריכה את חילוף החומרים התאים על ידי מדידת ריכוזי מטבוליטים המכילים זרחן, שימשה לאפיון רקמות אדיפוגניות מהונדסות העוברות התמיינות7. עם זאת, טכניקה זו דורשת גם ציוד מיוחד והכשרה.
הקבוצה שלנו הדגימה לאחרונה טכניקה בזמן אמת, לא פולשנית ומאוד ספציפית למדידת מצב חמצון רדוקסי מיטוכונדריאלי כסמן לחיותם של איברים באמצעות ספקטרוסקופיית ראמן תהודה (RRS). RRS משתמש בפיזור לא אלסטי של פוטונים לכימות מצבי רדוקס של ציטוכרומים מיטוכונדריאליים. טבעות פורפירין בקטעי המים של מולקולות כמו ציטוכרומים מיטוכונדריאליים, המוגלובין ומיוגלובין מייצרות ספקטרום ראמן אופייני בהתאם למצב החמצון שלהן כאשר הן מעוררותעם לייזר באורך גל של 441 ננומטר. למרות שמערכת RRS עושה שימוש באורך גל של 441 ננומטר, ניתן להשתמש גם בלייזרים עם אורכי גל של 420 ננומטר ו-405 ננומטר, שכל אחד מהם מחזק באופן מועדף קומפלקס ציטוכרום שונה. הספקטרום המתקבל מדגימה לא ידועה מושווה לספריות מוקלטות מראש של מיטוכונדריה שלמה מחומצנת לחלוטין או מופחתת, ומניבה את היחס בין מיטוכונדריה מצומצמת לכלל או את מצב הרדוקס הממוצע של ציטוכרומים ETC במקום . יחס זה מוגדר כיחס מיטוכונדריה מופחת של רמאן רזוננס (3RMR).
ישנם 3 חישובים/סוגים מובחנים של 3RMR: 3RMR מיטוכונדריאלי (mito-3RMR), 3RMR מרוכב III (cIII-3RMR), ו-3RMR מרוכב IV (cIV-3RMR). כל אחד מהאינדקסים הללו מחושב דרך השבר של המוקטן למספר הכולל של רכיב נתון. לדוגמה, ה-3RMR של cIII יהיה היחס בין cIII מופחת למספר הכולל של cIII ברקמה (cIII-R/(cIII-O+CIII-R). אותו דפוס חל גם על cIV. לכן, 3RMR-cIII מתייחס ליחס בין cIII מופחת לכמות הכוללת של cIII, ו-3RMR-cIV מתייחס ליחס בין cIV המופחת לכמות הכוללת של cIV. באמצעות ניתוח רגרסיה, או שמצבי רדוקס מיטוכונדריאלי (מיטו-3RMR) מחושבים באמצעות ספריות ספקטרליות של מיטוכונדריה שלמה, או שמצבי רדוקס מורכבים בודדים (cIII-3RMR ו-cIV-3RMR) מחושבים באמצעות ספריות ספקטרליות cIII ו-cIV. פרסום עדכניבשם 9 הראה שמיטו-3RMR מייצג את הממוצע המשוקלל של מצבי החמצון האדום cIII ו-cIV (או cIII-3RMR ו-cIV-3RMR). חשוב לציין ש-cI ו-cII אינם פעילים ברמן או מוגברים בתהודה לאורך הגל של 441 ננומטר. כתוצאה מכך, הם אינם מחושבים בעת חישוב ה-mito-3RMR.
בהסתמך על סוגי 3RMR אלו, הגדרנו את טווח האופטימלי של 3RMR. באיברים "בריאים", המיטוכונדריה שלמה ויש לה אספקת חמצן מספקת. לעומת זאת, איברים פגועים עלולים לספק או לנצל חמצן בצורה לא מספקת, מה שגורם להצטברות אלקטרונים בקומפלקסים של ETC. הצטברות אלקטרונים גורמת ל"מאמץ רדוקטיבי," שמעביר את המיטוכונדריה ממצב מחומצן למצב מופחת ומעלה ערכי 3RMR. מספר מחקרים 8,9,10,11,12 הנעים מלב וכבד במודלים של מכרסמים וחזיר, החלו להאיר את טווח ה"בריא" האופטימלי ל-3RMR, שמוצע להיות בין 10 ל-30. לדוגמה, פרי ואח' חשפו היפוקסיה בלבבות יונקים, כאשר 3RMR של 30% הוכח כמספק את האיזון האופטימלי לרגישות ולספציפיות לזיהוי רקמה היפוקסית8. מגמה זו אושרה עוד יותר במחקרים נוספים עם רקמת לב11,12, ושתלי כבד10. בנוסף, ניוגן ואח' הראו שערכי 3RMR יורדים לערכים נמוכים מאוד (מחומצנים) ברקמות שבהן המטבוליזם נעצר, עם רמות 3RMR (7.667 ±± 4.926) של כבדים חמים-איסכמיים שאינם ניתנים להשתלה לאחר 3 שעות של פרפוזיה נורתורמית במכונה, לעומת ערכי 3RMR מעל 10 (~12–15) עבור כבדים חמים-איסכמיים טרייםוניתנים להשתלה 9.
מעבר להדגמות אלו של האופן שבו 3RMR יכול למדוד את חיוניות הרקמות, הרגישות, הספציפיות והקלות בשימוש ב-RRS הופכים אותו לרלוונטי מאוד לסוגי מחקר רבים אחרים שבהם מטבוליזם תאי ותפקוד מיטוכונדריה מושפעים. במחקרים קודמים, RRS שימש לזיהוי ניוון מקולרי וגלאוקומה בעכברים באמצעות הערכת הפעילות המטבולית של אקסונים לא מיאליניים של תאי גנגליון רשתית בראש עצב הראייה13. בנוסף, הוא שימש לזיהוי קוארקטציה של האאורטה (CoA) במודל חולדה של מחלת לב מולדת, אבחנה שלעיתים קרובות מתפספסת בסריקות לב של תינוקות12. טכנולוגיה זו נוצלה להבנת תפקוד האיברים וחיוניותם בתנאים ניסיוניים שונים הרלוונטיים בתחום השתלת איברים, כולל מחקרים שהעריכו את חיוניות האיברים במכשיר ex vivo 10,11, מעריכים חמצון מחדש לאחר אחסון קר סטטי14, או מפחיתים פגיעת רפרפווזיה בכבד חם-איסכמי9.
מאמר זה שואף לבסס את RRS ככלי רגיש בזמן אמת להערכת בריאות המיטוכונדריה. כבד שלם ממודל עכברוש עבר רמות שונות של איסכמיה וריפרפוזיה של חמצן כמבחן מאמץ להערכת תגובת המיטוכונדריה. בבדיקת לחץ חמצן זו, כבד טרי עובר 5 דקות של זרימת פרפוזיה ראשונית, 5 דקות של איסכמיה ו-5 דקות של רפרוזיה. 3RMR, וכן מדידות לקטט, K+, לחץ חלקי של חמצן (pO2) נערכו לאורך כל מבחן המאמץ. תגובה מהירה יותר לשינויים בחמצון נצפתה עם 3RMR בהשוואה לאנליטים מסורתיים של גזי דם. בניסויים אלו, השימוש ב-RRS מודגש לא רק למחקרים מכניים, אלא גם כשיטה אבחנתית וכבסיס ניסוי טיפולי. לכן, הפרוטוקול המשותף עשוי להיות שימושי למגוון חוקרים העובדים עם מיטוכונדריה. בסך הכל, RRS, בשל אופיו הלא-פולשני, בזמן אמת וספציפי מאוד, עשוי להשפיע משמעותית על חילוף החומרים התאי.