מקור הנתונים ואסטרטגיית החיפוש
כדי לשפר את הכיסוי ולהפחית הטיית מקורות בספרות, נבדקו ארבעה מאגרי מידע אלקטרוניים: Web of Science (כולל Web of Science Core Collection, WoSCC), PubMed, Scopus ו-Embase. תקופת הפרסום הוגבלה ל-1 בינואר 2016 ועד 31 בדצמבר 2025. רק מאמרי מחקר מקוריים ומאמרי סקירה שנכתבו באנגלית נכללו. מונחי החיפוש התמקדו בשני מושגים: "סוכרת" (DM) ו"תכנות מחדש מטבולי". אסטרטגיות החיפוש וכל קריטריוני ההדרה ששימשו במהלך תהליך הסינון מסוכמים באיור 1.
מחרוזות החיפוש המדויקות ששימשו לכל מסד נתונים מוצגות להלן:
רשת המדע (WoSCC):
TS=((סוכרת או "סוכרת" או "סוכרת סוג 1" או "סוכרת סוג 2" ) ו-("תכנות מחדש מטבולי" או "עיצוב מטבולי" או "מטבוליזם של גלוקוז" או "אפקט וורבורג" או "מטבוליזם תאי" או "תפקוד לקוי של מיטוכונדריה"))
*מסננים: שנות פרסום: 2016-2025; סוגי מסמכים: מאמר, ביקורת; שפה: אנגלית.*
PubMed:
("סוכרת"[כותרת/תקציר] או "סוכרת סוג 2"[כותרת/תקציר] או "סוכרת סוג 1"[כותרת/תקציר] או "T2DM"[כותרת/תקציר] או "T1DM"[כותרת/תקציר]) ו-("תכנות מחדש מטבולי"[כותרת/תקציר] או "תכנות מחדש מטבולי"[כותרת/תקציר] או "עיצוב מטבולי"[כותרת/תקציר] או "אפקט וורבורג"[כותרת/תקציר] או "חילוף חומרים תאי"[כותרת/תקציר] או "חילוף חומרים תאי"[כותרת/תקציר] או "תפקוד מיטוכונדריאלי לקוי"[כותרת/תקציר])
*מסננים: תאריך פרסום: 2016/01/01 – 2025/12/31; סוג מאמר: מאמר, ביקורת; שפה: אנגלית.*
סקופוס:
TITLE-ABS-KEY ("diabetes mellitus" או "diabetes" או "סוכרת סוג 1" או "סוכרת סוג 2" או "T1DM" או "T2DM") ו-ABS-key ("תכנות מחדש מטבולי" או "תכנות מחדש מטבולית" או "תפקוד מיטוכונדריאלי לקוי" או "עיצוב מטבולית" או "אפקט וורבורג")
*מסננים: שנת פרסום: 2016-2025; סוג מסמך: מאמר, ביקורת; שפה: אנגלית.*
Embase:
('סוכרת מליטוס'/ניסיון או 'סוכרת מליטוס':ab,ti או 'סוכרת סוג 2':ab,ti או 'סוכרת סוג 1':ab,ti) וגם ('תכנות מחדש מטבולי':ab,ti או 'תכנות מחדש מטבולי':ab,ti או 'אפקט וורבורג':ab,ti או 'עיצוב מטבולי':ab,ti)
*מסננים: שנת פרסום: 2016-2025; סוגי מסמכים: מאמר, ביקורת; שפה: אנגלית.*
כל קריטריוני ההדרה ששימשו במהלך תהליך הסינון מסוכמים באיור 1. הרשומות שנאספו מכל מסד נתונים יוצאו בפורמט טקסט פשוט, כולל מידע ביבליוגרפי מלא (כותרת, מחברים, כתב עת, שנת פרסום, תקציר, מילות מפתח ומקורות מצוטטים).
הסרת שכפול ותהליך סינון ידני
כדי להבטיח שחזוריות, אומצה תהליך הסרת שכפול וסינון ידני בשלב שלבי: ראשית, כל קבצי הטקסט הפשוטים שיוצאו מארבעת מסדי הנתונים יובאו לתוכנת ניהול הפניות, והסרת שכפול אוטומטית בוצעה באמצעות פונקציית "הפניות > מציאת כפילים"; לאחר מכן, הרשומות המשוכפלות יוצאו לפורמט Excel באמצעות סגנון הייצוא "הצג את כל השדות" וסונקו ידנית על בסיס כותרות ותקצירים. קריטריוני ההכללה היו מחקרים מקוריים או מאמרי סקירה שעסקו בבירור בסוכרת (כל סוג) ותכנות מחדש מטבולי (כולל גליקוליזה, זרחון חמצוני, אפקט וורבורג או הסתגלות מטבולית מיטוכונדריאלית), שנכתבו באנגלית. קריטריוני ההדרה כללו מאמרי מערכת, מכתבים לעורך, תקצירי כנס, דוחות מקרה, מחקרים בבעלי חיים שאינם קשורים לבני אדם, ומחקרים שהתמקדו אך ורק בתסמונת מטבולית מבלי להתמודד עם סוכרת. בסופו של דבר, 6,864 רשומות נכללו בניתוח הביבליומטרי (קובץ משלים 1).
תוכנה ומתודולוגיות לניתוח ביבליומטרי
מחקר זה השתמש בשלושה כלים לניתוח ביבליומטרי (טבלת חומרים) כדי לבחון באופן שיטתי מחברים, מוסדות, מקורות, כותרות, מילות מפתח, מקורות מצוטטים ומידע מפורט נוסף מהמאמרים. הנתונים הגולמיים של 6,864 המחקרים (קובץ משלים 1) שימשו כקלט לכל שלושת כלי התוכנה. תוכנת ביבליומטריה #1 היא כלי תוכנה חופשית מבוסס Java המסייעת לחוקרים בניתוח, המחשה ופרשנות של ספרות אקדמית, רשתות ידע, יחסי שיתוף פעולה ומוקדי מחקר13. תוכנת ביבליומטריקה #2 היא כלי ויזואליזציה לביבליומטריקה מדעית ומיפוי ידע, המשמשת בעיקר לחשיפת מגמות פיתוח, מוקדי מחקר ורשתות שיתופיות בתחומים אקדמיים14. תוכנת ביבליומטריה #3 היא חבילת R לניתוח סיינטומטרי ומיפוי ידע, המשמשת לייבוא, ניתוח והמחשה של נתונים ביבליוגרפיים15. נהלי התפעול המפורטים והגדרות הפרמטרים הספציפיות לכל תוכנה מסופקים בטבלת החומרים.