הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

זיהוי מהיר בנקודת הטיפול (Point-of-Care) של פתוגנים הגורמים לזיהומים בדרכי הנשימה התחתונות במטופלי טיפול נמרץ

649 צפיות

⸱

DOI:

10.3791/71534

⸱

19 בספטמבר 2026

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 

* These authors contributed equally

במאמר זה

סיכום

פרוטוקול זה מתאר שיטה מבוססת שבב מיקרופלואידי משולב למגבור איזותרמי באמצעות לולאה (LAMP), המאפשרת זיהוי בנקודת הטיפול של 15 פתוגנים הגורמים לזיהומים בדרכי הנשימה התחתונות אצל חולי טיפול נמרץ תוך שעה אחת.

תקציר

זיהומים של דרכי הנשימה התחתונות (LRTIs) הם מהגורמים המובילים להידרדרות קלינית ולמוות בקרב חולים במצב קריטי. ביחידה לטיפול נמרץ (ICU), זיהוי מהיר של הפתוגן הגורם לזיהום חיוני למתן טיפול אנטימיקרוביאלי הולם; עם זאת, שיטות תרבית קונבנציונליות דורשות 3 עד 5 ימים ובעלות שיעורי חיוביות שאינם אופטימליים, במיוחד עבור פטריות. גישות מולקולריות כגון PCR מקצרות את זמן התוצאה אך עדיין תלויות במיצוי ידני של חומצות גרעין ובמעגלי טמפרטורה (thermocycling), מה שמגביל את התאמתן לשימוש לצד מיטת החולה. פרוטוקול זה מתאר זרימת עבודה של בדיקה בנקודת הטיפול (point-of-care) המבוססת על שבב מיקרופלואידי אינטגרלי בצורת דיסק (CD chip), המשלב טיהור חומצות גרעין מבוסס חרוזי מגנט עם הגברה איזותרמית באמצעות לולאה (LAMP). לאחר שלב מפושט של הנזלה וליזיס ידנית, הדגימה המעובדת נטענת על השבב יחד עם שני מבחולי ריאגנטים ארוזים מראש. המכשיר מבצע לאחר מכן באופן אוטונומי מיצוי, הגברה ב-65 °C וקריאת פלואורסצנציה בזמן אמת, ומספק תוצאות איכותיות עבור 15 מטרות, הכוללות 11 חיידקים, 3 פטריות ופתוגן לא טיפוסי אחד, בתוך 45 min של זמן ריצת המכשיר (כ-1 h עבור זרימת העבודה המלאה מהדגימה לתשובה, כולל שלב עיבוד המדגם הידני). אנו מציגים נתוני זיהוי מ-10 דגימות מ-ICU, כולל ליחה, שאיפות סימפוניות ונוזל שטיפת סימפונית-נאשית (BAL), המקיפות הן זיהומים של פתוגן בודד והן זיהומים פולימיקרוביאליים המערבים עד 7 אורגניזמים על שבב בודד. עיצוב המחסירה הסגורה ממזער את הסיכון לזיהום באמצעות רסס (aerosol), ושלב הטעינה הבודד אינו דורש הכשרה מיוחדת, מה שממצב מערכת זו ככלי אבחון מעשי לצד מיטת החולה עבור צוותי ה-ICU.

מבוא

בקרב חולים במצב קריטי ביחידה לטיפול נמרץ (ICU), זיהומים בדרכי הנשימה התחתונות, כאשר דלקת ריאות הקשורה למסייע נשימה (VAP) היא העיקרית שבהם, נותרים גורם מתמיד לתחלואה, להארכת ההנשמה המכנית ולעלייה בתמותה1,2. המפה המיקרוביולוגית של זיהומים בדרכי הנשימה התחתונות (LRTIs) שנרכשו בטיפול נמרץ שונה באופן ניכר מזו של מחלות שנרכשו בקהילה. חיידקים גרם-שליליים עמידים לריבוי תרופות (Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii) הם השולטים, לעיתים קרובות כחלק ממקבצים פולימיקרוביאליים המסבכים את משטרי הטיפול האמפיריים3,4. פטריות אופורטוניסטיות מוסיפות רובד נוסף של מורכבות. אספרגילוזיס ריאתי פולשני, שנחשב בעבר למאפיין של דיכוי חיסוני עמוק, מזוהה כיום בתדירות גוברת בחולי טיפול נמרץ שאינם נויטרופנים, ובמיוחד לאחר שפעת חמורה ו-COVID-195. אלגוריתמים אבחנתיים קיימים לאספרגילוזיס משלבים תרבית בעלת נבחה נמוכה עם בדיקה לנוגדן גלקטומנאן (GM), אך בדיקת ה-GM מוגבלת על ידי חלונות אבחנתיים מתועדים היטב ורגישות משתנה במארחים שאינם נויטרופנים6. כל שעת עיכוב בתחילת טיפול אנטימיקרוביאלי מתאים לאלספסיס קשורה לעלייה מדידה בתמותה7. יחד, המהירות והמורכבות של זיהומי טיפול נמרץ מחייבות כלים אבחנתיים שיכולים לעמוד בדרישה הקלינית הדחופה.

תרבית מיקרוביולוגית סטנדרטית, למרות היותה חיונית לבדיקות רגישות, מוגבלת מהותית מקצב הביצוע: זמן התוצאות נמשך 3 עד 5 ימים, מיקרואורגניזמים תובעניים (fastidious) מתפספסים, ושיעור החיוביות של תרביות פטריות נותר נמוך8. רצף דור הבא מטא-גנומי (mNGS) מציע חלופה לא מוטה, אך אימוצו הקליני מוגבל בשל עלויות, זמני עיבוד של 24 עד 48 שעות, הסתמכות על צינורות עיבוד ביו-אינפורמטיים וישימות מוגבלת בנקודת הטיפול (point-of-care)9. פאנלים מבוססי PCR צמצמו את פער הזמנים, אך הם עדיין דורשים הפקת חומצות גרעין רב-שלבית, מכשור למחזורי תרמי (thermal cycling) ובפורמטים קונבנציונליים, גםת אספורזה פוסט-אמפליפיקציה10. אף אחת מפלטפורמות אלו אינה עונה במלואה לדרישות המצטברות של מחלקת טיפול נמרץ (ICU): מהירות של פחות משעה, זמן עבודה ידני מינימלי, כיסוי פתוגנים מרובה (multiplexed) כולל פטריות, ופשטות תפעולית המספיקה עבור צוות שאינו אנשי מעבדה.

הגברה איזותרמית מתווכת לולאה (LAMP) נותנת מענה למספר מהמגבלות הללו. השיטה, שתוארה לראשונה על ידי Notomi et al., מגבירה DNA מטרה בטמפרטורה קבועה של 65 °C באמצעות סט של ארבעה עד שישה פריימרים המזהים שישה אזורים מובחנים, המונעת על ידי פולימרזה בעלת יכולת החלפת גדיל11. התגובה מייצרת מבני אמפליקון אופייניים מסוג לולאה-גבעול (stem-loop) ומבנים דמויי כרובית, הניתנים לזיהוי באמצעות פלואורסצנציה בזמן אמת, המניבים עקומות בצורת S תוך דקות ספורות מחציית הסף. הרגישות בריכוזי תבנית נמוכים היא גבוהה, ותכנון הרב-פריימר מעניק סלקטיביות המגבילה תוצאות חיוביות שגויות12,13. כאשר היא משולבת עם פלטפורמות של שבבי מיקרופלואידיקה, ניתן להריץ LAMP במקביל עבור מספר מטרות מדגימה בודדת14. עבודות קודמות הראו כי מערכות שבבי LAMP מזהות פתוגנים נשימתיים עם זמן תגובה קצר בהרבה משלוש שעות15. עם זאת, מגבלה מרכזית של מערכות אלה היא התלות בתהליך נפרד וידני של מיצוי DNA, המוסיף זמן, מורכבות תפעולית וסיכון לזיהום.

המערכת המתוארת כאן מבטלת צוואר בקבוק זה. המערכת, הבנויה סביב שבב מיקרופלואידי חד-פעמי בצורת דיסק (בקוטר 86 mm), משלבת טעינת דגימה, טיהור חומצות גרעין מבוסס חרוזיים מגנטיים והגברה מסוג 16-plex LAMP בתוך מחסנית אטומה אחת (איור 1). המפעיל מבצע רק שלב קצר של הנזלה-ליזיס ידני באמצעות צינור עיבוד שתוכנן למטרה זו, ולאחר מכן טוען את הליזט ושני מבחלי ריאגנטים אל השבב (איור 2). מנקודה זו ואילך, המכשיר מבצע באופן אוטונומי את המיצוי, הגברה איזותרמית ב-65 °C ורכישת פלואורסצנציה, ומספק תוצאות איכותיות עבור 15 מטרות בעלות רלוונטיות קלינית: 11 חיידקים, 3 פטריות (Aspergillus spp., Candida albicans, Pneumocystis jirovecii), ופתוגן שאינו טיפוסי אחד (Mycoplasma pneumoniae), בתוך 45 min. גן ממשפחת neuroblastoma breakpoint family (NBPF) המשמש כבקר פנימי מהליך תיקוף את הלימות הדגימה ואת שלמות התגובה בכל בדיקה. פרוטוקול זה מספק הוראות שלב-אחר-שלב לכל זרימת העבודה, החל מאיסוף דגימות ביחידה לטיפול נמרצים (ICU), דרך עיבוד מקדמי, טעינת שבב, זיהוי אוטומטי ופירוש התוצאות, והוא מיועד הן לצוותי מעבדה קלינית והן לצוותים לצד מיטת החולה ביחידה לטיפול נמרצים.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

כל הדגימות נאספו תחת פרוטוקול שאושר על ידי ועדת הבקרת האתיקה של בית החולים של Peking Union Medical College, האקדמיה הסינית למדעי הרפואה (מספר אישור I-24PJ1778). הסכמה מודעת בכתב התקבלה מכל משתתף או מנציגו המורשה על פי חוק לפני איסוף הדגימות. פאנל הפתוגנים המטרה והקצאות בארי בארי התגובה מפורטים ב- טבלה 1, והחומרים המתכלים ששימשו במהלך עיבוד המדגמים מפורטים ב- טבלה 2.

1. איסוף דגימות קליניות מהדרכים הנשימיות התחתונות ביחידה לטיפול נמרץ (ICU)

  1. איסוף ליחה
    1. שטפו את חלל הפה במים נקיים או בתמיסת סליין פיזיולוגית סטרילית שלוש פעמים כדי להסיר שאריות מזון ופלורה פהית קומנסלית.
    2. הנחו את המטופל לנשום שלוש עד שתי נשימות עמוקות, ולאחר מכן להשתעל בעוצמה כדי להוציא ליחה מדרכי הנשימה העמוקות ישירות לכלי איסוף סטרילי.
      הערה: דגימה קבילה מורכבת מחומר צמיגי, מוגלתי או עם פסי דם המגיע מאזור מתחת לקנה הנשימה; רוק צלול או נזלת המטפטפת מהאף לגרון אינם מספיקים ועשויים לפגוע בזיהוי בהמשך התהליך.
  2. איסוף שאיבות ברונכיאליות (BAS)
    1. עבור מטופלים שאינם מחוברים למנשם, הכניסו קטטר שאיבה סטרילי (קטטר 10–12 Fr, כאשר מקור השאיבה מוגדר ללחץ של −0.0267 MPa, שווה ערך ל-−200 mmHg) דרך הנתיב הנזאלי או האורלי לעומק של כ-30 cm.
    2. הפעילו שאיבה תוך כדי סיבוב הקטטר והוציאו את הקטטר באיטיות. אספו את ההפרשות שנשאבו למלכודת דגימות סטרילית.
      הערה: אם ההפרשות דלילות, הכניסו כ-5 mL של סליין סטרילי דרך הקטטר לפני השאיבה.
    3. עבור מטופלים במנשם מכני, בחרו את קטטר השאיבה בהתאם לגודל התוכן האנדוטראכאלי: השתמשו בקטטר 10 Fr עבור צינור של 7.0–7.5 mm ובקטטר 12 Fr עבור צינור של 8.0 mm.
    4. בצעו חמצנון מקדים למטופל עם 100% חמצן למשך 30–60 s לפני השאיבה. נתקו את מעגל המנשם והכניסו את הקטטר הנבחר דרך נתיב הנשימה המלאכותי עד למפגש עם התנגדות.
    5. הפעילו לחץ שלילי של −0.0267 MPa (שווה ערך ל-−200 mmHg), תוך הגבלת כל שלב שאיבה, ובכך גם את זמן ניתוק המנשם, למשך לא יותר מ-15 s כדי למזער דה-רקרוטמנט (derecruitment) והיפוקסמיה, וחמצנו שוב את המטופל ב-100% חמצן למשך 30–60 s לאחר השאיבה.
    6. הכניסו 1–2 mL סליין סטרילי דרך הקטטר והמתינו 3 s.
    7. הפעילו שאיבה והוציאו את הקטטר. אספו את ההפרשות שנשאבו למלכודת דגימות סטרילית. חברו מחדש את מעגל המנשם מיד לאחר איסוף הדגימה.
      הערה: טכניקת אספטיקה קפדנית חיונית לאורך כל התהליך כדי למנוע זיהום נשגב (נוזוקומיאלי) של הדגימה.
  3. איסוף נוזל שטיפה ברונכואלוולארית (BALF)
    1. זהו את הסגמנט המטרה בדימות חזה. הלהיקו את הברונכוסקופ והנחיתו אותו בתוך הברונכוס הסגמנטלי או הסוב-סגמנטלי המתאים.
    2. הזריקו במהירות מנות של 20–50 mL סליין סטרילי, במשך 3–5 מנות (סה"כ 60–120 mL). הפעילו שאיבה עדינה לאחר כל מנה, ולאחר מכן אספו את הנוזל שהוחזר למכל סטרילי ואטום.
      זהירות: ניטור המודינמי ונשמתי רציף הוא חובה במהלך BAL במטופלי טיפול נמרץ. התאימו את הגדרות המנשם לפי הצורך עבור נבדקים במנשם מכני.
      הערה: החזרה טיפוסית היא 40–60% מהנפח שהוזרק. החזרה דלה עשויה להצריך מיקום מחדש של קצה הברונכוסקופ.

2. הנזלה וליזיס של פתוגנים

  1. באמצעות פיפטה חד-פעמית מס' 2, שאבו את הדגימה עד לקו המסומן (בערך 1 mL) והעבירו אותה למבחורת ההנזלה. לחצו על בלב הפיפטה מספר פעמים כדי להעביר את כל החומר הצמיגי, ולאחר מכן סגרו את המבחורה במכסה.
    הערה: עבור BALF או ליחה מימית, העבירו שני נפחי פיפטה כדי להבטיח כמות מספקת של פתוגנים.
  2. נערה את מבחורת ההנזלה בעוצמה ביד למשך 1 דקה. בחנו את הדגימה חזותית והמשיכו לנער עד שלא יישארו גושי ריר נראים והדגימה תזרום בחופשיות דרך פיפטה חד-פעמית מס' 1 ללא התנגדות (סמיכות אחידה דמוית מים). נערה למשך 1 דקה לפחות, והאריכו את הזמן לפי הצורך עבור דגימות בעלות צמיגות גבוהה עד להשגת קריטריונים אלו.
  3. פתחו את מכסה האיטום של מבחורת הליזיס.
  4. שאבו בערך 0.5 mL מהדגימה ההומוגנית באמצעות פיפטה חד-פעמית מס' 1 והעבירו את הדגימה למבחורת הליזיס.
  5. סגרו את מכסה האיטום וודאו שראש המכסה מהודק היטב.
  6. הניחו את מבחורת הליזיס במכשיר עיבוד הדגימות המקדים (SP device), תוך לחיצה כלפי מטה עד לקיבועה. לחצו על Start.
  7. המתינו לסיום מחזור ההנזלה-ליזיס האוטומטי של מכשיר ה-SP (הפרמטרים מופיעים ב-Table 3), הנמשך כ-15 דקות.
    הערה: אין לפתוח או להוציא את המבחורה במהלך העיבוד.

3. טעינת השבב וגילוי אוטומטי

  1. טעינת ריאגנטים ודגימות
    1. הוציאו את שבב ה-CD מהאחסון בטמפטורה של 4 °C והמתינו להגעה לשיווי משקל בטמפרטורת החדר (בערך 25 °C) במשך 10 דקות.
      ​הערה: מבחנות הריאגנטים O ו-B והליזאט שעבר עיבוד מקדים משמשים בטמפרטורת החדר; הגברת ה-LAMP על השבב מבוצעת בטמפרטורה של 65 °C (ראו שלב 3.2.3 ו-טבלה 3).
    2. פתחו את נרתיק הרבדי והניחו את השבב על משטח שטוח.
    3. סובבו את המכסה נגד כיוון השעון כדי לפתוח את השבב.
    4. נערה קלות את מבחנה O כדי לרכז את הנוזל בתחתית המבחנה.
    5. פתחו את מכסה מבחנה O, הכניסו את הדיזה לתוך יציאה O, והעבירו את כל התוכן לתוך היציאה.
    6. השליכו את מבחנה O. חזרו על הפרוצדורה באמצעות מבחנה B ויציאה B.
    7. הוציאו את מבחנת הליזיס המעובדת ממכשיר ה-SP והסירו את מכסה הקצה.
    8. יישרו את קצה המבחנה עם יציאה S והעבירו את כל נפח הליזאט לתוך השבב.
    9. השליכו את מבחנת הליזיס המשומשת.
    10. סובבו את מכסה השבב עם כיוון השעון עד ששני נקישים נשמעים ומאשרים אטימה מלאה.
      הערה: טעינה חלקית של אחת היציאות עלולה לגרום לכשלים בערוצים בודדים. ודאו ריקון מלא לפני האיטום. כדי למנוע איטום חלקי וסיכוני זיהום, אין להשתמש בכפפות PE בעת איטום המכסה; מומלץ להשתמש בכפפות לטקס או ניטריל במקום זאת.
  2. הפעלת המכשיר
    1. הפעילו את המנתח האוטומטי לחומצות גרעין. הקישו על Detect, סרקו את הברקוד שעל נרתיק הרבדי של השבב, והזינו את הפרטים הדמוגרפיים של המטופל ואת מזהה הדגימה.
    2. הרכיבו את השבב על הציר המסתובב ולחצו למטה עד שנקיש מאשר את החיבור.
    3. הקישו על Start. המכשיר מבצע באופן אוטונומי חלוקת ריאגנטים צנטריפוגלית, מיצוי באמצעות חרוזיים מגנטיים, הגברת LAMP בטמפרטורה של 65 °C ורכישת פלואורסנציה. זמן ההרצה הוא בערך 45 דקות (סיכום של טעינת הריאגנטים/דגימות וזרימת העבודה של המכשיר מופיע ב-איור 3).
      הערה: אין לפתוח את המכסה במהלך ההרצה.
  3. פירוש התוצאות
    1. התוכנה מזהה את נקודת ההשen (inflection point) של כל עקומת הגברה בצורת S באמצעות ניתוח מקסימום נגזרת שנייה ומדווחת על ערך ה-TP התואם (זמן עד לחיוביות).
    2. השוו כל ערך TP לסף התואם הרשום ב-טבלה 4. סווגו ערוצים עם ערכי TP השווים לסף או נמוכים ממנו כחיוביים, וערוצים עם ערכי TP מעל הסף כשליליים.
    3. וודאו שערוץ הבקרה הפנימי (באר 16) מראה עקומת הגברה בצורת S עם ערך TP נמוך מ-12 דקות.
    4. פסלו את ההרצה אם הבקרה הפנימית נכשלה. חזרו על הבדיקה באמצעות שבב חדש או אספו מחדש את הדגימה.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

עם השלמת הרצה תקפה, המכשיר הציג עקומות פלואורסצנציה בזמן אמת עבור כל 16 הערוצים. ערוצים חיוביים הראו קינטיקת הגברה בצורת S הצפויה, עם ערכי TP מסומנים אוטומטית, בעוד שערוצים שליליים נשארים בקו הבסיס. ערוץ ה-IC (באר 16) הניב עקומה בצורת S עם TP < 12 min בכל ההרצות התקפות.

כהדגמה ראשונית להוכחת ההיתכנות (proof-of-concept) של הפרוטוקול, נבחרו 10 דגימות מייצגות כדי להדגים את מגוון התרחישים הקליניים הנפוצים בפרקטיקה של יחידה לטיפול נמרץ (ICU), כולל 6 שאיבות סימפוניאליות (BAS), 2 דגימות של נוזל שט...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

זיהוי מהיר של פתוגנים הוא קריטי לניהול זיהומים ביחידה לטיפול נמרץ (ICU). המערכת המתוארת כאן מקצרת את הזמן עד לזיהוי הפתוגן מ-3 עד 5 הימים הדרושים בדרך כלל לתרבית לפחות משעה אחת, מסגרת זמן שבה מתקבלות לעיתים קרובות החלטות לגבי טיפול אנטימיקרוביאלי בקו ראשון7. על ידי שילוב של מיצוי חומצות גרעין, טהרה והגברה של 16-plex LAMP בתוך שבב אטום אחד, זרימת עבודה זו מבטלת את שלב מיצוי ה-DNA הידני, שהיה צוואר הבקבוק התפעולי העיקרי של פלטפורמות שבבי LAMP מוקדמות יותר15. התוצאה היא הליך ט...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי אינטרסים.

תודות

פרויקט מדע וטכנולוגיה לאומי מרכזי למחלות כרוניות לא מדבקות (מס' 2023ZD0516500), מימון למחקר קליני בבית חולים ברמה גבוהה לאומית (2026-PUMCH-A-103), תוכנית תחרות פתוחה של CMB (24-561) ותוכנית לטיפוח כישרונות של בית החולים של המכללה הרפואית של בקינג יוניון (מס' UGG11571).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
מנתח חומצות גרעיניות אוטומטיBeijing Taihao Biotechnology Co., LtdTHE-T80-01TurboFlow T; מבצע חלוקת ריאגנטים בצנטריפוגה, מיצוי באמצעות חרוזי מגנט, LAMP ב-65 °C, וגילוי פלואורסצנציה בזמן אמת (זמן ריצה של כ-45 min)
פיפטת פסטור חד-פעמית מס' 1Zhongtai Experimental Equipment Factory (Haimen)Custom-madeמתכלה חד-פעמית; 0.5 mL; להעברת דגימה הומוגנית לשפופרת ליזיס
פיפטת פסטור חד-פעמית מס' 2Zhongtai Experimental Equipment Factory (Haimen)Custom-madeמתכלה חד-פעמית; 2 mL; לשאיבת דגימה עד לקו הסימון לתוך שפופרת הנזלה
דיסקית CD chipBeijing Hongyang Chensheng Technology Co., LtdCustom-madeמתכלה חד-פעמית; דיסקית בקוטר 86 mm עם אזור טעינה מרכזי (נמלי O, B, S), אזור טיהור בחרוזי מגנט, וטבעת חיצונית עם 16 בארי תגובה (15 מטרות פתוגנים + בקרת פנימית NBPF)
ריאגנטים לתגובת LAMPYeasen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd16730ES80ריאגנטים לתגובת LAMP המאוחסנים מראש בדיסקית ה-CD chip כחרוזים ליופילים
שפופרת הנזלהBeijing Taihao Biotechnology Co., LtdCustom-madeמתכלה חד-פעמית; 2 mL/tube; לקליטת דגימה לצורך הומוגניזציה ידנית
שפופרת ליזיסBeijing Taihao Biotechnology Co., LtdCustom-madeמתכלה חד-פעמית; 0.5 mL/tube; גוף סיליקון דחיס עם ממברנת סינון של 200 µm; מכילה ריאגנטים לליזיס המטוענים מראש
פריימריםSangon Biotech (Shanghai) Co., LtdCustom-madeתערובת פריימרים המוטמעת בתא התגובה של ה-CD chip
מכשיר להכנה מקדימה של דגימותBeijing Taihao Biotechnology Co., LtdTHE-R10-02TS-2000; מחזור הנזלה–ליזיס אוטומטי (כ-15 min)
בקבוקון למינון בודד “B”Ruifu Biotechnology (Guangzhou) Co., LtdCustom-madeמתכלה חד-פעמית; ריאגנט ארוז מראש על השבב; אחד לכל בדיקה; מאוחסן ב-4 °C ומובא לטמפרטורת החדר (כ-25 °C) לפני הטעינה
בקבוקון למינון בודד “O”Ruifu Biotechnology (Guangzhou) Co., LtdCustom-madeמתכלה חד-פעמית; ריאגנט ארוז מראש על השבב; אחד לכל בדיקה; מאוחסן ב-4 °C ומובא לטמפרטורת החדר (כ-25 °C) לפני הטעינה

מקורות

  1. GBD 2016 Lower Respiratory Infections Collaborators. Estimates of the global, regional, and national morbidity, mortality, and aetiologies of lower respiratory infections in 195 countries, 1990–2016: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2016. Lancet Infect Dis. 2018;18(11):1191-1210.
  2. Niederman MS, Torres A. Respiratory infections. Eur Respir Rev. 2022;31(166):220150.
  3. Weiser JN, Ferreira DM, Paton JC. Streptococcus pneumoniae: transmission, colonization and invasion. Nat Rev Microbiol. 2018;16(6):355-367.
  4. Reynolds D et al. The threat of multidrug-resistant/extensively drug-resistant gram-negative respiratory infections: another pandemic. Eur Respir Rev. 2022;31(166):220068.
  5. Schauwvlieghe AFAD et al. Invasive aspergillosis in patients admitted to the intensive care unit with severe influenza: a retrospective cohort study. Lancet Respir Med. 2018;6(10):782-792.
  6. Meersseman W et al. Galactomannan in bronchoalveolar lavage fluid: a tool for diagnosing aspergillosis in intensive care unit patients. Am J Respir Crit Care Med. 2008;177(1):27-34.
  7. Seymour CW et al. Time to treatment and mortality during mandated emergency care for sepsis. N Engl J Med. 2017;376(23):2235-2244.
  8. Noviello S, Huang DB. The basics and the advancements in diagnosis of bacterial lower respiratory tract infections. Diagnostics (Basel). 2019;9(2):37.
  9. Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019;20(6):341-355.
  10. Hanson KE et al. Molecular testing for acute respiratory tract infections: clinical and diagnostic recommendations from the IDSA's diagnostics committee. Clin Infect Dis. 2020;71(10):2744-2751.
  11. Notomi T et al. Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res. 2000;28(12):E63.
  12. Soroka M, Wasowicz B, Rymaszewska A. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): the better sibling of PCR? Cells. 2021;10(8):1931.
  13. Parida M et al. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): a new generation of innovative gene amplification technique; perspectives in clinical diagnosis of infectious diseases. Rev Med Virol. 2008;18(6):407-421.
  14. Ou H et al. Rapid detection of multiple pathogens by the combined loop-mediated isothermal amplification technology and microfluidic chip technology. Ann Palliat Med. 2021;10(10):11053-11066.
  15. Lai JX et al. Rapid detection of bacterial pathogens causing lower respiratory tract infections via microfluidic-chip-based loop-mediated isothermal amplification. J Vis Exp. 2024;(205):e66677.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

גלה מאמרים נוספים

זיהומים בדרכי הנשימה התחתונותזיהוי פתוגניםשבב מיקרופלואידיטיהור חומצות גרעיןהגברה איזותרמיתמיצוי באמצעות חרוזי מגנטאבחון לצד המיטהפתוגנים בדרכי הנשימה