$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
ה-d2EGFP-T2A-hTERT modRNA תוכנן כמסגרת קריאה פתוחה (ORF) היברידית, שבה רכיב דוחה (reporter) מסוג EGFP לא יציב (d2EGFP) קושר ל-TERT אנושי באמצעות פפטיד T2A בעל יכולת פיסול עצמי. הרצפים המלאים של הנוקלאוטידים והחלבונים עבור כל המבנים מופיעים ב-Supplementary File 1. רצף הקידוד היה מוקף על ידי אזור לא מתורגם (UTR) סינתטי ב-5′ ו-UTR של β-globin אנושי ב-3′ כדי להגביר את יעילות התרגום ואת יציבות ה-mRNA (איור 1A). קסטת הביטוי הכילה גם רצף מייצב אנזימים סינתטי (Es) ורצף מגביר שעתוק סינתטי (TEs), שנועדו לשפר את הפרוססיביות של T7 polymerase ולהפחית סיום שעתוק מוקדם. לאחר שיבוט במורד של פרומוטר T7, בוצע שעתוק in vitro תוך שימוש באנלוג לכובע נגד-היפוך (ARCA) ובנוקלאוטידים שעברו מודיפיקציה (m5CTP ו-ΨUTP), ולאחריהם הוספה אנזימטית של זנב poly(A) (כ-120–200 nt) כדי להפיק d2EGFP-T2A-hTERT modRNA בעל כובע, פוליאדנילציה ושלמות גבוהה (איור 1A).
ניתוח אלקטרופורטי אוטומטי של RNA אישר סינתזה יעילה של התמלול, וחשף סוג RNA דומיננטי בגודל הצפוי עם מינימום של תוצרי פירוק על פני כמויות קלט שונות, דבר העולה בקנה אחד עם ייצור מוצלח של modRNA באורך מלא (איור 1B). לאחר טרנספקציה של פיברובלסטים LF1 בשלב סניסנס מוקדם עם 2 µg/mL d2EGFP-T2A-hTERT modRNA, חלבון hTERT הפך ניתן לגילוי תוך 24 h ונשאר ברמה גבוהה למשך 48–96 h, מה שמעיד על תרגום מתמשך של התמלול הסינתטי (איור 1C). ניתוח של רפורטר d2EGFP המקושר העלה פלואורסצנציה חזקה לאחר טרנספקציה הפוכה (reverse transfection), בעוד שפלואורסצנציה נמוכה באופן משמעותי נצפתה לאחר טרנספקציה רגילה (forward transfection) (איור 1D,E). ממצאים אלו מעידים על שיפור בהגעה ובביטוי של hTERT modRNA באמצעות גישת הטרנספקציה ההפוכה בפיברובלסטים LF1 בשלב סניסנס מוקדם.
טרנספקציה קדימה (FT) חוזרת של פיברובלסטים מסוג LF1 בשלב סניסנס מוקדם עם modRNA של d2EGFP-T2A-hTERT במרווחי זמן של 5 ימים הובילה לעלייה הדרגתית באורך התלומרים הממוצע (rT/S) ביחס לבקרים שעברו טרנספקציה מדומה, כפי שנמדד באמצעות monochrome multiplex quantitative PCR (MMqPCR) (איור 2A). יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור FT, כאשר המובהקות הסטטיסטית השתפרה מ-*P < 0.05 ל-**P < 0.01.
יישום של אותו לוח זמנים למינון באמצעות טרנספקציה הפוכה (RT) הוביל לעלייה בולטת יותר באורך הטלומרים. יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור RT והגיע להבדלים מובהקים מאוד ביחס לבקרי ביקורת שעברו טרנספקציה מדומית (mock) (*P < 0.05 עד ****P < 0.0001) (איור 2B). השוואה ישירה בין FT ל-RT לאחר שלושה מחזורי טיפול הראתה ששתי הגישות העלו באופן מובהק את ערכי ה-rT/S ביחס לבקרי ביקורת שעברו טרנספקציה מדומית; עם זאת, RT הניבה עלייה גדולה יותר מאשר FT תחת תנאי מינון ותזמון זהים (*P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001) (איור 2C).
ניתוח גדילה לטווח ארוך הדגים עוד כי מתן חוזר של hTERT modRNA האריך את תוחלת השכפולים (איור 2D). תאים שקיבלו מחזור טיפול אחד, שניים או שלושה הראו מספר מצטבר של כפילויות אוכלוסייה הגבוה יותר באופן פרוגרסיבי בהשוואה לבקרי mock-transfected. תרביות שקיבלו שלושה סבבי טיפול של hTERT modRNA, במיוחד באמצעות RT, הראו את הסטייה הגדולה ביותר מעקומות הגדילה של הביקורת לאורך כ-250 ימים (עד ****P < 0.0001). חישובי כפילויות האוכלוסייה מוצגים ב-קובץ משלים 2.
פיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של הזדקנות (senescence) שעברו טרנספקציה של d2EGFP-T2A-hTERT modRNA הראו דפוס סולמי TRAP חזק 48 שעות לאחר הטרנספקציה, בעוד שתאים שעברו טיפול ב-mock או ב-eGFP-modRNA הראו רק אות רקע, מה שמעיד על כך שפעילות הטלומראז נבעה מביטוי אקסוגני של hTERT (איור 3A). טיפול מקדים בחום ביטל את דפוס הסולם, ובכך אישר את ספציפיות הבדיקה (איור 3B).
ניתוח של מהלך הזמן הוכיח כי פעילות הטלומראז הגיעה לשיאה בין 24 ל-48 שעות לאחר הטרנספקציה ולאחר מכן ירדה, וחזרה לרמות קרובות לרמת הבסיס בתוך 72–96 שעות (איור 3C). הגברה של ריכוז ה-hTERT modRNA מ-50 ל-3,000 ng/mL גרמה לעלייה מקבילה בעוצמת אות ה-TRAP, מה שמעיד על הפעלת טלומראז תלויה במינון (איור 3D).
ניתוח תפקודי באמצעות מבנים של hTERT מסוג wild-type, אי-פעיל קטליטית (CI), ונחסר באות למיקום גרעיני (ΔNLS) הראה כי רק hTERT מסוג wild-type יצר פעילות טלומראז חזקה. שני הווריאנטים, CI ו-ΔNLS, כשלו בהשראת פעילות דומה למרות תנאי הובלה דומים (איור 3E). בהתאמה לממצאים אלה, ניתוח MMqPCR חשף עלייה ניכרת באורך הממוצע של הטלומרים (rT/S ≈ 1.4) רק בתאים שקיבלו modRNA של hTERT מסוג wild-type. תאים שקיבלו CI-hTERT, ΔNLS-hTERT או טיפול דמה (mock) נותרו קרובים לרמות הבסיס (rT/S ≈ 0.3; ****P < 0.0001) (איור 3F).
שלושה סבבים רצופים של טרנספקציה הפוכה באמצעות modRNA של hTERT במרווחי זמן של 5 ימים הפחיתו באופן משמעותי את הפרופורציה של תאים חיוביים ל-β-galactosidase הקשור לסנסנציה (Senescence-associated β-galactosidase). אחוז התאים החיוביים ירד מכ-85% בתרביות שעברו טיפול דמה (mock) לכ-40% בתרביות שטופלו ב-hTERT, 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה (***P < 0.001) (איור 4A).
צביעה אימונוציטוכמית קונפוקלית חשפה ביטוי מוגבר של Ki67 בתאים שקיבלו שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT ביחס לבקרה שעברה טיפול דמה, מה שמעיד על פעילות פרוליפרטיבית מוגברת (Figure 4B). ניתוח RT-qPCR הדגים עוד ירידה בביטוי של סממני הזקנה p16 ו-p21 בעקבות טיפול ב-hTERT. ביחס לתאי זקנה מוקדמת שעברו טיפול דמה, ביטוי p16 ירד מכמיה של כ-2.3-fold ל-0.7-fold, וביטוי p21 ירד מכמיה של כ-11-fold ל-6-fold (**P < 0.01; ****P < 0.0001) (Figure 4C,D). Supplementary Figure 1 מדגים עוד כי טיפול ב-chloroquine (CQ) או ב-Y-27632 לבדם לא שינה באופן משמעותי את ביטוי p16 או p21 בתאים שעברו טרנספקציית דמה. לעומת זאת, השילוב של CQ ו-Y-27632 במהלך שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT הפיק את ההפחתה הגדולה ביותר בביטוי של p16 ו-p21 בהשוואה לטרנספקציה הפוכה של hTERT לבדה או לכל אחד מהחומרים בנפרד, בעוד שטיפול בחומר בודד הפיק השפעות בינוניות. ממצאים אלו מעידים כי שימוש משולב ב-CQ וב-Y-27632 הגביר את ההפחתה בביטוי סממני הזקנה בעקבות טרנספקציה הפוכה של mRNA של hTERT. יחד, ממצאים אלו מוכיחים כי טרנספקציה הפוכה חוזרת של mRNA של hTERT מקדמת הארכת טלומרים, מפחיתה סממני זקנה ומגבירה מאפיינים פרוליפרטיביים בפיברובלסטים LF1 בשלב זקנה מוקדמת.

איור 1: תכנון, סינתזה ותיקוף פונקציונלי של mRNA של d2EGFP‑T2A‑ hTERT בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. (A) תרשים של מבנה ה-mRNA ההיברידי של hTERT המכיל קסטה של d2EGFP מקושרת לפפטיד T2A לביטוי סימולטני של hTERT ו-EGFP לא יציב. ה-ORF של d2EGFP-T2A-hTERT מוקף על ידי ה-3’ UTR של הגן האנושי β globin (HBB) ועל ידי 5’ UTR סינתטי. ה-mRNA סונתז באמצעות נוקלאוטידים משוערים, ובסוף נוסף זנב poly (A). (B) סינתזה יעילה של d2EGFP-T2A-hTERT mRNA בעל שלמות גבוהה באמצעות תמלול in vitro, כפי שנותח בניתוח RNA אלקטרופורטי אוטומטי. (C) ניתוח של מהלך הזמן של ביטוי חלבון hTERT באמצעות בדיקה אימונולוגית אוטומטית מבוססת קפילרה לאחר טרנספקציה של 2 µg/mL של d2EGFP-T2A-hTERT mRNA. (D) היעילות והביטוי של טרנספקציית d2EGFP-T2A-hTERT mRNA, כפי שהוערכו על ידי ביטוי EGFP בין טרנספקציה ישירה (FT) לטרנספקציה הפוכה (RT), נבחנו בפיברובלסטיים דיפלואידיים ראשוניים בשלב מוקדם של סנצנציה (LF1). סרגל קנה מידה = 10 µm. (E) כימות עוצמת פלורסנציה ממוצעת (MFI) של אות eGFP לאחר טרנספקציה ישירה או הפוכה. סה"כ 20 תמונות בודדות נותחו עבור כל תנאי, כולל 4 אזורים נפרדים מ-5 חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; כפי שהוערך במבחן t לא מזווג עם תיקון וולש (Welch's correction). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2דינמיקה של אורך הטלומרים ות ebenfalls תוחלת חיים פרוליפרטיבית לאחר טרנספקציה חוזרת של mRNA של hTERT בכיוון קדימה לעומת כיוון הפוך בפיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של סנסנס. (Aהאורכים הממוצעים של הטלומרים (rT/S) נקבעו באמצעות Telomere MMqPCR. פיברובלסטים בשלב מוקדם של סנסקנציה עברו טרנספקציה קדימה (FT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברציפות במרווחי זמן של 5 ימים, החל מהכפלה אוכלוסייתית (PD) מספר 76. סרגל השגיאה מציין SEM; n = 5 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, **P < 0.01 בהשוואה לתאים שטופלו בביקורת (mock) בלבד. (B(בדומה ל- (A), הוערכו rT/S כאשר תאים בשלב מוקדם של סנסנציה (הזדקנות תאית) עברו טרנספקציה חוזרת (RT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברצף, במרווחי זמן של 5 ימים, החל מהכפלה אוכלוסייתית (PD) מספר 76. סביב הנתונים מייצג SEM; n = 7 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו בביקורת (mock) בלבד. (C(השוואה של אורך הטלומר הממוצע (rT/S) לאחר 3 סבבים רצופים של טרנספקציות קדמיות והפוכות במרווחי 5 ימים, או קבוצת ביקורת (mock) בלבד. פס השגיאה מייצג SEM; n = 10 שחזורים ביולוגיים; *P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001. (Dעקומות גדילה של פיברובלסטים מסוג LF1 שהועברו להם (transfected) 2 µg/ml mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT או mock בלבד, פעם אחת, פעמיים או שלוש פעמים ברצף במרווחי 5 ימים, החל מ-PD# 76. חצים שחורים מציינים את מועדי הטיפול. עקומות הגדילה שוכפלו שלוש פעמים, כאשר כל אוכלוסייה תורגשב בטריפליקאט. 3 חזרות טכניות לכל דגימה ביולוגית, הנתונים מייצגים ממוצעים. ± סטיית תקן (SD)P < 0.05, **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שנמדד על ידי מבחן ANOVA של Brown-Forsythe ו-Welch אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: mRNA של hTERT בעל פעילות קטליטית הממוקם בגרעין מניע עלייה זמנית ותלוית-מינון בפעילות הטלומראז, אשר לבדה מספיקה כדי לקדם הארכה מדידה של הטלומרים בפיברובלסטים LF1 בשלב התחלה של סנצנציה. (A) תאים בשלב התחלה של סנצנציה עברו טרנספקציה עם mock, eGFP, או mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT. 48 שעות לאחר הטרנספקציה, הוכנה תמצית תאים מ-20,000 תאים והוערכה באמצעות בדיקת TRAP. תוצרי התגובה הופרדו ב-PAGE במצב טבעי ונצבעו ב-SYBR Green. (B) השבתה של טלומראז באמצעות חום כפי שנמדדה בבדיקת TRAP. (C) ניתוח של פעילות הטלומראז לאורך זמן בתאי LF1 בשלב התחלה של סנצנציה לאחר טרנספקציה של mRNA של hTERT הראה כי הפעילות חזרה לרמת הבסיס בתוך 72 שעות, מה שמעיד על הפעלה אנזימטית זמנית. (D) תאי LF1 בשלב התחלה של סנצנציה קיבלו כמויות משתנות של mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT (0–3,000 ng/mL), והראו עלייה בפעילות הטלומראז באופן פרופורציונלי למינון. (E) העברה של 2 µg/ml TERT הגבירה את פעילות הטלומראז בתאי LF1 בשלב התחלה של סנצנציה. ΔNLS הגביר חלקית את פעילות הטלומראז ללא השראה של הארכת טלומרים, כיוון שהוא פועל בציטופלזמה אך אינו עובר לגרעין, בעוד ש-mRNA של CI TERT לא חולל אפקט זה, מה שמעיד על תוצאות תפקודיות שונות. (F) השפעת טרנספקציה הפוכה של TERT תפקודי, TERT חסר סיגנל למיקום גרעיני (ΔNLS), ו-TERT שאינו פעיל קטליטית (CI) על אורכי הטלומרים הממוצעים (rT/S) של תאי LF1 בשלב התחלה של סנצנציה, המצביעה על חשיבותו של TERT פעיל קטליטית הממוקם בגרעין להארכת הטלומרים. סורג השגיאה מייצג SD; n = 7 חזרות ביולוגיות; ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mocks בלבד, כפי שנמדד ב-one-way ANOVA עם תיקון Welch. RTA%-פעילות טלומראז יחסית (אחוז מהביקורת) מצוינת בתחתית כל נתיב. היחס בין רמות העוצמה של סולמי דגימות TRAP ופס ITAS (ביקורת פנימית- IC) חושב לפי הנוסחה הבאה עבור כל נתיב: Activity normalized = Ladder intensity/ IC intensity, וכל דגימה נורמלה לביקורת חיובית כאחוז (ביקורת חיובית; 2,500 תאי H1299) באמצעות הנוסחה הבאה: Relative activity (%) =Activity normalized (sample)/ Activity normalized (reference). חיסור רקע בוצע בכל שלב. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: טרנספקציה הפוכה אופטימלית של hTERT mRNA מהווה הפיכה חלקית של פנוטיפים הקשורים להזדקנות ומשיבה סמני פרוליפרציה בפיברובלסטים LF1 בשלב הזדקנות מוקדם. (A) תמונות מייצגות של תאי LF1 מזדקנים מוקדם המבטאים β-gal לאחר טרנספקציה של hTERT mRNA שונה 3 פעמים ברצף במרווחים של 5 ימים. סרגל קנה מידה = 100 µm. ביטוי β-gal נותח 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה. הניסויים בוצעו שלוש פעמים עם >100 תאים לדגימה שנספרו ידנית. (B) תמונות קונפוקליות מייצגות (הגדלה של 20x) של תאי LF1 מזדקנים מוקדם, צבועים בסמן הפרוליפרציה Ki67. סרגל קנה מידה = 100 µm. עלייה משמעותית בביטוי Ki-67 לאחר 3 סבבים של טרנספקציה הפוכה עם hTERT. אחוז הגרעינים החיוביים ל-Ki67 עולה באופן משמעותי לאחר 3× hTERT (RT). הגרף מייצג את הממוצע ± SD של ספירת הגרעינים החיוביים ל-Ki67, מנורמל למצב של טרנספקציית Mock. עבור כל תנאי, נבחנו סה"כ 18 תמונות, כאשר 6 שדות נבחרים מכל אחת מהשחזורים הביולוגיים, לסה"כ n = 3 שחזורים ביולוגיים. ****P < 0.0001. (C) ביטוי סמני הזדקנות לאחר הצעירה חלקית בתיווך של 3× hTERT כפי שנמדד ב-RT-qPCR (n = 6). כל הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שחושב באמצעות unpaired t-test עם תיקון של Welch. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של איור זה.
| רכיב | נפח/ריכוז סופי |
| DNA תבנית ל-PCR | 200 –1000 ng |
| 10× IVT Buffer | 2 μL |
| ATP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) |
| GTP (100 mM) | 1.5 μL (ריכוז סופי 7.5 mM) |
| CTP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) |
| m1Ψ-5′-TP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) (ניתן להגדיל את שילוב ה-pseudo-UTP על ידי שילוב UTP רגיל ביחס של 1:4-2:2 (m1Ψ-5′-TP:UTP).) |
| ARCA (10 mM) | 4 μL (ריכוז סופי 2 mM) |
| מעכב RNase (40 U/μL) | 0.5 μL (20 U) |
| T7 RNA Polymerase (50 U/μL) | 2 μL (100 U) |
| H₂O נטול נוקלאזות | 20 μL |
טבלה 1: הרכב תגובת השעתוק במבחנה (IVT) עבור סינתזה של hTERT mRNA עם נוקליוזידים משוערים. רכיבי התגובה והכמויות הסופיות ששימשו לסינתזת IVT עם כיסוי ARCA מפורטים כאן.
| מרכיב | נפח/ריכוז סופי |
| mRNA מופק עד 5 μg | ≤20 μL |
| 10× Poly(A) Tailing Buffer | 5 μL |
| ATP (10 mM | 5 μL (1 mM סופי) (למרות שהוא כבר נמצא בבופר, תוספת נוספת מסייעת לייצוב ה-poly A.) |
| Poly(A) Polymerase (5 U/μL) | 1 μL (5 U) |
| Nuclease-free H₂O | עד לנפח סופי של 50 μL |
טבלה 2: הרכב תגובת ה-poly(A)-tailing המשמשת למודיפיקציה פוסט-טרנסקריפציונית של hTERT mRNA. מוצגים נפחי ריאגנטים ותנאי תגובה ליצירת זנב poly(A) באורך 120–200 נוקלאוטידים.
| פרמטר | פורמט 12 בארות | פורמט 6 בארות |
| שטח פני גידול | ~3.8 cm² | ~9.5 cm² |
| מצע לכל בארה | 1.0 mL | 2.0 mL |
| מספר זריעת תאים | 5× 104–6.5× 104 Cells/ml | 2.0–2.5 × 10⁵ |
| מספר תאים ממוצע (ב-100% התמזגות) | 5.7× 104–7.2× 104 Cells/ml | 2.9–3 × 10⁵ |
| כמות mRNA לטרנספקציה | 750 –1000ng | 2000–3500 ng |
| חומר טרנספקציה של mRNA | 1.5 – 3.0 µL | 4.75 – 7 µL |
| נפח סופי של mRNA + חומר טרנספקציה ב-Opti-MEM | 50 µL | 200 µL |
טבלה 3: פרמטרי טרנספקציה מומלצים להחדרה של mRNA של hTERT בפורמטים של תרביות ב-6 בארות וב-12 בארות. מוצגים סיכומי צפיפויות זריעת תאים, כמויות mRNA, נפחי ריאגנט טרנספקציה ונפחי יצירת קומפלקסים ששימשו בניסויי טרנספקציה ישירה והפוכה.
איור משלים 1: השפעתה של chloroquine ו-Y-27632 על ביטוי p16 ו-p21 הקשורים להשכחה בעקבות טרנספקציה הפוכה חוזרת של hTERT mRNA. (A) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p16 mRNA בפיברובלסטי LF1 שעברו טיפול דמה (mock) וטרנספקציה הפוכה (RT) של 3× hTERT, לאחר טיפול ב-chloroquine (CQ), Y-27632, או שילוב שלהם, כפי שצוין. (B) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p21 mRNA תחת אותם תנאים ניסיוניים. רמות התמלול נורמלו ל-RpL13a והובעו ביחס לתאי בקרה צעירים (PD#12). נקודות נתונים בודדות מייצגות חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD מ-n = 2 חזרות ביולוגיות, עם 5 חזרות טכניות לכל חזרה ביולוגית. מובהקות סטטיסטית מצוינת באיור; ns, לא מובהק. *P < 0.05, **P < 0.01, ****P < 0.0001, כפי שנקבע על ידי Brown–Forsythe ו-Welch's ANOVA. קיצורים: CQ, chloroquine; RT, טרנספקציה הפוכה (reverse transfection); Y-27632, מעכב Rho-associated protein kinase (ROCK).אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 1: רצפי DNA וחלבון של מבני ביטוי של hTERT.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 2: חישוב הכפלות אוכלוסייה (PD). הכפלות אוכלוסייה (PD) חושבו באמצעות הנוסחה PD = log₂ (Nf/N₀), כאשר N₀ הוא מספר התאים שנזרעו, ו-Nf הוא מספר התאים החיוניים שנאספו. PD מצטבר נקבע על ידי סיכום ערכי ה-PD לאורך המעברים.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.