ה-modRNA מסוג d2EGFP-T2A-hTERT הונדס כמסגרת קריאה פתוחה (ORF) היברידית, שבה רפורטר EGFP לא יציב (d2EGFP) קושר ל-TERT אנושי באמצעות פפטיד T2A בעל יכולת פיצול עצמי. הרצפים המלאים של הנוקלאוטידים והחלבונים עבור כל המבנים מופיעים ב-Supplementary File 1. רצף הקידוד הוקף על ידי אזור שאינו מתורגם (UTR) סינתטי ב-5′ ועל ידי ה-3′ UTR של β-globin אנושי כדי להגביר את יעילות התרגום ואת יציבות ה-mRNA (איור 1A). קסטת הביטוי הכילה גם רצף מייצב אנזימם סינתטי (Es) ורצף מגביר שעתוק סינתטי (TEs) שנועדו לשפר את הפרוססיביות של T7 polymerase ולהפחית סיום שעתוק מוקדם. לאחר שיבוט במורד של מקדם T7, בוצע שעתוק in vitro באמצעות אנלוג של כיפה נגד-היפוך (ARCA) ונוקלאוטידים שעברו מודיפיקציה (m5CTP ו-ΨUTP), ולאחריו הוספה אנזימטית של זנב poly(A) (בערך 120–200 nt) כדי להפיק d2EGFP-T2A-hTERT modRNA בעל כיפה, פולי-אדנילציה ושלמות גבוהה (איור 1A).
ניתוח אלקטרופורטי אוטומטי של RNA אישש סינתזה יעילה של התמליט, וחשף מין RNA דומיננטי בגודל הצפוי עם מוצרי פירוק מינימליים בטווח של מספר כמויות קלט, באופן העולה בקנה אחד עם ייצור מוצלח של modRNA באורך מלא (איור 1B). בעקבות טרנספקציה של פיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנסינס (senescence) עם 2 µg/mL d2EGFP-T2A-hTERT modRNA, חלבון hTERT הפך ניתן לגילוי בתוך 24 h ונשאר ברמה גבוהה למשך 48–96 h, מה שמעיד על תרגום מתמשך של התמליט הסינתטי (איור 1C). ניתוח של רפורטר d2EGFP המקושר הדגים פלואורסצנציה חזקה בעקבות טרנספקציה הפוכה (reverse transfection), בעוד שפלואורסצנציה נמוכה משמעותית נצפתה בעקבות טרנספקציה ישירה (forward transfection) (איור 1D,E). ממצאים אלו מעידים על הובלה וביטוי משופרים של hTERT modRNA באמצעות גישת הטרנספקציה ההפוכה בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנסינס.
טרנספקציה קדימה (FT) חוזרת של פיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה (senescence) באמצעות modRNA של d2EGFP-T2A-hTERT במרווחי 5 ימים, הובילה לעלייה הדרגתית באורך הממוצע של הטלומרים (rT/S) ביחס לבקרי mock-transfection, כפי שנמדד באמצעות monochrome multiplex quantitative PCR (MMqPCR) (איור 2A). יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור FT, כאשר המובהקות הסטטיסטית השתפרה מ-*P < 0.05 ל-**P < 0.01.
יישום של אותו לוח זמנים של מינונים באמצעות טרנספקציה הפוכה (RT) הביא לעלייה מודגשת יותר באורך הטלומרים. יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור RT והגיע להבדלים מובהקים מאוד ביחס לבקרות שעברו טרנספקציית דמה (*P < 0.05 עד ****P < 0.0001) (איור 2B). השוואה ישירה בין FT ל-RT לאחר שלושה מחזורי טיפול הראתה כי שתי הגישות העלו באופן מובהק את ערכי ה-rT/S ביחס לבקרות שעברו טרנספקציית דמה; עם זאת, RT הניבה עלייה גדולה יותר מאשר FT תחת תנאי מינון ותזמון זהים (*P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001) (איור 2C).
ניתוח צמיחה לטווח ארוך הדגים עוד כי מתן חוזר של hTERT modRNA האריך את תוחלת החיים השכפולית (איור 2D). תאים שקיבלו מחזורי טיפול אחד, שניים או שלושה הראו כפילויות אוכלוסייה מצטברות גדולות יותר באופן פרוגרסיבי בהשוואה לבקרה שעברה טרנספקציה דמה. תרביות שקיבלו שלושה סבבים של טיפול ב-hTERT modRNA, במיוחד באמצעות RT, הראו את הסטייה הגדולה ביותר מעקומות הצמיחה של הבקרה לאורך כ-250 ימים (עד ****P < 0.0001). חישובי כפילות האוכלוסייה מוצגים ב-קובץ משלים 2.
פיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של סניסנציה (senescence) שעברו טרנספקציה עם d2EGFP-T2A-hTERT modRNA הראו דפוס סולם (laddering) חזק של TRAP כ-48 שעות לאחר הטרנספקציה, בעוד שתאים שעברו טיפול ב-mock או ב-eGFP-modRNA הראו רק אות רקע, מה שמעיד על כך שפעילות הטלומראז נבעה מביטוי אקסוגני של hTERT (איור 3A). טיפול מקדים בחום ביטל את דפוס הסולם, ובכך אישש את ספציפיות הבדיקה (איור 3B).
ניתוח של מהלך הזמן הדגים כי פעילות הטלומראז הגיעה לשיאה בין 24 ל-48 שעות לאחר הטרנספקציה ולאחר מכן ירדה, וחזרה לרמות קרובות לרמות הבסיס ב-72–96 שעות (איור 3C). העלאת ריכוז ה-hTERT modRNA מ-50 ל-3,000 ng/mL גרמה לעלייה תואמת בעוצמת אות ה-TRAP, מה שמעיד על הפעלת טלומראז תלוית מינון (איור 3D).
ניתוח פונקציונלי באמצעות מבני hTERT מסוג בר (wild-type), חסרי פעילות קטליטית (CI), וחסרי אות למיקום גרעיני (ΔNLS) הדגים כי רק hTERT מסוג בר יצר פעילות טלומראז חסונה. שני הווריאנטים, CI ו-ΔNLS, נכשלו ביצירת פעילות דומה למרות תנאי הובלה דומים (איור 3E). בהתאמה לממצאים אלו, ניתוח MMqPCR חשף עלייה ניכרת באורך הטלומר הממוצע (rT/S ≈ 1.4) רק בתאים שקיבלו modRNA של hTERT מסוג בר. תאים שקיבלו CI-hTERT, ΔNLS-hTERT, או טיפול דמה (mock) נותרו קרובים לרמות הבסיס (rT/S ≈ 0.3; ****P < 0.0001) (איור 3F).
שלושה סבבים רצופים של טרנספקציה הפוכה באמצעות hTERT modRNA במרווחים של 5 ימים הפחיתו באופן משמעותי את שיעור התאים החיוביים ל-β-galactosidase הקשור לסנסינציה (senescence-associated). אחוז התאים החיוביים ירד מכ-85% בתרביות שעברו טיפול דמה (mock) לכ-40% בתרביות שטופלו ב-hTERT, 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה (***P < 0.001) (איור 4A).
צביעה אימונוציטוכימית קונפוקלית חשפה ביטוי מוגבר של Ki67 בתאים שעברו שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT בהשוואה לבקרה שעברה טיפול דמה (mock), מה שמעיד על פעילות פרוליפרטיבית מוגברת (איור 4B). ניתוח RT-qPCR הדגים עוד ירידה בביטוי של סמני ההזדקנות p16 ו-p21 בעקבות הטיפול ב-hTERT. בהשוואה לתאי LF1 בשלב הזדקנות מוקדם שעברו טיפול דמה, ביטוי p16 ירד מכ-2.3-מכפלות ל-0.7-מכפלות, וביטוי p21 ירד מכ-11-מכפלות ל-6-מכפלות (**P < 0.01; ****P < 0.0001) (איור 4C,D). איור משלים 1 מדגים עוד כי טיפול ב-chloroquine (CQ) או ב-Y-27632 לבדם לא שינה באופן מובהק את ביטוי p16 או p21 בתאים שעברו טרנספקציית דמה. לעומת זאת, שילוב של CQ ו-Y-27632 במהלך שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT הביא להפחתה הגדולה ביותר בביטוי של p16 ו-p21 בהשוואה לטרנספקציה הפוכה של hTERT לבדה או לכל אחד מהחומרים באופן בודד, בעוד שטיפול בחומר בודד הניב השפעות ביניים. ממצאים אלו מעידים כי השימוש המשולב ב-CQ וב-Y-27632 הגביר את ההפחתה בביטוי סמני ההזדקנות בעקבות טרנספקציה הפוכה של hTERT mRNA. יחד, ממצאים אלו מוכיחים כי טרנספקציה הפוכה חוזרת של hTERT mRNA מקדמת הארכה של הטלומרים, מפחיתה סמני הזדקנות ומגבירה מאפיינים פרוליפרטיביים בפיברובלסטים מסוג LF1 בשלב הזדקנות מוקדם.

איור 1: תכנון, סינתזה ותיקוף פונקציונלי של d2EGFP‑T2A‑ hTERT mRNA בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. (A) סכימה של תכנון מבנה ה-hTERT mRNA ההיברידי המכיל את קסטת d2EGFP המקושרת לפפטיד T2A לביטוי סימולטני של hTERT ו-EGFP לא יציב. ה-ORF של d2EGFP-T2A-hTERT מוקף ב-3’ UTR של גן ה-β globin האנושי (HBB) וב-5’ UTR סינתטי. ה-mRNA סונתז באמצעות נוקלאוטידים שעברו מודיפיקציה, ובסוף נוסף זנב poly (A). (B) סינתזה יעילה של d2EGFP-T2A-hTERT mRNA בעל שלמות גבוהה באמצעות תמלול in vitro, כפי שנותח בבדיקת RNA אלקטרופורטית אוטומטית. (C) ניתוח סדרת זמנים של ביטוי חלבון hTERT באמצעות בדיקה אימונולוגית אוטומטית מבוססת קפילריה לאחר טרנספקציה של 2 µg/mL של d2EGFP-T2A-hTERT mRNA. (D) היעילות והביטוי של טרנספקציית d2EGFP-T2A-hTERT mRNA, כפי שהוערכו על ידי ביטוי EGFP בין טרנספקציה קדימה (FT) לטרנספקציה אחורה (RT), נבחנו בפיברובלסטים דיפלואידיים ראשוניים בשלב מוקדם של סנצנציה (LF1). סרגל קנה מידה = 10 µm. (E) כימות של עוצמת פלואורסצנציה ממוצעת (MFI) של אות eGFP לאחר טרנספקציה קדימה או אחורה. סך של 20 תמונות בודדות נותחו עבור כל תנאי, המקיפות 4 אזורים נפרדים מ-5 חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; כפי שהוערך באמצעות unpaired t-test עם תיקון של Welch. נא ללחוץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: דינמיקת אורך הטלומרים ותוחלת חיים פרוליפרטיבית לאחר טרנספקציה חוזרת של mRNA של hTERT בכיוון קדימה לעומת כיוון הפוך בפיברובלסטים LF1 בשלב התחלה של סנסינציה. (A) אורכי הטלומרים הממוצעים (rT/S) נקבעו באמצעות Telomere MMqPCR. פיברובלסטים בשלב התחלה של סנסינציה עברו טרנספקציה קדימה (FT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברצף במרווחים של 5 ימים, החל מ-Population Doubling (PD) #76. פס השגיאה מציין SEM; n = 5 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, **P < 0.01 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mock בלבד. (B) בדומה ל-(A), rT/S הוערכו כאשר תאים בשלב התחלה של סנסינציה עברו טרנספקציה חוזרת (RT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברצף במרווחים של 5 ימים, החל מ-Population Doubling (PD) #76. פס השגיאה מייצג SEM; n = 7 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mock בלבד. (C) השוואת אורך הטלומרים הממוצע (rT/S) לאחר 3 טרנספקציות קדימה והפוכות ברצף במרווחים של 5 ימים, או mock בלבד. פס השגיאה מייצג SEM; n = 10 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001. (D) עקומות גדילה של פיברובלסטים LF1 שעברו טרנספקציה עם 2 µg/ml mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT או mock בלבד, פעם אחת, פעמיים או שלוש פעמים ברצף במרווחים של 5 ימים החל מ-PD# 76. חצים שחורים מציינים את מועדי הטיפול. עקומות הגדילה שוכפלו שלוש פעמים, כאשר כל אוכלוסייה תורבת בשלישייה. 3 חזרות טכניות לכל דגימה ביולוגית, הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. *P < 0.05, **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שהוערך במבחן Brown-Forsythe ו-Welch’s ANOVA אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: mRNA של hTERT בעל פעילות קטליטית הממוקם בגרעין מניע עלייה חולפת ותלוית-מינון בפעילות הטלומראז, אשר לבדה מספיקה כדי לקדם הארכה מדידה של הטלומרים בפיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. (A) תאים בשלב מוקדם של סנצנציה עברו טרנספקציה עם mock, eGFP, או d2EGFP-T2A-hTERT mRNA. 48 שעות לאחר הטרנספקציה, הוכנה תמצית תאים מ-20,000 תאים והיא הועברה לבדיקת TRAP. תוצרי התגובה הורצו ב-PAGE במצב native ונצבעו ב-SYBR Green. (B) השבתה של טלומראז באמצעות חום כפי שנמדדה בבדיקת TRAP. (C) ניתוח של פעילות הטלומראז לאורך זמן בתאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה בעקבות טרנספקציה של hTERT mRNA הראה כי הפעילות חזרה לרמת הבסיס תוך 72 שעות, מה שמעיד על הפעלה חולפת של האנזים. (D) תאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה קיבלו כמויות משתנות של d2EGFP-T2A-hTERT mRNA (0–3,000 ng/mL), והראו עלייה בפעילות הטלומראז באופן פרופורציונלי למינון. (E) הובלה של 2 µg/ml TERT הגבירה את פעילות הטלומראז בתאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. ΔNLS הגביר חלקית את פעילות הטלומראז ללא השראה להארכת טלומרים, מכיוון שהוא פועל בציטופלזמה אך אינו עובר לגרעין, בעוד ש-CI TERT mRNA לא עורר אפקט זה, מה שמעיד על תוצאות תפקודיות שונות. (F) השפעת טרנספקציה הפוכה של TERT תפקודי, TERT חסר אות מיקום גרעיני (ΔNLS), ו-TERT שאינו פעיל קטליטית (CI) על אורכי הטלומרים הממוצעים (rT/S) של תאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה, מה שמעיד על חשיבותו של TERT פעיל קטליטית הממוקם בגרעין להארכת הטלומרים. פס הטעות מייצג SD; n = 7 חזרות ביולוגיות; ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mocks בלבד, כפי שהוערך באמצעות one-way ANOVA עם תיקון וולש (Welch correction). RTA%-פעילות טלומראז יחסית (אחוז מהביקורת) מצוינת בתחתית כל נתיב. היחס בין רמות העוצמה של סולמי דגימות TRAP לבין פס ITAS (ביקורת פנימית- IC) חושב לפי הנוסחה הבאה עבור כל נתיב: Activity normalized = Ladder intensity/ IC intensity וכל דגימה נורמלה לביקורת חיובית כאחוז (ביקורת חיובית; 2,500 תאי H1299) באמצעות הנוסחה הבאה: Relative activity (%) =Activity normalized (sample)/ Activity normalized (reference). חיסור רקע בוצע בכל שלב. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: טרנספקציה הפוכה אופטימלית של hTERT mRNA הופכית חלקית פנוטיפים הקשורים להזדקנות ומחזירה סממני שגשוג בפיברובלסטים LF1 בשלבי הזדקנות מוקדמים. (A) תמונות מייצגות של תאי LF1 מזדקנים מוקדם המבטאים β-gal לאחר טרנספקציה של hTERT mRNA משופר 3 פעמים ברצף במרווחים של 5 ימים. סרגל קנה מידה = 100 µm. ביטוי β-gal ננתח 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה. הניסויים בוצעו שלוש פעמים עם >100 תאים לדגימה שסווגו ידנית. (B) תמונות קונפוקליות מייצגות (הגדלה של 20x) של תאי LF1 מזדקנים מוקדם, צבועים בסמן השגשוג Ki67. סרגל קנה מידה = 100 µm. עלייה משמעותית בביטוי Ki-67 לאחר 3 סבבים של טרנספקציה הפוכה עם hTERT. אחוז הגרעינים החיוביים ל-Ki67 עולה משמעותית לאחר 3× hTERT (RT). הגרף מייצג את הממוצע ± SD של ספירת הגרעינים החיוביים ל-Ki67, מנורמלים למצב Mock-transfected. עבור כל תנאי, נבחנו סה"כ 18 תמונות, כאשר 6 שדות נבדלים נבחרו מכל אחד מהחזרות הביולוגיות, לסה"כ של n = 3 חזרות ביולוגיות. ****P < 0.0001. (C) ביטוי סממני הזדקנות לאחר הת 젊ות חלקית בתיווך 3× hTERT כפי שנמדד ב-RT-qPCR (n = 6). כל הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שנמדד במבחן t לא מזווג עם תיקון של Welch. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.
| רכיב | נפח/ריכוז סופי |
| DNA תבנית ל-PCR | 200 –1000 ng |
| 10× IVT Buffer | 2 μL |
| ATP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) |
| GTP (100 mM) | 1.5 μL (ריכוז סופי 7.5 mM) |
| CTP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) |
| m1Ψ-5′-TP (100 mM) | 2 μL (ריכוז סופי 10 mM) (ניתן להגדיל את שילוב ה-pseudo-UTP על ידי שילוב UTP רגיל ביחס של 1:4-2:2 (m1Ψ-5′-TP:UTP).) |
| ARCA (10 mM) | 4 μL (ריכוז סופי 2 mM) |
| RNase Inhibitor (40 U/μL) | 0.5 μL (20 U) |
| T7 RNA Polymerase (50 U/μL) | 2 μL (100 U) |
| H₂O נקי מנוקלאז | 20 μL |
טבלה 1: הרכב תגובת התעתוק במבחנה (IVT) לסינתזה של hTERT mRNA עם מודיפיקציית נוקלאוזיד. רכיבי התגובה והכמויות הסופיות ששימשה לסינתזת IVT עם כיסוי ARCA מפורטים בטבלה.
| רכיב | נפח/ריכוז סופי |
| mRNA מנוקה עד 5 μg | ≤20 μL |
| בופר 10× להוספת זנב Poly(A) | 5 μL |
| ATP (10 mM | 5 μL (ריכוז סופי של 1 mM) (למרות שהחומר כבר נמצא בבופר, התוספת הנוספת מסייעת לייצוב ה-poly A). |
| פולי(A) פולימראז (5 U/μL) | 1 μL (5 U) |
| H₂O נטול נוקלאזים | לסך הכל 50 μL |
טבלה 2: הרכב תגובת ה-poly(A)-tailing המשמשת למודיפיקציה פוסט-טרנסקריפציונלית של hTERT mRNA. מוצגים נפחי הריאגנטים ותנאי התגובה ליצירת זנב poly(A) באורך 120–200 נוקלאוטידים.
| פרמטר | פורמט של 12 בארות | פורמט של 6 בארות |
| שטח פנים לצמיחה | ~3.8 סמ"ר | ~9.5 סמ"ר |
| מדיום לכל באר | 1.0 מ"ל | 2.0 מ"ל |
| מספר זריעת תאים | 5× 104–6.5× 104 תאים/מ"ל | 2.0–2.5 × 10⁵ |
| מספר תאים ממוצע (ב-100% קונפלואנסיות) | 5.7× 104–7.2× 104 תאים/מ"ל | 2.9–3 × 10⁵ |
| כמות טרנספקציית mRNA | 750–1000 ננוגרם | 2000–3500 ng |
| סוכן טרנספקציה של mRNA | 1.5 – 3.0 µL | 4.75 – 7 µL |
| נפח סופי של mRNA + חומר טרנספקציה ב-Opti-MEM | 50 µL | 200 µL |
טבלה 3: פרמטרי טרנספקציה מומלצים להחדרת mRNA של hTERT בפורמטים של תרבית ב-6 בארות וב-12 בארות. סיכום של צפיפויות זריעת תאים, כמויות mRNA, נפחי ריאגנט טרנספקציה ונפחי יצירת קומפלקסים ששימשו בניסויי טרנספקציה קדימה (forward) ולאחור (reverse).
איור משלים 1: השפעתה של chloroquine ו-Y-27632 על ביטוי של p16 ו-p21 הקשורים להזדקנות תאית בעקבות טרנספקציה הפוכה חוזרת של hTERT mRNA. (A) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p16 mRNA בתאי פיברובלסט LF1 שעברו טיפול דמה (mock) או טרנספקציה הפוכה (RT) של hTERT של 3 פעמים, לאחר טיפול ב-chloroquine (CQ), B-27632, או שילוב שלהם, כפי שמצוין. (B) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p21 mRNA תחת אותם תנאים ניסיוניים. רמות התמלול נורמלו ל-RpL13a ובוטאו ביחס לתאי בקרה צעירים (PD#12). נקודות נתונים בודדות מייצגות חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD מ-n = 2 חזרות ביולוגיות, עם 5 חזרות טכניות לכל חזרה ביולוגית. מובהקות סטטיסטית מצוינת באיור; ns, לא מובהק. *P < 0.05, **P < 0.01, ****P < 0.0001, כפי שנקבע על ידי מבחני Brown–Forsythe ו-Welch's ANOVA. קיצורים: CQ, chloroquine; RT, טרנספקציה הפוכה; Y-27632, מעכב Rho-associated protein kinase (ROCK).אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 1: רצפי DNA וחלבון של מבני ביטוי hTERT.אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 2: חישוב הכפלת אוכלוסייה (PD). הכפלות אוכלוסייה (PD) חושבו באמצעות הנוסחה PD = log₂ (Nf/N₀), כאשר N₀ הוא מספר התאים שנזרעו, ו-Nf הוא מספר התאים החיוניים שנאספו. PD מצטבר נקבע על ידי סיכום ערכי ה-PD לאורך המעברים.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.