פרוטוקול זה נועד להעריך התפתחות מלנומה בזנוגרפטים של דגי זברה באמצעות תהודה פרמגנטית אלקטרונית in vivo (ספקטרוסקופיה לזיהוי וניתוח רדיקלים של מלנין), ומציע גישה חדשנית למחקר פרה-קליני ולהערכה טיפולית.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה נועד להעריך התפתחות מלנומה בזנוגרפטים של דגי זברה באמצעות תהודה פרמגנטית אלקטרונית in vivo (ספקטרוסקופיה לזיהוי וניתוח רדיקלים של מלנין), ומציע גישה חדשנית למחקר פרה-קליני ולהערכה טיפולית.
פרוטוקול זה מציג יישום חדש ב-vivo של ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X (9.5 GHz) למעקב אחר דינמיקת רדיקליים הקשורה למלנין במודלים של מלנומה של דגי זברה (Danio rerio). מטרת שיטה זו היא לאפשר הערכה ישירה, ללא תוויות וכמותיות של שינויים רדוקסידו הקשורים למלנין במהלך התפתחות העובר, ואינטראקציות גידול–מארח במודל חולייתנים רלוונטי פיזיולוגית.
על ידי ניצול התכונות הפרמגנטיות הפנימיות של המלנין, גישה זו מספקת מידע ביוכימי משלים שלא ניתן לקבל באמצעות הדמיה מבוססת פלואורסצנציה קונבנציונלית בלבד. חשוב לציין שאות התהודה הפרהמגנטי של האלקטרון שזוהה משקף את החלק הפעיל לחמצון אדום בפולימר המלנין ולכן משמש כקריאה רגישה לחמצון אדום ולא כמדד ישיר לשפע הפיגמנט הכולל.
הביצועים של השיטה אומתו באמצעות זיהוי סלקטיבי של רדיקלים הקשורים למלנין בעוברים מסוג פיגמנטלי מסוג פראי, היעדר אות בביקורת אלבינו, שינויים התפתחותיים מובהקים סטטיסטית באות תהודה פרמגנטית אלקטרונית מנורמל בין שכפולים ביולוגיים עצמאיים, ותוצאות דומות שהושגו באמצעות מחזיקי דגימות חלופיים ודגימות קפואים.
על ידי שילוב ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית של אלקטרונים בתחום X עם מודלים של גזנוגרפט של דגי זברה, פרוטוקול זה מספק פלטפורמה ניתנת להרחבה, אתית וניתנת להעברה למחקר פרה-קליני, מחקרי ביולוגיה של חמצון אדום והערכת התערבויות המווסתות מלנוגנזה.
המטרה הכוללת של מחקר זה היא לפתח ולאמת שיטה אמינה ב-vivo לזיהוי וכימות רדיקלי מלנין במודל זנוגרפט של עוברי דגי זברה (Danio rerio) בשילוב עם ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X (9.5 GHz). גישה זו שואפת לאפשר הערכה ישירה וכמותית של תהליכי רדוקס הקשורים למלנין במהלך התפתחות המלנומה ובתגובה להתערבויות פרמקולוגיות.
מלנין הוא קבוצה הטרוגנית של ביופולימרים האחראים לפיגמנטציה בעור, בשיער ובעיניים במגוון רחב של אורגניזמים. מבין צורותיו, לאאומלנין ולפיאומלנין תפקידים מובחנים בביולוגיה. אומלנין מציג תכונות נוגדי חמצון ופוטופרוטניות, בעוד שפיאומלנין יכול לקדם ייצור מיני חמצן תגובתי (ROS), במיוחד תחת חשיפה ל-UV 1,2,3. גם פעולות נוגדי חמצון וגם פרואוקסידנט קשורות להיווצרות רדיקלים של מלנין. ברמה המולקולרית, מלנין הוא פולימר הטרוגני פעיל לחמצן אדום המורכב מתת-יחידות אינדוליות וקינונים, שיכול להתקיים במספר מצבים פיזיקוכימיים, כולל קינון מחומצן לחלוטין, סמיקינון מופחת חלקית, והידרוקינון מצומצם לחלוטין 4,5,6. השפע היחסי של מיני רדיקלי סמיקינון הוא דינמי ותלויה בתנאים פיזיקוכימיים מקומיים, כולל זמינות חמצן, מיני חמצן ריאקטיביים (ROS), אינטראקציות בין יוני מתכת, pH, דרגת פולימריזציה ובשלת מלנוזום 7,8,9.
לכן, יש צורך בשיטות המאפשרות הערכה כמותית של ריכוזי הרדיקלים הללו להבנה טובה יותר של השינויים במצב החמצון הרדוקסי של המלנין. במלנומה, חוסר הוויסות של המלנוגנזה במלנוציטים תורם להתחלת המלנומה ולהתקדמותה. דיסרגולציה זו קשורה לעיתים קרובות לשינויים במצב החמצון האדום, התלויים בתנאי מיקרו-סביבה מקומיים. דבר זה הופך את פעילות החמצון האדום של המלנין לגורם חשוב בביולוגיה של הגידולים10. לכן, שיטות המאפשרות הערכה ישירה של רדיקלים של מלנין הן חיוניות להבנת פתוגנזה של מלנומה ותגובתן הטיפולית.
עוברי דגי זברה מהווים מודל חי חזק לחקר פיגמנטציה ומלנומה. עד 5 ימים לאחר ההפריה (120 שעות לאחר ההפריה, HPF), הם אינם מסווגים כבעלי חיים מוגנים לפי הנחיה 2010/63/EU, מה שמאפשר ניסויים בעלי תפוקה גבוהה ללא אישור אתי פורמלי. התפתחות מהירה, שקיפות אופטית ופרוטוקולים מבוססים הופכים את דג הזברה למתאים מאוד למחקרים טוקסיקולוגיים ופרמקולוגיים11,12. חשוב לציין כי דג זה חולק דמיון גנטי ופיזיולוגי משמעותי עם בני אדם, ומסלולים מרכזיים המעורבים במלנוגנזה נשמרים13. בעוד שדגי זברה מסוג בר מייצרים בעיקר אומלנין ומשמשים מודל לפיגמנטציה פיזיולוגית, מודלים של זנוגרפט — המבוססים על השתלת קווי תאי מלנומה המייצרים אומלנין ופאומלנין — מאפשרים חקירת התקדמות גידולים ביונקים ותגובות תרופתיות בסביבה מיקרו-רלוונטיתפיזיולוגית 14,15.
כיום, הדמיה מבוססת פלואורסצנציה היא השיטה הסטנדרטית במחקרי זנוגרפט של מלנומה של דג זברה. גישה זו מאפשרת ויזואליזציה בזמן אמת של צמיחת הגידול, נדידה ותגובת הטיפול באמצעות צבעים פלואורסצנטיים, כגון דיכלורודיהידרופלואורסצאין דיאצטט (DCFDA) או קווים טרנסגניים (Grx1-roGFP2, HyPer)16,17. עם זאת, טכניקות פלואורסצנציה מספקות בעיקר מידע מורפולוגי ומרחב ומוגבלות ביכולתן ללכוד תהליכים ביוכימיים ותהליכים הקשורים לחמצון אדום. בנוסף, הקריאות שלהן עשויות להיות מושפעות מהלבנת פוטו, דליפת צבע, הפרעות מתרכובות פלואורסצנטיות ושינויים פוטנציאליים בפיזיולוגיה של התאים הנגרמים על ידי תיוג. חשוב לציין ששיטות מבוססות פלואורסצנציה אינן מספקות מידע ישיר על רדיקלים של מלנין או על התנהגות החמצון הדינמי שלהם.
ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית מציעה גישה אנליטית ייחודית ועוצמתית, שכן היא מאפשרת זיהוי וכימות ישיר של מינים פרמגנטיים, כולל רדיקלים יציבים הקשורים למלנין. גם האומלנין וגם הפאומלנין מכילים חתיכות סמיקינון שמייצרות אותות תהודה פרמגנטיים אלקטרוניים אופייניים, והתרומה היחסית של אותות אלו נחקרה כסמן ביולוגי למצב הפיגמנטציה והתקדמות המלנומה18,19. חשוב לציין, מאחר שרק חלק הסמיקינון הפעיל ב-Redox תורם ישירות לאות המזוהה, ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית מספקת מידע משלים לבדיקות קונבנציונליות הקשורות למלנוגנזה, כגון כימות תכולת המלנין, פעילות טירוזינאז או ניתוח פיגמנטציה. בהתאם לכך, יש לפרש את עוצמת אות תהודה פרהמגנטית של אלקטרונים כקריאה רגישה לחמצון אדום של מצב פונקציונלי של מלנין, המושפעת מתנאים פיזיקוכיים מקומיים, ולא כמדד ישיר לשפע הפיגמנט הכולל.
בעוד שרוב מחקרי תהודה פרמגנטית אלקטרונים ב-vivo נערכו באמצעות מערכות L-band (סוג של ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית המשתמשת במיקרוגל בתדר נמוך (כ-1–2 GHz) לחקר מינים פרמגנטיים, במיוחד בדגימות גדולות שבהן נדרשת חדירת אות עמוקה יותר)20— תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X מספקת רזולוציה ספקטרלית גבוהה יותר ורגישות לדגימות בנפח קטן, מה שהופך אותו למתאים במיוחד לעוברי דגי זברה. יתרה מזאת, פיתוחים טכניים אחרונים, כולל מערכות גילוי הרמוניות מרובות, משפרים משמעותית את איכות האות ומאפשרים מדידות אמינות בדגימות ביולוגיות מאתגרות (קטנות ולחות יותר)21,22. גודל התהודה בפס X הוא הגודל המתאים לכמה עוברים של דגי זברה, אשר בשילוב עם רזולוציה גבוהה יותר מאשר במערכת L-band, מאפשר הפחתת מספר בעלי החיים בהם משתמשים. זה חשוב במיוחד בעבודה עם מודלים של xenograft.
למרות יתרונות אלו, יישום תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X על עוברי דגי זברה חיים ועל זנוגרפות מלנומה במודל זה נותר ברובו לא נחקר. מחקרים במבחנה באמצעות קווי תאי מלנומה, כגון B16F10, סיפקו תובנות חשובות לגבי תכונות רדיקלי המלנין; עם זאת, הם חסרים את ההקשר הפיזיולוגי המורכב של אורגניזם חי23,24. במיוחד, מיקרו-סביבת דג הזברה מציגה גורמים קריטיים — כגון גרדיאנטים של חמצן, אינטראקציות בין תאים לתא ופעילות מטבולית דינמית — שעשויים להשפיע משמעותית על התנהגות רדיקלי המלנין25,26. לכן, יש צורך ברור לפתח ולאמת מתודולוגיה in vivo שמאפשרת מדידה ישירה של רדיקלים של מלנין בתנאים פיזיולוגיים רלוונטיים.
במחקר זה אנו מציגים פרוטוקול מפורט ליישום ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X על עוברי דגי זברה, כולל מודלים של xenograft המכילים קווי תאי מלנומה B16F10 ו-B16F1. שיטה זו מספקת גישה משלימה להדמיה מבוססת פלואורסצנציה על ידי מתן הערכה כמותית של תכולת רדיקלי המלנין, ובכך מספקת תובנות לדינמיקת החמצון האדום. על ידי שילוב מידע מבני ומרחב מטכניקות פלואורסצנציה עם תובנות ביוכימיות מתהודה פרהמגנטית אלקטרונית, אסטרטגיה משולבת זו מחזקת את הכוח האנליטי של מודלי דגי זברה למחקר פרה-קליני במלנומה. חשוב לציין שאות התהודה הפרמגנטי של האלקטרון שזוהה בפרוטוקול זה משקף את החלק הפעיל של פולימר המלנין-חמצון הפעיל. בהתאם לכך, יש לפרש את עוצמת האות כקריאה רגישה לחמצון אדום ולא כמדד ישיר לתכולת המלנין הכוללת, ולשקול אותה בשילוב עם תכולת הפיגמנט הכוללת כאינדיקציה לשינויים ב-Redox הקשורים למלנין. עקב גישת מדידת כל האורגניזם ומספר תאי המלנומה המוגבל שהוזרקו, האות שזוהה מייצג בעיקר שינויים רדיקליים גלובליים הקשורים למלנין ברמת כל עובר/זחל דג הזברה, ולא אות ספציפי למלנומה שמקורו בלעדית בהשתל הזנולוגי. הבחנה זו רלוונטית במיוחד במערכות ביולוגיות דינמיות, שבהן שינויים במצב חמצון המלנין עשויים להתרחש באופן עצמאי משינויים בכמות הפיגמנט הכוללת.
עוברים של דגי זברה (Danio rerio) שימשו במחקר זה עד 5 ימים לאחר ההפריה (120 hpf). בשלב ההתפתחותי הזה, עוברים אינם נחשבים לבעלי חיים מוגנים לפי הנחיה 2010/63/EU ולכן ניסויים אינם דורשים אישור רשמי מוועדת אתיקה. למרות זאת, כל העבודה בוצעה בהתאם לפרקטיקות מעבדה טובות ולהנחיות מוסדיות לטיפול ושימוש בדגי זברה.
1. הכנת תגובות ותחזוקה של קווי תאי מלנומה בעכבר B16F1 ו-B16F10
2. השתלת תאי סרטן לזחלי דגי זברה
3. זיהוי רדיקלי מלנין באמצעות ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית
סקירה סכמטית של זרימת העבודה הניסיונית מוצגת באיור 1. עוברי דגי זברה נאספו, הושתלו בתאי מלנומה B16F10, דוגרו בתנאים מבוקרים, ונעקבו במיקרוסקופיה בשדה בהיר או פלואורסצנציה לפני ניתוח תהודה פרמגנטית אלקטרונים בתחום X. עוברים חיים הועמסו לאחר מכן לתוך נימים/מחזיק דגימה שטוח למדידות תהודה פרמגנטית של אלקטרון שלם, מה שאפשר זיהוי לא פולשני של אותות רדיקליים הקשורים למלנין. לאחר רכישת תהודה פרמגנטית אלקטרונית, שוחררו עוברים למדיום E3 טרי, מה שאפשר מדידות אורך באותם דגימות ביולוגיות.

איור 1: סקירה גרפית של זרימת העבודה הניסיונית במעקב אינ-ויבו אחר רדיקלים הקשורים למלנין בזנוגרפטים של מלנומה של דגי זברה באמצעות ספקטרוסקופיית EPR (תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X). עוברי דגי זברה נאספים, מושתלים בתאי מלנומה, מודגרים ומפוטרים במיקרוסקופ לפני שהם נטענים לנימים שטוחים מותאמים למדידות EPR של כל האורגניזם. לאחר גילוי אות הרדיקלי האופייני למלנין (g ≈ 2.003), משתחררים הזחלים למדידות מעקב לאורך זמן. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
כדי לאמת את הספציפיות של השיטה, בוצעו מדידות על עוברים מסוג בר (WT) ודגי זברה אלבינו. עוברי WT מתחילים לפתח פיגמנטציה נראית לעין בכ-27 hpf. בהתאם לכך, ספקטרום תהודה פרמגנטית אלקטרונים הנרכש מעוברי WT מציגים אות קווי יחיד אופייני שמרכזו ב-g ≈ 2.003, בהתאם לרדיקלים סמיקונונים שמקורם באאומלנין (למשל, DHI/DHICA). לעומת זאת, עוברים אלבינו, שחסרים סינתזת מלנין פונקציונלית, אינם מראים אות תהודה פרמגנטי אלקטרוני ניתן לזיהוי באותו אזור ספקטרלי אפילו 5 ימים לאחר ההפריה (DPF). דבר זה מאשר שהאות הנצפה נובע במיוחד מרדיקלים של מלנין ומייצג סלקטיביות של שיטת אימות בקרה שלילית (איור 2).

איור 2: ספקטרום תהודה פרמגנטית של אלקטרונים בתחום X של עוברים מסוג פראי (WT) ואלבינו של דגי זברה ב-5dpf. החץ מציין את מיקום התהודה (g ≈ 2.003) של אות הרדיקלי הקשור למלנין מעוברי דגי זברה WT ב-5dpf. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
השיטה מאפשרת ניטור כמותי של היווצרות רדיקלי המלנין במהלך ההתפתחות. ככל שהפיגמנטציה מתקדמת, נצפית עלייה ברורה בעוצמת אות התהודה הפרמגנטית של האלקטרונים. השוואה בין עוברי WT מ-2 dpf ל-5 dpf מראה עלייה משמעותית באות התהודה הפרהמגנטי האלקטרוני המשולב הכפול המנורמל לכל עובר. הנורמליזציה בוצעה על ידי חלוקת עוצמות אות התהודה הפרמגנטית של האלקטרונים הגולמיים במספר העוברים בדגימה לפני חישוב האינטגרל הכפול (איור 3A).
ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות מבחן קרוסקל–ווליס ואחריו מבחן ההשוואות המרובות של דאן. ניתוח על שישה שכפולים ביולוגיים עצמאיים (כל אחד כולל 7–10 עוברים) הראה הבדלים מובהקים סטטיסטית באות התהודה הפרהמגנטית המנורמל בין שלבי ההתפתחות (p < 0.05), מה שמאשר את רגישות השיטה.
האינטגרל הכפול של ספקטרום התהודה הפרמגנטית של האלקטרונים פרופורציונלי למספר הספינים הלא-מזווגים של האלקטרונים. לכן, העלייה מצביעה על עלייה באוכלוסיית הרדיקלים הקשורים למלנין במהלך ההתפתחות. חשוב לציין כי עלייה זו ככל הנראה משקפת שינויים בשיווי המשקל של החמצון המלנין הקשורים למלנוגנזה מתקדמת, ולא רק הצטברות פיגמנט.
השחזוריות של הפרוטוקול הוערכה עוד יותר על ידי השוואת ספקטרום תהודה פרמגנטית של אלקטרונים מייצגים שנאספו מדגימות המכילות מספר שונה של עוברים (7 לעומת 10) באותו שלב התפתחותי (5 dpf). כצפוי, הספקטרום הגולמי הראה הבדלים במשרעת האות הפרופורציונלית לגודל המדגם (איור 3B). לאחר הנרמול של כל ספקטרום למספר העוברים בכל דגימה, הספקטרום חפף כמעט לחלוטין (איור 3C), והשונות בין האצווה נותרה מתחת ל-10%. תוצאות אלו מדגישות את חשיבות הנורמליזציה לכל עובר ומאשרות את עמידות השיטה למחקרים השוואתיים.

איור 3: ניטור כמותי של דינמיקת רדיקליים התפתחותית הקשורה למלנין ונורמליזציה של ספקטרום תהודה פרמגנטית אלקטרונית. (A) אות תהודה פרמגנטי אלקטרונים אינטגרטיבי בפס X מתקבל מעוברי דגי זברה מסוג בר (WT) בימים 2, 3, 4 ו-5 ימים לאחר ההפריה (dpf). עוצמת האות נורמלה למספר העוברים בכל דגימה. הנתונים מייצגים ממוצע ± SD של שישה שכפולים ביולוגיים עצמאיים, שכל אחד מהם כולל 7–10 עוברים. הבדלים מובהקים סטטיסטית - *p < 0.05. (B) ספקטרום תהודה פרמגנטית אלקטרונים גולמי מייצגת שנאספה מעוברים 5 dpf WT באמצעות דגימות המכילות 7 ו-10 עוברים. משרעת האות עולה באופן פרופורציונלי עם מספר העוברים בדגימה. (C) אותם ספקטרום תהודה פרמגנטית אלקטרונים המוצגים בפאנל B לאחר הנרמליזציה, כלומר, עוצמות הספקטרום הגולמיות מחולקות במספר העוברים בקפילריה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
כדי להעריך האם הפרוטוקול תלוי בנימי השטוח המותאם האישי למדידות דגי זברה בחיים , בוצע זיהוי רדיקלי קשור למלנין באמצעות הנימים השטוחים המותאמים אישית וניתוח אקס ויבו סטנדרטי זמין מסחרית. ספקטרום תהודה פרמגנטי של אלקטרונים ייצוגיים שנרכשו באמצעות שני מחזיקי הדגימות הראו צורת קו ומיקום תהודה דומים מאוד (איור 4A), מה שמעיד כי זיהוי אמין של רדיקלים הקשורים למלנין אינו מוגבל לעיצוב הנימים המותאם אישית. האותות מהנימים השטוחים, לאחר הנורמליזציה לעובר, היו נמוכים פי 2 מאלו שחושבו מחדש מהנימים הסטנדרטיים.
כדי להעריך עוד את גמישות טיפול הדגימה, נמדדו עוברי דגי זברה מיד לאחר האיסוף ואחרי ההקפאה, ואחריהם ניתוח ex vivo באמצעות נימים סטנדרטיים. לא נצפו הבדלים מובהקים סטטיסטית בין דגימות טריות ומוקפאות בשישה שכפולים ביולוגיים עצמאיים (איור 4B). תוצאות אלו מראות כי ניתן להתאים את הפרוטוקול למחזיקי דגימות תהודה פרמגנטיות אלקטרונים הזמינים באופן נפוץ ותומך בניתוח אקס ויבו מאוחר, מה שמגביר משמעותית את הנגישות, הגמישות והשחזור של השיטה במעבדות עם ספקטרומטרים שונים של תהודה פרמגנטית אלקטרונית.

איור 4: תאימות הפרוטוקול. (A) ספקטרום תהודה פרמגנטית אלקטרונים גולמיים שנמדדו בנימים סטנדרטיים ושטוחים של דג זברה WT 2dpf. (ב) השוואה בין אותם שכפולים ביולוגיים (3 dpf זברה WT) שנמדדו חיים ומוקפאים בנימים סטנדרטיים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
כדי לקבוע האם אות התהודה הפרמגנטית של האלקטרון ניתן לייחס ישירות לרדיקלים שמקורם במלנין, השתמשו בעוברי דגי זברה אלבינו כרקע ללא מלנין והוזרקו לתאי מלנומה B16F10. מדידות תהודה פרמגנטית אלקטרונית בוצעו 4 ימים לאחר ההפריה (DPF) באותם תנאי רכישה המשמשים לעוברים מסוג בר. כצפוי, עוברים אלבינו שלא הוזרקו לא הראו אות תהודה פרמגנטי אלקטרוני ניתן לזיהוי באזור הספקטרום הספציפי למלנין. חשוב לציין שלא נצפה אות תהודה פרמגנטית אלקטרון המזוהה עם מלנין בעוברים אלבינו עם תאי B16F10 שהוזרקו (איור 5A), למרות שהשתלה מוצלחת של תאים אושרה במיקרוסקופיה מוארת (איור 5B).

איור 5: הערכת גילוי רדיקלי מלנין שמקורם במלנומה בגזנוגרפטים של דגי זברה אלבינו B16F10. (A) אות תהודה פרמגנטית אלקטרונים הקשור למלנין במדידות זנוגרפט 4df אלבינו ואלבינו B16F10 שנמדדו באמצעות ספקטרומטר תהודה פרמגנטי אלקטרוני בתחום X. נעשה שימוש בשלושה שכפולים ביולוגיים של 10 עוברים כל אחד. (B) תמונת שדה בהיר של 4 dpf אלבינו וגזנוגרפט אלבינו עם B16F10 שלושה ימים לאחר השתלת תאי הסרטן. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
תוצאות אלו מצביעות על כך שבתנאים ניסיוניים נוכחיים, מספר תאי המלנומה המוזרקים נמוך מסף הגילוי הישיר של תהודה פרמגנטית של אלקטרונים בתחום X. לכן, האות הקשור למלנין שזוהה במדידות אורגניזם שלם משקף בעיקר שינויים גלובליים במצב החמצון המלנין של עובר/זחל דג הזברה, ולא אות ספציפי למלנומה שמקורו בלעדית בהשתלת הזנו.
בניסויי זנוגרפט, יעילות ההשתלה והצמיחה של תאי מלנומה הייתה תלויה מאוד באתר ההזרקה. הזרקה למחזור הדם (זרם הדם) הביאה להתפתחות גידולים עקבית יותר ואפשרה זיהוי אמין של אותות תהודה פרמגנטיים אלקטרוניים הקשורים לתאי מלנומה. לעומת זאת, הזרקה לשק החלמון גרמה לפגיעה בהתפתחות העובר ולצמיחה לקויה, מה שהוביל לאותות חלשים או לא עקביים. לכן, מומלץ לבצע זרם דם לקבלת תוצאות חזקות וניתנות לפענוח (איור 6).

איור 6: השפעת אתר הזרקת תאי המלנומה על התפתחות עובר דג זברה 2 dpf והתפתחות זנוגרפט שנמדדה באמצעות תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X. ספקטרום תהודה פרמגנטית של אלקטרונים מייצגים מעוברי דגי זברה שהוזרקו בתאי מלנומה B16F10 לשק החלמון או למחזור הדם. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
כדי להדגים עוד יותר את היישום של השיטה במודלים של מלנומה, השווינו את אות התהודה הפראמגנטית של האלקטרון שהתקבל מעוברי דגי זברה מסוג בר (WT) ועוברי WT שהוזרקו לתאי מלנומה B16F10 בנקודות זמן התפתחות שונות.
בעוברי WT, אות התהודה הפרמגנטית של האלקטרון גדל בהדרגה עם הזמן, ומשקף את ההצטברות הטבעית של אומלנין במהלך ההתפתחות. לעומת זאת, עוברים הנושאים זנוגרפטים B16F10 הציגו שינוי בדינמיקת אותות, עם אות תהודה פרמגנטי אלקטרוני מותאם לעומת WT בנקודות זמן מתאימות (איור 7). הבדלים אלו ככל הנראה משקפים מודולציה שנגרמה על ידי גידול של מלנוגנזה של מארח ותנאי רדוקס מערכתית, ולא זיהוי ישיר של רדיקלים ממלנין שמקורם במלנומה בלבד. מכיוון שתאי B16F10 מייצרים בעיקר אומלנין, לא זוהה אות פאומלנין.

איור 7: השוואה מייצגת של דינמיקת אות EPR של אורגניזם שלם בעוברי דגי זברה הנושאים WT ו-WT B16F10 בביקורת. אות תהודה פרמגנטית אלקטרונית אינטגרטיבית ב-X שהתקבל מעוברי דגי זברה מסוג WT ו-WT B16F10 בשליטה ב-2, 3, 4 ו-5 ימים לאחר ההפריה (DPF). עוצמת האות נורמלה למספר העוברים בכל דגימה. הנתונים מייצגים ממוצע SD ± של שישה שכפולים ביולוגיים עצמאיים (לבקרה) ושלושה עבור זנוגרפטים של B16F10, שכל אחד מהם כולל 7–10 עוברים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
בסך הכול, היישום המוצלח של פרוטוקול זה מתבטא ב: (i) זיהוי אות תהודה פרמגנטי אלקטרוני חד-קו ב-g ≈ 2 בעוברים פיגמנטליים, (ii) היעדר אות בבקרות אלבינו, (iii) עלייה בעוצמת האות בשלב ההתפתחות, ו-(iv) שחזוריות בין שכפולים ביולוגיים לאחר הנרמליזציה.
מחקר זה מציג פרוטוקול עמיד ורגיש לזיהוי רדיקלים הקשורים למלנין בעוברי דגי זברה באמצעות ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X. השיטה מאפשרת ניטור לא פולשני וללא תוויות של שינויים רדוקסיביים הקשורים למלנין במהלך מלנוגנזה פיזיולוגית, התפתחות זנוגרפט מלנומה והתערבות פרמקולוגית. על ידי שילוב הרגישות הגבוהה של ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X עם פלטפורמת הזנוגרפט של דג זברה, גישה זו מרחיבה את היכולות האנליטיות של מודלים מודרניים של מלנומה של דגי זברה מעבר להדמיה מורפולוגית קונבנציונלית אל אפיון ביוכימי ישיר של מיני מלנין פעילים ב-Redox. בניגוד להדמיה מבוססת פלואורסצנציה, שמספקת בעיקר מידע מבני ומרחב, ספקטרוסקופיית תהודה פרהמגנטית אלקטרונית מזהה ישירות רדיקלים פרמגנטיים יציבים של סמיקינון, ומספקת תובנות פונקציונליות משלימות לביולוגיית חמצון רדוקסי של מלנין.
תהליך העבודה המוצג רלוונטי באופן רחב במחקר פיגמנטציה ומלנומה. יישומים פוטנציאליים כוללים הערכת טיפולים נגד מלנומה, חקר שינויים באיזון החמצון הרדוקסי שנגרמו על ידי תרופות, הערכת תרכובות מווסתות מלנוגנזה כגון חומרי הסרת פיגמנטציה או תגובת UV, וניתוח אינטראקציות בין גידול למארח ב-vivo. יתרה מזאת, שילוב עם הדמיית פלואורסצנציה ובדיקות פנוטיפיות אחרות עשוי לספק פלטפורמה רב-מודלית המשלבת מידע מרחבי, מורפולוגי וביוכימי, ובכך לשפר את הערך החיזוי של מודלי דגי זברה במחקר פרה-קליני ובפיתוח טיפולי.
מספר פרמטרים ניסיוניים הם קריטיים להשגת תוצאות אמינות. בניסויי זנוגרפט, הזרקה למחזור הדם סיפקה השתלה עקבית יותר ומדידות תהודה פרמגנטיות אלקטרוניות שניתנות לשחזור מאשר הזרקת שק חלמון, מה שמתאים למחקרים קודמים29,30. בחירת טמפרטורת הדגירה משחקת תפקיד חשוב. בעוד שזנוגרפות דגי זברה עשויות להישמר בדרך כלל בטמפרטורה של 32 מעלות צלזיוס כדי להעדיף קינטיקה של תאי יונקים31, קווי המלנומה B16F10 של העכברים ששימשו במחקר זה נראים אגרסיביים מספיק כדי להראות יכולות רבייה והגירה חזקות ב-28 מעלות צלזיוס. מכיוון שסביבה של 32 מעלות צלזיוס עלולה להאיץ משמעותית את התפתחות דגי הזברה — שעשויה להוביל להתנהגות אכילה עצמאית לפני היום החמישי לאחר ההפריה — שמירה על הזחלים בטמפרטורה של 28 מעלות צלזיוס תבטיח שהאורגניזמים יישארו בשלב ההתפתחותהלא מוגן 32. כתוצאה מכך, בחירת טמפרטורה זו עשויה לאפשר תצפית מוצלחת על התקדמות הגידול והגרורות תוך שמירה על עמידה בתקנות רווחת בעלי החיים שמגנות על הזחלים כאשר הם מגיעים לשלב ההאכלה העצמאי. נקודה קריטית נוספת היא שנירמול מדויק למספר העוברים ושלב התפתחותי עקבי הם חיוניים למזעור שונות ביולוגית. אותות חלשים או לא עקביים עשויים לנבוע מפיגמנטציה לא מספקת, עומס גידול נמוך, מיקום דגימה לא אופטימלי בתוך התהודה, או מילוי קפילרי לא שלם. במקרים כאלה, הגדלת מספר העוברים לכל דגימה, אופטימיזציה של יעילות ההשתלה ואימות מיקום הדגימה בנפח התהודה הפעילה עשויים לשפר את זיהוי האותות. נדרש מספר גבוה יותר של עוברים למדידות in vivo בקפילריה שטוחה בשל אובדן דיאלקטרי ופקטור מילוי מופחת הקשור למדידות אורגניזם שלם בדגימות ביולוגיות מימיות. עם זאת, שיטה זו יכלה לשמש עם נימים רגילים ex vivo. ממצאים אלו מראים כי הפרוטוקול תואם לתצורות ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונים בתחום X ותומך בניתוח אקס ויבו מאוחר, מה שמגביר את הנגישות והשחזוריות בין מעבדות המשתמשות במכשור שונה.
למרות יתרונותיה, לשיטה יש מספר מגבלות. שיקול ביולוגי חשוב הוא שאות התהודה הפרהמגנטית של האלקטרון שזוהה משקף את החלק הפעיל של חמצון אדום בפולימר המלנין ולא את תכולת הפיגמנט הכוללת בלבד 15,21,33. בהתאם לכך, יש לפרש שינויים בעוצמת אות תהודה פרמגנטית אלקטרונית כשינויים בשיווי המשקל של החמצון הרדוקטורי הקשור למלנין ולא כתחליף ישיר לשפע המלנין. ניסויי הזנוגרפט האלבינו הראו כי בתנאים הנוכחיים של הניסוי, מספר תאי המלנומה שהוזרקו נשאר מתחת לסף הגילוי הישיר של ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית בתחום X. לכן, אות האורגניזם השלם שזוהה בזחלים נושאי זנוגרפט משקף בעיקר שינויים גלובליים במצב החמצון הקשור למלנין המארח, הנגרמים על ידי אינטראקציות גידול-מארח, ולא אות ספציפי למלנומה שמקורו בלעדית מהזרע. חשוב לציין שהמיקרו-סביבה של דג הזברה מציגה גרדיאנטים דינמיים של חמצן, אינטראקציות מטבוליות ותנאי לחץ חמצוני שעשויים גם לווסת את אוכלוסיות רדיקלי המלנין ב-vivo 19,20. ביישומי זנוגרפט, השיטה מוגבלת כיום למודלים של מלנומה בעלת פיגמנט גבוה, שכן נדרש ריכוז מלנין מספק לזיהוי אותות אמין. גידולים אמלנטיים או בעלי פיגמנט חלש עשויים שלא לייצר אותות ניתנים לזיהוי27. בנוסף, קווי התאים של המלנומה ששימשו במחקר זה (B16F10) מייצרים בעיקר אומלנין, מה שמוביל לקו תהודה פרמגנטי אלקטרוני יחיד. במודלים עם תרומה משמעותית לפיומלנין, חפיפה ספקטרלית עשויה להתרחש13. במקרים כאלה, יידרשו סימולציה ספקטרלית מתקדמת ודקונבולוציה כדי להבחין בין אותות יומלנין לפיומלנין.
עם זאת, תהליך העבודה המוצג מציע פוטנציאל רחב לחקר ביולוגיית מלנומה, ויסות מלנוגנזה המושרה על ידי תרופות, לחץ חמצוני ואינטראקציות בין גידול למארח ב-vivo. שילוב ספקטרוסקופיית תהודה פרמגנטית אלקטרונית עם הדמיית פלואורסצנציה, מדווחים גנטיים ובדיקות פנוטיפיות נוספות עשוי לשפר עוד יותר את הערך החיזוי של מודלים של דגי זברה במחקר פרה-קליני במלנומה ובפיתוח טיפולי.
המחבר מיקולאי ברנובסקי מועסק בחברת Novilet, שמייצרת רכיבים של הספקטרומטר ששימש במחקר זה (אנלייזר רב-הרמוני). המחברים הנותרים מצהירים שאין להם אינטרסים מתחרים.
פרויקט "נימים חדשים ושיטה לקביעת רדיקל המלנין לשימוש במחקרים פרה-קליניים של תרופות פוטנציאליות למלנומה במודל העובר Danio rerio " FENG.02.07-IP.05-0059/23 בוצע במסגרת תוכנית FENG POC של הקרן למדע פולני, במימון משותף של האיחוד האירופי במסגרת קרנות אירופה לכלכלה חכמה 2021–2027 (FENG). מחקר זה נתמך על ידי האיחוד האירופי במסגרת תוכנית תפעול הצמיחה החכמה (מספר פרויקט POIR.01.02.00-00-00-0077/18).
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL או 0.5 mL צינורות אפנדורף | Eppendorf | 0030120086, 0030121023 | להעברת זחלי דג זברה לקפילרי |
| צינורות פסטר חד פעמיים של 3 mL | Medlab Products | 76-1303-2 | למיון והעברת עוברים וזחלים |
| ספקטרומטר EPR בנד X שולחני MiniScope MS200 | Magnettech | Bruker.com | רישום ספקטרום EPR |
| סידן כלוריד, דיהידרט | Chempur | 363-118748706 | להכנת מדיום E3 |
| שקופיות ספירת תאים (למשל, EVE או EVE PLUS) | Nanoentek Inc | NC2200445 | למונה תאים |
| CellTracker Green | Thermo Fisher | C2925 | צבע מעקב תאים פלואורסצנטי, לסימון תאים |
| CM-DiI | Thermo Fisher | C7000 | צבע מעקב תאים פלואורסצנטי, לסימון תאים |
| חממת CO2 ICO240med | Memmert | N/A | לתחזוקת תאים, מוגדר ל-37°C, 5% CO2, ≥95% לחות |
| מונה תאים אוטומטי Countess II | Invitrogen | AMQAX1000 | לספירת תאים ודחיסות תאים |
| קופסאות אחסון קריוגניות CryoKING | Biologix | BGX-ID81 | לאחסון דג זברה עם חומרת מושתל |
| מדיום קריופרזרבציה CM-1 | Cytion | #800150 | להקפאה של תאים סרטניים |
| מדיום דולוקה שונה (DMEM), גלוקוז גבוה, גלוטמין, ללא נתרן פירובט | Gibco | #11965-092 | לתחזוקת תרביות תאים |
| מדיום E3 | תוצרת בית | N/A | להחזקת עוברים/זחלים של דג זברה, הוכן על פי Cold Spring Harb Protoc 2011, doi: 10.1101/pdb.rec066449 |
| חממת ביצים | Incubato | 10130024 | להדגרת עובר/זחל של דג זברה, מוגדר ל-28–32°C |
| תוכנת eSpect+ | Novilet | https://novilet.eu/products/espect/ | למנתח רב-הרמוני |
| סרום בקר עוברית (FBS) | Gibco | A5256701 | תוסף ל-DMEM |
| מלקטות עדינות, מצופות קרמיקה, Dumont #5, 11 ס ³ | Dumont SA | 11252-50 | להסרת קליפת זחלי דג זברה |
| קפילריות זכוכית שטוחות המיועדות לדג זברה (מספר יישום: 21 736) | N/A | N/A | למדידות EPR של עוברי דג זברה |
| מחטים קפילריות מזכוכית | Harvard Apparatus | GB100-10 | ללא חוט, למיקרו-זריקות |
| קפילריות המטוקריט (מיקרופיפטות BLAUBRAND חד פעמיות של BRAND), נפח 50 ו-100 µL | BRAND | 41121500 | למדידות EPR או להעברת זחלי דג זברה לקפילריה שטוחה |
| מגנזיום כלוריד, הקסה-הידרט | Chempur | 363-116120500 | להכנת מדיום E3 |
| מערכת מיקרו-זריקה עם מיקרומניפולטור FemtoJet | Eppendorf | EPE5252000021 | להטעינת תאים למחטי מיקרו |
| טיפים Microloader לטעינת מחט | Eppendorf | #5242956003 | למערכת מיקרו-זריקה |
| שורת תאי מלנומה בעכבר B16-F1 | Cytion | CLS-400122 | להשתלות זרות |
| שורת תאי מלנומה בעכבר B16-F10 | Cytion | 305157 | להשתלות זרות |
| מנתח רב-הרמוני eSpect+ | Novilet | https://novilet.eu/products/espect/ | לספקטרומטר EPR, להגברת הרגישות |
| תמיסת פניצילין-סטרפטומיצין | Sigma | P0781-50ml | אופציונלי, תוסף ל-DMEM לתרבית תאים |
| צלחת פטרי, 55 ממ | Medlab Products | 51-0056-0A-NX | להדגרת ביצי דג זברה, עוברים וזחלים |
| מאגר פוספט מאוזן (PBS), ללא סידן ומגנזיום | Sigma | D8537-500ml | לשטיפת תאים |
| אשלגן כלוריד | Chempur | 363-117397402 | להכנת מדיום E3 |
| ערכת איטום לקפילריות המטוקריט - Critoseal | Noxygen | NOX-A.3-VPC | למדידות EPR של עוברי דג זברה |
| נתרן כלוריד | Chempur | 363-117941206 | להכנת מדיום E |
מאמר זה פורסם
הסרטון יגיע בקרוב