כדי לקבוע את ריכוז הפוּרוֹמִיצין האופטימלי לברירה יציבה, תאי 16HBE14o− הוריים טופלו בריכוזים עולים של פוּרוֹמִיצין (0.5–4 µg/mL), וחיוניות התאים נבדקה לאחר 24, 48 ו-72 שעות באמצעות מבחן חיוניות תאים. פוּרוֹמִיצין הפחית את חיוניות התאים באופן תלוי מינון וזמן, כאשר כל הריכוזים הפחיתו את החיוניות לרמה של פחות מ-20% לאחר 48–72 שעות (איור 3). ריכוז של 1 µg/mL היה הריכוז הנמוך ביותר שחיסל לחלוטין תאים שאינם טרנסדוקטריים, והפחית את אות החיוניות השאריתי לכ-4.5% תוך 48 שעות (p < 0.0001). הגדלת ריכוז הפוּרוֹמִיצין לא הובילה להפחתה נוספת בחיוניות התאים. לפיכך, נבחר ריכוז של 1 µg/mL פוּרוֹמִיצין לברירה העוקבת של תאים טרנסדוקטריים.
כדי למטב את יעילות הטרנסדוקציה הלנטיביראלית, תאי 16HBE14o− עברו טרנסדוקציה עם לנטיבירוס של דוחן לוציפראז STAT6 בריבוי זיהומים (MOIs) של 1, 5, 10 ו-20 למשך 48 h, ולאחר מכן עברו גרייה באמצעות IL-4 ו-IL-13 (במינון של 10 ng/mL כל אחד) למשך 24 h להפעלת סיגנל STAT6. כפי שמוצג ב-איור 4, יחידות לומינצנציה יחסיות (RLUs) עלו באופן תלוי MOI. MOI של 20 הניב את האינדוקציה הגבוהה ביותר של הדוחן, מה שהוביל לעלייה של כ-50 מומים בלומינצנציה בהשוואה לבקרת אי-הגרייה (p < 0.0001). בהתבסס על תוצאות אלה, נבחר MOI של 20 עבור הניסויים הבאים.
בעקבות הטרנסדוקציה והסלקציה באמצעות puromycin תחת התנאים הממוטבים, תאים שאינם טרנסדוקטיביים עברו מוות תאי נרחב, בעוד שתאים טרנסדוקטיביים שמרו על מורפולוגיה וחיוניות תקינות (איור 5). התאים ששרדו הועברו לאחר מכן לדילול מגביל (limiting dilution) לצורך הקמת קווי תאים מונוקלונליים של STAT6 reporter.
שלושה קווי תאי דגמי (reporter) מונוקלונליים שהופקו מתאים בודדים נבחנו עבור פעילות דגמי של STAT6. כל השיבטים הפגינו לומינסנציה בסיסית נמוכה (<1,000 RLU). גרייה באמצעות IL-4 ו-IL-13 השריתה פעילות דגמי חזקה בשיבטים 2 ו-3, עם לומינסנציה שעברה את 20,000 RLU והתאימה להשראה של יותר מ-20 מנתים (איור 6A). שיבט 3 הפגין את הלומינסנציה הבסיסית הנמוכה ביותר ולכן נבחר לאפיון נוסף. פעילות הדגמי בשיבט 3 נבחנה לאורך מעברים סדרתיים (P9–P21) כדי להעריך יציבות לטווח ארוך. כפי שמוצג ב-איור 6B, השראת הדגמי התלויה ב-STAT6 נותרה יציבה לאורך טווח המעברים שנבדק. שיבט נחשב למתאים לניסויים עוקבים כאשר הפגין קצב גדילה תקין, לומינסנציה בסיסית נמוכה מכ-1,000 RLU, והשראה של יותר מ-20 מנתים בעקבות גרייה של ציטוקינים.
מכיוון ש-IL-4 ו-IL-13 יכולים להפעיל חברים נוספים במשפחת STAT, כולל STAT3 ו-STAT5, נבחנה בהמשך הספציפיות של מערך הדיווח (reporter assay)17,18. תאי דיווח של STAT6 עוררו באמצעות IL-4 ו-IL-13 בנוכחות או בהיעדר מעכבים סלקטיביים המכוונים ל-STAT6, STAT5 או STAT3 למשך 24 h19,20,21. חיוניות התאים נותרה מעל 90% בכל תנאי הטיפול (מעכב STAT6 AS1517499, 100 nM: 98.4%; מעכב STAT5 AC-4-130, 2.5 µM: 97.4%; מעכב STAT3 Stattic, 2.5 µM: 96.2%; איור 7A). עיכוב של STAT6 הפחית באופן משמעותי את פעילות הלוקיפראז (p < 0.0001), בעוד שעיכוב של STAT5 או STAT3 לא הניב השפעה מובהקת על פעילות הדיווח (p = 0.2593 ו-p = 0.8857, בהתאמה; איור 7B). ממצאים אלו אישרו כי הפעלת הדיווח תלויה בעיקר ב-STAT6.
את חסוּנות הבדיקה העריכו באמצעות חישוב של מקדם Z′-factor, כאשר תאים שעברוהסטימולציה של IL-4 ו-IL-13 שימשו כביקורת לאות גבוה, ותאים שטופלו במעכב STAT6 שימשו כביקורת לאות נמוך. הבדיקה הניבה Z′-factor של 0.703 ± 0.097, דבר המעיד על ביצועי בדיקה מצוינים, חלון אות רחב והתאמה לסריקה בתוספת גבוהה (high-throughput screening).
לבסוף, נעשה שימוש בבדיקת הדו"ח (reporter assay) של STAT6 כדי לסנן מרכיבים סביבתיים נבחרים של חומר חלקיקי (particulate matter) לבחינת יכולתם לווסת את אותות ה-STAT6. לאחר 24 שעות של טיפול, benzo[b]fluoranthene (10 µM) הגביר באופן מובהק את פעילות הדו"ח של STAT6 בכ-1.75-מכפלות (p = 0.0006), בעוד שחומר חלקיקי (100 µg/mL) הגביר את פעילות הדו"ח בכ-1.5-מכפלות (p = 0.0398; איור 8). לעומת זאת, שאר הפחמימנים הארומטיים הפוליציקליים ותרכובות המתכות הכבדות, כולל CdCl2, HgCl2, ו-NiSO4 (10 µM כל אחד), לא שינו באופן מובהק את פעילות הדו"ח. יחד, תוצאות אלו מדגימות כי בדיקת הדו"ח של STAT6 היא יציבה, ספציפית, חסונה ומתאימה לסריקה בספיקה גבוהה (high-throughput screening) של תרכובות סביבתיות המווסתות את אותות ה-STAT6.

איור 1: זרימת עבודה ליצירת תאי 16HBE14o− STAT6 reporter. סקירה סכמטית של הפרוטוקול ליצירת תאי 16HBE14o− המבטאים באופן יציב STAT6 luciferase reporter. אנא לחץ כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: זרימת העבודה להקמה ויישום של בדיקת דגימה של STAT6. סקירה סכימטית של בדיקת דגימה של STAT6 לצורך תיקוף הבדיקה וסריקה של רעלים סביבתיים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: קביעת ריכוז הפיורומיצין האופטימלי לבחירה של תאים יציבים. תאי 16HBE14o− הורים טופלו בפיורומיצין (0.5, 1, 2, או 4 µg/mL) למשך 24, 48, או 72 שעות. תאי ביקורת-נשאי קיבלו 0.1% dimethyl sulfoxide (DMSO). חיות התאים נקבעה באמצעות בדיקת חיות תאים. חיות התאים חושבה מהפרש הבליעה בין 450 ל-650 nm לאחר חיסור רקע ונורמליזציה לביקורת-הנשאי. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD משלוש חזרות ביולוגיות בלתי תלויות עם כפילויות טכניות (n = 3). מובהקות סטטיסטית נקבעה באמצעות one-way ANOVA ולאחריו מבחן השוואות מרובות של Dunnett. ערכי p להשוואות מול ביקורת-הנשאי מצוינים בתרשים. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: אופטימיזציה של יעילות טרנסדוקציה לנטיווירלית. תאי 16HBE14o− עברו טרנסדוקציה עם לנטיווירוס רפורטר לוסיפראז של STAT6 בריבוי זיהומים (MOIs) של 1, 5, 10, או 20 למשך 48 h. לאחר תקופת התאוששות של 24 h, התאים עוברו בגירוי עם IL-4 ו-IL-13 (במינון של 10 ng/mL כל אחד) למשך 24 h. (A) יחידות לומינסנציה יחסיות (RLUs) בתאים שעברו טרנסדוקציה דמה (mock) ובתאים שעברו טרנסדוקציה עם הרפורטר ב-MOIs המצוינים. ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות one-way ANOVA, ולאחריו מבחן השוואות מרובות של Dunnett. (B) קיפול ההשראה לאחר גירוי בציטוקינים ביחס לביקרת MOI 20 לא מעוברית. ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות unpaired Student's t-test. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD משלוש חזרות ביולוגיות בלתי תלויות (n = 3). ערכי p מצוינים בגרף. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: תמונות מייצגות של תאים לאחר סלקציה של פיורומיצין.תאי 16HBE14o− עברו טרנסדוקציה עם או ללא לנטי-וירוס של רפורטר לוסיפרז עבור STAT6 (MOI = 20) וטופלו לאחר מכן ב-1 µg/mL פיורומיצין למשך 5 ימים. התמונות הופקו באמצעות מיקרוסקופ הפוך בניגודיות פאזה (phase-contrast) בהגדלה של 100× תחת תנאי דימוי זהים. תאי הורה שלא טופלו יצרו שכבה אפיתליאלית נורמלית (שמאלה). תאים שלא עברו טרנסדוקציה וטופלו בפיורומיצין הראו מוות תאי נרחב והיפרדות (מרכז), בעוד שתאים שעברו טרנסדוקציה ונבחרו באמצעות פיורומיצין נותרו חיוניים ושמרו על מורפולוגיה נורמלית (ימינה). Scale bar = 50 µm. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: זיהוי של שיבוטי דורג (reporter) של STAT6 והערכת יציבות הדורג. בעקבות דילול מגביל, הורחבו שלושה שורות תאים מונוקלונליות של דורג STAT6 ועוברו גרייה באמצעות IL-4 ו-IL-13 (במינון של 10 ng/mL כל אחד) למשך 24 h. (A) פעילות לוסיפראז של שיבוטי דורג בודדים לאחר גרייה בציטוקינים בהשוואה לבקרה ללא גרייה. (B) יציבות פעילות דורג STAT6 בשיבוט 3 לאורך מעברים סדרתיים (P9–P21). הנתונים מוצגים כממוצע ± SD של כפילויות טכניות. אנא לחצו כאן להצגת גרסה מורחבת של איור זה.

איור 7: עיכוב סלקטיבי של פעילות דגיש (reporter) של STAT6 ללא השפעה על חיות התאים. תאי דגיש של STAT6 עוררו באמצעות IL-4 ו-IL-13 (10 ng/mL כל אחד) למשך 24 h בנוכחות מעכב STAT6 מסוג AS1517499 (100 nM), מעכב STAT5 מסוג AC-4-130 (2.5 µM), או מעכב STAT3 מסוג Stattic (2.5 µM). קבוצת הביקורת (vehicle) שעוררה בציטוקינים קיבלה 0.1% DMSO. (A) חיות התאים נקבעה באמצעות מבחן חיות תאים. (B) פעילות לוקיפראז התלויה ב-STAT6 מנורמלת לביקורת שעוררה בציטוקינים. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD משלוש חזרות ביולוגיות בלתי תלויות (n = 3). ערכי p מצוינים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 8: הערכת ההשפעות המודולטוריות של רעלים סביבתיים על STAT6. תאי רפורטר של STAT6 טופלו במשך 24 h בחומר חלקיקי (100 µg/mL) או ברעלים סביבתיים מצוינים, כולל פחמימנים ארומטיים פוליציקליים (PAHs) ומתכות כבדות (10 µM כל אחד). פעילות לוסיפרז תלויית STAT6 נורמליזה ביחס לביקורת ה-vehicle (0.1% DMSO). הנתונים מוצגים כממוצע ± SD משלוש חזרות ביולוגיות בלתי תלויות (n = 3). מובהקות סטטיסטית נקבעה על ידי השוואה לביקורת ה-vehicle, וערכי p מצוינים. נא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה נלווית 1: מפרטי כלי תרבית ופרמטרי מעבר עבור תרבית תאים של 16HBE14o−אנא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.
טבלה נלווית 2: השוואה בין שיטות למדידת פעילות STAT6.אנא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.