שיטה הניתנת להתאמה אישית להחדרת חלבונים חיסוניים מופרשים לתוך מוח של עכבר חי, לצורך אפיון זמני ומרחבי של אינטראקציות נוירו-אימוניות.
מאמר שיטה
שיטה הניתנת להתאמה אישית להחדרת חלבונים חיסוניים מופרשים לתוך מוח של עכבר חי, לצורך אפיון זמני ומרחבי של אינטראקציות נוירו-אימוניות.
אף על פי שכידוע השפעתם של חלבונים חיסוניים מופרשים על תפקוד מערכת העצבים הולכת וגוברת, עדיין קיימים חסמים טכניים בהגדרת הדינמיקה המרחבית-זמנית שלהם בתוך הסביבה המורכבת של המוח. לדוגמה, מיקרוגליה, אוכלוסייה של תאי חיסון מרכזיים במוח, משחררת מגוון גורמים המקיימים אינטראקציה עם מטרות תאיות מגוונות רבות. חלבונים שמקורם במיקרוגליה יכולים לסמן לסוגי תאים אחרים via מנגנונים כגון קישור לקולטן שטח ללא הפנמה, הובלה פסיבית דרך הממברנה, ספיגה פגוציטית או ספיגה המתווכת על ידי אנדוציטוזה. כאן מוצגת שיטה להעברה מקומית של חלבון מופרש שמקורו במיקרוגליה כדי לנתח מנגנונים של אינטראקציה תאית ותוצאות תפקודיות המשך in vivo. אנו מתארים כיצד להכין דגימות חלבון להעברה, כיצד לבצע הזרקה סטריאוטקסיס של חלבון לאזורי מוח מטרתים, ושיטות עבודה מומלצות לאיסוף והכנה של רקמת מוח לצורך ויזואליזציה של חלבונים הרגישים לקיבוע באמצעות אימונוהיסטוכימיה. גישה זו מספקת מסגרת רב-גונית למחקרים מבוקרים מרחבית וזמנית של תקשורת נוירו-אימונית, ומאפשרת חקירה מנגנונית של האופן שבו חלבונים ממקור חיסוני מווסתים באופן דינמי את תפקוד הנוירונים והמוח.
תקשורת נוירו-אימונית, או השיח המולקולרי בין מערכת העצבים למערכת החיסון, הוכרה רק לאחרונה כחיונית להבנת הבריאות והמחלה. המוח, שבעבר נחשב למוגן במידה רבה מפני פעילות מערכת החיסון1,2, מוכר כיום כבעל נישות אימוניות דינמיות ביותר, המאפשרות למערכת העצבים לשלוח ולקבל אותות חיסוניים בכל רחבי הגוף3. תקשורת דו-כיוונית חסונה זו מתווכת לרוב על ידי תאים בעלי יכולת חיסונית החיים במוח או בממשקים של מערכת העצבים, כגון ה-choroid plexus, הקרומיות (meninges) והחללים הפרי-וסקולריים4. עם זאת, בתוך הפרנכימה של המוח, סיגנל אימוני מתווך בעיקר על ידי מיקרוגליה, המקרופאגים תלויי-רקמה ארוכי החיים המנביטים את המוח בשלב ההתפתחות העוברית. למרות שהם נחקרים לעיתים קרובות בניסויים תוך דגש מיוחד על תפקודי הפגוציטוזה שלהם, תאי המיקרוגליה מקיימים אינטראקציה הן עם סביבתם המיידית והן למרחקים ארוכים באמצעות שחרור מגוון רחב של פקטורים חיסוניים5.
מידול של מצבים מורכבים ומולטי-פקטוריאליים כמו זיהומים, פגיעות ומחלות in vivo, למרות יתרונו במתן הבנה הוליסטית של מערכת העצבים תחת עומס, מוביל למפל של גורמים עם השלכות נרחבות ומגוונות שעלול להיות קשה להפריד ביניהן. יתרה מכך, בהינתן ההטרוגניות הגבוהה בין תאים באזורי מוח שונים, זיהוי השחרור הסיבתי וההשפעות הנלוות של גורמים בודדים נותר מאתגר. בעוד שכלים כגון וקטורים לנטי-ויראליים וויראליים אסוציאטיביים-אדנו (AAV), המאפשרים ביטוי יתר של גורמים ספציפיים בעקבות הדבקה מדויקת למיקום, אפשרו חקירה של תפקידיהם של גורמים מופרשים מתאי מוח אחרים, כגון נוירונים ואסטרוציטים, במגוון הקשרים, מיקרוגליה נותרה עד כה קשה למודולציה ספציפית וחזקה בדרך זו6. לפיכך, היכולת להעביר מולקולות איתות שמקורן במיקרוגליה למיקום מוגדר במוח מספקת שיטה שימושית להפרדת תפקידיהם המדויקים והשלכותיהם בהקשרים שונים.
מטרת שיטה זו היא להוביל גורמים המופקים ממיקרוגליה לתוך מוחו של עכבר חי באופן מרחבי-זמני, וזאת כדי לאפשר חקירה המשכית של ההשפעות הפונקציונליות של חלבון או מולקולה רלוונטיים. יתרה מכך, שיטה זו למתן תוך-גולגולת ניתנת להתאמה להקשרים ולשאלות מחקר רבות אחרות, כגון באמצעות מתן משולב של גורמים מרובים, כגון גורמי חיסון בעלי השפעה הדדית או מעכבים, או חקירת תגובות רקמה לאורך מסלול זמן רלוונטי. בעוד שפרוטוקול זה יתאר איסוף והכנה של רקמות עבור נקודות קצה של אימונוהיסטוכימיה, ניתן לשלב עם שיטת מתן זו מגוון של נקודות קצה מוחיות אחרות, כגון איסוף דגימות רקמה (punches) בהקפאה מהירה מאזור מוחי רלוונטי עבור qPCR או לבדיקת שפע חלבונים. באמצעות Western blot או ELISA, או ביצוע רישומים אלקטרופיזיולוגיים של פעילות נוירונלית באזור מוזרק במוח.
כל ההליכים הכוללים בעלי חיים בוצעו בהתאם למדריך של המכונים הלאומיים לבריאות (National Institutes of Health) לטיפול בבעלי חיים במעבדה ובמסגרת פרוטוקולים שאושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול בבעלי חיים ולשימוש בהם (IACUC) במוסד המחקר. כל ההליכים המתוארים כאן נבחנו ואושרו על ידי ה-IACUC באוניברסיטת Duke. הריאגנטים והציוד שנעשה בהם שימוש מפורטים ב- טבלת חומרים.
1. (אופציונלי) הכנת חומר ההזרקה עם הסימון הרצוי
2. הכנת הציוד להליך הכירורגי
3. הליך ניתוח סטריאוטקסי
הערה: כל הניתוחים בוצעו בחדר ניתוחים בעל אוורור גבוה, וכל אנשי הצוות ענדו ציוד מיגון אישי הכולל כפפות, מסכות פנים, כיסויי שיער, כיסויי נעליים וחלוקים. חשיפה לגז Isoflurane מהווה סיכון בריאותי ולכן דורשת מערכת שאיבה (scavenging system), כגון מכלים של פחם פעיל, אותם יש לשקול לפני ואחרי השימוש ב-isoflurane. יש לוודא שכל הציוד, כגון מאייד ההרדמה, מערכות האוורור וציוד השאיבה, מאושר ומכויל כראוי לפני השימוש.
4. הזרקה של חלבון העניין והתאוששות כירורגית
5. הכנת רקמה להליך האימונוהיסטוכימי
6. ביצוע אימונוהיסטוכימיה עבור החלבון המוזרק
C1q הוא חלבון גדול (~450 kD) המבוטא ברמה גבוהה בכל רחבי הגוף, בעל תפקידים מוגדרים היטב במערכת החיסון המולדת כחבר מפתח במסלול המשלים הקלאסי. עם זאת, תפקידיהם התפקודיים של C1q במוח עדיין נמצאים תחת מחקר. C1q במוח מיוצר ומשוחרר בעיקר על ידי מיקרוגליה, אוכלוסיית תאי החיסון התושבים של המוח9. תפקידו של C1q בתהליכים כגון הסרה סינפטית במהלך התפתחות תקינה של המוח, למידה וזיכרון, ובהקשרי מחלה, הוכח שוב ושוב10,11,12,13,14. כמו כן, נצפתה הצטברות של C1q בתוך מבנים עצביים או בסמיכות מיידית אליהם עם התגבשות גיל המוח, הן במכרסמים והן בפרימטים שאינם בני אדם9,15,16. המעבדה שלנו מעוניינת בהשלכות התפקודיות של הצטברות C1q במוח במהלך ההזדקנות. מחקר זה גילה כי C1q מקיימת אינטראקציה עם חלבונים תוך-תאיים עצביים במכרסמים בוגרים ומזדקנים, כולל חלבונים קושרי RNA8. מכיוון שהוכח בעבר שתאי T מסוגלים להפנים (internalize) C1q שמקורו מסוגי תאים אחרים17, בדקנו האם גם נוירונים מסוגלים להפנים C1q חיצוני in vivo.
במחקר זה בוצעו תחילה הזרקות חד-צדדיות תוך-חדריות מוחיות (ICV) של 2 µL מחלבון C1q לעכברים זכרים בני 3 חודשים. מכיוון ש-C1q מבוטא במוח של בוגרים מסוג wild-type, השתמשנו בשתי גישות: ראשית, חלבון C1q הוזרק לעכבר C1q -/- (knockout), ושנית, ה-C1q סומן פלואורסצנטית באמצעות צימוד 594-maleimide כדי לאפשר הבחנה בין חלבון C1q טבעי לבין חלבון C1q חיצוני בבעל חיים מסוג C1q +/+ (wild-type). החלבון ניתן בריכוז של 1 mg/mL, תלוי בתמיסת באפר של 10 mM HEPES, 300 mM NaCl, pH 7.2. הקואורדינטות הסטריאוטקסיות הבאות שימשו להזרקה ICV להמיספירה השמאלית: X = +1.0 mm, Y = -0.4 mm, Z = -2.5 mm, והנפח הוזרק בקצב של 500 nL/min. כדי לצמצם זרימה חוזרת, המחט מזכוכית מומשכת ששימשה להזרקה הושארה במקומה למשך 5 min לאחר סיום ההזרקה ולפני הסרתה. רקמות נאספו שעה אחת לאחר ההזרקה ועובדו לניתוח אימונוהיסטוכימי בחתכים סגיטליים. הזרקה מוצלחת צריכה להוביל לפלואורסצנציה מקומית באזור שהוגדר סטריאוטקסיות.
ראשית, בעכברים C1q -/-, ביצענו דימוג של חתכים סגיטליים בעובי 30 µm של ההמיספרה השמאלית (איור 3A) והימנית (איור 3B) לאחר השלמת פרוצדורת האימונוהיסטוכימיה (שלבים 6.1–6.17). נעשה שימוש בנוגדן anti-NeuN להדמיית גופי תאי עצב (ציאן), ובנוגדן anti-C1q (אדום) להדמיית C1q לא-מתויג שהוזרק שעה אחת לפני כן לחדר המ ventricle השמאלי. ניתן להבחין בכמות שופעת של C1q בהמיספרה השמאלית בתוך הפארנכימה הפרי-ונטריקולרית, ובלוקולוקליזציה גבוהה בין גופי תאי עצב לבין C1q באזור CA3 של ההיפוקמפוס (איור 3A), בדומה למה שנצפה בעכבר מסוג wild-type עם ביטוי אנדוגני של C1q. כפי שצפוי, C1q המוזרק אינו נראה סביב החדרים (או בכל מקום אחר בפארנכימה) בהמיספרה הקונטרלטרלית שעה לאחר ההזרקה (איור 3B). לאחר מכן, בוצע דימוג של מוחות של עכברי wild-type C1q +/+ (C57BL/6J) שהוזרק להם C1q-594 בשיטת ICV. כאן אושש כי ניתן להדמות C1q-594 (מגנטה) בחתכים סגיטליים של 30 µm באמצעות כיבוי אוטופלורסצנציה בלבד וכיסוי עם DAPI (כחול) (שלבים 6.12–6.17). בהמיספרה השמאלית (המוזרקת), ניתן להבחין ב-C1q מוזרק המתויג פלואורסצנטית (מגנטה) באותה התפלגות פרי-ונטריקולרית (איור 3C).
על מנת לאשר קולוקליזציה נוירונלית, בוצע ניסוי משני עם שני זכרים בני חודשיים מסוג C1q -/-. בהמיספרה אחת, קיבלו העכברים הזרקה ICV של 2 µL של C1q-594, ובהמיספרה השנייה קיבלו העכברים 2 µL של C1q-594 שעבר אינאקטיבציה תרמית (HI). האינאקטיבציה התרמית בוצעה לאחר צימוד 594-maleimide, כאשר מחצית מהחלבון שהוכן הוכנסה לבלוק חימום שהוגדר ל-56 °C למשך 30 min. הוכח בעבר כי אינאקטיבציה תרמית משנה את מבנה החלבון הטבעי של C1q ומשבשת את האקטיבציה18. C1q טבעי ונורמלי בריכוז של 200 µg/mL במסנן תמיסה (50 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.5) הוא מסיס בתמיסה ואינו יוצר אגרגטים נראים תחת מיקרוסקופיה בשדה בהיר (איור 4A). לעומת זאת, כאשר אותה הכנה של חלבון חוממה, נצפו אגרגטים נראים תחת שדה בהיר (איור 4B), דבר המצביע על שינוי בקונפורמציה של החלבון. לאחר מכן, נבדק האם הזרקה של HI-C1q in vivo תשנה את הספיגה הנוירונלית של C1q. מוחות נאספו שעה אחת לאחר ההזרקה, וכל המיספרה עובדה באופן זהה כפי שמתואר בפרוטוקול לעיל. בחתכים סגיטליים בעובי 20 µm, בוצע אימונוהיסטוכימיה לזיהוי נוירונים. תמונות בהגדלה של 40x צולמו עם הגדרות זהות של hippocampal CA3 כדי ללכוד נוירונים NeuN+ (בציאן) ו-C1q-594 (באדום) (איור 5A,B). בהמיספרה שהוזרק בה C1q-594 נורמלי, נצפתה סימונ C1q חזק (איור 5A), בעוד שבמיספרות שהוזרק בהן HI-C1q-594, לא נצפה C1q-594 ב-CA3, אף שניתן היה להבחין בחלבון הפלואורסצנטי נאסף מסביב לקצוות המערכות (איור 4C), דבר העולה בקנה אחד עם שינוי בתפקוד הנורמלי של חלבון C1q בספיגה נוירונלית. כימות של תאי NeuN+ על ידי כימות ידני על ידי חוקר מסומך (blinded) ב-8 שדות ראייה בהגדלה של 40x לא העלה שינויים בצפיפות הנוירונים ב-CA3 בין ההמיספרות (איור 5D), עם זאת, אחוז הנוירונים שהיו C1q+ היה נמוך באופן מובהק בהמיספרות שהוזרק בהן HI-C1q-594 (איור 5C) לפי t-test דו-זנבי (p = 0.026, n = 2 בעלי חיים, 2 תמונות של כל המיספרה לכל בעל חיים שנותחו).

איור 1: מערך כירורגי והכנת שטח סטרילי לניתוח. (A) ציוד כירורגי: 1. סטריאוטקס, 2. מחמם למכרסמים, 3. מאייד איזופלורן, 4. מיכל לפינוי איזופלורן, 5. זרוע סטריאוטקס דיגיטלית, 6. מיקרו-מזרק, 7. מקדח, 8. מיקרוסקופ סטריאוסקופי. (B) כלי עיקור באוטוקלאב ומגבת כירורגית לשטח סטרילי עם פס אינדיקטור לאדים לאישור הסטריליות. (C) כלים שעברו עיקור באוטוקלאב מונחים בזהירות כאשר הקצוות פונים פנימה אל השטח הסטרילי שהגדירו על המגבת הכירורגית שעברה עיקור. הידיות נשארות מחוץ למרכז הסטרילי, וקצוות הכלים יבואו במגע עם החיה רק לאחר חיטוי ב-betadine וב-70% ethanol. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: עיבוד והקפאת המוח לצורך חיתוך סגיטלי. (A) השתמשו בלהב תער כדי לחתוך את המוח לאורכו של קו האמצע, ולאחר מכן הניחו כל המיספרה כאשר צד קו האמצע פונה כלפי מטה בתבנית הקפאה. (B) מלאו את התבניות בתערובת של 50:50 של מדיום הטמעה להקפאה ו-30% סוכרוז ב-PBS. (C) הקפיאו את המוחות בתבניות על קרח יבש (שמאל). המוחות יהפכו לאטומים כאשר יהיו קפואים לחלוטין (ימין). אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של איור זה.

איור 3: תוצאות מייצגות של מתן תוך-חדרי מוחי (ICV) של חלבון C1q שעה אחת לאחר ההזרקה. (A) חיתוך סגיטלי של חלבון C1q המוזרק (אדום) וגופי תאי עצב NeuN+ (ציאן) בהמיספרה המוזרקת, ובתמונה מוגדלת אזור CA3 של ההיפוקמפוס הסמוך לחדר. (B) חיתוך סגיטלי של ההמיספרה הנגדית להזרקה באותו בעל חיים, עם חלבון C1q המוזרק (אדום) וגופי תאי עצב NeuN+ (ציאן), ובתמונה מוגדלת אזור CA3. (C) חיתוך סגיטלי של בעל חיים מסוג wild-type שהוזרק ICV עם C1q המסומן פלואורסצנטית באמצעות צימוד 594-maleimide (מגנטה), ללא הגברה אימונוהיסטוכימית, אך עם כיסוי של DAPI (כחול), ובתמונה מוגדלת אזור CA3. סרגלי קנה מידה בתמונות משמאל = 1000 µm, סרגלי קנה מידה בתמונות מימין = 150 µm. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: אינאקטיבציה תרמית של חלבון C1q. (A) חלבון C1q טבעי, תלוי בבופר (50 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7.5) בריכוז של 200 μg/mL, שצולם במיקרוסקופיית שדה בהיר. (B) אותו מקור של חלבון C1q, תלוי באותו בופר ובאותו ריכוז, אך שעבר טיפול תרמי ב-56 °C למשך 30 min לפני הצילום במיקרוסקופיית שדה בהיר. (C) לוקליזציה של HI-C1q-594 שעבר אינאקטיבציה תרמית (אדום) ותאי +NeuN (ציאן) בחתך סגיטלי שעה אחת לאחר הזרקה תוך-וונטריקולרית (ICV). סרגל קנה מידה עליון = 10 µm, סרגל קנה מידה תחתון = 1000 µm. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: כימות של ספיגת חלבון C1q תקין לעומת C1q שהשתבת בחימום לתוך נוירונים בהיפוקמפוס. (A) חיתוך סגיטלי של אזור CA3 בהיפוקמפוס סמוך לחדר, שבו הוזרק C1q-594 שעה אחת לפני כן. גופי תאי נוירונים NeuN+ (ציאן), C1q-594 (אדום), והחפפה של השניים. (B) חיתוך סגיטלי של אזור CA3 בהיפוקמפוס סמוך לחדר, שבו הוזרק (HI)-C1q-594 שהשבת בחימום שעה אחת לפני כן. גופי תאי נוירונים NeuN+ (ציאן), C1q-594 (אדום), והחפפה של השניים. (C) כימות של אחוז התאים NeuN+ שהם C1q-594+ בשדה ראייה של 40x, מבחן t-test דו-זנבי. (D) כימות של מספר התאים NeuN+ בשדה ראייה של 40x, מבחן t-test דו-זנבי. סרגלי קנה מידה = 50 µm. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.
| סימון חלבונים | נוגדן | |
| ויזואליזציה | ישיר, שאינו תלוי בנוגדן | עשוי להפגין תגובתיות צולבת עם חלבונים אחרים, בהתאם לזמינות האנטיגן |
| הכנה | דרושה הכנה ותיקוף ממושכים וטכניים יותר של החלבון הנחקר, שכן סימון עלול לשנות את מבנה החלבון ואת תפקודו. בנצולת התגובה עשויה להיות נמוכה, דבר הדורש כמויות גדולות של חלבון פלט (input protein). | ללא הכנה, נוגדנים רבים זמינים מסחרית וכבר עברו תיקוף |
| גמישות ניסיונית | מעקב בזמן אמת אפשרי במידה ונדרש | דורש קיבוע |
| רגישות | רגישות מוגבלת עקב סטוכיומטריה | מאפשר הגברה |
טבלה 1: יתרונות וחסרונות של סימון חלבונים נגדגילוי נוגדנים.
ראיות חדשות תומכות בתפקיד קריטי של מיקרוגליה בהומאוסטזיס של מערכת העצבים המרכזית (CNS), המתווך על ידי רפרטואר מורכב יותר ויותר של גורמים מופרשים5. היכולת לספק גורמים המופרשים ממיקרוגליה באופן מרחבי-זמני מוגדר מהווה כלי בעל ערך להבנת התקשורת הנוירו-אימונית המורכבת תחת מגוון תנאים סביבתיים וגנטיים.
ניתן להתאים שיטה זו בקלות למענה על מגוון שאלות ביולוגיות. בעוד ששיטה זו שימשה בעבר להבנה טובה יותר של תפקידי C1q, חלבון גדול מאוד, בתפקוד נוירונלי8, ניתן להחיל אותה גם כדי לחקור את תפקידיהם של חלבונים גדולים אחרים, כמו גם חלבונים קטנים כגון ציטוקינים וכימוקינים. בעוד שהתפקידים החיסוניים של ציטוקינים וכימוקינים מובנים היטב למדי, in vivo, גורמים אלה משתחררים לעיתים קרובות יחד, בתגובה לגורם מאמץ, ובאופן נרחב. יתרה מכך, תפקידיהם הלא-חיסוניים/הלא-קנוניים של גורמי חיסון שונים, שלעיתים קרובים להומיאוסטזה, הופכים ברורים יותר ויותר. שימוש בשיטה זו יאפשר חקירה של גורמים ספציפיים באופן מבודד, כמו גם באזורי מוח ספציפיים, ואפילו את תפקידיהם של גורמים אלו בהומיאוסטזה. יישום מועיל נוסף של פרוטוקול זה יהיה מתן חלבונים רלוונטיים בקווי עכברים טרנסגניים, כגון בקווי knockout או במודלים של מצבי מחלה ספציפיים. היכולת לשלוט במיקום המדויק ובכמות של חלבון רלוונטי בעכבר ללא ביטוי אנדוגני של חלבון זה, יכולה לשמש כדי לקבוע אם מתן מקומי ואקוטי של החלבון משרה השפעה כלשהי, כגון שינוי התנהגותי. לחלופין, ניתן להזריק לקו טרנסגני שחסר רצפטור ספציפי או חלבון איתות שמעריכים כי הם חשובים לתפקוד של הגורם המוזרק.
בנוסף, ניתן לבצע מתן תוך-גולגולתי של גורמים המופקים ממיקרוגליה במקביל להזרקה של גורמים אחרים, כדי לשפר את ההבנה המכניסטית של תפקוד חלבון מסוים. לדוגמה, כדי לקבוע כיצד C1q, חלבון המופק ממיקרוגליה, חודר לנוירונים ומתממשק עם מערכת התרגום שלהם, השתמשנו בעבר בטכניקה זו למתן משולב של מעכב אנדוציטוזה 30 דקות לפני הזרקת C1q. הדבר אפשר לנו לקבוע כי C1q יכול להיכנס לנוירונים via אנדוציטוזה, שכן יישום משולב עם המעכב הוביל להפחתה משמעותית של C1q בתוך הנוירונים8. ניסויים דומים ניתן לבצע באמצעות מתן של נוגדי חסימה או אפילו גורמים אחרים המשערים קשירה תחרותית. ניתן למשוך את ניסויי המתן המשולב הללו גם באופן זמני על ידי הארכה או קיצור של מרווחי ההזרקה, למשל, הזרקת גורם אחד 30 דקות לפני השני, או גורם אחד 5 דקות לעומת שעה אחת לפני כן.
יש לשקול מספר גורמים בעת תכנון ניסויים המשתמשים במתודולוגיה זו, החל מהאסטרטגיה לגילוי החלבון הנחקר. כאן הודגמו שתי גישות מייצגות: סימון פלואורסצנטי ישיר של החלבון (איור 3C) וגילוי אימונוהיסטוכימי באמצעות נוגדנים (איור 3A), שלכל אחת מהן יתרונות ומגבלות נפרדים (טבלה 1). גילוי מבוסס נוגדנים הוא רגיש מאוד ומאפשר הגברה של האות, אך הוא דורש קיבוע של הרקמה, מה שהופך אותו לבלתי מתאים ליישומים כגון דימוי חי של דינמיקת חלבונים. סימון פלואורסצנטי ישיר נמנע ממגבלה זו אך דורש שינוי של החלבון עצמו, דבר העלול להשפיע על תכונותיו ולכן מחייב תיקוף. ללא קשר לגישה הנבחרת, תיקוף קפדני הוא חיוני. נוגדנים מסחריים זמינים באופן נרחב אך עשויים להראות קישור לאתרים שאינם המטרה (off-target binding) או תגובת צלב, מה שהופך את בדיקת הספציפיות לקריטית. במידת האפשר, יש לאשר את ביצועי הנוגדן באמצעות בקרות מתאימות, כגון השוואת צביעה ברקמה של סוג בר (wild-type) וברקמה עם נשקיות של החלבון (protein knockout), שנותרתe תקן הזהב לתיקוף נוגדנים.
לעומת זאת, סימון פלואורסצנטי ישיר דורש הן הכנה והן תיקוף לפני השימוש הניסויי. למרות שגישה זו מאפשרת ויזואליזציה ישירה של החלבון ללא הסתמכות על נוגדנים, חיוני לוודא שהתג הפלואורסצנטי אינו משנה את מבנה החלבון, המיקום שלו, האינטראקציות שלו או תפקודו. תיקוף מתאים תלוי בחלבון, אך עשוי לכלול אישור של המשקל המולקולרי הצפוי באמצעות Western blot, אימות מיקום תאי או תת-תאי תקין, או הערכת השימור של אינטראקציות ידועות בין חלבונים באמצעות בדיקות כגון co-immunoprecipitation. בסופו של דבר, הן לזיהוי מבוסס נוגדנים והן לסימון ישיר של חלבונים ישנם יתרונות ומגבלות מובנים, ויש לקבוע את הגישה המתאימה ביותר באופן אמפירי באמצעות מחקרי פיילוט המותאמים לחלבון הנחקר ולהמלצות שפורסמו19.
כדי שמתודולוגיה זו תהיה אמינה, חשוב שהקואורדינטות הסטריאוטקסיות וריכוז החלבון המוזרק שנבחרו על ידי החוקר יעברו אופטימיזציה ותיקוף אמפיריים מראש. ניתן לבצע תיקוף של הקואורדינטות באמצעות הזרקה ראשונית (pilot) של צבע, כגון Fast Green, ולאחר מכן איסוף המוח מיד לאחר ההזרקה. פעולה זו תאפשר אישור ויזואלי של מיקום הצבע באזור העניין, וכן תעניק את ההזדמנות לדייק את הקואורדינטות לצורך השגת ההזרקה המדויקת ביותר האפשרית. המחברים ממליצים להסתמך על עבודות שפורסמו בעבר כדי לקבוע קואורדינטות סטריאוטקסיות מדויקות לאזורי העניין, או לחשב קואורדינטות לבדיקה בעכברים גדולים או קטנים בהתבסס על יחס ה-bregma-lambda, כפי שמתואר ב-פרוטוקול.
על מנת להסיק מסקנות ניסיוניות לגבי החלבון שהוזרק, ישנם מספר בקרות מפתח שיש לשקול ולכלול בניסוי שתוכנן היטב. קיימים אתגרים מובנים בחקר חלבונים המופקים ממיקרוגליה via מתן תוך-גולגולתי. אם החוקר מעוניין בתגובה לחלבון מסוים באזור ספציפי במוח, הניתוח עצמו יהיה דלקתי ועשוי להטות את הממצאים. כאשר בוחנים חלבונים הקשורים למערכת החיסון, הפשוטים ביותר לביצוע הם בקרות ניתוחיות, שבהן מבוצע ניתוח דמה (כל השלבים למעט הזרקת החלבון), הזרקת בקרת נשא (כל השלבים, אך במקום הזרקת חלבון, מוזרק אותו נפח של תמיסת הבופר של החלבון בלבד), או שניהם. אלו מסייעים להבחין בין השפעות התלויות בניתוח או בפגיעה ברקמה לבין תוצאה של החלבון עצמו. דפיניטיבי יותר יהיה לכלול בקרת הזרקה של חלבון לא פעיל או לא רלוונטי באותו נפח וריכוז. חשוב לשקול את הגודל היחסי של חלבון הבקרה בהשוואה לחלבון הניסיוני; לדוגמה, C1q הוא חלבון גדול מאוד (~450 kD), ולכן הזרקת חלבון בקרה נפוץ כמו bovine serum albumin (~66 kD) עשויה שלא להיות המתאימה ביותר. לפיכนั้น, C1q שעבר אינאקטיבציה בחום שימש כבקרת חלבון לא פעיל. בהתאם להתפשטות החלבון המוזרק בחלון הזמן הרצוי לפני האיסוף, ניתן לבצע זאת כבקרת תוך-נבדק על ידי הכללת אחד מתנאי בקרה אלו בהמיספירה הנגדית להמיספירה שבה בוצעה ההזרקה הניסיונית, כפי שניתן לראות בתוצאות מייצגות (איור 4 ו-איור 5).
שיקול חשוב בתכנון ניסיוני הוא אסטרטגיית קיבוע הרקמה, שכן הן סוג הקיבוע והן משכו יכולים להשפיע באופן עמוק על ויזואליזציה של חלבונים, על מורפולוגיית הרקמה, ובמקרים מסוימים, על תפקוד החלבון. מקבעים יוצרי קשרי גומלין (crosslinking) כגון פאראפורמאלדהיד (PFA) מספקים בדרך כלל שימור מעולה של ארכיטקטורת הרקמה, אך עלולים להפחית את הגילוי של אפיטופים הרגישים לקיבוע עקב קישור יתר של חלבונים, להגביר את האוטופלורסצנציה, ולהצריך שלב של חשיפת אנטיגן (antigen retrieval). לעומת זאת, מקבעים שאינם יוצרי קשרי גומלין, כגון תמיסות המבוססות על אלכוהול, אצטון או מתנול, משמרים לעיתים קרובות טוב יותר חלבונים הרגישים לקיבוע, אך עלולים לפגוע בשלמות הרקמה. ניתן לצמצם פשרות אלו על ידי אופטימיזציה של משך הקיבוע ושיטתו, כולל שימוש בחתכים קפואים טריים עם קיבוע על השקף, פרפוזיה של מי מלח ולאחריה טבילה קצרה ב-PFA, או קיבוע באמצעות פרפוזיה סטנדרטית, בהתאם למטרות הניסוי. מכיוון שאין אסטרטגיית קיבוע אחת שהיא אופטימלית לכל היישומים, על החוקרים לבחור ולהתאים באופן אמפירי את תנאי הקיבוע בהתבסס על נקודות הקצה הניסיוניות העיקריות שלהם, כדי להשיג את האיזון הטוב ביותר בין שימור הרקמה לבין גילוי חלבונים.
מטרת פרוטוקול זה היא להסדיר את אופן אספקת החלבון ולא לקבוע שיטות לכימות תוצאות ניסיוניות; עם זאת, גישות שונות עשויות להיות שימושיות בהתאם למטרות המחקר. בדוגמה זו, ספיגת חלבון ספציפית לסוג תא מוערכת באמצעות סימון אימונולוגי עם נוגדנים נגד סממנים תאיים (למשל, NeuN עבור נוירונים) וכימות קולוקליזציה עם החלבון הנבדק (איור 5), למרות שקווי עכברים עם רפורטר פלואורסצנטי מספקים אמצעי חלופי לזיהוי אוכלוסיות תאים ספציפיות. תוצאה חשובה נוספת היא דיפוזיה של חלבון, המושפעת רבות מהתכונות הביוכימיות של החלבון המוזרק. כאשר נדרש אפיון מדויק של התפשטות החלבון, אנו ממליצים על הזרקה משולבת של סמן פלואורסצנטי אינרטי, כגון דקסטראנים בעלי משקלים מולקולריים מוגדרים, כדי להעריך את התפלגות ההזרקה ואת הדיפוזיה ברקמה בנקודות זמן מוגדרות לאחר אספקה תוך-גולגולתית. ניסויים אלו בוצעו בעבר על ידי המחברים כדי לקבוע את הפרמטרים הניסיוניים עבור סעיף Representative Results8.
לבסוף, במהלך פתרון בעיות, ייתכן שיהיה צורך באופטימיזציה של זיהוי החלבון וההחדרה תוך-גולגולתית. אתגר נפוץ אחד הוא השגת אות פלואורסצנטי אמין מהחלבון הנחקר. כפי שנדון לעיל, אסטרטגיית הקיבוע היא גורם מרכזי הקובע את איכות האות. אם פלואורסצנציה עצמית גבוהה מלווה באות פלואורסצנטי חלש, מומלץ תחילה להפחית את משך הזמן ו/או את מידת קיבוע הרקמה, שכן קיבוע יתר הוא שכיח ויכול לתרום הן לעלייה בפלואורסצנציה עצמית והן להפחתה באות המטרה. פרוטוקול זה כולל גם תמיסה לכיבוי פלואורסצנציה עצמית, שעלולה לשפר את יחס אות לרעש של הפלואורסצנציה של המטרה. כאשר היא מבוצעת נכון, הזרקה זו אמורה להוביל לנזק רקמתי מינימלי. אין לצפות להיווצרות חללים (cavitation) או נגעים באתר הכניסה של המזרק. אם אחד מאלו קורה, ייתכן שיהיה צורך באופטימיזציה של הכנת הפ pipette-ים שנמשכו מזכוכית כדי להבטיח חדירה נקייה לרקמה. לדוגמה, ודאו שקצה ה-pipette קשיח מספיק ואינו מתכופף במגע עם פרנכימת המוח, והתאימו את זווית החיתוך לפי הצורך כדי ליצור קצה חד המקל על כניסה חלקה. עבור הזרקות לאזורי מוח עמוקים, ייתכן שיהיה צורך להגדיל גם את אורכו של ה-pipette הנמשך כדי לאפשר הגעה לאזור המטרה מבלי שהמזרק יבוא במגע עם פני המוח. כאשר מזריקים את החומר ישירות לתוך פרנכימת המוח ולא לתוך פרוזדור (ventricle), מומלץ להשתמש בנפח הזרקה קטן (<1 µL) כדי למזער בצקת, למנוע היווצרות חללים באתר ההזרקה ולהפחית את זרימת החומר חזרה במהלך נסיגת ה-pipette. כמו כן, מומלץ להזריק לאט (<500 nL/min) ולהמתין 5–10 min לאחר סיום ההזרקה לפני נסיגת ה-pipette כדי לאפשר לחומר המוזרק להתפשט לרקמה הסובבת. אם נצפה נוזל הזורם חזרה לאורך נתיב ההזרקה במהלך הסרת ה-pipette, או אם הוא מזוהה לאורך נתיב ההזרקה לאחר עיבוד אימונוהיסטוכימי, יש להפחית את נפח ההזרקה ו/או את קצב ההזרקה, ולהאריך את תקופת ההמתנה שלאחר ההזרקה.
המחברים מצהירים כי אין ניגודי עניינים.
עבודה זו נתמכה במימון מהמרכז הלאומי לתיאום מחלת האלצהיימר (NACC; NSH), מאיגוד האלצהיימר (NSH), וממענק Germinator של מכון דיוק למדעי המוח (DIBS) (JD).
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| סליין 0.9% (בדרגה פרמצבטית) | Cytiva | Z1376 | |
| מזרקים של 30 מ"ל | Becton, Dickinson and Company (BD) | 302832 | |
| 70% אתנול | Koptec | UN1170 | |
| Alexa Fluo 594 C5 Maleimide | Invitrogen | A10256 | |
| מאייד חומרי הרדמה | נתונים מהעולם האמיתי (RWD) | TAIJI-IE | |
| מכשיר סטריליזציה בחרוזי זכוכית | VWR | 75999-324 | |
| BSA | Genessee Scientific | 25-529 | |
| מחט פרפר - Vacutainer Safety-Lok | Becton, Dickinson and Company (BD) | 367281 | |
| כיסויות - 50 מ"מ מס' 1 | Avantor (VWR) | 48393-081 | |
| מכשיר סטריאוקסיס דיגיטלי למכרסמים | נתונים מהעולם האמיתי | 68803 | |
| תבניות הקפאה חד-פעמיות | מדעי המיקרוסקופיה האלקטרונית | 70182 | 22 מ"מ x 22 מ"מ עבור חתכים סגיטליים של מוח עכבר בוגר |
| מיקרוסקופ סטריאוסקופי | Leica | MZ FLIII | |
| תווך שיכון - Tissue-Tek OCT | סאקורה | 4583 | |
| חומר סיכוך לעין | Optixcare | OPX-4242 | |
| מכשיר למשיכת פיפטות זכוכית | Sutter Instrument Co. | דגם P-30 | אנו משתמשים ב-1.14 MM, 3.5" גודל עבור המזרק שלנו |
| פיפטות זכוכית | World Precision Instruments | 504949 | |
| נוגדן משני עיז anti-Rabbit AF594 | Invitrogen | A-11012 | |
| נוגדן משני עיז anti-Rat AF488 | Invitrogen | A-11006 | |
| קרם להסרת שיער | נאיר | 42016527 | |
| במה מחוממת - Rodent Warmer X1 | Stoelting | 53800M | |
| מיקרו-מוטור סיבובי במהירות גבוהה (מקדחה) עם מקדחים | Stoelting | 51449 | |
| איזופלורן | Dechra | איסו-ספייר (Isospire) | |
| מיקרו-מזרק ובקר | WPI | ננו-ליטר 2020 | |
| זכוכיות מיקרוסקופ | בכורה | 8348 | |
| שמן מינרלי, קל | Fisher Scientific Education | S25439 | |
| תוכנית להרכבה עם DAPI | Sigma-Aldrich | F6057 | |
| לק לציפורניים | מדעי המיקרוסקופיה האלקטרונית | 72180 | |
| חלבון complement C1q טבעי מעכבר | Creative Biolabs | CTP-463 | ייתכן שמוצרים של יצרנים אחרים מכילים מזהמים מולקולריים המעכבים את הדינמיקה התקינה של C1q במוח |
| עט לסימון פאפ - ImmEdge Pen | Vector Laboratories | H-4000 | |
| פרהפורמאלדהיד - 16% | מדעי המיקרוסקופיה האלקטרונית | 15710 | דללו ל-4% |
| סליין buffered פוספט (PBS) | Sigma-Aldrich | P3813 | |
| תמיסת פובידון-יוד, 10% (משקל/נפח) | Ricca | 3955-16 | |
| נוגדן ראשוני ארנב נגד C1q | Abcam | ab182451 | |
| נוגדן ראשוני נגד NeuN (RBFOX3) מחולדה | Biolegend | 608451 | |
| ספונין | Sigma-Aldrich | 47036 | |
| להבי סקלפל - מספר 10 | VWR | 76457-442 | |
| פסים לאינדיקציה של קיטור | Steris | 801010 | |
| מקלונים סטריליים עם טיפ כותנה של Puritan | פוריטני | 25-806 1WC | |
| סוכרוז | Sigma-Aldrich | 84097 | |
| מגבות ניתוח | McKesson | 16-6006-B | |
| דבק לרקמות - Vetbond | 3M | 1469SB | |
| תמיסת מלחים בבופר Tris | Sigma-Aldrich | T5941, S7653 | |
| TrueBlack | BIOTIUM | 23007 |
מאמר זה פורסם
הסרטון יגיע בקרוב