כל הפרוצדורות בבעלי חיים בוצעו בהתאם למדריך לטיפול ושימוש בבעלי חיים במעבדה שפורסם על ידי האקדמיות הלאומיות למדעים. הפרוטוקול אושר על ידי ועדת אתיקה לבעלי חיים של בית החולים המסופח לאוניברסיטת נאנג'ינג לרפואה סינית (מספר אישור 2023DW-059-01). רשימה מקיפה של כל החומרים, הריאגנטים, הכלים והתוכנות ששימשו במחקר זה מפורטת בטבלת החומרים.
בעלי חיים ניסייתיים וחלוקה לקבוצות
עכברים נקביים בריאים מסוג BALB/c (דרגת SPF, בני 8–10 שבועות) הושגו מהמרכז לבעלי ניסוי של אוניברסיטת נאנג'ינג לרפואה סינית (רישום מס׳ SYXK (Su) 2018-0049). בעלי החיים שהו בתנאים סטנדרטיים עם מחזור אור/חושך של 12 h בטמפרטורה של 24–26 °C. מזון ומים סטריליים סופקו ad libitum, המצע הוחלף באופן קבוע והכלובים נקיים באופן שגרתי. לאחר 7 ימי הסתגלות, העכברים חולקו באופן אקראי לשישה קבוצות (n = 7 לקבוצה): קבוצת ביקורת (Normal), קבוצת מודל, קבוצת CGRP, קבוצת BIBN-4096, קבוצת KAST וקבוצת KAST + CGRP. בעלי החיים הוקצו לקבוצות באופן אקראי באמצעות טבלת מספרים אקראיים שהופקה במחשב. הקצאת הקבוצות הוסתרה מהחוקרים עד להקצאת ההתערבויות. כדי למקסם את ניצול הרקמה, דגימות ריאה מהקוהורט שהוקצה אקראית (n = 7 לקבוצה) הוקצו באופן שיטתי למסלולי עיבוד שונים, כאשר גדלי המדגמים המדויקים שנותחו (n = 5, 4 או 3) עבור בדיקות היסטולוגיות ומולקולריות ספציפיות צוינו במפורש במקראות של האיורים הרלוונטיים. לא הוצאו נתונים מהניתוח.
הכנת פורמולציית KAST
הפורמולציה הוכנה על ידי המחלקה לרוקחות בבית החולים המסונף לאוניברסיטת ננג'ינג לרפואה סינית 22. נעשה שימוש בתשעה צמחי מרפא סיניים מסורתיים: Semen Brassicae (2 חלקים), Rhizoma Corydalis (2 חלקים), Radix Kansui המעובד בחומץ (חלק 1), Asarum (חלק 1), Ephedra (חלק 1), Semen Lepidii (חלק 1), ציפורן (חלק 1), קליפת קינמון (חלק 1), ו-Gleditsia sinensis (חלק 1). כל צמח נטחן לאבקה דקה ועבר דרך נפה של 80-mesh. לכל 100 g של תערובת האבקה, נוספו 70 mL של מיץ ג'ינג'ר טרי ו-30 mL של paraffin נוזלי, ערבוב יסודי, ועיבוד למדבקות של 0.3 g ± 5% בקוטר של 0.5 cm. באופן ספציפי, כל מרכיבי הצמחים והג'ינג'ר הטרי אומתו על ידי הרוקח הראשי Lin-gang Zhao ואוחסנו ב-4 °C בסביבה חשוכה ויבשה לפני השימוש9. כדי להבטיח את השחזור של ההתערבות ואת היציבות בין סדרות ייצור, הוטמע סטנדרט קפדני לבקרת איכות המבוסס על שיטות UPLC-Q-TOF-MS ו-HPLC שפיתח הצוות שלנו, אשר אישרו את הנוכחות העקבית של מרקרי פעילות עיקריים כגון sinapine thiocyanate23. למעשה, המדבקות בגודל 0.5 cm קובעו באמצעות סרט דבק רפואי נושם והיפואלרגני בגודל 2.5 cm × 5.5 cm כדי להבטיח הולכה טרנסדרמלית אופטימלית.
הקמה של מודל העכבר AA
מודל ה-AA הושרה על פי פרוטוקול מבוסס מהספרות באמצעות רגישות ל-OVA ואתגר תוך-אפי (intranasal challenge)24. למעט קבוצת הנקיאים (Normal), כל העכברים עברו רגישות באמצעות הזרקה תוך-בטנית של 200 µL סליין המכיל 100 µg OVA ו-2 mg אלומיניום הידרוקסיד בימים 0 ו-12. מהימים 18 עד 23, העכברים עברו אתגר תוך-אפי פעם ביום עם 50 µg OVA ב-50 µL סליין. מהימים 24 עד 53, OVA ניתן באופן תוך-אפי מדי יומיים. ביום 54, לאחר שקילת העכברים, בוצע המתנסיא (euthanasia) באמצעות נקיעה של צווארו של העכבר, ונאספו רקמות. לאחר מכן, נקבע מקדם הריאה על ידי חלוקת המשקל הכולל של הריאה במשקל הגוף.
התערבויות
מימים 40 עד 53, עכברים בקבוצת ה-KAST ובקבוצת ה-KAST + CGRP גולחו על פני שטח גבי שגודלו 3 cm × 6 cm. מדבקות הונחו מעל נקודות הדיקור הדו-צדדיות Feishu (BL13), Geshu (BL17), Pishu (BL20) ו-Shenshu (BL23), וקובעו באמצעות סרט דבק למשך 1.5 h פעם ביום במשך 14 ימים רצופים. עכברים בקבוצות ה-CGRP וה-KAST + CGRP קיבלו מתן אינטראנזלי של 10 µL של תמיסת Calcitonin/CALCA (בריכוז 1 pg/µL) מדי יום שני, מהיום ה-40 עד היום ה-53. עכברים בקבוצת ה-BIBN-4096 קיבלו מתן אינטראנזלי של 10 µL של תמיסת BIBN-4096 (בריכוז 0.3 mg/mL, אנטגוניסט לקולטן CGRP) מדי יום שני. קבוצות השליטה (Normal) והמודל קיבלו האכלה סטנדרטית ללא התערבות. טיפול ה-KAST ניתן מהיום ה-40 עד היום ה-53, לאחר ביסוס הדלקת דרכי הנשימה האלרגית (החל מהיום ה-40, שהוא 22 ימים לאחר חשיפה ראשונה ל-OVA ביום ה-18). לפיכך, ה-KAST במחקר זה שימש כהתערבות טיפולית ולא כמנעית.
להכנת העור, בוצעה הסרת שיער באזור הגבי השיווי באמצעות מכונה חשמלית. איתור נקודות הדיקור בוצע בהתאם לנהלי ה-Nomenclature and Location of Acupoints for Laboratory Animals - Part 3: Mice (T/CAAM 0002-2020) שפורסמו על ידי ה-Chinese Acupuncture-Moxibustion Society. ארבעה זוגות של נקודות גביות בילטרליות סומנו במדויק והוגדרו כדלקמן: Feishu (BL13: בין הצלעות מתחת לזיז של החוליה החזית השלישית, 3 mm לטרלי לקו האמצע האחורי), Geshu (BL17: מתחת לזיז של החוליה החזית השביעית, 3 mm לטרלי לקו האמצע), Pishu (BL20: מתחת לזיז של החוליה החזית השני עשרה, 3 mm לטרלי לקו האמצע), ו-Shenshu (BL23: מתחת לזיז של החוליה המותנית השנייה, 3 mm לטרלי לקו האמצע). סרט הדבקה של 3M נכרך בחוזקה כדי להשיג היצמדות יציבה, תוך הבטחה שלא תתרחש תזוזה של המדבקה או שחיקה משנית של העור במהלך תקופת ההחזקה של 1.5 h.
מינוני ה-CGRP/CALCA (בנפח של 1 pg/µL, 10 µL לעכבר) וה-BIBN-4096 (בנפח של 0.3 mg/mL, 10 µL לעכבר) נבחרו על בסיס מחקרים שפורסמו25. באופן ספציפי, עבור ההתערבות ב-CGRP, הוכר תמיסת 0.1% BSA על ידי המסה של 1 mg של BSA ב-1 mL של ddH2O, ולאחר מכן ערבוב במערבל Vortex להשגת ריכוז סופי של 1 mg/mL. לפני השחזור, אבקת החלבון הליאופיליזית Calcitonin/CALCA סובבה בצנטריפוגה ב-12,000 × g למשך 30 s ב-4 °C. לאחר מכן, הוספו 20 µL מתמיסת ה-0.1% BSA שהוכנה כדי להשיג תמיסת מלאי בריכוז 1 µg/µL. את המבחנה הפכו בעדינות מספר פעמים (ללא ערבוב במערבל Vortex), סובבו בצנטריפוגה למשך שניות ספורות, והשאירו בטמפרטורת החדר למשך מספר דקות כדי להבטיח שחזור מלא של החלבון. כדי להכין את תמיסת העבודה בריכוז 1 pg/µL מבלי ליצור נפח גדול מדי בשלב אחד, בוצע דילול סדרה סטנדרטי בשני שלבים: 1 µL מתמיסת המלאי בריכוז 1 µg/µL דוללו תחילה ב-999 µL של תמיסת סליין סטרילית להכנת תמיסה ביניים בריכוז 1 ng/µL, ולאחר מכן 1 µL מתמיסת ביניים זו עורבבו עם 999 µL נוספים של תמיסת סליין סטרילית להשגת תמיסת העבודה הסופית בריכוז 1 pg/µL. תמיסת העבודה נשמרה ב-4 °C, בעוד ששאר המנות (aliquots) נשמרו ב-20 °C- למשך עד 2–3 חודשים. עבור קבוצת ה-BIBN-4096, 1 mg של אבקת BIBN-4096 הומסו ב-333 µL של ddH2O כדי לקבל תמיסת מלאי בריכוז 3 mg/mL, אשר חולקה למנות של 50 µL למבחנה ונשמרה ב-80 °C-. להכנת תמיסת העבודה בריכוז 0.3 mg/mL, כל מנה של 50 µL מתמיסת המלאי עורבבה היטב עם 450 µL של תמיסת סליין סטרילית. מהיום ה-40 עד היום ה-53, נפח של 10 µL של תמיסת CGRP בריכוז 1 pg/µL או תמיסת BIBN-4096 בריכוז 0.3 mg/mL הניתן למנה תוך-אפית (intranasally) לכל עכבר בכל יום שני, תחת ריסון עדין וללא הרדמה.
מדדי תוצאה ושיטות זיהוי
בדיקות התנהגותיות
ביום ה-53, לאחר החשיפה האינטראנזאלית האחרונה, נ monitored ונרשמו תדירויות אירועי השפשוף האפי והעיטוכים באמצעות מערכת וידאו דיגיטלית למשך 10 min. תדירויות ההתנהגות בסרטוני הווידאו נספרו באופן בלתי תלוי על ידי שני חוקרים בשיטת סמיות כפולה. במקרים של אי-הסכמה משמעותית בין הספירות שלהם, חוקר שלישי העריך מחדש את הסרטון, והנתונים בעלי העקביות הגבוהה ביותר נבחרו בסופו של דבר לניתוח סטטיסטי.
מבחן פרובוקציה סימפונית
בתוך 24 שעות לאחר האתגר הסופי, נבחנו תגובתיות דרכי הנשימה באמצעות אצטילכולין (ACh) בערפיל בריכוזים של 0, 5, 10, 20 ו-40 mg/mL (300 µL לכל ריכוז, בערפיל למשך 1 דקה). ערכי Penh (Enhanced pause), מדד חסר יחידות המשמש להצבעה אמפירית על התכווצות דרכי הנשימה ולהערכת תגובתיות יתר של דרכי הנשימה (AHR), נרשמו למשך 5 דקות לאחר כל ערפיל באמצעות פלתיסמוגרפיה לא פולשנית של הגוף כולו. העכברים הותאמו לתא למשך 10 דקות לפני הרשמה. ה-Penh חושב באופן אוטומטי באמצעות התוכנה של מערכת האחסון/הזרמה הידנית המשולבת, בהתאם לנוסחה אמפירית המאזנת בין זמן הנשיפה/שאיפה לבין שיאי הזרימה.
היסטופתולוגיה (צביעת HE)
רקמות ריאה שקובעו ב-4% paraformaldehyde עברו דהידרציה באמצעות סדרת אלכוהול מדורגת, הבהרה ב-xylene, והטמעה בבלוקים של פראפין באמצעות מעבד אוטומטי. הבלוקים נחתכו לעובי של 4 µm, הצופו באמבט מים בטמפרטורה של 42 °C, והועברו לעלSlides זכוכית. ה-Slides נאפו ב-80 °C למשך 2 h והויבשו למשך לילה לפני קירור לטמפרטורת החדר. לצורך צביעה, החתכים עברו דה-פראפיניזציה ב-xylene (I ו-II, 20 min כל אחד), רהידרציה באמצעות סדרת אתנול מדורגת (100% I/II ו-75%, 5 min כל אחד), ושטיפה במי ברז. ה-Slides נצבעו ב-hematoxylin למשך 3–5 min, עברו דיפרנציאציה ב-1% acid alcohol, וצביעה כחולה בתמיסת bluing. לאחר שטיפה, החתכים עברו דהידרציה באמצעות אתנול 85% ו-95% (5 min כל אחד) וצביעת נגד ב-eosin למשך 5 min. לבסוף, ה-Slides עברו דהידרציה באתנול מוחלט (I, II, ו-III, 5 min כל אחד), הבהרה ב-xylene (I ו-II, 5 min כל אחד), הטמעה ב-neutral balsam, וייבוש באוויר. תמונות צולמו משדות אקראיים בהגדלה של 200× באמצעות מיקרוסקופ אור ושימוש במערכת CaseViewer. דלקת בריאה ועבוי אפיתליאלי דורגו באופן עיוור בסולם של 0–4: 0, ללא דלקת; 1, תאי דלקת מדי פעם; 2, מעט (<3) מוקדי דלקת; 3, מוקדי דלקת מרובים (≥3); 4, חדירה דיפוזית בכל הריאה. העבוי האפיתליאלי דורג כך: 0, נורמלי; 1, עבוי נראה; 2, עבוי חלקי של דרכי הנשימה; 3, חסימה כמעט מלאה; 4, היעדר מבנה נורמלי. עבור כל קבוצה ניסויית, סה"כ 20 שדות מיקרוסקופיים אקראיים צולמו והוערכו כדי לקבל את ציוני ההיסטופתולוגיה הגולמיים. הנתונים מכל ארבעה שדות חושבו כממוצע כדי להניב נקודת נתון בלתי תלויה אחת, מה שהוביל לגודל מדגם סופי של n = 5 חזרות לקבוצה לצורך ניתוח סטטיסטי. הדירוג בוצע באופן עיוור.
ריצוף RNA (RNA-seq)
RNA כולל הופק מרקמות ריאה של עכברים באמצעות ריאגנט TRIzol בהתאם לפרוטוקול היצרן. טוהר ה-RNA, ריכוזו ושלמותו הוערכו באמצעות ספקטרופוטומטר ופלטפורמה מבוססת מיקרופלואידיקה. ספריות טרנסקריפטום הוכנו באמצעות ערכה מסחרית להכנת ספריות ורוצפו בפלטפורמת ריצוף רב-תפוקה כדי להפיק קריאות זוגיות (paired-end) באורך 150 bp. נתוני הגלם עברו בקרת איכות באמצעות תוכנת סינון מתאימה להשגת קריאות נקיות, שמופו לגנום הייחוס באמצעות כלי יישור המזהה אתרי חיבור (splice-aware alignment tool). רמות ביטוי הגנים חושבו כ-FPKM, וספירת הקריאות בוצעה באמצעות כלי לספירת קריאות. ניתוח ביטוי דיפרנציאלי בוצע באמצעות חבילה סטטיסטית ייעודית, כאשר הספים נקבעו לפי |log2 Fold Change| ≥ 1 ומתוקנן p < 0.05.
ELISA
רקמות ריאה טריות של עכברים נשקלו בדיוק והומוגניזות בבופר PBS ביחס קבוע של 20 mg רקמה ל-200 µL בופר. ההומוגנאטים סנטריגוזים במהירות של כ-13,400 × g למשך 10 min ב-4 °C כדי לאסוף את עליון החלבונים. לצורך נורמליזציה, תוכן החלבון הגולמי של העליונים כולובה בשיטת BCA. הליך ה-ELISA בוצע בשלוש חזרות טכניות באמצעות ערכות מסחריות בהתאם לפרוטוקול היצרן. בקצרה, 50 µL של דילול סטנדרטים או 50 µL של דגימות מדוללות מראש (10 µL דגימת חלבון מעורבבת עם 40 µL מדלל דגימות, להשגת דילול סופי של פי 5) הוספו ללוחיות 96-בארים מצופות בנוגדנים. הלוחיות נסגרו ודגרו ב-37 °C למשך 30 min. לאחר חמישה שטיפות עם בופר שטיפה מדולל ביחס של 1:30, הוספו 50 µL של ריאגנט צמידה מקושר לאנזים לכל באר (מלבד בארי השליליים), והתערובת דגרה ב-37 °C למשך 30 min. לאחר חמש שטיפות נוספות, הוספו 50 µL של תמיסת כרומוגן A ו-50 µL של תמיסת כרומוגן B לכל באר, והלוחית דגרה בחושך ב-37 °C למשך 10 min. התגובה הופסקה על ידי הוספת 50 µL של תמיסת עצירה, אשר שינתה את הצבע מכחול לצהוב. הבליעה (ערך OD) של כל באר נמדדה ב-450 nm באמצעות קורא מיקרו-לוחיות תוך 15 min. עקומות סטנדרט שורטטו באמצעות מודל רגרסיה ליניארית או לוגיסטית בעלת ארבעה פרמטרים (תוך הבטחת R2 > 0.99), ומהן חושבו ריכוזי חלבוני המטרה בהומוגנאטים של רקמת הריאה.
ציטומטריית זרימה
רקמות ריאה הוצאו, קוצצו ועובדו בעיכול ב-5 mL של RPMI-1640 המכיל 10% FBS, 50 µL Liberase TM ו-5 µL DNase I ב-37 °C למשך 45 דקות תוך ניעור במהירות של 80 rpm. התו suspension שעבר עיכול הועבר דרך מסננת תאים של 400-mesh וסובב בצנטריפוגה ב-300 × g למשך 10 דקות ב-4 °C. המשקע הוסעה ב-2 mL של בופר לליזה של אריתרוציטים למשך 10 דקות בטמפרטורת החדר בחשיכה. לאחר שטיפה, התאים הוסעה וצבעו ב-Ghost Dye Red 780 (כ-1.25 µL לדגימה) למשך 20 דקות ב-4 °C בחשיכה לצורך הדירה של תאים מתים. בעקבות שטיפה, התאים נחסמו באמצעות 10 µL של FcR Blocking Reagent למשך 10 דקות ב-4 °C. לאחר מכן, התאים עברו צביעה שטחית עם הנוגדנים הבאים המצומדים לפלואורוכרום למשך 30 דקות ב-4 °C: FITC anti-mouse CD45 (כ-0.5 µL), PE anti-mouse/human KLRG1 (כ-1.25 µL), BB700 rat anti-mouse CD90.2 (כ-0.5 µL), ותערובת lineage ביוטינילית המכילה anti-mouse CD3ε, CD4, CD8a, CD11b, CD11c, CD49b, TER-119, Ly-6G/Ly-6C (Gr-1) (כל אחד 0.5 µL), ו-anti-mouse CD19 (כ-2 µL). לאחר שטיפה, התאים דגרו עם Brilliant Violet 605 Streptavidin (כ-2 µL) למשך 30 דקות ב-4 °C. הנתונים נרכשו בפלטפורמת BD flow cytometer ונותחו באמצעות תוכנת FlowJo. מטריצות פיצוי של זליגת פלואורסצנציה (spillover compensation) נוטרו והותאמו באופן אוטומטי על ידי תוכנת הרכישה המכוילת של המכשיר. אסטרטגיית ה-gating ההיררכית לזיהוי תאי pulmonary ILC2s יושמה ברצף כדלקמן: תחילה בודדו לימפוציטים כוללים באמצעות מורפולוגיה של פיזור קדמי/צדי (FSC-A/SSC-A), ולאחריהם ביצוע הבחנה בין דובלטים באמצעות gating של סינגלטים (FSC-H/FSC-A). תאים חיוניים זוהו לאחר מכן על ידי הדירה של תאים מתים (Ghost Dye-), ולאחר מכן הוחלו בהדרגה gates סטנדרטיים לבחירת אוכלוסיות CD45+ ו-Lineage-. בתוך חלון ה-gating של תאים חיוניים CD45+ Lineage- , הוגדרו וכומתו תאי pulmonary ILC2s באופן מפורש על בסיס gates רצופים ומדורגים של אשכולות CD90.2+ ו-KLRG1+.
אימונופלואורסצנציה (IF)
חתכים קפואים של ריאה הופשרו בטמפרטורת החדר למשך 15–30 min ונשטפו שלוש פעמים עם PBST (PBS המכיל 0.05% Tween-20) למשך 6 min בכל פעם להסרת תרכובת ה-OCT. לאחר ספיגת עודפי נוזלים, שרטטו מחסום הידרופובי סביב הרקמה באמצעות עט אימונוהיסטוכימיה. החתכים הוכשרו בבופר חסימה (blocking) וחדירה (permeabilization) המכיל 0.3% Triton X-100 ו-5% סרום עיזים בטמפרטורה של 37 °C למשך 100 min, ולאחר מכן הוכשרו למשך לילה (16–20 h) ב-4 °C עם הנוגדן הראשוני. למחרת, החתכים הותאמו לטמפרטורת החדר למשך 30 min, נשטפו שלוש פעמים עם PBST, והוכשרו עם נוגדן משני מדתו סגול לצבע פלואורופורי התואם את המין ב-37 °C בחושך למשך 60–90 min. לאחר שלושה שטיפות PBST נוספות, בוצע צביעה נגדית של הגרעינים באמצעות DAPI (מהול ביחס של 1:1 או 2:1 ב-PBS) למשך 8 min בטמפרטורת החדר בחושך. בעקבות סבב סופי של שטיפות PBST (3 × 6 min), החתכים הועמדו על זכוכית באמצעות חומר עיגון למניעת דהייה (anti-fade mounting medium), נחתמו למניעת היווצרות בועות ואוחסנו בחושך. תמונות צולמו באמצעות מיקרוסקופ קונפוקאלי בהגדלה של 400×. מספר התאים החיוביים בכל שדה נספר ידנית באמצעות תוכנת Leica LAS X. עבור כל קבוצה ניסיונית, צולמו סך הכל 15 שדות מיקרוסקופיים אקראיים כדי לקבל את ספירת התאים הגולמית. הנתונים מכל שלושה שדות חושבו כממוצע כדי להניב נקודת נתון עצמאית אחת, מה שהוביל לגודל מדגם סופי של n = 5 חזרות לכל קבוצה לצורך ניתוח סטטיסטי. הספירה בוצעה באופן עיוור.
אימונוהיסטוכימיה (IHC)
חתכי פאראפין עברו דה-פאראפיניזציה בשלושה סבבים של xylene (15 דקות כל אחד), רהידרטציה בסדרה מדורגת של ethanol (100% פעמיים, 85% ו-75%; 5 דקות כל אחד), ושטיפה במים מזוקקים. שחזור אנטיגן בוצע בבופר ציטראט (pH 6.0) באמצעות סיר לחץ (3 דקות בלחץ גבוה לאחר רתיחה), ולאחריו קירור ושלושה שטיפות של 5 דקות ב-PBS (pH 7.4). פראוקסידאז אנדוגני נחסם באמצעות 3% H2O2 למשך 15 דקות בטמפרטורת החדר בחושך. לאחר השטיפה, החתכים הוקפו בעט הידרופובי ונחסמו עם 3% goat serum למשך 30 דקות. לאחר מכן, החתכים דגרו למשך לילה ב-4 °C עם נוגדנים ראשוניים המדוללים ב-PBS: anti-IL-4 (1:400), anti-IL-5 (1:300), או anti-IL-13 (1:150). למחרת, החתכים נשטפו ודגרו עם נוגדנים שניוניים המצומדים ל-HRP (anti-mouse עבור IL-4; anti-rabbit עבור IL-5 ו-IL-13) למשך 50 דקות בטמפרטורת החדר. האותות הוויזואלו באמצעות תמיסת DAB שהוכנה טרי לפני השימוש תחת בקרה מיקרוסקופית, והתהליך הופסק באמצעות מי ברז. לבסוף, החתכים נצבעו בצביעה נגדית עם hematoxylin, עברו דיפרנציאציה, הכחלה (bluing), דהידרטציה באמצעות אלכוהולים מדורגים ו-xylene, וסופקסו ב-neutral balsam לבחינה מיקרוסקופית. צפיפות אופטית ממוצעת (IOD/Area) נמדדה באמצעות פלטפורמת תוכנה לניתוח תמונות בהגדלה של 200×. עבור כל קבוצה ניסויית, צולמו סך הכל 15 שדות מיקרוסקופיים אקראיים כדי לקבל את הערכים הגולמיים. הנתונים מכל שלושה שדות חושבו כממוצע כדי להניב נקודת נתון עצמאית אחת, מה שהביא לגודל מדגם סופי של n = 5 חזרות לקבוצה לצורך ניתוח סטטיסטי. הדירוג בוצע על ידי שני צופים מסווגים (blinded).
תסמיך חלבון (Western blot - WB)
להכנת הדגימות, רקמות ריאה של עכברים (כ-30 mg) קצצו דק והומוגניזרו ב-300 µL של באפר ליזיס RIPA מקורר מראש, בתוספת 1% תערובת מעכבי פרוטאז/פוספטאז. ההומוגניזציה בוצעה באמצעות הומוגניזר רקמות ב-60 Hz למשך ארבעה מחזורים (60 s למחזור). לאחר מכן, התמליגים סנטריגו בערך ב-13,400 × g למשך 15 min ב-4 °C לאיסוף תסמיך הליזיס. ריכוזי חלבון כוללים נקבעו באמצעות ערכה סטנדרטית של BCA protein assay. הדגימות נורמלו, ערבוב עם loading buffer בריכוז 5x ביחס נפחים של 4:1, ועברו דנטורציה ב-95 °C למשך 7 min. עבור SDS-PAGE, דגימות חלבון (20 µg לכל נתיב) הועמסו יחד עם ס marker למשקל מולקולרי של חלבון צבוע מראש, הופרדו במתח קבוע של 80 V למשך 20 min, ולאחר מכן המתח הועלה ל-120 V למשך 70 min. החלבונים הועברו בשיטת wet-transfer לממברנות PVDF של 0.22 µm תחת זרם קבוע של 300 mA למשך 120 min באמבט קרח. הממברנות נחסמו עם 5% BSA ב-TBST למשך 1 h בטמפרטורת החדר ודגרו באופן תכף (עד 18 h) ב-4 °C עם נוגדנים ראשוניים נגד CGRP (1:500) ו-GAPDH (1:2000). לאחר שטיפה עם TBST שלוש פעמים (10 min בכל פעם), הממברנות דגרו עם נוגדנים משניים המשורשריים ל-horseradish peroxidase (1:10000) למשך 1–2 h בטמפרטורת החדר. לאחר שלושה שטיפות נוספות, פסי החלבון הודגמו באמצעות תסבירי כימולומינסנציה מוגברים (ECL) במערכת דימוי VILBER Fusion FX. עוצמות הפסים כוונתו באמצעות ImageJ 1.8, וביטוי חלבוני המטרה נורמל לבקרת הפנימית GAPDH.
ניתוח סטטיסטי
כל הנתונים הניסויים מוצגים כממוצע ± סטיית תקן (SD). ניתוח הנתונים והשרטוט הסטטיסטי בוצעו באמצעות פלטפורמת תוכנה סטטיסטית ייעודית. לפני השוואות בין קבוצות, מערכי הנתונים הועמדו באופן שיטתי לבדיקת נורמליות. עבור נתונים בעלי התפלגות נורמלית ושונויות הומוגניות, בוצע ניתוח שונות (ANOVA) חד-כיווני או דו-כיווני רגיל, ולאחריו מבחני post hoc מסוג Tukey, Šídák, Holm-Šídák או Fisher’s LSD להשוואות זוגיות מרובות. בעת השוואת קבוצות מרובות מול קבוצת ביקורת אחת, הוחל מבחן Dunnett. עבור מערכי נתונים עם שונויות הטרוגניות, נעשה שימוש ב-Brown-Forsythe ANOVA, ולאחריו מבחן post-hoc מסוג Dunnett's T3. עבור מערכי נתונים שלא תאמו התפלגות נורמלית, נעשה שימוש במבחן Kruskal-Wallis לא-פרמטרי, ולאחריו מבחן post hoc מסוג Dunn להשוואות מרובות. ערך P < 0.05 נחשב כמעיד על הבדלים מובהקים סטטיסטית. רמות מובהקות שונות מסומנות באופן דינמי כ-*p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, ו-****p < 0.0001. כל הערכות תוצאות הניסוי, כולל דירוג היסטולוגי, ניתוח ציטומטריה של זרימה וכמותיות של תמונות, בוצעו באופן מסותר (blinded) באופן קפדני.