$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
מאפייני מאגר הנתונים של היישום השגרתי
במהלך תקופת המחקר, 197 דגימות רצופות עברו את בדיקת הזכאות והערכת איכות טרום-אנליטית ונכנסו לתהליך העבודה שניתן לדווח. קבוצת המחקר כללה 98 מטופלים, 62 (63.3%) עם לוקמיה לימפובלסטית חריפה בתאי B (B-ALL) ו-36 (36.7%) עם לוקמיה מיאלואידית חריפה (AML). הקבוצה כללה 64 גברים (65.3%) ו-34 נשים (34.7%), עם גיל חציוני של 32 שנים (טווח בין-רבעוני [IQR], 13–49 שנים; טווח: 2–73 שנים). אחוז הפיצוץ החציוני היה 67.2% (IQR, 56.9% – 80.2%).
רוב הדגימות שנבדקו היו שאיפות מח עצם (174/197, 88.3%), בעוד שדגימות דם היקפיות היוו 23 מתוך 197 (11.7%). לפי מרווחי הניטור שהוגדרו מראש, 86 דגימות (43.7%) נאספו בסיום טיפול ההשראה, 65 (33.0%) במהלך טיפול קונסולידציה, ו-46 (23.4%) לפני השתלת תאי גזע המטופואטיים (HSCT) (טבלה 1).
החיוניות החציונית של הדגימה הייתה 88.3% (IQR, 84.4% – 92.6%). תהליך הרכישה הניב חציון של 1,116,901 אירועים בסך הכל (IQR, 908,521–1,258,946) לפני ניקוי הנתונים. לאחר ההסרה האנליטית הסדרתית של פסולת, כפילים חופפים ותאים לא ברי קיימא, אסטרטגיית השער השיגה חציון של 907,325 אירועי יעד יחידים חיוביים ל-CD45 (IQR, 690,112–1,095,836), עם זמן רכישה חציוני של 11.9 דקות. ציון ההמודילולציה החציוני היה 0.20 (IQR, 0.14–0.28). לאחר הפרשנות המתאמת לפי מכנה, 41 דגימות (20.8%) סווגו כחיוביות ל-MRD, ו-156 דגימות (79.2%) סווגו כמתחת לגבול הגילוי הספציפי לדגימה (LOD) (טבלה 1).
אימות אנליטי: חזרתיות, ליניאריות ויציבות
הביצועים האנליטיים של זרימת העבודה הסטנדרטית הוערכו באמצעות חזרתיות, ליניאריות מדיללת ומחקרי יציבות לטווח קצר (איור 2). אליקווטים כפולים שהוכנו מאותם דגימות שנבדקו בנפח הראו חזרתיות חזקה, עם מקדם שונות כפול חציוני (CV) של 0.101% ו-CV באחוזון ה-95 של 0.222%.

איור 2: אימות אנליטי של זרימת העבודה הסטנדרטית של זרימת ציטומטריית זרימה רב-צבעונית MRD. (א) התפלגות החיוניות של הדגימה בין דגימות שנבדקו. (ב) מתאם בין ערכי MRD צפויים ונצפו בניסויי דילול סדרתיים בניתוח לוגריתמי. (ג) הסכמה בין ניתוחי שכפול עצמאיים במהלך הערכת חזרתיות. (D) יציבות מדידות MRD לאחר אחסון בטמפרטורת החדר ב-0 שעות, 24 שעות ו-48 שעות. אנא לחצו כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
כדי להעריך התנהגות גילוי ברמה נמוכה, נותחו 12 ניסויי דילול סדרתי שכללו 72 תצפיות בסך הכל בטווח ה-MRD הנמוך הצפוי. ערכי MRD שנצפו הראו התאמה חזקה לערכים הצפויים בניתוח לוגריתמי (r = 0.999, R2 = 0.998 מותאם, שיפוע = 1.009, יירוט = 0.018), מה שמעיד על שמירה על ליניאריות בטווחי אירועים בתדירות נמוכה.
בדיקות יציבות קצרות טווח הראו ירידה הדרגתית בחיוניות הדגימה לאורך זמן, כאשר החיוניות החציונית ירדה מ-89.1% ב-0 שעות ל-84.9% ב-24 שעות ו-80.6% ב-48 שעות. לעומת זאת, השינוי היחסי האבסולוטי החציוני בנטל ה-MRD נותר מוגבל ב-24 שעות (6.2%) ו-48 שעות (12.0%), מה שתומך בעיבוד שגרתי במרווח של 24 שעות לאחר האיסוף.
שכפול בין אופרטורים ובין מכשירים
שחזוריות בין מפעילים ובין מכשירים הוערכה באמצעות 24 דגימות ייחוס שנותחו על פני מספר אופרטורים וציטומטרי זרימה מתואמים, והניבו בסך הכל 96 הערכות. הסטייה היחסית החציונית מהערכים הייחוס הייתה 13.7%. ממצאים אלו מראים ביצועים אנליטיים עקביים לאחר סטנדרטיזציה של הכנת דגימה, הגדרות רכישה ואסטרטגיות שער סדרתיות (טבלה 2).
טבלה 2: מדדי ביצוע של אימות אנליטי והשוואת שיטות עבור זרימת העבודה הסטנדרטית המדידה של מחלה שאריתית. טבלה זו מוגבלת לתוצאות אימות, כולל חזרתיות תוך-מבחנת, ליניאריות מדוללת, יציבות לטווח קצר, שחזוריות בין אופרטורים ובין מכשירים, ומדדי השוואת שיטות מולקולריות אורתוגונליות; הוא אינו משכפל את הדמוגרפיה של המטופלים או מאפייני הדגימות שדווחו בטבלה 1. אנא לחצו כאן להורדת הטבלה הזו.
יישום קליני והשוואת שיטות אורתוגונליות
בוצעה השוואה אורתוגונלית עם 117 דגימות זוגיות, כולל 75 שנותחו על ידי תגובת שרשרת פולימראז כמותית (qPCR) ו-42 באמצעות ריצוף מהדור הבא (NGS). הערכות qPCR עקבו בעיקר אחר תמלילי איחוי ספציפיים למחלה שנקבעו בעת האבחון, כולל BCR::ABL1, RUNX1::RUNX1T1 ו-PML::RARA. גישות ה-NGS העריכו סידורי גנים של אימונוגלובולין קלונלי או קולטני תאי T ללוקמיה לימפובלסטית ועקבו אחר מוטציות סומטיות חוזרות באמצעות פאנלים מיאלואידיים ממוקדים ללוקמיה מיאלואידית חריפה. ערכי MRD בזרימה, ציטומטריים, הראו מתאם חזק עם תוצאות מולקולריות משולבות ברמות מחלה מדידות (r = 0.893 בניתוח לוגריתמי).
ניתוח בלנד-אלטמן הראה הפרש לוגריתמי ממוצע של −0.093 עם גבולות התאמה הנעים בין −0.848 ל-0.663 (איור 3). מבין מקרים דיסוננטיים, זוהתה תוצאה שלילית שגויה אחת מתוך 25 דגימות חיוביות מולקולרית. זרימת העבודה הראתה אחוז הסכמה חיובי של 78.1%, הסכמה שלילית של 97.6%, ושיעור התאמה כולל של 92.3%.

איור 3: יישום קליני ואימות אורתוגונלי של הערכת MRD סטנדרטית. (א) התפלגות מקרים חיוביים ל-MRD בין קבוצות מחלה ותקופות ניטור. (B) מתאם בין ערכי MRD ציטומטריים זרימה לתוצאות משווים מולקולריים זוגיים בניתוח לוגריתמי. (ג) ניתוח בלנד-אלטמן השוואה בין מדידות ציטומטריות זרימה ומדידות MRD מולקולריות זוגיות, כאשר קווים אופקיים מציינים את ההטיה הממוצעת ואת גבולות ההתאמה של 95% בטווח האנליטי. (ד) התפלגות תוצאות חיוביות ל-MRD בין תקופות ניטור טיפוליות. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
ממצאים אלו מראים כי תהליך העבודה הסטנדרטי של ציטומטריית זרימה רב-צבעונית הגיע להתאמה חזקה עם בדיקות MRD מולקולריות אורתוגונליות בדגימות קליניות שגרתיות.
טבלה משלימה 1: פרמטרים תפעוליים מקיפים לזרימת העבודה הסטנדרטית של מחלה שאריתית מדידה של זרימת ציטומטריה רב-צבעית. טבלה מאוחדת זו מפרטת את המרכיבים המתודולוגיים החיוניים המחולקים לחלקים נפרדים. סעיף א' מפרט את תצורות פאנל הנוגדנים הספציפיים למחלה, כאשר בחירת CD73 או CD304 מבוססת על אימונופנוטיפ אבחנתי בסיסי הקשור ללוקמיה. סעיף ב' מפרט את מטרות עיבוד הדגימות הקדם-אנליטיות הסטנדרטיות ורכישת הזרימה הציטומטרית. סעיף C מגדיר את ספי הדיווח המותאמים למכנה לצד קריטריוני פרשנות סופית. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.