YTHDC1 מעודד את ייצוא הציטופלזמה של Rab27A שעבר שינוי m6A, בעוד IGF2BP2 מייצב את Rab27A בציטופלזמה, ובכך משפר את התמיינות האוסטיאוקלסטים ותורם לאוסטאופורוזיס.
מאמר מחקר
* These authors contributed equally
YTHDC1 מעודד את ייצוא הציטופלזמה של Rab27A שעבר שינוי m6A, בעוד IGF2BP2 מייצב את Rab27A בציטופלזמה, ובכך משפר את התמיינות האוסטיאוקלסטים ותורם לאוסטאופורוזיס.
פיתוח טיפולים חדשניים לאוסטאופורוזיס משך תשומת לב גוברת. Rab27A עובר ויסות גבוה במהלך התמיינות האוסטיאוקלסטים, ושינוי N6-מתילאדנוזין (m6A) הפך לווסת אפיגנטי חשוב במחלות אורתופדיות. ניתוחים ביואינפורמטיים חזו כי Rab27A מכיל מספר אתרי שינוי m6A ומקיים אינטראקציה עם מספר חלבונים הקשורים ל-m6A. נערכו ניסויי הנקה כדי להעריך את תפקיד Rab27A בהבדלה של אוסטאוקלסט ואוסטאופורוזיס באמצעות מודל עכבר שחלות (OVX). דלדול Rab27A הפחית את האוסטאופורוזיס והעלה את אחוז היווצרות העצם מ-14.73% ל-28.13% (P < 0.05) בעכברי OVX. ווסטרן בלוטינג ו-PCR כמותי הראו כי הפלת Rab27A הפחיתה את ביטוי החלבון וה-mRNA של סמני האוסטיאוקלסטים TRAP, NFATc1 ו-c-FOS, ובכך דיכאה התמיינות אוסטאוקלסטית של מקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) שנגרמו על ידי גורם מגרה מושבות מקרופאגים (M-CSF) ומפעיל הקולטנים של ליגנד גורם גרעיני-κB (RANKL). צביעת TRAP הראתה בנוסף כי דלדול Rab27A הפחית משמעותית את פעילות TRAP מ-24.1% ל-12.9% (P < 0.01) לאחר השראה של M-CSF ו-RANKL. בדיקות אימונופרסיפיטציה של RNA אישרו אינטראקציות בין Rab27A לחלבוני הקורא m6A YTHDC1 ו-IGF2BP2. הפרדה גרעינית וציטופלזמית הראתה כי YTHDC1 מסייע לייצוא ציטופלזמי של Rab27A שעבר שינוי m6A. בנוסף, ניתוחי q-PCR ו-Western Blot הראו כי הפחתת YTHDC1 או IGF2BP2 הפחיתה את ביטוי Rab27A והפחיתה את ביטוי TRAP, NFATc1 ו-c-FOS, ובכך דיכאה התמיינות אוסטאוקלסטית שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL. ביחד, ממצאים אלו מצביעים על כך שייצוא ציטופלזמה בתיווך YTHDC1 וייצוב IGF2BP2 של Rab27A מותאם על ידי m6A מקדמים התמיינות אוסטאוקלסטית ותורמים לאובדן עצם במודל העכבר OVX.
אוסטאופורוזיס (OP) היא הפרעה שלדית נפוצה המאופיינת בהידרדרות של מיקרוארכיטקטורת העצם וירידה בצפיפות המינרלים של העצם, מה שמוביל לסיכון מוגבר לשברים ברחבי העולם 1,2,3. שברים אוסטאופורטיים מתרחשים בעיקר באמה, בהומרוס, בירך ובעמוד השדרה, והם נפוצים במיוחד בקרב מבוגרים. שברים אלו פוגעים משמעותית באיכות החיים ומטילים נטל פיזי, פסיכולוגי וחברתי-כלכלי משמעותי על המטופלים, משפחותיהם ומערכות הבריאות3. כתוצאה מכך, מניעה, ניהול וטיפול באוסטאופורוזיס נותרו עדיפויות מרכזיות קליניות ובריאות הציבור.
פותחו מגוון אסטרטגיות טיפוליות לאוסטאופורוזיס וניתן לסווג אותן בדרך כלל לשתי קטגוריות: תרופות ליצירת עצם וטיפולים אנטי-ספיגיים 4,5. תרופות אנטי-ספיגות מסורתיות כוללות ביספוספונטים, ראלוקסיפן וסטרונציום רנלט, בעוד שחומרים חדשים יותר כוללים דנוסומב, אודנקטיב וסראקטיניב. טיפולים ליצירת עצם כוללים הורמון פאראתירואיד (PTH 1–84), בעוד שמספר מועמדים נוספים, כגון MK-5442, AMG 785 ו-BHQ 880, נמצאים בפיתוח קליני5. למרות שטיפולים אלו יכולים להיות יעילים, רבים מהם קשורים לתופעות לוואי משמעותיות, יעילות מוגבלת לטווח הארוך, או הגבלות על שימוש ממושך 4,6,7,8,9. לדוגמה, מתן ארוך טווח של אמינוביספוספונטים ודנוסומב עלול לפגוע בעיצוב עצם תקין5. לכן, זיהוי מטרות טיפוליות בטוחות ויעילות יותר נותר מטרה חשובה במחקר האוסטאופורוזיס.
חלבוני ראב הם רגולטורים מרכזיים של תנועת ווסיקולות תוך-תאית ואותות תאים, ומשתתפים בתהליכים ביולוגיים מגוונים, כולל זיהום ויראלי, אוטופגיה וארגון ציטוסקלטל10. בשנים האחרונות, תשומת לב גוברת הופנתה לתפקידי חלבוני משפחת ראב במטבוליזם העצם ואוסטאופורוזיס. דווח כי Rab44 מווסת התמיינות אוסטאוקלסטית על ידי ויסות איתות Ca2⁺ תוך-תאי והפעלת גורם גרעיני של תאי T מופעלים 1 (NFATc1) במפעיל קולטנים של גורם גרעיני-ליגנד κB (RANKL)11. אוסטאוקלסטים הם תאים רב-גרעיניים שמקורם בקדומים בקו המקרופאגים ומשחקים תפקידים חיוניים בספיגת עצם ובהומאוסטזיס השלד 12,13,14,15,16,17,18,19. לכן, הבנת המנגנונים המולקולריים השולטים על התמיינות אוסטאוקלסט היא קריטית לפיתוח גישות טיפוליות חדשות לאוסטאופורוזיס.
Rab27A הוא חבר חשוב במשפחת Rab GTPase ומתבטא באופן נרחב בתאי הפרשה וחיסוניים. הוא ממלא תפקידים מרכזיים בהעברת ווסיקולות, אקסוציטוזה ואיתות תוך-תאי 20,21,22,23,24,25,26,27. מחקרים קודמים הראו כי Rab27A מווסת דגרנולציה של אאוזינופיל במהלך דלקת דרכי הנשימה ומבקר את המוביליזציה הוזיקולרית הקשורה לפעילות NADPH אוקסידאז במקרופאגים מופעלים20.23. ראוי לציין כי ראיות מצטברות מצביעות על כך שהביטוי של Rab27A מווסת משמעותית במהלך התמיינות האוסטיאוקלסטית. שימדה-סוגווארה ואחרים דיווחו כי ביטוי Rab27A עולה במהלך התמיינות של מקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) לאוסטאוקלסטים, מה שמרמז על תפקיד פוטנציאלי באוסטאוקלסטוגנזה28. ביחד, ממצאים אלו מצביעים על כך ש-Rab27A עשוי להשפיע על היווצרות ותפקוד האוסטאוקלסטים על ידי ויסות תנועת וזיקולריות ומסלולי איתות תוך-תאיים28,29.
N6-מתילאדנוזין (m6A) הוא השינוי הפנימי השכיח ביותר ב-RNA שליח אאוקריוטי וב-RNA שאינו מקודד, ומשמש כרגולטור קריטי של חילוף החומרים והביטוי של הגן. כשינוי ה-mRNA הראשון שזוהה ביונקים, m6A היה מעורב בתהליכים ביולוגיים רבים, כולל יציבות RNA, חיבור, הובלה ותרגום. Wang ואחרים הראו כי שינויים ב-m6A, המופיעים בדרך כלל בתוך מוטיבים של רצפים משומרים, מזוהים על ידי חלבונים המכילים תחום YTH ותורמים לוויסות יציבות ה-mRNA והמטבוליזם30. יתרה מזאת, שינוי m6A היה מעורב בתפקודים ביולוגיים מגוונים, כולל יציבות הגנום, ויסות שעתוק, ארגון כרומטין, התקדמות סרטן ותגובות חיסוניות31. מחקרים עדכניים הדגישו גם תפקידים חשובים לאיתות m6A במחלות הקשורות לעצמות ובאוסטאופורוזיס32.
מבין חלבוני הקריאה m6A, YTHDC1 פועל כקורא גרעיני המווסת עיבוד RNA וייצוא גרעיני, בעוד שחלבון קושר mRNA 2 (IGF2BP2) דמוי אינסולין 2 מייצב תמלילים שעברו עיבוד m6A בציטופלזמה. צ'ן ועמיתיו הראו ש-YTHDC1 מקדם את ייצוא הגרעין של circNSUN2 שעבר שינוי m6A, אשר מתקשר לאחר מכן עם IGF2BP2 לייצוב mRNA של HMGA2 ולקידום גרורות סרטן המעי הגס33. ממצאים אלו מצביעים על כך שוויסות מתואם על ידי YTHDC1 ו-IGF2BP2 עשוי לייצג מנגנון כללי השולט בגורלם של תמלולים שעברו שינויים ב-m6A.
המחקר הנוכחי חקר אתרי שינוי חזויים של m6A בתוך mRNA של Rab27A ובחן את האינטראקציות שלו עם YTHDC1 ו-IGF2BP2. נמצא כי YTHDC1 מקל על ייצוא גרעיני של תמלילי Rab27A שעברו שינוי m6A, בעוד IGF2BP2 אינטראקציה עם Rab27A בציטופלזמה ושיפר את יציבותו. באמצעות מנגנון רגולציה זה, Rab27A קידם התמיינות אוסטאוקלסטית ותרם להתפתחות האוסטאופורוזיס. ביחד, הממצאים מזהים מסלול רגולטורי התלוי ב-m6A שלא זוהה קודם לכן, הכולל את YTHDC1, IGF2BP2 ו-Rab27A בהבדלת אוסטאוקלסט. תוצאות אלו מספקות תובנות חדשות לגבי הפתוגנזה המולקולרית של האוסטאופורוזיס ועשויות לסייע בפיתוח אסטרטגיות טיפוליות חדשות הממוקדות בוויסות m6A של Rab27A.
כל ההליכים לבעלי חיים אושרו על ידי ועדת הגנת בעלי חיים וניצול בית החולים המסונף של אוניברסיטת סאות'ווסט לרפואה (אישור מס' 2024-Ethics-042). כל הניסויים בוצעו בהתאם להנחיות ARRIVE, לחוק בעלי החיים הבריטי (נהלים מדעיים) 1986 ולהנחיות הנלוות, להוראת האיחוד האירופי 2010/63/EU, ולמדריך המכונים הלאומיים לבריאות לטיפול ושימוש בבעלי חיים במעבדה (פרסום NIH מס' 8023, מתוקן 1978). העכברים חולקו באקראי לקבוצות ניסוי, ורצף ההקצאה הוסתר מהחוקר. כל איסוף הנתונים והניתוחים, כולל הערכה היסטולוגית, ניתוח תמונות מיקרו-CT וניתוחים סטטיסטיים, בוצעו על ידי חוקרים עיוורים להקצאת קבוצות. לא הוצאו בעלי חיים או דגימות מהניתוחים. כל התגובות, הציוד, התוכנה והמשאבים האחרים המשמשים בפרוטוקול זה מופיעים בטבלת החומרים.
1. בניית מודל השחלות (OVX)
עשרים וארבע נקבות עכברים מסוג בר מסוג C57BL/6 בגיל 8 שבועות שימשו לבניית מודל אוסטאופורוזיס. לאחר תקופת הסתגלות של שבוע, העכברים חולקו באקראי לקבוצת Sham או OVX. מודל OVX הוקם באמצעות כריתת שחלות דו-צדדית כפי שתואר קודם34,35. עכברים שניתחו בשמה עברו חשיפה ניתוחית של השחלות ללא הסרה.
להעברת גנים תוך-ירכית, וקטורים לנטיויראליים המבטאים sh-Rab27A או sh-NC הוזרקו 7 ימים לאחר ניתוח OVX כפי שדווח קודםלכן 36,37. בקצרה, חלקיקי לנטיוויראל מרוכזים (1 × 106 יחידות טרנסדוקציה למ"ל) הושמו לעצם הירך דרך מסלול הפיקה באמצעות מחט 22 גייג' תחת הרדמה. כל עכבר קיבל 20 מיקרו-ליטר של תליון לנטיויראלי. החתך נתפר לאחר מכן, והחיות נבדקו לאורך כל תקופת ההחלמה.
כל הניסויים בבעלי חיים בוצעו בתנאים מסוימים ללא פתוגנים. דגימות הירך נאספו 8 שבועות לאחר הניתוח. לפחות שישה עכברים בכל קבוצה שימשו לניתוחים היסטולוגיים ולחילוץ RNA או חלבון.
2. הדמיית מיקרו-CT ב-in-vivo
בוצעה טומוגרפיה מיקרו-ממוחשבת (micro-CT) להערכת מורפולוגיית עצם טרבקולרית. הטיביה הימנית של כל עכבר נסרקה ב-vivo לפני ניתוח OVX בגיל 14 שבועות. סריקות מעקב בוצעו מדי שבוע עד גיל 22 שבועות. לפחות שישה עכברים בכל קבוצה נכללו בניתוח המיקרו-CT.
העכברים הורדמו בפנטוברביטל נתרן תוך-פריטוניאלי (50 מ"ג/ק"ג משקל גוף). הרדמה מספקת אושרה על ידי היעדר רפלקס צביטת האצבעות ועל ידי ניטור מתמיד של קצב הנשימה, והיא נשמרה לאורך כל תהליך ההדמיה. כל הליכי המתת החסד בוצעו בהתאם לפרוטוקול בעלי החיים המאושר, להנחיות רווחת בעלי חיים מוסדיות, ולתקנות הלאומיות להמתת חסד לבעלי חיים במעבדה.
בגיל 24 שבועות, עכברים הושמתו על ידי פריקת צוואר הרחם לאחר הרדמה עמוקה, ושתי הטיביות נלקחו לסריקת ex vivo באמצעות אותו פרוטוקול הדמיה. פרמטרי הסריקה כללו גודל ווקסלים של 10.4 מיקרון, מתח של 55 קילו-וולט, זרם של 145 מיקרואמבר, שדה ראייה של 32 מ"מ, 1500/750 דגימות לכל הקרנה, וזמן אינטגרציה של 100 מילישניות.
התמונות עובדו באמצעות אלגוריתם תיקון הקשחת קרן פולינומי מדרגה שלישית, מכויל מול פנטום של 1200 מ"ג HA/cm3 . שבר נפח העצם (BV/TV), עובי טרבקולר (Tb.Th) ומספר טרבקולר (Tb.N) נמדדו במטאפיזיזה הפמורלית הדיסטלית הממוקמת במרחק 1.0 מ"מ קרוב לפלטת הגידול.
3. טרנספקציה לפלסמיד
פלסמידים sh-Rab27A ו-sh-NC יוצרו ושימשו לייצור לנטיווירוס. פלסמידים ארוזים לנטיויראליים ומבני shRNA הועברו יחד לתאי HEK293T בהתאם להוראות היצרן. טיטרים ויראליים נקבעו לפני מתן תוך-ירך כפי שתואר קודם36. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
4. צביעת המטוקסילין ואאוזין (HE)
דגימות הירך קיבעו ב-4% פאראפורמלדהיד במשך 24 שעות, דה-קלציפיק ב-10% EDTA במשך 4 שבועות, הוגנו בקירור ב-30% סוכרוז/PBS, הוטמעו בפרפין, וחתכו בעובי של 5 מיקרון. חתכי הרקמה צובקו בהמטוקסילין ואאוזין ונבדקו באמצעות מיקרוסקופ אור. לפחות שישה עכברים בכל קבוצה נותחו.
5. צביעת חומצה עמידה לטארטרט (TRAP)
צביעת TRAP של חתכי הירך בוצעה בהתאם להוראות היצרן38. פעילות TRAP במקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) הוערכה באמצעות בדיקת צביעת TRAP. אוסטאוקלטים בוגרים הוגדרו כתאים מרובי גרעינים חיוביים ל-TRAP המכילים לפחות שלושה גרעינים. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים, כל אחד עם שלושה שכפולים טכניים.
6. q-PCR
סך ה-RNA בודד באמצעות תגובת טריזול לפי הוראות היצרן. DNA משלים סונתז באמצעות טרנסקריפטאז הפוך ונחשף ל-PCR כמותי בזמן אמת באמצעות כימיה של SYBR Green. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים, כל אחד עם שלושה שכפולים טכניים.
רצפי הפריימר היו כדלקמן:
Rab27A: F, TTCCTGCTCTGTTTCGACCT; R, GGCAGCACTGTTTCAAAT
מלכודת: F, TGTTGACAGCGGTCCATCTA; R, CCTCCTTCTTAACCCGAAGC
NFATc1: F, GGTGCTGTCTGGCCATAACT; R, GCGGGAAAGGTGTGTATCTCAA
C-FOS: F, TACTACCATTCCCCAGCGA; R, GCTGTCACCGTGGGGATAA
YTHDC1: F, GAAGTGGAAGCTCTGCATCAG; R, TTGATCTTTTCGGACAGCACG
IGF2BP2: F, GACTACCCCGACCAGAACTG; R, GAGGCGGGATGTTCCGAATC
β-אקטין: F, GGGAAATCGTGCGTGACATTAAG; R, TGTGTTGGCGTACAGGTCTTTG
7. כתמים מערביים
תאים או רקמות עברו ליזה באמצעות בופר RIPA שהושלף עם מעכבי פרוטאז. ריכוזי החלבון נקבעו באמצעות בדיקת ברדפורד. כמויות שוות של חלבון (20 מיקרוגרם) הופרדו על ידי SDS-PAGE והועברו לממברנות פוליווינילידין פלואוריד (PVDF) או ניטרוצלולוזה. הממברנות נחסמו עם חלב דל שומן 5% למשך שעה בטמפרטורת החדר ודגרו במהלך הלילה בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס עם נוגדנים ראשוניים נגד TRAP, NFATc1, c-FOS, Rab27A, YTHDC1, IGF2BP2 או β-אקטין. לאחר השטיפה, הממברנות דוגרו עם נוגדנים משניים מתאימים למשך שעה בטמפרטורת החדר. רצועות החלבון הוצגו באמצעות נהלי זיהוי סטנדרטיים. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
8. תרבית תאים
מקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) בודדו כפי שתואר קודם39. תאי מח עצם שנקטפו מעצם עצם העכבר נגרמו במהלך הלילה במדיום חיוני מינימלי α עם תוספת של 10% סרום בקר עוברי, 30 ng/mL גורם מגרה מושבת מקרופאגים (M-CSF) ו-1% פניצילין/סטרפטומיצין בטמפרטורה של 37°C באטמוספירה לחה המכילה 5% CO₂. תאים לא דבקים נאספו ותרבתו במערכת נטולת תאי סטרומל המכילה 30 ng/mL M-CSF. לאחר 3 ימים, תאים דבקים נאספו כ-BMM והוגדרו בנוכחות 30 ng/mL M-CSF ומפעיל קולטנים של 50 ng/mL של ליגנד גרעיני-κB (RANKL) במשך 72 שעות כדי לעודד התמיינות אוסטאוקלסטית.
9. הפרעות RNA (RNAi)
RNA קטן מתערב (siRNAs) סונתז והועבר באמצעות מגיב טרנספקציה מבוסס שומנים לפי הוראות היצרן. התאים נזרעו בצפיפות של 2 ×-10תאים באר בלוחות של שישה בארות לפני הטרנספקציה. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
רצפי היעדים היו כדלקמן:
si-Rab27A: GGACUUAAUCAUCTAAGAGAAUGGAA
si-YTHDC1: GCAAGGAGUGUUAUCUUAATT
si-IGF2BP2: CCGUUAACCAACAAGCCAATT
10. אימונופלואורסצנציה
התאים תוקנו ב-4% פרפורמלדהיד למשך 20 דקות וחדיר ב-0.1% טריטון X-100 למשך 10 דקות. לאחר חסימה עם אלבומין סרום בקר 5% למשך 30 דקות, התאים הוגברו עם נוגדנים ראשוניים במהלך הלילה בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס.
לאחר הכביסה, הוחלו נוגדנים משניים מצומדים בפלואורופור למשך 30 דקות בטמפרטורת החדר. גרעינים צובעו נגד ב-DAPI, והתמונות צולמו באמצעות מיקרוסקופיה קונפוקלית. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
11. הפרדה גרעינית וציטופלזמית
שברים גרעיניים וציטופלזמיים בודדו לפי הוראות היצרן. התאים הונחו על קרח למשך 10 דקות וצנטריפוגה ב-500 × גרם למשך 3 דקות בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס. הסופרנטנט המכיל רכיבים ציטופלזמיים נאסף, בעוד שהגרעינים המכילים הכדור נשטף ועובד בנפרד.
12. אימונופרציפיטציה של חלבון קשור ל-RNA (RIP)
בדיקות אימונופרציפיטציה של RNA (RIP) בוצעו בהתאם להוראות היצרן. לזמן קצר, התאים היו מונחים על קרח למשך 30 דקות. לאחר הצנטריפוגה, הסופרנטנטים דוגרו במהלך הלילה עם נוגדנים וחרוזי אגרוז חלבון A/G. לאחר השטיפה, חלבונים עם אימונופרציפיטציה נותחו באמצעות Western blotting, ו-RNA קו-אימונופרציפיטציה נותח באמצעות PCR כמותי בזמן אמת. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
13. בדיקת יציבות mRNA של Rab27A
סך ה-RNA הוצא בנקודות הזמן המצוינות לאחר IGF2BP2 ההפלה. לאחר מכן בוצעו שעתוק הפוך ו-PCR כמותי בזמן אמת. רמות ה-mRNA של Rab27A נורמל לקבוצת si-NC המתאימה ב-0 שעה. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים.
14. ניתוח סטטיסטי
כל הניסויים בוצעו באופן עצמאי באמצעות לפחות שלושה שכפולים ביולוגיים. עבור q-PCR, הפרעות RNA, צביעת TRAP, ווסטרן בלוטינג ובדיקות נוספות מבוססות תאים, כל שכפול ביולוגי כלל שלושה שכפולים טכניים אלא אם צוין אחרת. הנתונים מוצגים כסטיית תקן ממוצעת ± (SD).
ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות גרסה 9.0 של GraphPad Prism ותוכנת SPSS. השוואות בין שתי קבוצות בוצעו באמצעות מבחן t דו-זנבי של סטודנט. השוואות בין קבוצות מרובות נותחו באמצעות ניתוח שונות דו-כיווני (ANOVA), ואחריו מבחן השוואות מרובות לאחר מכן של טוקי כדי להתאים את עצמו להשוואות מרובות. ערך P < 0.05 נחשב מובהק סטטיסטית.
הפלת Rab27A הפחיתה את האוסטאופורוזיס במצב חי.
כדי לחקור את תפקיד Rab27A באוסטאופורוזיס, בוצעה הפיכה של Rab27A במודל עכבר שחלה (OVX) שהוקם בשיטות שדווחו בעבר34,40. עיצוב המחקר הכולל מסוכם באיור 1. ניתוח טומוגרפיה מיקרו-ממוחשבת הראה שצפיפות מינרלים בעצם, שבר נפח העצם (BV/TV), עובי טרבקולר (Tb.Th) ומספר טרבקולר (Tb.N) ירדו באופן משמעותי בעכברי OVX בהשוואה לביקורת של שאם (איור 2A). ממצאים אלו אישרו את הקמת מודל האוסטאופורוזיס בהצלחה. הפלת Rab27A החזירה באופן משמעותי את כל הפרמטרים המבניים לעצם שנמדדו, מה שמעיד על החלשה של אובדן עצם שנגרם מ-OVX והידרדרות מיקרוארכיטקטורה (איור 2A).
בדיקה היסטולוגית תמכה עוד יותר בממצאים אלו. צביעת המטוקסילין ואאוזין חשפה אובדן משמעותי של עצם טרבקולרית והפרעה לארכיטקטורה טרבקולרית בעכברי OVX בהשוואה לקבוצת שאם (איור 2B). לעומת זאת, דלדול Rab27A הקל על התדרדרות טרבקולרית והחזיר חלקית את מורפולוגיית העצם (איור 2B). מכיוון ש-Rab27A היה מעורב בהתמיינות אוסטאוקלטים28, פעילות האוסטיאוקלטים הוערכה באמצעות צביעת חומצה עמידה לטארטרט (TRAP). פעילות TRAP הייתה גבוהה משמעותית בעכברי OVX ביחס לביקורת Sham וירדה משמעותית לאחר הפלת Rab27A (איור 2C).
לאחר מכן נבדק ביטוי של סמנים הקשורים לאוסטיאוקלסט. ניתוח Western Blot הראה כי רמות החלבונים Rab27A, TRAP, NFATc1 ו-c-FOS עלו באופן משמעותי בעכברי OVX וירדו לאחר דלדול Rab27A (איור 2D). תוצאות עקביות התקבלו ברמת השעתוק, כאשר PCR כמותי בזמן אמת (q-PCR) הראה דפוסי ביטוי דומים לביטוי mRNA של Rab27A, TRAP, NFATc1 ו-c-FOS (איור 2E).

איור 1: סקירה סכמטית של עיצוב הניסוי והמנגנון הרגולטורי המוצע בבסיס ויסות IGF2BP2 ב-YTHDC1 וב- של Rab27A מותאם ב-m6A במהלך התמיינות אוסטאוקלסט והתקדמות אוסטאופורוזיס. מודל עכבר שחלות (OVX) ומפעיל קולטנים של גורם גרעיני-ליגנד κB (RANKL)/גורם מגרה קולוניית מקרופאגים (M-CSF) שימשו לבדיקת תפקיד Rab27A באוסטאוקלסטוגנזה. בוצעו בדיקות של Rab27A, שבר גרעיני וציטופלזמי, ואימונופרציפיטציה של RNA להערכת סמני התמיינות אוסטאוקלטים (TRAP, NFATc1 ו-c-FOS), ביטוי Rab27A ומיקום תת-תאי. YTHDC1 הקל על ייצוא הציטופלזמה של Rab27A שעבר שינוי m6A, בעוד IGF2BP2 ייצב את Rab27A בציטופלזמה. יחד, מנגנוני הרגולציה המתואמים הללו קידמו התמיינות אוסטאוקלסטית ותרמו לאובדן עצם במודל OVX. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 2: הפחתת Rab27A הפחיתה אוסטאופורוזיס ב-vivo. (א) ניתוח מורפומטרי עצם טרבקולרית. צפיפות המינרלים בעצם, שבר נפח העצם (BV/TV), עובי טרבקולר (Tb.Th) ומספר טרבקולר (Tb.N) נמדדו. **P < 0.01, ***P < 0.001. (ב) הערכה היסטולוגית של עצם טרבקולר הירך לאחר דלדול Rab27A. בוצעו צביעת המטוקסילין ואאוזין (HE) להערכת שינויים מבניים בירך הרחוקה. קבוצות OVX ו-OVX + sh-NC שימשו כביקורת. פס קנה מידה = 50 מיקרון. ***P < 0.001. (ג) צביעת מלכודת על קטעי הירך. פעילות TRAP הוערכה להערכת פעילות האוסטאוקלסטים. קבוצות OVX ו-OVX + sh-NC שימשו כביקורת. פס קנה מידה = 50 מיקרון. ***P < 0.001. (D–E) ביטוי של Rab27A, TRAP, NFATc1 ו-c-FOS לאחר דלדול Rab27A. ביטוי החלבון נקבע באמצעות ווסטרן בלוטינג (D), וביטוי mRNA נקבע באמצעות q-PCR (E). β-אקטין שימש כבקר טעינה. **P < 0.01, ***P < 0.001. קבוצת שאם עברה חשיפה כירורגית לשחלות ללא כריתת שחלות, בעוד שקבוצת OVX עברה כריתת שחלות דו-צדדית. sh-NC, שליטה שלילית RNA קצר עם סיכת שיער. שישה עכברים נכללו בכל קבוצת ניסוי. הנתונים מוצגים כממוצעים ± SD. אנא לחצו כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של האיור הזה.
הפלת Rab27A דיכאה התמיינות אוסטאוקלסטית של BMM שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL
כדי להעריך את תפקיד Rab27A במהלך אוסטאוקלסטוגנזה, מקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) הוגרו באמצעות גורם מגרה קולוניית מקרופאגים (M-CSF) ומפעיל קולטנים של ליגנד גורם κB גרעיני (RANKL) כדי לעודד התמיינות אוסטאוקלסטית28.
ניתוחי PCR כמותיים בזמן אמת ו-Western Blot הראו כי גירוי M-CSF ו-RANKL הגביר משמעותית את ביטוי ה-mRNA והחלבון של Rab27A, בעוד שטרנספקציה עם si-Rab27A הפחיתה למעשה את ביטוי Rab27A (איור 3A, B). צביעת TRAP הראתה עלייה משמעותית בפעילות האוסטיאוקלסט לאחר טיפול ב-M-CSF ו-RANKL. הפלת Rab27A הפחיתה משמעותית את פעילות ה-TRAP בהשוואה לקבוצה המושרה (איור 3C).
לאחר מכן נבדקו ביטוי של סמני התמיינות אוסטאוקלסטיות. ניתוח PCR כמותי בזמן אמת הראה שרמות ה-mRNA של TRAP, NFATc1 ו-c-FOS עלו באופן משמעותי לאחר השראת האוסטיאוקלסטים וירדו בעקבות דלדול Rab27A (איור 3D). תוצאות דומות נצפו ברמת החלבון על ידי ווסטרן בלוטינג (איור 3E).

איור 3: הפחתת Rab27A דיכאה התמיינות אוסטאוקלסטית של מקרופאגים שמקורם במח עצם (BMMs) שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL. (A–B) ביטוי של Rab27A לאחר השראת אוסטאוקלסט. רמות mRNA (A) וחלבון Rab27A נקבעו באמצעות q-PCR ו-Western blotting, בהתאמה. β-אקטין שימש כבקר טעינה. P < 0.001. (ג) צביעת מלכודת של אוסטאוקלטים שמקורם ב-BMM. פעילות TRAP מוגברת שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL דוכאה לאחר הפלת Rab27A. פס קנה מידה = 50 מיקרון. ***P < 0.001. (D–E) ביטוי של סימני התמיינות אוסטאוקלסטית לאחר דלדול Rab27A. רמות ה-mRNA של TRAP, NFATc1 ו-c-FOS נקבעו באמצעות q-PCR (D), ורמות החלבון נקבעו באמצעות ווסטרן בלוטינג (E). β-אקטין שימש כבקר טעינה. **P < 0.01, ***P < 0.001. בקרה, תאים לא מטופלים; si-NC, שליטה שלילית siRNA. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD. אנא לחצו כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של האיור.
ייצוא ציטופלזמי של Rab27A מותאם על ידי m6A הוקל על ידי YTHDC1
כדי לבדוק את המעורבות האפשרית של שינוי m6A בוויסות Rab27A, בוצעו ניתוחים ביואינפורמטיים. אתרי שינוי m6A שחזו זוהו בתמלול Rab27A (איור 4A). בנוסף, ניתוח חיזוי אינטראקציה הציע קשרים פוטנציאליים בין Rab27A לחלבוני הקורא m6A YTHDC1 ו-IGF2BP2 (איור 4B).
כדי לאמת את האינטראקציה בין YTHDC1 ל-mRNA של Rab27A, בוצעו בדיקות אימונופרסיפיטציה של RNA (RIP). mRNA של Rab27A הועשר משמעותית במורכבים שקיבלו אימונופרציפיטציה בנוגדן אנטי-YTHDC1 בהשוואה לבקרת האימונוגלובולין G (IgG) (איור 4C).
מכיוון ש-YTHDC1 פועל כקורא m6A גרעיני המעורב בייצוא RNA41, בוצעו בדיקות פירוק גרעיניות וציטופלזמיות. הפלת YTHDC1 העלתה משמעותית את שימור ה-mRNA של Rab27A גרעינית תוך הפחתת שפע הציטופלזמה שלו (איור 4D).
השפעת YTHDC1 על ביטוי Rab27A הוערכה בהמשך. ניתוח PCR כמותי בזמן אמת הראה כי דלדול YTHDC1 מפחית את ביטוי ה-mRNA של Rab27A (איור 4E). באופן עקבי, ניתוח Western Blot הראה ירידה בביטוי חלבוני Rab27A לאחר ירידה ב-YTHDC1 (איור 4F).

איור 4: ייצוא ציטופלזמי של Rab27A שעבר שינוי m6A הוקל על ידי YTHDC1. (A) אתרי שינוי m6A חזויים בתוך Rab27A שזוהו באמצעות כלי החיזוי SRAMP. (B) אינטראקציות חזויות בין Rab27A לחלבוני הקורא m6A YTHDC1 ו-IGF2BP2 זוהו באמצעות StarBase. (ג) בדיקת אימונופפרסיפיטציה של RNA (RIP) המדגימה את האינטראקציה בין YTHDC1 ל-mRNA של Rab27A. **P < 0.01. IgG שימש כשליטה שלילית. העשרת Rab27A נורמלה לאחוז הקלט. רצועת האימונובלוט YTHDC1 משקפת יעילות אימונופרסיפיטציה. (D) ניתוח שבר גרעיני וציטופלזמי המדגים עלייה בשימור גרעיני של Rab27A לאחר הפלת YTHDC1. **P < 0.01, ***P < 0.001. (E–F) ביטוי של YTHDC1 ו-Rab27A לאחר הפלת YTHDC1. ביטוי mRNA נקבע באמצעות q-PCR (E), והביטוי של החלבון נקבע באמצעות Western bloting (F). β-אקטין שימש כבקר טעינה. **P < 0.01. si-NC, שליטה שלילית siRNA. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים. הנתונים מוצגים כממוצעים ± SD. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של איור זה.
ייצוב Rab27A באמצעות אינטראקציה עם IGF2BP2
האינטראקציה בין IGF2BP2 ל-Rab27A נחקרה באמצעות בדיקות RIP. mRNA Rab27A הועשר משמעותית במורכבים שקיבלו אימונופרציפיטציה בנוגדן אנטי-IGF2BP2 בהשוואה לביקורת IgG, מה שמעיד על קשר בין IGF2BP2 ל-mRNA Rab27A (איור 5A).
ניתוח אימונופלואורסצנציה הראה קולוקליזציה של IGF2BP2 ו-Rab27A בעיקר בתוך הציטופלזמה (איור 5B). כדי לקבוע את ההשפעה הפונקציונלית של IGF2BP2 על ביטוי Rab27A, IGF2BP2 הושתקה באמצעות siRNA. ניתוח PCR כמותי בזמן אמת חשף ירידה משמעותית ברמות ה-mRNA של Rab27A לאחר דלדול IGF2BP2 (איור 5C). בהתאם לממצאים אלו, ניתוח Western Blot הראה ירידה בביטוי חלבוני Rab27A לאחר IGF2BP2 הנפילה (איור 5D).
השפעת IGF2BP2 על יציבות ה-mRNA של Rab27A הוערכה לאחר מכן. IGF2BP2 ההתדלדלות קיצרה משמעותית את מחצית החיים של mRNA של Rab27A והפחיתה את יציבות התמלול (איור 5E).

איור 5: ייצוב Rab27A באמצעות אינטראקציה עם IGF2BP2. (א) בדיקת אימונופרציפיטציה של RNA המדגימה את הקשר בין IGF2BP2 ל-mRNA של Rab27A. IgG שימש כשליטה שלילית. העשרת Rab27A נורמלה לאחוז הקלט. P < 0.001. (B) ניתוח אימונופלואורסצנציה המדגים קו-לוקליזציה של Rab27A ו-IGF2BP2 בציטופלזמה. הגרעינים צובעו נגד DAPI. פס קנה מידה = 20 מיקרומטר. (C–D) ירידה בוויסות של Rab27A לאחר IGF2BP2 התרוקנות. רמות ה-mRNA של Rab27A נקבעו באמצעות q-PCR (C), ורמות החלבון נקבעו באמצעות ווסטרן בלוטינג (D). β-אקטין שימש כבקר טעינה. **P < 0.01, ***P < 0.001. (ה) יציבות mRNA של Rab27A לאחר ההפלה IGF2BP2. רמות ה-mRNA של Rab27A נורמל לקבוצת si-NC המתאימה ב-0h. **P < 0.01. si-NC, שליטה שלילית siRNA. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים. הנתונים מוצגים כממוצעים ± SD. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של איור זה.
השתקת YTHDC1 או IGF2BP2 דיכאה התמיינות אוסטאוקלסטית של BMMs שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL
כדי לחקור עוד את הקשר הפונקציונלי בין YTHDC1, IGF2BP2 ו-Rab27A במהלך התמיינות האוסטיאוקלסטים, נערכו ניסויי נוקדאון ב-BMMs.
גירוי M-CSF ו-RANKL הגבירו משמעותית את ביטוי ה-mRNA של Rab27A, YTHDC1 ו-IGF2BP2 (איור 6A). בהתאם לכך, גם ביטוי החלבונים של מולקולות אלו עלה לאחר השראת אוסטאוקלטים (איור 6B). השתקת YTHDC1 או IGF2BP2 הפחיתה משמעותית את ביטוי Rab27A, בעוד שהפלת אחד הרגולטורים לא השפיעה באופן משמעותי על הביטוי של השני.
צביעת TRAP הראתה כי דלדול YTHDC1 או IGF2BP2 דיכא משמעותית את פעילות האוסטיאוקלסטים שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL (איור 6C). יתרה מזאת, ניתוח PCR כמותי בזמן אמת חשף ביטוי מופחת של TRAP, NFATc1 ו-c-FOS לאחר הפלת YTHDC1 או IGF2BP2 (איור 6D). ניתוח ווסטרן בלוט אישר ירידות מקבילות ברמת החלבון (איור 6E).
ביחד, ממצאים אלו מצביעים על כך ש-YTHDC1 ו-IGF2BP2 מקדמים התמיינות אוסטאוקלסטית באמצעות ויסות ביטוי Rab27A.

איור 6: השתקה של דיכוי YTHDC1 או IGF2BP2 הבדלות אוסטאוקלסטית של BMMs שנגרמה על ידי M-CSF ו-RANKL. (A–B) ביטוי של Rab27A אחרי YTHDC1 או IGF2BP2 knockdown. רמות mRNA (A) וחלבון Rab27A נקבעו באמצעות q-PCR ו-Western blotting, בהתאמה. β-אקטין שימש כבקר טעינה. P < 0.001. (ג) צביעת TRAP המדגימה דיכוי פעילות האוסטיאוקלסט לאחר דלדול YTHDC1 או IGF2BP2. פס סולם = 50 מיקרומטר. **P < 0.01, ***P < 0.001. (D–E) ביטוי של סמני התמיינות אוסטאוקלסטיות לאחר YTHDC1 או דלדול IGF2BP2. רמות ה-mRNA של TRAP, NFATc1 ו-c-FOS נקבעו באמצעות q-PCR (D), ורמות החלבון נקבעו באמצעות ווסטרן בלוטינג (E). β-אקטין שימש כבקר טעינה. *P < 0.05, **P < 0.01, ***P < 0.001. בקרה, תאים לא מטופלים; si-NC, שליטה שלילית siRNA. בוצעו שלושה שכפולים ביולוגיים עצמאיים. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD. אנא לחצו כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של האיור.
זמינות נתונים:
מערכי הנתונים ששימשו ו/או נותחו במהלך המחקר הנוכחי (כולל נתוני ווסטרן בלוט, מערכי דימות, ניתוחים כמותיים וקבצי מקור) במהלך מחקר זה סופקו בקובץ משלים 1.
קובץ משלים 1: מערכי הנתונים והנתונים הגולמיים של מחקר זה. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ הזה.
התמיינות האוסטיאוקלסטים ממלאת תפקידים חיוניים בעיצוב מחדש של עצם, ספיגת עצם, תיקון שברים, והומאוסטזיס השלדי12˒15˒17˒18˒42˒43. פעילות אוסטאוקלסטית מופרזת היא גורם מרכזי לאוסטאופורוזיס, מה שהופך את זיהוי מסלולים רגולטוריים השולטים בהבדלת אוסטאוקלטים למטרה מחקרית חשובה. מספר טיפולים אנטי-ספיגתיים המיועדים לתפקוד האוסטיאוקלסט הוכיחו יעילות קלינית 6,44,45. לדוגמה, דנוסומאב נקשר להפחתת שכיחות שברים ולפרופיל בטיחותחיובי 6, בעוד שהמעכב קתפסין K ONO-5334 הראה השפעות חיוביות על צפיפות מינרלים בעצם וחוזק עצם בפרימטים לא-אנושיים שעברו שחלות44. המחקר הנוכחי זיהה מנגנון רגולטורי התלוי ב-m6A שלא זוהה קודם לכן, הכולל את YTHDC1, Rab27A ו-IGF2BP2, המעודד התמיינות אוסטאוקלסטית והתקדמות האוסטאופורוזיס. ממצאים אלו מספקים תובנות חדשות על הוויסות המולקולרי של אוסטאוקלסטוגנזה ומציעים מטרות טיפוליות פוטנציאליות לאוסטאופורוזיס.
Rab27A היה מעורב בעבר בהבדלות אוסטאוקלסטיות ובספיגת עצם באמצעות ויסות תנועה וזיקולרית ואיתות תוך-תאי, ועשוי גם להשפיע על מפלי איתות מונעים על ידי RANKL באמצעות מיחזור אנדוסומלי של קולטנים מרכזיים28,29. בהתאם לדיווחים אלו, הביטוי של Rab27A עלה משמעותית במהלך התמיינות האוסטיאוקלסטים, בעוד שהידלדול Rab27A דיכא התמיינות אוסטאוקלטים במבחנה והקל על אובדן עצם הקשור לאוסטאופורוזיס ב-vivo. ממצאים אלו תומכים בתפקיד קריטי של Rab27A בביולוגיה של האוסטאוקלטים ומרחיבים עוד יותר תצפיות קודמות על ידי הוכחת שפעילות Rab27A מוסדרת באמצעות מנגנונים התלויים ב-m6A. ביחד, הממצאים מצביעים על כך ש-Rab27A שמותאם על ידי m6A עשוי לווסת תהליכים אלו ברמה שלאחר השעתוק ובכך להשפיע על פעילות ספיגת העצם.
ראיות מצטברות מצביעות על כך ששינוי m6A תורם להתפתחות והתקדמות מחלות הקשורות לעצמות32. ניתוחים ביואינפורמטיים זיהו אתרי שינוי משוערים של m6A בתוך mRNA של Rab27A (איור 4A), ומחקרים פונקציונליים הראו כי YTHDC1 ו-IGF2BP2 מווסתים את ביטוי Rab27A ואת ההתמיינות האוסטיאוקלסטית (איורים 4–6). ממצאים אלו מצביעים על כך ששינוי m6A הוא מנגנון ויסות חשוב במעלה הזרם השולט בתפקוד Rab27A במהלך אוסטאוקלסטוגנזה. מכיוון שמספר אתרי m6A חזויים זוהו בתוך Rab27A, מחקרים עתידיים צריכים לקבוע האם נדרשים אתרים בודדים או שילובים של אתרים לוויסות Rab27A. בניית מוטנטים חסרי m6A של Rab27A וניסויי חילוץ עתידיים יספקו ראיות ישירות לחשיבות התפקודית של שינוי m6A במסלול זה.
מבחינה מכנית, המחקר הנוכחי הראה ש-YTHDC1 מתקשר עם mRNA של Rab27A ומקל על יצואו הגרעיני. לאחר טרנסלוקציה ציטופלזמטית, IGF2BP2 מתחבר ישירות ל-mRNA של Rab27A ומשפרת את יציבות התמלול. כתוצאה מכך, דלדול של YTHDC1 או IGF2BP2 הפחית את ביטוי Rab27A ודיכא התמיינות אוסטאוקלסטית. ממצאים אלו תומכים במודל שבו YTHDC1 ו-IGF2BP2 משתפים פעולה לשמירת ביטוי Rab27A על ידי תיאום העברת mRNA ויציבותו. מנגנון רגולטורי זה מרחיב את ההבנה הנוכחית של ויסות מתווך m6A של התמיינות אוסטאוקלטים ומזהה רכיבים מרובים של מסלול זה כמטרות טיפוליות פוטנציאליות.
יש להכיר בכמה מגבלות. ראשית, אף ש-Rab27A הוכח כמווסת התמיינות אוסטיאוקלסטית, השפעותיו הפוטנציאליות על תפקוד האוסטאובלסט לא נחקרו. מכיוון שהומאוסטזיס עצם תלוי באיזון בין ספיגת עצם המתווכת על ידי אוסטאוקלטים לבין היווצרות עצם המתווכת על ידי אוסטאובלסטים, מחקרים עתידיים צריכים לבחון האם Rab27A משפיע גם על התמיינות או פעילות האוסטאובלסטים. שנית, המחקר הנוכחי התבסס בעיקר על גישות של אובדן תפקוד. ביטוי יתר משלים של Rab27A, YTHDC1 ו-IGF2BP2, יחד עם ניסויי חילוץ עם מוטנטים חסרי m6A של Rab27A, יחזקו עוד יותר את המודל הרגולטורי המוצע. שלישית, אף שמספר אתרי m6A משוערים בתוך mRNA של Rab27A חזו באמצעות גישות ביואינפורמטיות, האתרים הספציפיים האחראים לווסת פונקציית Rab27A נותרו לא מזוהים ודורשים אימות ניסיוני. לבסוף, נדרשים מחקרים נוספים כדי לקבוע האם חלבוני קורא m6A אחרים, חלבוני קישור RNA או מסלולי איתות משתתפים בוויסות Rab27A במהלך התמיינות האוסטיאוקלסטים.
ויסות מערכת החיסון הפך לרכיב חשוב בפתוגנזה של אוסטאופורוזיס 46,47. Rab27A ביסס תפקידים בהפרשת תאי חיסון, שחרור גרנולים ציטוטוקסיים, דה-גרנולציה נויטרופילית, וויסות מיקרוסביבה של הרקמה 48,49,50,51,52,53,54,55. חקירה נוספת של הקשר בין Rab27A, ויסות מערכת החיסון וההומאוסטזיס של העצם עשויה לספק תובנות נוספות לגבי הפתוגנזה של אוסטאופורוזיס.
חקירות עתידיות צריכות לתת עדיפות למספר תחומים מרכזיים. ראשית, נדרשת מוטגנזה שיטתית של אתרי m6A החזויים בתוך Rab27A כדי לזהות את אתרי הקישור הפונקציונליים המעורבים בוויסות מתווך YTHDC1 ו-IGF2BP2. שנית, ביטוי יתר של Rab27A, YTHDC1 ו-IGF2BP2, יחד עם ניסויי חילוץ עם מוטנטים חסרי m6A של Rab27A, יהיו חיוניים לקביעת התרומה הישירה של ציר הרגולציה YTHDC1/Rab27A/IGF2BP2. שלישית, אימות מסלול זה במודלים נוספים של אוסטאופורוזיס והערכת תפקוד Rab27A באוסטאובלסטים יהיו חשובים לתמיכה נוספת של הממצאים הנוכחיים.
לסיכום, המחקר הנוכחי זיהה ציר רגולטורי חדש של YTHDC1/Rab27A/IGF2BP2 המקדם התמיינות בין אוסטאוקלטים והתקדמות האוסטאופורוזיס. YTHDC1 סייע לייצוא גרעיני של mRNA Rab27A ששונה על ידי m6A, בעוד IGF2BP2 שיפר את יציבות ה-mRNA של Rab27A בציטופלזמה. אירועים רגולטוריים מתואמים אלו הגבירו את ביטוי Rab27A וקידמו אוסטאוקלסטוגנזה. ביחד, הממצאים מרחיבים את ההבנה הנוכחית של ויסות מתווך m6A באוסטאופורוזיס ומספקים בסיס לפיתוח אסטרטגיות טיפוליות המיועדות למסלול YTHDC1/Rab27A/IGF2BP2.
המחברים מצהירים שאין אינטרסים פיננסיים מתחרים או ניגודי עניינים.
עבודה זו נתמכה כלכלית על ידי פרויקט שיתוף הפעולה האסטרטגי המדעי והטכנולוגי בין בית החולים העממי פנגג'ואו לאוניברסיטת הרפואה דרום-מערבית (מענק מס' 2023PZXNYD01) לליאן טאנג.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 4% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | A5818101 | Tissue and cell fixation |
| Alexa Fluor 488 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11001 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534069 |
| Alexa Fluor 546 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11035 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534093 |
| Bovine serum albumin (BSA) | Merck | A2153 | Blocking reagent |
| Bradford Protein Assay | Merck | B6916 | Protein quantification |
| C57BL/6JSlac mice | Shanghai SLAC Laboratory Animal Co., Ltd. | — | Female, 8 weeks old; RRID: MGI:2159769 |
| c-FOS antibody | Abcam | ab222699 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2891049 |
| Confocal laser scanning microscope (SP8) | Leica Microsystems | SP8 | Immunofluorescence image acquisition; RRID: SCR_018169 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Nuclear counterstain for immunofluorescence; RRID: AB_2307445 |
| EDTA | Merck | V900081-500G | Tissue decalcification reagent |
| Eosin | Solarbio | G1100 | Histological cytoplasmic stain |
| Fetal bovine serum (FBS) | Thermo Fisher Scientific | A5669701 | Cell culture supplement |
| GraphPad Prism | GraphPad Software | Version 9.0 | Statistical analysis software; RRID: SCR_002798 |
| Hematoxylin | Cell Signaling Technology | #14166 | Histological nuclear stain |
| IBM SPSS Statistics | IBM | Windows version | Statistical analysis software; RRID: SCR_016479 |
| IGF2BP2 antibody | Proteintech | 11601-1-AP | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_2122672 |
| Inverted light microscope (DMi8) | Leica Microsystems | DMi8 | Histological image acquisition; RRID: SCR_026672 |
| Lentiviral titer quantification kit | Takara Bio | 631235 | Lentiviral titer determination |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | Plasmid transfection reagent |
| Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | siRNA transfection reagent |
| M-CSF | MedChemExpress | HY-P7085 | Osteoclast differentiation factor |
| Micro-computed tomography system | Scanco Medical | VivaCT80 | Bone morphometric analysis |
| M-MLV Reverse Transcriptase | Promega | M1701 | cDNA synthesis |
| NFATc1 antibody | Santa Cruz Biotechnology | sc-7294 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2152503 |
| PARIS Kit | Thermo Fisher Scientific | AM1556 | Nuclear and cytoplasmic fractionation |
| Penicillin/Streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Antibiotic supplement for cell culture |
| Power SYBR Green Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4367659 | Quantitative real-time PCR |
| Protease inhibitor cocktail | Thermo Fisher Scientific | 78429 | Prevention of protein degradation |
| Protein A/G agarose beads | Merck | IP05 | Immunoprecipitation |
| PVDF membrane | Thermo Fisher Scientific | 88520 | Protein transfer membrane for western blotting |
| Rab27A antibody | Abcam | ab55667 | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_945112 |
| RANKL | MedChemExpress | HY-P7425 | Osteoclast differentiation factor |
| Real-time PCR system | Applied Biosystems | ABI7900HT | Quantitative real-time PCR instrument |
| RIPA buffer | Thermo Fisher Scientific | 78501 | Protein extraction buffer |
| RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit | Millipore | RIP-12RXN | RNA immunoprecipitation assay |
| SDS-PAGE reagents | Thermo Fisher Scientific | BT041210BOX | Protein electrophoresis |
| shRNA plasmids | RiboBio | — | Gene silencing by RNA interference |
| Small interfering RNAs (siRNAs) | GenePharma | — | Gene silencing by RNA interference |
| SRAMP | Online resource | — | Prediction of m6A modification sites; RRID: SCR_024500 |
| StarBase (ENCORI) | Online resource | — | RNA interaction prediction database; RRID: SCR_016303 |
| TRAP antibody | Abcam | ab2391 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_303034 |
| TRAP staining kit | Merck | 387A | Detection of osteoclast activity |
| Triton X-100 | Thermo Fisher Scientific | 85111 | Cell permeabilization reagent |
| TRIzol Reagent | Thermo Fisher Scientific | 15596026CN | Total RNA isolation |
| YTHDC1 antibody | Abcam | ab122340 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_11128253 |
| α-MEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 139-15651 | Cell culture medium |
| β-Actin antibody | Merck | A5441 | Loading control for western blotting; RRID: AB_476744 |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה