עיצוב המחקר
מחקר זה השתמש בעיצוב ביבליומטרי וגרף ידע שהתמקד בראיות קליניות ובמחקר מכניסטי על TXYF עבור UC. תהליך העבודה מוצג באיור 1 וכולל שישה שלבים מקושרים: שליפת מסדי נתונים, הסרת כפילות, סינון כותרות/תקצירים, הערכת זכאות לטקסט מלא, חילוץ נתונים מובנה, והדמיה/סינתזה. המדגם האנליטי הסופי כלל 133 מאמרים וביקורות באנגלית. טבלה 1 מסכמת את אסטרטגיית החיפוש וקריטריוני הזכאות, וטבלת החומרים מפרטת את הפלטפורמה הביבליוגרפית, סוגי הנתונים המיוצאים, כלי התוכנה והערות השחזור.
העיצוב משלב מטא-דאטה ביבליוגרפית, מידע על מחברים ומוסדות, מדינות/אזורים, כתבי עת מקורים, מקורות מצוטטים, מילות מפתח, תקצירים ותכונות נושאיות מקודדות ידנית. גישה זו מאפשרת לכתב היד לתאר דפוסי צמיחה ושיתופי פעולה בפרסום, תוך בחינת האם ראיות קליניות ומחקר מכניסטי מתפתחים כזרמים תרגומיים מחוברים או כגופי עבודה מקבילים ומקושרים חלש.
מקור הנתונים ואסטרטגיית החיפוש
מקור הנתונים היה Web of Science Core Collection (WoSCC), שנבחר משום שהוא מספק רשומות ציטוט סטנדרטיות, מילות מפתח למחברים, השתייכות מוסדית, שדות מדינה/אזור, הפניות מצוטטות ופורמטים לייצוא התואמים ל-VOSviewer ול-CiteSpace. החיפוש כלל רשומות זמינות עד 31 בדצמבר 2025. גם שליפת וגם ייצוא נתונים בוצעו בנקודת זמן אחת כדי להפחית את חוסר היציבות שנגרם מעדכוני מסד נתונים.
שאילתת חיפוש הנושא המדויקת שבוצעה ב-WoSCC הייתה:
TS=(("טונגשיה יאופאנג" או "טונג שי יאו פאנג" או "טונגשי-יאופאנג" או "נוסחת טונגשי" או "TXYF") ו-("קוליטיס כיבית" או "UC"))
תוצאות החיפוש הוגבלו למאמרים וביקורות בשפה האנגלית. תקצירי כנס, מאמרי מערכת, מכתבים, תיקונים, ביקורות ספרים ורשומות ללא מידע ביבליוגרפי מספק הוצאו. הגבלות אלו יושמו כדי לשמור על עקביות מטא-דאטה לבניית רשת; עם זאת, עיצוב ה-WoSCC באנגלית בלבד מוכר בדיון כמגבלה חשובה בשחזור ולא כהוכחה לכך שעבודה קלינית בשפה הסינית אינה קיימת.
לצורך שכפול, כל רשומות WoSCC הזכאיות יוצאו כרשומות מלאות עם מקורות מצוטטים. תיאורים מגבילים כגון קליני, מנגנוני, פרמקולוגיית רשת, מסלול איתות, מיקרוביוטה או ניסוי לא נוספו לשאילתה הראשונית. לאחר השחזור, הרשומות נבדקו ידנית וקודדו לפי כותרת, תקציר וכאשר נדרש – טקסט מלא. שדות גאוגרפיים עברו סטנדרטיזציה לפני הוויזואליזציה: רשומות השתייכות מטייוואן, הונג קונג ומקאו טופלו כרשומות אזוריות בסין לספירה ברמת המדינה ולא פורשו כמדינות ריבוניות נפרדות.
קריטריוני זכאות וסינון ספרות
כדי להבטיח רלוונטיות גבוהה בין הספרות הכלולה לנושא המחקר, ולשפר את הדיוק והפרשנות של תוצאות ניתוח גרף הידע לאחר מכן, המחקר קבע קריטריונים ברורים להכללה והחרגה לפני ניתוח פורמלי וביצע סקר מדורג של ספרות שנאספה באמצעות הליכים סטנדרטיים. תהליך הסינון הכולל כלל ארבעה שלבים: הסרת שכפול מסמכים, סינון ראשוני של כותרות ותקצירים, סינון מחדש של טקסט מלא, וקביעת הכללה סופית (ראו איור 1 לתהליך עבודה מפורט). לאחר שליפה שיטתית וסינון מתקדם, נכללו בסופו של דבר 133 מאמרים בניתוח הביבליומטרי של מחקר זה.
לגבי קריטריוני הכללה, מחקר זה בחר בעיקר בספרות העומדת בדרישות הבאות: ראשית, נושא המחקר חייב לכלול במפורש את טונגסי יאופאנג וקוליטיס כיבית, כלומר גם טונגסי יאופאנג וגם קוליטיס כיבית משמשים כנושאי מחקר מרכזיים ולא רק מוזכרים ברקע או בדיונים. שנית, סוג הספרות חייב להיות מוגבל אך ורק למאמרים או ביקורות פורמליות כדי להבטיח שלמות של מידע ביבליוגרפי ונתוני ציטוטים. שלישית, שפת הספרות חייבת להיות מוגבלת לאנגלית כדי לשפר את עקביות מקורות הנתונים ולעמוד בדרישות היסוד של ניתוח ביבליומטרי בינלאומי. רביעית, רשומות הספרות צריכות להכיל מידע מטא-דאטה יחסית שלם, כולל כותרת, מחבר, כתב עת מקור, תקציר, מילות מפתח ופרטי ציטוטים, מה שיאפשר ניתוח רשת שיתופי, ניתוח הופעות משותפת של מילות מפתח וניתוח ציטוט משותף.
קריטריוני החרגה כוללים בעיקר את הקטגוריות הבאות: ראשית, רשומות ספרות כפולות; שנית, מחקרים שאינם קשורים ישירות לנושאים של Tongxie Yaofang (נוסחת הקלה בכאב) או קוליטיס כיבית, כמו אלו שדנים אך ורק בנוסחאות רפואה סינית מסורתית אחרות או מתמקדים במחלות מעי דלקתיות כלליות ללא התייחסות מפורשת לטונגסי יאופאנג; שלישית, תקצירי כנסים, מאמרי מערכת, מכתבי קוראים, תיקונים, ביקורות ספרים ומסמכים אקדמיים לא פורמליים אחרים חסרי מבני מחקר מלאים; רביעית, רשומות עם מידע ביבליוגרפי לא מלא או תקצירים תקפים ופרטים בסיסיים של ציטוטים לא זמינים; חמישית, ספרות שבה טונגשי יאופאנג אינה נושא המחקר הראשי למרות התאמות במונחי החיפוש, או שקוליטיס כיבית אינה מוקד המחלה המרכזי. באמצעות קריטריונים אלו, המחקר שואף למזער הפרעות מספרות שאינה ממוקדת ומחומרים בעלי תוכן מידע נמוך על תוצאות המחקר.
תהליך סינון הספרות בוצע בגישה היררכית פרוגרסיבית. ראשית, כל הרשומות המקוריות שיובאו ממאגרי מידע הועברו לתוכנות ניהול ספרות וגיליונות אלקטרוניים, שם אומת שמות, מחבר, שנה ומידע על כתב העת, ורשומות כפולות הוסרו. בהמשך, החל שלב הסינון הראשוני לכותרות ותקצירים, כאשר כותרת כל רשומה ותקצירו נבדקו באופן עצמאי מול קריטריוני הכללה/החרגה מוגדרים מראש, כדי להוציא באופן ראשוני מסמכים שלא עמדו בדרישות הנושאיות. לאחר מכן, המסמכים שנשמרו עברו בדיקה מחודשת של טקסט מלא כדי לבדוק האם נושאי המחקר, התוכן והנושאים המרכזיים שלהם באמת מתמקדים ב"נוסחת הקלה על כאב לטיפול בקוליטיס כיבית", תוך אימות עמידה בסיווג סוגי הספרות ובדרישות שלמות המטא-דאטה.
הגדרות תפעוליות יושמו לפני הקידוד. מחקרי ראיות קליניים הוגדרו כרשומות שמטרתן העיקרית הייתה להעריך יעילות ברמת המטופל, בטיחות, הישנות המחלה, שינוי בתסמינים, פעילות מחלה, איכות חיים, תוצאות תסמונת הרפואה הסינית הסינית הסינית (TCM), סמנים דלקתיים, תוצאות אנדוסקופיות, תוצאות היסטולוגיות או נקודות קצה קליניות אחרות. מחקרים מכניים הוגדרו כרשומות שמטרתן העיקרית הייתה להסביר את פעולת TXYF באמצעות פרמקולוגיה רשתית, עגינה מולקולרית, דינמיקה מולקולרית, חיזוי מטרות, מודלים בעלי חיים, אימות תאי, ניתוח מיקרוביוטה, מולטי-אומיקס, איתות דלקתי, ויסות חיסוני, תיקון מחסום אפיתלי, לחץ חמצוני, אפופטוזיס, מיטופגיה או מסלולים קשורים. מחקרים תרגומיים או גשר הוגדרו כרשומות שמקשרות בין הערכה קלינית למדידה מכנית, סינתזת ראיות, מיפוי סמנים ביולוגיים או אימות ניסויי באופן שיכול להנחות את עיצוב הניסויים הקליניים.
חילוץ נתונים וסיווג נושאי
לאחר השלמת סינון ספרות ובחירת 133 פרסומים יעדיים, המחקר ביצע חילוץ וארגון מובנה של מידע ביבליוגרפי רלוונטי כדי להקים בסיס נתונים לניתוח גרף ידע עתידי. חילוץ הנתונים כלל בעיקר שלושה רכיבים: מידע ספרותי בסיסי, פרטי ציטוטים, ונתוני מאפיינים נושאיים. מידע ספרותי בסיסי כלל כותרת, מחבר, שנת פרסום, כתב עת מקור, מדינה/אזור, מוסד, סוג מסמך ותקציר. נתוני הציטוט כללו תדירות ציטוטים, הפניות, מילות מפתח ומילות מפתח של המחבר. מידע על מאפיינים נושאיים שימש לסטרטיפיקציה של תוכן מחקר וניתוח השוואתי, וכולל נושאי מחקר, מתודולוגיות, מודלים וכיוונים תמטיים מרכזיים.
מאפיינים נושאיים הופקו בנוסף לשדות ביבליומטריים סטנדרטיים. לכל רשומה, המחברים קידדו את סוג המחקר הדומיננטי, המודל או השיטה העיקריים, המוקד הקליני או המכניסטי המרכזי, והאם המחקר קישר ישירות ממצאים ברמת מנגנון לנקודות קצה קליניות. רשומות עמומות סווגו לפי המטרה העיקרית שצוינה בכותרת, תקציר ושיטות, ולא לפי הצהרות דיון ספקולטיביות קצרות.
קידוד נקודות קצה קליני שוכלל לתוצאות המדווחות על ידי מטופלים (PROs) ולנקודות קצה אובייקטיביות. ה-PROs כללו שלשולים, כאבי בטן, תדירות צואה, שיפור כללי בתסמינים, איכות חיים וציוני תסמונת הרפואה הסינית הסינית (TCM). נקודות הקצה האובייקטיביות כללו אינדקסי פעילות מחלה, סמנים דלקתיים, מדדים אנדוסקופיים או ריריריים, היסטולוגיה, חזרות, אירועי בטיחות, פרופילי מיקרוביוטה, אינדיקטורים של מחסום אפיתלי, ציטוקינים, פנוטיפים של תאי חיסון וסמנים ביולוגיים של מסלולים.
מחקרים המשלבים חיזוי פרמקולוגיה רשתית עם אימות בעלי חיים, תאים, מיקרוביום או מולקולרי קודדו כמחקרים מכניים אם המטרה העיקרית היא הבהרת מנגנונים. מחקרים התמקדו בתצפית על היעילות אך הזכרו מנגנונים אפשריים רק בדיון הוגדרו כמחקרי ראיות קליניות. פרוטוקולים או רשומות סינתזת ראיות שניסו במפורש לשלב הערכת השפעה קלינית עם חקר מנגנונים קודדו כמחקרי תרגום/גשר.
ניתוח ביבליומטרי והדמיה
ניתוח ביבליומטרי בוצע באמצעות תוכנת גיליונות אלקטרוניים, VOSviewer ו-CiteSpace; טבלת החומרים מדווחת על שדות הגרסה/מזהה ומסמנת פריטים הדורשים אישור מחבר מתוך יומני הניתוח המקוריים. תוכנת גיליונות אלקטרוניים שימשה לבדיקות כפולות, סטטיסטיקות תיאוריות, ספירות פרסומים שנתיות, סיווג סוגי מחקר והכנת טבלאות מקור. VOSviewer שימש לבניית רשתות משותפות לכתיבה, מוסדיות, מדינות/אזור, כתבי עת ומילות מפתח. CiteSpace שימש לניתוח ציטוטים משותפים, זיהוי אשכולות, פירוש ציר זמן וזיהוי מילות מפתח בפיצוץ.
ניתוח קו-ציטוט שימש לזיהוי מודולי בסיס ידע שצוטטו שוב ושוב במחקרי TXYF-UC. אשכולות פורשו ידנית על ידי קריאת כותרות מייצגות, תקצירים והקשרים מצוטטים, תוך התמקדות במנגנוני דלקת של UC, ראיות להתערבות תרכובות TCM (התערבות TCM), מחקרי מיקרוביום במעי ומחסום רירי, ושיטות פרמקולוגיה חישובית.
עיבוד מקדים של מילות מפתח כלל איחוד מילים נרדפות, סטנדרטיזציה של איות, נרמול מקרים, הסרת מונחים לא אינפורמטיביים והרמוניזציה של מושגים ביולוגיים שווים. לאחר מכן נעשה שימוש בניתוחי הופעה משותפת ומילות מפתח לזיהוי מוקדי מחקר מרכזיים וחזיתות מתפתחות, כולל איתות דלקתי, ראיות קליניות ל-TCM, אינטראקציות בין מיקרוביוטה למטבוליזם, פרמקולוגיה חישובית וויסות חסינות של מחסום.
מיפוי קליני לעומת מכני שילב את הסיווג התמטי עם אשכולות מילות מפתח ותחומי קצה מקודדים. ההשוואה בחנה שישה תחומים: שליטה בתסמינים, תגובה דלקתית, תיקון מחסום מעיים, מיקרוביום במעיים, ויסות מערכת החיסון והתקדמות המחלה.