זרימת המשתתפים והשחזוריות של הבדיקה
סך כולל של 326 אנשים נבדקו, ו-49 ה excluded: 12 קיבלו טיפול נגד גידולים לפני דגימת דם, ל-8 הייתה ממאירות ראשונית אחרת, 9 סבלו מזיהום חמור, מחלה אוטואימונית או תחלואה נלווית לא מאוזנת שסביר כי תשפיע על סמני גידול בסרום, 11 סבלו מהמוליזה, ליפמיה, הפרעה עקב צהובון, נפח סרום לא מספיק או מרווח עיבוד ממושך, ו-9 היו חסרים נתונים קליניים, פתולוגיים או נתוני מעקב מרכזיים. האוכלוסייה האנליטית הסופית כללה 277 משתתפים: 167 חולים עם קרצינומה של תאי קשקש בוושט (ESCC), 55 חולים עם מחלה שפירה של הוושט ו-55 ביש Controls בריאים. מרכז A תרם 194 משתתפים לקבוצת האימון, ומרכז B תרם 83 משתתפים לקבוצת התיקוף החיצוני. זרימת המשתתפים, הקצאת הקבוצות, סבב בדיקות הביומארקרים, פיתוח המודל האבחנתי, התיקוף החיצוני ומסגרת המודל הפרוגנוסטי מוצגים ב-איור 1, ופרטי הסינון וההחרגה מסוכמים ב-טבלה משלימה 1.
השחזוריות בין-בדיקתית ובין-מרכזית הוערכה באמצעות 30 מנות סרום מקשרות (bridging serum aliquots) בסמיות. מקדמי השונות בין-מרכזיים היו 4.8% עבור carcinoembryonic antigen (CEA), 5.6% עבור squamous cell carcinoma antigen (SCC-Ag), ו-5.1% עבור carbohydrate antigen 125 (CA125). מקדמי המתאם תוך-מעמדיים התואמים היו 0.94, 0.92 ו-0.93, בהתאמה. לא נדרש כיול מחדש ספציפי למרכז לפני הסטנדרטיזציה הסטטיסטית ופיתוח המודל. תוצאות שחזוריות הבדיקה מופיעות ב-Supplementary Table 2.
מאפייני בסיס של אוכלוסיית המחקר
הגיל החציוני של כלל האוכלוסייה היה 59 שנים (IQR, 53–66 שנים), ו-198 משתתפים (71.5%) היו גברים. עישון נוכחי או בעבר דווח על ידי 141 משתתפים (50.9%), ושימוש נוכחי או בעבר באלכוהול דווח על ידי 127 משתתפים (45.8%). הקוהורטה כללה 167 חולי ESCC (60.3%), 55 חולים עם מחלה וסתית שפירה (19.9%), ו-55 ביקורות בריאות (19.9%). רמות הסרום החציוניות של CEA, SCC-Ag ו-CA125 היו 3.9 ng/mL (IQR, 2.0–6.6 ng/mL), 1.4 ng/mL (IQR, 0.8–2.3 ng/mL), ו-22.8 U/mL (IQR, 13.9–35.7 U/mL), בהתאמה. גיל, מין, היסטוריית עישון, שימוש באלכוהול, קבוצת אבחנה ורמות ביומרקרים סרומיים בבסיס היו דומים בין קוהורטת האימון לקוהורטת התיקוף החיצונית (טבלה 1).
מבין 167 חולי ה-ESCC, הגיל החציוני היה 61 שנים (IQR, 55–68 שנים), ו-133 חולים (79.6%) היו גברים. הגידולים מוקעו לרוב בווריד הוושט החזיתי האמצעי (89/167, 53.3%), ואחריו בוושט החזיתי התחתון (56/167, 33.5%) ובוושט החזיתי העליון (22/167, 13.2%). גידולים בעליה Differientiation בינונית ונמוכה היוו 81 מקרים (48.5%) ו-66 מקרים (39.5%), בהתאמה. אורך הגידול היה לפחות 5 cm ב-68 חולים (40.7%), מחלה בשלב pT3–4 הייתה קיימת ב-121 חולים (72.5%), גרורות בבלוטות לימפה היו קיימות ב-100 חולים (59.9%), ומחלה בשלב TNM III–IV נצפתה ב-111 חולים (66.5%). פלישה לימפו-וסקולרית זוהתה ב-65 חולים (38.9%). הטיפול הראשוני כלל ניתוח רדיקלי עם או ללא טיפול עזר (adjuvant therapy) ב-113 חולים (67.7%), כימורדיותרפיה דפיניטיבית ב-32 חולים (19.2%), וטיפול סיסטמי פליאטיבי או טיפול תומך ב-22 חולים (13.2%). המשתנים הקליניקו-פתולוגיים העיקריים היו ברי-השוואה בין קבוצת האימון לקבוצת התיקוף החיצונית של חולי ה-ESCC (Table 2).
התפלגות רב-ממדית של ביומארקרים בסרום בין קבוצות המחקר
ההפצות של CEA, SCC-Ag ו-CA125 בסרום היו שונות בין חולים עם ESCC, ביקורות עם מחלות מאכלת שפירות ובקרות בריאות (איור 2). לאחר טרנספורמציה לוגריתמית, שלושת הסמנים הביולוגיים הראו רמות גבוהות יותר בקבוצת ה-ESCC מאשר בשתי הקבוצות הלא-ממאירות. רמת ה-CEA החציונית הייתה 5.2 ng/mL בחולי ESCC, בהשוואה ל-2.4 ng/mL בביקורות עם מחלות מאכלת שפירות ו-1.9 ng/mL בבקרות בריאות. רמת ה-SCC-Ag החציונית הייתה 1.9 ng/mL בחולי ESCC, בהשוואה ל-0.9 ng/mL ו-0.7 ng/mL בקבוצות האחרות. רמת ה-CA125 החציונית הייתה 28.9 U/mL בחולי ESCC, בהשוואה ל-18.7 U/mL ו-16.1 U/mL בקבוצות האחרות. הפצות הסמנים הביולוגיים בסרום עבור כל קבוצה מסוכמות ב-טבלה משלימה 3.
CEA ו-SCC-Ag הראו הפרדה ברורה יותר בין ESCC לבין בישורי בקרה לא-ממאירים מאשר CA125. בהתפלגות דו-ממדית של CEA ו-SCC-Ag שעברו טרנספורמציה לוגריתמית, דגימות ESCC ריכזו תדירות גבוהה יותר באזור הערכים הגבוהים, בעוד שבישורי בקרה בריאים התקבצו תדירות גבוהה יותר באזור הערכים הנמוכים. עומס סממנים ביולוגיים משולב גבוה, שהוגדר כעלייה של לפחות שניים משלושת הסממנים, נצפה ב-61 מתוך 167 חולי ESCC (36.5%), ב-8 מתוך 55 בישורי בקרה עם מחלה וסתיגית שפירה (14.5%), וב-4 מתוך 55 בישורי בקרה בריאים (7.3%). התפלגות עומס הסממנים הביולוגיים המוגברים הייתה שונה באופן מובהק בין שלוש הקבוצות (P < 0.001), כפי שדווח גם ב- טבלה נלווית 3.
פיתוח החתימה האבחנתית המשולבת בקבוצת האימון
החתימה האבחנתית המשולבת פותחה בקבוצת האימון באמצעות ערכי CEA, SCC-Ag ו-CA125 שעברו טרנספורמציית לוגריתם (איור 3). ניתוח מתאם זוגי הראה מתאמים חיוביים בינוניים בין שלושת הסמנים. המתאם החזק ביותר נצפה בין CEA ל-SCC-Ag (r = 0.58), ואחריו בין SCC-Ag ל-CA125 (r = 0.47) ובין CEA ל-CA125 (r = 0.41), דבר התומך במידול משותף מבלי להתייחס לסמנים כמדידות שניתן להחליף זו בזו.
בניתוח רגרסיה לוגיסטית חד-משתנית, נמצא כי CEA, SCC-Ag ו-CA125 קשורים כל אחד למצב של ESCC, עם יחסי סיכויים (odds ratios) של 2.81, 3.94 ו-2.14, בהתאמה. במודל האבחנתי הרב-משתני, SCC-Ag הראה את גודל האפקט המותאם הגדול ביותר (OR, 2.87; 95% CI, 1.62–5.09; P < 0.001), ואחריו CEA (OR, 1.80; 95% CI, 1.19–2.72; P = 0.006) ו-CA125 (OR, 1.52; 95% CI, 1.03–2.25; P = 0.034). מקדמי המודל האבחנתי מסוכמים ב-Supplementary Table 4. המנבא הליניארי האבחנתי הסופי היה:
LPdiagnostic = -0.46 + 0.59 × zlnCEA + 1.05 × zlnSCC - Ag +0.42 × zlnCA125
ההסתברות החזויה האישית ל-ESCC חושבה באופן הבא:
PESCC = 1/1 + exp( -LPdiagnostic )
התפלגות ההסתברות החזויה מהמודל האבחנתי המשולב הראתה הפרדה בין משתתפים עם ESCC לבין משתתפים ללא ESCC. נקודת החיתוך האופטימלית הייתה 0.57. בנקודת חיתוך זו, המודל המשולב השיג שטח תחת עקומת מאפייני תפעול המקבל (AUC) של 0.869 (95% CI, 0.817–0.921), עם ערך ניבוי חיובי של 85.8% וערך ניבוי שלילי של 73.0% בקוהורט האימון.
ביצועים אבחנתיים ותיקוף חיצוני של פאנל הסמנים הביולוגיים המשולב
בקוהורט האימון, SCC-Ag הראה את הביצועים האבחנתיים הגבוהים ביותר מבין שלושת הביומרקרים הבודדים, עם AUC של 0.802 (95% CI, 0.735–0.869). ערכי ה-AUC עבור CEA ו-CA125 היו 0.711 (95% CI, 0.635–0.786) ו-0.668 (95% CI, 0.591–0.744), בהתאמה. הפאנל המשולב השיג את ההבחנה הכוללת הגבוהה ביותר, עם AUC של 0.869 (95% CI, 0.817–0.921), רגישות של 79.8%, סגוליות של 81.2%, ערך ניבוי חיובי של 85.8%, ערך ניבוי שלילי של 73.0%, דיוק של 80.4%, ומדד F1 של 82.7% (טבלה 3).
עקומות מאפייני מקלט (receiver operating characteristic curves) אישרו הבחנה אבחנתית גבוהה יותר של הפאנל המשולב בהשוואה לסמנים ביולוגיים בודדים (איור 4A). בנקודת החיתוך האופטימלית של 0.57, הפאנל המשולב הראה רגישות של 79.8% וסגוליות של 81.2%. ה-AUC של הפאנל המשולב היה גבוה משמעותית מזה של SCC-Ag לבד (P = 0.032). תיקוף פנימי בשיטת Bootstrap עם 1,000 דגימות חוזרות הראה AUC מתוקן לאופטימיזם של 0.856, שיפוע כיול מתוקן לאופטימיזם של 0.97, וציון Brier מתוקן לאופטימיזם של 0.154. הערכות תיקוף פנימי מופיעות בטבלה משלימה 4.
בקוהורט התיקוף החיצוני, ניתוח precision-recall הראה את הדיוק הממוצע הגבוה ביותר להבחנה בין ESCC לביקרים בריאים (AP = 0.912; איור 4B). הדיוק הממוצע היה 0.863 עבור ESCC לעומת non-ESCC ו-0.841 עבור ESCC לעומת מחלה שפירה של הוושט. הדיוק הממוצע עבור ESCC בשלב מוקדם לעומת ביקרים שאינם זדוניים היה 0.535. ניתוח כיול הראה התאמה בין ההסתברויות החזויות לתוצאות הנצפיות בשתי הקוהורטים (איור 4C). מדד Brier score היה 0.148, עם שיפוע כיול של 1.02 ונקודת חיתוך של 0.01 בקוהורט האימון. בקוהורט התיקוף החיצוני, מדד Brier score היה 0.164 עם שיפוע כיול של 0.93 ונקודת חיתוך כיול של −0.04. ניתוח עקומי החלטה הראה תועלת נטו גבוהה יותר עבור הפאנל המשולב מאשר עבור אסטרטגיות ה-treat-all וה-treat-none ברוב ספי הstrosts של ההסתברות (איור 4D).
תוצאות התיקוף החיצוני מסוכמות ב- טבלה 4הפאנל המשולב השיג AUC של 0.842 (רווח ברתק של 95%, 0.753–0.930) להבחנה בין ESCC לבין non-ESCC, עם רגישות של 75.5%, סגוליות של 76.7%, דיוק של 75.9%, ציון Brier של 0.164, שיפוע כיול של 0.93, ותועלת נטו של 0.218 בסף הסתברות של 0.30. ערכי ה-AUC היו 0.801 (רווח ברתק של 95%, 0.686–0.916) עבור ESCC לעומת מחלה וסתגית שפירה, 0.889 (רווח ברתק של 95%, 0.800–0.979) עבור ESCC לעומת ביקורות בריאות, ו-0.818 (רווח ברתק של 95%, 0.704–0.932) עבור ESCC בשלב מוקדם לעומת ביקורות לא-ממאירות. הסגוליות הגבוהה ביותר נצפתה עבור ESCC לעומת ביקורות בריאות (86.7%), בעוד ש-ESCC בשלב מוקדם לעומת ביקורות לא-ממאירות הראה רגישות של 70.6% וסגוליות של 78.3%.
פרופיל קשר קליני-פתולוגי של פאנל הביומארקרים המשולב ב-ESCC
הקשר בין עלייה בסמנים ביולוגיים בנסיוב לבין מאפיינים קליניו-פתולוגיים הוערך בחולי ESCC (טבלה 5). גיל ומגדר הראו קשר מוגבל לעלייה בסמנים ביולוגיים בודדים. בקרב חולים בני 65 ומעלה נמצא שיעור גבוה יותר של עומס משולב גבוה של סמנים ביולוגיים בהשוואה לחולים מתחת לגיל 65 (47.6% לעומת 29.8%; P = 0.028), בעוד שמגדר לא נמצא קשור לעלייה בסמנים ביולוגיים בודדים או לעומס משולב של סמנים ביולוגיים.
משתנים הקשורים לגידול הראו קשרים חזקים יותר עם עלייה בביו-מרקרים. עומס ביו-מרקרים משולב גבוה נמצא ב-50.0% מהחולים עם אורך גידול של לפחות 5 cm, בהשוואה ל-27.3% מהחולים עם אורך גידול של פחות מ-5 cm (P = 0.004). עומס ביו-מרקרים משולב גבוה היה שכיח יותר גם בחולים עם דיפרנציאציה נמוכה מאשר באלו עם דיפרנציאציה טובה או בינונית (50.0% לעומת 28.2%; P = 0.006), בחולים עם מחלה בדרגת pT3–4 מאשר באלו עם מחלה בדרגת pT1–2 (42.1% לעומת 21.7%; P = 0.011), בחולים עם גרורות בבלוטות הלימפה מאשר באלו ללא גרורות בבלוטות הלימפה (43.0% לעומת 26.9%; P = 0.038), ובחולים עם מחלה בשלב TNM III–IV מאשר באלו עם מחלה בשלב TNM I–II (43.2% לעומת 23.2%; P = 0.009).
ויזואליזציה ברמת המטופל הראתה כי ציוני סיכון משולבים גבוהים יותר לוו במאפיינים קליניקו-פתולוגיים מתקדמים יותר (איור 5A). מטופלים עם ציונים גבוהים יותר סווגו בתדירות גבוהה יותר כ-pT3–4, חיוביים לקשרי לימפה, בעלי דיפרנציאציה נמוכה, או בשלב TNM III–IV. ניתוח באמצעות תרשים קופסה (Boxplot) הראה התפלגויות עולות של הביומרקרים במטופלים עם אורך גידול גדול יותר, דיפרנציאציה נמוכה, מחלה בשלב pT3–4, חיוביות לקשרי לימפה, ומחלה בשלב TNM III–IV (איור 5B). תרשים סנקי (Sankey plot) הראה כי מטופלים עם שניים או שלושה ביומרקרים מוגברים סווגו לעיתים קרובות יותר כשלב TNM III–IV, בעוד שמטופלים ללא ביומרקרים מוגברים סווגו לעיתים קרובות יותר כשלב TNM I–II (איור 5C). הקשר בין נטל הביומרקרים המשולב לבין התפלגות שלבי ה-TNM היה מובהק סטטיסטית (P < 0.001).
סיווג פרוגנוסטי המבוסס על פאנל משולב של סמנים ביולוגיים בסרום
חציון זמן המעקב עבור חולי ESCC היה 34 חודשים. במהלך המעקב, תועדו 78 מקרי מוות ו-96 אירועים של הישרדות ללא התקדמות המחלה. פרטי המעקב והאירועים מסוכמים ב-Supplementary Table 5. עומס גבוה של ביומארקרים משולבים היה קשור לתוצאות הישרדות גרועות יותר. ברגרסיית Cox חד-משתנית, עומס גבוה של ביומארקרים משולבים היה קשור לסיכון מוגבר למוות (HR, 2.91; 95% CI, 1.89–4.46; P < 0.001) ולהתקדמות המחלה או מוות (HR, 2.63; 95% CI, 1.80–3.84; P < 0.001). לאחר התאמה לגיל, אורך הגידול, дифרנציאציה, שלב pT, גרורות בבלוטות לימפה ואופן הטיפול, עומס גבוה של ביומארקרים משולבים נותר קשור באופן בלתי תלוי להישרדות כוללת (OS; HR, 2.24; 95% CI, 1.41–3.54; P = 0.001) ולהישרדות ללא התקדמות המחלה (PFS; HR, 2.03; 95% CI, 1.35–3.05; P = 0.001). לעומת זאת, רמות גבוהות של CEA, SCC-Ag ו-CA125 לא היו עוד בעלות מובהקות סטטיסטית כאשר נכללו באופן אינדיבידואלי במודלים הרב-משתניים. תוצאות רגרסיית Cox מסוכמות ב-Table 6.
ניתוח קפלן-מייר (Kaplan–Meier) הראה הפרדה ברורה בין הקבוצות עם עומס ביומרקרים משולב גבוה ונמוך (איור 6A,B). חציון זמן ההישרדות הכוללת (OS) היה 38 חודשים בקבוצה עם העומס הנמוך ו-19 חודשים בקבוצה עם העומס הגבוה (log-rank P < 0.001). חציון זמן ההישרדות ללא התקדמות המחלה (PFS) היה 28 חודשים בקבוצה עם העומס הנמוך ו-13 חודשים בקבוצה עם העומס הגבוה (log-rank P < 0.001). המודל הפרוגנוסטי המשולב הראה יכולת הבחנה תלוית-זמן גבוהה יותר מאשר שלב TNM לבדו (איור 6C), עם ערכי AUC של 0.829, 0.806 ו-0.781 לאחר שנה אחת, 3 שנים ו-5 שנים, בהתאמה, בהשוואה ל-0.701, 0.676 ו-0.648 עבור שלב TNM לבדו. השיפור במדד C (C-index) לעומת שלב TNM לבדו היה 0.130 בקוהורט האימון ו-0.120 בקוהורט האימות החיצוני. מפת החום של נקודות זמן המעקב הראתה עלייה בתמותה המצטברת על פני רמות הסיכון (איור 6D). בשליש התחתון של הסיכון (low-risk tertile), ההסתברויות לתמותה מצטברת היו 6%, 12%, 24%, 37% ו-52% בחודשים 6, 12, 24, 36 ו-60, בהתאמה. ההסתברויות התואמות היו 14%, 26%, 44%, 59% ו-74% בשליש בעל הסיכון הבינוני, ו-28%, 47%, 68%, 82% ו-91% בשליש בעל הסיכון הגבוה.
תיקוף חיצוני ותועלת פרוגנוסטית מצטברת של המודל המשולב
המודל המשולב הראה את ההבחנה הפרוגנוסטית הגבוהה ביותר מבין המודלים שנבחנו בשתי когоריות המחקר. בקוהורט האימון, ה-C-index עבור המודל המשולב היה 0.792, בהשוואה ל-0.736 עבור המודל הקליניקופתולוגי, 0.703 עבור פאנל הביומרקרים לבדו, ו-0.662 עבור שלב TNM לבדו. בקוהורט האישוש החיצוני, ה-C-index עבור המודל המשולב היה 0.761, בהשוואה ל-0.708, 0.681 ו-0.641 עבור שאר המודלים. גם ערכי AUC התלויים בזמן העדיפו את המודל המשולב. בקוהורט האימון, המודל המשולב השיג ערכי AUC של 0.829, 0.806 ו-0.781 ב-1, 3 ו-5 שנים, בהתאמה. בקוהורט האישוש החיצוני, ערכי ה-AUC התואמים היו 0.801, 0.774 ו-0.748. בהשוואה לשלב TNM לבדו, המודל המשולב הראה NRI של +0.274 ו-IDI של +0.102. אישוש פנימי בשיטת Bootstrap הראה C-index מתוקנן לאופטימיות של 0.779 עבור המודל המשולב. מדדי ביצועי המודל מוצגים ב-Table 7, ותוצאות אישוש פרוגנוסטיות נוספות מופיעות ב-Supplementary Table 5.
תרשים השוואת המודלים הראה את מדד Harrell’s C-index הגבוה ביותר עבור המודל המשולב בשתי העוקבות (איור 7A). הנומוגרמה שילבה גיל, אורך הגידול, דיפרנציאציה היסטולוגית, שלב pT, סטטוס קשרי לימפה, שיטת הטיפול הראשונית ועומס גבוה של ביומרקרים משולבים להערכת הסתברויות OS ל-1, 3 ו-5 שנים (איור 7B). בעוקבת התיקוף החיצונית, עקומות הכיול עבור OS ל-1, 3 ו-5 שנים היו קרובות לקו הייחוס האידיאלי (איור 7C). מדדי Brier היו 0.141, 0.164 ו-0.178 בהתאמה, עם שיפורי כיול של 0.97, 0.93 ו-0.91. ניתוח עקומות החלטה הראה כי למודל המשולב היה תועלת נטו גבוהה יותר מאשר לשלב TNM לבדו, למודל הקליני-פתולוגי ולשיטות הטיפול-בכל או אי-טיפול-בכלל לאורך טווח הסתברות הסף העיקרי (איור 7D). בהסתברות סף של 0.30, התועלת נטו הייתה 0.181 עבור המודל המשולב, בהשוואה ל-0.139 עבור המודל הקליני-פתולוגי ו-0.117 עבור שלב TNM לבדו. תוצאות כיול ועקומות החלטה אלו מסוכמות ב-טבלה משלימה 5.
זמינות נתונים:
מסדי הנתונים שהופקו ונותחו במהלך המחקר הנוכחי זמינים לציבור במאגר Figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.33154580.v1.

איור 1: מערך המחקר וזרימת העבודה האנליטית. סקירה סכמטית של סריקת משתתפים, הקצאת קוהורט, מדידת סממנים ביולוגיים בסרום, פיתוח מודל אבחנתי, תיקוף חיצוני ובניית מודל פרוגנוסטי. מרכז A שימש כקוהורט האימון, ומרכז B שימש כקוהורט התיקוף החיצוני. אנא לחצו כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: התפלגות של CEA, SCC-Ag ו-CA125 בנסיב על פני קבוצות המחקר. (A) תרשימי כינור ותרשימי קופסה המראים רמות של סמני סרטן בנסיב לאחר טרנספורמציה לוגריתמית בחולי ESCC, בביקורות של מחלה וסתית שפירה ובביקורות בריאות. (B) התפלגות דו-משתנית של CEA ו-SCC-Ag לאחר טרנספורמציה לוגריתמית. (C) תרשים רדאר המסכם את פרופיל סמני הסרטן המשולב על פני הקבוצות האבחנתיות. (D) התפלגות של נטל סמני סרטן מוגברים על פני הקבוצות האבחנתיות. CEA = carcinoembryonic antigen; SCC-Ag = squamous cell carcinoma antigen; CA125 = carbohydrate antigen 125; ESCC = esophageal squamous cell carcinoma. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: פיתוח החתימה האבחנתית המשולבת בקוהורט האימון. (A) מפת חום של מתאמים עבור CEA, SCC-Ag ו-CA125 לאחר טרנספורמציית לוגריתמים. (B) תוצאות רגרסיה לוגיסטית חד-משתנית ורב-משתנית עבור סמנים ביולוגיים בודדים והמודל האבחנתי המשולב. (C) התפלגות הסבירות החזויה עבור משתתפים עם ESCC וללא ESCC בהתבסס על המודל האבחנתי המשולב. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של איור זה.

איור 4: ביצועים אבחנאיים ותיקוף חיצוני של פאנל הביו-מרקרים המשולב. (A) עקומות מאפיין תפעול קולטן (Receiver operating characteristic) המשוות בין ביו-מרקרים בודדים לבין הפאנל המשולב בקבוצת האימון. (B) עקומות דיוק-Recall בתרחישי תיקוף חיצוניים. (C) גרפי כיול עבור קבוצת האימון וקבוצות התיקוף החיצוניות. (D) ניתוח עקומת החלטה המראה תועלת נטו על פני הסתברויות סף. ROC = receiver operating characteristic. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: פרופיל קשר קליני-פתולוגי של פאנל הסמנים הביולוגיים המשולב ב-ESCC. (A) תמונת מצב ברמת המטופל של ציוני סיכון משולבים, רמות סמנים ביולוגיים בנסיוב ומאפיינים קליניים-פתולוגיים. (B) תרשימי קופסה המראים את התפלגות הסמנים הביולוגיים בין תתי-קבוצות קליניות-פתולוגיות עיקריות. (C) תרשים Sankey המראה את הקשר בין עומס מוגבר של סמנים ביולוגיים לבין שלב TNM. TNM = tumor-node-metastasis. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: סטרטיפיקציה פרוגנוסטית המבוססת על עומס סמנים ביולוגיים משולב. (A) עקומות קפלן–מייר להישרדות כוללת בהתאם לעומס סמנים ביולוגיים משולב. (B) עקומות קפלן–מייר להישרדות ללא התקדמות המחלה בהתאם לעומס סמנים ביולוגיים משולב. (C) עקומות מאפיין תפעול נקלטה (ROC) תלויות-זמן המשוואות את המודל המשולב מול שלב TNM לבדו. (D) מפת חום המראה הסתברויות תמותה מצטברות על פני טריטילים של סיכון ונקודות זמן למעקב. OS = הישרדות כוללת; PFS = הישרדות ללא התקדמות המחלה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: תיקוף חיצוני ותרגום קליני של המודל הפרוגנוסטי המשולב. (A) השוואה של מדד C של Harrell בין מודלים פרוגנוסטיים בקבוצות האימון והתיקוף החיצוני. (B) נומוגרמה המשלבת גיל, אורך הגידול, דיפרנציאציה היסטולוגית, שלב pT, סטטוס קשרי לימפה, שיטת טיפול ראשונית ועומס גבוה של ביומרקרים משולבים להערכת הישרדות כוללת ל-1, 3 ו-5 שנים. (C) גרפי כיול של תיקוף חיצוני להישרדות כוללת ל-1, 3 ו-5 שנים. (D) ניתוח עקומת החלטה המשווה את המודל המשולב לשלב TNM לבדו, למודל הקליני-פתולוגי, ולאסטרטגיות של "טיפול בכל" או "אי-טיפול בכלל". אנא לחצו כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
| משתנה | בסך הכל (n = 277) | קבוצת אימון, מרכז A (n = 194) | קוהורט תיקוף חיצוני, מרכז B (n = 83) | ערך P |
| גיל, שנים, חציונה (IQR) | 59 (53–66) | 59 (52–65) | 60 (54–67) | 0.284 |
| מין זכר, n (%) | 198 (71.5) | 137 (70.6) | 61 (73.5) | 0.622 |
| מעשנים בהווה/בעבר, n (%) | 141 (50.9) | 95 (49.0) | 46 (55.4) | 0.321 |
| שימוש נוכחי/בעבר באלכוהול, n (%) | 127 (45.8) | 87 (44.8) | 40 (48.2) | 0.603 |
| קבוצת אבחנה, n (%) | | | | 0.701 |
| סרטן קשמיות הוושט (ESCC) | 167 (60.3) | 114 (58.8) | 53 (63.9) | |
| מחלה שפירה של וסת הוושט | 55 (19.9) | 40 (20.6) | 15 (18.1) | |
| ביקורת בריאה | 55 (19.9) | 40 (20.6) | 15 (18.1) | |
| CEA בנסיוב, ng/mL, חציון (IQR) | 3.9 (2.0–6.6) | 3.8 (1.9–6.4) | 4.1 (2.1–6.8) | 0.367 |
| SCC-Ag בסרום, ng/mL, חציון (IQR) | 1.4 (0.8–2.3) | 1.4 (0.8–2.2) | 1.5 (0.9–2.4) | 0.418 |
| CA125 בנסיוב, U/mL, חציון (IQR) | 22.8 (13.9–35.7) | 22.4 (13.5–34.9) | 23.6 (14.6–36.8) | 0.447 |
טבלה 1: מאפייני בסיס של המשתתפים בקוהורט האימון ובקוהורט התיקוף החיצוני. מאפיינים דמוגרפיים, הרכב הקוהורט ורמות בסיס של CEA, SCC-Ag ו-CA125 בסרום מסוכמים עבור כלל האוכלוסייה, קוהורט האימון וקוהורט התיקוף החיצוני.
| משתנה | סך כלל ה-ESCC (n = 167) | קוהורט אימון (n = 114) | קוהורט אישוש חיצוני (n = 53) | ערך P |
| גיל, שנים, חציון (IQR) | 61 (55–68) | 61 (55–67) | 62 (56–68) | 0.386 |
| מין זכר, n (%) | 133 (79.6) | 91 (79.8) | 42 (79.2) | 0.931 |
| מעשן נוכחי/לשעבר, n (%) | 110 (65.9) | 74 (64.9) | 36 (67.9) | 0.701 |
| שימוש נוכחי/שעבר באלכוהול, n (%) | 95 (56.9) | 66 (57.9) | 29 (54.7) | 0.688 |
| מיקום הגידול, n (%) | | | | 0.879 |
| חזה עליון | 22 (13.2) | 15 (13.2) | 7 (13.2) | |
| חזה אמצעי | 89 (53.3) | 60 (52.6) | 29 (54.7) | |
| חזה תחתון | 56 (33.5) | 39 (34.2) | 17 (32.1) | |
| דיפרנציאציה היסטולוגית, מספר (%) | | | | 0.944 |
| מובחן היטב | 20 (12.0) | 14 (12.3) | 6 (11.3) | |
| מובחן באופן בינוני | 81 (48.5) | 56 (49.1) | 25 (47.2) | |
| בעל בידול נמוך | 66 (39.5) | 44 (38.6) | 22 (41.5) | |
| אורך הגידול ≥5 ס"מ, n (%) | 68 (40.7) | 45 (39.5) | 23 (43.4) | 0.621 |
| שלב pT3–4, מספר (%) | 121 (72.5) | 82 (71.9) | 39 (73.6) | 0.821 |
| גרורות בבלוטות הלימפה, n (%) | 100 (59.9) | 68 (59.6) | 32 (60.4) | 0.924 |
| שלב TNM III–IV, מספר (%) | 111 (66.5) | 75 (65.8) | 36 (67.9) | 0.785 |
| פלישה לימפו-וסקולרית, מספר (אחוז) (%) | 65 (38.9) | 42 (36.8) | 23 (43.4) | 0.404 |
| שיטת טיפול ראשונית, n (%) | | | | 0.753 |
| ניתוח רדיקלי ± טיפול עזר | 113 (67.7) | 79 (69.3) | 34 (64.2) | |
| כימו-הקרנות רדיואקטיביות רדיקליות | 32 (19.2) | 21 (18.4) | 11 (20.8) | |
| טיפול סיסטמי/תומך פליאטיבי | 22 (13.2) | 14 (12.3) | 8 (15.1) | |
טבלה 2: מאפיינים קליניקופתולוגיים של חולי ESCC בקבוצות האימון והתיקוף החיצוני. מיקום הגידול, דיפרנציאציה היסטולוגית, אורך הגידול, שלב pT, מצב קשרי הלימפה, שלב TNM, פלישה לימפו-וסקולרית ושיטת הטיפול הראשונית מושווים בין חולי ESCC בקבוצות האימון והתיקוף החיצוני.
| מודל | נקודת חיתוך אופטימלית | AUC (95% CI) | רגישות (%) | סגוליות (%) | PPV (%) | NPV (%) | דיוק (%) | ציון F1 (%) |
| CEA | 4.85 ng/mL | 0.711 (0.635–0.786) | 58.8 | 76.2 | 77.9 | 56.6 | 66.2 | 67.1 |
| SCC-Ag | 1.52 ng/mL | 0.802 (0.735–0.869) | 70.2 | 78.8 | 82.5 | 65.6 | 73.8 | 76.1 |
| CA125 | 31.8 U/mL | 0.668 (0.591–0.744) | 44.7 | 82.5 | 78.5 | 52.4 | 60.3 | 57 |
| פאנל משולב | 0.57 | 0.869 (0.817–0.921) | 79.8 | 81.2 | 85.8 | 73 | 80.4 | 82.7 |
טבלה 3: דיוק אבחוני של סמנים ביולוגיים בודדים ושל פאנל סמנים ביולוגיים משולב בסרום בקוהורט האימון. ביצועי האבחון מדווחים באמצעות נקודת חיתוך אופטימלית, שטח תחת עקומת מאפייני תפעול המקלט (ROC), רגישות, סגוליות, ערך ניבוי חיובי, ערך ניבוי שלילי, דיוק ומדד F1.
| השוואה | AUC (95% CI) | רגישות, % | סגוליות, % | דיוק, % | מדד Brier | שיפוע כיול | תועלת נטו בהסתברות סף 0.30 |
| ESCC מול non-ESCC | 0.842 (0.753–0.930) | 75.5 | 76.7 | 75.9 | 0.164 | 0.93 | 0.218 |
| ESCC מול מחלה וסופגית שפירה | 0.801 (0.686–0.916) | 73.6 | 73.3 | 73.5 | 0.171 | 0.9 | 0.196 |
| ESCC מול ביקורות בריאות | 0.889 (0.800–0.979) | 77.4 | 86.7 | 79.5 | 0.122 | 0.97 | 0.252 |
| ESCC בשלב מוקדם מול ביקורות לא ממאירות | 0.818 (0.704–0.932) | 70.6 | 78.3 | 76.3 | 0.153 | 0.89 | 0.173 |
טבלה 4: תיקוף חיצוני של הביצועים האבחנתיים של פאנל הסממנים הביולוגיים המשולב בנסיוב. ביצועי המודל מסוכמים בארבעה תרחישים אבחנתיים: ESCC לעומת non-ESCC, ESCC לעומת מחלה נשפית שפירה, ESCC לעומת ביקורת בריאה, ו-ESCC בשלב מוקדם לעומת ביקורות שאינן ממאירות.
| מאפיין | קטגוריה | CEA גבוה (n %) | SCC-Ag גבוה (n %) | CA125 גבוה (n %) | נטל משולב גבוה (n %) | P עבור CEA | P עבור SCC-Ag | P עבור CA125 | P עבור נטל משולב |
| גיל | <65 שנים (n = 104) | 40 (38.5) | 54 (51.9) | 29 (27.9) | 31 (29.8) | 0.129 | 0.108 | 0.151 | 0.028 |
| ≥65 שנים (n = 63) | 32 (50.8) | 41 (65.1) | 25 (39.7) | 30 (47.6) | | | | |
| מין | נữ (n=34) | 13 (38.2) | 17 (50.0) | 13 (38.2) | 12 (35.3) | 0.513 | 0.367 | 0.402 | 0.871 |
| זכר (n = 133) | 59 (44.4) | 78 (58.6) | 41 (30.8) | 49 (36.8) | | | | |
| אורך הגידול | <5 cm (n = 99) | 35 (35.4) | 49 (49.5) | 24 (24.2) | 27 (27.3) | 0.015 | 0.021 | 0.009 | 0.004 |
| ≥5 cm (n = 68) | 37 (54.4) | 46 (67.6) | 30 (44.1) | 34 (50.0) | | | | |
| דיפרנציאציה | טובה/מתונה (n = 103) | 38 (36.9) | 52 (50.5) | 27 (26.2) | 29 (28.2) | 0.018 | 0.032 | 0.027 | 0.006 |
| דלה (n=64) | 34 (53.1) | 43 (67.2) | 27 (42.2) | 32 (50.0) | | | | |
| שלב pT | pT1–2 (n = 46) | 13 (28.3) | 20 (43.5) | 9 (19.6) | 10 (21.7) | 0.016 | 0.028 | 0.036 | 0.011 |
| pT3–4(n = 121) | 59 (48.8) | 75 (62.0) | 45 (37.2) | 51 (42.1) | | | | |
| מצב קשרי לימפה | שלילי (n = 67) | 21 (31.3) | 31 (46.3) | 15 (22.4) | 18 (26.9) | 0.012 | 0.025 | 0.021 | 0.038 |
| חיובי (n = 100) | 51 (51.0) | 64 (64.0) | 39 (39.0) | 43 (43.0) | | | | |
| שלב TNM | I–II (n = 56) | 16 (28.6) | 25 (44.6) | 11 (19.6) | 13 (23.2) | 0.008 | 0.021 | 0.014 | 0.009 |
| III–IV (n= 111) | 56 (50.5) | 70 (63.1) | 43 (38.7) | 48 (43.2) | | | | |
טבלה 5: קשרים בין עלייה בסממנים ביולוגיים בסרום לבין מאפיינים קליניקו-פתולוגיים בחולי ESCC. שיעורי העלייה ב-CEA, עלייה ב-SCC-Ag, עלייה ב-CA125 ועומס גבוה של סממנים ביולוגיים משולבים מושווים בין תת-קבוצות דמוגרפיות ותת-קבוצות הקשורות לגידול.
| משתנה | HR חד-משתני ל-OS (95% CI) | ערך P | HR רב-משתני ל-OS (95% CI) | ערך P | HR חד-משתני ל-PFS (95% CI) | ערך P | HR רב-משתני ל-PFS (95% CI) | ערך P |
| גיל ≥65 שנים | 1.52 (1.01–2.31) | 0.046 | 1.39 (0.90–2.14) | 0.138 | 1.41 (0.97–2.06) | 0.074 | 1.31 (0.88–1.95) | 0.186 |
| מין זכר | 1.18 (0.67–2.08) | 0.566 | — | — | 1.13 (0.69–1.84) | 0.632 | — | — |
| אורך גידול ≥5 cm | 1.89 (1.25–2.86) | 0.003 | 1.44 (0.93–2.23) | 0.103 | 1.76 (1.22–2.55) | 0.003 | 1.36 (0.92–2.01) | 0.122 |
| דיפרנציאציה נמוכה | 1.63 (1.07–2.47) | 0.024 | 1.29 (0.84–1.99) | 0.245 | 1.58 (1.09–2.28) | 0.016 | 1.27 (0.86–1.87) | 0.228 |
| שלב pT3–4 | 2.04 (1.19–3.49) | 0.009 | 1.36 (0.76–2.44) | 0.304 | 1.92 (1.18–3.11) | 0.009 | 1.29 (0.77–2.18) | 0.335 |
| גרורות בקשרי לימפה | 2.46 (1.50–4.03) | <0.001 | 1.94 (1.15–3.28) | 0.013 | 2.12 (1.37–3.28) | 0.001 | 1.73 (1.08–2.79) | 0.023 |
| טיפול מבוסס ניתוח רדיקלי | 0.43 (0.28–0.65) | <0.001 | 0.56 (0.36–0.88) | 0.012 | 0.51 (0.35–0.74) | <0.001 | 0.63 (0.43–0.94) | 0.024 |
| CEA מוגבה | 1.88 (1.24–2.85) | 0.003 | 1.34 (0.86–2.10) | 0.199 | 1.71 (1.18–2.49) | 0.005 | 1.26 (0.84–1.88) | 0.267 |
| SCC-Ag מוגבה | 1.95 (1.25–3.03) | 0.003 | 1.29 (0.80–2.08) | 0.302 | 1.82 (1.22–2.72) | 0.004 | 1.25 (0.81–1.93) | 0.315 |
| CA125 מוגבה | 1.79 (1.16–2.78) | 0.009 | 1.21 (0.76–1.93) | 0.421 | 1.68 (1.13–2.50) | 0.011 | 1.18 (0.77–1.82) | 0.446 |
| עומס גבוה של סממנים ביולוגיים משולבים | 2.91 (1.89–4.46) | <0.001 | 2.24 (1.41–3.54) | 0.001 | 2.63 (1.80–3.84) | <0.001 | 2.03 (1.35–3.05) | 0.001 |
טבלה 6: ניתוחי רגרסיה של Cox חד-משתניים ורב-משתניים להישרדות כוללת ולהישרדות ללא התקדמות המחלה. יחסי סיכון ומרווחי סמך של 95% מוצגים עבור משתנים קליניקו-פתולוגיים, עלייה בביו-מרקרים בודדים ועומס גבוה של ביו-מרקרים משולבים.
| מודל | C-index של קבוצת האימון | AUC לשנה אחת (אימון) | AUC ל-3 שנים (אימון) | AUC ל-5 שנים (אימון) | C-index של תיקוף חיצוני | AUC לשנה אחת (חיצוני) | AUC ל-3 שנים (חיצוני) | AUC ל-5 שנים (חיצוני) | NRI לעומת TNM | IDI לעומת TNM |
| שלב TNM בלבד | 0.662 | 0.701 | 0.676 | 0.648 | 0.641 | 0.672 | 0.651 | 0.628 | — | — |
| פאנל ביומרקרים בלבד | 0.703 | 0.744 | 0.713 | 0.689 | 0.681 | 0.709 | 0.687 | 0.666 | 0.118 | 0.049 |
| מודל קליני-פתולוגי | 0.736 | 0.772 | 0.748 | 0.721 | 0.708 | 0.741 | 0.719 | 0.694 | 0.153 | 0.061 |
| מודל משולב | 0.792 | 0.829 | 0.806 | 0.781 | 0.761 | 0.801 | 0.774 | 0.748 | 0.274 | 0.102 |
טבלה 7: ביצועים חיזויים של מודלים פרוגנוסטים שונים בקבוצות האימון והתיקוף החיצוניות. מדד C-index של Harrell, שטח תחת העקומה תלוי-זמן, שיפור סיווג נקי (net reclassification improvement) ושיפור הבחנה משולב (integrated discrimination improvement) מושווים בין שלב TNM לבדו, פאנל הביומרקרים לבדו, המודל הקליני-פתולוגי והמודל המשולב.
טבלה משלימה 1: סינון משתתפים, הדרה והקצאה סופית לקוהורט. מספרי הסינון, סיבות ההדרה, האוכלוסייה האנליטית הסופית, התפלגות הקבוצות האבחנתיות וההקצאה לקוהורט לפי מרכז מסוכמים בטבלה.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה נלווית 2: שחזור בין-בדיקתי ובין-מרכזי של מדידת סממנים ביולוגיים בנסיוב. תוצאות בדיקת נסיוב סרום לגישור בסמיות מסוכמות באמצעות מקדמי וריאציה בין-מרכזיים ומקדמי מתאם תוך-מעמדיים עבור CEA, SCC-Ag ו-CA125.אנא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.
טבלה נלווית 3: התפלגות סממנים ביולוגיים בסרום ועומס סממנים משולב בין קבוצות אבחנה. התפלגויות ספציפיות לקבוצות של CEA, SCC-Ag ו-CA125 בסרום, וכן הפרופורציה של מטופלים עם עומס סממנים ביולוגיים משולב גבוה, מסוכמות עבור חולי ESCC, ביקורות עם מחלות וסת רגילות וביקורות בריאות.נא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 4: מקדמי מודל אבחנתי ותיקוף פנימי באמצעות bootstrap. מסוכמים כאן נקודת החיתוך (intercept) של המודל האבחנתי, מקדמי הביומארקרים, אומדני רגרסיה לוגיסטית חד-משתנית ורב-משתנית, ערך הסף (cutoff) של קוהורט האימון, מספר דגימות ה-bootstrap, השטח תחת העקומה (AUC) המתוקנן לאופטימיזם, שיפוע הכיול ומדד Brier.אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
טבלה משלימה 5: תוצאות מעקב, תמותה בנקודת זמן קבועה (landmark), כיול ועקומות החלטה עבור תיקוף פרוגנוסטי. מסוכמים משך המעקב, אירועי הישרדות, חציונ OS ו-PFS לפי קבוצת עומס הביומרקר; שיפור ב-C-index; מדד C-index מתוקן לאופטימיות; הסתברויות תמותה מצטברות בנקודת זמן קבועה; מדדי Brier של תיקוף חיצוני; שיפעורי כיול; והערכות תועלת נטו מעקומות החלטה.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.