ניתוח ביבליומטרי זה מתאר את נוף המחקר המיטוכונדריאלי בנפרופתיה סוכרתית (DN) ומסכם שינויים נושאיים מרכזיים ונושאים מתפתחים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר מחקר
* These authors contributed equally
ניתוח ביבליומטרי זה מתאר את נוף המחקר המיטוכונדריאלי בנפרופתיה סוכרתית (DN) ומסכם שינויים נושאיים מרכזיים ונושאים מתפתחים.
מחקר ביבליומטרי זה ממפה באופן שיטתי את הנוף הגלובלי של מחקר מיטוכונדריה ב-DN בין השנים 2016 ל-2025. כדי לשמור על עקביות עם כותרת המחקר ומוקד החיפוש, DN משמש כמונח העיקרי, בעוד שמחלת כליות סוכרתית (DKD) נשמרת רק בעת תיאור מונחי חיפוש, קריטריוני סינון או מילות מפתח מקוריות של המחבר. בסך הכול נאספו 1,342 פרסומים מ-Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) ו-Social Sciences Citation Index (SSCI) בתוך Web of Science Core Collection (WoSCC) ונותחו באמצעות CiteSpace, VOSviewer ו-Scimago Graphica. תפוקת הפרסומים השנתית עלתה כמעט פי ארבעה מ-63 ב-2016 ל-239 ב-2025, ונראות הציטוטים ברמת מערך הנתונים עלתה גם היא. סין הובילה בנפח הפרסומים, בעוד שאוסטרליה וארה"ב הראו ממוצע ציטוטים גבוה יותר למאמר, מה שמעיד על פער בין תפוקה לנראות מבוססת ציטוטים. אוניברסיטת סנטרל סאות' דורגה ראשונה בתפוקה מוסדית ובסך הציטוטים בין המוסדות המוצגים, אך הקישוריות שיתופית שלה הייתה נמוכה מזו של אוניברסיטת ג'יאו טונג ושנגחאי ואוניברסיטת ג'ג'יאנג. ניתוחי מילות מפתח והפניות הראו התרחבות זמנית ממתח חמצוני ואפופטוזיס המושרים על ידי גלוקוז גבוה למיטופגיה, פרופטוזיס, דינמיקה מיטוכונדרית, ממברנות רשתית אנדופלזמיות הקשורות למיטוכונדריה (MAMs), ואינפלמזום NLRP3. זוהו גם נושאים הקשורים להתערבויות ולמתודולוגיה, כולל מעכבי SGLT2, MitoQ, הגבלת קלוריות, רנדומיזציה מנדלית ומטבולומיקה. בסך הכול, מחקר מיטוכונדריה ב-DN התרחב לבקרת איכות מיטוכונדריאלית, מוות תאים מבוקר, גישות מולטי-אומיקס ונושאים הקשורים להתערבות. דפוסים ביבליומטריים אלו מצביעים על בולטות נושא ונראות ציטוט ולא ראיות מכניות או קליניות ישירות, ועשויים לסייע בזיהוי כיוונים הדורשים אימות נוסף.
DN הוא אחד הסיבוכים המיקרווסקולריים החמורים ביותר של סוכרת וגורם מוביל למחלות כליות סופניותבעולם. למרות התקדמות משמעותית בשליטה על הגלוקוז, ניהול לחץ דם וחסימת מערכת הרנין-אנגיוטנסין, שכיחות DN ממשיכה לעלות, וחלק ניכר מהמטופלים עדיין מתקדמים לכשל כלייתי בלתי הפיך3. הצורך הקליני הבלתי מסופק זה הוביל לחיפוש אינטנסיבי אחר מנגנונים פתופיזיולוגיים חדשים ומטרות טיפוליות. המיטוכונדריה משמשת כמרכזי מטבוליזם אנרגיה תאית, הומאוסטזיס רדוקס ואפופטוזיס, והפכו לצמתים קריטיים בפתוגנזה של DN 4,5. מחקרים בעשרים השנים האחרונות הוכיחו כי תפקוד לקוי של מיטוכונדריה הנגרמת מהיפרגליקמיה תורם ישירות לפגיעה בפודוציט, נזק לתאי אפיתל צינוריים, התרחבות מזנגיאלית ופיברוזיס אינטרסטיציאלי 6,7. תפקוד לקוי זה מאופיין בייצור מופרז של מיני חמצן תגובתי, פגיעה בפוספורילציה חמצונית לקויה, פיצול מיטוכונדריאלי, מיטופאגיה פגומה וביוגנזה של מיטוכונדריה לא מווסתת 8,9. כתוצאה מכך, מסלולי איתות הקשורים למיטוכונדריה הכוללים SIRT3, PGC1α, Drp1, PINK1, פארקין ואינפלמזום NLRP3 הפכו למוקדי מחקרמרכזיים 10,11. לאחרונה, מושגים מתפתחים כמו פרופטוזיס, MAMs ותכנות מחדש מטבולי מיטוכונדריאלי הרחיבו עוד יותר את הנוף המכניסטי של DN 12,13,14. נפח הפרסומים על מחקר מיטוכונדריה ב-DN גדל משמעותית, ויצר גוף ידע עשיר אך מורכב ומפוצל יותר ויותר.
בהתחשב בהתפשטות המהירה של ספרות, סקירות נרטיביות מסורתיות אינן מספיקות כדי ללכוד באופן שיטתי את הנוף האינטלקטואלי המתפתח, רשתות שיתופיות והגבולות המתפתחים בתחוםזה. ניתוח ביבליומטרי, גישה כמותית ומבוססת ויזואליזציה, מציע אמצעי אובייקטיבי למיפוי תוצרים מדעיים, זיהוי מאמרים, מחברים, מוסדות ומדינות משפיעים, ולזהות את הדינמיקה של נושאי מחקר לאורך זמן 16,17,18,19,20. מספר מחקרים ביבליומטריים בחנו נפרופתיה סוכרתית, DKD, מחקר כליות הקשור למיטוכונדריה או נושאים הקשורים ללחץ חמצוני 21,22,23,24. עם זאת, סינתזה ביבליומטרית מעודכנת וממוקדת נושא של מחקר מיטוכונדריה ב-DN עשויה עדיין לסייע בהבהרת פעילות מחקרית עדכנית, דפוסי שיתוף פעולה, התפתחות נושאית ונושאים מתפתחים בתחום זה. במחקר זה, כל הפרסומים הרלוונטיים נאספו מ-SCI-EXPANDED ו-SSCI בתוך WoSCC, בתקופה שבין 2016 ל-2025. CiteSpace, VOSviewer ו-Scimago Graphica שימשו לביצוע ניתוח ביבליומטרי ווויזואליזציה שיטתי. מחקר זה מתאר את נוף המחקר הנוכחי ומסכם את התפתחותם של נושאים מרכזיים, כולל מיטופגיה, פרופטוזיס, דינמיקת מיטוכונדריה ומחקר הקשור להתערבות, ובכך מספק בסיס ביבליומטרי לזיהוי כיוונים המחייבים אימות ניסויי וקליני נוסף.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
רכישת נתונים ואסטרטגיית חיפוש
כל הרשומות הביבליומטריות נאספו מ-SCI-EXPANDED ו-SSCI בתוך WoSCC ב-30 באפריל 2026. SCI-EXPANDED שימש לכידת ספרות ביו-רפואית ומדעי החיים, בעוד ש-SSCI נשמר לכלול רשומות בין-תחומיות פוטנציאליות רלוונטיות. אסטרטגיית החיפוש נבנתה בהתייחס למאגר הראשיות הרפואיות (MeSH). "נפרופתיות סוכרתיות" ו"מיטוכונדריה" נבדקו בנפרד ב-MeSH, והמונחים המתאימים של MeSH, מונחי הערך והכותרות המשניות הנלוות נבדקו כדי להנחות בחירת מילות מפתח והרחבת מילים נרדפות. מכיוון ש-Web of Science אינו משתמש ישירות באינדקס MeSH, המונחים שמקורם ב-MeSH תורגמו למונחי חיפוש בתחום הנושא. החיפוש הסופי בוצע באמצעות הביטוי הבוליאני הבא: TS=(("נפרופתיה סוכרתית" או "נפרופתיה סוכרתית" או "מחלת כליות סוכרתית" או "מחלות כליות סוכרתיות" או "כליה סוכרתית" או "כליה סוכרתית") ו-(מיטוכונדריה* או מיטוכונדריאלית* או מיטוכונדריאלית או "דיספונקציה מיטוכונדריאלית" או "דינמיקת מיטוכונדריה" או "ביקוע מיטוכונדריאלי" או "מיזוג מיטוכונדריאלי" או "ביוגנזה מיטוכונדרית" או "בקרת איכות מיטוכונדריאנית")). סוגי המסמכים הוגבלו למאמרים ומאמרי סקירה, ותקופת הפרסום נקבעה מ-1 בינואר 2016 עד 31 בדצמבר 2025. תקופה זו נבחרה משום שהיא ייצגה את התקופה המלאה האחרונה של 10 שנים הזמינה בזמן השחזור, מה שאפשר לניתוח להתמקד בהתפתחויות עכשוויות במחקר מיטוכונדריה ב-DN תוך הימנעות מהטיה אפשרית משנת פרסום לא שלמה 2026.
כל הרשומות יוצאו בפורמט טקסט פשוט עם אפשרות "רשומה מלאה ומקורות מצוטטים" נבחרה. כדי להפחית את הכללת רשומות לא רלוונטיות שעלולות להישלף דרך מילות מפתח פלוס, כותרות, תקצירים ומילות מפתח של המחבר של כל הרשומות שנאספו נבדקו ידנית. נשמרו רק רשומות מהותיות הקשורות למחקר מיטוכונדריאלי ב-DN או DKD. פרסומים הוצאו מכלל אם DN או DKD הוזכרו רק כאחד ממספר סיבוכי סוכרת או כמידע רקע, ללא תוצאות הקשורות לכליות, מודלים של תאי כליה, ראיות לרקמת כליה, מנגנונים ספציפיים לנפרופתיה או התמקדות ראשונית ב-DKD. לאחר הסרת כפילויות וסינון ידני לפי קריטריוני הכללה והחרגה מוגדרים מראש, נכללו 1,342 פרסומים זכאים בניתוח הסופי.
כלים אנליטיים ותהליך מיפוי
ניתוחים סטטיסטיים בסיסיים ותרשימים קונבנציונליים, כולל תרשימי עמודות, תרשימי קווים, תרשימי עוגה וגרפים בועות, נוצרו באמצעות WPS Excel 2023 ו-GraphPad Prism 10.1. תפוקת הפרסום השנתית סוכמה לפי שנת פרסום. ספירות שנתיות ברמת מאגר הנתונים התקבלו מדוח הציטוטים של WoSCC והוגדרו כציטוטים שהתקבלו בכל שנה קלנדרית על ידי כל 1,342 הרשומות שנכללו, ולא כציטוטים באותה שנה לקבוצות פרסום שנתיות או כסך הציטוטים השנתיים בתחום. לניתוחים ברמת מדינה/אזור, ממוצע הציטוטים למאמר חושב על ידי חלוקת סך הציטוטים במספר הפרסומים לכל מדינה/אזור. מדד זה פורש כאינדיקטור תיאורי לא מותאם לנראות ציטוטים במאגר הנתונים שנשלף. הוא לא נחשב למדד ישיר לאיכות המחקר הלאומית או להשפעה אקדמית, משום שמספר הציטוטים עשוי להיות מושפע משנת פרסום, חלון ציטוטים, פלטפורמת כתב עת, סוג מאמר, עיצוב מחקר ונהלי ציטוט ספציפיים לתחום.
מיפוי ידע בוצע באמצעות VOSviewer 1.6.19, CiteSpace 6.4.R1, ו-Scimago Graphica 1.0.25. מאגרי המידע, התוכנה והמשאבים המקוונים המשמשים לשליפת ספרות, ניתוח ביבליומטרי, ויזואליזציה ושליפת מדדים מכתבי עת מופיעים בטבלת החומרים. ניתוחי רשת בוצעו באמצעות שיטת הספירה המלאה. קבצי הטקסט הפשוטים של WoSCC יובאו ל-VOSviewer כדי לבנות רשתות מחברים משותפים ברמת המדינה/אזור, מוסד ומחברים, וכן רשתות קו-הופעות של מילות מפתח ורשתות ציטוט משותף בכתבי עת. לצורך ויזואליזציה גאוגרפית, רשת המחברים המשותפת של מדינה/אזור שנוצרה ב-VOSviewer יוצאה כקובץ Graph Modeling Language (GML) ויובאה ל-Scimago Graphica, שם יושמה פריסה גאוגרפית עם מפת עולם כרקע. במפה זו, גודל הצומת ייצג את נפח הפרסום, ועובי הקישור הצביע על עוצמת שיתוף הפעולה. אותו מערך נתונים של WoSCC יובא ל-CiteSpace לצורך אשכולות מילות מפתח-ציר זמן, אשכולות ציטוט משותף של ייחוסים, וזיהוי פיצוצי ציטוטים כדי לאפיין את ההתפתחות הזמנית והמבנה האינטלקטואלי של התחום.
תצורת פרמטרים ב-CiteSpace וב-VOSviewer
ב-CiteSpace, טווח הזמן נקבע מ-2016 עד 2025, כאשר כל חתך זמן נקבע לשנה אחת, מה שהניב בסך הכל 10 פרוסות. סוגי הצמתים נבחרו לפי המטרה האנליטית, כאשר מילת המפתח שימשה לניתוח ציר זמן ומילות מפתח, ו-Reference שימשה לניתוח ציטוט משותף וניתוחי פרצות. קריטריון בחירת הצמתים הוגדר למדד g עם מקדם קנה מידה k = 10, במקום סף קבוע של Top N או Top N%, כדי לאפשר לבחירת הצמתים להסתגל להתפלגויות ציטוט או הופעות שנתיות תוך שמירה על גודל רשת ניתן לפענוח25,26. גיזום Pathfinder יושם על רשתות חתוכות בזמן ועל הרשת הממוזגת, בעוד שלא נעשה שימוש באלגוריתם Minimum Spanning Tree. לצורך זיהוי פיצוץ, מקדם הדעיכה γ הוגדר ל-0.5. בניתוח אשכולות קו-ציטוט ייחוסים, חושבו ערכי Q מודולריות וערכי סילואט ממוצעים משוקללים כדי לתאר את המבנה הכולל ואת עקביות האשכול של הרשת המסודרת.
ב-VOSviewer 1.6.19, כל קבצי הטקסט הפשוט של WoSCC יובאו על ידי בחירה ב"יצירת מפה המבוססת על נתונים ביבליוגרפיים" ו"קריאת נתונים מקבצי מסד נתונים ביבליוגרפיים", כאשר סוג הקובץ צוין כ-Web of Science. שיטת הספירה המלאה השתמשו בה. ברשתות שותפות לכתיבה, סף הפרסום המינימלי נקבע ל-5 למדינות/אזורים ומוסדות ול-3 למחברים.
לניתוחים ברמת המוסד, שמות מוסדות נבדקו והתאמרו ידנית בהתאם לרשומות ההשתייכות של WoSCC לפני בניית הרשת. ספירת הציטוטים עבור כל מוסד הוגדרה כסך הפרסומים המצוטטים של WoSCC Times המיוחסים לאותו מוסד במאגר הנתונים שנשלף. תוויות צמתים מקוצרות שנוצרו ב-VOSviewer נבדקו עוד מול השמות המוסדיים המלאים המתאימים כדי למנוע עמימות. לניתוח מדינה/אזור, נעשה שימוש בשדה כתובת המדינה/אזור של WoSCC. שמות המדינות/האזורים התאמו ידנית עבור וריאציות איות וקיצורים. אנגליה, סקוטלנד, ויילס וצפון אירלנד אוחדו לממלכה המאוחדת, והרפובליקה העממית של סין קוצר לסין. סין היבשתית דווחה כסין, בעוד שהאזור המנהלי המיוחד של הונג קונג (Hong Kong SAR), מקאו SAR וטאיוואן נשמרו כאזורים נפרדים אם סומנו בנפרד על ידי WoSCC; לא בוצעה מיזוג לאחר מכן לניתוח רשת ברמת מדינה/אזור. לניתוח הופעה משותפת של מילות מפתח, יחידת הניתוח הוגדרה לכתוב מילות מפתח שהופקו מרשומות WoSCC, וסף ההופעה המינימלי הוגדר ל-5; בסף זה, 89 מילות מפתח עמדו בקריטריונים. לפני יצירת הרשת, מונחים וקיצורים נרדפים שזוהו ברשימת מילות המפתח של המחבר היו סטנדרטיים ידנית; לדוגמה, קיצורים למיני DN ומיני חמצן תגובתי הומרו למונחים המלאים שלהם. לניתוח ציטוט משותף בכתבי עת, מקורות מצוטטים שימשו כיחידת ניתוח, וסף ציטוטים הוחל לשמירה על רשת ניתנת לפרשנות של 53 כתבי עת. הפריסה הייתה מוגדרת ל-LinLog/מודולריות, כאשר Attraction מוגדר ל-2 ו-Repullsion על -1. גודל הצומת נשקלל לפי מספר פרסומים, תדירות ציטוטים, הופעת מילות מפתח או עוצמת ציטוט משותף בהתאם לניתוח הספציפי. כל הליכי יצירת הרשת בוצעו באופן עצמאי פעמיים על ידי המחברים הראשון והשני, תוך שימוש באותם מערך נתונים והגדרות פרמטרים כדי לאמת את יציבות התוצאות. במקרים של אי-התאמות בולטות, הנתונים הגולמיים והגדרות הפרמטרים נבדקו מחדש לפני ניתוח מחדש.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מגמות פרסום שנתיות ונראות ציטוטים ברמת מאגר הנתונים
בין 2016 ל-2025, מספר הפרסומים השנתי על מחקר מיטוכונדריה ב-DN עלה מ-63 ל-239. ספירת ה-Times Citation השנתית ברמת מערך הנתונים הקבוע עלתה מ-49 ב-2016 ל-12,516 ב-2025. מדד זה מייצג ציטוטים שהתקבלו בכל שנה קלנדרית על ידי כל הרשומות הכלולות, ולא ציטוטים מאותה שנה לקבוצות פרסום שנתיות או סך הציטוטים בתחום. מכיוון שמדד הציטוט הזה חושב עבור מאגר הנתונים הקבוע כולו, ספירת הציטוטים השנתית מושפעת מגיל ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר ביבליומטרי זה מספק סקירה שיטתית של נוף המחקר הגלובלי וההתפתחות התמטית של מחקר מיטוכונדריה ב-DN בין השנים 2016 ל-2025. התוצאות מראות כי פעילות המחקר בתחום זה עלתה בעשור האחרון, במיוחד לאחר 2021. במהלך תקופה זו, מוקד המחקר התרחב בהדרגה מעקה חמצונית ותפקוד לקוי של מיטוכונדריה לבקרת איכות מיטוכונדריאה, הסתגלות מטבולית, מוות תאים מווסת, אינטראקציות עם אברונים וחקירה טיפולית מוכוונת תרגום. מגמות אלו מצביעות על כך שמחקר המיטוכונדריה ב-DN עבר מאפיון תיאורי של פגיעות מיטוכונדריאלית לחקירה ממ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים שאין ניגוד עניינים.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Web of Science Core Collection | Clarivate | https://www.webofscience.com/ | Not applicable |
| VOSviewer | Leiden University | https://www.vosviewer.com/ | 1.6.19 |
| CiteSpace | Drexel University | https://citespace.podia.com/ | 6.4.R1 |
| Scimago Graphica | Scimago Laboratory | https://www.scimagographica.org/ | 1.0.25 |
| WPS Excel | Kingsoft Corporation | https://www.wps.com/ | 2023 |
| GraphPad Prism | GraphPad Software | https://www.graphpad.com/ | 10.1 |
| Journal Citation Reports | Clarivate | https://jcr.clarivate.com/ | Not applicable |
| Medical Subject Headings database | National Library of Medicine | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/ | Not applicable |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.