הפרוטוקול מפרט כיצד לתכנן ולהרכיב כלי דם in vitro עם מקטעים מפותלים או מפרצת (aneurysm), באמצעות מדפסת אקסטרוזיה או יישום ידני של דיו הקרבתי מפוסטר, וכיצד לבחון זרימה המודינמית ותגובות של תאי אנדותל.
מאמר שיטה
הפרוטוקול מפרט כיצד לתכנן ולהרכיב כלי דם in vitro עם מקטעים מפותלים או מפרצת (aneurysm), באמצעות מדפסת אקסטרוזיה או יישום ידני של דיו הקרבתי מפוסטר, וכיצד לבחון זרימה המודינמית ותגובות של תאי אנדותל.
פיתול כלי דם ואניוריזמות מהוות סיכונים בריאותיים משמעותיים במגוון רקמות אנושיות ובסוגים שונים של כלי דם. שינויים אלו במבנה כלי הדם גורמים לאנומליות בדינמיקת זרימת הדם, המשפיעות באופן משמעותי על התפקוד האנדותליאלי. מודלים חייים של מצבי מחלה וסקולריים אלו היו ממחים במקרים מסוימים, אך הם יקרים להקמה ומוגבלים לפיזיולוגיה של מיני בעלי החיים. כמענה לכך, מודלי in vitro תלת-ממדיים של איבר-על-שבב (OOC) הפכו לארגז כלים עוצמתי להערכת תפקוד וסקולרי ותגובות אנדותליאליות בתאים אנושיים. בעוד שלכל אחד ממודלי ה-OOC ישנם יתרונות, נדרשת מערכת נגישה לחקר חדירות כלי דם, מדד מרכזי לתפקוד וסקולרי בכלי דם מעוקלים ובאניוריזמות תחת קצב גזירה ולחץ פיזיולוגיים. כאן, המתודולוגיה המוצגת מאפשרת את חקר התגובות של תאי אנדותל אנושיים לאנומליות בזרימה במערכת מודל כלכית של כלי דם מעוקל, תוך שימוש במדפסת ביו-טכנולוגית בסיסית המייצרת כלי דם התואמים לקצבי זרימה של נוזלים פיזיולוגיים, למחקרי חדירות, למיקרוסקופיית אור ברזולוציה גבוהה, ולתמיכה במטריצה חוץ-תאית בעלת קשיחות פיזיולוגית.
מורפולוגיה של כלי דם היא מדד חשוב לתפקוד התוורי (vascular function), שכן פיתול כלי דם ואניוריזמות הן סימני היכר מרכזיים למחלות שונות ולסיכוני בריאות. פיתול תוורי יכול להיות מולד, כפי שקורה בתסמונות כמו Marfan1, Turner2, ו-Loeys-Dietz3, או להתפתח בשלב מאוחר יותר בחיים כסימן למספר מחלות, כולל יתר לחץ דם, סוכרת, סרטן וייתכן שגם טרשעורקים (atherosclerosis)4,5,6. אניוריזמות של רקמות עורקיות, כולל עורקים קרטידיים7, כליליים (coronary)8, פמורליים9, אאורטליים10, ומוחיים11, קשורות לתחלואה ולסיכוני בריאות עקב דיסקציה ספונטנית או קרע. בנוסף לגרימת אי-סדירויות בזרימה ודלקת אנדותליאלית נלווית, פיתול תוורי ואניוריזמות עשויים להעיד על תפקוד לקוי של הרקמה ודלקת בבסיסם. לדוגמה, בילודים ובchildren, תסמונת של פיתול עורקי מהווה תחזית קלינית לשבץ ילדות12, יתר לחץ דם ריאתי עמיד, ודיסקציה של האאורטה4,13. במבוגרים, וסקוליטיס רטינלית מתבטאת בכלי דם רטינליים מפותלים שהופכים לפחות בולטים ככל שהדלקת הבסיס נרגעת14. האופן שבו פיתול מזוהה ומתורגם לאותות חריגים המניעים התקדמות של המחלה נותר תחום מחקר פעיל. תאי אנדותל המצפים את כלי הדם נחשבים למגשים הראשוניים בתהליך זה. זרימה מופרעת או איטית המושרית על ידי פיתול תוורי או אניוריזמות משנה את מאמץ הגזירה (shear stress), ובכך מעוררת שינויים אנדותליאליים באותות דלקתיים15 ובתפקוד מחסומי16. תאי אנדותל רגישים מאוד לזרימת נוזלים באמצעות מנגנונים הכוללים שערות ראשוניות (primary cilia)17, חלבוני הדבקה מכנו-סנסיטיביים18,19, ותעלות יונים20,21, המניעים סיגנלינג שעלול להפעיל דליפה, דלקת ותכנות מחדש של האנדותל22,23,24. לפיכך, שיטות לבחינת תגובות אנדותליאליות לגאומטריה תווריים של כלי דם הן חשובות לפיתוח טיפולים תווריים.
תפקודים אנדותליאליים במצבי מחלה וסקולרית מודלו באמצעות מודלים של בעלי חיים in vivo, מערכות איבר-על-שבב (OOC) וגישות של הדפסה ביומטרית. מודלים של עכברים מאפשרים שליטה על ביטוי של גנים ידועים הקשורים למחלות ומשלבים את המורכבות של ארכיטקטורת הרקמה והפיזיולוגיה, כולל מעורבות של תאי קיר ותאי מערכת החיסון. מודלים של עכברים לאתרוסקלרוזיס25, לתסמונת מרפאן26 ולמגוון מפוערים (אנוריזמות)27,28,29 מספקים תובנות לגבי פתולוגיות הקשורות לתפקוד לקוי של כלי דם. למרות יתרונות אלו, קשה להשיג תצפית ישירה, מניפולציה ניסיונית וכימות של תאים אנדותליאליים, מלבד שיטות גבאיות (bulk) כגון ריצוף RNA. יתרה מכך, מודלים של בעלי חיים מעמידים שיקולים אתיים וכלכליים והם מוגבלים על ידי פיזיולוגיה ספציפית למין.
פותחו מספר גישות in vitro של איבר על שבב (OOC) כדי לחקור תגובות של תאי אנדותל אנושיים לזרימה למינרית ומשובשת30,31,32במערכות דו-ממדיות (2D)33,34 ותלת-ממדיות (3D)35,36,37. הספרות הנרחבת על OOC38 הונעהה במידה רבה על ידי הנדסה ביו-רפואית, כאשר מאפייני התכנון נותנים מענה לשאלות ביו-רפואיות ספציפיות. מודלי OOC וסקולריים רבים משתמשים בתמיכות של פולידימეთילסילוקסאן (PDMS) כדי לשלוט בארכיטקטורה של כלי הדם38. מודלים אלו מספקים שליטה ברזולוציה גבוהה על גיאומטריות מורכבות ומאפשרים מידול של אינטראקציות בין איברים לכלי דם, כולל כאלו המערבות את הכבד39, המוח40 והריאה41. עם זאת, עדיין קיימות מגבלות. החדירות הנמוכה של PDMS ופולימרים דומים למולקולות גדולות (macromolecules) עלולה להגביל מחקרים של תפקוד מחסום וסקולרי. בנוסף, למרבית ה-PDMS המקשוח יש קשיות של כ- 0.8–10 MPa42, אם כי פורמולציות חלופיות יכולות להשיג טווחים פיזיולוגיים יותר של 8–200 kPa43. הערכות של קשיות קרומי הבסיס הוסקולריים נעות בין ~350 Pa44 ל- ~70 kPa45, תלוי בסוג כלי הדם ובמתודולוגיית המדידה, כאשר מרבית קרומי הבסיס הוסקולריים הבריאים נמצאים בטווח של 2–3 kPa46. כיוון שמחלות וסקולריות כגון טרשת עורקים ויתר לחץ דם קשורות בחלקן לעלייה בקשיות המטריצה החוץ-תאית (ECM)47,48,49,50,51, ותאי אנדותל מגיבים לקשיות ה-ECM, שליטה בקשיות בטווחים פיזיולוגיים היא חשובה במודלים in vitro. גישות OOC עדכניות יותר משתמשות בתשתיות פיזיולוגיות המאפשרות גיאומטריות מורכבות52,53, משלבות סוגי תאים מרובים כדי לשחזר תפקוד איברים39,54,55,56,57, או אינטראקציות חיסוניות-וסקולריות58, ממדלות מבנים וסקולריים ספציפיים למטופל59,60, ותומכות בפיתוח תרופות פרה-קליני61,62. במודלים מיקרו-וסקולריים רבים הכוללים אינטראקציות עם סוגי תאים אחרים, תאי אנדותל יוצרים באופן ספונטני כלי דם בעלי גיאומטריות שאינן נשלטות יחסית63. לעומת זאת, מערכות OOC המאפשרות גיאומטריות מוגדרות של כלי דם תחת זרימה נשלטת דורשות לרוב תשתית הנדסית, חומרים ומומחיות משמעותיים53,64. לכן, נדרשות שיטות חסונות (robust) הנגישות למי שאינם מומחים כדי להקל על מחקרים של התנהגות תאים וסקולריים תחת תנאים רלוונטיים פיזיולוגית.
פלטפורמות של הדפסה ביונית התואמות הידרוגלים של ECM פיזיולוגיים מספקות מודלים ורסטיליים in vitro לחקר תפקוד אנדותל במבנים וסקולריים שונים65. גישות אלו משתמשות באחד משני נתיבים: שיקוע מכוון של ג'לים המכילים תאי אנדותל בצורת כלי דם66, או שימוש בדיו שניתן להסרה (sacrificial ink) ליצירת לומנלים צינוריים פתוחים המוטמעים ב-ECM, אשר ניתן להמיסם לאחר מכן ולהשאיר לומן שניתן לזרע בו תאי אנדותל54. מצעי ECM התואמים ביולוגית, הכוללים ג'לטין, קולגן ופיברין, ניתנים לכיוונון לרמות קשיחות המקורבות לאלה של קרומי הבסיס הוסקולריים (1–3 kPa67) ומאפשרים בדיקות חדירות וסקולרית דומות לאלו המבוצעות in vivo. למרות שגישות אלו אינן משיגות את אותה רזולוציית צורה וגודל כפי שמתקבל בייצור PDMS, ניתן ליצור כלים מעוקלים, מסועפים וסטנוטיים52,66,68. לפיכך, פלטפורמות אלו מתאימות מאוד למידול גאומטריות וסקולריות, כולל כלים מפותלים ואנוריזמתיים.
השיטה המוצגת כאן משתמשת בגישת הדפסה תלת-ממדית המבוססת על אקסטרוזיה פנאומטית, מיקום תלת-ממדי ברמת מיקרון, בקרת טמפרטורה של משטח ההדפסה ושל ראש ההדפסה המכיל את הדיו, ודיו זמני (sacrificial ink) שפותח בעבר עבור אינטראקציות כליות-וסקולריות על שבב67,69. הדיו הזמני מודפס בגיאומטריה הוסקולרית הרצויה ומוטמע מיד בתוך ה-ECM. שינוי בטמפרטורה מסיר לאחר מכן את הדיו, ומותיר לומן פתוח ב-ECM שבו נזרעות תאי אנדותל אנושיים. ה-ECM הבסיסי מורכב מג'לטין ופיברין, מה שמאפשר ג'לציה מהירה ופולימריזציה של פיברין המתווכת על ידי תרומבין, תוך אספקת קשיחות מכנית המתאימה לממברנות בסיס וסקולריות רבות. ניתן לשלב רכיבי ECM נוספים, כולל למינין או פיברונקטין, כדי לדמות טוב יותר את הרכב ממברנת הבסיס הוסקולרית70,71,72ולעודד היצמדות של תאי אנדותל. המערכת מורכבת בתאי Rose רב-פעמיים73 המכילים תומכי מתכת, אטמי גומי סיליקון וזכוכית כיסוי למיקרוסקופ ברזולוציה גבוהה, מה שמאפשר חיבור למשאבת נוזלים באמצעות מחטים מסוג Luer-lock. לחלופין, ניתן לייצר את הפלטות העליונה והתחתונה באמצעות הדפסת תלת-ממד מחומר פולילקטית או חומר מחוזק בסיבי פחמן. המערכת המורכבת עומדת בלחצים הנוצרים מקצבי זרימה פיזיולוגיים של נוזלים. הליך פסטור נחלק משפר גם את הסטריליות של הדיו הזמני מבלי לשנות את תכוניו הפיזיים. בנוסף, גישה של תבנית-מחט וביו-דיו מאפשרת ייצור של כלי דם ישרים המכילים מפרצת (aneurysm) ללא צורך במדפסת ביולוגית. ניתן לבחון את כלי הדם המעוקלים או המפרצתיים בעלי האנדותל שנוצרו תחת זרימה פיזיולוגית באמצעות מיקרוסקופיית אור ברזולוציה גבוהה למשך כשבוע, מה שמאפשר חקירה של תגובות אנדותליאליות חריפות לשינוי בגיאומטריה הוסקולרית.
יתרון מרכזי של מערכת זו הוא התאימות שלה למיקרוסקופיה של אור. כלי דם In vitro שנוצרו באמצעות פרוטוקול זה מתאימים למספר שיטות דימות, והם מתאימים במיוחד למיקרוסקופיית פלואורסצנציה קונפוקלית מסוג spinning-disk או סריקת לייזר. בעת בחירת תנאי הדימות, יש להביא בחשבון את הרזולוציה המרחבית והזמנית, את הרגישות ואת מרחק העבודה של העדשה. עבור רוב כלי הדם שנוצרו במערכת זו, על לעדשת העצם להיות בעלת מרחק עבודה מספיק כדי להגיע לכ-100–300 µm מהזכוכית המכסה ולדמות דרך נקודת האמצע של כלי הדם. עדשות עצם בעלות מפתח מספרי גבוה נדרשות לדימוי ברזולוציה גבוהה של מבנים אנדותליאליים, כולל אבניקים ואדזיות תאיות, ולדימוי חי הדורש רזולוציה זמנית גבוהה, כגון מעקב אחר חלקיקי סימון (fiducial beads) תחת זרימה. ניתן לבצע חלק מהבדיקות הדורשות לכידת פוטונים פחות יעילה, כגון מדידות של מחסום אנדותלי המבוססות על פלואורסצנציה, באמצעות עדשות בעלות מפתח מספרי נמוך יותר, כגון עדשות אוויר 10–20×.
הפרוטוקול מתאר יצירה של כלי דם מפותלים ואנוריזמתיים המורכבים מתאי אנדותל אנושיים במערכת in vitro התומכת בזרימה פיזיולוגית של נוזלים ובמיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה. זרימת העבודה כוללת תכנון של כלי הדם, ייצור התא, הכנת דיו הקרבה והדפסה בתלת-ממד, הכנת ה-ECM והסרת הדיו, זריעה של תאי אנדותל ותרביתם תחת זרימה, הערכת דליפה וסקולרית, מיפוי זרימה וצביעה אימונופלורסצנטית (איור 1).
1. תכנון הכלי
2. הכנת הדיו ההקרבתי
3. בניית תא ה-Rose והכנת הצנרת
4. הכנת ריאגנטים למטריצה החוץ-תאית
5. הכנה והפעלה של כיסויות הזכוכית
6. ציפוי הזכוכיות במעטפת הבסיס של המטריצה החוץ-תאית
7. הדפסה בביו-דיו של הדיו המקריב והכלילתו ב-ECM
8. יצירת מפרצת באמצעות תבנית חוט
9. שטיפת דיו ההקרבה מתא הכלי
10. ציפוי וטיפול מקדים של חלל הכלי ברכיבי ECM נוספים
11. זריעת תאים בכלי
12. גידול הכלי תחת זרימה
13. ביצוע בדיקת דליפה כלי דמית (vascular leak assay)
14. מיפוי זרימת נוזלים
15. קיבוע וצביעה אימונוהיסטוכימית של כלי הדם המצופים באנדותל
השימוש בדיו הקריב להדפסת רקמות צינוריות שונות בוסס היטב על ידי מספר קבוצות, ובעיקר במעבדת Lewis, שייצרה צינוריות כליה יחד עם כלי דם67,76. גישות דומות שימשו להדפסת מבני נמיקים (alveolar structures)77 וגידולים בעלי כלי דם (vascularized tumors)78. כאן, גישות אלו הותאמו ליצירת גיאומטריות של כלי דם לצורך חקירת תגובות אנדותליאליות תחת זרימה פיזיולוגית של נוזלים (איור 2). גיאומטריות של כלי דם הומרו מתמונה של כלי דם למפת קואורדינטות, ולאחר מכן לקוד G כדי להגדיר את נתיב ההדפסה (איור 2A–C). הגישה שהתקבלה אפשרה ייצור של תבניות כלי דם למחקר על האופן שבו תפקוד אנדותליאלי וארגון השלד התאי משתנים על ידי כלי דם מפותלים ומפרגמתיות (aneurysms) (איור 2D–G). תכנון של תא Rose הניתן להדפסה בתלת-ממד שולב גם הוא כדי לבטל את הצורך בשירותי עיבוד שבבים (איור 2H). דוגמה לקובץ G-code להדפסת כלי דם מסופקת ב-קובץ משלים 1, וקבצי ה-CAD התואמים של תא Rose ומעמדי השלב מסופקים ב-קובץ משלים 2 וב-קובץ משלים 3, בהתאמה. הדפסה מבוססת STL עשויה לדרוש מעברים מרובים של ראש ההדפסה, מה שמוביל לגיאומטריות של כלי דם קלועים עם לומנים (lumens) נפרדים (איור משלים 1). הפלטפורמה שהתקבלה תוכננה להיות נגישה לביולוגים של תאי כלי דם עם מומחיות מינימלית בביו-הנדסה, תוך תמיכה בלחצים ובקצבי זרימה פיזיולוגיים ואספקת גישה למיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה (איור 2I).
לאחר ייצור כלי הדם והצלולריזציה, הוטמע התקן כלי הדם במערכת פרפוזיה במעגל סגור כדי לאפשר סירקולציה מבוקרת של המדיה (איור 3). המערכת כללה משאבה פריסטלטית, ברז עצירה תלת-כיווני המחובר למזרק ה priming, מלכודת בועות, משכך פעימות, את התקן כלי הדם ומאגר מדיה, שסודרו ברצף בתוך מעגל הזרימה (איור 3A). תצורה זו אפשרה למדיה להזרים באופן רציף דרך כלי הדם המהונדס, תוך שילוב של רכיבים לביצוע priming למערכת, הסרת בועות ושיכוך פעימות הנוצרות על ידי המשאבה הפריסטלטית. ניתן היה להפעיל את המערכת המורכבת כאשר התקן כלי הדם ממוקם בתוך המערך הניסיוני, כפי שמוצג באיור 3B, דבר המספק תצורה פרקטית לפרפוזיה עוקבת של כלי דם שעברו צלולריזציה תחת תנאי זרימה מבוקרים.
שינוי אחד בגישות הדיו ההקרבה שתוארו בעבר היה פסטור של הדיו לפני ההדפסה. שינוי זה היה נחוץ מכיוון שיישום פרוטוקולי הכנת דיו שפורסמו הוביל לתרביות מזוהמות בעובש. בדומה לדיו אחרים מבוססי Pluronic המשמשים ליישום זה, דיו ה-25% Pluronic F127/1% PEO נותר נוזלי בטמפרטורות נמוכות ועובר למצב של ג'ל מיצלארי דחוס עם עליית הטמפרטורה. לפורמולציה זו טמפרטורת מעבר של 15°C, דבר שנוח ליצירת תבניות של מבנים בטמפרטורות אינקובטור והסרת הדיו ב-4°C. בדומה ל-Pluronic טהור, חומר זה מראה גם הוא דילול גזירה (shear thinning) משמעותי בטמפרטורת ההדפסה (איור 4A). עם זאת, אפילו בטמפרטורות נמוכות, הדיו צמיגי מדי עבור סטריליזציה בסינון באמצעות מסנני תרביות רקמה סטנדרטיים וואקום. למרות שניתן לעקר את הדיו על ידי פסטור ב-70°C ומעלה למשך 20s, טמפרטורות אלו משנות את הדיו באופן בלתי הפיך ומפחיתות את הצמיגות שלו בטמפרטורת ההדפסה (נתונים לא מוצגים). פסטור בטמפרטורה נמוכה יותר ולמשך זמן ארוך יותר ב-63°C למשך >1 h מפחית את הזיהום על ידי פטריות ומיקרואורגניזמים אחרים מבלי לשנות את הצמיגות המורכבת של הדיו בטמפרטורות המתאימות להדפסה. אפיון ראולוגי באמצעות ראומיטר המצויד בגיאומטריית קונוס-ופלטה של 25 mm הראה שלדיו הגולמי והמדפסטר היו צמיגויות דומות בטווח של מהירויות דפורמציה בטמפרטורות הדפסה (איור 4B), מה שמוכיח שהפסטור אינו פוגע ביכולת ההדפסה. דיו מפוסטר מאפשר גם תרבית כלי דם לטווח ארוך יותר ללא צורך בתרופות אנטי-מיקוטיות, שעלולות לשנות את התפקוד האנדותליאלי.
לאחר שהכלי עבר תהליך של התאבייה (cellularization), תאי אנדותל קונפלואנטיים צריכים לצפות את הכלי כולו, כפי שמוצג ב- איור 5, עם השלכה של עוצמה מקסימלית ב- איור 5A והחתך הרוחבי ב- איור 5Bלאחר מכן ניתן להעלות את זרימת המצע לקצבי גזירה פיזיולוגיים, אותם ניתן להעריך עבור כלי דם מעגליים בקירוב באמצעות משוואת Hagen-Poiseuille.79בפועל, ניתן להעריך את קצב הזרימה הדרוש להשגת מאמץ גזירה רצוי על ידי התחשבות בצמיגות המדיום ובהתנגדות המיקרופלואידית. בתרבית דו-ממדית טיפוסית in vitro, זרימת מדיום ב-12 dyn/cm²2גורם לרוב סוגי התאים האנדותליאליים להתמצא לאורך ציר הזרימה. ניתן להדמיא תגובה זו באמצעות צביעה פלואורסצנטית של F-actin באמצעות פאלוידין (איור 5D,E) או על ידי ניתוח של הציר גולג'י-גרעין (איור 5D,F), שניהם מראים אוריינטציה אניזוטרופית העולה בקנה אחד עם קיטוב אנדותליאלי, כפי שתואר בעבר18אף על פי שמאמצי גזירה העולים על 40 dyn/cm2 להתרחש in vivoתנאים כאלה לא מודלו כאן.
תוצאה מרכזית של גיאומטריה משתנה של כלי דם היא זרימה משתנה של נוזלים, אליה מגיבים תאי אנדותל באמצעות מספר מסלולי סיגנלינג80,81. קיימות מספר שיטות לניטור מהירות זרימת הדם, כולל אולטרסאונד דופלר 4D82, דימות תהודה מגנטית (MRI) של זרימה ב-4D83, ודימות ספקל לייזר (laser speckle imaging)84. למרות שטכניקות אלו מציעות יתרונות חשובים in vivo, הפרדה של הבדלי זרימה מקומיים לאורך כלי דם בודד עלולה להיות מאתגרת. יכולת הדימות בעלת הממספר האפטורה הגבוה של פלטפורמה זו מאפשרת מעקב ישיר אחר חלקיקים פלואורסצנטיים (איור 6B) ומיפוי ברזולוציה מרחבית גבוהה של אנומליות זרימה המושרה על ידי קימור כלי הדם באמצעות ולוקימטריה של תמונות חלקיקים (particle image velocimetry) (איור 6C). לדוגמה, נצפית זרימה איטית יותר לאורך הקימור הפנימי של כלי הדם מאשר לאורך הקימור החיצוני (איור 6C), דבר שעשוי לתרום לתגובות אנדותליאליות משתנות85.
לאחר שנוצר כלי דם קונפלואנטי (confluent), ניתן להעריך את הפתוחות (patency) ואת תפקוד המחסום על ידי פרפוזיה של מקרו-מולקולות המסומנות פלואורסצנטית, כגון דקסטראנים או חלבונים, דרך הלומן. כלי דם פתוחים המרופדים בתאי HUVECs עומדים בפני מעבר של דקסטראנים המסומנים פלואורסצנטית (איור 6D,F). לעומת זאת, חשיפה לגירויים המשבשים את מחסום הדימום, כגון TNFα מגביר דליפה של כלי דם (איור 6H, ג'ניתן להמחיש שיעורי דליפה מקומיים באמצעות ניתוח קימוגרף (איור 6EG,I,K). מכיוון שהקימוגרף (kymograph) מייצג מרחק בציר ה-X וזמן בציר ה-Y, ניתן להשוות שיעורי דליפה יחסיים על ידי כימות השיפועים של קווים המותאמים לעוצמות פלואורסצנציה מקטעות (איור 6E,G,I,Kניתוחים אלו מאפשרים להעריך כיצד גאומטריית כלי דם מקומית משפיעה על תפקוד מחסום האנדותל בתגובה לגירויים מוגדרים.
יתרון מרכזי של פלטפורמה זו הוא גישה מיקרוסקופית משופרת בהשוואה למה שניתן להשיג in vivo. המערכת מקלה גם על אנליזה אימונוהיסטוכימית של הארגון המולקולרי האנדותליאלי, ובמיוחד של שלד התא האקטיני. תאי אנדותל הם דקים מאוד ומוקפים in vivo על ידי תאי שריר חלק, דבר שעלול לסבך את איתורם של מבני שלד התא באופן ספציפי בתוך האנדותל. פלטפורמה זו מאפשרת צביעה והדמיה פשוטות של מולקולות היצמדות ואקטין פילמנטרי בתאי אנדותל (איור 5) ותומכת באנליזות רב-רכיביות הקשות לביצוע in vivo, כולל הערכה של קיטוב ואנדותליאלי וחלוקה תחת זרימה פיזיולוגית (איור 5D–F). שילוב של בדיקות אלו בפלטפורמה אחת מאפשר בחינה ישירה של הקשרים בין גיאומטריית כלי הדם, זרימה משתנה, תפקוד מחסום, ארגון מולקולרי אנדותליאלי והיצמדות בין-תאית.

איור 1: זרימת העבודה להדפסה ושימוש בכלי דם תלת-ממדיים על שבב. תרשים זרימה של הפרוטוקולים ליצירה ושימוש בכלי דם תלת-ממדיים על שבב. עיגולים שחורים מציינים את מספרי הפרוטוקול המתאימים. צבעי התיבות מציינים את הטמפרטורה שבה מבוצע כל פרוטוקול או את הטמפרטורה שבה הדגימה מוחדרת. זרימת העבודה כוללת מידול צורת כלי הדם, הכנת דיו, הכנת מטריצה חוץ-תאית (ECM), הכנת תא, הדפסת כלי דם, שטיפה וציפוי של כלי הדם, תאיזציה (cellularization), תרבית זרימה, בדיקות תפקודיות וניתוח היסטולוגי. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.

איור 2הדפסת כלי דם ותכנון תא. ניתן לתכנן כלי דם מ- in vivo דימויים כליים לשחזור גיאומטריות כליות ספציפיות למטופל. (A) כלי דם כלילי קטן שצולם באמצעות טומוגרפיה ממוחשבת (CT) עם חומר ניגוד, שוחזר באישור של Parekh et al.86 סרגל קנה מידה = 2 מ"מ. (Bמפת קואורדינטות של נקודות ייחוס מחלק של כלי הדם המוצג בלוח A, שהופקה באמצעות רישום נקודות ב-FIJI.C) פלט G-code שהופק ממפת הקואורדינטות באמצעות תוכנת בקרה למדפסת. קואורדינטות X, Y ו-Z מצוינות בפינה הימנית התחתונה. (ד') סכמה של תא Rose המכיל כלי דם מודפס בביו-הדפסה. העיצוב עם ברגי האצבע העליונים תואם לתא המודפס בתלת-ממד מפולילקטית חומצה (PLA). (ה_) תא Rose המכיל כלי קיבול ומאגרים שהודפסו באמצעות דיו ביולוגי זמני (sacrificial bioink) על לבישי זכוכית (coverslip) מצופה ECM. סרגל קנה מידה = 9 מ"מ. (F(סכימה של תא Rose המותאם למודל של מפרצת. חוט המשולב דרך מחטי הכניסה והיציאה משמש כתבנית לכלי הדם, ודיו ביולוגי להקרבה המונח על החוט משמש כתבנית למפרצת. (ג'(תא רוז (Rose chamber) המכיל את התיל ואת תבנית הביו-דיו (bioink) ההקרבית על זכוכית כיסוי מצופה ב-ECM. (ה׳מתאם לבמה של מיקרוסקופ מדפוס בתלת-ממד מחומר PLA (שמאל) ותא Rose (ימין), המספקים חלופות לרכיבי אלומיניום מעובדים. סביבות מתכת על המתאם לבמה מקובעות ללוח המתאם. סרגל קנה מידה = 30 מ"מ.I) כלי מודפס שנשטף, בתוך תא Rose מאלומיניום המותקן על במה של מיקרוסקופ, עם מחטי כניסה ויציאה וצינוריות מחוברות. סרגל קנה מידה = 20 מ"מ. קיצורים: CT = טומוגרפיה ממוחשבת; ECM = מטריצה חוץ-תאית; PLA = חומצה פולילקטית. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.

איור 3: מערכת זרימת נוזלים עבור כלי דמי תאי (cellularized vessel) בתא Rose. (A) סכימה של תצורת הצנרת המשמשת להקמת זרימת נוזלים דרך תא Rose המכיל כלי דמי תאי. החיצים מצביעים על כיוון הזרימה. הרכיבים המסומנים במספרים הם (1) משאבה פריסטלטית, (2) ברזים שלוש-דרכי (three-way stopcock) עם מזרק להחלאה (priming), (3) מלכוד בועות, (4) משכך דופקים, (5) התקן הכלי, ו-(6) מאגר מצע. כל הרכיבים הבאים במגע עם מצע התרבית עוברים סטריליזציה לפני השימוש. (B) מערכת זרימת נוזלים המכילה כלי דמי תאי בתא Rose בתוך אינקובטור לתרביית רקמות. המספרים תואמים לרכיבים המוצגים בפאנל A. מחטי הכניסה והיציאה מקובעות בסרט דביק ליציבות. סרגל קנה מידה = 40 mm. אנא לחצו כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: אפיון ריאולוגי של הביו-דיו ההקרבתי. (A) צמיגות גזירה של דיו Pluronic F127 25%/polyethylene oxide (PEO) 1% לא פסטוריזציה כפונקציה של קצב הגזירה בטמפרטורות של 5 °C, 10 °C, 14.4 °C, 15 °C ו-23 °C. (B) צמיגות מורכבת כפונקציה של תדר זוויתי עבור דיו Pluronic F127/PEO פסטוריזציה ולא פסטוריזציה ב-25 °C ו-37 °C. קיצור: PEO = polyethylene oxide. אנא לחצו כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5דימות ואנליזה כמותית של כלי דם מקובעים וצבועים שעברו אנדותליזציה. (A) הקרנה של עוצמה מקסימלית (Maximum-intensity projection) של תמונות פלואורסצנציה במיקרוסקופ קונפוקלי עם דיסקים מסתובבים (spinning-disk) של כלי דם שעבר סלולריזציה מלאה לאחר זריעה ראשונית ותרבית תחת מאמץ גזירה נמוך (1 dyn/cm2)2. הכלי נצבע עבור VE-cadherin (ירוק), F-actin (אדום), ו-DNA באמצעות DAPI (כחול). סרגל קנה מידה = 50 µm. (Bחתך רוחבי משוחזר במישור xz של z-stack של תמונות פלואורסצנציה במיקרוסקופ קונפוקלי עם דיסקים מסתובבים (spinning-disk), של כלי דם שעבר תהליך של cellularization מלא וצבעו בפלואידין פלואורסצנטי לסימון F-actin (באדום). סרגל קנה מידה = 50 µm. (Cהטלה של עוצמה מקסימלית (Maximum-intensity projection) של z-stack של תמונות פלואורסצנציה במיקרוסקופ קונפוקאלי עם דיסקה מסתובבת (spinning-disk) של כלי דם תאי מלא לאחר 24 שעות של זרימה ב-12 dyn/cm²2. F-actin סומן באמצעות פאלואידין פלואורסצנטי (אדום). סרגל קנה מידה = 100 µm. (ד'תמונת פלואורסצנציה קונפוקלית בשיטת דיסק מסתובב (Spinning-disk) של אזור כלי דם לאחר 24 שעות של תרבית תחת מאמץ גזירה של 16 dyn/cm2הכלי נצבע עבור VE-cadherin (צהוב), F-actin (מגנטה), סמן הגולג'י GM130 (ירוק), ו-DNA באמצעות DAPI (כחול). החץ מציין את כיוון הזרימה. סרגל קנה מידה = 30 µm. (ה_) כימות מייצג של הת方向 הממוצע של סיבי מאמץ (stress-fibers) מערוץ ה-F-actin בפאנל D באמצעות FibrilTool74. רשת של 45 אזורים, שכל אחד מהם בעל שטח של 1,600 µm2, נותח, והכיון הממוצע של הסיבים מוצג כהיסטוגרמה רדיאלית ביחס לכיוון הזרימה. (F) כימות מייצג של ציר הגרעין-גולג'י מלוח D כמדד לקטביות של תאי אנדותל. וקטורים ממרכזו של כל גרעין למרכזו של מכשיר גולג'י התואם מוצגים כהיסטוגרמה רדיאלית ביחס לכיוון הזרימה; n = 75 וקטורים. קיצור: DAPI = 4′6-דיאמידינו-2-פנילינדול, DAPI אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.

איור 6: ניתוח זרימת נוזלים ודליפה וסקולרית. (A) תרשים של גאומטריית כלי הדם ששימשה לניתוחים בפאנלים B–K. אותיות מציינות את אזורי כלי הדם המקורבים המתאימים לפאנלים הרלוונטיים. (B) השלכה זמנית מקודדת בצבע של רצף תמונות פלואורסצנציה במיקרוסקופ קונפוקאלי עם דיסק מסתובב (spinning-disk) בשיטת time-lapse, המראה חרוצים פלואורסצנטיים נעים תחת זרימה דרך אזור כלי דם מעוקל. הצבע מציין את מספר הפריים מ-1 עד 100; הקימורים החיצוניים והפנימיים מסומנים. (C) ניתוח ולוסימטריית תמונת חלקיקים (PIV) המראה מהירות זרימה יחסית לאורך אזור כלי הדם המעוקל. צבעים מייצגים מהירות יחסית, וחצים מציינים את כיוון הזרימה ועוצמתה. סרגל קנה מידה = 50 µm. (D–G) בדיקת מחסום וסקולרי מייצגת של כלי דם לא מטופל שבו הוזרק דקסטראן 10 kDa המסומן ב-Alexa 647. (D,D′,D″) תמונות של אזור כלי דם ישר שצולמו ב-0, 70 ו-150 דקות, בהתאמה. הקו הלבן מציין את האזור ששימש לקיימוגרף בפאנל E. (E) קיימוגרף של האזור הישר בפאנל D המראה קצב דליפה של 0.39 µm/min, שהוא השיפוע של הקו המקווקו. (F,F′,F″) תמונות של אזור כלי דם מעוקל שצולמו ב-0, 70 ו-150 דקות. הקו הלבן מציין את האזור ששימש לקיימוגרף בפאנל G. סרגל קנה מידה = 150 µm. (G) קיימוגרף של האזור המעוקל בפאנל F המראה קצב דליפה של 1.01 µm/min, שהוא השיפוע של הקו המקווקו. (H–K) בדיקת מחסום וסקולרי מייצגת לאחר דגירה מוקדמת עם 250 ng/mL של tumor necrosis factor alpha (TNFα). (H,H′,H″) תמונות של אזור כלי דם ישר שצולמו ב-0, 200 ו-400 דקות, בהתאמה. הקו הלבן מציין את האזור ששימש לקיימוגרף בפאנל I. סרגל קנה מידה = 250 µm. (I) ניתוח קיימוגרף של אזור כלי הדם הישר בפאנל H מראה קצב דליפה של 2.1 µm/min, שהוא השיפוע של הקו המקווקו. (J,J′,J″) תמונות של אזור כלי דם מעוקל שצולמו ב-0, 200 ו-400 דקות. הקו הלבן מציין את האזור ששימש לקיימוגרף בפאנל K. סרגל קנה מידה = 250 µm. (K) ניתוח קיימוגרף של אזור כלי הדם המעוקל בפאנל J מראה קצב דליפה של 6.7 µm/min, שהוא השיפוע של הקו המקווקו. כוכביות בפאנלים D–K מסמנות את הקצוות המתאימים של הקווים ששימשו ליצירת הקיימוגרפים. קיצורים: PIV = particle image velocimetry; TNFα = tumor necrosis factor alpha. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור משלים 1: הדפסת כלי דם באמצעות תכנות מדפסת מבוסס STL. (A) תמונת ניגודיות הפרעה דיפרנציאלית (Differential interference contrast) של כלי דם מודפס שנוצר באמצעות תכנות מדפסת מבוסס STL, המכוון את ראש המדפסת לבצע שתי מעברים, ובכך יוצר מבנה כלי דם קלוע. סרגל קנה מידה = 250 µm. (B) הדמיה תלת-ממדית של כלי הדם הקלוע לאחר שטיפה, המלאה ב-bovine serum albumin (BSA) המסומן ב-Alexa 647. ניתן לראות מרווח בין הלומנים של שני הגדילים הקלועים. סרגל קנה מידה = 100 µm. קיצורים: BSA = bovine serum albumin; STL = standard tessellation language. אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 1: G-code להדפסת כלי המכיל. אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 2: שרטוט CAD של תא ה-Rose. אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.
קובץ משלים 3: שרטוט CAD של מתאם הרכבת הבמה. נא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.
מתוארת מערכת חסונה למידול גיאומטריות של כלי דם הקשורות לזרימה מופרעת, כולל כלי דם מפותלים, מפרכיות (aneurysms) ונקודות פיצול. השיטה תומכת בדימות ברזולוציה גבוהה, במיפוי זרימה ובהערכת תפקוד מחסום כלי הדם בתוך פלטפורמה הנגישה לביולוגים של תאים עם ניסיון מוגבל בביו-הנדסה. אף על פי שהגישה העיקרית דורשת מדפסת ביו, מדפסות מבוססות דחיסה (extrusion) הזמינות מסחרית נעות בין מערכות בקוד פתוח לפלטפורמות מתקדמות יותר בעלות ראשי הדפסה מרובים. יכולות מפתח של המדפסת כוללות בקרה על טמפרטורת ראש ההדפסה והדיו, ויסות לחץ מדויק וטמפרטורת מיטת ההדפסה. בנוסף לכלי דם מפותלים ומסועפים שהודפסו בביו, השיטה כוללת גם מודל של מפרכית שניתן לייצר ללא מדפסת ביו. יחד, גישות אלו מקלות על חקירת תפקוד תאי אנדותל בכלי דם מפותלים באמצעות שיטות מיקרוסקופיה הזמינות בדרך כלל במעבדות לביולוגיה של תאים.
מערכות מודל in vitro רבות זמינות לחקר תפקוד כלי דם87,88, שלכל אחת מהן נקודות חוזק ומגבלות מובחנות. המערכת המתוארת כאן, המותאמת מעבודות קודמות54,67,69, מתאימה במיוחד לבחינת ההשפעות של עקמומיות כלי הדם (vascular tortuosity) על התפקוד האנדותליילי, מכיוון שהיא מאפשרת מידול ישיר של גאומטריה של כלי דם המופקת מחולים ושינוי שיטתי של עקמומיות כלי הדם בתוך התקן בודד. גישות אחרות מידלו כלי דם כליליים של חולים באמצעות ג'לטין מתאקרילט פוטו-פולימריזבילי כדי ליצור מבני כלי דם מוקטנים תחת זרימה פיזיולוגית60. מערכות כאלה מציעות מידול מדויק של כלי דם, ניתוח זרימה ואפשרות לשילוב שכבות של tunica media. עם זאת, גודלן הכללי והצורך בתמיכת זכוכית עלולים להגביל דימות ברזולוציה גבוהה ובדיקות דליפה מקומיות. לעומת זאת, מערכות קטנות יותר המבוססות על הרכבה עצמית של תאי אנדותל המופקים מ-iPSC מאפשרות דימות ברזולוציה גבוהה ויכולות לשלב הן תאי אנדותל והן תאי שריר חלק של כלי דם89. מודלים אלה, לעומת זאת, מספקים פחות שליטה על גאומטריית כלי הדם, ויצירת קצבי זרימה ומסחף (shear rates) גבוהים עלולה להיות מאתגרת. לפיכך, המערכת הנוכחית מייצגת גישה בינונית מעשית המשלבת גאומטריית כלי דם מוגדרת עם דימות ברזולוציה גבוהה של עקמומיות כלי הדם.
יתרון מרכזי של פלטפורמה זו הוא היכולת לייצר כלי דם המכילים אזורים מעוקלים וישרים כאחד, מה שמאפשר השוואה ישירה של גאומטריית כלי דם מקומית בתוך אותה דגימה בעוד שמשתנים ניסיוניים אחרים נותרים קבועים, כפי שמוצג ב-איור 6. יתרון נוסף הוא היכולת להשתמש בדימויים של כלי דם מהחולה, שהתקבלו באמצעות אנגיוגרפיה או CT עם חומר ניגוד. המגבלה העיקרית בשחזור של כלי דם של מטופלים היא הגודל. קשה להדפיס באופן הדיר כלי דם שקוטרם קטן מ-150µm, בעוד שקטעי כלי דם המשתרעים מעבר למספר סנטימטרים דורשים תאי הרכבה גדולים יותר. כמו כן, קטעי כלי דם צריכים להישאר שטוחים יחסית במימד השלישי כדי שניתן יהיה להדפיסם על שכבת מטריצת הבסיס ולשמרם בתוך מרחק העבודה של עדשת העדשה במהלך דימוי מיקרוסקופי.
בעבודות עתידיות, ניתן יהיה לשנות את המערכת המתוארת כאן כדי לדגמן מחלות כגון atherosclerosis, שבהן גיאומטריית כלי הדם עשויה לתרום לפתופיזיולוגיה. ניתן יהיה לשלב תאים אנדותליאליים שעברו שינוי גנטי או סוגי תאים נוספים, כולל תאי שריר חלק ותאי מערכת החיסון, כדי להגביר את המורכבות הפיזיולוגית. שילוב של תאי שריר חלק מתחת לשכבה האנדותליאלית, כפי שהודגם במערכות פשוטות יותר, עשוי לספק תובנה נוספת לגבי אינטראקציות בין שריר חלק לאנדותליום בעקמומיות של כלי דם ובמחלות90. שינויים נוספים עשויים לכלול תאי גידול כדי לחקור intravasation68,91, ואת השפעת העקמומיות על תהליך זה. ניתן להשתמש בפלטפורמה גם כדי לבחון כיצד זרימה מופרעת משנה תגובות דלקתיות92,93 ועשוי להשפיע על סיבוכים וסקולריים הקשורים לזיהומים כגון COVID-1994. בהתחשב במעורבות הרחבה של מערכת כלי הדם בבריאות ובמחלות אנושיות, מערכות נגישות כזו עשויות להקל על חקירה נוספת של התפקוד האנדותליאלי בהקשרים של מחלות מגוונות.
התוכן הוא באחריותם הבלעדית של המחברים ואינו מייצג בהכרח את העמדות הרשמיות של המכונים הלאומיים לבריאות (National Institutes of Health). המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי אינטרסים פיננסיים.
המחברים מעוניינים להודות לחברי המעבדה של Jennifer Lewis באוניברסיטת הרווארד על עצתם בשלבי החקירה המוקדמים של עבודה זו, ולחברי המעבדה של Waterman על המשוב והעצות.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| (3-Aminopropyl)trimethoxysilane (APTMS), 97% | Sigma-Aldrich | 281778 | משמש לסילניזציה ולהפעלה של לוחות כיסוי מזכוכית לפני הצמדת ECM. |
| מזרק סטרילי 1mL | Fisher Scientific | 14-823-434 | משמש להגשת ריאגנטים, ציפוי כלי והעברת נוזלים. |
| 1xPhosphate-buffered saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | J61196.AP | משמש להכנת ריאגנטים, שטיפה ושטיפת כלים. |
| מזרק סטרילי 10mL | Fisher Scientific | 14-955-459 | משמש להכנת ריאגנטים והעברת נוזלים. |
| מבחנות קוניות 15mL עם פקק | Fisher Scientific | 05-538-59A | משמשות להכנת ריאגנטים, טיפול בתאים ואחסון תמיסות. |
| צלחת פטרי מפוליסטירן 150mm | Fisher Scientific | FB0875714 | משמשת כמיכל עבודה או אינקובציה סטרילי. |
| מחט 21G | Fisher Scientific | 14-817-227 | משמשת להכנת תבנית כלי וגישה לתא. |
| מחט 23G | Fisher Scientific | 14-817-237 | משמשת לחיבורי כניסה ויציאה של הכלי במהלך שטיפה ופרפוזיה. |
| מחט חלוקה שקופה ומסועפת 27G | Nordson | 7018417 | משמשת להחצנת דיו מקריב וויזואליזציה של בועות אוויר במהלך ההדפסה. |
| מזרק סטרילי 3mL | Fisher Scientific | 14-955-459 | משמש להעברת נוזלים והגשת ריאגנטים. יש לאמת את מספר הקטלוג כיוון שהמספר שסופק מופיע גם עבור המזרק של 10 mL. |
| חוט מנדריל רפואי מפלדת אל-חלד 304, בקוטר 0.0190 in | Component Supply | GWX-0190-36 | משמש כתבנית נשלפת עבור הלומן הישר במודל המפרצת מבוסס החוט. |
| מבחנות קוניות 50mL עם פקק | Fisher Scientific | 05-526B | משמשות להכנה, ערבוב, פסטוריזציה ואחסון של ריאגנטים. |
| Alexa 488 anti-mouse secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A32723TR | נוגדן משני פלואורסצנטי המשמש לצביעה אימונוהיסטוכימית. |
| Alexa 555 anti-rabbit secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-21428 | נוגדן משני פלואורסצנטי המשמש לצביעה אימונוהיסטוכימית. |
| Alexa 647-labeled bovine serum albumin | Thermo Fisher Scientific | A34785 | סמן מקרו-מולקולרי פלואורסצנטי המשמש לבדיקות מחסום/דליפה וסקולאריתים. |
| Alexa 647-labeled dextran, 10 kDa | Thermo Fisher Scientific | D22914 | סמן פלואורסצנטי המשמש להערכת תפקוד מחסום אנדותליאלי ודליפה וסקולאריתית. |
| Alexa 647-phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A22287 | משמש לסימון פלואורסצנטי של F-actin לצורך דימות של השלד התאי וניתוח אוריינטציה. |
| Albumin, bovine serum, Fraction V, fatty acid-free | Sigma-Aldrich | 126575-10GM | משמש לחסימה והכנת תמיסות המכילות חלבון. |
| Antibiotic-Antimycotic, 100x | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | תוסף אנטי-מיקרוביאלי אופציונלי עבור ECM ומצע גידול. |
| Anti-GM130 antibody, clone 4A3 | Sigma-Aldrich | MABT1363 | נוגדן ראשוני המשמש לסימון מנגנון גולג'י לצורך ניתוח קוטביות אנדותליאלית. |
| Anti-VE-cadherin rabbit monoclonal antibody, D87F2 | Abcam | 65707 | נוגדן ראשוני המשמש לוויזואליזציה של צומת תא-תא אנדותליאלי. |
| Calcium chloride | Sigma-Aldrich | C7902 | משמש בהכנת ECM ובבופרי קיבוע. יש לוודא אם הריאגנט המיועד הוא סידן כלורי ללא מים (anhydrous) או הידרטי. |
| ערכת מחברים | World Precision Instruments | 504954 | מחברי Luer-to-tubing המשמשים להרכבת מעגל הפרפוזיה מיקרו-פלואידי. |
| מעמד לצביעת לוחות כיסוי | Electron Microscopy Sciences | 72240 | משמש להחזקת לוחות כיסוי במהלך ניקוי, סילניזציה, הפעלה ושטיפה. |
| D-(+)-Glucose | Sigma-Aldrich | G7021-100G | מרכיב של בופר הפרמבליזציה המשמש במהלך צביעה אימונוהיסטוכימית. |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | 62248 | צבע גרעיני פלואורסצנטי המשמש לדימות תאים וניתוח קוטביות. |
| פלטת חימום דיגיטלית | Fisher Scientific | 11-475-028 | משמשת לשמירת תא הכלי והריאגנטים בטמפרטורה של כ-37 °C במהלך ההרכבה. |
| EGTA tetrasodium salt | Sigma-Aldrich | E8145-10G | חומר קילטי המשמש בבופר הפרמבליזציה. |
| מחבר Luer נקבי עם שיניים עבור צינורית ב-ID של 1/16 in | Scientific Commodities Inc. | BB330A | משמש לחיבור צינוריות בתוך המעגל המיקרו-פלואידי. |
| Female Luer with 1/16 in ID barb, CrystalVu QC | Fisher Scientific | 01-000-123 | משמש לחיבורי צינוריות ותא-כלי. |
| Fibrinogen | Sigma-Aldrich | F8630 | מרכיב ECM המשמש עם ג'לטין ותרומבין ליצירת ההידרוג'ל התומך בכלי. יש לוודא מקור: כתב היד מתאר פיברינוגן מפלזמה אנושית, בעוד שהטבלה שסופקה מציינת פלזמה בקרים. |
| משכך דופק נוזלי | Darwin Microfluidics | SE-D1606-3NB-PC-31 | משמש להפחתת תנודות פולסטיליות הנוצרות על ידי משאבה פריסטלטית. |
| רצועת גומי סיליקון עמידה לטמפרטורות גבוהות לתעשיית המזון | McMaster-Carr | 8417K51 | משמשת לייצור האטם עבור תא Rose. |
| Gelatin from porcine skin, gel strength 300, Type A | Sigma-Aldrich | G2500 | מרכיב ECM עיקרי המשמש ליצירת ההידרוג'ל המקיף את לומן הכלי. |
| לוח כיסוי מזכוכית, מס' 1.5 | VWR | EN-MAS-25X25-1-5-CS | מצע למיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה ומשטח תא. |
| Glutaraldehyde, 25% | Electron Microscopy Sciences | 16220 | מהול לצורך הפעלת לוח הכיסוי לפני הצמדת ECM. |
| Growth Kit-BBE | ATCC | PCS-100-040 | ערכת תוספים המשמשת עם מצע בסיסי לתאים וסקולאריים לתרבית תאים אנדותליאליים. |
| Growth Kit-VEGF | ATCC | PCS-100-041 | תוסף לצמיחה אנדותליאלית המשמש עם מצע בסיסי לתאים וסקולאריים בעת הצורך. |
| Human plasma fibronectin | Sigma-Aldrich | FC010 | ציפוי ECM לומנלי אופציונלי המשמש לקידום הצמדה אנדותליאלית. |
| סגור צינוריות בקו (Inline) | Sigma-Aldrich | Z503371-1PAK | משמש להפסקה וויסות של זרימה דרך צינוריות במהלך מניפולציה של התא ואינקובציה. |
| משאבה פריסטלטית Ismatec Reglo Digital | Masterflex | 78018-12 | משמשת ליצירת זרימה מבוקרת של נוזלים דרך כלים תאיים. |
| Laminin | Sigma-Aldrich | L2020-1MG | ציפוי ECM לומנלי אופציונלי לשינוי של אדהזיה וקיטוב אנדותליאליים. |
| ערכה מגוונת של מחברי Luer-to-tubing | World Precision Instruments | 504954 | משמשת לחיבור צינוריות, מזרקים ורכיבי כניסה/יציאה של התא. כפיל של מספר קטלוג של connector-kit; השאר רשומה אחת אם הן זהות. |
| Magnesium chloride hexahydrate | Sigma-Aldrich | M2393-100G | מרכיב של בופרי קיבוע והפרמבליזציה. |
| מחבר Luer זכרי עם שיניים עבור צינורית ב-ID של 1/16 in | Scientific Commodities Inc. | BB329A | משמש לחיבורי צינוריות מיקרו-פלואידיים. |
| מחבר Luer זכרי, 1/16 in ID | World Precision Instruments | 13160-100 | משמש לחיבור צינוריות למזרקים ומרכיבי תא. |
| Matrigel | Sigma-Aldrich | CLS356234-1EA | ציפוי ECM לומנלי אופציונלי המשמש להצמדה אנדותליאלית. |
| פקקים לבקבוקי מדיה | Fisher Scientific | 05-719-310 | פקקים בעלי שני פתחים המשמשים לבניית מאגרי מצע גידול סטריליים עבור מעגל הזרימה. |
| Nalgene Pharma-Grade silicone tubing, 1/16 in ID | Thermo Fisher Scientific | 8600-0020 | צינוריות גמישות המשמשות במעגלי הפרפוזיה והשטיפה המיקרו-פלואידיים. |
| Parafilm | Electron Microscopy Sciences | 70990-125 | משמש כמשטח לא-דביק במהלך פולימריזציה של ציפויי ECM על לוחות כיסוי. |
| PBS, 10x, pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 70011044 | בופר מרוכז המשמש להכנת תמיסות PBS לעבודה. |
| Penicillin/Streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | תוסף אנטיביוטי המשמש במצע גידול אנדותליאלי ובתמיסות שטיפה. |
| PIPES | Sigma-Aldrich | P1851-25G | מרכיב בופר של תמיסת הפרמבליזציה. |
| Pluronic F-127 | Sigma-Aldrich | P2443 | מרכיב תגובתי לטמפרטורה של דיו ההדפסה המקריב. |
| ברז הפסקה תלת-כיווני מפוליקרבונט עם Luer זכרי | Fisher Scientific | NC9593742 | משמש להכנה (priming), החלפה ובקרת נתיבי נוזלים במעגל הפרפוזיה. |
| Polyethylene oxide (PEO) | Sigma-Aldrich | 372781 | מרכיב פולימרי של פורמולציית הדיו המקריב. |
| מערבל סיבובי | Fisher Scientific | 88861050 | משמש לערבוב דיו מקריב PEO/Pluronic ב-4 °C. |
| צלחת צביעה ליחידות סלייד | MSE Supplies | DWK90020 | משמשת לשטיפה, צביעה או אינקובציה של ריאגנטים ללוחות כיסוי. |
| זכוכית כיסוי מרובעת, מס' 2, 25mm x 25mm | Sigma-Aldrich | CLS285525-1000EA | לוח כיסוי לתא; זכוכית עבה יותר מס' 2 מספקת עמידות מוגברת לשבירה ותואמת לעדשות אוויר או מים מתאימות. |
| מחט חלוקה קהה מפלדת אל-חלד, 21 G, 1 in | Component Supply | NE-212PL | משמשת להגשת נוזלים או לבניית מודל כלי מבוסס תבנית חוט. |
| יחידות מסנן ואקום Steriflip | MilliporeSigma | SE1M179M6 | משמשות לסינון סטרילי של ג'לטין חם ותמיסות תואמות אחרות. |
| מזרקים פלסטיים סטריליים 5mL | Allevi | PSYR5-S | משמשים לטעינת דיו מקריב להדפסת החצנה פנאומטית. |
| Thrombin, human plasma, high activity | Sigma-Aldrich | 605195 | משמש להפעלת פולימריזציית פיברין במהלך יצירת ג'ל ECM. |
| Transglutaminase | Moo Gloo | 1201 | אנזים לקשירה המשמש במהלך הכנה ושינוי של ECM מסוג ג'לטין/פיברין. |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | 648466 | דטרגנט המשמש להפרמבליזציה של תאים אנדותליאליים לפני צביעה אימונוהיסטוכימית. |
| TrypLE Express Enzyme, 1x, phenol red | Thermo Fisher Scientific | 12605010 | ריאגנט לפירוק תאים המשמש לקצירת תאים אנדותליאליים לפני זריעתם בכלי. |
| Tween 20 | Sigma-Aldrich | 11332465001 | מרכיב דטרגנט של בופר החסימה לצביעה אימונוהיסטוכימית. |
| Vascular Cell Basal Medium | ATCC | PCS-100-030 | מצע בסיסי המשמש לתרבית תאים אנדותליאליים וניסויי פרפוזיה. |