פרוטוקול זה מציג את ההקמה והתפעול של ביו-ראקטור רשום במטרה לבצע מחקרי מכנו-אימונו-מודולציה. כאן, באמצעות ביו-ראקטור מותאם אישית המשחזר כוחות פיזיולוגיים, אנו מדגימים כי מקרופאגים מפתחים תגובה פרו-דלקתית מובהקת לגירוי מכני.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מציג את ההקמה והתפעול של ביו-ראקטור רשום במטרה לבצע מחקרי מכנו-אימונו-מודולציה. כאן, באמצעות ביו-ראקטור מותאם אישית המשחזר כוחות פיזיולוגיים, אנו מדגימים כי מקרופאגים מפתחים תגובה פרו-דלקתית מובהקת לגירוי מכני.
דלקת היא תהליך מורכב המניע מחלות חריפות וכרוניות כאחד. היא מווסתת על ידי רצפים של אותות ביוכימיים וביופיזיים המובילים להפעלת תאי מערכת החיסון. מקרופאגים הם סוג תאי חיסון מרכזי המעורב במצבים דלקתיים מרובים, כולל סרטן, פיברוזיס ומחלות אוטואימוניות. שיטות מסורתיות לחקר הפעלת מקרופאגים כוללות גירוי ביוכימי באמצעות אותות מוגדרים של ציטוקינים או קמיוקינים, המפעילים את המקרופאגים לעבר מצב פרו-דלקתי או אנטי-דלקתי. עדויות חדשות מצביעות על כך שגם לאותות ביופיזיים יש תפקיד בהפעלת מקרופאגים, בנוסף לאותות הביוכימיים ברקמות. אחד מאותם רמזים מכניים השכיחים הוא פריסטלטיקה, המורכבת ממאמץ רב-צירי וממאמץ גזירה, המתרחשת בדרכי העיכול, ברחם, בדרכי הנשימה המתפתחות ובשופכנים. כאן, בחנו את ההשערה שפריסטלטיקה עשויה להפעיל מקרופאגים. בפרוטוקול זה, מתואר השימוש בביוריאקטור פריסטלטי לחקר ההפעלה המכנית של מקרופאגים. ממברנות של Polydimethyl siloxane קוסינו בפיברונקטין כדי להגביר את היצמדות המקרופאגים. מקרופאגים ממח עצם של עכברים שהם תאים מוכנסי תמימות (iBMDM) נזרעו על ממברנות מצופות בפיברונקטין ונשמרו כביקורות סטטיות או נחשפו לפריסטלטיקה למשך 4 h. הפריסטלטיקה הפעילה את המקרופאגים, עם הבדלים משמעותיים בביטוי הגנים של Il6 (פי 50.9 לעומת ביקורות סטטיות; p < 0.0001, t-test) ו-Nos2 (פי 19.8 לעומת ביקורות סטטיות; p = 0.0046). באופן מעניין, לא נצפו שינויים משמעותיים ב-Chil3 (פי 1.22 לעומת ביקורות סטטיות; p = 0.9726) או ב-Mrc1 (פי 1.16 לעומת ביקורות סטטיות; p = 0.9810) בהשוואה לביקורות סטטיות, מה שמעיד על כך שהגורמים המכניים הניעו בעיקר הפעלה פרו-דלקתית. הממצאים הנוכחיים תומכים בקונספט של מכנו-אימונומודולציה של מקרופאגים, במיוחד בתגובה למכניקת פריסטלטיקה השכיחה ברקמות רבות המבוססות על שריר חלק.
מקרופאגים הם תאי מערכת חיסון מולדת הממלאים תפקידים חיוניים בהגנת המאחס, בעיצוב מחדש של רקמות ובויסות הדלקת באמצעות פגוציטוזה והפרשת ציטוקינים1,2,3,4. בהתאם לגירויים בתוך המיקרו-סביבה in vivo, מקרופאגים לא מובחנים (M0) יכולים לעבור קיטוב פלסטי לעבר פנוטיפים פרו-דלקתיים (M1) או אנטי-דלקתיים/פרו-רגנרטיביים (M2)5,6. מודלים in vitro משמשים בדרך כלל לבידוד הגירויים השונים הללו, על מנת להבין טוב יותר את המכניזמים המורכבים המניעים את קיטוב המקרופאגים. מקרופאגים M1 המופעלים באופן קלאסי מודעים בדרך כלל in vitro על ידי גירויים ביוכימיים כגון ליפופוליסכריד (LPS) ואינטרפרון גמא (IFN-γ), מה שמוביל לביטוי מוגבר של מתווכים דלקתיים, כולל סינטטאז חנקן חמצני הניתן להשראה (iNOS), אינטרלוקין-6 (IL6) וגורם נמק גידול אלפא (TNF-α)7,8. מקרופאגים M2 המופעלים באופן חלופי מודעיםים בדרך כלל באמצעות חשיפה לאינטרלוקין-4 (IL-4) ולאינטרלוקין-13 (IL-13), המעודדים תגובות של עיצוב מחדש של רקמות וריפוי פצעים8,9. מקרופאגים M2 מחולקים בהמשך לפנוטיפים M2a, M2b ו-M2c, על בסיס מסלולי הפעלה נפרדים ופרופילים של ביטוי סמני פני שטח10,1. בעוד שהוויסות הביוכימי של קיטוב מקרופאגים אופיין רבות הן במערכות in vivo והן במערכות in vitro, מקרופאגים שוהים בתוך מיקרו-סביבות דינמיות מאוד המכילות גם גירויים ביופיזיים משמעותיים12. בנוסף לציטוקינים וכימוקינים מסיסים, מקרופאגים חשופים למטריצה חוץ-תאית ואינטראקציות בין-תאיות, קשיחות של תשתית, מאמץ גזירה של נוזלים, לחץ הידרוסטטי ועיוות רקמה מחזורי12,13,14. ככליים רגישים למכניקה, מקרופאגים יכולים לשנות את הפנוטיפים הדלקתיים שלהם בתגובה לרמזים פיזיים אלה, מה שמדגיש את חשיבותה של המכננביולוגיה בוויסות החיסוני.
גוף ספרות הולך וגדל הוכיח כי גירויים מכניים מבודדים in vitro יכולים להשפיע באופן משמעותי על מצבי הפעלה של מקרופאגים (איור 1). חשיפה לתשתיות קשיחות יותר הגבירה את הקיטוב למצב M1 ואת ייצור ציטוקינים דלקתיים בהשוואה לתשתיות רכות יותר, אשר השרו פנוטיפ פרו-רגנרטיבי15,16,17,18,19,20. באופן דומה, מאמץ גזירה של נוזלים מווסת את הפנוטיפ של המקרופאגים באופן התלוי בעוצמה, כאשר רמות נמוכות של זרימת נוזלים בינרקומיות מקדמות לרוב הפעלה פרו-רגנרטיבית21,2, בעוד שמאמצי גזירה גבוהים יותר, הדומים לערכים הנצפים בעורקים, עשויים להשריץ תגובות פרו-דלקתיות23,24,25,26,27,28. מודלים של מתיחה מחזורית in vitro שנועדו לחקות מכניקה של רקמות שלד-שריר, שריר לב, ריאה ומעי, הדגימו גם הם ביטוי מוגבר של מתווכים דלקתיים, אם כי התוצאות משתנות בהתאם לעוצמה, למשך, לתדירות ולמימדיות של הכוח המופעל29,30,31,32. יתרה מכך, הרגישות המכנית של מקרופאגים שונה בין מינים ומקור תאים שונים, דבר המדגיש את החשיבות של בחירת מודלים ניסיוניים מתאימים למחקרי מכנוביולוגיה13,14.

איור 1סכימה הממחישה את ה- in vitro גירויים ביוכימיים וביופיזיקליים להפעלת מקרופאגים למצבים פרו-דלקתיים או פרו-רגנרטיביים. ניתן לעורר מקרופאגים למצב פרו-דלקתי in vitro על ידי הוספת גירויים כימיים, ליפופוליסכריד (LPS), אינטרפרון גמא (IFN-γ), או חשיפה לגירויים מכניים, הכוללים מאמץ גזירה, קשיות מוגברת, מאמץ השרה הנגרם ממתיחה חד-צירית סטטית ומחזורית גבוהה, דחיסה ומאמץ השרה הנגרם מדחיסה רב-צירית. ניתן לעורר מקרופאגים למצב פרו-רגנרטיבי על ידי in vitro הוספה של גירויים כימיים, Interleukin-13 (IL-13) ו-IL-4. הם יכולים להפוך גם לפרו-רגנרטיביים (מעודדי התחדשות) כאשר הם נחשפים לגירויים מכניים בצורה של מאמץ גזירה תנודתי, זרימה אינטרסטיציאלית, תשתיות רכות או רמות נמוכות של מאמץ מחזורי חד-צירים. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.
בנוסף לחקר גירויים מכניים מבודדים באופן עצמאי, חשוב להבס את העבודה הזו כדי להתחיל לבחון את ההשפעה של כוחות פיזיקליים משולבים, בהינתן שמאקרופאגים in vivo חשופים בדרך כלל לשילובים של כוחות סימולטניים. פריסטלטיקה מייצגת סביבה מכנית מורכבת אחת own כזו, המורכבת ממאמץ מחזורי רב-צירי וסרט ומסרטזזת של זרימה (fluid shear stress) הנוצרים כתוצאה מכיווץ שריר חלק33. מכניקות אלו קיימות במספר מערכות איברים, כולל מערכת העיכול, דרכי נשימה בהתפתחות, כלי דם, רחם ושופכנים34,35,36. באופן משמעותי, התפקוד הפריסטלטי לוקה לעיתים קרובות בבקרת לקויה במחלות דלקתיות, כולל פיברוזיס, מחלות מעיים דלקתיות, סרטן והפרעות של עיצוב מחדש של דרכי הנשימה (airway remodeling), אשר כולן כרוכות בדלקת משמעותית המתווכת על ידי מאקרופאגים3,37,38,39. למרות התפקיד המוכר של מאקרופאגים במחלות אלו, נותר פער קריטי בהבנה כיצד כוחות מכניים פריסטלטיים משפיעים ישירות על הפעלת מאקרופאגים.
פרוטוקול זה מתאר את השימוש במערכת ביו-ריאקטור פריסטלטית לבדיקת אימונו-מודולציה מכנית של מקרופאגים תחת תנאים מכניים רלוונטיים פיזיולוגית. בהשוואה למערכות תרבית סטטיות קונבנציונליות או לפלטפורמות של גירוי מכני בכוח בודד, שיטה זו מאפשרת הפלה סימולטנית של מאמץ רב-צירי מחזורי ומאמץ גזירה של נוזלים, ובכך משחזרת באופן מדויק יותר את המיקרו-סביבה המכנית in vivo של רקמות המבוססות על שריר חלק. בפרוטוקול זה, מקרופאגים ממחיל העצם של עכבר שהונחלו (iBMDMs) וגודלו בביו-ריאקטורים תחת תנאים פריסטלטיים הפגינו עלייה בסמנים של הפעלת M1, בעוד שלא נצפו מגמות לעבר הפעלת M2. ממצאים אלו מוכיחים כי מכניקה פריסטלטית מספיקה כדי למשפיע על התנהגות דלקתית של מקרופאגים ותומכת במושג הרחב יותר של אימונו-מודולציה מכנית ברקמות החשופות לכוחות דינמיים המונעים על ידי שריר חלק. שיטה זו רלוונטית במיוחד לחוקרים הלומדים מכנו-ביולוגיה, דלקת, הנדסת רקמות, פיזיולוגיה של מערכת העיכול, התפתחות ריאות, פיברוזיס ומחלות אחרות שבהן מקרופאגים חשופים למיקרו-סביבות מכניות מורכבות. באמצעות הרכבה קפדנית, כיול עקבי וניטור שוטף, המשתמשים יכולים להבטיח ביצועי ביו-ריאקטור הדירים ולמנוע מגבלות נפוצות של טכניקה זו.
הפרוטוקול מתאר את ההרכבה והתפעול של מכשיר רשום כפטנט40 מערכת ביו-ריאקטור למחקרי מכנו-אימונומודולציה. הרכיבים והציוד שנעשה בהם שימוש מפורטים ב- טבלת חומרים.
1. תרבית תאים
2. ייצור פולידימეთילסילוקסאן (PDMS)
3. סטריליזציה של ממבצת ה-PDMS
4. ציפוי של ממברנות PDMS בפיברונקטין
5. זריעת תאי iBMDM על ממбраסת ה-PDMS
6. ביו-ריאקטור
7. הרכבה וכיול של מעגל Arduino

איור 2תרשים של הרכבת ביו-ראקטור פריסטלטי ואנליזה במערכת זרימה (downstream analysis). תאי iBMDM נזרעים על ממברנת PDMS מצופה פיברונקטין הממוקמת בתוך הביוריאקטור. לאחר חשיפה למשך 4 שעות לפריסטלזה או תחזוקה כביקורות סטטיות, התאים נאספים לניתוחים המשכיים, כולל qPCR, צביעה אימונופלורסצנטית ודימוג. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
8. הרכבה והגדרה של ביו-ריאקטור הפריסטלזה
9. פירוק הביוראקטור
10. ניתוח המשך
1. ניקוי ביו-ריאקטורים ורכיבים נלווים
פרוטוקול זה נועד להדגים שיטה הניתנת לשחזור לקביעת האופן שבו כוחות מכניים פריסטלטיים מושפעים באופן ישיר מאקטיבציה של מקרופאגים. לפני ניסויי הביוריאקטור, הוכשר כי iBMDMs עוברים קיטוב תקין בתגובה לתנאי גרייה ביוכימיים סטנדרטיים. בהתאם לפרוטוקול זה, ממברנות PDMS צופו בפיברונקטין ונזרעו עליהן iBMDMs. התאים הושארו להיקשר למשך 24 שעות לפני בדיקה ויזואלית לאישור היצמדות מוצלחת, פיזור אחיד על פני שטח הממברנה וחיוניות, כפי שנראה במורפולוגיית "ביצת מטוגנת" לא סדירה בהתאם לתיאור הספק (איור 3A,B). ממברנות עם היצמדות דלה, זריעה לא אחידה או עדות לניתוק תאים הוצאו מהניסוי, שכן תנאים אלו עלולים להוביל לגרייה מכנית לא עקבית ואיתות משני משתנה. ממברנות שזריעתן הצליחה הורכבו למערכת הביוריאקטור כדי לעבור גרייה פריסטלטית או נשמרו כביקורת סטטית. לאחר 4 שעות של תרבית, הדגימות הוערכו מחדש כדי לאשר שהתאים נותרו צמודים לאחר הגרייה המכנית (איור 3C,D). לאחר אישור שימור התאים בכל התנאים, נבחנה אקטיבציה של המקרופאגים באמצעות qPCR וצביעה אימונופלואורסצנטית.
ביצעו אנליזת qPCR כדי להעריך שינויים בביטוי של גנים מקדמי דלקת הקשורים ל-M1, Il6, Nos2, ו- Cd40, וכן גנים הקשורים ל-M2, Chil3 ו- Mrc1 (Table 1). תוצאות אלו הדגימו כי גרייה פריסטלטית קידמה את הפעלת המקרופאגים לעבר פנוטיפ מקדם דלקת. תרבית פריסטלטית הגבילה באופן משמעותי את ביטוי Il6 פי 50.9 בהשוואה לבקרה סטטית (p < 0.001, unpaired t-test) ואת ביטוי Nos2 פי 19.8 (p = 0.0046, unpaired t-test) (Figure 4A). ביטוי Cd40 עלה אף הוא פי 7.7, אם כי שינוי זה לא היה מובהק (p = 0.106, unpaired t-test)(Figure 4A). בניגוד לכך, לא נצפו שינויים מובהקים ב- Chil3 (פי 1.2 לעומת בקרה סטטית; p = 0.9726, unpaired t-test) או ב- Mrc1 (פי 1.16 לעומת בקרה סטטית; p = 0.9810, unpaired t-test) (Figure 4B). יחד, ממצאים אלו מעידים כי הכוחות הפריסטלטיים שהופעלו קידמו באופן מובהק הפעלה פרו-דלקתית של מקרופאגים על פני מסלולי הפעלה חלופיים.
כדי להעריך באופן מעמיק יותר את הקיטוב של המקרופאגים, בוצע צביעה אימונופלואורסצנטית באמצעות נוגדנים למסמן הפאן-מקרופאגי F4/80, וכן למסמן CD40 הקשור ל-M1 (איור 5A) או למסמן YM1/YM2 הקשור ל-M2 (איור 5B). הדגימות נצבעו בצביעת נגד של DAPI וצולמו תחת הגדרות רכישה זהות כדי לאפשר השוואה בין התנאים. עצימות הפלואורסצנציה הממוצעת (MFI) נמדדה עבור כל מסמן ונורמלה לאות F4/80 המתאים באותה תמונה. מקרופאגים תחת גירוי פריסטלטי הראו MFI נורמלי של CD40 בערך של 1.74 ± 0.72, המייצג עלייה של 64.80% בהשוואה לבישורי סטטיים, אם כי עלייה זו לא הייתה מובהקת סטטיסטית (איור 5C). בדומה לממצאי ה-qPCR, לא נצפו שינויים משמעותיים בביטוי הנורמלי של YM1/YM2 לאחר גירוי פריסטלטי, עם עלייה של 5% בלבד ביחס לבישורי סטטיים (איור 5D). תוצאות מייצגות אלו מדגימות כי הפרוטוקול משרה באופן עקבי תגובה מקרופאגית פרו-דלקתית דומיננטית באמצעות גירוי מכני בלבד.

איור 3תמונות בשדה בהיר (Brightfield) מראות אישור חזותי של היצמדות תאים לפני ואחרי פריסטלטיקה. תמונות בשדה בהיר (Brightfield) של תאים על ממברנות PDMS הן מהמצב הסטטי (א, ג) ותנועה פריסטלטית (B,D) תנאים שנמדדו לפני הגדרת הביוריאקטור (t = 0 שעות) ולאחר השלמת הניסוי (t = 4 שעות). סרגי קנה מידה = 200 µm. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.

איור 4ניתוח ביטוי גנים מעיד על הפעלה פרו-דלקתית של מקפגים דרך גירוי פריסטלטי. שינוי שכיחות (Fold change) בביטוי גנים של (Aסממני M1 Il6, Nos2, ו- Cd40, ו- (B) סממני M2 Chil3 ו- Mrc1. *p < 0.05, ****p < 0.001, ns = לא מובהק. כל הנתונים מוצגים כממוצע ± SD; n = 3 עבור כל קבוצה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה מוגדלת של איור זה.

איור 5צביעה אימונופלואורסצנטית מאשרת הפעלה פרו-דלקתית של מקרופאגים לאחר הפעלת פריסטלסיס. תמונות אימונופלואורסצנטיות מייצגות של מקפגים שנצבעו עבור הסמן הפן-מקפגי F4/80 (בירוק) ועבור (Aסמני M1 CD40 (ורוד) או (B) סמני M2 YM1/YM2 (באדום). פסי קנה מידה = 20 µm. (Cכימות של עוצמת פלואורסצנציה ממוצעת (MFI) של CD40 בנרמול ל-F4/80.ד'כימות MFI של YM1/YM2 מנורמל ל-F4/80. כל הנתונים מוצגים כממוצע ± SD; n = 3 לכל קבוצה. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
| Gene | Primer | Sequence (5′–3′) |
| Gapdh | F | AGGTCGGTGTGAACGGATTTG |
| Gapdh | R | GGGGTCGTTGATGGCAACA |
| Chil3 | F | CAG GTC TGG CAA TTC TTC TGA A |
| Chil3 | R | GTC TTG CTC ATG TGT GTA AGT GA |
| Nos2 | F | GGA GTG ACG GCA AAC ATG ACT |
| Nos2 | R | TCG ATG CAC AAC TGG GTG AAC |
| Mrc1 | F | CTC TGT TCA GCT ATT GGA CGC |
| Mrc1 | R | TGG CAC TCC CAA ACA TAA TTT GA |
| Il-6 | F | TCTATACCACTTCACAAGTCGGA |
| Il-6 | R | GAA TTG CCA TTG CAC AAC TCT TT |
| Cd40 | F | TTGTTGACAGCGGTCCATCTA |
| Cd40 | R | GCCATCGTGGAGGTACTGTTT |
טבלה 1: רצפי פריימרים עבור גנים שנבדקו באמצעות qPCR.
איור משלים 1: זרימת העבודה להכנת PDMS, הרכבת ביו-ריאקטור והגדרת הפרפוזיה. (A) הכנת PDMS ב-BSC. (B) זריעת תאים. (C) סטריליזציה ב-UV של רכיבי הביו-ריאקטור. (D) הרכבת הביו-ריאקטור. (E) ביו-ריאקטור מאובטח. (F) חיבור המשאבה. (G) הגדרת האינקובטור ב-0 h. (H) הגדרת האינקובטור ב-4 h. אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
איור משלים 2: מעגל ביו-ראקטור עם לוח לחם, משאבה, מנוע וחיווט. אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 1: קוד ארדואינו (Arduino) של הביוראקטור. נא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
ההבנה הנוכחית לגבי האופן שבו כוחות פריסטלטיים משפיעים על תפקוד המקרופאגים נותרה מוגבלת, למרות השכיחות של פריסטלטיקה לא תקינה במחלות דלקתיות. בעוד שגירויים מכניים בודדים, כגון מאמץ גזירה ומתיחה מחזורית, ידועים כמעצבים של אקטיבציית מקרופאגים, ההשפעות של מתיחה רב-צירית וזרימת נוזלים בו-זמנית, המרכיבים יחד את הפריסטלטיקה, לא נחקרו באופן נרחב בהקשר של מכנוביולוגיה של מקרופאגים. הפרוטוקול המתואר כאן מספק פלטפורמה ניתנת לשחזור לבדיקת האופן שבו כוחות מכניים משולבים אלו מווסתים את ההתנהגות הדלקתית של מקרופאגים תחת תנאים רלוונטיים פיזיולוגית. באמצעות מערכת זו, הודגם כי חשיפה לגירוי פריסטלטי למשך 4 h מקדמת פנוטיפ של מקרופאגים פרו-דלקתי באופן דומיננטי, המאופיין בביטוי מוגבר משמעותית של Il6 ו-Nos2.
באופן חשוב, הרגישות המכנית של מקרופאגים תלויה במידה רבה בעוצמה, בתדירות ובמשך הכוח המופעל12,13,14. מחקרים קודמים שבחנו גירויים מכניים מבודדים הראו כי מצבי ההפעלה של מקרופאגים משתנים באופן משמעותי בהתאם לפרמטרים אלו. לכן, מחקרים עתידיים צריכים לבחון טווח רחב יותר של תנאי פריסטלטיקה, כולל מאמצים (strains) ומאמצי גזירה (shear stresses) משתנים וזמן ממושך יותר תחת גירוי מכני, כדי להגדיר טוב יותר את ספקטרום התגובות של מקרופאגים המושרות על ידי מכניקה פריסטלטית. יתרה מכך, מחקר זה היה מוגבל בכך שבחרנו להתמקד בפריסטלטיקה כקלט מכני, במקום במאמץ גזירה של נוזלים או במאמץ מחזורי באופן מבודד. מחקרים עתידיים עשויים להשתמש בפלטפורמת ביו-ריאקטור זו כדי לחקור את הפעלת המקרופאגים כפונקציה של קלטים מכניים משתנים תוך שימוש בדיוק של פלטפורמה אחת. הרחבת מחקרים אלו עשויה לסייע בזיהוי ספי מעבר מכניים המעודדים פנוטיפים דלקתיים או פרו-רגנרטיביים בהקשרי רקמה שונים.
הרגישות המכנית של מקרופאגים תלויה במידה רבה גם בקשיחות ובטופוגרפיה של התשתית. חשוב לציין כי לקשיחות של ה-PDMS שנבחר למחקר זה עשוי להיות השפעה על הפעלת המקרופאגים בנפרד מהשפעות הכוחות הפריסטלטיים15,16,17,18,19. כדי לשלוט בקשיחות כמשתנה, השווינו את המקרופאגים שנחשפו לפריסטלסיס למקרופאגים על PDMS בעל קשיחות תואמת בתנאים סטטיים. מחקרים עתידיים יוכלו לשלוט עוד יותר בקשיחות כמשתנה על ידי שינוי יחס ה-PDMS, שימוש בחומרים נוספים עבור התשתית, או גידול מקרופאגים בצלחת תרבית רקמות דו-ממדית (2D) לצורך השוואה. בנוסף, למרות שלא שינינו את הטופוגרפיה של ה-PDMS, המכשיר שלנו מאפשר מחקרים עתידיים של משתנה זה.
יתרון מרכזי של פרוטוקול זה הוא יכולת ההתאמה שלו למגוון רחב של מחקרי דלקת. למרות שעבודה זו משתמשת במקרופאגים ממח עצם שהושרם (iBMDMs), ניתן להתאים את המערכת בקלות למקרופאגים ראשוניים, מונוציטים, מקרופאגים תלויי-רקמה או מערכות של תרבית שיתופית רב-תאית. לדוגמה, ניתן לשלב תאי אפיתל, תאי סטורמה או תאי שריר חלק כדי לשחזר טוב יותר את המיקרו-סביבה התאית של מערכת העיכול, הרחם או השופכנים. בנוסף, ניתן להתאים את הרכב המטריצה החוץ-תאית לרקמה הרלוונטית על ידי שינוי הציפוי המיושם על ממברנת ה-PDMS. במחקר זה, פיברונקטין היה נחוץ כדי לשמר את היצמדות ה-iBMDM במהלך גרייה פריסטלטית, בעוד שציפויים של קולגן I וקולגן IV גרמו להיפרדות תאים משמעותית. עם זאת, ציפויי מטריצה אופטימליים עשויים להשתנות בהתאם למקור המקרופאגים או לתצורת התרבית השיתופית. כתוצאה מכך, תיקוף קפדני של היצמדות התאים בנקודות הבקרה המומלצות הוא קריטי כדי להבטיח גרייה מכנית ניתנת לשחזור ואנליזות המשך.
מספר שיקולים טכניים חיוניים ליישום מוצלח של פרוטוקול זה, כולל תחזוקה שוטפת, המסייעת במניעת הכשלים השכיחים ביותר. הרכבה ואיטום נאותים של הביוראקטור באמצעות אזיקי פלסטיק חשובים במיוחד, שכן איטום לא מלא עלול להוביל לדליפת מצע, לשינוי בפרופילי מאמץ הגזירה והמתיחה, לסיכון לזיהום או לאובדן חיוניות התאים. בנוסף, משאבות ומנועים דורשים כיול יציב כדי לשמור על גירוי פריסטלטי הניתן לשחזור, ושטיפה סדירה של צינורות המשאבה באתנול ובמים אולטרה-טהורים מונעת הצטברות של שאריות. לבסוף, יש לבדוק את התאים שנזרעו על ממברנות ה-PDMS כדי לוודא היצמדות תקינה ו-80% confluency לפני הכנסתם לביוראקטור. יחד, שלבי פתרון הבעיות ואילוצי המערכת הללו מדגישים את הצורך בהרכבה קפדנית, כיול עקבי וניטור שוטף כדי להבטיח ביצועים הניתנים לשחזור של הביוראקטור.
באופן כללי, פרוטוקול זה מספק פלטפורמה רב-גונית ורלוונטית פיזיולוגית לחקר של מודולציה אימונולוגית-מכנית תחת סביבות מכניות דינמיות מורכבות. על ידי מתן אפשרות ליישום סימולטני של מאמץ רב-צירי מחזורי ומאמץ גזירה של נוזל, מערכת זו מרחיבה את מודלי ה- in vitro המסורתיים המבוססים על כוח בודד, ומציעה כלי בעל ערך לחקר דלקות ברקמות המונעות על ידי שריר חלק. גישה זו עשויה להיות ישימה באופן רחב למחקרים של מחלות במערכת העיכול, פיברוזיס, סרטן ופתולוגיות אחרות שבהן מקרופאגים נחשפים למיקרו-סביבות מכניות דינמיות.
למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר עליהם.
עבודה זו מומנה על ידי הקרן הלאומית למדע (National Science Foundation), מספר מענק 2440798. איור 1 ו-איור 2 נוצרו באמצעות גרסה בעלת רישיון של BioRender.com.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 0.25% Trypsin- EDTA | Fisher | 25200056 | |
| מבחנות מיקרוצנטריפוגה 1.5 mL | USA Scientific | 1615-5510 | |
| צלוחיות פטרי 100 mm x 15 mm | Fisher | 50-190-0276 | |
| צלוחיות תרבית 150 mm | Fisher | FB012925 | |
| 4% פאראפורמאלדהיד | Santa Cruz | sc-281692 | |
| צלוחיות תרבית 90 mm | Fisher | FB012923 | |
| נוגדן Alexa Fluor 488 Anti-F4/80 | Abcam | ab204266 | |
| נוגדן Alexa Fluor 647 Anti-CD40 | Abcam | ab275158 | |
| Arduino Uno | Amazon | B008GRTSV6 | |
| לוח לחם (Breadboard) | Amazon | ||
| בופר RLT | Qiagen | 79216 | |
| מגרדת תאים (Cell scraper) | Fisher | 353087 | |
| DAPI | MilliporeSigma | 50-874-10001 | |
| דסיקטור | MilliporeSigma | Z119008 | |
| פלייר אלכסוני | Amazon | ||
| סרום עגל עוברי (FBS) | Innovative Biosciences | 11-01-500 | |
| פיברונקטין | MilliporeSigma | F1141-1MG | |
| בופר HEPES | Fisher (Gibco) | 15630080 | |
| iBMDM | Applied Biological Materials Inc. (abm) | T0673 | |
| מנוע | Robotshop | FT-SPARK16-360 | |
| נוגדן PE Anti-Ym-1 + Ym-2 | Abcam | ab211621 | |
| פניצילין-סטרפטומייצין | Fisher | 15140122 | |
| משאבה פריסטלטית | DigiKey | 1150 | |
| בופר סליין פוספט (PBS) | Fisher | 14190250 | |
| פילמנט PLA | Amazon | B0D7ZYCVTY | |
| פוטנציומטר B1K 1K Ohm | Amazon | B0CZ747F6F | |
| RPMI 1640 | Fisher | 11875085 | |
| גריז סיליקון | Amazon | B000XBH9HI | |
| פלייר עם מפרק מתכוונן | Amazon | ||
| נתרן פירובט | Cytiva Hyclone | SH3023901 | |
| ערכה לאלסטומר סיליקון Sylgard 184 | Fisher | NC9285739 | |
| בקבוק תרבית T-25 | Fisher | 229331 | |
| טרנזיסטור | DigiKey | IRF520NPBF-ND | |
| חיווט/תפס תנימים | Amazon | ||
| אזיקי פלסטיק 18 אינץ' | Amazon | ||
| β-מרקפטואתנול | Fisher | AC125472500 |