ביטוי של Plasma LINC00707 מוגבר בפגיעות בחוט השדרה ומקדם דלקת ותסמיכי חמצון המתווכות על ידי מיקרוגליה דרך ציר הסיגנלינג miR-145-5p/TRAF6. השתקה של LINC00707 מחלישה תגובות פתולוגיות אלו, ובכך מדגישה את פוטנציאל ה-LINC00707 כמטרה טיפולית.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר מחקר
140 צפיות
⸱
11 בספטמבר 2026
* These authors contributed equally
ביטוי של Plasma LINC00707 מוגבר בפגיעות בחוט השדרה ומקדם דלקת ותסמיכי חמצון המתווכות על ידי מיקרוגליה דרך ציר הסיגנלינג miR-145-5p/TRAF6. השתקה של LINC00707 מחלישה תגובות פתולוגיות אלו, ובכך מדגישה את פוטנציאל ה-LINC00707 כמטרה טיפולית.
פגיעה בחבל השדרה (SCI) גורמת למוגבלות לכל החיים, מפחיתה באופן משמעותי את איכות החיים ומטילה נטל סוציו-כלכלי כבד. מחקר זה בחן את תפקידו של LINC00707 ב-SCI באמצעות ויסות של ציר השליחה miR-145-5p/TRAF6. דגימות פלזמה מ-30 נבדקים בריאים ו-75 חולים עם SCI נותחו לבדיקת ביטוי של LINC00707, miR-145-5p ו-TRAF6 באמצעות RT-qPCR. קשרים בין רמות LINC00707 בפלזמה לבין גורמים פרו-דלקתיים הוערכו בחולים עם SCI. תאי מיקרוגליה מסוג BV2 נחשפו ל-100 ng/mL LPS, ונמדדו גורמים הקשורים לדלקת ולעקה חמצונית. אינטראקציות מולקולריות הוערכו באמצעות בדיקת דו-לוסיפראז (dual-luciferase reporter assay). ניתוח רגרסיה לוגיסטית שימש לזיהוי גורמים הקשורים לביטוי של LINC00707. רמות LINC00707 ו-TRAF6 בפלזמה היו מוגברות בחולים עם SCI, בעוד שרמות miR-145-5p היו מופחתות. רמות LINC00707 בפלזמה נמצאו במתאם חיובי עם רמות גורמים דלקתיים בפלזמה. LINC00707 פעל כספוג מולקולרית עבור miR-145-5p, ו-TRAF6 היה גן מטרה של miR-145-5p. עיכוב של LINC00707 הפחית גורמים דלקתיים, חומרים מעודדי עקה חמצונית ורמות mRNA של TRAF6 בתאי BV2. עיכוב של miR-145-5p הפיק השפעות הפוכות. ממצאים אלה מרמזים כי ביטוי מוגבר של LINC00707 קשור לחומרת ה-SCI, וכי השתקה (knockdown) של LINC00707 עשויה להקל על דלקת ועקה חמצונית המתווכות על ידי מיקרוגליה באמצעות ויסות של ציר השליחה miR-145-5p/TRAF6.
פגיעה בחבל השדרה (SCI) היא מצב טראומטי הגורם לנזק לחבל השדרה, רכיב קריטי במערכת העצבים המרכזית. SCI קוטעת באופן ישיר את נתיבי ההולכה העצבית בין חבל השדרה למוח, דבר הגורם לליקויים משמעותיים בתפקודי המוטוריקה, החושים והמערכות האוטונומיות1,2. מחקרים אפידמיולוגיים דיווחו על שכיחות שנתית של כ-5 מקרים ל-100,000 אנשים, כאשר שיעור התמותה הקשור למחלה מגיע עד ל-16.7%3,4. סקר קנדי העריך כי עלות השיקום לאורך החיים עבור כל חולה עם SCI עשויה להגיע עד ל-US$336,0005. השכיחות הגבוהה, שיעור התמותה והעלויות המשמעותיות הקשורות לאבחון, טיפול ושיקום הופכים את SCI לאתגר קליני מרכזי הדורש אסטרטגיות טיפוליות משופרות.
ההתקדמות הפתולוגית של SCI מורכבת משני שלבים: פגיעה ראשונית ופגיעה משנית. פגיעה ראשונית נובעת מדחיסה מכנית טראומטית או מקריעה של רקמת חוט השדרה, בעוד שפגיעה משנית מתווכת על ידי תהליכים פתולוגיים, כולל דלקת ועקה חמצונית6,7. בתנאים פיזיולוגיים, נוירו-דלקת המתווכת על ידי מיקרוגליה תורמת להומיאוסטזיס של מערכת העצבים המרכזית8,9,10. עם זאת, בעקבות SCI, המיקרוגליה הופכת למפועלת באופן מוגזם ומשחררת כמויות גדולות של מתווכי דלקת (pro-inflammatory mediators)11,12. מתווכים אלו גורמים לייצור מופרז של מיני חמצן רדיקליים (ROS), מה שגורם לנזק ולמוות של נוירונים ומחמיר את הפגיעה המשנית בחוט השדרה13,14. לפיכך, דיכוי של הפעלה מוגזמת של מיקרוגליה והקטעת רצף הדלקת מהוויים אסטרטגיות טיפוליות מבטיחות לקידום התאוששות נוירולוגית ולשיפור התוצאות בעקבות SCI.
RNA לא מקודדים ארוכים (lncRNAs) הם סוג של RNA לא מקודדים, שאורכם עולה על 200 נוקלאוטידים ואין להם פוטנציאל לקידוד חלבונים15בתחילה נחשב כטרנסקריפציוני "רעש," lncRNAs מוכרים כיום כווסתים חשובים של תהליכים פיזיולוגיים ופתולוגיים מגוונים16מחקרים אחרונים הראו כי ל-lncRNAs יש תפקידים קריטיים בפגיעות עצביות. Long intergenic non-protein-coding RNA 707 (LINC00707) התגלה כווסת חשוב של הפרעות במערכת העצבים. מחקרים קודמים דיווחו כי LINC00707 מחמיר פגיעות מוחית טראומטית על ידי הגברת דלקת המתווכת על ידי מיקרוגליה.17בנוסף, Zhu ואחרים. הוכיח כי השתקה של LINC00707 הפחיתה באופן משמעותי דלקת ואפופטוזיס בתאי PC12 שגורמו על ידי ליפופוליסכריד (LPS)18ממצאים אלו מספקים בסיס תיאורטי ראשוני לבחינת המעורבות של LINC00707 בפגיעה בחוט השדרה (SCI). עם זאת, נותר לבסס אם LINC00707 מווסת דלקת המתווכת על ידי מיקרוגליה במהלך SCI.
LncRNAs פועלים כספוגים מולקולריים באמצעות מנגנון ה-competitive endogenous RNA (ceRNA), כאשר הם מבודדים microRNAs (miRNAs) ומסדירים את ביטוי הגנים של מטרות במורד המסלול19. דפוס רגולטורי זה מעורב באופן נרחב בפתוגנזה של מחלות שונות. בפרט, miR-145-5p מופחת משמעותית ברקמות של SCI20 ובמהלך פגיעה המושרית על ידי LPS21, וביטויו יתר מחליש ביעילות את תגובות העקה החמצונית והדלקת של המיקרוגליה22. לגורם Tumor necrosis factor receptor-associated factor 6 (TRAF6) יש אף הוא תפקיד מרכזי בפתולוגיה של SCI23,24,25. עם זאת, השאלה האם LINC00707, miR-145-5p ו-TRAF6 מפעילים פונקציות רגולטוריות מתואמות ב-SCI נותרה לבירור.
במחקר הנוכחי, ביטוי LINC00707 היה מוגבר באופן משמעותי בתאי מיקרוגליה שעברוהסטימולציה על ידי LPS. לפיכך, השערנו כי LINC00707 עשוי לפעול כווסת פרו-דלקתי במיקרוגליה, וכי השתקתו עשויה להפחית את התגובה הנוירו-דלקתית, ובכך לשפר את ההתקדמות הפתולוגית של SCI. מחקר זה בחן האם LINC00707 מווסת תגובות דלקתיות של מיקרוגליה ותורם לפתוגנזה של SCI.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר זה אושר על ידי ועדת האתיקה של בית החולים הראשון בז'אנגג'יקו (מספר אישור 2024-KY-18). כל המשתתפים עודכנו במטרות המחקר ובסיכונים הפוטנציאליים וחתמו על טופס הסכמה מדעת לפני הגיוס. דגימות דם ורידיות נאספו מקבוצות ביקורת בריאות במהלך בדיקות גופניות שגרתיות, ומחולים עם פגיעה בחוט השדרה (SCI) מיד לאחר הקבלתו לבית החולים. המדידות המעבדתיות בוצעו על ידי המעבדה הקלינית של בית החולים. כלי המחקר שנעשה בהם שימוש בפרוטוקול זה מפורטים ב- טבלת חומרים.
1. נבדקים
סך הכל 75 חולים עם SCI גויסו מבית החולים הראשון בז'אנגג'יקו (Zhangjiakou First Hospital) בין ינואר 2023 לינואר 2025. קריטריוני ההכללה היו SCI שאושר באמצעות טומוגרפיה ממוחשבת (CT) או דימות תהודה מגנטית (MRI), וזמן של ≤ 12 h מהפגיעה ועד להשכבה בבית החולים. קריטריוני ההחרגה היו היסטוריה של טראומה או ניתוח בחוט השדרה או במוח במהלך 6 החודשים האחרונים; מחלה קרדיווסקולרית קשה, כולל אוטם בשריר הלב או הפרעות קצב; היריון או הנקה; וגידולים ממאירים, ליקוי בתפקוד הכבד או הכליות, מחלה צרברו-וסקולרית קשה או מחלות זיהומיות.
על פי תקני הסיווג הנוירולוגי של איגוד פגיעות העמודשדרה האמריקאי (ASIA)26, 75 חולים עם SCI סווגו לקבוצות של תפקוד נוירולוגי תקין (n = 21), SCI חלקית (n = 36) ו-SCI מלאה (n = 18). התפלגות אתרי הפגיעה הייתה כדלקמן: צווארית, 36.0%; חזית, 30.7%; ומותנית, 33.3%. 30 אנשים בריאים שהותאמו לאוכלוסיית המחקר גויסו באופן אקראי כדי לשמש כקבוצת ביקורת. מידע קליני בסיסי נאסף עבור כל המשתתפים. קריטריוני ההכללה עבור אנשים בריאים היו: ללא היסטוריה של טראומה של חוט השדרה או המוח, ניתוח, או הפרעות נוירולוגיות; ללא היסטוריה של מחלות דלקתיות כרוניות, הפרעות אוטואימוניות או גידולים ממאירים; ללא מחלה קרדיווסקולרית, כבדית או כלייתית חמורה; ללא זיהום חריף או כרוני ב-4 השבועות האחרונים; ללא היריון או הנקה; והתאמה בגיל ובמין לקבוצת ה-SCI.
מדד העצמאות התפקודית (FIM) שימש להערכת העצמאות התפקודית בפעילויות היומיום. הניקוד המקסימלי ב-FIM הוא 126. תחושה מגעית, acmesthesia וניקוד מוטורי שימשו להערכת התפקוד החושי והמוטורי. הניקוד המקסימלי לתחושה מגעית ול-acmesthesia היה 112, והניקוד המוטורי המקסימלי היה 100. ניקוד נמוך יותר מעיד על ליקוי נוירולוגי חמור יותר.
2. תרבית תאים, בניית מודל והטרנספקציה
תאי מיקרוגליה BV2 של עכבר המוקטנים (Immortalized) התקבלו ממרכז משאבי התאים של מכון הביוטכנולוגיה של שנגחאי. התאים תורבדו במצע DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium) עם רמת גלוקוז גבוהה, בתוספת 10% סרום בקר עוברי (FBS), פניצילין (100 U/mL) וסטרהפტომיצין (100 U/mL). התאים הוחזקו בטמפרטורה של 37 °C באינקובטור לח הכיל 5% CO₂.
לבניית המודל, תאי BV2 עוררו באמצעות 0, 10, 20, 50, 100, 150, או 200 ng/mL של lipopolysaccharide (LPS) למשך 24 h. ריכוז ה-LPS האופטימלי נבחר על סמך התוצאות הניסיוניות.
עבור טרנספקציה, תאי BV2 נזרעו בלוחיות בעלות 6 בארות ועברו טרנספקציה ברגע שהגיעו לצפיפות (confluence) המתאימה. נעשה שימוש ברכיב טרנספקציה בריכוז של 1.5 µL/well בהתאם להוראות היצרן. לאחר 6 h, מצע התרבית הוחלף במצע טרי, והתאים תורבדו למשך 24 h נוספות. עבור המבנה להשקת LINC00707, הביקורת השלילית התואמת, אוליגנוקלאיד miR-145-5p ואוליגנוקלאיד הביקורת התואם, נעשה שימוש בריכוז של 50 nM לכל בארה. כל ניסויי הטרנספקציה חזרו באופן בלתי תלוי לפחות 5 פעמים, עם 3 חזרות מקבילות לכל ניסוי בלתי תלוי. הנתונים נותחו סטטיסטית באמצעות תוצאות של לפחות 5 ניסויים בלתי תלויים.
3. ELISA
את עליוני תרבית התאים (supernatants) של תאי BV2 שעברו טרנספקציה ועירור באמצעות LPS אספו על ידי צנטריפוגציה במהירות של 12,000 × g למשך 10 דקות, ורמות של interleukin-1β (IL-1β), IL-6 ו-tumor necrosis factor-α (TNF-α) נמדדו באמצעות ערכות ELISA המתאימות. בקצרה, הבדיקה בוצעה על ידי אינקובציה רצופית עם נוגדן מסומן בביוטין, קונג'וגט של HRP-streptavidin ותסבסב TMB, בהתאם להוראות היצרן. הבליעה נמדדה באורך גל של 450 nm באמצעות קורא מיקרו-פלייטים. רמות הציטוקינים נקבעו על פי עקומות סטנדרט. כל דגימה נמדדה בשלוש חזרות, ובוצעו 6 ניסויים עצמאיים.
4. מדידת ROS
רמות ה-ROS התוך-תאיים בתאי BV2 שעברו סטימולציה באמצעות LPS נמדדו באמצעות ערכה לבדיקת מיני חמצן ראקטיביים (reactive oxygen species assay kit). בקצרה, התאים דגרו עם 10 µmol/L DCFH-DA בטמפרטורה של 37 °C למשך 20 דקות. לאחר הדגירה, הוסר הנוזל שמעל התאים והתאים נשטפו 3 פעמים בתמיסת PBS כדי להסיר שאריות של הגשוש (probe) החוץ-תאי. עוצמת הפלואורסצנציה נמדדה באמצעות קורא לוחות (microplate reader) באורכי גל של עירור ופליטה של 488 nm ו-525 nm, בהתאמה. רמות ROS יחסיות חושבו על בסיס עוצמת הפלואורסצנציה. כל הדגימות נותחו בשלוש חזרות, והניסוי כולו חזר באופן עצמאי לפחות 5 פעמים.
5. זיהוי של מלונדיאלדהיד, סופראוקסיד דיסמוטאז וגלוטתיון
תאי BV2 שעברו טיפול נאספו, והוכנו הומוגנאטים של התאים. דגימות סנטריפוגו במהירות של 12,000 × g למשך 10 דקות ב-4 °C כדי לקבל את העילאי. ערכות זיהוי מסחריות למלונדיאלדהיד (MDA), סופראוקסיד דיסמוטאז (SOD) וגלוטתיון (GSH) שימשו לקביעת רמותיהם בעילאי התאים, בהתאם להוראות היצרן. כל הדגימות נותחו בשלוש חזרות, והניסוי כולו חזר באופן עצמאי לפחות 5 פעמים.
6. בדיקת דואל-לוציפראז (Dual-luciferase reporter assay)
מקטעים של האזור הבלתי מתורגם 3' (3' UTR) של LINC00707 ו-TRAF6 המכילים את אתרי הקשירה החזויים של miR-145-5p, יחד עם הרצפים המוטנטיים התואמים, שוכפלו לתוך וקטור הדוח לוציפראז pmirGLO כדי ליצור קונסטרוקטים של דוח מסוג פראי (WT-LINC00707 ו-WT-TRAF6) ומסוג מוטנטי (MUT-LINC00707 ו-MUT-TRAF6). תאי BV2 עברו טרנספקציה משולבת של קונסטרוקטי הדוח ואוליגונוקלאידים של miR-145-5p וגודלו במשך 24 h. לאחר מכן התאים נאספו, ופעילות לוציפראז של firefly ו-Renilla נמדדה באמצעות קורא מיקרו-פלטה.
7. RT-qPCR
RNA כולל הוצאה באמצעות ריאגנט להוצאת RNA. איכות ה-RNA הוערכה באמצעות יחס OD₂₆₀/OD₂₈₀, כאשר ערכים שבין 1.8 ל-2.0 נחשבו למקובלים. כ-1 µg של RNA כולל הועבר ל-cDNA באמצעות ערכה לשעתוק הפוך. ביטוי גנים נכמת באמצעות RT-qPCR באמצעות SYBR Green PCR master mix. שעתוק הפוך בוצע ב-42 °C למשך 15 min, ולאחריו ביטול פעילות של reverse transcriptase ב-95 °C למשך 3 min. ה-cDNA המסנתזאשמר במאוזן ב-−20 °C עד לניתוח. PCR כמותי בזמן אמת בוצע באמצעות דנטורציה מוקדמת ב-95 °C למשך 1 min, ולאחריה 40 מחזורים של דנטורציה ב-95 °C למשך 5 s והיכרות (annealing) והארכה ב-60 °C למשך 15 s. אותות פלואורסצנציה נאספו בסוף כל שלב של היכרות והארכה. ניתוח עקומת התכה בוצע ב-95 °C למשך 15 s, ולאחריו ב-60 °C למשך 1 min. רמות ביטוי יחסיות חושבו באמצעות שיטת 2⁻ΔΔCt. GAPDH או 5S שימשו כרפרנס פנימי לנורמליזציה של ביטוי הגנים. רצפי הפריימרים היו כדלקמן: LINC00707, forward 5'-CCAACAGGGTATCAGAATTCTC-3' ו-reverse 5'-TGCTGACAATAGCCATTAGG-3'; miR-145-5p, forward 5'-GCCGAGGTCCAGTTTTCCCA-3' ו-reverse 5'-CTCAACTGGTGTCGTGGA-3'; TRAF6, forward 5'-ATTACAACTGAGGTGCTTCT-3' ו-reverse 5'-GCATCTGGTTCTGTTATAGGA-3'; GAPDH, forward 5'-ATCCCATCACCATCTTCCAGG-3' ו-reverse 5'-CGCCCCACTTGATTTTGG-3'; ו-5S, forward 5'-TCGTCTGATCTCGGAAGCTAA-3' ו-reverse 5'-AAGCCTACAGCACCCGGTAT-3'.
8. ניתוח סטטיסטי
ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות תוכנה סטטיסטית. נורמליות התפלגות הנתונים הוערכה באמצעות מבחן Shapiro-Wilk, כאשר P > 0.05 העיד על התפלגות נורמלית. נתונים בעלי התפלגות נורמלית הוצגו כממוצע ± SD, בעוד שנתונים שאינם בעלי התפלגות נורמלית הוצגו כחציון (P25, P75). עבור משתנים רציפים בעלי התפלגות נורמלית, השוואות בין 2 קבוצות בוצעו באמצעות מבחן t של Student, והשוואות בין קבוצות מרובות בוצעו באמצעות ANOVA חד-כיווני ולאחריו מבחן post hoc של Tukey. עבור נתונים שאינם בעלי התפלגות נורמלית, נעשה שימוש במבחן Mann-Whitney U להשוואות בין 2 קבוצות, ובמבחן Kruskal-Wallis להשוואות בין קבוצות מרובות. מבחן chi-square שימש לניתוח משתנים קטגוריאליים בין קבוצות. ניתוחי רגרסיה לוגיסטית חד-משתנית ורב-משתנית שימשו להערכת גורמים קליניים הקשורים לביטוי של LINC00707. משתנים רציפים חולקו לשתי קבוצות לפי חציון העמות (קבוצת ערך גבוה = 1; קבוצת ערך נמוך = 0). משתנים עם P < 0.05 בניתוח רגרסיה לוגיסטית חד-משתנית הוכנסו לניתוח רגרסיה לוגיסטית רב-משתנית. התוצאות הוצגו כיחסי סיכויים (ORs) עם רווחי סמך (CIs) של 95%, כאשר OR > 1 העיד על קשר חיובי ו-OR < 1 העיד על קשר שלילי. כל ניסויי הפנוטיפ של התאים כללו לפחות 4 חזרות ביולוגיות בלתי תלויות, עם 3 חזרות טכניות לכל חזרה ביولوجית. P < 0.05 נחשב למשמעותי סטטיסטית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
רמות LINC00707 בפלזמה היו גבוהות בחולים עם SCI
נותחו המאפיינים הקליניים הבסיסיים של 30 נבדקים בריאים ו-75 חולים עם SCI. בהשוואה לנבדקים בריאים, לחולים עם SCI היו ציונים נמוכים באופן ניכר בתחושת מגע, acmesthesia, תפקוד מוטורי ומדד עצמאות תפקודית (FIM), מה שמעיד על פגיעה בתפקוד החושי והמוטורי. בנוסף, רמות של ציטוקינים פרו-דלקתיים בסרום היו גבוהות באופן משמעותי בחולים עם SCI מאשר בביקורות בריאות (טבלה 1, P < 0.001), מה שמרמז על תגובה דלקתית מוגברת.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פגיעה בחבל השדרה (SCI) היא הפרעה טראומטית חמורה של מערכת העצבים המרכזית הגורמת לפגיעה או לאובדן מלא של ההולכה העצבית דרך חבל השדרה, דבר המוביל לליקויים מוטוריים, תחושתיים ואוטונומיים לכל החיים, וכן להשלכות פיזיולוגיות ופסיכולוגיות עמוקות29˒30. חומרת ליקויים אלו עולה בדרך כלל עם היקף הפגיעה בחבל השדרה. במחקר הנוכחי, ביטוי LINC00707 בפלזמה היה מוגבר בחולים עם SCI והיה במתאם חיובי עם רמות של ציטוקינים פרו-דלקתיים במחזור הדם, מה שמרמז על תפקיד פוטנציאלי של LINC00707 בדלקת ובעקה...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי אין להם ניגודי אינטרסים.
עבודה זו נתמכה על ידי פרויקט מחקר במדעי הרפואה של Hebei (מענק מס' 20251479).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| מבחנה למיקרו-צנטריפוגה בנפח 1.5 מ"ל | KIRGEN | KG2211 | מבחנה מפוליפרופילן עם מכסה בלחץ (snap-cap), נקייה מ-DNase/RNase, לא פירוגנית, כוח צנטריפוגלי מרבי 20,000 × g, לאחסון דגימות RNA/חלבון ולצנטריפוגה. |
| צלחת תרבית תאים בעלת 6 בארות | Corning | 3516 | פלטת פוליסטירן שטופה TC עם תחתית שטוחה, סטרילית ועטופה בנפרד; נפח הבאר הוא 16.8 מ"ל עם שטח גידול של 9.5 סמ"ר |
| מחט לאיסוף דם | Becton, Dickinson and Company | 367283 | מחט לאיסוף דם לשימוש חד-פעמי של BD Vacutainer. עיצוב מחט דו-צדדי, כאשר קצה אחד מיועד לדקירה ורידית והקצה השני מתחבר למחזיק ולשפופרת הוואקום לצורך איסוף למספר שפופרות. מצופה בסיליקון כדי לצמצם את אי-הנוחות של המטופל בזמן ההחדרה. |
| מבחנות לאיסוף דם | Becton, Dickinson and Company | 367605 | מבחנות BD Vacutainer לאיסוף דם בוואקום. פקקים בצבעים שונים מצביעים על תוספים שונים, התואמים לבדיקות מעבדה ספציפיות. |
| קו תאי מיקרוגליה של עכבר המונחלים BV2 | מרכז משאבי התאים של מכון הביוטכנולוגיה של שנגחאי | RRID: CVCL_0182 | שורת תאי מיקרוגליה עכבריים מאומתים המבטאים באופן יציב סמנים ספציפיים למיקרוגליה (Iba1, CD11b, F4/80). בעקבות גרייה ב-LPS, תאי BV2 מפרישים ציטוקינים פרו-דלקתיים (IL-1β, IL-6, TNF-α) ומצבירים ROS ותוצרי MDA תוך-תאיים, כדי לדמות במערכת חוץ-גופית (in vivo) הפעלה דלקתית של מיקרוגליה לאחר פגיעה בחוט השדרה. התאים גודלים במצע DMEM עם ריכוז גלוקוז גבוה, בתוספת 10% FBS ו-1× פניצילין-סטRepartitionפטומייצין, שנשמר ב- 37 °C עם 5% CO2 אינקובטור עם לחות; מעבר (passaging) כאשר מגיעים ל-70%–80% התמזגות (confluence) כדי למנוע הפעלה יתרה. |
| ערכה לבדיקת מלונדיאלדהיד (MDA) בתאים | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A003-4-2 | ערכה קולורימטרית מבוססת מיקרופלט לזיהוי כמותי של מלונדיאלדהיד תאי, סמן של פראוקסידציה של ליפידים. MDA מגיב עם חומצה תיוברוביטורית (TBA) תחת חימום ליצירת תוצרי תגובה (adducts) אדומים; הבליעה נמדדת באורך גל של 532 ננומטר באמצעות ספקטרופוטומטר למיקרופלט. הערכה עברה אופטימיזציה לדגימות של ליזט תאי, תפעול בקיבולת גבוהה במיקרופלט של 96 בארות, וטווח כימות ליניארי המכסה רמות נמוכות עד בינוניות של חמצון ליפידים במיקרוגליה. |
| CO2 אינקובטור | Thermo Scientific | 3111 | מים מלחחים במעטפת מים CO22 אינקובטור עם נפח פנימי של 184 L, IR CO22 חיישן, מערכת סינון אוויר HEPA למיזעור זיהום מיקרוביאלי. שומרת על סביבת תרבית יציבה ב- 37 °C, 5% CO22 ולחות רוויה עבור תרבית תאים נצמדים לטווח ארוך. |
| ערכת בדיקה לגן דוחה של לוסיפראז כפול (Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit) | Beyotime Biotechnology | RG028 | ערכה דו-לוסיפראזית זו מאפשרת גילוי כמותי עוקב של לוסיפראז מרשש (firefly luciferase) ולוסיפראז רנילה (Renilla luciferase) בליזאטים של תאים. תחילה נמדד אות לוסיפראז מרשש באמצעות סובסטרט לוסיפרין; רכיב הגילוי של רנילה שבא לאחר מכן מכיל מעכב (quencher) חזק המבטל את >99.9% שארית לומנסנציה של גחלילית (firefly), המבטיחה קריאה נקייה של אות Renilla עם סובסטרט קואלנטראזין (coelenterazine). הערכה כוללת בופר ייעודי לליזיס תאים עבור ליזיס של תאים נצמדים, התואם ללוח מיקרופלטה בעל 96 בארות עבור לומינומטר. ריאגנט הגחלילית הוא נוזל מעורב מראש לשימוש ישיר; ערכי הלומנסנציה של הגחלילית ושל ה-Renilla נרשמים באופן רצופי כדי לחשב פעילות לוסיפראז יחסית מנורמלת (יחס גחלילית/Renilla) לצורך תיקוף של מטרה מסוג ceRNA. |
| מצע דאלבקו המשופר (Dulbecco's Modified Eagle Medium) | Gibco | 11995065 | DMEM הוא מצע בסיסי הנמצא בשימוש נרחב לתמיכה בצמיחה של סוגים רבים ושונים של תאי יונקים. פורמולציה זו מכילה גלוקוז בריכוז גבוה, L-glutamine, פנול אדום וסודיום פירובט. המצע דורש תוספים, בדרך כלל 10% סרום עוברי בקר (FBS), ו-5–10% CO2 סביבה לשמירה על pH פיזיולוגי. |
| סרום עוברי של בקר | כל הירוק | 13011-8611 | FBS בדרגת פרימיום, רמה נמוכה של אנדוטוקסינים ומייקופלסמה & שלילי לבקטריופאג'ים, הוסף ל-DMEM בריכוז של 10% נפח/נפח כדי לתמוך בצמיחת התאים. |
| GraphPad Prism גרסה 9 | GraphPad Software, סן דייגו, קליפורניה, ארה"ב | לא ניתן לתרגם טקסט ריק. אנא ספק את הטקסט באנגלית שברצונך לתרגם. | תוכנה לגרפים מדעיים ולניתוח סטטיסטי המתמחה בנתונים מניסויי תאים in vitro. כל ערכי הבליעה הגולמיים של qPCR, ELISA, עקה חמצונית ולומניסנציית dual-luciferase יוובאו ל-Prism 9 לצורך ביצוע אימות נורמליות, השוואות קבוצות פרמטריות/לא-פרמטריות, יצירת כל הדמויות הכמותיות וחישוב הממוצע ± סטיית תקן (SD), ערכי P מדויקים ורווחי סמך (CIs) של 95%, וייצוא איורים ברזולוציה גבוהה (300 dpi) העומדים בתקני פרסום של כתבי עת. קבצי מקור מקוריים של פרויקטי .prism עבור כל הגרפים הופקדו במאגר הנתונים הציבורי כנדרש. |
| IBM SPSS Statistics גרסה 26.0 | IBM Corporation, Armonk, NY, USA | לא רלוונטי | חבילת תוכנה סטטיסטית מקיפה המשמשת למיון נתוני בסיס של דגימות קליניות, בדיקת נורמליות (מבחן שפירו-וילק), מבחן t למדגמנים בלתי תלויים/לא מזווגים, וניתוח שונות (ANOVA) חד-כיווני עם מבחן Tukey’תיקון השוואות מרובות, מבחן Mann-Whitney U לא-פרמטרי, וחישוב ערכי P מדויקים ומרווחי סמך של 95% עבור כל מערכי הנתונים הכמותיים האנושיים והתאיים. כל הנתונים הדמוגרפיים והמעבדתיים של המטופלים הקליניים עובדו ונאחרו בפלטפורמה זו. |
| IL-1β ערכה ל-ELISA מסוג SimpleStep | Abcam | ab255730 | ערכה זו של ELISA קולורימטרי מסוג סנדוויץ' עם שטיפה אחת מאמצת את טכנולוגיית SimpleStep הקניינית, המשלימה את כל הליך הזיהוי בתוך 90 דקות. היא מודדת באופן כמותי אינטרלוקין-1 של חולדה.β בסבסב (supernatant) של תרבית תאים, בסרום, ובדגימות פלזמה עם EDTA/ציטראט/הפרין. רגישות הגילוי מגיעה ל-26.58 pg/mL, עם טווח כימות ליניארי של 54.69–3500 pg/mL. ערכה כוללת מיקרו-פלטה של רצועות בעלות 8 בארות שניתן להפרידן, המצופה מראש. אותי בליעה מזוהים באורך גל של 450 ננומטר באמצעות קורא מיקרו-פלטות לצורך חישוב IL-1β ריכוז. |
| ערכת SimpleStep ELISA ל-IL-6 | Abcam | ab234570 | ערכה לביצוע בדיקת SimpleStep ELISA קולורימטרית מסוג סנדוויץ', המותאמת לזיהוי כמותי של אינטרלוקין-6 (IL-6) של חולדה בדגימות של על-נוזל תרבית תאים, סרום ופלזמה עם ציטראט/EDTA/הפרין. הערכה מאמצת תהליך עבודה הכולל אינקובציה בשלב אחד ושטיפה אחת כדי לקצר את זמן הבדיקה הכולל ל-90 דקות, עם רגישות זיהוי של 43 pg/mL וטווח כימות ליניארי שבין 125 pg/mL ל-8000 pg/mL. הערכה כוללת מיקרופלטה עם פסים של 8 בארות הניתנים להפרדה ומצופה מראש; ערכי הבליעה נקראים באורך גל של 450 nm באמצעות ספקטרופוטומטר למיקרופלטות לצורך חישוב ריכוז ה-IL-6 הסופי. |
| פלטת LightCycler Multiwell 96, לבנה | Roche LifeScience, שוויץ | 4729692001 | פלטות תגובה לבנות מ 폴ipropylene בעלות 96 בארות עם שוליים חלקיים (half-skirted), שעברו אופטימיזציה מיוחדת עבור מכשיר ה-LightCycler 96 ל-PCR בזמן אמת. דפנות הבארות הלבנות מפחיתות הפרעות של פלואורסצנציה ברקע ומשפרות את השתקפות האות על מנת להגביר את רגישות הגילוי עבור תמלילים בריכוז נמוך. תכנון אחיד של דפנות דקות מבטיח מוליכות תרמית עקבית בכל הבארות, ותואם לנפחי תגובה הנעים בין 10 ל- 50 μLנקי מ-DNase/RNase ומפירוגנים עבור בדיקות הגברה של cDNA המופק מ-RNA. |
| סוכן טרנספקציה LipofectamineTM 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | ריאגנט טרנספקציה של ננו-חלקיקי ליפידים, המשולב עם P3000 Enhancer, מאפשר טרנספקציה יעילה של siRNA/פלסמיד בתאי מיקרוגליה מסוג BV2 עם רעילות תאית נמוכה. |
| ערכה לסנתזה של cDNA גדיל ראשון מ-lnRcute lncRNA | TIANGEN | KR202-02 | ערכה זו עברה אופטימיזציה מיוחדת עבור תעתוקה הפוכה של RNA לא מקודד ארוך (lncRNAs) בעל שכיחות נמוכה, תכולת GC משתנה ומבנים שניוניים מורכבים. היא מכילה בופר נפרד להסרת gDNA כדי לבטל זיהום של DNA גנומי לפני התעתוקה ההפוכה, ותערובת פריימרים ייעודית ל-lnR-RT להעשרת תבניות lncRNA באורכן המלא. רב-התעתק ההפוך (reverse transcriptase) המודגמ תאפשר סינתזה יעילה של cDNA בעל גדיל ארוך מכמות RNA כוללת הנעה בין 10 ng ל-2 ng. |
| ערכה לגילוי lncRNA באמצעות qPCR מסדרת lnRcute (SYBR Green) | TIANGEN | FP402 | תערובת מוכנה (premix) ייעודית ל-qPCR כמותי המבוסס על SYBR Green, המשמשת לכמותיות של lncRNA. פולימרז DNA מסוג hot-start המתווך על ידי נוגדן מבטיח סגוליות הגברה גבוהה; רכיבי H-competitor מקטינים הַפרעות של מבנים שניוניים בתבניות lncRNA עשירות ב-GC. התערובת תואמת ל-cDNA שהופק באמצעות ערכת שעתוק הפוך של lncRNA מסדרת lnRcute, ומתאימה לכימות ביטוי יחסי של lncRNA בריכוזים נמוכים. |
| אוליגנוקליאוטידים של miR-145-5p | Generalbiol (ווחאן, סין) | לא רלוונטי | מימוס (mimic), מעכב (inhibitor) ואוליגונוקלאוטידי ביקורת שלילית תואמים סינתטיים של miR-145-5p, ששימשו לוויסות פעילות miR-145-5p בתאי BV2. נעשה בהם שימוש בניסויי ביטוי, דלקת, עקה חמצונית ובבדיקות דוּ-לוסיפראז (dual-luciferase reporter assays). |
| ערכה לסנתזה של גדיל cDNA ראשון של miRNA מסוג miRcute Plus | TIANGEN | KR211-02 | עושה שימוש בתגובה של מבחנה אחת המשלבת זנב poly (A) ושעתוק הפוך כדי לפשט את זרימת העבודה הניסויית. תערובת האנזימים מכילה poly (A) polymerase מ-E. coli, reverse transcriptase חסר RNase H ומעכב RNase, המכוונים באופן ספציפי ל-miRNA בוגר חד-גדילי ומונעים הפרעה להגברה מצד pre-miRNA בעל מבני לולאה (hairpin). מתאים ל-miRNA שהופק מליזט של תאים, פלסמה ודגימות רקמה. |
| ערכה לזיהוי miRNA באמצעות qPCR miRcute Plus (SYBR Green) | TIANGEN | FP411 | תערובת מוכנה (premix) של SYBR Green המותאמת לכימות של miRNA בוגר, תואמת באופן מלא למוצרי שעתוק הפוך של miRcute. מערכת הבאפר משפרת את יעילות ההישבטות (annealing) של הפריימרים עבור אמפליקונים קצרים של miRNA, ומספקת אותות פלואורסצנציה יציבים ורגישות גבוהה לזיהוי של miRNA בעל ביטוי חלש. U6 snRNA משמש בדרך כלל כייחוס פנימי לנורמליזציה. |
| תמיסת פניצילין-סטרפטומייצין (100×) | Beyotime Biotechnology | C0222 | תערובת מסוננת סטרילית המכילה 10,000 U/mL פניצילין ו-10 mg/mL סטריפטומייסין; דילול עבודה של 1:100 במצע תרבית למניעת זיהום חיידקי. |
| ערכה לבדיקת מיני חמצן ראקטיביים עם מדלל | Beyotime Biotechnology | S0034M | ערכה זו משתמשת בחסון הפלואורסצנטי DCFH-DA לצורך כימות של מיני חמצן רהאקטיביים (ROS) תוך-תאיים. DCFH-DA חודר את ממבנה התא ועובר הידרוליזה על ידי אסטראזה תוך-תאית ל-DCFH, אשר מחומצן על ידי ROS ליצירת DCF פלואורסצנטי. הערכה תואמת למיקרו-פלטה בעלת 96 בארות ולקורא מיקרו-פלטות פלואורסצנטי לצורך זיהוי בסביקת תפוקה גבוהה (Ex = 488 nm, Em = 525 nm). הערכה מצוידת במדלל חסון ייעודי ובריאגנט בקרת חיוביות Rosup לייצוב אותות הצביעה, והיא מתאימה לזיהוי עקה חמצונית בתאי מיקרוגליה BV2 דבקים ללא ליזיס של התאים. |
| ערכה לבדיקה של גלוטתיון רדוקציוני (GSH) | המכון להנדסה ביו-טכנולוגית ג'יאנצ'נג בננג'ינג (Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute) | A006-1-2 | ערכה קולורימטרית למיקרו-פלטה לזיהוי גלוטתיון רדוקטז (GSH), נוגד החימצון התאי המרכזי. GSH מגיב עם חומצה דיתיאו-דיניטרובנזואית (DTNB) כדי להפיק תוצר כרומוגני צהוב, שספיגתו נמדדת באורך גל של 405 ננומטר באמצעות קורא מיקרו-פלטות. הערכה מתאימה פרוטוקול סטנדרטי במבחנות לזיהוי בתפוקה גבוהה במיקרו-פלטה בעלת 96 בארות, לצורך ניתוח נוגדי חימצון בליזאט של תאים. |
| si-LINC00707 | GenePharma (שנגחאי, סין) | לא ניתן להציג תוכן לתרגום. | RNA מספרי קטן (small interfering RNA) שנועד להפחית את ביטוי LINC00707 בתאי BV2. משמש לניסויי אובדן תפקוד (loss-of-function) כדי להעריך את ההשפעות של השתקת LINC00707 על תגובות דלקתיות, עקה חמצונית, ביטוי miR-145-5p וביטוי TRAF6. |
| si-LINC00707 NC | GenePharma (שנגחאי, סין) | לא ניתן לספק תרגום מכיוון שלא הוזן טקסט מקור. נא לספק את הטקסט באנגלית לתרגום. | RNA פריערה קטן (siRNA) שאינו מכוון, המשמש כביקורת שלילית עבור טרנספקציה של si-LINC00707. משמש לשליטה על השפעות לא ספציפיות של הליך הטרנספקציה והחשיפה ל-siRNA. |
| SuperReal PreMix Plus (SYBR Green) | TIANGEN | 4992777 | תערובת מוכנה (premix) אוניברסלית ל-qPCR כמותי עם SYBR Green עבור כימות יחסי של mRNA, המכילה Taq polymerase עם התנעה חמה (hot-start), dNTPs, SYBR Green I וצבע ייחוס ROX לנרמול פלואורסצנציה. הגברה לא ספציפית נמוכה, יעילות הגברה יציבה, ושימוש נרחב לכימות גנים מטרת mRNA (כגון TRAF6, GAPDH וכו'). |
| צנטריפוגה קטנה לשולחן Thermo ScientificTM SorvallTM ST 8 | Thermo Scientific | 75200709 | הבחירה הקלאסית עבור מעבדות קליניות, המסוגלת לטיפול בעד 24 × 5/7 מ"ל של מבחנות לאיסוף דם בבת אחת. סדרת R היא גרסה מקוררת, היכולה להגן טוב יותר על דגימות הדורשות סרטיפוגציה בטמפרטורה נמוכה. |
| ערכה לסינתזה של cDNA גדיל ראשון TIANScript II | TIANGEN | GKR107-02 | תוכנן עבור שעתוק הפוך כללי של mRNA ליצירת cDNA באורך רב של עד 12 kb. מצויד גם בפריימרים מסוג Oligo (dT) 15 וגם בפריימרים של הקסמרים אקראיים (random hexamers) לאסטרטגיות פרימינג גמישות. ה-reverse transcriptase של M-MLV המ модиפייד קורא ביעילות דרך תכנים בעלי אחוז GC גבוה ומבנים משניים מורכבים של mRNA, עם תאימות רחבה להגברה של mRNA ב-qPCR בהמשך התהליך. |
| TNF-α ערכה ל-ELISA מסוג SimpleStep | Abcam | ab236712 | ערכה ל-ELISA מסוג סנדוויץ' (sandwich ELISA) מהירה בשטיפה אחת (SimpleStep), המותאמת לזיהוי כמותי של גורם נמק גידולי (tumor necrosis factor) של חולדהα (TNF-α) בתעלי supernatant של תרביות תאים, בסרום ובדגימות פלזמה שונות. משך הבדיקה הכולל הוא 90 דקות, עם רגישות גבוהה במיוחד של 1.04 pg/mL וטווח גילוי לינארי מ-15.63 pg/mL ועד 1000 pg/mL. מצויד ב-8 נתיבים נתיקים×פלטה בעלת 12 בארות עם ציפוי מוקדם; ערכי OD ב-450 ננומטר נרשמים עבור TNF- סופי-α חישוב כמותי. |
| ערכה למדידת סך superoxide dismutase (T-SOD) | המכון להנדסה ביו-טכנולוגית נאנג'ינג ג'יאנצ'נג (Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute) | A001-3-2 | ערכה של מיקרופלטה כרומוגנית WST-1 לגילוי פעילות אנזימטית כוללת של SOD. SOD מסלק רדיקלי אניון סופראוקסיד ומעכב את תגובת החזרת ה-WST-1. בליעה נמדדת באורך גל של 450 ננומטר באמצעות קורא מיקרופלטות לצורך חישוב הפעילות. מתאימה לדגימות של הומוגנאט תאים, סרום ורקמות, עם התפתחות צבע יציבה וחזרתיות גבוהה להערכת קיבולת נוגדי חמצון. |
| ריאגנט TRIzol | Thermo Fisher Scientific | 15596018 | ריאגנט פנול-גואנידין איזו-תיocyanate חד-פאזי לבידוד שלב אחד של RNA כולל מתאי מיקרוגליה בתרבית; מחלץ בו-זמנית DNA וחלבון מדגימות זהות. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.