מחקר זה נועד לבחון את המנגנונים המולקולריים הפוטנציאליים העומדים בבסיס ההשפעות הנוגדות חמצון והנוגדות דלקת של amygdalin במודל של alopecia areata בעכברי C3H/HeJ ובמודל של פגיעה במלנוציטים אפדרמליים ראשוניים של בני אדם שגרמה H2O2.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר מחקר
* These authors contributed equally
מחקר זה נועד לבחון את המנגנונים המולקולריים הפוטנציאליים העומדים בבסיס ההשפעות הנוגדות חמצון והנוגדות דלקת של amygdalin במודל של alopecia areata בעכברי C3H/HeJ ובמודל של פגיעה במלנוציטים אפדרמליים ראשוניים של בני אדם שגרמה H2O2.
מאמר זה נועד לבחון את המנגנון של ההשפעה הטיפולית של אמיגדלין (AMG) על אלופציה אריאטה (AA). צביעת Hematoxylin-eosin שימשה לבדיקת הרעילות הכבדית והכלייתית של AMG. לאחר הקמת מודל AA בעכברי C3H/HeJ ובמלנוציטים אפידרמליים ראשוניים של בני אדם (HPEMs) שנפגעו על ידי H2O2, ובעקבות התערבות באמצעות AMG, נוטרו תכולת המינים הreactive של החמצן (ROS) ורמות החלבון והגן של forkhead box O3A (FOXO3a). ערכות ביוכימיות או בדיקת enzyme-linked immunosorbent assay שימשו לזיהוי התכנים של superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), glutathione peroxidase 4 (GPX-4), malondialdehyde (MDA), interleukin-15 (IL-15), interferon-gamma (IFN-γ), ו-interleukin-6 (IL-6). Western blot בוצע כדי להעריך את רמות ה-MHC I, IL-15, FOXO3a, SOD, CAT, GPX-4, IFN-γ, IL-6, ו-IL-15. ChIP-PCR בוצע כדי להעריך את העשירה של AMG בפרומוטורים של SOD, CAT, ו-GPX-4 ב-FOXO3a. במקביל, נחקרו ROS, אפופטוזה, ורמות החלבון והגן של FOXO3a, SOD, CAT, ו-GPX-4 ב-HPEMs עם ביטוי נמוך של FOXO3a. ל-AMG אין רעילות פוטנציאלית לכבד או לכליות והוא יכול להפחית את ביטוי חלבוני MHC I ו-IL-15 בעור, כמו גם את רמת ה-IL-15 בסרום. AMG יכול להגביר את ביטוי החלבון והגן של FOXO3a בעור, כמו גם את רמות ה-SOD, CAT, ו-GPX-4, תוך הפחתת רמות ROS ו-MDA. AMG יכול לעכב את MHC I, IFN-γ, IL-6, ו-IL-15, MDA, אפופטוזה, וייצור ROS ב-HPEMs, ולהגביר את תכני ה-SOD, CAT, ו-GPX-4. חשוב לציין, כי AMG יכול להעלות את ביטוי הגנים והחלבונים של FOXO3a, SOD, CAT, ו-GPX-4, ולהעשיר את FOXO3a בפרומוטורים של SOD, CAT, ו-GPX-4. נתונים אלו מרמזים כי AMG יכול לקדם את ביטוי FOXO3a ולעכב עקה חמצונית ותגובות דלקתיות, ובכך לשפר את מצב ה-AA בעכברי C3H/HeJ.
אלופציה אריאטה (AA) היא הפרעה אוטואימונית המאופיינת בנשירה פתאומית של שיער ללא השארת צלקות, ושכיחותה העולמית היא כ-2–3%, עם למעלה מ-30 מיליון חולים בסין1. נתונים אפידמיולוגיים מראים כי המחלה יכולה להשפיע על אנשים בכל קבוצות הגיל, אך היא שכיחה יותר בקרב מבוגרים צעירים, כאשר כ-60% מהחולים חווים את ההתפרצות הראשונה לפני גיל 20, ביחס כמעט שווה בין גברים לנשים1,2. ברמה עולמית, השכיחות השנתית של AA היא כ-0.2–0.3%, כאשר 40% מהמקרים הם AA באתר בודד, 35% AA באתרים מרובים, 5% קרחת מלאה ו-2% אלופציה אוניברסלית3,4,5. מבחינת סיבוכים, לכ-30% מהחולים יש שקעים בציפורניים, חריצים אורכיים ונזקים אחרים, ושיעור התחלואה הנלווית למחלות אוטואימוניות כגון הפרעות בבלוטת התריס וויטיליגו גבוה מהרמות הנצפות באוכלוסייה הכללית6,7. מהיבט מזיק, AA אינה משפיעה רק על המראה החיצוני אלא נוטה לגרום גם לבעיות פסיכולוגיות כגון דיכאון וחרדה, כאשר כ-70% מהחולים עם התפרצות ראשונית חוו אירועי סטרס משמעותיים בתוך 3 חודשים לפני תחילת המחלה8,9. ללא טיפול לאורך זמן, חולים עלולים להתקדם לקרחת מלאה או לאלופציה אוניברסלית, דבר המשפיע קשות על התפקוד החברתי ועל איכות חייהם10.
נכון להיום, הרפואה המערבית משתמשת בעיקר בשילוב של תרופות מקומיות, תרופות לבליעה, פיזיותרפיה והשתלת שיער לטיפול ב-AA11,12. טיפול מקומי כולל בעיקר תמיסת minoxidil וקורטיקוסטרואידים (כגון קרם fluticasone propionate), אשר ממריצים את זקיקי השיער ומעכבים תגובות חיסוניות מקומיות כדי לעודד צמיחת שיער, אך שימוש ממושך עלול להוביל לתגובות לוואי כגון אטרופיה של העור13,14. עבור חולים עם מחלה פרוגרסיבית, מדכאי חיסון דרך הפה (כגון prednisone ו-cyclosporine) יכולים לווסת ביעילות את התגובה החיסונית הסיסטמית, אך נדרש ניטור קבוע של תפקודי הכבד והכליות12,15. בפיזיותרפיה, קרינת ultraviolet בטווח צר ובאורך גל בינוני וטיפול בלייזר בעוצמה נמוכה משפרים את המיקרוסירקולציה כדי לסייע לצמיחת שיער, אך נדרשים טיפולים מרובים, וההשפעה משתנה מאדם לאדם16,17. במקרים עקשניים, ניתוח להשתלת שיער יכול להשתיל זקיקי שיער בריאים לאזור הקירחה, אך קיים סיכון לכישלון ההשתלה, ונדרש תחזוקה תרופתית18. יתרונות הטיפול ברפואה מערבית טמונים בתחילת השפעה מהירה ובסטנדרטיזציה גבוהה, במיוחד עבור AA מוקדם ומקומית19. עם זאת, חסרונותיו כוללים נטייה להישנות (rebound) בשימוש בתרופות הורמונליות, תופעות לוואי משמעותיות של מדכאי חיסון, ויעילות מוגבלת עבור חולים עם קירחה מלאה/אלופציה אוניברסלית20,21. בנוסף, מחזור הטיפול ארוך (בדרך כלל 3–6 חודשים), והעלות גבוהה (למשל, עלות שנתית של מעכבי JAK וסוכנים ביולוגיים, העולה על 100,000 yuan), דבר המגביל את יישומם הנרחב19,22. בשל הסיבות הרבות שהוזכרו לעיל, המחברים חשים צורך דחוף לחקור תרופות מטרות חדשות.
עקה חמצונית תורמת באופן משמעותי למנגנון הפתוגני של AA. במהלך תהליך סינתזת הפיגמנט במלנוציטים, מיוצרת כמות גדולה של מימן פראוקסיד (H2O2)23,24. בנסיבות רגילות, ניתן לנקות זאת באמצעות אנזימים נוגדי חמצון (כגון superoxide dismutase (SOD) ו-catalase (CAT))25. עם זאת, בקרב אנשים עם AA, פעילות האנזימים נוגדי החמצון היא לרוב נמוכה יותר, מה שמוביל להצטברות של תוצרי חמצון וגורם לנזק ל-DNA ולאפופטוזיס של תאים26,27. מצב של עקה חמצונית זו יפעיל עוד יותר את התגובה הדלקתית, וישחרר מתווכי פרו-דלקתיים (כגון TNF-α ו-IFN-γ), מה שיצור מעגל קסמים של עקה חמצונית ודלקת28. התגובה הדלקתית תוקפת את זקיקי השיער באמצעות לימפוציטים T, מה שגורם לזקיקי השיער להיכנס לשלב מנוחה ולנשור29. ניסויים קליניים מצאו כי למטופלים עם AA יש לעיתים קרובות מחלות אוטואימוניות אחרות (כגון מחלות בלוטת התריס)30, מה שמרמז כי הפרה חיסונית סיסטמית משמשת כגורם מעורר קריטי. בנוסף, עקה חמצונית ודלקת מקדמות יחד אפופטוזיס של תאי זקיק השערה, והשיבוש באותות האפופטוטיים יפגע עוד יותר ביכולת ההתחדשות של זקיק השערה, וימנע מהשיער לצמוח מחדש31. לכן, הטיפול ב-AA צריך לקחת בחשבון פעילות נוגדת חמצון, נוגדת דלקת וויסות של מסלולי אפופטוזיס כדי לשבור את מעגל הקסמים הזה.
אמיגדלין (AMG) הוא תרכובת גליקוזיד ציאנוגנית המופיעה באופן טבעי, ונמצאת בעיקר בזרעי צמחים השייכים למשפחת ה-Rosaceae (כגון גרעיני משמש, שקד, אפרסק ונשפר)32,33,34. מחקרים קודמים הראו כי AMG יכול לשפר פסוריאזיס על ידי הגברת תפקוד מחסום העור35. במקביל, ההשפעות האנטי-אפופטוטיות והאנטי-חמצוניות של AMG מאפשרות את השימוש בו לטיפול ב-AA36,37. ראיות קודמות אישרו גם כי AMG יכול לעכב את התגובה הדלקתית כדי להקל על תסמיני AA בעכברי C3H/HeJ38. עם זאת, המנגנון המולקולרי שבאמצעותו AMG מעכב דלקת ומקל על עקה חמצונית כדי לצמצם את ה-AA לא דווח באופן מקיף. מחקר זה הדגים בעיקר אירועי עקה חמצונית המתווכים על ידי שביל הסיגנלינג של forkhead box O3A (FOXO3a) כתוצאה מהתערבות של AMG בטיפול במודל AA של עכברי C3H/HeJ ובמודל פגיעה של מלאנוציטים אפידרמליים ראשוניים של בני אדם (HPEMs) המושרה על ידי H2O2.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אישור אתי והסכמה להשתתפות
הפרוטוקולים הניסויים הכוללים בעלי חיים אושרו על ידי ועדת האתיקה של Scientist Biotechnology Co., Ltd. (מספר אישור אתי: SYST-2024-014), בהתאם להנחיות ARRIVE 2.0 ומדריך ה-NIH לטיפול בבעלי חיים במעבדה. כמו כן, ועדת האתיקה של בית החולים המהי של מחוז סיצ'ואן (Sichuan Provincial People’s Hospital) העניקה אישור לשימוש אתי בדגימות קליניות מאנשים עבור in vitro ניסויים (מספר אישור אתי: 2024103). הושגה הסכמה מדעת מכל תורמי הרקמות. כל הפרטים המסחריים של הרכיבים והציוד ששימשו במחקר זה מופיעים ב- טבלת חומרים.
הקמת מודל AA בעכברי C3H/HeJ ומתן AMG
בהתבסס על הספרות הקודמת, הוקם מודל AA בעכברי C3H/HeJ והם טופלו ב-AMG38,39. בקצרה, שלושים עכברות C3H/HeJ (בגיל 6–8 שבועות) עברו תקופת אקלימציה של שבוע לפני שחולקו באופן אקראי לחמש קבוצות נפרדות: Control, AA, AMG-L, AMG-M ו-AMG-H. למעט קבוצת הביקורת, מודל ה-AA בארבע הקבוצות הנותרות הוקם על ידי מריחת 0.05 g של קרם imiquimod על עור הגב של העכברים. מריחה זו בוצעה שלוש פעמים בשבוע, ובסך הכל ניתנו תשעה מנתקים. שטח העור שנמרח היה 1.5 cm × 1.5 cm. עכברים הן בקבוצת הביקורת והן בקבוצת ה-AA קיבלו 0.02 mL/g של תמיסת סלין נורמלית על ידי gavage מדי יום. עכברים בקבוצות ה-AMG קיבלו זריקות תוך-קיבתיות במינונים של 60, 90 ו-120 mg/kg מדי יום. תקופת המתן נמשכה 21 ימים. לצורך תצפית כללית והערכה של מודל ה-AA, נדרשת פריקרה (alopecia) מעגלית מוגדרת היטב בקוטר ≥ 1 cm, ללא צלקות או דלקת חמורה, ועם מוטות שיער שבורים. עכברים המראים דלידול שיער דיפוזי בכל הגוף, כיבובים חמורים בעור או צמיחה מהירה וספונטנית של שיער מוחרגים מהניסוי.
HPEMs
בהתאם לשיטה הקודמת40, נבחרו רקמות עור בריאות ממטופלים שעברו ברית מילה בבית החולים והושרגו באלכוהול 75% למשך 5 min. לאחר מכן, רקמות העור נשטפו שוב ושוב ב-PBS המכיל ampicillin (100 U/mL) ו-streptomycin sulfate (100mg/mL), והודגרו בתמיסת dispase II בטמפרטורה של 4°C למשך לילה לצורך עיכול. שכבות האפידרמיס שהופרדו ובודדו נקיצו וסוננו דרך ממבנה סטרילי כדי להפיק את תרחף התאים. לאחר צנטריפוגציה, נאספו תאי השכבה התחתונה ששקעו, ולאחר מכן הושעו מחדש במצע melanocyte 254 ללא סרום ונזרעו שוב בצפיפות של כ-5 × 105 בבקבוקי תרבית ותובעתו באינקובטור CO2. לאחר שלושה מעברים, נעשה שימוש במלנוציטים טהורים עבור הניסויים הבאים.
הקמה של H2O2מודל פגיעה ממתח חמצוני במלנוציטים אנושיים המושרה על ידי [Source missing/blank] והתערבות באמצעות AMG
מלנוציטים אנושיים עם דרגת התמזגות של 60% עד 80% חולקו לקבוצת ביקורת ולקבוצות עם ריכוזים שונים של H2O2 (200, 400, 600, 800, ו- 1000 µM). לאחר דגירה של 24 שעות, חיוניות התאים הייתה הוערך בשיטת CCK-8. לאחר מכן, הריכוז האופטימלי של H2O2 הושתמש להקמת מודל של עקה חמצונית במלנוציטים, וריכוזים שונים של AMG (0.1, 0.25, 0.5, 1, 2.5, 5 ו-10 מ"ג/מ"ל) נוספו לתרבית למשך 24 שעות. לאחר מכן נבחר מדד חיוניות התאים כדי להעריך ולסנן את ריכוז ה-AMG.
בדיקת H&E
רקמות כבד וכליות של עכברים קובעו ב-4% פאראפורמאלדהיד למשך 24 שעות ונטמנו בפאראפין, לאחר מכן בוצע תהליך דהידרציה (הסרת מים) בשלבים הבאים: 70% אתנול למשך 4 שעות, 80% אתנול למשך שעתיים, 90% אתנול למשך שעתיים, 95% אתנול למשך שעתיים, אתנול אניהידרי פעמיים, שעה בכל פעם; וקסילן פעמיים, 30 דקות בכל פעם.38,39,41לאחר מכן, 4-µm חתכים בפרפין עברו צביעת H&E&צביעת E, הותיבשו, עברו בירירות (clearing) ועוגנו עם דבק ניטרלי (neutral gum). סורק 3D HISTECH שימש לדיגיטציה של חתכי הרקמה, ותמונות בהגדלה של 20× ו-40× תמונות תועדו בהגדלות שונות.
בדיקה אימונו-סורבנטית תלוית אנזים (ELISA) וזיהוי ביוכימי
רקמות עור הומוגניזו בתמיסת בופר ביחס של 1:9 (משקל/נפח), ולאחר מכן הופרדו בצנטריפוגה ב-1006–1789 × g למשך 10 דקות. לאחר כימות חלבונים בסרום, בתמריות מרקמות עור ובסופרנאט של תאים באמצעות BCA, נמדדו רמות של MDA, IL-6, IL-15 ו-IFN-γ באמצעות ערכות ELISA המתאימות. פעילויות האנזים של SOD, CAT ו-GPX-4 זוהו בהתאם להוראות של הערכות הביוכימיות הרלוונטיות.
ציטומטריה זורמת לגילוי מיני חמצן רהאקטיביים (ROS)
השתמשו במצע גידול נטול סרום לצורך דילול 10µM DCFH-DA ביחס של 1:1000. לאחר מכן, רקמות עור של עכבר או מלנוציטים אנושיים הוכנו כתלי תאים בריכוז של 1–20×106 תאים/מ"ל באמצעות 10µM DCFH-DA. התאים דגרו ב- 37°C במשך 20 דקות. במהלך תקופה זו, התאים נוערו ועורבבו מדי 3–5 דקות. לאחר שלושה שטיפות במצע נטול סרום, נמדדו רמות ה-ROS התוך-תאיים באמצעות ציטומטריית זרימה, כאשר אורכי גל העירור והפליטה נקבעו ל-488nm ו-525nm, בהתאמה.42,43.
מדידת אימונופלורסצנציה
דגרו נוגדן ראשוני FOXO3a (בדילול 1:1000) עם 4-µm חתכים של רקמת עור או HPEMs מקובעים למשך לילה ב- 4°Cלאחר מכן, הדגימות טופלו בנוגדנים משניים המסומנים בפלואורופורים מסוג Alexa Fluor וצבעו נגדי בתמיסת DAPI. לבסוף, הפרוסות נבחנו ותועדו באמצעות מיקרוסקופיה פלואורסצנטית. לצורך דימות פלואורסצנטי של ROS, נעשה שימוש ב-4-µm נתחים קפואים של רקמת עור או שקופיות HPEMs הוחממו מחדש בטמפרטורת החדר והובשו. סביב הרקמה סומן עיגול באמצעות עט היסטוכימי. השקופיות טופלו בחומר למניעת פלואורסצנציה עצמית (autofluorescence quencher) למשך 5 דקות ולאחר מכן נשטפו תחת מים זורמים למשך 10 דקות. תמיסת צביעה ל-ROS הוטפלה ודגרה בחושך ב- 37°C במשך 30 דקות. החתכים עברו שלושה שלבי שטיפה של 5 דקות ב-PBS באמצעות שייקר להסרת צבע. לאחר מכן, טפטפו תמיסת צביעה ב-DAPI והדגישו אותה במשך 10 דקות בתנאי חשיכה ובטמפרטורת החדר. הזכוכיות נחתמו באמצעות תווך למניעת פלואורסצנציה (quencher). לאחר מכן נבחנו הדגימות, ותמונות נאספו באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנציה. פרופילי העירור/פליטה הם 330–380/420 ננומטר עבור DAPI ו-510–560/590 ננומטר עבור Cy3.
וסטן בלוט (Western blot)
עבור רקמת עור של עכבר או מלנוציטים אנושיים, 50 מ"ג של רקמת העור או 2 × 105 תאים ו-1 מ"ל של תמיסת ליזיס RIPA, מועשרת במעכבי פרוטאז, הועברו לפרוטוקול בתוך מבחנת מיקרו-צנטריפוגה בנפח 1.5 מ"ל. לאחר 30 דקות במי קרח, בוצעה צנטריפוגציה למשך 5 דקות ב-12,000 g כדי לאסוף את פראקציית העילוי. לאחר שנקבע ריכוז החלבון בשיטת BCA, תמיסת החלבון ו-5× ערבבו תמיסת טעינה SDS ביחס נפחי של 4:1, ולאחר מכן הרתיחו במכחול מתכתי ב- 95 °C במשך 5 דקות. לאחר שהמדגם הועבר לאלקטרופורזה ב-SDS-PAGE בריכוז של 10% במתח של 80V או 120V, הועברו החלבונים בהעברה חשמלית (electrotransfer) לממברנה של 0.22-µm ממברנת PVDF בזרם קבוע של 200 mA למשך שעה אחת44,45לאחר מכן, חסמו את הממברנות בטמפרטורת החדר במנער צנטריפוגלי למשך שעה אחת באמצעות 5% חלב דל שומן (שהוכן עם בופר TBST). לאחר מכן, חשפו את הממברנות לנוגדנים ראשוניים ספציפיים ל- complex התאימות רקעיתית גדולה מחלקה I (MHC I) (1:1000), IFN-γ (1:1000), IL-6 (1:1000), IL-15 (1:1000), β-אקטין (1:1000), SOD (1:1000), CAT (1:1000), גלוטתיון פרוקסידאז 4 (GPX-4) (1:1000), ו-FOXO3a (1:1000) ב- 4 °C במהלך הלילה. ולאחר מכן, הדמיונות נחשפו לנוגדן משני (1:10,000) למשך שעה אחת בטמפרטורת החדר. נעשה שימוש בריאגנט כימילומנסנטי ECL לפיתוח וללכידת תמונות באמצעות ChemiScope 6100.
תגובת שרשרת פולימראז עם שעתוק הפוך כמותי (qRT-PCR)
ראשית, ה-RNA מהדגימה של רקמת עור של עכבר או ממלנוציטים אנושיים הופק בהתאם להוראות היצרן של ערכת מיצוי ה-RNA הכולל (total RNA). בהתאם להוראות ההפעלה של ערכת השעתוק ההפוך, פרמטרי מכשיר ה-PCR נקבעו כדלקמן: 25°C במשך 10 דקות, 42°C במשך 15 דקות, ו- 85°C במשך 5 דקות כדי לקבל דגימות cDNA. באופן דומה, הפרמטרים להגדרת מכשיר ה-PCR היו כדלקמן כדי להשיג מספר עותקים מספיק של DNA: דנטורציה ראשונית: 95°C למשך 5 דקות, מחזור אחד; דנטורציה: 95°C למשך 10 שניות, 40 מחזורים; אפשרה (Annealing) והארכה: 60°C למשך 30 שניות, 40 מחזורים. הביטוי הנורמל של הגן המבוקש מחושב באמצעות הנוסחה הבאה: 2‑ΔΔCq (ΔΔCq = Cqמטרה‑Cqβאקטין-)46,47המידע על רצפי הפריימרים של הגנים עבור qRT-PCR מוצג ב- טבלה 1.
ניתוח ChIP-PCR
ניתוח ChIP-PCR בוצע בהתאם לפרוטוקול הקודם48. ראשית, התאים עברו קישור צולב (cross-linking) עם 1% formaldehyde למשך 10 דקות, ותמיסת glycine הוספה כדי להפסיק את תגובת הקישור הצולב. לאחר שטיפה עם PBS מקורר מראש המכיל PMSF, התאים עברו ליסיס באמצעות SDS lysis buffer המכיל PMSF. לאחר מכן, ה-chromatin DNA שובש למקטעים שגודלם נע בעיקר בין 200 ל-1,000 bp באמצעות ultrasonic cell disruptor, וגודל המקטעים אומת על ידי אלקטרופורזה בג'ל agarose. דגימות הכרומטין המשובש הושעו שוב ב-ChIP dilution buffer המכיל PMSF, ו-20µL מהדגימה נלקחו כקבוצת בקרת input. שאר הדגימות טופלו מראש עם Protein A+G Agarose/Salmon Sperm DNA. לאחר מכן, הוסף 0.5µg של נוגדן ראשוני, ואחריו דגירה למשך לילה ב-4°C עם ניעור איטי. קבוצת הבקרה השלילית טופלה בכמות שווה של rabbit IgG. למחרת, הוספו חרוזי Protein A+G agarose כדי ללכוד את קומפלקסי האנטיגן-נוגדן, והקומפלקסים נשטפו ברצף עם low salt immune complex wash buffer, high salt immune complex wash buffer, LiCl immune complex wash buffer ו-TE buffer. הקומפלקסים שהושגו באמצעות אימונו-שיקוע (immunoprecipitated) הולוכו (eluted) באמצעות elution buffer, והן תוצרי ההלוכה והן הדגימות בקבוצת בקרת ה-input עברו טיפול בחום ב-65°C למשך 4 שעות כדי לשבור את הקשרים הצולבים. לאחר עיכול חלבונים באמצעות proteinase K, ה-DNA בודד באמצעות חילוץ phenol-chloroform ולאחריו השקיעה באתנול. ה-DNA המטוהר הומס ב-TE buffer ושימש לניתוח qRT-PCR בהמשך. מידע על רצפי הגנים עבור ChIP-PCR מוצג ב-Table 2.
האתרים הגנומיים המועמדים עבור ChIP-PCR נבחרים באמצעות חיזוי in silico באמצעות מאגר הנתונים JASPAR (https://jaspar.elixir.no/). באופן ספציפי, החוקרים שלפו את רצפי הפרומוטור המשתרעים על פני 2000 bp במעלה ה-TSS של הגנים CAT, SOD ו-GPX4. רצפים אלה נסרקו לאיתור מוטיבים של קישור FOXO3a באמצעות מטריצת משקלי מיקום (PWM) המתאימה. כדי לאזן בין הרגישות לספציפיות, קבעו המחברים סף של ציון פרופיל יחסי של >80%. מבין כל המוטיבים החזויים שעמדו בקריטריון זה, בחרו המחברים את שני האתרים המשוערים בעלי הציונים הגבוהים ביותר עבור כל גן כאזורים מועמדים לאימות באמצעות ChIP-PCR. לדוגמה, בגן CAT, האתרים שנבחרו ממוקמים ב-733- bp ו-1259- bp ביחס ל-TSS. הנוגדן anti-FOXO3a ששימש במחקר זה הוא נוגדן בדרגת ChIP הזמין מסחרית. כדי להבטיח ספציפיות, החלו המחברים שני ביקורות שליליות עצמאיות עבור כל בדיקת ChIP-PCR: נוגדן isotype IgG ולוכס גנומי שלילי. ביקרת ה-isotype IgG בוצעה כהסמכה חיסונית מקבילה באמצעות IgG לא-חיסוני מאותו מין. עבור הלוקס הגנומי השלילי, תכננו המחברים זוג פריימרים ספציפי המכוון לאזור שאינו קושר, שחסר בו כל מוטיב קונסנזוס חזוי של FOXO3a. אזור ביקורת זה אפשר למחברים לשלול העשרה הנובעת מגזירה מקרית של כרומטין או הגברה לא ספציפית של PCR. פי ההעשרה חושבו באמצעות אסטרטגיית נורמליזציה בת שלושה שלבים.
שלב 1: הזנת ΔCt מנורמל, ΔCt [IP מנורמל] = Ct[IP]-(Ct[Input]-log₂(DF)) (1)
ΔCt [IgG מנורמל] = Ct[IgG] - (Ct[Input] - log₂(DF)). (2)
DF = מקדם דילול הקלט (Input Dilution Factor); בניסוי, DF = 10, כיוון שנעשה שימוש ב-10% קלט.
שלב 2: ΔΔCt בין IP ל-IgG:
ΔΔCt [IP/IgG] =ΔCt [normalized IP]-ΔCt [normalized IgG] (3)
שלב 3: פי כמה העשרה (Fold enrichment) = 2(-ΔΔCt [IP/IgG]). (4)
ניתוח סטטיסטי
הנתונים מוצגים כממוצע ± סטיית תקן בהתבסס על לפחות שלושה ניסויים עצמאיים. ניתוחים סטטיסטיים בוצעו באמצעות תוכנת GraphPad Prism (גרסה 6.0). השוואה של נתונים בין קבוצות מרובות בעלות התפלגות נורמלית והומוגניות של השונות הוערכה באמצעות ניתוח שונות חד-כיווני (ANOVA), ולאחריו מבחן post-test של Tukey. מובהקות סטטיסטית נקבעה עבור p < 0.05.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ל-AMG אין רעילות כבדית-כלייתית בעכברי C3H/HeJ תקינים
כדי לזהות בבירור את הרעילות הפוטנציאלית של AMG לכבד ולכליות מנקודת מבט ניסויית, חוקרים ניהלו שלושה מינונים (60, 90 ו-120 mg/kg) שנחקרו בעבר בעכברי C3H/HeJ תקינים באמצעות הזנה בבלון קיבתי (gavage) 38. כפי שמוצג ב-איור 1, לאחר מתן תוך-קיבתי של AMG בשלושה מינונים למשך 21 ימים, מבנה האונה הכבדית היה ברור, כאשר ההפטוציטים היו מסודרים באופן מאורגן. הרקמות הקורטיקליות והמדולריות של הכליה היו תקינות, ולא נצפו נזקים או נגעים ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ל-AMG עצמו אין רעילות ישירה. הוא עובר הידרוליזה על ידי אנזימים מיקרוביאליים במעיים או על ידי חומצה בקיבה, תהליך המייצר ומשחרר מימן ציאניד רעיל ביותר49. מימן ציאניד נספג לאחר מכן במהירות דרך מערכת העיכול אל זרם הדם ומתפשט ברקמות הגוף, ובכך גורם להיפוקסיה ברקמות של מערכת העצבים, מערכת הלב וכלי הדם ומערכת הנשימה50. מבחינת מנגנון הפעולה, מימן ציאניד נקשר ליוני הברזל בציטוכרום אוקסידאז, חוסם את שרשרת הנשימה התאית, מה שמוביל להיפוקסיה של הרקמות ולהפרעות מטבוליות תאיות, ומעורר הרע...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
לכותבים אין ניגודי עניינים להצהיר.
תרומת המחברות:
שון הוא: חקירה, מתודולוגיה, כתיבה – גרסה מקורית. ג'ינסונג ליו, ג'יאווי וואנג, וז'ה דאי: ארגון נתונים. יוג'נג גונג, ויי לו, ו샤וואי שַה: תוכנה, ויזואליזציה ואימות. שון הוא: הקצאת מושגים, כתיבה – סקירה &עריכה, רכש מימון, ופיקוח
עבודה זו נתמכה על ידי ועדת הבריאות של מנהיגי מחוז סיצ'ואן (2024-221).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 5×All-In-One MasterMix (עם ערכת AccuRT להסרת DNA גנומי) | Applied Biological Materials Inc., ג'יאנגסו, סין | G492 | |
| βנוגדן לאקטין | Affinity Biosciences Co., Ltd., ווהאן, סין | AF7018 | |
| אמיגדלין | Chengdu Herbpurify Co., Ltd., צ'נגדו, סין | K-001-181216 | |
| נוגדן לקטלאז | Proteintech, ווהאן, סין | 66765-1-Ig | |
| ערכה לבדיקת קטלאז | Elabscience, ווהאן, סין | E-BC-K031-M | |
| עכברי C3H/HeJ | Chengdu Yaokang Biotechnology Co., Ltd., צ'נגדו, סין | N000190 | |
| ערכה לבדיקת ChIP | Beyotime Biotechnology, שנגחאי, סין | P2078 | |
| תווך גידול 254 | Gibco, Thermo Fisher Scientific, אמריקה | M-254-500 | |
| סוכן צביעה DAPI | Servicebio, ווהאן, סין | G1012 | |
| Dispase II | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd., שנגחאי, סין | S25046 | |
| EvaGreen Express 2×תערובת qPCR מוכנה (MasterMix) ללא צבע | Applied Biological Materials Inc., ג'יאנגסו, סין | MasterMix-ES | |
| Fast black HB | Sangon Biotech Co., Ltd., שנחאי, סין | A602008-0025 | |
| סרום עגל עוברי | כל הירוק | 13011-8611 | |
| מיקרוסקופ פלואורסצנציה | SOPTOP | CX40 | |
| נוגדן FOXO3a | Proteintech, ווהאן, סין | 10849-1-AP | |
| מיקרוטום להקפאה | Thermo | קריוטום E | |
| נוגדן ל-Glutathione peroxidase 4 | Proteintech, ווהאן, סין | 67763-1-Ig | |
| ערכה למדידת גלוטתיון פראוקסידאז 4 | Elabscience, ווהאן, סין | E-BC-K883-M | |
| Image-pro plus 6.0 | Media Cybernetics, Inc., רוקוויל, מרילנד, ארה"ב | —— | |
| קרם Imiquimod | Sichuan Mingxin Pharmaceutical Co. Ltd., צ'נגדו, סין | H20030129 | |
| נוגדן לאינטרפרון גמא | Proteintech, ווהאן, סין | 15365-1-AP | |
| ערכה לגילוי interferon gamma | Elabscience, ווהאן, סין | E-EL-H0108 ו-E-EL-M0048 | |
| נוגדן לאינטרלוקין 6 | Proteintech, ווהאן, סין | 21865-1-AP | |
| ערכה לבדיקת אינטרלוקין 6 | Elabscience, ווהאן, סין | E-EL-H6156 ו-E-EL-M0044 | |
| נוגדן לאינטרלוקין 15 | Affinity Biosciences Ltd., ווהאן, סין | DF2521 | |
| ערכה לזיהוי אינטרלוקין 15 (Interleukin 15 kit) | Elabscience, ווהאן, סין | E-EL-H0222 ו-E-EL-M0728 | |
| ערכה למדידת מלונדיאלדהיד (Malondialdehyde kit) | Elabscience, ווהאן, סין | E-EL-0060 | |
| נוגדן MHC | Affinity Biosciences Ltd., ווהאן, סין | DF8558 | |
| מיקרוסקופ אופטי | ZEISS | Primo Star | |
| סכין לחיתוך פאראפין | Thermo Scientific | HM325 | |
| תוכנה לסריקה פתולוגית | 3DHISTECH (הונגריה) | צופה שקופיות 2.5.0 | |
| תמיסת פניצילין-סינטרויד (Penicillin-synthroid solution) | Biosharp, בייג'ינג, סין | BL505A | |
| IgG של ארנבת | Beyotime Biotechnology, שנגחאי, סין | A7016 | |
| ערכה לבדיקת ROS | Beyotime Biotechnology, שנגחאי, סין | S0033M | |
| נוגדן ל-Superoxide dismutase 1 | Proteintech, ווהאן, סין | 10269-1-AP | |
| מכשיר להטמעה של רקמות | Wuhan Junjie Electronics Co., Ltd., ווהאן, סין | JB-P5 | |
| מחלץ מים מרקמה (Tissue hydroextractor) | Thermo Scientific | STP420 ES | |
| ערכה לבידוד RNA כולל | Foregene, צ'נגדו, סין | RE-03014 | |
| ערכה למדידת סך superoxide dismutase | Elabscience, ווהאן, סין | E-BC-K020-M | |
| וזלין לבן | Shanghai Aladdin Biochemical Technology Co., Ltd., שנגחאי, סין | P434227 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.