אלקטרו-אקופונקטורה משפרת את תפקוד הלב ומקלה על פגיעה בשריר הלב בחולדות עם אי-ספיקת לב כרונית
כדי להעריך את ההשפעות של EA על CHF, הוקם מודל חולדה באמצעות ליגציה של העורק הכלילי LAD, ולאחריה התערבויות של EA ספציפי או Sham EA. בוצעו הערכות שיטתיות, כולל אקו-קרדיוגרפיה, בדיקות ביוכימיות וצביעה היסטולוגית (איור 2A). מבחינה תפקודית, קבוצת ה-CHF הראתה התרחבות של החדרים ופגיעה בספיקות. טיפול ב-EA שיפר את הירידה ב-LVEF וב-LVFS שנצפתה בחולדות עם CHF, בעוד שקבוצת ה-Sham EA הראתה רמות תפקוד לבבי דומות לאלו של קבוצת ה-CHF (איור 2B ו-איור 2C).
יתרה מכך, EA הפחיתה את רמות ה-NT-proBNP וה-cTnT בסרום, מה שמעיד על הפחתה בעומס הלבבי והפגתי של פגיעה בשריר הלב. לעומת זאת, קבוצת ה-Sham EA הראתה פרמטרים ביוכימיים הדמים לאלו של קבוצת ה-CHF (איור 2E,F). ניתוח היסטולוגי הראה כי קבוצת ה-CHF הציגה נזק מבני בשריר הלב ופיברוזיס. טיפול ב-EA שיפר את ארכיטקטורת שריר הלב והפחית את ה-CVF, בעוד שקבוצת ה-Sham EA שמרה על שינויים פתולוגיים ורמות CVF דומות לאלו של קבוצת ה-CHF (איור 2D). באופן כללי, EA הפעילה השפעות cardioprotective נגד CHF, בעוד שהתערבות ה-Sham EA לא הניבה תוצאות טיפוליות דומות.
דיקור חשמלי מפעיל נוירונים בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius) בחולדות עם אי-ספיקת לב כרונית
כדי לקבוע האם ה-NTS מתווך את התגובה המרכזית לטיפול ב-EA, הוערכה האקטיבציה העצבית על ידי צביעה ל-c-Fos, סמן לעירור עצבי. דימוי אימונופלואורסצנציה (איור 3A) וספירה כמותית של תאים (איור 3B) גילו כי מספר הנוירונים החיוביים ל-c-Fos ב-NTS היה נמוך יותר בקבוצת ה-CHF בהשוואה לקבוצת ה-Sham. עם זאת, טיפול ב-EA העלה את ביטוי ה-c-Fos לרמות הדומות לקו הבסיס של קבוצת ה-Sham. במקביל לתוצאות התפקודיות הפריפריות, קבוצת ה-Sham EA הראתה רמות ביטוי דומות של c-Fos בהשוואה לקבוצת ה-CHF.
כדי להעריך את המצב התפקודי של נוירונים אלו ב-NTS, הוקלטו אותות אלקטרופיזיולוגיים in vivo. עקומות פריקת הפולסים (איור 3C) וקצב הירי הממוצע הכמותי (איור 3D) תאמו לממצאי ההיסטולוגיה. תדירות הירי הספונטנית של נוירוני NTS הייתה מופחתת בתנאי CHF. לעומת זאת, התערבות EA העלתה את קצב הירי הנוירונלי, בעוד שפרוצדורת Sham EA לא גרמה לשינויים אלקטרופיזיולוגיים own כאלה.
דפוס זה של הפעלה עצבית נתמך על ידי ניתוח פוטנציאל השדה המקומי (LFP). כפי שמוצג בספקטרוגרמות של סקאלת צבעי LFP בדו-ממד ובמפות צפיפות הספקטרום של ההספק בתלת-ממד (איור 3E), האנרגיה התנודתית העצבית בתוך ה-NTS נחלשה במהלך מצב ה-CHF. בעקבות טיפול ב-EA, חלה עלייה בעוצמת ההספק לאורך ספקטרום התדרים העצבי, מה שמעיד על הפעלת הרשת, דבר שלא נראה בקבוצת ה-Sham EA.
כדי לבחון את הרלוונטיות הפיזיולוגית של הפעלה מרכזית זו, בוצע ניתוח מתאם פירסון, אשר שילב מדריקים לבביים פריפריים עם פעילות נוירונלית מרכזית ב-NTS (איור 3F). הניתוח הדגים כי קצב הפריקה הממוצע והבעת c-Fos בתוך ה-NTS היו במתאם חיובי עם ה-LVEF. לעומת זאת, מדדי פעילות עצבית מרכזית אלה הראו מתאם שלילי עם NT-proBNP, סמן דם לאי-ספיקת לב. מתאמים אלו מעידים כי ההפעלה העצבית של ה-NTS המודולת על ידי EA קשורה ליעילותה במיגון לב פריפרי.
אלקטרו-אקופונקטורה משנה את הפרופיל הפרוטאומי הגלובלי בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius)
בשל היעדר היעילות הטיפולית שנצפתה בקבוצת ה-Sham EA במהלך ההערכות התפקודיות הקודמות, שלב הפרוטאומיקה כלל רק את קבוצות ה-Sham, ה-CHF וה-EA. לפני איסוף הרקמות, 12 חולדות לכל קבוצה עברו הערכה אקו-קרדיוגרפית לבדיקת ההשפעות הטיפוליות של EA, ותוצאות אלו מוצגות ב- איור משלים 1Aבעקבות הערכה זו, 6 רפליקות ביולוגיות מכל קבוצה הועברו לאנליזה פרוטאומיקה כמותית מבוססת ספקטרומטריית מסות.
בוצעו בקרת איכות ואנליזות רב-משתניות כדי להעריך את המהימנות ואת ההתפלגות הכללית של הנתונים הפרוטאומיים. המספר הכולל של החלבונים שזוהו היה 5,914 בקבוצת ה-Sham, 5,980 בקבוצת ה-CHF ו-5,836 בקבוצת ה-EA, מה שמעיד על זיהוי חלבונים בר השוואה בין שלוש קבוצות הניסוי (איור 4A ו- טבלה משלימה 1ניתוח מבדיל של ריבועי מינימום חלקיים (Partial least squares discriminant analysis) הדגים הפרדה ברורה בין קבוצות ה-Sham, ה-CHF וה-EA, דבר המעיד על פרופילים פרוטאומיים גלובליים מובחנים הקשורים למצב המחלה ולהתערבות ה-EA (איור 4B).
ניתוח אפליבט של ריבועים פחותים חלקיים אורתוגונליים בזוגות (Pairwise orthogonal partial least squares discriminant analysis) הדגים הפרדה נוספת בין קבוצת ה-Sham לקבוצת ה-CHF (איור 4C) ובין קבוצת ה-CHF לקבוצת ה-EA (איור 4D). מבחני פרמוטציה תואמים תמכו באמינות של המודלים הרלוונטיים. בנוסף, מפת חום של מתאם פירסון הראתה מתאמים גבוהים בתוך הקבוצות ודפוסים בין-קבוצתיים מובחנים בין הדגימות הפרוטאומיות, דבר התומך בחזרתיות של השכפולים הביולוגיים (איור 4E). יחד, ניתוחים אלו של בקרת איכות וניתוחים רב-משתנים העידו על כך שסט הדגימות הפרוטאומי היה חסון מספיק לצורך זיהוי וניתוח ביואינפורמטיקה של חלבונים בעלי ביטוי שונה.
אלקטרו-אקופונקטורה מווסתת חלבוני ליבה המבטאים באופן דיפרנציאלי ומסלולי איתות בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius)
כדי לחקור את המטרות המולקולריות של EA, נותחו השינויים בחלבונים. תרשימי הגעש (volcano plots) הציגו את התפלגות החלבונים בעלי הביטוי המוגבר והמופחת בהשוואות בין Sham ל-CHF ובין CHF ל-EA (איור 5A, טבלה משלימה 2, ו-טבלה משלימה 3). כדי לזהות את המטרות הטיפוליות, בוצע ניתוח חפיפה. כפי שמוצג בדיאגרמות ונ, זוהו 58 חלבונים בעלי ביטוי מוגבר בקבוצת ה-CHF אשר ביטויים פחת בעקבות טיפול EA, לצד 27 חלבונים בעלי ביטוי מופחת בקבוצת ה-CHF שביטוים גבר בעקבות התערבות EA (איור 5B ו-טבלה משלימה 4). סינון זה הניב סך של 85 חלבונים מרכזיים בעלי ביטוי שונה. מפת החום של ההclustering ההיררכי הדגימה כי התערבות ה-EA שינתה את דפוסי הביטוי הבלתי תקינים של 85 חלבונים אלו, והסיטה את הפרופילים שלהם לעבר קו הבסיס של קבוצת ה-Sham (איור 5C).
כדי לקבוע את התפקודים הביולוגיים של יעדים מרכזיים אלו, בוצעו ניתוחי העשרה של GO ו-KEGG בנפרד עבור שתי תתי-הקבוצות הנבדלות של חלבונים. עבור תת-הקבוצה של 58 חלבונים שהביטוי שלהם הופחת על ידי EA, תרשים הבועות של GO הדגים העשרה משמעותית בתהליכים ביולוגיים, כולל ארגון המטריצה החוץ-תאית וארגון מבנה חוץ-תאי, לצד רכיבים תאיים כגון מבנה מעטפת חיצוני וטרימר קולגן, ותפקודים מולקולריים, כולל קישור לקולגן וקישור לקולטן גלוטמט (איור 5D ו-טבלה משלימה 5). ניתוח נתיבי KEGG עוקב, שהוצג באמצעות תרשימי chord ו-Sankey, גילה כי 58 חלבונים אלו משתתפים במסלולים הכוללים עיכול וספיגה של חלבונים, את השלד התאי בתאי שריר, ונתיב האיתות של TGF-β (איור 5E ו-טבלה משלימה 6). ויזואליזציות טופולוגיות אלו הדגישו חלבונים ספציפיים, כולל COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN ו-DPF2, כצומת מרכזי המקשר בין מספר נתיבים פתולוגיים.
לעומת זאת, בוצעו אנוטציות פונקציונליות עבור תת-הקבוצה של 27 חלבונים שהביטוי שלהם עלה בעקבות התערבות ה-EA. ניתוח העשרה של GO הצביע על מעורבות בתהליכים ביולוגיים כגון ויסות גדילת תאים וויסות חיובי של הארכת שעתוק מבוססת DNA, וכן בתפקודים מולקולריים הכוללים קישור חלבונים תלוי סידן וקישור טטרה-פירול (איור 5F ו-טבלה נספחת 7). דיאגרמות Chord ו-Sankey תואמות של KEGG מיפו חלבונים אלו למסלולים קריטיים, כולל שינוי מבנה כרומטין תלוי ATP וקומפלקס הדכאה של polycomb (איור 5G ו-טבלה נספחת 8). ראוי לציין כי מיפוי רשת זה בידל חלבונים מרכזיים כגון YY1, E2F2 ו-ENTPD5, המגשרים בין רשתות איתות מרכזיות אלו. סיווג פונקציונלי מקיף זה הניח את התשתית המבנית לאימות המטרות הליבתיות שבוצע בהמשך.
טופולוגיית רשת ופרופיל ביטוי מזהים את YY1 כמטרה מועמדת הקשורה להשפעות של התערבות באלקטרו-אקופונקטורה
כדי לקבוע את הגן המרכזי (hub gene) מבין 85 החלבונים שהביטוי שלהם השתנה באופן מובהק, נבנתה רשת אינטראקציות חלבון-חלבון. ניתוח טופולוגי זיהה 18 צמתים בעלי ציוני קישוריות גבוהים (איור 6A ו-טבלה נספחת 9). לאחר מכן, נערך ניתוח נתיבי KEGG באופן ספציפי עבור 18 חלבוני המפתח הללו. דיאגרמות chord ו-Sankey התואמות מיפו את הקשרים המורכבים בין מוקדי מפתח אלה לבין רשראות אותות מועשרות, כולל שינוי מבני של כרומטין התלוי ב-ATP, קומפלקס הדיכוי polycomb, ונתיב האותות של TGF-β (איור 6A ו-טבלה נספחת 10). על בסיס פרופיל תפקודי זה, נבחרו 10 החלבונים בעלי ההעשרה הבולטת ביותר לסריקה נוספת. מכיוון שהמטרה הטיפולית של EA נמצאת במערכת העצבים המרכזית, 10 המועמדים הללו הוערכו באמצעות מאגר ביטויי הרקמות האנושי GTEx (איור 6B ו-איור נספח 1B–J). התוצאות הצביעו על כך שרק YY1 (איור 6B), DMAP1 (איור נספח 1C) ו-DPF2 (איור נספח 1D) בוטאו ברקמות מוח.
כדי לבודד את המטרה הפוטנציאלית בעלת התגובתיות הגבוהה ביותר ל-EA, בוצעו ניסויים מולקולריים in vivo תוך שימוש ברקמות NTS. qPCR כמותי שימש להערכת התגובתיות השעתוקית של שלושת המועמדים המועשירים את המוח. ביטוי ה-mRNA של YY1 פחת בתנאי CHF ועלה בעקבות טיפול ב-EA, בעוד שרמות ביטוי ה-mRNA של DPF2 ו-DMAP1 לא הראו שינויים מובהקים סטטיסטית בין הקבוצות הניסיוניות (איור 6C). סריקה שעתוקית זו פסלה את DPF2 ו-DMAP1 מוולדידציה נוספת ותמכה ב-YY1 כמועמד התגובתי העיקרי. אנליזת Western blot שלאחר מכן הצביעה על כך שרמות החלבון של YY1 פחתו בקבוצת ה-CHF ביחס לקו הבסיס של ה-Sham, בעוד שההתערבות ב-EA נגדה מגמה זו והגבירה את ביטוי החלבון של YY1 (איור 6D ו-איור 6E). תוצאות ניסיוניות אלו מעידות על כך ש-EA מעלה את ביטוי YY1 בתוך ה-NTS.
כדי לחקור את מנגנוני הבקרה השליליים (upstream) השולטים בביטוי של YY1, נותחו שינויי ההיסטון הקשורים אליו וגורמי שעתוק. חשוב לציין כי ממצאים אלו מבוססים אך ורק על תחזיות ביואינפורמטיות חישוביות שהופקו מ-Cistrome Data Browser ואינם מהווים תיקוף ניסיוני ישיר באמצעות ChIP-seq. התחזית האפיגנטית הדגישה שינויי היסטון, כולל H3K27ac, H3K27me3 ו-H3K4me3, עם ציוני פוטנציאל רגולטורי גבוהים עבור הלוכוס של YY1 (איור 6F). במקביל, דירוג הפוטנציאל הרגולטורי זיהה גורמי שעתוק כגון CDK9, PRDM1 ו-ELL2 כווסתים של YY1 (איור 6G). תחזיות ביואינפורמטיות אלו מתארות את הרשתות האפיגנטיות והשעתוקיות הפוטנציאליות השולטות בביטוי YY1 ב-NTS.
לסיכום, הנתונים המוצגים מדגימים כי התערבות EA משפרת ביעילות את תפקוד הלב המערכתי ומפחיתה פגיעה בשריר הלב בחולדות עם CHF. השפעות קרדיופרוטקטיביות פריפריאליות אלו מלוות באופן מרכזי בהשבה של פעילות פריקה עצבית ואנרגיה תנודתית עצבית בתוך ה-NTS. יתרה מכך, סריקה פרוטאומיקה כמותית זיהתה 85 חלבוני ליבה בעלי ביטוי Differentially Expressed והדגישה את גורם השחלוף YY1 כמועמד למטרה בעל תגובתיות גבוהה. יחד, ממצאים אלו מרמזים כי היעילות הטיפולית של EA נגד CHF קשורה קשורה באופן הדוק להשבה של התפקוד העצבי ב-NTS, וכי עלייה בביטוי של YY1 עשויה להיות מעורבת בתהליך נוירוביולוגי מרכזי זה.
זמינות נתונים
כל הנתונים שהופקו ונותחו כדי לתמוך בממצאי מחקר זה כלולים בכתב היד וב- קובץ משלים 1כדי לעמוד בדרישה לנגישות נתונים ציבורית, כל הנתונים הגולמיים הזמינים העומדים בבסיס מחקר זה הופקדו במאגר הציבורי Zenodo והם נגישים באופן חופשי באמצעות הקישור הבא: https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. נתונים תומכים נוספים זמינים מהכותבים המקשרים על פי בקשה סבירה.

איור 1: מערך הניסוי, הקמת מודל חולדה לאי-ספיקת לב כרונית והתערבות באמצעות אלקטרו-אקופונקטורה. (A) תרשים זרימה כללי של הניסוי, כולל ציר הזמנים והחלוקה לקבוצות עבור שתי סדרות הניסויים העצמאיות. (B) הקלטות מייצגות של אלקטרוקרדיוגרם לפני ואחרי קשירת העורק הכלילי LAD, כאשר החיצים מצביעים על התרוממות של מקטע ST המאשרת איסכמיה של השריר הלבבי. (C) ניתוח כמותי של LVEF ארבעה שבועות לאחר הניתוח לאישור הצלחת המודל (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham. (D) התערבות EA בנקודות הדיקור HT7 הדו-צדדיות. אנא לחצו כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: דיקור חשמלי (Electroacupuncture) משפר את תפקוד הלב ומפחית פגיעה בשריר הלב בחולדות עם אי-ספיקת לב כרונית. (A) תצלומי אקו-לב במצב M-mode מייצגים לצד תמונות של צביעת hematoxylin and eosin וצביעת Masson trichrome של רקמות שריר הלב בארבע קבוצות הניסוי (סרגל קנה מידה = 50 µm). (B) ניתוח כמותי של LVEF בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, ללא מובהקות לעומת קבוצת ה-CHF. (C) ניתוח כמותי של LVFS בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, ללא מובהקות לעומת קבוצת ה-CHF. (D) ניתוח כמותי של CVF בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 3, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ##p < 0.01 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, ללא מובהקות לעומת קבוצת ה-CHF. (E) ניתוח כמותי של רמות NT-proBNP בנסיוב בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, ללא מובהקות לעומת קבוצת ה-CHF. (F) ניתוח כמותי של רמות cTnT בנסיוב בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, ללא מובהקות לעומת קבוצת ה-CHF. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: אלקטרו-אקופונקטורה משחזרת את הפעילות הנוירונלית ב-nucleus tractus solitarius בחולדות עם אי-ספיקת לב כרונית. (A) תמונות אימונופלורסצנציה מייצגות של ביטוי c-Fos ב-NTS בין הקבוצות. הגרעינים נצבעו ב-DAPI, ותאים חיוביים ל-c-Fos נצבעו בירוק. הקווים המקווקווים מתוחמים את האזור האנטומי, וחצי חצים לבנים מצביעים על נוירונים מייצגים חיוביים ל-c-Fos (סרגל קנה מידה = 30 µm). (B) ניתוח כמותי של ספירת תאים חיוביים ל-c-Fos בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 3, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, לא מובהק לעומת קבוצת ה-CHF. (C) עקומות פריקה של פוטנציאלי פעולה (spike discharge) אלקטרופיזיולוגיות מייצגות in vivo של ה-NTS בין הקבוצות. (D) ניתוח כמותי של קצב הירי הנוירונלי הממוצע בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 3, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, לא מובהק לעומת קבוצת ה-CHF. (E) ספקטרוגרמות דו-ממדיות מייצגות של פוטנציאל שדה מקומי (LFP) וטופוגרפיות תלת-ממדיות של צפיפות ספקטרלית של הספק, הממחישות את האנרגיה התנודתית העצבית בתוך ה-NTS. (F) מטריצת קורלציה המעריכה את הקשרים בין פנוטיפים קרדיווסקולריים פריפריים לבין פרמטרים של פעילות עצבית מרכזית. עיגולים אדומים וכחולים מצביעים על קורלציות חיוביות ושליליות, בהתאמה. **p < 0.01; ***p < 0.001. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: בקרת איכות והערכה סטטיסטית רב-משתנית של הפרופילים הפרוטאומיים בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius). (A) סקירה כמותית של החלבונים שזוהו בשלוש קבוצות הניסוי (חזרות ביולוגיות n = 6). (B) תרשים פיזור של ציוני אנליזת מבחן Discriminant של ריבועים פחותים חלקיים (PLS-DA), הממחיש את ההתפלגות המרחבית הכללית ואת ההפרדה בין הקבוצות. (C) תרשים פיזור של ציוני אנליזת מבחן Discriminant של ריבועים פחותים חלקיים אורתוגונליים (OPLS-DA) ומבחן הפרמוטציה המתאים, המאמתים את מהימנות המודל עבור ההשוואה בין קבוצת ה-Sham לקבוצת ה-CHF (200 פרמוטציות). (D) תרשים פיזור של ציוני אנליזת מבחן Discriminant של ריבועים פחותים חלקיים אורתוגונליים (OPLS-DA) ומבחן הפרמוטציה המתאים, המאמתים את מהימנות המודל עבור ההשוואה בין קבוצת ה-CHF לקבוצת ה-EA (200 פרמוטציות). (E) מפת חום של קיבץ היררכי של מקדמי מתאם פירסון, המעריכה את השחזוריות התוך-קבוצתית ואת השונות בין-קבוצתית בכל הדגימות הפרוטאומיות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה מוגדלת של איור זה.

איור 5: זיהוי וניתוח העשרה פונקציונלית של חלבונים מרכזיים המבטאים ביטוי דיפרנציאלי המודולים על ידי אלקטרו-אקופונקטורה בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius). (A) תרשימי Volcano הממחישים את התפלגות החלבונים עם ביטוי מוגבר (upregulated) וביטוי מופחת (downregulated) בהשוואות בין Sham ל-CHF ובין CHF ל-EA. (B) דיאגרמות ון הממפות את ניתוח החפיפה לזיהוי החלבונים המרכזיים עם ביטוי מופחת וביטוי מוגבר בעקבות התערבות ה-EA. (C) מפת חום של קיבוץ היררכי (Hierarchical clustering heatmap) של פרופילי הביטוי של החלבונים המרכזיים המבטאים ביטוי דיפרנציאלי. (D) תרשימי בועות (bubble plots) של GO המפרטים את התהליכים הביולוגיים, הרכיבים התאיים והפונקציות המולקולריות המועשרות עבור תת-הקבוצה של חלבונים עם ביטוי מופחת. (E) דיאגרמות Chord ו-Sankey של KEGG הממפות את מסלולי השליחויות המועשרים על ידי חלבונים עם ביטוי מופחת. (F) תרשימי בועות של GO המפרטים את התהליכים הביולוגיים, הרכיבים התאיים והפונקציות המולקולריות המועשרות עבור תת-הקבוצה של חלבונים עם ביטוי מוגבר. (G) דיאגרמות Chord ו-Sankey של KEGG הממפות את מסלולי השליחויות המועשרים על ידי חלבונים עם ביטוי מוגבר. אנא לחצו כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: טופולוגיית רשת, פרופיל ביטוי ברקמות ותיקוף מולקולרי מזהים את YY1 כמטרה פוטנציאלית הקשורה לאלקטרו-אקופונקטורה. (A) רשת אינטראקציה בין חלבונים, דיאגרמת חבלים (chord diagram) ודיאגרמת סנקי (Sankey diagram) של חלבוני המפתח (hub proteins) שזוהו. (B) פרופיל ביטוי של YY1 ברקמות אנושיות המופק ממאגר ה-GTEx, כאשר המסגרת האדומה מדגישה רקמות מוח. (C) ניתוח כמותי של ביטוי mRNA של YY1, DPF2 ו-DMAP1 ב-NTS בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 6, ממוצע ± SD). **p < 0.01, ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF; ns, לא מובהק לעומת קבוצת ה-CHF. (D) פסי Western blot מייצגים של YY1 ו-β-actin ב-NTS בין הקבוצות. (E) ניתוח כמותי של ביטוי חלבון YY1 בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 3, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; #p < 0.05 לעומת קבוצת ה-CHF. (F) חיזוי ביואינפורמטי של מודיפיקציות אפיגנטיות של היסטונים המווסתות את לוקוס ה-YY1, המבוסס על ציוני פוטנציאל רגולטורי. (G) חיזוי ביואינפורמטי של גורמי שעתוק במעלה הזרם המווסתים את לוקוס ה-YY1, המבוסס על ציוני פוטנציאל רגולטורי. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: מודל מוצע לקשר בין אלקטרו-אקופנקטורה בנקודה HT7, עלייה בביטוי של YY1, השבת הפעילות הנוירונלית בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius), ושיפור באי-ספיקת לב כרונית. (שמאלה) מצב פתולוגי: במודל של CHF המושרה על ידי ליגטורה של העורק הכלילי LAD, הפעילות הנוירונלית בתוך ה-NTS פחיתה, בליווי דיכוי של גורם השעתוק YY1. עיכוב עצבי מרכזי זה קשור לremodeling לבבי פתולוגי, המתבטא בירידה ב-LVEF, עלייה בפיברוזה של השריר הלבבי ועלייה במדדי סרום של אי-ספיקת לב. (ימינה) טיפול ב-EA: התערבות EA בנקודת הדיקור HT7 מעלה את ביטוי YY1 ב-NTS ומשיבה את הפריקה הנוירונלית. נוירומודולציה מרכזית זו מפעילה השפעות קרדיופרוטקטיביות, הממתנות את ה-remodeling הפתולוגי ומשפרות את תפקודי הלב המערכתיים. אנא לחץ כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור משלים 1: הערכת תפקוד לבבי של קהל המחקר הפרוטאומי ופרופילי ביטוי ברקמות אנושיות של גני צומת (hub genes) מועמדים. (A) ניתוח כמותי של LVEF ו-LVFS בין הקבוצות (חזרות ביולוגיות n = 12, ממוצע ± SD). ***p < 0.001 לעומת קבוצת ה-Sham; ###p < 0.001 לעומת קבוצת ה-CHF. (B-J) פרופילי ביטוי ברקמות אנושיות של גני צומת מועמדים שהופקו ממאגר הנתונים GTEx, כולל COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH11 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I), ו-COL14A1 (J).אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 1: מטריצת זיהוי וכמותיות מקיפה של הפרוטאום הגלובלי בגרעין המסלול הבודד (nucleus tractus solitarius). טבלה זו מציגה את מערך הנתונים הפרוטאומי הכמותי המלא עבור כל הקבוצות הניסוייות. עמודות חשובות כוללות את Protein ID (מספר גישה של UniProt), Gene (סמל הגן), First.Protein.Description (הערה תפקודית), וערכי העוצמה הנורמליזים של החלבון עבור כל שכפול ביולוגי בקבוצות ה-Sham, ה-CHF וה-EA (n = 6 לכל קבוצה).אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.
טבלה משלימה 2: מדדי חשיבות משתנים בהקרנה (VIP) של OPLS-DA עבור חלבונים בהשוואה בין קבוצת ה-Sham לקבוצת ה-CHF. טבלה זו מפרטת את המאפיינים המבדילים בין קבוצות ה-Sham וה-CHF על פי מודל OPLS-DA. העמודות המרכזיות כוללות את המאפיין (המייצג את המזהה של החלבון/גן הספציפי) ואת ה-VIP_value (Variable Importance in Projection), המציין את התרומה של כל מאפיין להפרדה בין הקבוצות (סף VIP > 1.0).אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 3: ציוני חשיבות משתנה בהקרנה (VIP) של OPLS-DA עבור חלבונים בהשוואה בין CHF ל-EA. טבלה זו מפרטת את המאפיינים המבדילים בין קבוצות ה-CHF וה-EA בהתבסס על מודל ה-OPLS-DA. בדומה לטבלה S2, היא כוללת את עמודת המאפיינים ואת ערך ה-VIP המקביל, תוך הדגשת המאפיינים בעלי התגובה הגבוהה ביותר להתערבות ה-EA.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.
טבלה משלימה 4: רשימה מפורטת של 85 חלבוני הליבה בעלי ביטוי דיפרנציאלי שהושפעו מדיקור חשמלי. טבלה זו מציגה את החפיפה של חלבונים ששינויים משמעותיים בהם נגרמו על ידי CHF ובהמשך הוחזרו למצבם המקורי על ידי התערבות EA. עמודות חשובות כוללות את Protein_ID, Gene, log2FC (שינוי קיפול ב-log2 המעיד על שונות בביטוי), P_value למשמעות סטטיסטית (סף p < 0.05), ו-VIP_value המעריך את התרומה למודל.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 5: ניתוח העשרה של אונטולוגיית גנים (Gene Ontology) עבור תת-קבוצת חלבוני הליבה שביטויה פחת. טבלה זו מציגה את האנוטציה התפקודית של אונטולוגיית גנים (GO) עבור 58 החלבונים שביטוים פחת כתוצאה מ-EA. עמודות חשובות כוללות את ONTOLOGY (המחולקת לתהליך ביולוגי [BP], רכיב תאי [CC], ותפקוד מולקולרי [MF]), תיאור תפקודי (Description), p.adjust (ערך p מתוקנן לבדיקות מרובות), ו-geneID, המקשר לגנים הספציפיים שהועשרו בכל מונח.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.
טבלה משלימה 6: ניתוח העשרה של מסלולים מתוך ה-Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes עבור תת-הקבוצה של חלבוני הליבה שהפחיתו את ביטוים. טבלה זו ממחישה את רשראשי השיגנלינג המועשרים עבור 58 החלבונים שהפחיתו את ביטוים. העמודות המרכזיות כוללות את שם המסלול (Term), את ערך ה-p-value המתוקנן המעיד על המובהקות הסטטיסטית של ההעשרה, ואת הגנים הספציפיים החופפים המעורבים בכל מסלול.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 7: ניתוח העשירה של אונטולוגיית גנים (Gene Ontology) עבור תת-קבוצת חלבוני הליבה בעלי ביטוי מוגבר. טבלה זו מציגה את האנוטציה הפונקציונלית של אונטולוגיית הגנים (GO) עבור 27 החלבונים שהיו בעלי ביטוי מוגבר (upregulated) בעקבות EA. הפורמט והגדרות העמודות (ONTOLOGY [BP, CC, MF], Description, p.adjust, geneID) זהים לאלו המפורטים בטבלה S5.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה משלימה 8: אנליזת העשרה של מסלולים מתוך Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes עבור תת-הקבוצה של חלבוני הליבה בעלי ביטוי מוגבר. טבלה זו ממחישה את מסלולי השיגנל המועשרים עבור 27 החלבונים שהביטוי שלהם עלה (upregulated). הפורמט והגדרות העמודות (מונח, מתואם p-value, גנים) זהים לאלו המפורטים בטבלה S6.אנא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.
טבלה משלימה 9: ציוני קישוריות טופולוגית של 18 חלבוני ה-hub שהופקו מרשת האינטראקציה בין חלבונים. טבלה זו מסכמת את הפרמטרים הטופולוגיים של הרשת ששימשו לזיהוי גני ה-hub המרכזיים. העמודות המרכזיות כוללות את שם הגן ומדדי רשת מרכזיים כגון Degree, Betweenness Centrality ו-Closeness Centrality, המכמתים את החשיבות היחסית והקישוריות של כל צומת בתוך הרשת הביולוגית.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.
טבלה נלווית 10: ניתוח העשרה של מסלולים מתוך ה-Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes עבור 18 חלבוני המרכז (hub proteins) של הרשת. טבלה זו מציגה את מסלולי השליחויות הספציפיים שהועשרו באופן בלעדי על ידי 18 חלבוני המרכז שזוהו. העמודות המרכזיות כוללות את שם המסלול (Term), ערך p מתוקנן למשמעות סטטיסטית, והגנים הרלוונטיים המניעים את ההעשרה התפקודית.אנא לחץ כאן להורדת הקובץ.
קובץ משלים 1: סקריפטים של R ששימשו לניתוח נתונים ולהדמיה ותמונות לא חתוכות של Western blot. הקובץ המשלים מכיל את סקריפטים של R ששימשו לניתוח מתאם פירסון, יצירת תרשימי Volcano כפולים וזיהוי חלבונים שהתהפכו ב-EA, ניתוח העשراء של Gene Ontology (GO), יצירת מפת חום של מקבץ היררכי, הדמיה של העשראה מה-Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), ניתוח מבחין של ריבועים פחותים חלקיים אורתוגונליים (OPLS-DA) ובדיקת פרמוטציה, ניתוח מבחין של ריבועים פחותים חלקיים (PLS-DA), יצירת מפת חום של מתאם דגימות פרוטאומיות וניתוח דיאגרמות ון.אנא לחצו כאן כדי להוריד קובץ זה.