בידוד ואפיון כימי ליפידים מחיידקים גראם שליליים

המטרה הכוללת של הניסוי הבא היא לבודד ליפופוליסכריד מהמשטח החיצוני של חיידקים גראם-שליליים ולאפיין מבנית את חלק השומן באמצעות פרוטוקולי טרשת נפוצה טנדם. זה מושג על ידי מיצוי כימי של ליפופוליסכריד מפני השטח של תא החיידק ולאחר מכן הידרוליזה קלה של חומצה כדי לשחרר שומן A מהחלק הפוליסכרידי של ליפופוליסכריד ולאחר מכן הידרוליזה של חומצה קלה כדי לשחרר שומן A מהחלק הפוליסכרידי של ליפופוליסכריד. כשלב שני, תמיסה של ליפיד A מנותחת על ידי יינון ריסוס אלקטרוני MSMS.

בהליך שלנו, ליפיד A מנותח על ידי דיסוציאציה הנגרמת על ידי התנגשות או דיסוציאציה פוטו אולטרה סגולה מבוססת MS MS לאפיון מבני. התוצאות מראות הבדלים בדפוס הפיצול בספקטרום המסה המיוצר מדיסוציאציה הנגרמת על ידי התנגשות או מפרוטוקולי MS MS מבוססי דיסוציאציה אולטרה סגולה שבהם UVPD מניב דפוס פיצול אינפורמטיבי יותר. היתרון העיקרי של טכניקה זו על פני השיטות הקיימות הוא שספקטרומטריית מסה טנדם מאפשרת הבהרה של אנליטי מטרה על סמך פרשנות של דפוסי פיצול אבחנתיים.