14 באפריל 2014
הנגע Explorer (LE) הוא צינור שפותח כדי להשיג רקמת מוח אזורית וVolumetrics נגע hyperintensity קורטיקליים מMRI המבני של מחלת אלצהיימר וקשישים נורמלים חצי אוטומטי, עיבוד תמונה. כדי להבטיח רמה גבוהה של דיוק ואמינות, הבא הוא, פרוטוקול סטנדרטי מודרך וידאו לנהלים הידני של LE.
המטרה הכוללת של הצינור הבא היא להבין טוב יותר הזדקנות ודמנציה. על ידי השגת מדדים נגזרים מ-MRI של ניוון מוחי אזורי וסמנים ביולוגיים של הדמיה מוחית של מחלת כלי דם קטנים. זה מושג על ידי יצירת תחילה מסכת מוח מופשטת גולגולת, ופילוח רקמת מוח בסיסי כדי לכמת במדויק את הנפח התוך גולגולתי הכולל.
כשלב שני, הושלם פילוח נגעים של TRIFE כדי לכמת ולסווג תת-סוגים של נגעים למדידות ביולוגיות מדויקות של הדמיה של מחלת כלי דם קטנים. לאחר מכן מבוצעת סימון אנטומי על כל אדם כדי לאכול את המוח ל-26 אזורי עניין סטנדרטיים. מתקבלות תוצאות המראות ניוון עצבי אזורי דיפרנציאלי ודפוסי וסקולופתיה בין קבוצות מחלה על סמך ניוון רקמת המוח, מדדים ונפח נגעים המתקבלים מ-MRI מבני.
גישת הניתוח שלנו יכולה לעזור לענות על שאלות מפתח בהדמיה מוחית של הזדקנות ודמנציה. הצינור המותאם אישית שפיתחנו מאפשר לחוקרים ולקלינאים כאחד להבין טוב יותר את האבחון, ההתקדמות והתגובה לטיפול באנשים בודדים כמו גם בקבוצות מטופלים שונות. זה שימושי במיוחד לאנשים הסובלים ממחלת כלי דם קטנים במוח בשילוב עם הפרעות ניווניות.
זה שכיח מאוד בקרב קשישים, במיוחד במחלת אלצהיימר. ניתן ליישם את הצינור גם על אנשים עם הפרעות נוירולוגיות אחרות כגון דמנציה וסקולרית ושבץ מוחי, דמנציה טמפורלית קדמית, פגיעה מוחית טראומטית וטרשת נפוצה. הדגמה חזותית של שיטה זו היא קריטית מכיוון ששלבי ההתערבות הידנית יכולים להיות מורכבים.
זה דורש שילוב של בסיס ידע חזק בנוירואנטומיה כמו גם יכולת חזקה וכישורי מחשב. רבים מהשלבים הללו מועברים בצורה הטובה ביותר באמצעות פורמט. סרטון זה יאפשר למשתמש לדמיין כראוי את המבנים האנטומיים המדוברים ולהראות את ההתערבויות החישוביות הנדרשות.
ידגימו את ההליך מנהל המעבדה שלנו, כריסטופר סקוט, ואנליסטית הדמיית RIN, אלישיה מקנילי וקורטני ביק. כדי להתחיל, פתח את התוכנה וטען תמונה משוקללת T אחת והגולגולת האוטומטית הפשיטה את שכבת מסכת הכספת התוך גולגולתית הכוללת או TIV אוטומטי. לאחר מכן השתמש בכלי המברשת כדי להתחיל לערוך את ה-TIV auto כדי להוסיף או ללכוד מחדש מוח שה-TIV auto לא לקח בחשבון.
בחר תווית ציור פעילה כתווית אחת וצייר כמו כל התוויות כדי ללכוד מחדש צבע, אזורים אוטומטיים של DIV או ללכוד מחדש בזהירות את האזורים הלא צבעוניים. השתמש במברשת כדי לצבוע מחדש את המסכה האוטומטית של TIV. בדקו היטב כל פרוסה ופרוסה כדי לוודא שרק רקמת המוח צבועה בירוק כתווית אחת ולכל רקמה שאינה מוחית יש תווית אחרת.
אם קשה לצבוע, השתמש בכלי המצולע הסגור, לכוד מחדש את ה-TIV auto לפי הצורך ומחק את ה-TIV auto לפי הצורך. כאשר אתה מרוצה מהשינויים ב- TIV, שמור את התמונה כעריכת TIV כדי להתחיל בהקצאה מחדש של החדר. טען את תמונת ה-seg מעל תמונת T one IHC, ולאחר מכן התאם את תוויות הציור לצבעים המתאימים.
לאחר מכן, הקצה מחדש CSF Voxels באמצעות כלי מילוי ההצפה, עבור קדימה ואחורה בין מילוי הצפה למגבלות ציור על ידי לחיצה על החלל. מגבלות מוטות משמשות כדי למנוע ממילוי ההצפה למלא אזורים מסוימים בחדר הנחשבים לחורים שחורים סביב החדר או חלק מעוצמות יתר של חומר לבן. השתמש בתמונה המשוקללת T one כמדריך לגבי מה למלא ומה לא למלא עבור האונה הרקתית.
ניתן להפעיל ולכבות את פילוח החדרים הצדדיים באמצעות מקש S. בסיום, שמור את הפילוח להסרת גזע המוח, המוח הקטן והמבנים התת-טנטוריאליים. בחר בכלי מצולע וכשהסגמנטציה כבויה, גלול לפרוסה הראשונה שבה מתחיל המוח הקטן.
לאחר מכן לחץ שמאלי כדי לצייר מצולע מעל הדורה המקיפה את המוח הקטן ולאורך בסיס גזע המוח על פני הקאלי. לאחר מכן לחץ לחיצה ימנית כדי לסגור את המצולע ולחץ על קבל כדי למחוק את האזור הזה של הפילוח. האזור יציג כעת את ה-T שמתחתיו ומציין שהוא כבר לא נכלל בסגמנטציה.
לאחר שהפדונקל המוחי נפרד, התחל להסיר גם את גזע המוח וחוט השדרה. כעת גלול למעלה בתמונה פרוסה אחר פרוסה כדי לוודא שהחלקים היחידים של הפילוח שנותרו הם רקמת מוח מוחית. בסיום, שמור את הפילוח.
כדי להתחיל לטעון את תמונת ה-ISO ואת קובץ המחצלת ליישור CPC תחילה, התקרב מקרוב באמצעות כלי הניווט. לאחר מכן השתמש בכלים למעלה, למטה והרם למעלה למטה כדי לכוונן את התצוגה הצירית כך שהקומיסורה הקדמית תהיה העבה ביותר והקומיסורה האחורית תהיה ישר לרוחב. זה אמור בסופו של דבר ליצור צורת חור מנעול נחמדה.
כוונן מחדש את התצוגה כדי להכניס את גלגלי העיניים לשדה הראייה. כעת כוונן את הגלגול על ידי איזון גלגלי העיניים בתצוגה צירית. הפרוסות הציריות צריכות להיראות מאוזנות באופן שווה בעת גלילה בתמונה.
פרוסה אחת בכל פעם התאימו אותך על ידי כך שתוודאו שהשיער הצלב האנכי עובר דרך המישור הסגיטלי האמצעי. במבט צירי, לפעמים זה עשוי להיות קשה לגרום למישור ליישר קו בצורה מושלמת בגלל עקמומיות טבעית של המוח בקטבים, ליצור את ההתאמה הטובה ביותר האפשרית. כדי להתחיל, טען את התמונה לזיהוי ציון דרך.
תחילה, לחץ על לחצן הבחירה AC בצד שמאל כדי לבחור את ציון הדרך להגדרה. לאחר מכן לחץ על ה-AC בתצוגה הצירית. לאחר מכן, לחץ על לחצן הבחירה למחשב בצד שמאל, ולאחר מכן על המחשב על התמונה הצירית.
כעת לחצו על כפתור הבחירה PE כדי להגדיר את הקצה האחורי של המוח בפרוסה הזו, ואז לחצו על החלק האחורי ביותר של המוח, משמאל או מימין. פעולה זו תמלא ערכים עבור פרוסת עטרה, שתשמש לרגע. לחץ על לחצן האפשרויות ca כדי להגדיר את התעלה המרכזית.
לאחר מכן גלול מטה 10 פרוסות מהתצוגה הצירית הנוכחית ולחץ על מרכז התעלה המרכזית. זה ממלא את הערך עבור פרוסה סגיטלית, שתשמש כעת כנקודת התחלה למציאת המישור הסגיטלי האמצעי. לאחר מכן, לחץ על כפתור הבחירה M כדי להגדיר את המישור הסגיטלי האמצעי.
לאחר מכן לחץ על כפתור הבחירה LPR כדי להגדיר את החריץ הקדם-עורפי השמאלי ועל כפתור הבחירה RPR כדי להגדיר את החריץ הקדם-עורפי של חצי הכדור הימני. ליצירת מפת אובייקטים, לחץ על לחצן האפשרויות LSC כדי להגדיר את הסולקוס המרכזי העליון השמאלי. לחץ לחיצה שמאלית כדי למקם סמן על הדורה מעל החריץ.
לחץ על לחצן הבחירה LOP כדי להגדיר את החריץ הקודקודי העורפי השמאלי. מעקב החריץ הזה עובר מהדורה לצר הטנטוריום למעקב אחר פני השטח. התחל לעקוב אחר הסילבי והסדק מהקצה האחורי לקצה הקדמי, החל מהנקודה שבה הוא מתפצל לרמי קטן, עולה ויורד.
כעת לחץ על כפתור הבחירה lc כדי לעקוב אחר החריץ המרכזי השמאלי. התחל מהקצה התחתון בנקודת סילבי וסדק ישירות מתחת לסיום הסולקוס. סיים לעקוב אחר החריץ בקצה העליון עד שקשה לעקוב אחר עקמומיות המוח.
לבסוף, לחץ על הכפתור הימני תחת נקודת מבט תלת מימדית וחזור על השלבים עבור סילבי והסדק הימניים והחריץ המרכזי הימני לפילוח נגעים עם סריקות PD או T שתיים. ראשית, סקור את כל ההדמיות הזמינות, כולל T one, PD ו-T 2 כדי ליידע את ההחלטה מה ללכוד כנגע במוח. לאחר מכן השתמש בכלי מברשת הצבע כדי לצבוע תווית שתיים מעל תווית אחת כדי לסמן את האזורים עם הנגע.
ניתן להפעיל ולכבות את הפילוח באמצעות מקש S. כמו כן, צבע תווית אחת מעל תווית שתיים כדי לציין תוצאות חיוביות או שגיאות שגויות עבור סריקות עם הדמיית התלקחות. שוב, השתמש בכל ההדמיה הזמינה לפי הצורך כדי לקבל החלטה מושכלת לגבי האזורים המרכיבים את הנגע.
לאחר מכן השתמש במכחול כדי לשנות את התוויות כדי לציין את הנגע ואת התוצאות החיוביות השגויות. כאשר אתה מרוצה משינויים בפילוח הנגעים, שמור את התמונה הערוכה הסופית. כאן אנו יכולים לראות שתי דוגמאות המציגות נהלי סימון SABRE.
הפרוסה הצירית משמאל מציגה את A CPC מיושר T אחד עם מיקומי ה-AC, המחשב האישי ונקודות ציון הקצה האחוריות. למשטח התלת-ממדי המעובד T one יש סדק סיאן ותיחום סולקוס מרכזי. ל-PD צירי זה יש שכבת נגע שנוצרה אוטומטית ושכבת נגע ערוכה ידנית.
זוהי דוגמה להליך התיוג מחדש הידני שהושלם כחלק מתהליך סייר הנגעים, וכאן אנו יכולים לראות דוגמה להליך התיוג מחדש הידני שהושלם כחלק מתהליך הגמישות. להתלקחות הצירית יש שכבת נגע שנוצרת אוטומטית ושכבת נגע ערוכה ידנית. ראה את כתב היד הנלווה לסרטון זה לשיטות להערכת מהימנות בין מעריכים של הליכי מיצוי המוח.
בעת ניסיון הליך זה, חשוב לזכור שיש שונות אנטומית מנושא לנבדק, ולמרות שפרוטוקול זה מספק קווים מנחים שיש לעקוב אחריהם, ניסיון וידע אנטומי הם חיוניים כדי להבטיח הצלחה לאחר שליטה, ניתן לבצע טכניקה זו תוך שעה עד שעה וחצי לכל נבדק לאחר הליך זה. ניתן לבצע שיטות אחרות כמו פילוח של ריקה רובינס המבוססות על היפר-אינטנסיביות כולינרגיות ומעקב אחר שבץ מוחי. זה מאפשר לחוקרים לענות על שאלות נוספות כמו התרומה של פגיעה ספציפית בכלי הדם בחקר דמנציה.
לאחר צפייה בסרטון זה, אתה אמור להבין היטב כיצד ליישם בצורה מדויקת ואמינה את צינור עיבוד ה-MRI של סייר הנגע לניתוח נפחי כחלק מכלי המוח של Sabre. תוכנה זו זמינה בחינם. הורד online@sabrebrainlab.ca.
Lesion Explorer (LE) הוא צינור עיבוד תמונות חצי-אוטומטי שנועד לניתוח רקמת מוח ונגעי תגירת אות (hyperintensity lesions) במחלת אלצהיימר ובהזדקנות נורמלית. פרוטוקול זה נועד לשפר את דיוקם של מדידות נפח המופקות מ-MRI.
מדידות נפח מדויקות המופקות מ-MRI הן קריטיות להפחתת סיכונים באימות יעדים נוירודגנרטיביים ולאפשר כימות אמין של סמנים ביולוגיים במחקר על מחלת האלצהיימר והזדקנות. תהליך העבודה של Lesion Explorer נותן מענה לשונות טכנית הנובעת מניוון (atrophy) ומשינויים בחומר הלבן, ובכך תומך בקריאות דימות נוירולוגיות עקביות במחקרים פרה-קליניים ותרגומיים. סטנדרטיזציה זו מגבירה את הביטחון החזוי בבדיקת היפותזות טיפוליות ובסננון תיקי פיתוח של תרופות למערכת העצבים המרכזית (CNS).
תהליך העבודה של Lesion Explorer משתלב ברצף הגילוי, החל מאימות מטרות מוקדם ועד לפיתוח פרה-קליני, על ידי אספקת סמנים ביולוגיים של דימות עצבי כמותיים וסטנדרטיים התומכים בסריקה מונחית-השערה ובצמצום סיכונים מכניסטי.