Name: פרוטוקול ניסוי להטרוגניות קרקע מושרה צמח מניפולציה (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-03-13T15:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 16 s
Description: חקור את תפקידה של הטרוגניות פנימית בקרקע על דו-קיום מינים באמצעות מניפולציות מושרות צמח. שיטה זו מדגימה כיצד משוב צמח-קרקע משפיע על דינמיקת הקהילה האקולוגית.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

אנו מודים חוות סקוויר Valleevue ועמק Ridge של אוניברסיטת קייס ווסטרן ריזרב, כוללים א Locci, ג בונד, וא &#39;Alldridge, לעזרה בהקמת הגינה המשותפת. י ווים, ל האפמן, ל &#39;גונזלס, SC ליהי, ב Ochocki, א Ubiles, ג יו, X. זאו, וNM צימרמן סיפקו סיוע תחום. AJB וJHB מומנו על ידי קופות הפעלה מCWRU לJHBGAD נתמכה על ידי תוכניות קיץ במענק מחקר לתואר ראשון מCWRU מומנו על ידי המכון הרפואי הווארד יוז. עבודה זו נתמכה גם על ידי מימון הקרן הלאומית למדע לJHB (DEB 1,250,170).

<ol><li>Agrawal, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Filling+key+gaps+in+population+and+community+ecology%5BTitle%5D)+AND+%22Front.+Ecol.+Environ%22%5BJournal%5D)">Filling key gaps in population and community ecology.</a> Front. Ecol. Environ. 5, 145-152 (2007).</li>
<li>Suding, K. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toward+an+era+of+restoration+in+ecology%3A+successes%2C+failures%2C+and+opportunities+ahead%5BTitle%5D)+AND+%22Ann.+Rev.+Ecol.+Evol.+System%22%5BJournal%5D)">Toward an era of restoration in ecology: successes, failures, and opportunities ahead.</a> Ann. Rev. Ecol. Evol. System. 42, 465-487 (2011).</li>
<li>Melbourne, B. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Invasion+in+a+heterogeneous+world%3A+resistance%2C+coexistence+or+hostile+takeover%5BTitle%5D)+AND+%22Ecol.+Lett%22%5BJournal%5D)">Invasion in a heterogeneous world: resistance, coexistence or hostile takeover.</a> Ecol. Lett. 10, 77-94 (2007).</li>
<li>Lundholm, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+species+diversity+and+environmental+heterogeneity%3A+spatial+scale+and+competing+hypotheses%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Veg.+Sci%22%5BJournal%5D)">Plant species diversity and environmental heterogeneity: spatial scale and competing hypotheses.</a> J. Veg. Sci. 20, 377-391 (2009).</li>
<li>Pacala, S. W., Tilman, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Limiting+similarity+in+mechanistic+and+spatial+models+of+plant+competition+in+heterogeneous+environments%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+Natural%22%5BJournal%5D)">Limiting similarity in mechanistic and spatial models of plant competition in heterogeneous environments.</a> Am. Natural. 143, 222-257 (1994).</li>
<li>Chesson, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((General+theory+of+competitive+coexistence+in+spatially-varying+environments%5BTitle%5D)+AND+%22Theor.+Pop.+Biol%22%5BJournal%5D)">General theory of competitive coexistence in spatially-varying environments.</a> Theor. Pop. Biol. 58, 211-237 (2000).</li>
<li>Bever, J. D., Westover, K. M., Antonovics, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Incorporating+the+soil+community+into+plant+population+dynamics%3A+the+utility+of+the+feedback+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Incorporating the soil community into plant population dynamics: the utility of the feedback approach.</a> J. Ecol. 85, 561-573 (1997).</li>
<li>Kulmatiski, A., Beard, K. H., Stevens, J. R., Cobbold, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant-soil+feedbacks%3A+a+meta-analytical+review%5BTitle%5D)+AND+%22Ecol.+Lett%22%5BJournal%5D)">Plant-soil feedbacks: a meta-analytical review.</a> Ecol. Lett. 11, 980-992 (2008).</li>
<li>Bever, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rooting+theories+of+plant+community+ecology+in+microbial+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Trends.+Ecol.+Evol%22%5BJournal%5D)">Rooting theories of plant community ecology in microbial interactions.</a> Trends. Ecol. Evol. 25, 468-478 (2010).</li>
<li>Brandt, A. J., de Kroon, H., Reynolds, H. L., Burns, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+heterogeneity+generated+by+plant-soil+feedbacks+has+implications+for+species+recruitment+and+coexistence%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Soil heterogeneity generated by plant-soil feedbacks has implications for species recruitment and coexistence.</a> J. Ecol. 101, 277-286 (2013).</li>
<li>R: A language and environment for statistical computing. , Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria. (2012).</li>
<li>Crawley, M. J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCrawley%2C+MJ+%22The+R+Book%22">The R Book</a>. , John Wiley & Sons, Ltd. (2007).</li>
<li>Petermann, J. S., Fergus, A. J. F., Turnbull, L. A., Schmid, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Janzen-Connell+effects+are+widespread+and+strong+enough+to+maintain+diversity+in+grasslands%5BTitle%5D)+AND+%22Ecology%22%5BJournal%5D)">Janzen-Connell effects are widespread and strong enough to maintain diversity in grasslands.</a> Ecology. 89, 2399-2406 (2008).</li>
<li>Reynolds, H. L., Haubensak, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+fertility%2C+heterogeneity%2C+and+microbes%3A+towards+an+integrated+understanding+of+grassland+structure+and+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Veg.+Sci%22%5BJournal%5D)">Soil fertility, heterogeneity, and microbes: towards an integrated understanding of grassland structure and dynamics.</a> Appl. Veg. Sci. 12, 33-44 (2009).</li>
<li>Sokal, R. R., Rohlf, F. J. Biometry, 3rd edn. , W. H. Freeman. (1995).</li>
<li>Klironomos, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Feedback+with+soil+biota+contributes+to+plant+rarity+and+invasiveness+in+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Feedback with soil biota contributes to plant rarity and invasiveness in communities.</a> Nature. 417, 67-70 (2002).</li>
<li>Mommer, L., van Ruijven, J., Jansen, C., van de Steeg, H. M., de Kroon, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactive+effects+of+nutrient+heterogeneity+and+competition%3A+implications+for+root+foraging+theory%3F%5BTitle%5D)+AND+%22Funct.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Interactive effects of nutrient heterogeneity and competition: implications for root foraging theory?</a> Funct. Ecol. 26, 66-73 (2012).</li>
<li>Felsenstein, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phylogenies+and+the+comparative+method%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+Natural%22%5BJournal%5D)">Phylogenies and the comparative method.</a> Am. Natural. 125, 1-15 (1985).</li>
<li>Burns, J. H., Strauss, S. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((More+closely+related+species+are+more+ecologically+similar+in+an+experimental+test%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">More closely related species are more ecologically similar in an experimental test.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108, 5302-5307 (2011).</li>
<li>Fukami, T., Nakajima, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Community+assembly%3A+alternative+stable+states+or+alternative+transient+states%5BTitle%5D)+AND+%22Ecol.+Lett%22%5BJournal%5D)">Community assembly: alternative stable states or alternative transient states.</a> Ecol. Lett. 14, 973-984 (2011).</li>
</ol>

יש המחברים אין לחשוף.

ההטרוגניות אדמה נגרם צמח היא סבירה מאוד בקהילות טבעיות, כי יש לי צמחים השפעות גדולות, ולעתים קרובות מין ספציפיים בסביבת אדמתם ואת הצמחים הבאים שייתקלו אדמה ש( למשל Petermann et al. 13). עם זאת, ההבנה של התפקיד של סוג זה של ההטרוגניות על חברות צמחים שלנו היא מינימאלית 10,14. כאן, אנו מציגים שיטה למניפולצית ההטרוגניות אדמה נגרם צמח, תוך שימוש בקרקע ממקורות שונים (כלומר אזורי השפעת השורש של מינים שונים) בתחום. השלבים הקריטיים בפרוטוקול...

אחת המטרות העיקריות של אקולוגיה קהילה הוא להסביר ולחזות את התהליכים המסדירים הרכבה קהילה. עם זאת, חברות צמחים הן לעתים קרובות מגוונות יותר מהצפוי על ידי התאוריה דו קיום 1, ואקולוגים שיקום צריכים להבין מנגנונים דו קיום לשחזר בהצלחה קהילות ילידים מגוונות 2. ההטרוגניות סביבתית היא מנגנון חשוב באופן תיאורטי שיכול לעזור להסביר את הרמות גבוהות של גיוון קהילה, אבל מניפולציות ניסיוני של ההטרוגניות הן נדירות 3 ויתמקדו בהטרוגניות אביוטי (למשל נסקרה ב4 Lundholm). התאוריה שמשלבת ההטרוגניות בדרך כלל מניחה כי ההטרוגניות היא חיצונית לקהילת ההרכבה. ההטרוגניות חיצונית נשלטת על ידי גורמים כגון טיפולוגיה נוף, שהם בלתי תלויים בהרכב הקהילה. ההטרוגניות חיצונית יכולה לגרום לדו קיום באמצעות מחיצות נישה (ריווינישא במלבורן et al. 3, למשל Pacala וטילמן 5 וChesson 6). עם זאת, חלק גדול מההטרוגניות הסביבתית הרלוונטית לקהילות צמח עשויה להיות מהותית לקהילה, פיתוח כקהילת מרכיב ובהתאם לזהותו של המין בקהילה. ההטרוגניות פנימית יכולה להיגרם כתוצאה מפידבקים ביוטיים, אשר יכול להוביל לחיים משותפים באמצעות תדר תלות שלילית (לדוגמא Bever et al. 7). כאן אנו מתארים שיטה חדשה לטיפול בהטרוגניות אדמה נגרם צמח, סוג של הטרוגניות אדמה שהוא מהותי לקהילה ונובע מפידבקים צמח אדמה. פידבקים צמחים קרקע (כוחות הביטחון הפלסטיניים) מתרחש כאשר צמחים משפיעים על מבנה הקרקע, כימיה, או הביוטה באופן שמשפיע על ביצועי צמח שלאחר מכן באדמה, ויש לי כוחות הביטחון הפלסטיניים השפעות ממוצעים גדולות על ביצועי מפעל בקהילות צמחים מקומיים 8. מחקרים של כוחות הביטחון הפלסטיניים יש בדרך כלל גם אספו קרקעות מהשדה או קרקעות מותנות בניסוי, ואז שאל כיצד צמחים לבצע בביחס אדמת conspecific לheterospecific או מעוקר אדמה 9. אם צמחי ביצועים טובים יותר בהשוואת אדמת conspecific הפניה קרקעות, ולאחר מכן כוחות הביטחון הפלסטיניים הם חיוביים, בעוד שאם צמחי ביצועים טובים יותר בקרקעות התייחסות, כוחות הביטחון הפלסטיניים הם שליליים. כוחות הביטחון הפלסטיניים שליליים הדדיים יכול להוביל לקיום תדירות תלויה בין המינים 7. בעוד ההשפעות הממוצעת של כוחות הביטחון הפלסטיניים הן מאופיינות היטב 8, ההשפעות של הטרוגניות המרחבית בכוחות הביטחון הפלסטיניים הם הבינו היטב 10. מכיוון שכוחות הביטחון הפלסטיניים מתרחשים בקנה המידה של צמחים בודדים 7 וכי צמחים לעתים קרובות מופצים nonrandomly במרחב ובזמן, כוחות הביטחון הפלסטיניים עשויים להוביל להטרוגניות אדמה, שאנו מכנים את ההטרוגניות אדמה נגרם צמח. שלא כמו צורות רבות אחרות של הטרוגניות (למשל טופולוגיה נוף), heterogeneit זהy הוא מהותי לקהילת ההרכבה וייתכן ובכך להשפיע על ההרכבה קהילה בצורה שונה מצורות חיצוניות יותר של הטרוגניות. על מנת להבין את ההשפעה של צורה זו של ההטרוגניות על ביצועי מפעל ודו קיום, אנחנו צריכים שיטות ניסיוניות שלתפעל ההטרוגניות אדמה נגרם צמח. הנה, אנחנו מדגימים שיטה כזו, אשר עושה שימוש בקרקעות מותנות בשני מינים כדי ליצור טיפול הטרוגנית עם טלאים נפרדים משני מקורות קרקע וטיפול הומוגנית, שהוא תערובת של שני מקורות הקרקע. ערבוב אדמה זו יכול לייצג לפחות שני תרחישים סבירים בתחום: (1) הפרעה (למשל מכרסמים, חקלאות) אשר מתערבבת קרקעות ממוצא שונה או (2) צמחים משני מינים הולך וגדל בסמיכות, כך שאזורי השפעה שלהם שורש להתערבב והומוגני. אנו מציגים שני ניסויי דוגמא המשתמשים בהטרוגניות אדמה נגרם מפעל כדי לענות על שאלות מפתח בleve שונהls של ארגון אקולוגי: (1) האם צמח אוכלוסיות להגיב לשתול-induced ההטרוגניות אדמה? ו (2) האם צמחים בודדים להגיב להטרוגניות אדמה נגרם צמח? אנו מתארים ניסוי שדה באמצעות 6 טלאי אדמה כדי לענות על השאלה הראשונה וניסוי חממה באמצעות 2 טלאי אדמה כדי לענות על השאלה השנייה. כימות שתי תגובות צמח בודדות להטרוגניות אדמת אוכלוסייה, והוא חיוני להבנת אופן הרכבה קהילת השפעות ההטרוגניות.

<table><tbody><tr>את <td>חפירה(ים)</td><td>כל</td><td>NA</td><td>כדאי שיהיו לפחות שני אתים, אחד לכל מין ממוצא האדמה.</td></tr><tr><td>כף(ים)</td><td>כל</td><td>NA</td><td>יש צורך שיהיו לפחות שתי כפות בגודל זהה, אחת לכל מין ממוצא אדמה.</td></tr><tr><td>כפפות</td><td>ניתן להשתמש בכל</td><td>כפפות NA Gardening.</td><td></td></tr><tr><td>אקונומיקה מדוללת</td><td>כל</td><td>NA</td><td>אנו משתמשים בריכוז ~1:10 של אקונומיקה ביתית (המכילה 5-10% NaClO) להשקיה כדי לעקר את כל הציוד בין אוספי האדמה.</td></tr><tr><td>רשתות פלסטיק כל</td><td></td> <td>NA</td><td>מותאם אישית. השתמשנו ביריעות פלסטיק מבניית קירות חממה כדי ליצור את הרשת ששימשה בניסוי השדה. עם זאת, ניתן להשתמש בכל פלסטיק נוקשה שניתן לתפעל אותו. זה מועיל שיהיו שלוש רשתות לייצור טיפולים הטרוגניים הדדיים וטיפול הומוגני ללא צורך בסטריליזציה בין כל יחידת ניסוי.</td></tr><tr><td>מחיצות פלסטיק</td><td>כל</td><td>NA</td><td>CUSTOM. השתמשנו ביריעות פלסטיק נוקשות, שנחתכו כך שיתאימו לרוחב המינימלי של הסיר, כך שיוכלו להחליק מטה לתחתית העציץ לניסוי החממה. כדאי שיהיו לפחות שני חוצצים, אחד להטרוגני ואחד לטיפולים הומוגניים, אם החוקרים רוצים לחלק באופן אקראי את הסדר שבו יחידות ניסוי בתוך בלוק מתמלאות ללא צורך לעקר את המפריד בין כל יחידת ניסוי.</td></tr><tr><td>דליים או מריצות</td><td>כל</td><td>NA</td><td>כל מיכל להובלת קרקעות.</td></tr><tr><td>זרעים</td><td>בכל</td><td>NA</td><td>אנו אוספים זרעים בשדה ביד. ניתן להזמין זרעים גם מספקי גננות, במידת הצורך.</td></tr><tr><td>קיסמי פלסטיק</td><td>Soodhalter Plastics, Inc.</td><td>805KP</td><td>אנו שותלים זרעים בודדים מודבקים על קיסם בניסוי השדה כדי להקל על ניטור הנביטה וההישרדות של פרטים.</td></tr><tr><td>דבק מסיס במים</td><td>Elmer's</td><td>Elmer's Glue - הכל</td><td>ניתן להשתמש בכל דבק מסיס במים כדי להדביק זרעים לקיסמים מפלסטיק.</td></tr><tr><td>עציצים</td><td>כל</td><td>גודל עציץ NA יהיה תלוי בצמחי הניסוי המשמשים ובמספר כתמי האדמה הרצויים (למשל 2 או 6).</td><td></td></tr><tr><td>חול</td><td>ניתן</td><td></td><td>לערבב כל NA חול גס עם קרקעות שדה כדי לשפר את הניקוז בעציצים.</td></tr><tr><td>קלטת מעבדה&nbsp;</td><td>ניתן להשתמש בכל</td><td>NA</td><td>Tape כדי לתייג ציוד המשמש לטיפול בקרקעות עם מין המוצא.</td></tr><tr><td>דגלי סיכה</td><td>ניתן להשתמש בכל</td> דגלי <td>NA</td><td>כדי לזהות אנשים בשטח לפני איסוף האדמה.</td></tr><tr><td>בד נוף</td><td>ניתן</td><td></td><td>להשתמש בכל בד NA Landscape בשטח כדי למזער את צמיחת הצמחים מחוץ לחלקות ניסוי.</td></tr></tbody></table>

פרוטוקול ניסוי להטרוגניות קרקע מושרה צמח מניפולציה

Experimental Protocol for Manipulating Plant-induced Soil Heterogeneity

תאוריה דו קיום לעתים קרובות טיפלה ההטרוגניות סביבתית כמו להיות בלתי תלוי בהרכב הקהילה, אך יש לי פידבקים ביוטיים כגון פידבקים צמחים קרקע (כוחות הביטחון הפלסטיניים) השפעה גדולה על ביצועי מפעל, וליצור הטרוגניות סביבתית שתלויות בהרכב הקהילה. הבנת החשיבות של כוחות הביטחון הפלסטיניים להרכבת קהילת צמח מחייבת הבנה של התפקיד של ההטרוגניות בכוחות הביטחון הפלסטיניים, בנוסף להשפעות מתכוונים כוחות הביטחון הפלסטיניים. כאן אנו מתארים פרוטוקול לטיפול בהטרוגניות אדמה נגרם צמח. שני ניסויי דוגמא מוצגים: (1) ניסוי שדה עם רשת 6 תיקון של קרקעות כדי למדוד את תגובות אוכלוסיית צמח ו (2) ניסוי חממה עם קרקעות 2-תיקון כדי למדוד תגובות צמח בודדות. ניתן לאסוף קרקעות מאזור השפעת השורש (קרקעות מrhizosphere וישירות סמוכות לrhizosphere) של צמחים בשדה ממינים צמחי conspecific וheterospecific. לשכפל לאסוףיונים נמצאים בשימוש כדי למנוע pseudoreplicating דגימות קרקע. לאחר מכן קרקעות אלו ממוקמות לטלאים נפרדים לטיפולים הטרוגנית או מעורבים לטיפול הומוגני. צריך להקפיד על מנת להבטיח כי טיפולים הטרוגנית והומוגני לחוות את אותה המידה של הפרעת קרקע. לאחר מכן ניתן להציב צמחים בטיפולי קרקע אלה כדי לקבוע את ההשפעה של הטרוגניות אדמה נגרם מפעל על ביצועי מפעל. אנו מראים כי תוצאות מושרה צמח הטרוגניות בתוצאות שונות מהצפוי על ידי מודלים דו קיום מסורתי, אולי בגלל האופי הדינמי של פידבקים אלה. יש צורך בתאוריה שמשלבת ההטרוגניות סביבתית השפיעה על ידי קהילת ההרכבה ועבודה אמפירית נוספת כדי לקבוע מתי ההטרוגניות פנימית לקהילת ההרכבה תביא לתוצאות תצורות שונות לעומת חיצוני ההטרוגניות בהרכב הקהילה.

מינים הגיבו ההטרוגניות אדמה לשתול המושרה בדרכים מגוונות בשתי האוכלוסייה ורמת פרט (איורים 3 ו -4), עם השלכות להרכבת קהילה. כדי לקבוע אם צמח אוכלוסיות להגיב להטרוגניות אדמה נגרם צמח, ניסוי שדה הוקם כבפרוטוקול 2 באמצעות שלושה זוגות congeneric של מינים. אוכלוסיות צמח היו censused שבועית במשך שלושה חודשים והשיעור הכולל של זרעים שניטעו שנבטו והשיעור הכולל של שתילים אלה שמתו בעונת הגידול הראשונה (שבו תמותה מייצגת את ההופכי של הישרדות) חושבו (איור...

הבנת התפקיד של הטרוגניות סביבתית בקיום מין יש בדרך כלל מתמקד בסוגים של הטרוגניות שהם חיצוניים להרכב המינים של הקהילה. אנו מספקים שיטות מפורטות רומן ליצירת טיפולי ההטרוגניות אדמה באמצעות קרקעות כפופות לאוויר צמח אדמת משוב, או הטרוגניות מהותית בהרכב הקהילה.

Coexistence theory has often treated environmental heterogeneity as being independent of the community composition; however biotic feedbacks such as ...

experimental-protocol-for-manipulating-plant-induced-soil

Research

JoVE Journal

Environment

סביבה

מחקר זה מציג שיטה החפירה לחקירת הידרולוגיים מתחת לפני הקרקע, גיאוכימיים, וההטרוגניות מיקרוביולוגיות של lysimeter אדמה. Lysimeter מדמה hillslope המלאכותי שהיה בתחילה בתנאי הומוגניות היה נתון כ -5,000 מ"מ של מים במשך שמונה מחזורים של השקיה ב תקופה של 18 חודשים.

חפירה באדמה Lysimeter עבור ההידרולוגי מצמידים, גיאוכימיות, וחקירות מיקרוביולוגיות

חפירה של שורשי צמחים מן השדה, כמו גם עיבוד של דגימות לתוך endosphere, rhizosphere ואדמה מתוארים בפירוט, כולל הפקת דנ א ושיטות ניתוח הנתונים. נייר זה נועד לאפשר מעבדות אחרות שימוש בטכניקות אלה לצורך המחקר של קרקע, endosphere, rhizosphere microbiomes.

בידוד וניתוח של הקהילות מיקרוביאלית בקרקע, Rhizosphere ושורשים בניסויים עשב רב שנתי

הנוהל אדמת-דיגום המסורתית קובעת את מספר דגימות. אדמה באופן שרירותי. כאן, אנו מספקים פשוט אך יעיל מקובצים באשכולות עיצוב דיגום קרקע להדגים הטרוגניות מרחבי אדמה ולקבוע באופן כמותי מספר דגימות. אדמה נדרש דיוק דגימה המשויך.

קרקעות הדגימה במחקר הטרוגנית מגרש

להמחיש ומדידת הבסיס לצמיחה בחיי עיר הוא מאוד מאתגר. אנו מציגים שיטה rhizobox להתאמה אישית כדי לעקוב אחר התפתחות שורש והתפשטות לאורך זמן בתגובה העשרה התזונתי. שיטה זו משמשת כדי לנתח את ההבדלים genotypic תירס שורש פלסטיות בתגובה מקור חנקן אורגני.

פרוטוקול Rhizobox ממוטבת כדי להמחיש צמיחה השורש והיענות לצרכי מזינים לשפות אחרות

שיטת phenotyping כבידתית זו, טלמטרית, שלם, בעלת תפוקה גבוהה, מאפשרת מדידות ישירות ובו-זמנית בזמן אמת, כמו גם ניתוח של תכונות פיזיולוגיות מרובות הקשורות לתפוקה הכרוכות באינטראקציות דינמיות בין הצמח לסביבת הצמח.

פלטפורמה טלמטרית, כבידתית ל Phenotyping פיזיולוגי בזמן אמת של אינטראקציות צמח-סביבה

פרוטוקול זה מציג סיכום מפורט של אסטרטגיות לחיסון שורשי צמחים עם מיקרובים הנישאים באדמה. דוגמאות לפטריות Verticillium longisporum ו-Verticillium dahliae, מתוארות שלוש מערכות שונות של זיהום שורשים. יישומים פוטנציאליים וניתוחים אפשריים במורד הזרם מודגשים, ויתרונות או חסרונות נדונים עבור כל מערכת.

אסטרטגיות חיסון להדבקת שורשי צמחים במיקרואורגניזמים הנישאים בקרקע

ניסויי התחממות קרקע במעבדה משתמשים בדרך כלל בשתי טמפרטורות קבועות או יותר במספר תאים. על ידי הצגת תא סביבתי מתוחכם, אנו מספקים שיטת בקרת טמפרטורה מדויקת כדי לחקות את הגודל והמשרעת של טמפרטורת הקרקע באתרה ולשפר את התכנון הניסויי של מחקרי דגירה בקרקע.

הדמיית טמפרטורה בניסוי דגירה בקרקע

כאן אנו מציגים את הקמתו והפעלתו של מערך ניסיוני לשיפור בליה מינרלית באמצעות פעילותם של אורגניזמים בקרקע, תוך מניפולציה מקבילה של משתנים אביוטיים הידועים כמעוררי בליה. תוצאות מייצגות מתפקוד ההתקנה וניתוחי מדגם נדונים יחד עם נקודות לשיפור.

תכנון ובנייה של מערך ניסיוני לשיפור בליה מינרלית באמצעות פעילות אורגניזמים בקרקע

כאן אנו מציגים מחקר שהוקם ב-iDiv Ecotron, תאי מזוקוסמוס יבשתיים עם תנאים סביבתיים מבוקרים מעל ומתחת לאדמה, כדי לחקור את ההשפעות העצמאיות והאינטראקטיביות של היסטוריית הצמחים וההיסטוריה של הקרקע על תפקוד המערכת האקולוגית של קהילות עשב לאורך שיפוע מגוון צמחים.

JenaTron - גישה ניסויית לחקר ההשפעות של היסטוריית הצמח וההיסטוריה של הקרקע על תפקוד המערכת האקולוגית של העשב

פרוטוקול זה מתאר את ההרכבה והשימוש במערכת גידול גנוטוביוטית חדשה לצמחים, שנועדה להכיל דגנים ומאומתת בחיטה ותירס. מערכת גנוטוביוטית זו מאפשרת ניסויים מבוקרים בין צמחים למיקרואורגניזמים על ידי מתן תנאי גדילה סטריליים, ניהול השקיה ותאימות למצעי קרקע מגוונים.

הרכבה ושימוש במערכת גנוטוביוטית של צמחים למחקרי אינטראקציה בין צמחים למיקרואורגניזמים בדגנים

חקור את תפקידה של הטרוגניות פנימית בקרקע על דו-קיום מינים באמצעות מניפולציות מושרות צמח. שיטה זו מדגימה כיצד משוב צמח-קרקע משפיע על דינמיקת הקהילה האקולוגית.

פרוטוקול ניסוי להטרוגניות קרקע מושרה צמח מניפולציה

גלה סרטונים נוספים