VDJ-Seq: ניתוח רצף עמוק של ג'ין שרשרת מחדש Immunoglobulin כבד לחשוף את דפוסים משובטים אבולוציה של לימפומה B הסלולרי

26.6K צפיות

צוטט 19 פעמים

15:07 דק׳

28 בדצמבר 2015

10.3791/53215-v

28 בדצמבר 2015

26.6K צפיות

Yanwen Jiang¹^,² , Kui Nie³ , David Redmond² , Ari M. Melnick¹ , Wayne Tam³ , Olivier Elemento²

¹Department of Medicine, Weill Cornell Medical College, ²Institute for Computational Biomedicine, Weill Cornell Medical College, ³Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medical College

פרוטוקול זה מתאר גישה לחקירת אזורי VDJ בשרשרת כבדה של אימונוגלובולין של לימפומות על ידי ריצוף עמוק ואחזור סידור מחדש של VDJ ומצב היפרמוטציה סומטית כדי לתאר ארכיטקטורה משובטת של גידול בודד. השוואת ארכיטקטורה משובטת בין דגימות אבחנה זוגיות והישנות חושפת מצבי אבולוציה משובטים של הישנות לימפומה.