Name: אסטרטגיות דגימה ועיבוד של דגימות רקמה Biobank של מודלים ביו חזירי (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-03-06T14:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 7 s
Description: למד שתי טכניקות מרכזיות לדגימת רקמות חזיר בביובנק: שיטת השקיעה להערכת נפח איברים ושיטת האוריינטטור ליצירת חתכים איזוטרופיים אקראיים. שיטות אלו משפרות את דיוק הניתוח המורפולוגי במחקר ביורפואי.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

המחברים תודה ליסה Pichl לסיוע טכני מעולה.

<ol><li>Aigner, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transgenic+pigs+as+models+for+translational+biomedical+research%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol.+Med%22%5BJournal%5D)">Transgenic pigs as models for translational biomedical research.</a> J Mol. Med. 88, 653-664 (2010).</li>
<li>Blutke, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Munich+MIDY+Pig+Biobank%3A+A+unique+resource+for+studying+organ+crosstalk+in+diabetes%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Metab%22%5BJournal%5D)">The Munich MIDY Pig Biobank: A unique resource for studying organ crosstalk in diabetes.</a> Mol Metab. 6, 931-940 (2017).</li>
<li>Klymiuk, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dystrophin-deficient+pigs+provide+new+insights+into+the+hierarchy+of+physiological+derangements+of+dystrophic+muscle%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Mol+Genet%22%5BJournal%5D)">Dystrophin-deficient pigs provide new insights into the hierarchy of physiological derangements of dystrophic muscle.</a> Hum Mol Genet. 22, 4368-4382 (2013).</li>
<li>Klymiuk, N., Seeliger, F., Bohlooly, Y. M., Blutke, A., Rudmann, D. G., Wolf, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tailored+pig+models+for+preclinical+efficacy+and+safety+testing+of+targeted+therapies%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Pathol%22%5BJournal%5D)">Tailored pig models for preclinical efficacy and safety testing of targeted therapies.</a> Toxicol Pathol. 44, 346-357 (2016).</li>
<li>Renner, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Permanent+neonatal+diabetes+in+INSC94Y+transgenic+pigs%5BTitle%5D)+AND+%22Diabetes%22%5BJournal%5D)">Permanent neonatal diabetes in INSC94Y transgenic pigs.</a> Diabetes. 62, 1505-1511 (2013).</li>
<li>Abbott, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inside+the+first+pig+biobank%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Inside the first pig biobank.</a> Nature. 519, 397-398 (2015).</li>
<li>Albl, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tissue+sampling+guides+for+porcine+biomedical+models%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol+Pathol%22%5BJournal%5D)">Tissue sampling guides for porcine biomedical models.</a> Toxicol Pathol. 44, 414-420 (2016).</li>
<li>Gundersen, H. J. G., Mirabile, R., Brown, D., Boyce, R. W. Stereological principles and sampling procedures for toxicologic pathologists. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aGundersen%2C+HJG+%22Haschek+and+Rousseaux%27s+Handbook+of+Toxicologic+Pathology%22">Haschek and Rousseaux's Handbook of Toxicologic Pathology</a>. Haschek, W. , 3rd ed, Academic Press. London. 215-286 (2013).</li>
<li>Howard, C. V., Reed, M. G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHoward%2C+CV+%22Unbiased+Stereology%3A+Three-Dimensional+Measurement+in+Microscopy%22">Unbiased Stereology: Three-Dimensional Measurement in Microscopy</a>. , 2nd ed, Garland science/Bios Scientific Publishers. Oxford. 1-277 (2005).</li>
<li>Mattfeldt, T., Mall, G., Gharehbaghi, H., Moller, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimation+of+surface+area+and+length+with+the+orientator%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">Estimation of surface area and length with the orientator.</a> J Microsc. 159, 301-317 (1990).</li>
<li>Nyengaard, J. R., Gundersen, H. J. G. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2818.1992.tb01497.x/abstract">The isector: A simple and direct method for generating isotropic, uniform random sections from small specimens.</a> J Microsc. 165, 427-431 (1992).</li>
<li>Tschanz, S., Schneider, J. P., Knudsen, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Design-based+stereology%3A+Planning%2C+volumetry+and+sampling+are+crucial+steps+for+a+successful+study%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Anat%22%5BJournal%5D)">Design-based stereology: Planning, volumetry and sampling are crucial steps for a successful study.</a> Ann Anat. 196, 3-11 (2014).</li>
<li>Dorph-Petersen, K. A., Nyengaard, J. R., Gundersen, H. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tissue+shrinkage+and+unbiased+stereological+estimation+of+particle+number+and+size%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">Tissue shrinkage and unbiased stereological estimation of particle number and size.</a> J Microsc. 204, 232-246 (2001).</li>
<li>Mattfeldt, T. Stereologische Methoden in der Pathologie [Stereologic methods in pathology]. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMattfeldt%2C+T+%22Normale+und+pathologische+Anatomie%22">Normale und pathologische Anatomie</a>. Doerr, W., Leonhardt, H. , Georg Thieme Verlag. Stuttgart-New York. (1990).</li>
<li>Gundersen, H. J., Jensen, E. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+efficiency+of+systematic+sampling+in+stereology+and+its+prediction%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microsc%22%5BJournal%5D)">The efficiency of systematic sampling in stereology and its prediction.</a> J Microsc. 147, 229-263 (1987).</li>
<li>Scherle, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+method+for+volumetry+of+organs+in+quantitative+stereology%5BTitle%5D)+AND+%22Mikroskopie%22%5BJournal%5D)">A simple method for volumetry of organs in quantitative stereology.</a> Mikroskopie. 26, 57-60 (1970).</li>
<li>Nielsen, K. K., Andersen, C. B., Kromann-Andersen, B. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7500483">A comparison between the effects of paraffin and plastic embedding of the normal and obstructed minipig detrusor muscle using the optical disector.</a> J Urol. 154, 2170-2173 (1995).</li>
<li>Schneider, J. P., Ochs, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alterations+of+mouse+lung+tissue+dimensions+during+processing+for+morphometry%3A+a+comparison+of+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Physiol+Lung+Cell+Mol+Physiol%22%5BJournal%5D)">Alterations of mouse lung tissue dimensions during processing for morphometry: a comparison of methods.</a> Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 306, L341-L350 (2014).</li>
<li>von Bartheld, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distribution+of+particles+in+the+z-axis+of+tissue+sections%3A+Relevance+for+counting+methods%5BTitle%5D)+AND+%22NeuroQuantology%22%5BJournal%5D)">Distribution of particles in the z-axis of tissue sections: Relevance for counting methods.</a> NeuroQuantology. 10, 66-75 (2012).</li>
<li>Baddeley, A. J., Gundersen, H. J., Cruz-Orive, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimation+of+surface+area+from+vertical+sections%5BTitle%5D)+AND+%22J+microsc%22%5BJournal%5D)">Estimation of surface area from vertical sections.</a> J microsc. 142, 259-276 (1986).</li>
<li>Blutke, A., Schneider, M. R., Wolf, E., Wanke, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+hormone+%28GH%29-transgenic+insulin-like+growth+factor+1+%28IGF1%29-deficient+mice+allow+dissociation+of+excess+GH+and+IGF1+effects+on+glomerular+and+tubular+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol+Rep%22%5BJournal%5D)">Growth hormone (GH)-transgenic insulin-like growth factor 1 (IGF1)-deficient mice allow dissociation of excess GH and IGF1 effects on glomerular and tubular growth.</a> Physiol Rep. 4, e12709(2016).</li>
<li>Rasband, W. S. ImageJ. , U.S. National Institutes of Health. Bethesda, Maryland, USA. Available from:
 <a target="_blank" href="http://rsb.info.nih.gov/ij">http://rsb.info.nih.gov/ij</a> (1997).</li>
<li>Hermanns, W., Liebig, K., Schulz, L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Postembedding+immunohistochemical+demonstration+of+antigen+in+experimental+polyarthritis+using+plastic+embedded+whole+joints%5BTitle%5D)+AND+%22Histochemistry%22%5BJournal%5D)">Postembedding immunohistochemical demonstration of antigen in experimental polyarthritis using plastic embedded whole joints.</a> Histochemistry. 73, 439-446 (1981).</li>
<li>Böck, P. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aB%C3%B6ck%2C+P+%22Romeis+Mikroskopische+Technik%22">Romeis Mikroskopische Technik</a>. , Urban und Schwarzenberg. München, Wien, Baltimore. 17. Auflage 1-697 (1989).</li>
<li>Suvarna, K. S., Layton, C., Bancroft, J. D. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSuvarna%2C+KS+%22Bancroft%27s+theory+and+practice+of+histological+techniques%22">Bancroft's theory and practice of histological techniques</a>. Suvarna, K. S., Layton, C., Bancroft, J. D. , Churchill Livingstone. 1-654 (2013).</li>
<li>Knust, J., Ochs, M., Gundersen, H. J., Nyengaard, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stereological+estimates+of+alveolar+number+and+size+and+capillary+length+and+surface+area+in+mice+lungs%5BTitle%5D)+AND+%22Anat+Rec+%28Hoboken%29%22%5BJournal%5D)">Stereological estimates of alveolar number and size and capillary length and surface area in mice lungs.</a> Anat Rec (Hoboken). 292, 113-122 (2009).</li>
<li>Nyengaard, J. R., Gundersen, H. J. G. <a target="_blank" href="http://err.ersjournals.com/content/15/101/107">Sampling for stereology in lungs.</a> Eur Respir Rev. 15, 107-114 (2006).</li>
<li>Junatas, K. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stereological+analysis+of+size+and+density+of+hepatocytes+in+the+porcine+liver%5BTitle%5D)+AND+%22J+Anat%22%5BJournal%5D)">Stereological analysis of size and density of hepatocytes in the porcine liver.</a> J Anat. 230, 575-588 (2017).</li>
</ol>

המחברים אין לחשוף.

הדור של אספנים מדגם biobank חזירי חייתיים דורש חזקים טכניקות ופרוטוקולים מצפני איברים/רקמות כרכים, הדור לשחזור של נציג, דגימות רקמה עודפת מתאים למגוון רחב של שיטות ניתוח שונות, ועבור אקראיות על הכיוון של מדגם מקטעים עבור ניתוחים כמותיים stereological. בשיטות המתוארות במאמר הנוכחי הם מותאמים הגדלים של חזירי איברים ורקמות, פותחו להכיר ביעילות דרישות אלה,2,7. הם מבוססים על עקרונות מתודולוגיים מוכרת היטב, הוכיחו בעבר שלהם practicability מחקרים שונים שהתפרסמו<sup clas...

ב translational רפואה, חזירים הם נפוצים יותר ויותר לשימוש כמו חיה גדולה מודלים1,2,3,4,5, עקב מספר קווי דמיון יתרון בין חזירי, אנטומיה, פיזיולוגיה, וזמינות של הוקמה שיטות ביולוגי מולקולרי לאפשר לדור של המותאמים, מהונדסים גנטית חזיר דגמים למגוון רחב של מחלות תנאים1,4.
עם זאת, מספר החיות של מודל חזיר בהתאמה מסופקים עבור ניסויים בכל עת לעומת מודלים מכרסמים, מוגבל. זאת בשל המרווח דור חזירי של שנה אחת, ואת המאמצים פיננסיים וגוזלת זמן נדרש עבור הדור של חזירי מודלים טרנסגניים. לכן, חיות בודדות של מודל חזירי, כמו גם כדוגמאות ניתן להפיק של החזירים האלה הם חשובים מאוד, במיוחד אם מהונדסים גנטית מודלים חזירי ו/או בעיות ניסיוני לטווח ארוך (למשל, סיבוכים מאוחר של מחלות כרוניות) נבדקים ב אנשים בגילאי2,6,7.
במהלך כל המחקר, הביצועים של ניתוחים נוספים אשר לא נקבעו בעיצוב ניסיוני הראשונית של המחקר עשוי מאוחר יותר להפוך להיות רלוונטי, למשל, לכתובת שאלות שונות הנובעות קודם לכן גילה ממצאים בלתי צפויות. אם הדוגמאות מתאימים עבור ניסויים נוספים אלה אינם זמינים, עלות גבוהה באופן לא פרופורציונלי והוצאות אינטנסיבית יתכן שיהיה צורך ליצור חזירים נוספים ודוגמאות רקמה. כדי להיות מוכנים לכל מצב כזה, דור של biobank אוספים דגימות שנשמרת גיבוי של איברים שונים, רקמות או ביו-נוזלים, באופן כמותי ובאופיו מתאימים למגוון רחב של ניתוחים שלאחר מכן, נחשב חשוב הגישה2,6,7. הנובעות יתרונות מיטבית מודל בעלי חיים חזירי, הזמינות של דגימות biobank נאותה גם מציעה את האפשרות ייחודי כדי לבצע קשת רחבה של שיטות ניתוח שונות על מדגם זהה בחומרים על רמה איברים רב אותו חיות בודדות, למשל, על ידי חלוקת דוגמיות המדענים של קבוצות עבודה שונות מאורגן ב6,72,רשת המחקר. בנוסף, אסטרטגיית הדגימה "מבט לעתיד" biobanking תורם גם הפחתה של מספר החיות הצורך במחקר. היתרונות של מודל חזירי biobanking הוכחו לאחרונה באיבר רב, multiomics רקחמ, איברים הצלב לדבר במודל של חזירי מהונדס גנטית של סוכרת לטווח ארוך, באמצעות דגימות מן Biobank החזיר מינכן MIDY 2.
קיימות מספר דרישות חובה דגימות biobank חייב לעמוד בדרך כלל כדי לבסס את המהימנות ואת interpretability של תוצאות הבדיקות שבוצעו לאחר מכן. הדגימות להפיקם reproducibly, הם חייבים להיות נציג, כלומר, במידה מספקת שיקוף התכונות מעוניין מולקולרית מורפולוגיים של האיבר/הרקמות הדגימות נלקחו מ-7. למתאים למגוון רחב של סוגי ניתוח במורד הזרם, הדגימות חייב להיות בכמויות מספיקות אשר מעובדות בהתאם לדרישות (כולל זמן ותנאי טמפרטורה) שיטות אנליטיות השונות, כולל תיאורי ניתוחים histopathological, כגון cryohistology, פרפין, היסטולוגיה פלסטיק, אימונוהיסטוכימיה, בחיי עיר הכלאה, ultrastructural אלקטרון מיקרוסקופיות ניתוחים ניתוחים אבחון קליני מעבדתי, כמו גם כמו מולקולרית ניתוחים של ה-DNA, RNA, חלבונים ו מטבוליטים.
כדי לאפשר ההערכה של מגוון רחב של פרמטרים מורפולוגי כמותיים ברורים כגון מספרים, אמצעי אחסון, אורכי או פני שטחים של רקמות שונות מבנים על ידי ניתוחים כמותיים stereological, קטע אקראי מטוסים של דוגמאות היסטולוגית של הרקמות/האיברים המתאימים צריכים להיות מוכנים7,8,9,10,11. במחקרים כמותיים מורפולוגי, הקביעה מדויקת מהנפח הכולל של רקמה, איבר, או איבר תא, הדגימות שנלקחו ממנו (קרי, החלל הפניה) חשיבות מכרעת7,9 , 12 לחישוב הכמויות מוחלטת של הפרמטרים מעוניין בתוך האיברים המתאימים, רקמת, או אורגניזם. בסופו של דבר, ההשפעה של רקמות הטבעה הקשורות הצטמקות במהלך ההכנה של מקטעים היסטולוגית חייב להיות נחוש ונלקח לתוך חשבון13. לכן, ניתוחים כמותיים stereological, במיוחד של דגימות בארכיון (קבוע דגימות רקמה, רקמה מוטבע בלוקים, סעיפים היסטולוגית, וכו ') ממחקרים קודמים הם לפעמים מוגבלות מאוד או אפילו בלתי אפשרי12, במיוחד אם volumetry של האיברים המתאימים/הרקמות לא בוצע, אם אין עיצובים דגימה נאותה הוחלו על צו מדגמים מייצגים, אם המספרים ואת כמויות של דוגמאות בודדות זמין אינן מספיקות, או העיבוד דוגמאות אינו תואם שערוך של הפרמטרים מורפולוגי כמותית של עניין. בשל הגורמים כמשפיע האפשריים סעפת, התאמת חומרי ארכיון-sample ניתוחים של פרמטרים מורפולוגי כמותיים ברורים באופן חד משמעי אין אפשרות לענות, אבל תלוי הערכה זהירה של כל מקרה ומקרה.
לפיכך, מיקום, גודל, מספר, עיבוד, כיוון זמירה, וכיוון דוגמאות של פוטנציאל ישפיעו על התוצאות של הבדיקות עוקבות, גורמים אלה חשיבות גדולה, יש לקחת בחשבון בעיצוב ניסיוני בכל מחקר. בכל הנוגע היבטים אלה תכונות מיוחדות של האנטומיה חזירי, הנחיות דיגום מקיף, מפורט, בקנה מידה גדול מותאם חזירי חייתיים לאחרונה הוקמו, מתן התייחסות איתנה מתוקננת, לשחזור , ויצירת יעיל של דגימות יתיר, מעובד כראוי, באיכות גבוהה יותר מ-50 שונים חזירי איברים ורקמות6,7.
התיאורים מתודולוגי, את ערכת לימוד בנושא המוצג במאמר הנוכחי מספקים נתונים היסטוריים, המחשה, מובנת, צעד הוראות שלב אחר שלב מעשי בביצוע מגוון רחב של טכניקות volumetry, דגימה של רקמות חזירי, איברים, ועיבוד של דגימות רקמה עבור שיטות ניתוח שונות במורד הזרם. הטכניקות נבחרים כוללים שיטות לקביעת איברים/רקמות כרכים וצפיפות המבוססת על העקרונות של ארכימדס, קאבליירי9, לרבות קביעת מימדי תלת מימדי התכווצות של רקמות הקשורים הטבעה שונות ההטבעה מדיה14 במהלך עיבוד לבדיקה היסטולוגית, גישות יישום מעשית משוקלל נפח שיטתית אקראי הדיגום, עיבוד של דגימות רקמה שנדגמו עבור אחר העוקבים ניתוחים7,8,9,15, דור של כראוי ומכוונים מעובד דגימות פוטנציאלית ניתוח כמותי stereological7,8, 9,10,11. לצד היישום שלהם בפרויקטים biobank חזירי, השיטות והפגינו מתאימים בדרך כלל ללימודי כל בחינת מאפיינים כמותיים היסטו-מורפולוגי של איברים/רקמות. יתר על כן, דגימה אקראית שיטתית עיצובים הם מועיל במיוחד לדור של מדגמים מייצגים ניסויים בשיטות ניתוח מולקולרית כדי לזהות שינויים שפע של, למשל, RNAs, חלבונים או מטבוליטים ב איברים ורקמות שונות.
בפסקאות הבאות לספק הקדמה קצרה לשיטות אלו, בזמן הביצוע המעשי שלהם מתוארת בסעיף פרוטוקול.
הנחישות של איברים/רקמות כרכים קביעה של איברים משקולות ואמצעי אחסון חשוב מספר הגדרות ניסיוני, כמו גורמים אלה עשוי להצביע על שינויים, שעשוי להיות קשור השפעול נבדק גורמי עניין. הנפח הכולל איברים/רקמה נדרש גם כדי לחשב פרמטרים כמותיים מוחלט, (למשל, המספר בתא סכום) של צפיפויות נפח מספריים מוערך stereologically (כלומר, מספר התאים ליחידת נפח של רקמה)7,12. מלבד באמצעות ציוד טכני מורכב, כגון טומוגרפיה המחשב, טכניקות יש בעצם שלוש שיטות מעשיות נפוץ כדי לקבוע את נפח מוחלט של איבר או רקמה. היקף איבר יכול להיקבע על ידי "הנפחי מדידה ישירה", לפי עקרון ארכימדס, קרי, מדידת הנפח של מים או תמיסת מלח שנעקרו על ידי המבנה כאשר לחלוטין. עם זאת, עבור איברים חזירי וזהובה גדולים, גישות אלה הם מעשי נוטה העוסקת, מכיוון שהם דורשים מבחנות גדולות מאוד נפח/מדידה. יותר נוח, ניתן לחשב את עוצמת הקול איברים/רקמה שלו משקל, צפיפות7,12,16, אשר יכול ביעילות להיקבע באמצעות את "שיטת ועלייתו"7,12 ,16 (פרוטוקול שלב 1.1.). איברים/רקמות כרכים יכול גם להיות מוערך שימוש בגישות volumetry מבוסס על "עקרון Cavalieri" (1598-1647). במילים פשוטות, העיקרון קאבליירי קובע, כי אם שני עצמים הם למחלקה במישורים מקבילים למישור הקרקע, הפרופילים של הסעיפים לחתוך דרך שני העצמים ב המתאים המרחקים בין מישור הקרקע יש את אותם אזורים, שני העצמים יש באותו אמצעי אחסון. לפיכך, הנפח של אובייקטים באופן שרירותי בצורת יכול להיות מוערך כמו התוצר של אזורים הפרופיל שלהם סעיף סעיף מקביל, באותה מידה מרוחק מטוסים, המרחק בין המטוסים סעיף. . זה מובנת עם האנלוגיה הבאה: שקול שתי ערימות המורכב מספר זהה של מטבעות זהים ממוקמים לצד מחסנית אחת עם המשרת מטבעות בערימה אחד מעל השני מניב בצורת גליל של הערימה מטבע, והאחר ערימה של מטבעות עם מחוץ למרכז בעמדה מטבעות (איור 3 א). למרות הצורות של שני אוספים מטבעות שונים, האחסון שלהם זהים, מאז האזורים של המטבעות ברמות המתאימות של שתי ערימות (קרי, האזורים של פרופילים של מקטעים מקבילים לחתוך שתי ערימות מטבע מרחקים שווים קרקע) זהים. הערכה של הכרכים של חזירי איברים ורקמות באמצעות ה קאבליירי עקרון7,12,15 מתואר בשלב 1.2.
קביעת היקף רקמת הצטמקות הקשורים הטבעה היסטולוגית ניתוח של מספר פרמטרים כמותיים מורפולוגי נמדד בסעיפים רקמות היסטולוגית, כולל ההשפעה של רקמות הטבעה הקשורות הצטמקות המתרחשים במהלך עיבוד עבור היסטולוגיה רקמה להיות נחושים ולא נלקח בחשבון. היקף רקמת הטבעה הקשורות הצטמקות עשוי להיות משתנה, תלוי הן על הרקמה, העיבוד שלו את ההטבעה בינוני8,13,17,18,19. באופן כללי, שינויים הקשורים הטמעה של אמצעי האחסון של דגימת רקמה (קרי, בעיקר הצטמקות) מתרחשים כל שלושת הממדים של החלל, ולכן משפיע על כל הפרמטרים ממדי ההערכה על ידי ניתוחים כמותיים stereological8 . בעיקרון, היקף רקמת הקשורות הטבעה, הביע כגורם הצטמקות לינארית רקמת (fS), התכווצות יכול להיות מוערך כפי שמוצג צעד 1.3. משמשת עבור תיקון של פרמטרים מורפולוגי כמותית (הצטמקות רגיש)14.
משוקלל נפח דגימה אקראית שיטתית של איברים/רקמות על הקמתה של אוסף biobank של דגימות איברים חזירי/רקמה, גישות משוקלל נפח דגימה אקראית שיטתית כמו שמתואר בשלב 2 הוכיחו להיות טכניקות מעשיות, לחיסכון בזמן ויעיל עבור הדור של נציג, רב תכליתי רקמות דוגם7,8,9,15.
הדור של איזוטרופיות אחיד אקראי מקטעים ומקטעים אנכי אחיד אקראי עבור ניתוחים stereological כמותית דגימות רקמה Biobank צריך להיות מתאים עבור מגוון רחב של שיטות ניתוח stereological כמותיים שונים עבור הערכה של הפרמטרים לא היתה אפשרות לקבוע בלי הדגימה מוכן כראוי, לכל היותר. כמעט כל הפרמטרים stereological כמותיים ניתן לקבוע, באמצעות "isotropic (עצמאית) אחיד אקראי (iur השוק) סעיפים"8,9. בסעיפים iur השוק, כיוון תלת מימדי של המטוס סעיף של דגימת הרקמות הוא אקראי. אפשר להשיג על ידי אקראיות של העמדה של דגימת הרקמות ביחס המיקום של המטוס הסעיף, כפי שהוא מיושם בשיטה "Isector"11 (פרוטוקול שלב 3.1), או על ידי אקראיות על הכיוון של המטוס סעיף שיחסית אליה דגימת הרקמות, כמו שיטת "Orientator"10 (פרוטוקול שלב 3.2). דגימות רקמה, כגון העור - או mucosa הדגימה הצגת נוכח באופן טבעי, או לזיהוי כראוי והמוגדרים ציר אנכי, הכנת "אחיד אקראי (VUR) מקטעים אנכיים" (פרוטוקול שלב 3.3.) אך ורק למחלקה בתוך מישור שלהם הציר האנכי הוא יתרון8,20. על שיח שלם של היסודות התיאורטיים של הדגימה iur השוק/VUR, דיון מקיף של פוטנציאל במורד הזרם ניתוחים stereological כמותיים, הקורא מעוניין מכונה הלימוד של stereology כמותיים בחיים מדעי8,9.

<table><tbody><tr><td>Agar</td><td>Carl Roth GmbH, גרמניה</td><td>אגר (אבקה), קט': 5210.3</td><td>ממיסים כ -1 גרם אגר ב -10 מ"ל מים קרים בכוס או בכוס פלסטיק, מחממים במיקרוגל בחום של 700 וואט, מרתיחים את התמיסה פעמיים תוך ערבוב קפדני. יוצקים לתבנית כשהיא עדיין חמה ומניחים להתמצק. זהירות: בזמן הטיפול באגר נוזלי חם, יש ללבוש משקפי מגן וכפפות.</td></tr><tr><td>קליפר</td><td>Hornbach Baumarkt GmbH, בורנהיים, גרמניה</td><td>Schieblehre כרום/ורניקט 120 מ"מ Cat.: 3664902</td><td>כל סוג של קליפר (מכני או אלקטרוני) יעשה גם כן.</td></tr><tr><td>תבניות יציקה (מתכת)</td><td>אנגלברכט מדיזין & Labortechnik, Ederm&uuml; nde, גרמניה</td><td>Einbettsch&auml; lchen aus Edelstahl, 14 x 24 x 5 מ"מ, Cat.: 14302b</td><td>כל סוג אחר של תבנית יציקת מתכת המשמשת להטמעת פרפין יעשה גם כן.</td></tr><tr><td>תבניות העתקה של רשתות צולבות (5 מ"מ - 6 ס"מ)</td> <td>n.a.n.a.תבניות</td><td></td> <td>העתקה של רשתות צולבות (5 מ"מ - 6 ס"מ) מסופקות בקובץ הנתונים המשלים של Albl et al.&nbsp; טוקסיקול פאתול. 44, 414-420, doi: 10.1177/0192623316631023 (2016)</td></tr><tr><td>העתק תבניות של מעגלים שווי זווית ומשוקלל קוסינוס</td> <td>n.a.n.a.תבניות</td><td></td> <td>העתקה של מעגלים שווי זווית ומשוקללת קוסינוס מסופקות ב Nyengaard & גונדרסן</חזק>. Eur Respir Rev. 15, 107-114, doi: 10.1183/09059180.00010101 (2006) ובGundersen et al. עקרונות סטריאולוגיים ונהלי דגימה עבור פתולוגים טוקסיקולוגיים. בתוך: האשק ורוסו; s מדריך לפתולוגיה טוקסיקולוגית. מהדורה שלישית, 215-286, ISBN: 9780124157590 (2013).</td></tr><tr><td>מהדקים מתקפלים לאחור (תפסי קלסר YIHAI, 15 מ"מ ו-19 מ"מ)</td> <td>Ningbo Tianhong נייר מכתבים ושות 'בע"מ, סין</td><td>Y10006 ו-Y10005</td><td>כל סוג אחר של מהדקי קיפול משרדיים סטנדרטיים יעשה גם כן.</td></tr><tr><td>מלקחיים (אנטומיים)</td><td>NeoLab Migge GmbH, היידלברג, גרמניה</td><td>neoLab Standard -Pinzette 130 מ"מ, אנטומיש, rund, Cat.: 1-1811</td><td>כל סוג של מלקחיים אנטומיים יעשה.</td></tr><tr><td>פורמלדהיד-תמיסת 4%</td> <td>SAV-Liquid Produktion GmbH, פלינצבאך, גרמניה</td><td>פורמלדהיד 37/40%, קט': 1000411525005</td><td>לדלל ל-4% מהתמיסה המרוכזת. חוצץ ל-pH ניטרלי. יש ללבוש הגנה מתאימה לעיניים, לידיים ולנשימה. עבד דגימות רקמה קבועות בתמיסת פורמלדהיד מתחת למכסה המנוע ולבש משקפי מגן וכפפות מעבדה.</td></tr><tr><td>נייר גרף (לכיול)</td><td>B&uuml; romarkt B&ouml; ttcher AG, יינה, גרמניה. www.bueromarkt-ag.de</td><td>Penig Millimeterpapier A4, Cat.: 2514</td><td>כל סוג של נייר גרף (בקנה מידה של מילימטר) יתאים.</td></tr><tr><td>כוסות מעבדה (5 מ"ל, 10 מ"ל, 50 מ"ל, 100 מ"ל)NeoLab</td> <td>Migge GmbH, היידלברג, גרמניה</td><td>Becherglas SIMAX&reg; , niedrige Form, Borosilikatglas 3.3 Cat.: E-1031, E-1032, E-1035, E-1036</td><td>כל סוג של כוסות זכוכית או פלסטיק בנפח 5 &ndash; 100 מ"ל יתאים.</td></tr><tr><td>סולמות מעבדהMettler</td> <td>Toledo GmbH, Gie&szlig; en, גרמניה</td><td>PM6000</td><td>כל מאזני מעבדה סטנדרטיים עם טווחי מדידה בין 0.1 מ"ג לכ-20 גרם, בהתאמה בין 100 מ"ג לכ-500 גרם יעשו</td></tr><tr><td></td><td>Sartorius AG, G&ouml; ttingen, גרמניה</td><td>להבי מיקרוטום BP61S</td><td></td></tr><tr><td></td><td>Engelbrecht Medizin & Labortechnik, Ederm&uuml; nde, גרמניה</td><td>FEATHER Microtome blasdes S35, Cat.:14700</td><td>כל סוג של להבי מיקרוטום חד פעמיים יתאים.</td></tr><tr><td>תוכנת מורפומטריה / פלנימטריה / מערכת</td><td>המכון הלאומי לבריאות (NIH)</td> <td>ImageJ</td><td>הורד מ https://www imagej.nih.gov/ij/ (1997).</td></tr><tr><td>Zeiss-Kontron, Eching, גרמניה</td><td>מערכת ניתוח תמונות VideoplanTM</td><td>אזל מהמלאי</td><td></td></tr><tr><td>מצלמת צילום</td><td>Nikon</td><td>D40</td><td>כל סוג של מצלמת צילום דיגיטלית שניתן להרכיב על חצובה יתאים.</td></tr><tr><td>שקפים מפלסטיק</td><td>Avery Zweckform GmbH, Oberlaindern, גרמניה</td><td>לייזר תקורה-פולי DINA4 Cat.:&nbsp; 3562</td><td>כל שקף פלסטיק להדפסה (בלייזר) יעשה.</td></tr><tr><td>טבלאות מספרים אקראיות</td> <td>n.a.n.a.ניתן</td> <td>ליצור טבלאות מספרים אקראיות בנוחות (עם מספרים מוגדרים של מספרים אקראיים ובמרווחים מוגדרים), באמצעות מחוללי מספרים אקראיים, כגון: https://www.random.org/</td><td></td></tr> <tr><td>Razor blades</td><td>Plano GmbH, Wetzlar, Germany</td><td>T5016</td><td>כל סוג של סכיני גילוח יתאים.</td></tr><tr><td>שליט</td><td>B&uuml; romarkt B&ouml; ttcher AG, יינה, גרמניה. www.bueromarkt-ag.de</td><td>ליניאלי משרדי 30 ס"מ, Kunststoff, שקוף, Cat.: ln30</td><td>כל סוג של סרגל בקנה מידה של ס"מ-מ"מ יתאים גם כן.</td></tr><tr><td>תמיסת מלח (0.9%)</td><td>Carl Roth GmbH, גרמניה</td><td>Natriumchlorid, >99% קט': 0601.1</td><td>להכנת 0.9% מי מלח, יש להמיס 9 גרם NaCl ב-1000 מ"ל מים מזוקקים בטמפרטורה של 20&00 מעלות צלזיוס.</td></tr><tr><td>להבי אזמל</td><td>Aesculap AG & Co KG, Tuttlingen, גרמניה</td><td>להבים כירורגיים של BRAUN N&deg; 22</td><td>כל סוג של להבי אזמל יתאים.</td></tr><tr><td>סורק</td><td>Hewlett-Packard</td><td>hp scanjet 7400c</td><td>כל סוג של סורק משרדי סטנדרטי המסוגל לסרוק ברזולוציות של 150-600 dpi יתאים.</td></tr><tr><td></td><td></td><td>דוגמאות להתקני חיתוך שנבנו בעצמם ניתן למצוא ברשומה אנטומית Knust, et al.. 292, 113-122, doi: 10.1002/ar.20747 (2009) ובקובץ הנתונים המשלים של Albl et al.&nbsp; Toxicol Pathol. 44, 414-420, doi: 10.1177/0192623316631023 (2016).</td><td></td></tr><tr><td>תבניות יציקה כדוריות (למשל, בקוטר 25.5 מ"מ)Pralinen-Zutaten.de</td><td>, וינדך, גרמניה</td><td>פרלין-הולקוגלן וולמילך, תבניות יציקה כדוריות 25.5 מ"מ</td><td>יכולות להיות גם בבנייה עצמית, או להשיג מספקי קונדיטורים אחרים (לפרלינים). תבניות היציקה המצוינות כאן הן למעשה אריזה/עטיפה של גופי פרלינים חלולים (תחילה אוכלים את הפרלינים ולאחר מכן משתמשים באריזה ליצירת קטעי i-sector)</td></tr><tr><td>חוט דק</td><td>Basteln & הובי שובס, סטרה ושליג; furth, גרמניה. www,bastel-welt.de</td><td>Messingdraht (0.3 מ"מ) Cat.: 216464742</td><td>כל סוג אחר של חוט דק יתאים גם כן.</td></tr><tr><td>נייר טישו</td><td>NeoLab Migge GmbH, היידלברג, גרמניה</td><td>Declcate Task מגבונים-לבן, קט: 1-5305</td><td>כל סוג אחר של נייר טישו מעבדה יעשה גם כן.</td></tr><tr><td>עט עמיד למים</td><td>Staedler Mars GmbH & Co KG, N&uuml; rnberg, Grmany</td><td>Lumocolor קבוע 313, 0.4 מ"מ, S, שחור, Cat.: 313-2</td><td>כל סוג אחר של עט עמיד למים יעשה גם כן.</td></tr></tbody></table>

אסטרטגיות דגימה ועיבוד של דגימות רקמה biobank של מודלים ביו חזירי

Sampling Strategies and Processing of Biobank Tissue Samples from Porcine Biomedical Models

במחקר רפואי translational, מודלים חזירי בהתמדה הפך פופולרי יותר. בהתחשב בערך גבוה של חיות בודדות, במיוחד של חזיר מהונדס גנטית מודלים ומספר מוגבל לעיתים קרובות בעלי זמינות של מודלים אלה, הקמת (biobank) אוספים של דגימות רקמה שלמאחה מעובדים מתאים קשת רחבה של שיטות ניתוח עוקבות, כולל ניתוחים לא צוין בנקודת הזמן של הדגימה, מייצגים גישות משמעותי כדי לנצל את מלוא היתרונות של הערך translational של המודל. לגבי הייחוד של האנטומיה חזירי, הנחיות מקיף לאחרונה הוקמו לדור מתוקננת של נציג, באיכות גבוהה דגימות שונים חזירי איברים ורקמות. קווים מנחים אלה הם תנאים מוקדמים חיוניים עבור הפארמצבטית התוצאות, comparability שלהם בין מחקרים שונים החוקרים. ההקלטה של נתונים בסיסיים, כמו משקולות איברים כרכים, הקביעה של המיקומים דגימה, המספרים של דגימות רקמה שיווצר, כמו גם שלהם התמצאות, גודל, עיבוד וזמירה כיוונים, הם הגורמים הרלוונטיים קביעת את generalizability ואת השימושיות של הדגימה עבור מולקולרית, כמותיים המורפולוגיים. . הנה, המחשה, מעשית, צעד אחר צעד בהפגנה של הטכניקות החשובות בדור של נציג, רב תכליתי biobank דגימות רקמות חזירי מוצג. השיטות המתוארות כאן כוללים קביעת צפיפות, ואמצעי אחסון איברים/רקמות היישום של הליך משוקלל נפח דגימה אקראית שיטתית של איברים parenchymal על ידי ספירת נקודת, הנחישות של היקף רקמת הצטמקות הקשורים הטבעה היסטולוגית של דגימות, דור של דגימות מונחה באופן אקראי עבור ניתוחים כמותיים stereological, כגון איזוטרופיות אחיד אקראי (iur השוק) סעיפים שנוצר על ידי שיטות "Orientator" ו- "Isector", המדים אנכי קטעים אקראיים (VUR).

הטכניקה ועלייתו של קביעת צפיפות רקמה/איברים
איור 12A -B מראה הקביעה נציג של צפיפות ונפח של כליה חזירי בטכניקה ועלייתו שמתואר בשלב 1.1 (איור 1, איור 2). נציג יותר תוצאות מדידות צפיפות של האיברים חזירי נוספים מוצגים בטבלה מס ' 2. רשימה מקיפה של צפיפות התייחסות מגוונות חזירי רקמות ואיברים מוצג "רקמת דגימה מדריכים...

היישום המעשי והביצועים של שיטות לדור של דגימות רקמה נציג של חזירי מודלים בבעלי חיים עבור קשת רחבה של ניתוחים במורד הזרם בפרויקטים biobank מודגמות, כולל volumetry, דגימה אקראית שיטתית, ועיבוד דיפרנציאלית של דגימות רקמה עבור סוגי ניתוחים כמותיים מורפולוגיות ומולקולרית.

אסטרטגיות דגימה ועיבוד של דגימות רקמה Biobank של מודלים ביו חזירי

In translational medical research, porcine models have steadily become more popular. Considering the high value of individual animals, particularly of ...

סרטון זה מדגים שתי טכניקות מפתח לדגימה ועיבוד של דגימות רקמת חזיר ביו-בנק. טכניקת הטבילה מעריכה באופן אמין את נפח האיברים והרקמות הכולל וטכניקת האוריינטטור מייצרת קטעי רקמה איזוטרופיים אקראיים להערכה בלתי משוחדת של פרמטרים מורפולוגיים כמותיים. היתרון העיקרי של טכניקת הטבילה לקביעת צפיפות רקמות הוא שניתן ליישם אותה על כל סוג של רקמה ושהיא מייצרת תוצאות אמינות עבור דגימות קטנות כמו גם גדולות.היתרונות של טכניקת האוריינטטור הם בכך שהיא יעילה ביותר ועובדת גם עם דגימות רקמה גדולות. כדי להתחיל נפח עבור איבר גדול, הסר פיסת רקמה בגודל מתאים מהאיבר. ספוג בזהירות את הדגימה במגבת נייר כדי להסיר עודפי דם ונוזל רקמות.לאחר מכן שקלו את הדגימה בסולם מדויק ורשמו את משקל הדגימה. הוסף 0.9% מלח לכוס בגודל מתאים. אל תמלא את הכוס לחלוטין כדי למנוע הצפת יתר במהלך הופעת רקמות.הניחו את הכוס על המשקל ואז טבלו מלקחיים או מחזיק דגימה שנבנה בעצמו במי המלח עד שהסימן על המלקחיים או מחזיק הדגימה יגיע לנוזל. לאחר מכן, אפס את תצוגת הסולם לאפס. חבר בזהירות את דגימת הרקמה למלקחיים או למחזיק הדגימה וטבול לחלוטין את הדגימה במי מלח עד להגעה למיקום המסומן.כדי לתעד מדידות צפיפות אמינות חשוב לוודא שהדגימה שקועה לחלוטין ולהימנע מכל מגע של הדגימה השקועה לדפנות הפנימיות או לתחתית הכוס. תוך כדי החזקת הדגימה במקומה, רשום את המשקל המוצג על המשקל. השתמש במדידה זו ובצפיפות המלח בטמפרטורת החדר כדי לחשב את נפח הדגימה.לאחר מכן חשב את צפיפות דגימת הרקמה ממשקל הדגימה ונפחה עבור איברים ורקמות גדולים, כמו הכליה הזו, בצע מדידות חוזרות עם מספר דגימות וחשב את הצפיפות הממוצעת מהמדידות הבודדות. עבור דגימות קטנות ואיברים קטנים הנמדדים בסך הכל כגון בלוטת יותרת המוח, חזור על המדידה שלוש פעמים לפני חישוב צפיפות האיברים הממוצעת מערכי המדידה הבודדים.לבסוף, חשב את הנפח הכולל של האיבר, הרקמה או תא האיברים ממשקלו וצפיפותו. הניחו דגימת רקמה קבועה על הדפס של עיגול שווה עם קצה אחד מקביל לכיוון אפס עד 180 מעלות. לאחר מכן השתמש בטבלת מספרים אקראית כדי לקבוע זווית אקראית.מצא את הסימנים המתאימים בקנה המידה של המעגל השווה. בעזרת סימנים אלה, חותכים חתך דרך הדגימה כאשר מישור החתך מכוון במקביל לכיוון הזווית האקראית המצוינת בקנה המידה של המעגל השווה ואנכי למשטח המנוחה של הדגימה. הנח את גוש הרקמה כשמשטח החלק פונה כלפי מטה על עיגול משוקלל קוסינוס.כאשר קצה משטח המנוחה ממוקם במקביל לכיוון אחד לאחד. כעת חתכו קטע חדש דרך המדגם בזווית אקראית שנקבעה באמצעות טבלת המספרים האקראיים. מישור החתך המתקבל הוא חתך אקראי אחיד איזוטרופי.טבלה זו מציגה את הצפיפות המייצגת של מספר רקמות ואיברים חזיריים שנקבעו בטכניקת הטבילה. רוב רקמות החזיר מציגות ערכי צפיפות מעט גבוהים יותר מאלה המתייחסים לצפיפות המים. בעוד שרקמות השוחות במי מלח, כמו רקמת שומן למשל, מציגות צפיפות נמוכה מאחת.איור זה מציג ארבעה קטעי IUR מייצגים של שריר הלב של החדר השמאלי החזירי שהוכנו בטכניקת האוריינטטור. שימו לב לזוויות החיתוך שהשתנו בקטעי IUR השונים. לאחר השליטה, ניתן לבצע את טכניקת הטבילה לקביעת צפיפות הרקמות תוך מספר דקות.אם זה מבוצע כראוי. קטעי רקמה אקראיים אחידים איזוטרופיים שנוצרו בטכניקת האוריינטטור מתאימים להערכה של כל פרמטרים מורפולוגיים כמותיים באמצעות שיטות ניתוח סטריאולוגיות מתאימות. מוזיקה דיגיטלית.

sampling-strategies-processing-biobank-tissue-samples-from-porcine

Research

JoVE Journal

Medicine

רפואה

המחקר הנוכחי קובע מתודולוגיה סימולציה אלמנט ניסוי-סופי בשילוב להשיג את התגובה המכנית הדינמית uniaxial של ביו-חומרים רכים (מוח, כבד, גיד, שומן, וכו '). תוצאות ניסוי multiaxial שהתעוררו בגלל הדגימה בולטת שהתקבלו מבדיקות בר לחץ הפיצול-הופקינסון שניתנו להתנהגות מתח מתח אמיתית uniaxial כאשר מדומה באמצעות אופטימיזציה איטרטיבי של ניתוח האלמנטים הסופי של החומר הביולוגי.

ניסוי-סופי יחד אלמנט דוגמנות מתודולוגיה להערכת הזנים שיעור גבוהים מכאנית תגובה של Biomaterials רך

זהו פרוטוקול עבור הכנת רקמה אופטימלית עבור גנומית, טראנסקריפט, וניתוחים פרוטאומית של עטלפים נתפס בטבע. הוא כולל פרוטוקולים עבור לכידת בת וניתוח, שימור רקמות, ותא culturing של רקמת בת.

אוסף רקמות של עטלפים עבור-ניתוח Omics ותרבות התא הראשוני

בפרוטוקול זה, פריימרים ספציפיים porcine תוכננו, פלסמידים המכילים פלסמידים ספציפיים ל-DNA רסיס נבנו, ועיקולים סטנדרטיים עבור כמות הוקמו. באמצעות פריימרים ספציפיים למינים, cpsDNA היה לכמת על ידי qPCR במודלים השתלת תא חזיר לעכבר ומודלים השתלת תיקון עורק חזיר אל קוף.

כימות של DNA ספציפי חזיר במחזור בדם של מודל xenotransplantation

פרוטוקול זה מפרט את הטכניקה להסרת מוח החזיר בשלמותו וניתוח של מספר אזורי מוח הנחקרים בדרך כלל במדעי המוח.

מיצוי וניתוק של מוח החזיר המבוית

בעבודה הבאה, אנו מתארים את הצעדים הרצופים הדרושים להקמת ביובנק גדול של סרטן המעי הגס והלבלב.

יצירה ותחזוקה של ביובנק חי - איך אנחנו עושים את זה

The endothelium is a dynamic integrated structure that plays an important role in many physiological functions such as angiogenesis, hemostasis, ...

אפיון צמיחת דם תאי אנדותל (BOEC) מדם היקפי חזירי

ביובנקים הם משאבים חיוניים למחקר ביו-רפואי והיחידה לרפואה תרגומית ודיגיטלית במכון האירופי לאונקולוגיה היא מודל בתחום זה. כאן אנו מספקים תיאור מפורט של נהלי ההפעלה הסטנדרטיים של ביו-בנקים לניהול סוגים שונים של דגימות ביולוגיות אנושיות.

ביובנק לרפואה תרגומית: נהלי הפעלה סטנדרטיים לניהול דגימות אופטימלי

פרוטוקול זה מתאר שיטה להקל על איסוף דגימות מדגימות כריתת ערמונית רדיקלית. המטרה היא למפות, לאפיין ולנתח במיקרו-מאקרו דגימות רקמה מהדגימות על סמך קריטריונים אנטומופתולוגיים לפני אחסונן בביובנק.

שיפור האמינות הביו-בנקאית של גידול הערמונית באמצעות טכניקת דגימה משופרת ואפיון היסטולוגי

פרוטוקול זה מתאר ביצוע כריתת גולגולת באמצעות מקדחה פניאומטית במהירות גבוהה על חזיר דני בן 3 חודשים. הגישה נעשית דרך העצם הקדמית וחושפת את הדורה מאטר הגחוני ואת ההמיספרות המוחיות שמתחתיו. הליך זה מאפשר גישה לחלק גדול של מוח החזיר.

גישה למוח החזירי באמצעות כריתת מקדח פניאומטי במהירות גבוהה

כאן אנו מציגים שיטה סטנדרטית לבידוד יעיל של תאי גזע ומגדלי שומן שמקורם בשומן, המאופיינת בהפחתה של &gt;90% בזמן העיבוד, חיוניות תאית גבוהה ותאימות רחבה.

בידוד יעיל של תאי גזע ושומנים שמקורם בשומן מרקמת שומן חזיר

למד שתי טכניקות מרכזיות לדגימת רקמות חזיר בביובנק: שיטת השקיעה להערכת נפח איברים ושיטת האוריינטטור ליצירת חתכים איזוטרופיים אקראיים. שיטות אלו משפרות את דיוק הניתוח המורפולוגי במחקר ביורפואי.

אסטרטגיות דגימה ועיבוד של דגימות רקמה Biobank של מודלים ביו חזירי

גלה סרטונים נוספים