ExCYT: ממשק משתמש גרפי עבור התייעלות ניתוח של נתוני Cytometry גבוהה-ממדי

11.4K צפיות

צוטט 9 פעמים

05:12 דק׳

16 בינואר 2019

10.3791/57473-v

16 בינואר 2019

11.4K צפיות

John-William Sidhom¹^,²^,³ , Debebe Theodros¹^,²^,⁴ , Benjamin Murter¹^,² , Jelani C. Zarif¹^,² , Sudipto Ganguly¹^,² , Drew M. Pardoll¹^,² , Alexander Baras¹^,²^,⁵

¹The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy, Johns Hopkins University School of Medicine, ²The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center, Johns Hopkins University School of Medicine, ³Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University School of Medicine, ⁴Department of Immunology, Johns Hopkins University School of Medicine, ⁵Department of Pathology, Johns Hopkins University School of Medicine

ExCYT הוא MATLAB מבוסס גרפי וממשקי משתמש (GUI) המאפשר למשתמשים לנתח את הנתונים cytometry זרימה שלהם דרך כלל המועסקים בשיטות אנליטיות עבור נתונים גבוהה-ממדי כולל הפחתת dimensionality באמצעות t-סנה, מגוון אוטומטיות וידניות קיבוץ באשכולות שיטות heatmaps, זרימה גבוהה-ממדי הרומן חלקות.