שילוב ניתוח של דנ א ב מיצוי Virion גולמי עם הניתוח של RNA של עלים נגועים לגלות הגנום וירוס חדש

11.5K צפיות

08:56 דק׳

27 ביולי 2018

10.3791/57855-v

27 ביולי 2018

11.5K צפיות

Jeanmarie Verchot¹ , Aastha Thapa² , Dulanjani Wijayasekara³ , Peter R. Hoyt⁴

¹Texas A&M Agrilife Center at Dallas, ²Noble Research Center, Oklahoma State University, ³Department of Biology, College of Engineering and Natural Sciences, The University of Tulsa, ⁴Bioinformatics and Genomics Core Facility, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Oklahoma State University

כאן אנו מציגים גישה חדשה לזיהוי וירוסים עם כפול-גדיל DNA הגנום. אנו משתמשים בשיטות הרגילות כדי לחלץ DNA ו- RNA עלים נגועים ולבצע רצף הדור הבא. כלים Bioinformatic להרכיב רצפים לתוך contigs, לזהות contigs המייצג את הגנום של וירוס והקצה הגנום לקבוצות בטקסונומיה.