Name: גידול של טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus עבור ניתוח של Post-larval פנוטיפים ואת כולה-הר אימונוהיסטוכימיה (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-12-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 42 s
Description: למדו לגדל טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus ולבצע אימונוהיסטוכימיה על דגים לאחר-השלב הלרוואלי. השיטה מאפשרת השוואת פנוטיפים בין דגי מים נגררים ומערות וחקר מנגנוני הסתגלות אבולוציוניים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מכוני הבריאות הלאומיים [HD089934, DK108495].

ההליכים המתוארים בכל פרוטוקול זה אושרו על ידי טיפול בעלי חיים מוסדיים ועל שימוש הוועדה (IACUC) בבית הספר לרפואה בהרווארד.
1. רבייה
הערה: קיימות מספר שיטות שפורסמו כמקום לרביית15,16,17,20 יכול לשמש גם בשלב זה. לפני הרבייה, דגים למבוגרים נשמרים ב- 10:14 בהירה: כהה מחזור ב 23 ° C והאכילה גלולה דיאטה (ראה טבלה של חומרים) יומי פעם. ניתן לגדל דגים במערכת recirculating עם סינון מכני, עיקור UV. רבייה יכול להתבצע גם במיכלים (ללא צואה) סטטי, אבל דגים לא אמורים להישאר בטנק סטטי במשך יותר מ 3 ימים, כמו איכות המים במהירות מבזה.
<ol><li>למלא מיכל גל 5 במים דגים-מוכנות (dechlorinated מים התרגלו: pH = 7.1 + /-2, מוליכות = 900 + /-150 Μs, טמפרטורה = 23 ° C).</li>
	<li>במקום פלסטיק רשת שינוי (ראה חומרים) בחלק התחתון של הטנק. אם לגידול במיכלים סטטי, מוספית דוד לצד של הטנק. אם גידול במערכת recirculating, מקום דוד הניקוז במערכת. הערה: רשת פלסטיק מונע מבוגרים לצרוך ביצים.</li>
	<li>מקום אחד נקבה, זכר שני mexicanus א דגים של יותר מ בן שנה לתוך הטנק. לאפשר את הדגים להסתגלות למשך 30 דקות.</li>
	<li>הגדר את הטמפרטורה של החימום 24 ° C (או 1 מעלות חם יותר מאשר הטמפרטורה ההתחלתי).</li>
	<li>לאחר 24 שעות, מעלה את הטמפרטורה על ידי 1 ° C.</li>
	<li>לאחר 24 שעות, מעלה את הטמפרטורה על ידי 1 ° C. בדוק את הטנקים מדי יום עבור הביצים על ידי זוהר פנס לתוך החלק התחתון של הטנק. מסתיר את הדגים ממזון בתקופה זו 3 ימים.</li>
	<li>אם ההשרצה יש לא נגרמו לאחר 3 ימים, לכבות את התנור ומאפשרים למים לחזור לטמפרטורת החדר (RT) לפני העברת הדגים מיכל המקורי שלהם.</li>
</ol>2. הבקיעה מופרית ביצים
<ol><li>ברגע ביצים מזוהים בתוך מיכל רבייה, להסיר את המבוגרים ואת רשת פלסטיק, ולהפחית את המים עד לעומק של 10 ס מ באמצעות כוס כימית או גביע. הערה: כדי להעריך זמן ההשרצה, השתמש פיפטה של העברת למקם כמה ביצים לתוך צלחת פטרי, להציג אותם עם stereomicroscope כדי לקבוע את שלב14 ולהעריך את הזמן של הפריה.</li>
	<li>להזיז את הטנק על משטח עבודה נוח, להסיר את כל הביצים אטום או צואה, להשאיר רק את הביצים שקופה, פורייה במיכל. הערה: ניתן לרשום את מספר הביצים פורייה בשלב זה.</li>
	<li>מילוי מיכל מוכן-דגים מים (ראה שלב 1.1) ולהוסיף 6-7 טיפות של מתילן כחול למיכל כמו המים ממלאים. הערה: הריכוז הסופי של מתילן כחול הוא כ 1.5 ppm.</li>
	<li>להוסיף חימום ו bubbler אקווריום (מחובר משאבת אוויר, עם הרגולטור) למיכל.</li>
	<li>הגדר את החימום 24 ° C ולהתאים את הרגולטור זרימת אוויר כדי לייצר זרם עדין של בועות.</li>
	<li>במקום כיסוי על הטנק כדי לסייע בשמירה על טמפרטורת המים. הערה: הביצים כדאי להתחיל הבקיעה בתוך 24 שעות מהזמן ההשרצה.</li>
</ol>3. העברה של הזחלים המקווקו כדי משתלה מכולות
<ol><li>הוסף 20 גרם מלח (ראה חומרים) 8 L של דגים-מוכנות מים (ראה שלב 1.1) ומערבבים עד התפרקה. מילוי לכל מכולה משתלה 1.5 ליטר (ראה חומרים) עם 1 ליטר של המים מוכנים.</li>
	<li>השתמש פיפטה של העברה כדי להזיז הזחלים המקווקו לתוך מיכלים משתלה מוכן-צפיפות של 20 דגים לכל מיכל. הערה: מפנס קדמי יכול להיות שימושי לאתר ולהעביר את הזחלים המקווקו.</li>
	<li>לאחר כל הזחלים המקווקו גלוי הוסרו, להתסיס את המים במיכל זע, ו/או לנשוף סילוני מים לתוך בקצוות ובפינות של מיכל פיפטה. הערה: פעולה זו תסייע לחשוף את הזחלים הוחמצו על המעבר הראשון.</li>
	<li>תשליך הזחלים שאינו בשימוש בשלב זה באמצעות ההנחיות של המשרד של מעבדה רווחה (OLAW). להוסיף טנק כדי להשיג ריכוז סופי של 6.15% נתרן תת-כלורי. חכה לפחות 5 דקות לפני לשפוך לכיור.</li>
	<li>תווית לכל מכולה משתלה עם התאריך והשעה של הפריה. הצג את חדר הילדים מכולות מדי יום ולהמשיך להסיר כל הזחלים מת.</li>
</ol>4. הכנת מזון לדגים מבוסס-Rotifer
<ol><li>לקבלת מידע על קבלת rotifers, ראה טבלה של חומרים . לפי התקנון המופנה כדי להגדיר, לשמור על הקציר rotifers22.</li>
	<li>הכנת דגים מזון על ידי הוספת 3 מ"ל של אצות תערובת (ראה טבלה של חומרים) עד 1 ליטר של rotifers שנקטפו. תערובת זו תתווסף ישירות אל המכולות משתלה בתור אספקת מזון.</li>
</ol>5. האכלה של דגים פוסט-זחל
<ol><li>כאשר הדג 5 ימים פוסט הפריה (dpf), להוסיף 3 מ ל מזון דגים (להכין בשלב 4.2) לכל מכולה משתלה. -צפיפות אופטימלית, rotifers צריך להיות גלוי בקבוצות צפופות בפינות של המכולות משתלה, פחות נראית לעין במרכז של הגורם המכיל. מוסיפים את תערובת rotifer נוספים עד הגיעה הצפיפות המתאים.</li>
	<li>בדוק את המכולות מדי יום לנוכחות של rotifers, להוסיף עוד אם הריכוז מקבל דלה. המשך להסיר כל הזחלים מת.</li>
	<li>כאשר הדגים מגיעים 14 dpf, להעביר אותם למיכל מתאים עם מערכת recirculating-צפיפות של 5 דגים/לליטר מים. הערה: ניתן לרשום מספר ששרדו דגים שלאחר הזחל בשלב זה.</li>
</ol>6. כולה-הר אימונוהיסטוכימיה של דגים פוסט-זחל
<ol><li>הסר דגים פוסט-זחל של השלב הרצוי ממזון במשך 24 שעות ביממה על ידי מזיגת המכולה משתלה המכיל את הדגים דרך ניילון mesh מסננת והצבת את מסננת לתוך מיכל עם מים נקיים דגים-מוכנות (ראה שלב 1.1). הערה: זה חיוני כדי להסיר את כל המזון. כמויות אוכל בבטן אפילו קטנות אוטומטי-פלורסנט, ישפיע הדבר על הדמיה.</li>
	<li>לאסוף, המתת חסד את הדגים. הערה: פרוטוקול המתת חסד צריך ההנחיות OLAW, יאושרו על-ידי שלך אכפת לי חיה המוסדית והוועדה שימוש. אנו ציינו כי tricaine לבד לא המתת חסד פוסט-זחל דגים, הדגים מתחילים לנוע בעת העברת מ tricaine כדי מקבע אם הדג לא נשמרים גם על קרח.<ol>
<li>להכין tricaine פתרון בתוך על-ידי הוספת 0.4 גר' tricaine-S 0.8 גר' סודה לשתייה 1 ליטר של מים יונים, ומניחים אותו על קרח.</li>
		<li>שופכים את המים המכיל את הדגים דרך מסננת רשת ניילון כדי לאסוף את הדגים. בעדינות להטביע את מסננת בפתרון Tricaine קר כקרח, תשאיר את זה על קרח למשך 10 דקות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לתקן את הדגים לאללה.<ol>
<li>להשתמש על פיפטה העברה עם טיפ לחתוך כדי להעביר את הדגים צינור חרוטי.</li>
		<li>הסר את הפתרון Tricaine עם פיפטה העברת והחלף מקבע. דגירה עם נדנדה. הערה: מקבע וזמן קיבוע להיקבע בהתאם הנוגדן בשימוש. 10% פורמלין (4% פורמלדהיד, ראה חומרים) בן לילה ב 4 ° C הוא הפתרון נאותה נוגדנים המופיעים בטבלה של חומרים. התראה: פורמלין הוא רעיל, דליק. ללבוש ציוד מגן אישי (כפפות, חלוק המעבדה, ומשקפת splash) וטפל בשכונה כימי. פתרונות שמכילה פורמלין צריך להיות מסולק כפסולת מסוכנת.</li>
		<li>השתמש פיפטה של העברת בזהירות להסיר את מקבע מבלי להפריע את הדגים. להוסיף 3 מ"ל של פוספט buffered תמיסת מלח-טריטון פתרון [PBS עם 0.1% טריטון (PBST), רואה חומרים] דגירה למשך 15 דקות ב RT עם נדנדה.</li>
		<li>להסיר PBST להחליף PBST טריים, דגירה במשך 15 דקות חזור על פעולה זו פעם נוספת אחת של "כביסה". הערה: ניתן לאחסן דגים ב- PBS המכיל 0.02% אזיד הנתרן ב 4 מעלות צלזיוס למשך מספר שבועות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>לבצע כל-הר immunostaining.<ol>
<li>להכין 50 מ של חסימת פתרון [PB-0.5% טריטון X, 0.2% אלבומין שור (BSA), 1% דימתיל סולפוקסיד (דימתיל סולפוקסיד), אזיד הנתרן 0.02%, 5% חמור סרום]. התראה: אזיד הנתרן, דימתיל סולפוקסיד רעילים. ציוד מגן אישי (כפפות, חלוק המעבדה, ומשקפת splash) אמור לשמש בעת הטיפול. כל פתרון צריך להיות מסולק כפסולת מסוכנת.</li>
		<li>להשתמש על פיפטה העברה כדי להעביר את הדגים בקבוקון זכוכית 4 מ עם מכסה מתברג. השתמש פיפטה של העברה כדי להסיר את PBST ולהוסיף 3 מ"ל חסימת פתרון. תקופת דגירה של 1 h RT עם נדנדה.</li>
		<li>השתמש פיפטה של העברה כדי להסיר הפתרון חסימה ולהוסיף נוגדן ראשוני מעורבבת עם חסימת פתרון. דגירה ללילה בטמפרטורת החדר עם עצבנות. הערה: לדוגמה, להוסיף 1:250 דילול של אנטי-ההיברו/HuD עצביים נוגדנים חד שבטיים של העכבר חלבון (ראה טבלה של חומרים עבור רשימה של נוגדנים שימשו בהצלחה בא mexicanus). ערכה של דג עם נוגדן ראשוני אין הוסיף צריך להיכלל בשלב זה. נפח של נוגדן צריך להיות מספיק כדי לכסות את הדגים ולאפשר עצבנות.</li>
		<li>לשטוף את הדג 3 פעמים עם PBST כפי שמתואר בשלב 6.3.4. להחליף את PBST עם נוגדנים משניים מעורבבת עם חסימת פתרון, דגירה ללון במלון RT עם עצבנות. הערה: ריכוז נוגדן האופטימלית הראשיים והמשניים, זמן הדגירה, בטמפרטורת דגירה צריך להיקבע עבור כל נוגדן. לינה במלון RT היה יעיל עבור נוגדנים המופיעים בטבלה של חומרים.</li>
		<li>לשטוף את הדג 3 פעמים עם PBST, עם כל כביסה שנמשך 15 דקות כפי שמתואר בשלב 6.3.4.</li>
		<li>להעביר את הדגים PBS לאחסון לטווח קצר לפני שתמשיך עם לנתח, הרכבה, או חלוקתה הדג.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol><li>Carlson, B. M., Klingler, I. B., Meyer, B. J., Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+analysis+reveals+candidate+genes+for+activity+QTL+in+the+blind+Mexican+tetra%2C+Astyanax+mexicanus%5BTitle%5D)+AND+%22PeerJ%22%5BJournal%5D)">Genetic analysis reveals candidate genes for activity QTL in the blind Mexican tetra, Astyanax mexicanus.</a> PeerJ. 6, e5189(2018).</li>
<li>Chin, J. S. R., Gassant, C. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Convergence+on+reduced+stress+behavior+in+the+Mexican+blind+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Convergence on reduced stress behavior in the Mexican blind cavefish.</a> Developmental Biology. 441 (2), 319-327 (2018).</li>
<li>Lloyd, E., Olive, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+shift+towards+lateral+line+dependent+prey+capture+behavior+in+the+blind+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary shift towards lateral line dependent prey capture behavior in the blind Mexican cavefish.</a> Developmental Biology. 441 (2), 328-337 (2018).</li>
<li>Tabin, J. A., Aspiras, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Temperature+preference+of+cave+and+surface+populations+of+Astyanax+mexicanus%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Temperature preference of cave and surface populations of Astyanax mexicanus.</a> Developmental Biology. 441 (2), 338-344 (2018).</li>
<li>Xiong, S., Krishnan, J., Peuß, R., Rohner, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Early+adipogenesis+contributes+to+excess+fat+accumulation+in+cave+populations+of+Astyanax+mexicanus%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Early adipogenesis contributes to excess fat accumulation in cave populations of Astyanax mexicanus.</a> Developmental Biology. 441 (2), 297-304 (2018).</li>
<li>Riddle, M. R., Aspiras, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insulin+resistance+in+cavefish+as+an+adaptation+to+a+nutrient-limited+environment%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Insulin resistance in cavefish as an adaptation to a nutrient-limited environment.</a> Nature. 555 (7698), 647-651 (2018).</li>
<li>Moran, D., Softley, R., Warrant, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eyeless+Mexican+cavefish+save+energy+by+eliminating+the+circadian+rhythm+in+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Eyeless Mexican cavefish save energy by eliminating the circadian rhythm in metabolism.</a> PloS One. 9 (9), e107877(2014).</li>
<li>Aspiras, A. C., Rohner, N., Martineau, B., Borowsky, R. L., Tabin, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9668-9673 (2015).</li>
<li>Tang, J. L. Y., Guo, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+developmental+origin+of+heart+size+and+shape+differences+in+Astyanax+mexicanus+populations%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">The developmental origin of heart size and shape differences in Astyanax mexicanus populations.</a> Developmental Biology. 441 (2), 272-284 (2018).</li>
<li>Riddle, M. R., Boesmans, W., Caballero, O., Kazwiny, Y., Tabin, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphogenesis+and+motility+of+the+Astyanax+mexicanus+gastrointestinal+tract%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Morphogenesis and motility of the Astyanax mexicanus gastrointestinal tract.</a> Developmental Biology. 441 (2), 285-296 (2018).</li>
<li>Gore, A. V., Tomins, K. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+epigenetic+mechanism+for+cavefish+eye+degeneration%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Ecology+%26+Evolution%22%5BJournal%5D)">An epigenetic mechanism for cavefish eye degeneration.</a> Nature Ecology & Evolution. 2 (7), 1155-1160 (2018).</li>
<li>McGaugh, S. E., Gross, J. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+cavefish+genome+reveals+candidate+genes+for+eye+loss%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">The cavefish genome reveals candidate genes for eye loss.</a> Nature Communications. 5, (2014).</li>
<li>Gross, J. B., Furterer, A., Carlson, B. M., Stahl, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+Integrated+Transcriptome-Wide+Analysis+of+Cave+and+Surface+Dwelling+Astyanax+mexicanus%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">An Integrated Transcriptome-Wide Analysis of Cave and Surface Dwelling Astyanax mexicanus.</a> PLoS One. 8 (2), e55659(2013).</li>
<li>Hinaux, H., Pottin, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pach%C3%B3n+Cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pachón Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li>
<li>Borowsky, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breeding+Astyanax+mexicanus+through+natural+spawning%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">Breeding Astyanax mexicanus through natural spawning.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 3 (11), (2008).</li>
<li>Borowsky, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Handling+Astyanax+mexicanus+Eggs+and+Fry%5BTitle%5D)+AND+%22CSH+Protocols%22%5BJournal%5D)">Handling Astyanax mexicanus Eggs and Fry.</a> CSH Protocols. , (2008).</li>
<li>Stahl, B. A., Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Comparative+Transcriptomic+Analysis+of+Development+in+Two+Astyanax+Cavefish+Populations%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Zoology+Part+B%3A+Molecular+and+Developmental+Evolution%22%5BJournal%5D)">A Comparative Transcriptomic Analysis of Development in Two Astyanax Cavefish Populations.</a> Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution. 328 (6), 515-532 (2017).</li>
<li>Elipot, Y., Legendre, L., Père, S., Sohm, F., Rétaux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Astyanax+Transgenesis+and+Husbandry%5BTitle%5D)+AND+%22How+Cavefish+Enters+the+Laboratory.+Zebrafish%22%5BJournal%5D)">Astyanax Transgenesis and Husbandry.</a> How Cavefish Enters the Laboratory. Zebrafish. 11 (4), 291-299 (2014).</li>
<li>Ma, L., Jeffery, W. R., Essner, J. J., Kowalko, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome+editing+using+TALENs+in+blind+Mexican+Cavefish%2C+Astyanax+mexicanus%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Genome editing using TALENs in blind Mexican Cavefish, Astyanax mexicanus.</a> PloS One. 10 (3), e0119370(2015).</li>
<li>JoVE. Current methods in Astyanax mexicanus research. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://www.jove.com/methods-collections/16/current-methods-inastyanax-mexicanusresearch">https://www.jove.com/methods-collections/16/current-methods-inastyanax-mexicanusresearch</a> (2018).</li>
<li>Heanue, T. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Novel+Zebrafish+ret+Heterozygous+Model+of+Hirschsprung+Disease+Identifies+a+Functional+Role+for+mapk10+as+a+Modifier+of+Enteric+Nervous+System+Phenotype+Severity%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genetics%22%5BJournal%5D)">A Novel Zebrafish ret Heterozygous Model of Hirschsprung Disease Identifies a Functional Role for mapk10 as a Modifier of Enteric Nervous System Phenotype Severity.</a> PLoS Genetics. 12 (11), (2016).</li>
<li>Reed Mariculture Culturing Rotifers in Small Systems (Home or Lab). , Available from:
 <a target="_blank" href="http://reedmariculture.com/support_rotifers_culturing.php">http://reedmariculture.com/support_rotifers_culturing.php</a> (2018).</li>
<li>Riddle, M. R., Baxter, B. K., Avery, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+identification+of+microorganisms+associated+with+the+brine+shrimp+Artemia+franciscana%5BTitle%5D)+AND+%22Aquatic+Biosystems%22%5BJournal%5D)">Molecular identification of microorganisms associated with the brine shrimp Artemia franciscana.</a> Aquatic Biosystems. 9 (1), (2013).</li>
<li>Tsang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breeding+Zebrafish%3A+A+Review+of+Different+Methods+and+a+Discussion+on+Standardization%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">Breeding Zebrafish: A Review of Different Methods and a Discussion on Standardization.</a> Zebrafish. 14 (6), 561-573 (2017).</li>
<li>Cave fish assembly and gene annotation. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://useast.ensembl.org/Astyanax_mexicanus/Info/Annotation">http://useast.ensembl.org/Astyanax_mexicanus/Info/Annotation</a> (2018).</li>
</ol>

המחברים אין לחשוף.

השוואת פעילות גנים בין משטח המערה mexicanus א דורש פרמטרים סביבתיים מבוקרת בקפידה שיטות שבהן ניתן לשכפל אותו על פני מעבדות. פרוטוקול שלנו לגידול mexicanus א מספק תוכן תזונתי עקבי במהלך התפתחות הזחל פוסט. בעקבות המשטר האכלה, ג'ין פונקציה ניתן בביטחון להשוות בין אוכלוסיות באמצעות פרוטוקול אימונוהיסטוכימיה חזקים שאנו מציגים. כאן נדון את המשמעות של שיטה זו, כמו גם המגבלות, יישומים עתידיים.
כדי להשיג גידול מתאימים-צפיפות, מצאנו כי דגים פוסט-זחל יכול להיות הרים ללא צואה מים במשך שבועיים במיכלים 1.5 ליטר בדיאטה של rotifers. פרוטוקול זה יכול לשמש גם כדי לגדל דגים על מערכת recirculating; עם זאת, rotifers להתווסף מדי יום כדי לפצות על אלה לאיבוד דרך זרימה החוצה טנק. הדברים Artemia בימיו משמשים כמקור מזון, חקלאות ימית, אבל מצאנו כי שימוש rotifers יש יתרונות רבים, לרבות: צמצום מחיר, biosecurity משופרת, תזונה עקבית, איכות מים טובה יותר (ראה להלן).
ראשית, העלות שבועי במתכלים הוא 4 דולר עבור rotifers, בהשוואה ל- 14 דולר עבור Artemia. לגבי biosecurity, rotifers מגודלים במעבדה בתנאים מבוקרים, בעוד Artemia נאספים מן הטבע ובכפוף וריאציה טבעי מיקרוביאלי או פתוגן תוכן23. בנוסף, ההרכב התזונתי של הדברים Artemia הם ונחוש ולכן לא עקבי לסביבה. הדברים שפורחים את מאגרי האנרגיה שלהם לאחר הבקיעה; הם במהירות רופף ערך תזונתי כפי שהם מפתחים צריך בצורה אופטימלית להאכיל את הדגים בתוך מספר שעות. Artemia להתחיל להאכיל בבית 12 לאחר הבקיעה, המייצגים בפעם הראשונה יכול להיות תזונתית העשירו; עם זאת, בשלב זה הם הפכו להיות גדול מדי עבור 5 דגים dpf לצרוך. לשם השוואה, rotifers ניזונים באופן רציף microalgae ימית וכתוצאה מכך גבוהה מזין תוכן ללא קשר כאשר נקצרים את rotifers. Rotifers קטנים בהרבה Artmeia הדברים (160 לעומת 400 מיקרון), איתורם של הדג כדי ללכוד ולבלוע. Cavefish ודגים משטח פוסט-זחל לצרוך rotifers בכמויות דומות רומז אין הבדל העדפה או היכולת ללכוד את rotifers10.
לבסוף, Artemia הדברים מתחילים למות במים מתוקים מספר שעות אחרי שהתוודעתי. הדברים השוקולדים תרקב, הפחתת במהירות את איכות המים, אם הם לא יוסרו באופן ידני. הסרת מת Artemia היא גוזלת זמן ומסוכן עבור פוסט-זחל דגים גדולים לא הרבה יותר מאשר Artemia, ייתכן בטעות הוסר או נפגע. Rotifers ניתן לחיות ללא הגבלת זמן המכולות משתלה, לספק מזון דגים בכל עת מבלי להשפיע באופן משמעותי על איכות המים.
בזמן שימוש rotifers כמו מקור מזון יש יתרונות ניכר, כדי לשמור על האצות rotifer מניות, יש להוסיף מערכת התרבות מדי יום. אפשר להשיג עם מזין אוטומטי זה dispenses אצות נוזלי לתוך המיכל תרבות rotifer (ראה טבלה של חומרים). Rotifers חייב גם להיות שנקטפו זה כל 24-48 שעות כדי לשמור על הבריאות של התרבות. חוקרים מתרבים דגים מאוד לעיתים רחוקות (פעם בשנה, למשל), לא עוסקים ביצוע השוואות בין האוכלוסיות בשלבים שלאחר זחל עשויים להעדיף Artemia כמקור מזון, שכן יכול להיות בקע העוברים encysted בכל עת.
מומלץ מעקב אחר מספר הזחלים בקעו וכבר ששרד לעקוב אחר ההצלחה של הבקיעה וצמיחה. אם רוב של העוברים או הזחלים אמות, זה יכול להיות בגלל זיהום חיידקי או פטרייתי. מומלץ לפקח על איכות המים של המים דגים-מוכנות ולחטא את כל ציוד עם 70% אתנול. משתלת מכולות, אליו יכול לשמש מחדש לאחר הם ניקו, עיקור. כדי למזער את הסיכון של המחלה, חשוב גם כדי להסיר את כל דג מת המכולות משתלה לא להוסיף rotifers לפני 5 dpf, כאשר הדג מתחיל לאכול.
Mexicanus א הם בגרו בת כ אחד בשנה. זוהי מגבלה ליצירת הטרנסגניים mexicanus א לעומת רזבורה rerio (דג זברה) מסוגלים להתרבות בגיל 10-12 שבועות24. אימונוהיסטוכימיה (IHC) היא שיטה חלופית לחקור ביטוי גנים ולוקליזציה חלבון. הפרוטוקול המתואר כאן יכול להיות הותאם בכל שלב, המשמשים לזיהוי אנטיגנים ברקמות בכל עניין. חשוב לציין, עם זאת, כי רקמות מסוימות עשוי להיות יותר קשה לדמיין בדגים השטח בשל פיגמנטציה (מכשול לא קיים ב- unpigmented cavefish), העלולים להשפיע על הפרשנות של מחקרים השוואתיים. לטיפול בבעיה פוטנציאליים, דגים משטח פיגמנט יכול להיות מולבן לאחר קיבוע באמצעות מי חמצן 3%.
IHC מחייב קיבעון רקמות מוצלחת, חסימת ו נוגדן חדירה. שיטות עבור כל אחד משתנים בהתאם רקמת החלבון עניין. הפעם מקבע, קיבוע חייב לשמר ארכיטקטורה התא תוך שמירה על epitope אנטיגן. עבור פרוטוקול זה, אנו משתמשים מקבע cross-linking (paraformaldehyde), להשמיט מקבע denaturing (כגון מתנול או אצטון). מצאנו כי דגירה של אצטון פחתה נוגדן סיגנל סמנים עצביים והלבלב. השלב חסימה הוא חיוני כדי למנוע נוגדנים איגוד-יעד חלבונים ברקמות. שיטה זו משתמשת בשילוב של סרום רגילה (5%) BSA (0.2%) בהפתרון חסימה. הפתרון חסימה מכיל נוגדנים וחלבונים לאגד לאתרים תגובתי על חלבונים ברקמות, הולכת ופוחתת שאינם ספציפיים קשירה של נוגדנים ראשיים ומשניים.
כדי להשיג חדירה נוגדן, חייב להיות permeabilized הרקמה. זו יכולה להיות מושגת באמצעות חומרי ניקוי או ממיסים denaturing אך חייב להיות מותאם כדי לשמר את epitope אנטיגן. פרוטוקול שלנו משתמשת בשילוב של טריטון, דימתיל סולפוקסיד (דימתיל סולפוקסיד). טריטון דימתיל סולפוקסיד הינם כלולים במהלך השלבים הדגירה חסימה ו נוגדן בריכוזים של 0.5%, 1%, בהתאמה. באמצעות ריכוז הזה, הבחנו מכתימה המוח, הלבלב, המעי ו שריר, רומז שזה יעיל סביר לחדירה של כל הרקמות. דגים בגודל עשויים להשפיע גם חדירה. פרוטוקול זה לא נבדק על דגים מהערך בת 14 ימים (כ 7 מ מ אורך). כדי לפתור בעיות מכתים, מומלץ לשנות את השלבים חדירה קיבעון, חסימת ו נוגדן. חשוב גם לבחון את שימור רצף immunogen עם החלבון mexicanus א עניין באמצעות הגנום זמין25.
Mexicanus א הוא מודל מצוין לחקור האבולוציה כמו אוכלוסיות של בני אותו מין שהתפתח בסביבות שונות באופן דרמטי ניתן להשוות ישירות במעבדה. פרוטוקולי גידול רגיל, הן בתוך והן בין מעבדות, חיוניים להבנת ההבדלים הביולוגיים בין משטח דגים cavefish. המאמר שלנו מספק שיטה לבחון פיתוח ופעילות גנים בדגים פוסט-זחל נחשפים צמיחה עקבית פרמטרים.

טטרה מקסיקנית, Astyanax mexicanus, הוא בזן אחד של דגים אשר קיים נהר-דיור אוכלוסיות (משטח דגים), מספר אוכלוסיות שוכני המערה (cavefish) על המערות שהם שוכנים שם (קרי, Tinaja, מולינו, Pachón). מספר גדל והולך של חוקרים משתמש mexicanus א לחקור הבסיסים גנטי וההתפתחותי של התנהגות1,2,3,4, מטבולית5,6 7, ,8ואבולוציה מורפולוגית9,10,11. המשאבים הזמינים עבור מחקרים של mexicanus א כוללים הגנום ברצף, מוערת12; transcriptome13; התפתחותית הזמני טבלה14; שיטות כמקום לרביית15,16,17, יצירה transgenics18, ועריכה של הגנים19. הפצתו של כלים נוספים ופרוטוקולים סטנדרטיים מעודכן. נאיץ את הצמיחה של קהילת המחקר cavefish (ראה זה אוסף של שיטות20).
המטרה שלנו היא להוסיף הרפרטואר הקיים של כלים על-ידי מתן שיטה חזקה להערכת ג'ין פעילות בחיי עיר ב- פוסט-זחל mexicanus א, בצורה דומה בין מעבדות. ישנם שני אתגרים להשגת מטרה זו. ראשית, יש צורך משטרים מתוקנן עבור הבקיעה ומשפיעים לגדל את הדג בין מעבדות, כמו הבדלים בפרמטרים כגון האכלה וצפיפות גדילה, התבגרות, ובכך להשפיע על פעילות הגנים. שנית, יש צורך שיטה סטנדרטית עדיין יכולת הסתגלות עבור בחינת דפוסי פעילות הגן הדג פוסט-זחל. אנחנו בבעיות אלה כאן, קביעת תקן לשיטות גידול דגים כדי שלאחר דרגות זחל, הצגת פרוטוקול כולה-הר חזקים אימונוהיסטוכימיה (IHC) להערכת ביטוי גנים ב- mexicanus א.
תחילה נדגים כיצד מתרבים הדגים דרך טבעית ההשרצה, לזהות את הביצים. הבא לתאר הוא כיצד בוקעות הביצים (הזחלים) ומעבירים אותם אל חדר הילדים מכולות, היכן הן נשמרות על צפיפות של 20 דגים לכל מיכל למשך שבועיים ללא צואה או שינוי המים. ב- 5-ימים שלאחר ההפריה, הדג פיתחו כדי שלאחר שדרגות (יש יותר היצע החלמון), מקבלים אצות-fed Brachionus plicatilis (rotifers) כמקור מזון עשירות שאינם דורשים חידוש המלאי היומי. שיטה זו מספקת צמיחה עקבית פרמטרים עבור פיתוח זחל פוסט-זחל.
כדי להעריך תפקוד הגן, נדגים כיצד להסיר את הדגים משתלה מכולות ולבצע IHC כולה-הר. השיטה IHC המובאת מותאמת מן הפרוטוקולים פותח לשימוש עם רזבורה rerio21 , והוא יעיל לבחינת אנטיגנים ברקמות כל mexicanus א שנבדקו, לרבות המוח, המעיים, הלבלב. IHC היא חלופה מהירה יותר לייצר חיות הטרנסגניים בחינת התבטאות גנים ולוקליזציה חלבון. פרוטוקול זה יהיה שימושי עבור מחקרים שמטרתם השוואת על הפנוטיפים של דגים משטח cavefish בשלבים שלאחר זחל וגדל mexicanus א .

<table><tbody><tr><td>מתילן כחול</td><td>Kordon</td><td>B016CBHZUS</td><td>מחמם נגד פטריות</td></tr><tr><td></td><td>Finnex</td><td>4711457836017</td><td>100W דיגיטלי בקרה דוד</td></tr><tr><td>איירסטון</td><td>Lee's Aquarium & מוצרי חיות מחמד</td><td>10838125202</td> חד <td>פעמי מלח אבן אוויר אינסטנט</td></tr> מיכל <tr><td></td><td>משתלת מלח ים</td><td>51378014021</td><td>אוקיינוס</td></tr><tr><td></td><td>IPC</td><td>21545-002</td><td>40 אונקיות או 1.5 ליטר מיכלים שקופים</td></tr><tr><td>העברת פיפטה</td><td>VWR</td><td>414004-002</td><td>פיפטות נורת פלסטיק</td></tr><tr><td>מערכת תרבית קומפקטית (CCS) ערכת התחלה עם רוטיפרים Brachionus plicatilis (סוג L)</td><td>חקלאות ימית</td><td>na</td><td>מזון דגים</td></tr><tr><td>RGcomplete</td><td>APBreed</td><td>817656016572</td><td>32 oz בקבוק מזון רוטיפר</td></tr><tr><td>משאבת מינון אוטומטית ניתנת לתכנות DP-4</td><td>Jebao</td><td>DP-4</td><td>מזין אוטומטי לרוטיפרים</td></tr><tr><td>Tricane-S</td><td>Western Chemical</td><td>MS 222</td><td>הרדמת דגים</td></tr><tr><td>נתרן ביקרבונט</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5761-500G</td><td>לתמיסת טריקן</td></tr><tr><td>רשת ניילון מסננת</td><td>HIC (הרולד יבוא ושות')</td><td>735343476235</td> תמיסת פורמלין <td>בקוטר 3 אינץ'</td></tr><tr><td>, חוצץ ניטרלי, 10%</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>HT501128-4L</td><td>מאגר קיבוע</td></tr><tr><td>10X PBS</td><td>Invitrogen</td><td>AM9625</td><td>, מדלל ל-1X באמצעות מים מזוקקים</td></tr><tr><td>Triton-x 100</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T8787-250ML</td><td>חומר ניקוי</td></tr><tr><td>נתרן אזיד</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S2002-25G</td><td>אנטי בקטריאלי</td></tr><tr><td>אלבומין סרום בקר</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9647-100G</td><td>בקבוקון זכוכית מגיב חוסם</td></tr><tr><td>עם מכסה בורג 4 מ"ל</td><td>Wheaton</td><td>224742</td><td>מכתים</td></tr><tr><td>בקבוקון רשת פלסטיק למיכל גידול</td><td>Pentair</td><td>N1670</td><td>חתוך למלבן גדול ב-6 מ"מ מכל הקצוות מהמידות של תחתית מיכל הרבייה. חותכים ריבוע 6 מ"מ מכל פינה של המלבן. כופפו את שולי המסך כלפי מטה לאורך כל ארבעת הקצוות. הנח זוג מגנטים לדיסק מצופה ויניל בגודל 6 מ"מ משני צידי הרשת (למעלה ולמטה) בכל פינה. המסך צריך להיות צמוד ככל האפשר לצידי המיכל. ניתן להסיר את המסך מהמיכל בעזרת רשת דגים ממתכת.</td></tr><tr><td>מגנטים לדיסק מצופים ויניל</td><td>Kjmagnets</td><td>D84PC-AST</td><td></td></tr><tr><td>New Life Spectrum Thera-A מזון דגים גלולה</td><td>New Life</td><td>International</td><td>ומזון דגים למבוגרים. רשימת קמעונאים למוצר זה זמינה באתר החברה</td></tr><tr><td><נוגדנים חזקים></נוגדן אינסולין חזק></td><td></td><td></td><td></td></tr>חזק <tr><td>משרקן Dako</td><td></td><td>A0564</td><td>1:200</td></tr><tr><td>נוגדן גלוקגון מכבשים</td><td>Abcam</td><td>ab36215</td><td>1:200</td></tr><tr><td>נוגדן טובולין אצטילציה מעכבר</td><td>סיגמא</td><td>T6793</td><td>1:500</td></tr><tr><td>נוגדן HuD/HuC מ עכבר</td><td>Life Technologies</td><td>A-21271</td><td>1:500</td></tr><tr><td>נוגדן סינתאז תחמוצת החנקן (nNOS) מארנב</td><td>Abcam</td><td>ab106417</td><td>5&mu; g/mL</td></tr><tr><td>כולין אצטילטרנספראז (ChAT) מארנב</td><td>Abcam</td><td>ab178850</td><td>1:2000</td></tr><tr><td>סרטונין (5HT) מארנב</td><td>Immunostar</td><td>20080</td><td>1:500</td></tr></tbody></table>

גידול של טטרה מקסיקנית astyanax mexicanus עבור ניתוח של post-larval פנוטיפים ואת כולה-הר אימונוהיסטוכימיה

Raising the Mexican Tetra Astyanax mexicanus for Analysis of Post-larval Phenotypes and Whole-mount Immunohistochemistry

נהר ואוכלוסיות הותאם המערה של Astyanax mexicanus מראים הבדלים מורפולוגיה, פיזיולוגיה והתנהגות. המחקר מתמקד בהשוואת צורות למבוגרים גילה בסיס גנטי של חלק משינויים אלה. פחות ידוע על איך האוכלוסיות שונות בשלבי פוסט-זחל (עם תחילת האכלה). מחקרים כאלה עשויים לספק תובנה איך cavefish לשרוד לבגרות בסביבתם הטבעית. שיטות להשוואת התפתחות הזחל שלאחר במעבדה דורשים מתוקננת מדגה האכלה משטרים. כאן נתאר איך לגדל דגים בדיאטה של rotifers עשירות במים ללא צואה למשך עד שבועיים פוסט הפריה. נדגים כיצד לאסוף את הדגים פוסט-זחל ממערכת זו משתלה ולבצע כל-הר immunostaining. Immunostaining הוא חלופה אטרקטיבית transgene ניתוח ביטוי עבור חוקרים פיתוח ותפקוד גן ב- mexicanus א. השיטה משתלה יכול גם לשמש פרוטוקול תקני עבור הקמת תואם צפיפות אוכלוסיות לצמיחה לתוך מבוגרים.

טבלה 1 מציגה את ההצלחה במהלך שנה אחת של גידול דגים משטח, cavefish Tinaja Molino, Pachón במיכלים הרבייה סטטי. פני השטח ואת Pachón מולידה עם עוברי מופרית תמיד ייצרו בקעו הזחלים, בעוד Molino ו Tinaja החמיץ חלק מהזמן (2/6 ו- 2/18 ההשרצה אירועים לא לייצר הזחלים מקווקו, בהתאמה). יש וריאציה בתטולה אשר אינו מופיע כדי לייחס גיל של הדג האב. בטבלה 2 מציג את המספר הכולל של הזחלים המקווקו הנובע בחלק מהאירועים ההשרצה, ואת הגיל של הדג האב. באופן כללי, מצאנו כי דגים משטח לייצר מספר גדול יותר של הזחלים לכל הצאצאים (הממוצע ± ו-1,550 894, n = 5), ואחריו Pachón (הממוצע ± 879 680, n = 6), Tinaja (הממוצע ± 570 373, n = 11), ואת מולינו (הממוצע ± 386 276, n = 3). המספר של הזחלים המיוצר הוא בדרך כלל יותר נדרשים לכל ניסוי או לצמיחה לתוך מבוגרים. אנו בדרך כלל להגדיר 6-18 משתלה מכולות (120-360 הזחלים), המתת חסד הדגים הנותרים.
כדי למדוד את ההצלחה של פרוטוקול משתלה הקלטנו את המספר של הזחלים המקווקו ודגים זחל שלאחר ששרדו מאירועים ההשרצה מוצלחת. טבלה 3 מציג נתונים מ 1 חודש המעלה צואה טנקים, כולל המספר של הזחלים הועבר המכילים משתלה שרד 14 dpf. במהלך חודש זה, שיעור ההישרדות נע בין 41-81 אחוזים, וכתוצאה מכך 65-293 דגים לכל האוכלוסייה עבור ניסויים או צמיחה לתוך מבוגרים.
כדי לקבוע אם כולה-הר immunostaining היא מוצלחת, השווינו את זריחה של דגימות מודגרות עם נוגדן ראשוני לאלה מודגרות עם נוגדנים משניים בלבד. האות פלורסנט מוצגת רק בהדג מודגרות עם נוגדן ראשוני. השתמשנו פרוטוקול זה בהצלחה תווית נוירונים10 (איור 1) ובתאי הלבלב6 בשלבים עד 12.5 dpf השטח שני ואת מערת morphotypes.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/58972/58972fig1.jpg"> איור 1: תיוג נוירון. כולה-הר immunostaining של mexicanus א. תמונה של 12.5 dpf משטח דגים () Pachón cavefish (b). תמונה של אזור אמצע הגוף [חלוקה לרמות צהוב המקווקו באיור (א) ו- (ב)] של פני השטח דגים (ג) Pachón cavefish (ד) מוכתם נוגדן פאן עצבית (Hu). (e) Confocal תמונה של אזור של הנוירונים המעית מראה במעי דג משטח (Hu) והקרנות שלהם (טובולין acetylated). עבור תמונה זו, המעי היה גזור החוצה וטיפס בינוני המכיל דאפי כתם הגרעינים. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/58972/58972fig1large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
<table fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>האוכלוסייה</td>
			<td>ניסיונות</td>
			<td>ההשרצה אירועים</td>
			<td>מצמדים</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>94</td>
			<td>23</td>
			<td>23</td>
		</tr>
<tr>
<td>מולינו</td>
			<td>110</td>
			<td>6</td>
			<td>4</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>167</td>
			<td>13</td>
			<td>13</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>242</td>
			<td>18</td>
			<td>16</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 1: סיכום של נתונים שנה אחת של רבייה Mexicanus א במיכלים סטטי. מספר הרבייה ניסיונות, וכתוצאה מכך ההשרצה אירועים, מספר ההשרצה אירועים שהפיקה בקעו הזחלים.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>האוכלוסייה</td>
			<td>גיל האב</td>
			<td>הזחלים מקווקו</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>989</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>1050</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>3 שנים</td>
			<td>תודה</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>3 שנים</td>
			<td>432</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>3 שנים</td>
			<td>1768</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>4 שנים</td>
			<td>2852</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>1194</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>1933</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>1.5 שנים</td>
			<td>371</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>3 שנים</td>
			<td>480</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>4 שנים</td>
			<td>1190</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>4 שנים</td>
			<td>110</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>9 חודשים</td>
			<td>259</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>9 חודשים</td>
			<td>253</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>10 חודשים</td>
			<td>1100</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>11 חודשים</td>
			<td>857</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>713</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>853</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1 שנה</td>
			<td>542</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1.5 שנים</td>
			<td>360</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1.5 שנים</td>
			<td>58</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>1.5 שנים</td>
			<td>1100</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>4 שנים</td>
			<td>185</td>
		</tr>
<tr>
<td>מולינו</td>
			<td>2.5 שנים</td>
			<td>460</td>
		</tr>
<tr>
<td>מולינו</td>
			<td>2.5 שנים</td>
			<td>619</td>
		</tr>
<tr>
<td>מולינו</td>
			<td>3 שנים</td>
			<td>81</td>
		</tr>
</tbody></table>בטבלה 2: אומדן גיל הנשי ומספר הזחלים המקווקו מאירועים ההשרצה בודדים מתוך האוכלוסיות המצוין של א mexicanus.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>האוכלוסייה</td>
			<td>ניסיונות</td>
			<td>ההשרצה אירועים</td>
			<td>מצמדים</td>
			<td>בתטולה</td>
			<td>הזחלים הועבר משתלה כוסות</td>
			<td>דגים פוסט-זחל-14dpf</td>
			<td>הישרדות (%)</td>
		</tr>
<tr>
<td>משטח</td>
			<td>4</td>
			<td>3</td>
			<td>2</td>
			<td>576 &amp; 1728</td>
			<td>360</td>
			<td>174</td>
			<td>48</td>
		</tr>
<tr>
<td>מולינו</td>
			<td>4</td>
			<td>2</td>
			<td>1</td>
			<td>228</td>
			<td>159</td>
			<td>65</td>
			<td>41</td>
		</tr>
<tr>
<td>Tinaja</td>
			<td>4</td>
			<td>1</td>
			<td>1</td>
			<td>1952</td>
			<td>175</td>
			<td>93</td>
			<td>53</td>
		</tr>
<tr>
<td>Pachón</td>
			<td>4</td>
			<td>1</td>
			<td>1</td>
			<td>1696</td>
			<td>360</td>
			<td>293</td>
			<td>81</td>
		</tr>
</tbody></table>טבלה 3: סיכום של נתוני חודש אחד של רבייה mexicanus א צואה המערכת וכן גידול הזחלים. מספר נסיונות, וכתוצאה מכך גידול ההשרצה אירועים, מצמדים שהפיקה הזחלים מקווקו, המספר הממוצע של הזחלים תטולה, הזחלים להעביר את משתלת מכולות, ודגים פוסט-זחל נוכח המכולות משתלה לאחר 14 יום.

ב פרוטוקול זה, אנחנו מדגימים כיצד להתרבות Astyanax mexicanus מבוגרים, להעלות את הזחלים, לבצע כל-הר אימונוהיסטוכימיה על פוסט-זחל דגים כדי להשוות על הפנוטיפים של השטח, מערת morphotypes.

גידול של טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus עבור ניתוח של Post-larval פנוטיפים ואת כולה-הר אימונוהיסטוכימיה

River and cave-adapted populations of Astyanax mexicanus show differences in morphology, physiology, and behavior. Research focused on comparing adult ...

כאן אנו מדגימים כיצד להתרבות המקסיקני טטרה Astyanax מקסיקניוס, להעלות את הזחלים, ולבצע אימונוהיסטוכימיה כל הר על דגים לאחר הזחל להשוות את הפנוטיפים של נהר ומערה מותאם דגים. אנחנו מגדלים את הדגים באותה צפיפות על דיאטה עשירה בחומרים מזינים של רוטיפרים. טכניקה זו מבטיחה צמיחה עקבית ומספקת יתרונות בעלויות, אבטחה ביולוגית ואיכות מים.כדי להתחיל, מניחים רשת פלסטיק בתחתית מיכל של חמישה גלון. ואז למלא את המיכל עם מים מוכנים דגים. מדביקים דוד מים לצד המיכל.הוסף נקבה אחת ושני דגי אסטיאנקס מקסיקניוס זכרים בני יותר משנה למיכל. הגדר את הטמפרטורה של דוד המים ל 24 מעלות צלזיוס. לאחר 24 שעות, להגדיל את הטמפרטורה על ידי מעלות צלזיוס אחד.להאיר פנס לתוך החלק התחתון של המיכל כל יום כדי לבדוק ביצים. לאחר שהביצים מזוהות במיכל הרבייה, מוציאים את הדגים הבוגרים ואת רשת הפלסטיק. השתמש בבקבוק כדי להפחית את עומק המים ל 10 ס"מ.כדי להעריך את זמן ההפריה, השתמש פיפטה העברה למקם כמה ביצים לתוך צלחת פטרי ולהציג אותם עם מיקרוסקופ סטריאו כדי לקבוע את השלב שלהם. הסר ביצים אטומות או צואה. לאחר מכן ממלאים את המיכל במים מוכנים לדגים ומוסיפים למים שבע טיפות של מתילן כחול.לאחר מכן, מוסיפים תנור ובועה אקווריום למיכל. הגדר את התנור ל 24 מעלות צלזיוס ולהתאים את הרגולטור זרם האוויר כדי לייצר זרם עדין של בועות. ואז לכסות את המיכל כדי לשמור על טמפרטורת המים.מוסיפים 20 גרם מלח לשמונה ליטרים של מים מוכנים לדגים ומערבבים אותו עד שהוא מומס. לאחר מכן מוסיפים ליטר אחד של המים המוכנים לכל מיכל משתלה. לאחר מכן השתמש פיפטה העברה להעביר 20 של הזחלים בקעו לכל מיכל משתלה.להתסיס את המים במיכל הגדול יותר כדי להבטיח שכל הזחלים הוסרו. כדי להכין את מזון הדגים, מוסיפים שלושה מ"ל של תערובת אצות לליטר אחד של רוטיפרים שנקטפו. חמישה ימים לאחר ההפריה מוסיפים שלושה מ"ל של מזון דגים לכל מיכל משתלה.הרוטיפרים צריכים להיות גלויים בקבוצות צפופות בפינת המכולות אלא אם כן הם נראים ליד המרכז. בדוק את המיכל עבור rotifers כל יום ולהוסיף מזון נוסף אם הריכוז מתרוקן. הסר כל זחלים מתים.ראשית, כדי לנקות את מערכת העיכול של תוכן המזון, יוצקים את מיכל המשתלה עם הדגים של הגיל הרצוי באמצעות מסננת רשת ניילון. מניחים את מסננת לתוך מיכל עם מים מוכנים דגים נקיים לעכב מזון במשך 24 שעות. לאחר המתת חום הדגים, על פי הנחיות המוסד, להשתמש פיפטה העברה להעביר את הדגים צינור חרוט.החלף את פתרון המתת החסד בתיקון. ולהדיגר הצינור עם נדנדה לילה ב 4 מעלות צלזיוס. לאחר מכן, הסר את התיקון והחלף אותו ב- PBST.דגירה הצינור במשך 15 דקות נוספות עם נדנדה. ולחזור על תהליך הכביסה עוד פעם אחת. לאחר מכן, השתמש פיפטה העברה להעביר את הדג לבקבוקון זכוכית ארבעה מ"ל עם כובע העליון בורג.הסר את PBST מן הבקבוקון ולהוסיף שלושה מ"ל של פתרון חסימה. הדגירה את הבקבוקון בטמפרטורת החדר במשך שעה אחת עם נדנדה. לאחר מכן, השתמש פיפטה העברה כדי להסיר את פתרון החסימה ולהחליף אותו עם נוגדן ראשוני מדולל פתרון חסימה.הדגירה את הבקבוקון לילה בטמפרטורת החדר עם תסיסה. לאחר מכן, לשטוף את הדגים עם PBST שלוש פעמים, כפי שתואר קודם לכן. החלף את ה- PBST בנוגדן משני מדולל בת פתרון חסימה.ולדגר את הבקבוקון לילה בטמפרטורת החדר עם תסיסה. לבסוף, לשטוף את הדגים שלוש פעמים במשך 15 דקות עם PBST. באמצעות פרוטוקול זה, דגי פני השטח טינה, מולינו ודג מערת פצ'ון גודלו במיכלי רבייה סטטיים.פני השטח ופאחון הולידו, עם עוברים מופרים, תמיד ייצרו זחלים בקעו. בעוד מולינו ו Tinaja לא הצליחו חלק מהזמן. באופן כללי, דגי פני השטח ייצרו את המספר הגדול ביותר של זחלים לכל השרץ, ואחריו פצ'ון, טינז'ה ומולינו בהתאמה.טכניקת הכשל החיסונים כולה שימשה בהצלחה לתיוג נוירונים ותאי לבלב בשלבים של עד 12.5 ימים לאחר ההפריה. חשוב להסיר כל דג מת כשאתה מרים את הזחלים ולרשום את מספר הדגים ששרדו. אם דגים רבים מתים זה יכול להיות בגלל זיהום חיידקי או פטרייתי.יש לערפל את הטנקים עם 70% אתנול לפני השימוש. טכניקת כשל חיסוני שתיארנו שימשה בהצלחה עבור הנוגדנים המפורטים בטבלת החומרים. לאחר immunostaining, דגים יכולים להיות כל רכוב או חתך כדי להציג כל רקמה מעניינת.בשילוב, הליך הרבייה, הבקיעה והכשלה חיסונית מספק שיטה איתנה להערכת פעילות הגנים NC2 באופן דומה בין מעבדות.

raising-mexican-tetra-astyanax-mexicanus-for-analysis-post-larval

Research

JoVE Journal

Genetics

גנטיקה

ג'ין-מיקוד mutagenesis ניתן כיום במגוון רחב של אורגניזמים באמצעות טכניקות עריכה הגנום. הנה, אנחנו מדגימים פרוטוקול mutagenesis גן ממוקד באמצעות מפעיל שעתוק כמו nucleases המפעיל (TALENs) ב Astyanax mexicanus, זן של דגים הכולל דגי שטח cavefish.

הגנום עריכה<em&gt; Astyanax mexicanus</em&gt; שימוש תמלול Activator דמוי מפעיל nucleases (TALENs)

הדמית morphogenesis של עוברי חרק עם מיקרוסקופ פלואורסצנטי מבוסס אור גיליון הפכה מדינה של האמנות. פרוטוקול זה מתאר ומשווה שלוש טכניקות הרכבה מתאימות עובר Tribolium castaneum, מציג שני קווים מהונדסים רומן מחוייט גם מתאים הדמיה חיה, דן בקרות איכות חיוניות ומציין מגבלות ניסוי נוכחיות.

גיליון מבוסס אור מיקרוסקופ פלואורסצנטי של חיים או קבוע מוכתמת<em&gt; Tribolium castaneum</em&gt; עובר

Immunolabeling שיטות כדי לנתח אוכלוסיות נפרדות של microtubules במוח דג זברה המתפתח מתוארים כאן, אשר חלים באופן נרחב לרקמות אחרות. הפרוטוקול הראשון מתאר שיטה ממוטב עבור immunolabeling microtubules יציבה ודינמית. פרוטוקול השני מספק שיטה כדי התמונה ולכמת nascent microtubules במיוחד.

השימוש Immunolabeling כדי לנתח Microtubules יציב, דינמי, המתהווה של העובר דג זברה

אנו מתארים גישות על המניפולציה של גנים במערכת המודל האבולוציוני Astyanax mexicanus. שלוש טכניקות שונות מתוארים: בתיווך Tol2 transgenesis, יישוב מניפולציה של הגנום באמצעות CRISPR/Cas9, ואת נוקאאוט של הביטוי תוך שימוש morpholinos. כלים אלה צריך לאפשר חקירה ישירה של גנים שבבסיס וריאציית בין פני השטח - ואת מערת המגורים טפסים.

מניפולציה של פונקציית ג'ין Cavefish מקסיקני

כאן, אנו מציגים שיטות למחקר תפוקה גבוהה של סדרת cavefish מקסיקני התנהגויות, צביעת חיוני של מערכת mechanosensory. שיטות אלה להשתמש בקבצי script התוכנה-החופשית, מחוייט, מתן שיטה מעשית וחסכונית עבור המחקרים של התנהגויות.

מעקב אחר התנהגות והדימות Neuromast של Cavefish מקסיקני

פרוטוקול זה מאפשר הדמיה של ביטוי גנים בעובריים Astyanax cavefish. גישה זו פותחה במטרה למקסם את אות של ביטוי גנים, תוך מזעור צביעת הרקע לא ספציפית.

Wholemount ב באתרו הכלאה עבור עוברי Astyanax

הפריה חוץ גופית היא טכניקה בשימוש נפוץ עם מגוון רחב של אורגניזמים מודל לשמור על אוכלוסיות מעבדה לייצר עוברים מסונכרנים עבור יישומים במורד הזרם. כאן, אנו מציגים פרוטוקול המיישם טכניקה זו עבור אוכלוסיות שונות של הדגים טטרה מקסיקני, Astyanaxמקסיקני.

אוסף המשחק ו הפריה חוץ גופית של Astyanax מקסיאנוס

מאמר זה מתאר את תנאי המעבדה הבסיסיים ואת הפרוטוקולים למשטר טמפרטורה מצטבר כדי לעורר השרצה מקסימלית במקסיקו tetra Astyanax mexicanus, שהוא מודל מתפתח למחקרים התפתחותיים ואבולוציוניים.

שינויי טמפרטורה מצטברים לרבייה מקסימלית והשריצה באסטיאנקס מקסיקו

הפרוטוקול הנוכחי מתאר את שיטת הגידול של חרקים מזיקים טורטריים במעבדות. ההליכים להבחנה בין מין החרקים ולמיצוי חומצות גרעין לריצוף בתפוקה גבוהה נקבעים באמצעות שני מזיקים מומנטיים.

גידול המוני ומחקרים מולקולריים בחרקים מזיקים בטורטריים

כאן אנו מציגים פרוטוקול המאפשר אפיון פונקציונלי של תפוקה בינונית עד גבוהה של מבני גנים ומקדם ברקמת גזע משנית של עץ במסגרות זמן קצרות יחסית. הוא יעיל, קל לשימוש וישים באופן נרחב למגוון מיני עצים.

השימוש בניתוח מגזר סומטיים מושרה (ISSA) לימוד גנים ומקדמי המעורבים ביצירת עץ ופיתוח גזע משניים

למדו לגדל טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus ולבצע אימונוהיסטוכימיה על דגים לאחר-השלב הלרוואלי. השיטה מאפשרת השוואת פנוטיפים בין דגי מים נגררים ומערות וחקר מנגנוני הסתגלות אבולוציוניים.

גידול של טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus עבור ניתוח של Post-larval פנוטיפים ואת כולה-הר אימונוהיסטוכימיה

גלה סרטונים נוספים