Name: מעקב אחר התנהגות והדימות Neuromast של Cavefish מקסיקני (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-04-06T14:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 58 s
Description: למד שיטות לניתוח התנהגות ודימות מערכת החישה המכנית בדגי מערות מקסיקניים. גישה זו מציעה פתרון יעיל וחסכוני למחקרים התפתחותיים וביו-רפואיים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

אנו מודים לכל חברי המעבדה יושיזאווה כולל Cetraro ש ש סיימון, ג ולדז, ג Macapac, ג'יי צ'וי, ל' Lu, ג'יי נגוין, ס פודהורצר, ה Hernandes, פונג ג'יי, ג'יי קאטו, אני לורד לטיפול דגים על הדגים נסיוני בשימוש כתב היד הזה. אנו מודים גם חברי המעבדה קין א כולל עמ' Masek לאמן שלי להרכיב מצלמת IR CCD. לבסוף, ברצוננו להודות את מעבדת המדיה - המכללה למדעי החברה - בית הספר לתקשורת האוניברסיטה של hawai ' i Mānoa על עזרתם לא בפז עם ביצוע הווידאו, סמית ב', ג' לאם ולבן ס במיוחד. עבודה זו נתמכה על ידי קרן קהילתית הוואי (16CON-78919 ו- 18CON-90818), המכון הלאומי של הבריאות NIGMS (P20GM125508) מעניק שלי.

<ol><li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aKeene%2C+AC+%22Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish.+Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish%22">Biology and Evolution of the Mexican Cavefish. Biology and Evolution of the Mexican Cavefish</a>. , Elsevier Inc. Amsterdam. (2015).</li>
<li>Mitchell, R. W., Russell, W. H., Elliott, W. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMitchell%2C+RW+%22Mexican+eyeless+characin+fishes%2C+genus+Astyanax%3A+Environment%2C+distribution%2C+and+evolution.Special+publications+the+museum+Texas+Tech+University%22">Mexican eyeless characin fishes, genus Astyanax: Environment, distribution, and evolution.Special publications the museum Texas Tech University</a>. (12), Texas Tech Press. Texas. (1977).</li>
<li>Wilkens, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+and+genetics+of+epigean+and+cave+Astyanax-fasciatus+%28Characidae%2C+Pisces%29+-+Support+for+the+neutral+mutation+theory%5BTitle%5D)+AND+%22Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution and genetics of epigean and cave Astyanax-fasciatus (Characidae, Pisces) - Support for the neutral mutation theory.</a> Evolutionary Biology. 23, 271-367 (1988).</li>
<li>Fumey, J., Hinaux, H., Noirot, C., Thermes, C., Rétaux, S., Casane, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+late+Pleistocene+origin+of+Astyanax+mexicanus+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">Evidence for late Pleistocene origin of Astyanax mexicanus cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 18 (1), 1-19 (2018).</li>
<li>Yoshizawa, M., Gorički, S., Soares, D., Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+a+behavioral+shift+mediated+by+superficial+neuromasts+helps+cavefish+find+food+in+darkness%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution of a behavioral shift mediated by superficial neuromasts helps cavefish find food in darkness.</a> Current Biology. 20 (18), 1631-1636 (2010).</li>
<li>Moran, D., Softley, R., Warrant, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eyeless+Mexican+cavefish+save+energy+by+eliminating+the+circadian+rhythm+in+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Eyeless Mexican cavefish save energy by eliminating the circadian rhythm in metabolism.</a> PloS One. 9 (9), e107877(2014).</li>
<li>Moran, D., Softley, R., Warrant, E. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+energetic+cost+of+vision+and+the+evolution+of+eyeless+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Science+Advances%22%5BJournal%5D)">The energetic cost of vision and the evolution of eyeless Mexican cavefish.</a> Science Advances. 1 (8), e1500363(2015).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Evolution+of+a+Series+of+Behavioral+Traits+is+associated+with+Autism-Risk+Genes+in+Cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">The Evolution of a Series of Behavioral Traits is associated with Autism-Risk Genes in Cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 18 (1), 89(2018).</li>
<li>Riddle, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insulin+resistance+in+cavefish+as+an+adaptation+to+a+nutrient-limited+environment%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Insulin resistance in cavefish as an adaptation to a nutrient-limited environment.</a> Nature. 555 (7698), 647-651 (2018).</li>
<li>Protas, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+analysis+of+cavefish+reveals+molecular+convergence+in+the+evolution+of+albinism%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Genetics%22%5BJournal%5D)">Genetic analysis of cavefish reveals molecular convergence in the evolution of albinism.</a> Nature Genetics. 38 (1), 107-111 (2006).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13 (1), 15(2015).</li>
<li>Duboué, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21 (8), 671-676 (2011).</li>
<li>Fernandes, V. F. L., Macaspac, C., Lu, L., Yoshizawa, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+the+developmental+plasticity+and+a+coupling+between+left+mechanosensory+neuromasts+and+an+adaptive+foraging+behavior%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolution of the developmental plasticity and a coupling between left mechanosensory neuromasts and an adaptive foraging behavior.</a> Developmental Biology. 441 (2), 262-271 (2018).</li>
<li>Pérez-Escudero, A., Vicente-Page, J., Hinz, R. C., Arganda, S., de Polavieja, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((idTracker%3A+tracking+individuals+in+a+group+by+automatic+identification+of+unmarked+animals%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">idTracker: tracking individuals in a group by automatic identification of unmarked animals.</a> Nature Methods. 11, 743(2014).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li>
<li>Yoshizawa, M., Jeffery, W. R., Van Netten, S. M., McHenry, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+sensitivity+of+lateral+line+receptors+and+their+role+in+the+behavior+of+Mexican+blind+cavefish+%28Astyanax+mexicanus%29%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The sensitivity of lateral line receptors and their role in the behavior of Mexican blind cavefish (Astyanax mexicanus).</a> Journal of Experimental Biology. 217 (6), (2014).</li>
<li>Lee, A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLee%2C+A+%22Virtualdub%22">Virtualdub</a>. , http://www.virtualdub.org/ (2014).</li>
<li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NIH+Image+to+ImageJ%3A+25+years+of+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nature Methods. 9 (7), 671-675 (2012).</li>
<li>Cavallari, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+blind+circadian+clock+in+cavefish+reveals+that+opsins+mediate+peripheral+clock+photoreception%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">A blind circadian clock in cavefish reveals that opsins mediate peripheral clock photoreception.</a> PLoS Biology. 9 (9), e1001142(2011).</li>
<li>Swimmer, B., Lang, H. H. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSwimmer%2C+B+%22Surface+Wave+Discrimination+between+Prey+and+Nonprey+by+the+Back+Swimmer+Notonecta+glauca+L.+%28Hemiptera+%2C+Heteroptera+%29%22">Surface Wave Discrimination between Prey and Nonprey by the Back Swimmer Notonecta glauca L. (Hemiptera , Heteroptera )</a>. 6 (3), Springer Stable. https://www.jstor.org/stable/4599284 233-246 (1980).</li>
<li>Montgomery, J. C., Macdonald, J. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMontgomery%2C+JC+%22Sensory+Tuning+of+Lateral+Line+Receptors+in+Antarctic+Fish+to+the+Movements+of+Planktonic+Prey%22">Sensory Tuning of Lateral Line Receptors in Antarctic Fish to the Movements of Planktonic Prey</a>. 235 (4785), American Association for the Advancement of Science Stable. https://www.jstor.org/stable/1698962 195-196 (1987).</li>
<li>Prober, D. A., Rihel, J., Onah, A. A., Sung, R. J., Schier, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hypocretin%2Forexin+overexpression+induces+an+insomnia-like+phenotype+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">Hypocretin/orexin overexpression induces an insomnia-like phenotype in zebrafish.</a> The Journal of Neuroscience. 26 (51), 13400-13410 (2006).</li>
<li>Zhdanova, I. V., Wang, S. Y., Leclair, O. U., Danilova, N. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melatonin+promotes+sleep-like+state+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Research%22%5BJournal%5D)">Melatonin promotes sleep-like state in zebrafish.</a> Brain Research. 903 (1-2), 263-268 (2001).</li>
<li>Nussbaum-Krammer, C. I., Neto, M. F., Brielmann, R. M., Pedersen, J. S., Morimoto, R. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Investigating+the+Spreading+and+Toxicity+of+Prion-like+Proteins+Using+the+Metazoan+Model+Organism+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Investigating the Spreading and Toxicity of Prion-like Proteins Using the Metazoan Model Organism C. elegans.</a> Journal of Visualized Experiments. (95), e52321(2015).</li>
<li>Rasband, W. S. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRasband%2C+WS+%22Object+Tracker%22">Object Tracker</a>. , https://imagej.nih.gov/ij/plugins/tracker.html (2000).</li>
<li>Ferreira, T., Rasband, W. Create Shortcuts. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aFerreira%2C+T+%22ImageJ+User+Guide%22">ImageJ User Guide</a>. , https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-31.html#sub:Create-Shortcuts... (2012).</li>
<li>Lochmatter, T., Roduit, P., Cianci, C., Correll, N., Jacot, J., Martinoli, A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLochmatter%2C+T+%22SwisTrack%22">SwisTrack</a>. , https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack (2008).</li>
</ol>

המחברים אין לחשוף.

שיטות אלה שהוצגו קל לגישה אבל יכול להיות מסובך לביצוע בשל אופיו של מקורותיה freeware. לכן, מומלץ מאוד לבצע מבחני ניסיון וניתוחים לפני כל ניסויים בפועל.
קצב נתונים הדור יכול להיות מהירה ברגע הוקם במסגרת ניסיוני אנליטיים. הוקמה לאחר, זה אפשרי להקליט שני דגים ב- 7 דקות לקבלת VAB וזמינותו, דגים 30 ב- 24 שעות ביממה עבור פעילות/שינה וזמינותו של דג אחד 2.5 עד 3 דקות עבור neuromast הדמיה, החל מ- MS222 הרדמה לכידת התמונה הסופית. משך הזמן של הניתוחים וידאו ותמונה יכול להשתנות במידה ניכרת בהתאם הביצועים ...

טטרה מקסיקנית, Astyanax mexicanus (Teleostei: Characidae), מיוחד בין הדגים שיש שני morphs אלטרנטיביות שונות באופן קיצוני - מורף רואי, השטח-המגורים ואת מורף עיוורת, שוכני המערה מורכבת מכמה ברורים אוכלוסיות1. למרות שונה מורפולוגיה ופיזיולוגיה, הם עדיין interfertile2,3. אלה morphs interfertile להופיע התפתחו במהירות (~ 20,000 שנים)4, מה שהופך אותם מערכת מודל אידיאלי לחקר הסתגלותם המהירה. Cavefish ידועים חבילה של תכונות מורפולוגיים והתנהגותיים מתבדרת כולל צפיפות מוגברת של בלוטות הטעם, עלייה במספר mechanosensors, הרעיה התנהגות מכוון לתדר מסוים של גירוי רוטטת, היפראקטיביות, ו נדודי שינה. רבים של התנהגויות אלו ככל הנראה התפתח בו זמנית, אשר חלקם שהוצעו להיות יתרון בחשכת מערות שיחור מזון5 ושימור אנרגיה בסביבות כהה, מזון-דליל6,7.
במערכות רבות של המודל האבולוציוני, קשה לרכוש ידע משולב על שינוי התנהגות ומורפולוגיה כמה בעלי חיים בתגובה הסביבה כי רוב המינים מופצים מעבר הדרגתי מתמשך בסביבות מורכבות. עם זאת, הניגוד סטארק בין המערה של השטח מורף Astyanax שהתפתחו ב מאוד מנוגדים סביבות המותווית על ידי אקוטון חדה הובילה Astyanax המתעוררים כמודל מעולה כדי להבין את התפתחות בעלי חיים. הדבר מאפשר לקשר בקלות רבה יותר גנים ותהליכים התפתחותיים עם תכונות הסתגלות ומבחר בסביבה. יתר על כן, חקירות ביו האחרונים של תכונות אלה ב- Astyanax הראו כי התכונות הללו עשויים מקבילי הסימפטומים האנושי8,9,10. לדוגמה, הפסד של sociality ושינה, ורווח של קשב, התנהגות שחוזרת על עצמה, רמת הקורטיזול דומים מה נצפית בבני אדם עם הפרעת ספקטרום אוטיזם8.
כדי לטפל ההתפתחות שיתוף מורכבים של התנהגויות רבות תכונות מורפולוגיות, זה יתרון assay רבים מהם כדי לסמן מסלולים גנטית ומולקולרית המשמש כבסיס. שהוצגו במסמך זה הן שיטות אפיון מידת פנוטיפים התנהגותיים המערה-סוג של משטח המערה, היברידית morphs של Astyanax. ההתנהגויות מוקד ניתח לאפיין פנוטיפ הם למערה הותאם הרעיה התנהגות (רטט משיכה, המכונה מעתה ואילך VAB), היפראקטיביות/שינה משך11,12. הציג גם היא שיטת הדמיה של מערכת החישה המשויך VAB13. לאחרונה, תוכנת קוד פתוח מעקב רבים עבור הפעלת מבחני התנהגות הפכו זמינים14,15. אלה עובדים טוב מאוד עבור קטעי וידאו קצרים, פחות מ 10 דקות. עם זאת, הוא הופך להיות בעייתי אם הוידאו ארוך בגלל זמן חישוב/מעקב אינטנסיבי. תוכנה זמינים מסחרית מסוגל יכול להיות יקר. השיטות הציג בעיקר השתמש freeware, ולכן נחשבים חסכוניים ושיטות תפוקה גבוהה. נכללים גם התוצאות נציג מבוססים על שיטות אלה.

<table><tbody><tr><td>4-Di-1-ASP (4-(4-(dimethylaminostyryl)-1-methylpyridinium iodide)</td><td>MilliporeSigma</td><td>D3418</td><td></td></tr><tr><td>880 nm אורך גל אור שחור</td><td>תאורה מתקדמת</td><td>BL41192-880</td><td></td></tr><tr><td>avfs</td><td>freeware</td><td>גרסה 1.0.0.6</td><td>http://turtlewar.org/avfs/</td></tr> <tr><td>Avisynth</td><td>freeware</td><td>גרסה 2.6.0</td><td>http://avisynth.nl/index.php/Main_Page</td></tr><tr><td>Cygwin</td><td>freeware</td><td>גרסה 2.11.0</td><td>https://www.cygwin.com/</td></tr> <tr><td>תא בדיקה גלילי (צלחת זכוכית פיירקס 325 מ"ל)</td><td>Corning</td><td>3140-100</td><td>קוטר 10 ס"מ גובה 5 ס"מ</td></tr><tr><td>Ethovision XT</td><td>Noldus Information&nbsp; טכנולוגיה, Wageningen, הולנד</td><td>גרסה 14</td><td>https://www.noldus.com/animal-behavior-research/products/ethovision-xt</td></tr><tr><td>דגים אקווריום צילינדר מסנן מים אבן ספוג רך,</td><td>ז'רדן שחור (עד Amazon.com)</td><td>מסנן ספוג NA</td><td>למערכת הקלטת שינה/היפראקטיביות</td></tr><tr><td>ביצי שרימפס מלח</td><td>ישיר</td><td>BSEA16Z</td><td></td></tr><tr><td>תוכנה חופשית</td><td></td> <td>ImageJגרסה 1.52e</td><td>https://imagej.nih.gov/ij/</td></tr> <tr><td>מאקרו 1.8/12.5-75 מ"מ עדשת זום C-mount</td><td>Toyo</td><td>NA</td><td>חבר למצלמת אינטרנט USB באמצעות תושבת c, המודפסת במדפסת תלת מימד</td></tr><tr><td>רגולטור ניטרלי</td><td>Seachem</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>מסנן מעבר ארוך IR יצוק אופטי מפלסטיק</td><td>אדמונד אופטיקה</td><td>43-948</td><td>חתוך לחתיכה קטנה כדי להתאים ל-CCD של תוכנה חופשית</td></tr> <tr><td></td><td></td><td>של מצלמת אינטרנט USB pfmapבנה 178</td><td>http://pismotec.com/download/ (ב " הורד את הארכיון" קישור בתחתית)</td></tr><tr><td>Reef Crystals Reef Salt</td><td>Instant Ocean</td><td>RC15-10</td><td></td></tr><tr><td>SwisTrack</td><td>freeware</td><td>גרסה 4</td><td>https://en.wikibooks.org/wiki/SwisTrack</td></tr><tr><td>מצלמת אינטרנט USB (LifeCam Studio 1080p HD Webcam)</td><td>Microsoft</td><td>Q2F-00013</td><td>לחתוך 2-2.5 ס"מ מהחזית</td></tr><tr><td>WinAutomation</td><td>freeware</td><td>גרסה 8</td><td>https://www.winautomation.com/ (עצמאי בחינם אפליקציה להליך זה)</td></tr><tr><td>מערכת הפעלה</td><td>Windows Microsoft</td><td>7, 8 או 10</td><td>https://www.microsoft.com/en-us/windows</td></tr><tr><td>x264vfw</td><td>תוכנה חופשית</td><td>NA</td><td>https://sourceforge.net/projects/x264vfw/</td></tr></tbody></table>

מעקב אחר התנהגות והדימות neuromast של cavefish מקסיקני

Behavioral Tracking and Neuromast Imaging of Mexican Cavefish

בעלי החיים שוכני המערה התפתחו סדרה של מאפיינים מורפולוגיים והתנהגותיים להסתגל לסביבות שלהם חשיבתו אפל, מזון-דליל. בין התכונות הללו, התנהגות הרעיה הוא אחד החלונות שימושי לתוך יתרונות פונקציונליים של האבולוציה תכונה התנהגותית. שהוצגו במסמך זה הן שיטות מעודכן לניתוח התנהגות המשיכה רטט (VAB: התנהגות אדפטיבית הרעיה) הדמיה של mechanosensors המשויכת של טטרה הותאם המערה, Astyanax mexicanus. בנוסף, שיטות מוצגים לצורך מעקב תפוקה גבוהה של סדרת התנהגויות cavefish נוספים כולל היפראקטיביות ושינה-הפסד. Cavefish גם להראות asociality, התנהגות שחוזרת על עצמה וחרדה גבוהה יותר. לכן, cavefish לשמש מודל חיה עבור התנהגויות מפותחת. שיטות אלה להשתמש בקבצי script התוכנה-החופשית, בהזמנה אישית שניתן להחיל על סוגי אחרים של התנהגות. שיטות אלה מספקים חלופות מעשי וחסכוני תוכנת מעקב זמינים מסחרית.

התוצאות שהוצגו במסמך זה הן דוגמאות מייצגות של מה ניתן לרכוש עם השיטות שהוצגו. לכן, התוצאות ניתן לסטות מעט לבין אלו המובאות כאן הן cavefish והן דגים השטח בהתאם לתנאי הניסוי.
התנהגות המשיכה רטט
ניתן למצוא תוצאות נציג VAB באיור 3 מערת ודגים משטח. הערה הפעולה edge-בעקבות הדג פני השטח (איור 3 א; תכ...

כאן, אנו מציגים שיטות למחקר תפוקה גבוהה של סדרת cavefish מקסיקני התנהגויות, צביעת חיוני של מערכת mechanosensory. שיטות אלה להשתמש בקבצי script התוכנה-החופשית, מחוייט, מתן שיטה מעשית וחסכונית עבור המחקרים של התנהגויות.

מעקב אחר התנהגות והדימות Neuromast של Cavefish מקסיקני

Cave-dwelling animals have evolved a series of morphological and behavioral traits to adapt to their perpetually dark and food-sparse environments. Among ...

דג המערות מגדל כציור קיר פנטסטי של בעלי חיים כדי להבין את האבולוציה ואת התהליכים הביו-רפואיים. אנו מנהלים כעת חקירה ביו-רפואית על ידי שימוש בתכונה זו כמקבילה לתסמינים אנושיים. כאן נראה את סוללת ההתנהגויות ואת מערכת הניתוח שניתן להשתמש בה הן למחקרים אבולוציוניים והן למחקרים ביו-רפואיים.כדי לתייג רטט מושך והתנהגות, מוט זכוכית רוטט מוכנס לתוך קערת זכוכית המכילה דג אחד בחושך. דגים מסתגלים ארבעה ימים לפני ההתאקלמות במים מותנים עם מחזור כהה של 12, 12 אור. יום לפני יום ההתאקלמות לאחר שלושה ימים של התאקלמות, החליפו מים בתא ההתנזרות במים מתוקים ומותנים.ביום הבדיקה, דגים נמנעים ממזון עד לאחר השלמת הבדיקה, כי הפסקת תשנה את תגובתם לתנודות. הכינו מנגנון פולט רטט על ידי כוונון ל-40 הרץ. הגדר את פרמטרי ההקלטה, תנאי המלאי וקובץ היעד המתאימים.מניחים צילינדר על במת ההקלטה, מואר באור אחורי אינפרא אדום בחדר חשוך, ומאפשרים לדגים להתאקלם במשך שלוש דקות לאחר שהוצבו על הבמה. לאחר התאקלמות של שלוש דקות בחושך, להקליט שלוש דקות ו -30 שניות של וידאו. בתחילת ההקלטה, הכנס את מוט הזכוכית הרוטט בקוטר 7.5 מילימטר לתוך עמוד המים, כ-5 ס"מ לעומק.הימנעו מרעש או תנודות בעת מיקום מוט הזכוכית הרוטט במים, מכיווןים יכולים לחוש רעשים ותנודות קלות. הקפד לסיים הליך זה בתוך 30 שניות מהתחלת הקלטת הווידאו כדי להבטיח שיותר משלוש

behavioral-tracking-and-neuromast-imaging-of-mexican-cavefish

Research

JoVE Journal

Behavior

התנהגות

אנו מתארים קבוצה של טכניקות ללימוד התנהגות ספונטנית של שוחה בחופשיות דגי חשמל חלש על פני תקופה ארוכה של זמן, על ידי באופן סינכרוני מדידת העיתוי של החיה פריקת אורגן חשמלי, תנוחת גוף ואת היציבה הן מדויקת ואמין באקווריום שתוכנן במיוחד בתוך חושי חדר בידוד.

לטווח ארוך התנהגות מעקב של Freely בריכה בחולשת דגים חשמליים

ב פרוטוקול זה, אנחנו מדגימים כיצד להתרבות Astyanax mexicanus מבוגרים, להעלות את הזחלים, לבצע כל-הר אימונוהיסטוכימיה על פוסט-זחל דגים כדי להשוות על הפנוטיפים של השטח, מערת morphotypes.

גידול של טטרה מקסיקנית Astyanax mexicanus עבור ניתוח של Post-larval פנוטיפים ואת כולה-הר אימונוהיסטוכימיה

אנו מתארים גישות על המניפולציה של גנים במערכת המודל האבולוציוני Astyanax mexicanus. שלוש טכניקות שונות מתוארים: בתיווך Tol2 transgenesis, יישוב מניפולציה של הגנום באמצעות CRISPR/Cas9, ואת נוקאאוט של הביטוי תוך שימוש morpholinos. כלים אלה צריך לאפשר חקירה ישירה של גנים שבבסיס וריאציית בין פני השטח - ואת מערת המגורים טפסים.

מניפולציה של פונקציית ג'ין Cavefish מקסיקני

פרוטוקול זה מאפשר הדמיה של ביטוי גנים בעובריים Astyanax cavefish. גישה זו פותחה במטרה למקסם את אות של ביטוי גנים, תוך מזעור צביעת הרקע לא ספציפית.

Wholemount ב באתרו הכלאה עבור עוברי Astyanax

פרוטוקול זה מפרט את המתודולוגיה לכימות תנועת התנהגות גינקולוגיות ולישון ב cavefish מקסיקני. ניתוחים קודמים מורחבות כדי למדוד ההתנהגויות בדגים שוכנו מבחינה חברתית. מערכת זו ניתן להחיל באופן נרחב כדי ללמוד שינה ופעילות מינים דגים אחרים.

מדידות אוטומטיות שינה ופעילות גינקולוגיות Cavefish מקסיקני

הפריה חוץ גופית היא טכניקה בשימוש נפוץ עם מגוון רחב של אורגניזמים מודל לשמור על אוכלוסיות מעבדה לייצר עוברים מסונכרנים עבור יישומים במורד הזרם. כאן, אנו מציגים פרוטוקול המיישם טכניקה זו עבור אוכלוסיות שונות של הדגים טטרה מקסיקני, Astyanaxמקסיקני.

אוסף המשחק ו הפריה חוץ גופית של Astyanax מקסיאנוס

מאמר זה מתאר את תנאי המעבדה הבסיסיים ואת הפרוטוקולים למשטר טמפרטורה מצטבר כדי לעורר השרצה מקסימלית במקסיקו tetra Astyanax mexicanus, שהוא מודל מתפתח למחקרים התפתחותיים ואבולוציוניים.

שינויי טמפרטורה מצטברים לרבייה מקסימלית והשריצה באסטיאנקס מקסיקו

ניטור ממושך והמקיף של עכברים בסביבת כלוב-הבית מספק הבנה עמוקה יותר של התנהגות חריגה במודלים עכבריים של מחלות מוח. מאמר זה מתאר את ההתנהגות המשולבת התחנה (INBEST) כמרכיב המרכזי בניתוח התנהגות עכשווי.

ההתנהגות phenotyping של מודלי Murine מחלות עם ההתנהגות המשולבת התחנה (INBEST)

פרוטוקול זה נועד לאפשר לחוקרים לערוך ניסויים שנועדו לבחון היבטים אלה של התמכרות באמצעות מבחני העדפת מקום מותנית ורגישות התנהגותית תנועתית.

הערכת רגישות התנהגות נגרמת קוק העדפות מקום אלפו עכברים

גרסת חולדה של מבחן ערנות Psychomotor אדם (PVT) מתוארת מודד היבטים של תשומת לב דומים לשיעורים שנמדדו עם PVT האדם, כולל היבטים של ערנות אדם כגון דיוק ביצועים, מהירות מנוע, מוקדם להגיב, ובפערים בדום.

מבחן הערנות Psychomotor המכרסם (rPVT): שיטה להערכת ביצועי נוירו-התנהגותיות אצל חולדות ועכברים

למד שיטות לניתוח התנהגות ודימות מערכת החישה המכנית בדגי מערות מקסיקניים. גישה זו מציעה פתרון יעיל וחסכוני למחקרים התפתחותיים וביו-רפואיים.

מעקב אחר התנהגות והדימות Neuromast של Cavefish מקסיקני

גלה סרטונים נוספים