Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

Sujin Kim; Minjeong Kang; Yoosik Kim

doi:10.3791/59215

לומד RNA Interactors של חלבון ה-RNA-מופעל במהלך מחזור התא בתרבית

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

לומד RNA Interactors של חלבון ה-RNA-מופעל במהלך מחזור התא בתרבית

Full Text

6,905 Views

10:05 min

March 5, 2019

DOI: 10.3791/59215-v

Sujin Kim¹, Minjeong Kang¹, Yoosik Kim¹

¹Department of Chemical and Biomolecular Engineering and KI for Health Science and Technology (KIHST),Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

אנו מציגים גישות ניסיוניות של RNA-interactors לימוד של זוגיות גדילי RNA מחייב חלבון קינאז מופעל RNA (PKR) במהלך מחזור התא יונקים באמצעות תאים הלה. שיטה זו משתמשת פורמלדהיד קומפלקסים crosslink RNA-PKR, immunoprecipitation להעשיר PKR מכורך RNAs. אלה RNAs ניתן לנתח נוסף דרך רצף תפוקה גבוהה או לרביעיית-PCR.

פרוטוקול זה מספק שיטה לזיהוי אינטראקציות RNA של PKR חלבון מחייב RNA באופן גנום רחב. זה עוזר לנו להבין טוב יותר את הרגולציה שלאחר שעתוק של ביטוי גנים על ידי חלבון מחייב RNA. היתרון העיקרי של טכניקה זו הוא שהיא מנצלת crosslinking יעיל של פורמלדהיד כדי לתקן RNase קשור חלבונים מחייב RNA ולהעשיר אותם באמצעות immunoprecipitation.

PKR פעיל נצפתה בחולים עם מחלה ניוונית, כגון פרקינסון ואלצהיימר. זיהוי PKR-אינטראקציה כפולה תקוע RNase יעזור לנו להבין טוב יותר את הפתוגנזה של מחלות ניווניות אלה. שיטה זו יכולה לשמש לחקר אינטראקציות RNA של כל חלבונים מחייבי RNA.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos