Name: הפחתת גודל כירורגי של דג Zebrafish לחקר שינוי גודל של תבנית עובריים (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-05-03T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 31 s
Description: למד טכניקת הפחתת גודל כירורגי בזברה-דג לחקר תהליכי סקיילינג עובריים. השיטה מאפשרת צפייה בזמן אמת וניתוח כמותי של חוסן התפתחותי מבלי להפריע לתהליכים נורמליים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

העבודה נתמכת על ידי תוכנית מפרסטו של יפן מדעי וטכנולוגיה הסוכנות (JPMJPR11AA) ומכונים לאומיים של מענק בריאות (R01GM107733).

כל ההליכים הקשורים לדג בוצעו באישור של הוועדה לטיפול בבעלי חיים מוסדיים (IACUC) בבית הספר לרפואה של הרווארד.
1. הכנה לכלי ומגיב
<ol><li>
לעשות לולאת חוט לקצוץ עוברים
	<ol>
<li>קח 20 ס מ של חוט נירוסטה נוקשה ולא מאכל עם קוטר של 40 μm. לולאה התיל דרך לתוך נימי זכוכית (1.0 מ"מ קוטר חיצוני, 0.5 מ"מ קוטר פנימי, ללא פילמנט), עושה לולאה קטנה בראש (אורך הלולאה הוא 1.0 מ"מ)</li>
		<li>שים טיפה של לק מסמר ברור על קצה של נימי הזכוכית בין לולאת התיל כדי להחזיק אותו במקומו. . תן להתייבש ודא שלא לקבל לק ציפורניים על החלק לולאה, כפי שהוא עלול לגרום נזק לעוברים.</li>
		<li>חברו את נימי הזכוכית עם הלולאה אל המקל עץ (9 "במבוק מקלות אכילה שבורים לחצי) באמצעות קלטת מעבדה. השאירו כ 2.5 ס מ של נימי הזכוכית הארכת מעבר למקל, כך שהחלק של המקל של הכלי אינו טובלים במים. התאם אורך זה להעדפה.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
לחילופין, להכין מחט זכוכית כדי לקצוץ עוברים
	<ol>
<li>צביטה בקצה אחד של מיכל הזכוכית פסטר עם מלקחיים, תוך החזקת הצד השני עם יד. מחממים את החלק הדק של הפיפטה מעל מנורת רוח או מבער בונזן.</li>
		<li>. משוך את הזכוכית לצינורות הפיפטה האידיאלי כקוטר של כ -30 יקרומטר ועקומה עדינה (רדיוס של עקמומיות = כ-5 מ"מ). הקוטר והעקמומיות הנכונים מתקבלים עם תרגול והסיכוי כלשהו.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
הכנת מתיל תאית
	<ol>
<li>מתיל תאית משמש להחזיק את העוברים בזמן חיתוך. לעשות 2% מתיל תאית הפתרון 1/3x הפתרון של הצלצול (116 mM הנאקל, 2.9 mM KCl, 1.8 mM CaCl2, ו 5 מ"מ 4-(2-הידרוקסיל) -1-piperazinefonic חומצה (hepes; pH 7.2)). שייק מתיל תאית בתמיסה 1/3x של הצלצול ב 4 ° c בלילה.</li>
		<li>באופן אופציונלי, להוסיף ~ 1.5 mL פנול אדום (0.5% בפתרון מניות DPBS) כדי 10 mL 2% מתיל תאית פתרון, עד אדום, כדי להפוך את הפתרון גלוי. טלטל אותו עד שהצבע יהפוך לאחיד.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. הכנת עוברי דג העוברים עבור הפחתת גודל כירורגי
<ol><li>
לאסוף עוברים
	<ol>
<li>מניחים אחד או שניים זכר ואחת או שתיים דגים בחדר ההזדווגות מלא במים רבים. הפרד בין הזכרים והנקבות באמצעות מפצל פלסטי. השתמש בשורת ה-AB עבור הדמיה somite (סעיף 4) ושורת כתב טרנסגניים של הצינורית העצבית (nkx 2.2: מחבר-gfp, dbx1b: gfp, או Olig2: dsred) עבור דימות הצינור העצבי. . תשאירו אותם בחדר הלילה הערה: הבחירה של מבוגרים חשוב להשיג ביצים ששרדו היטב ניתוח. בדרך כלל, נקבות בריאות צעירות לייצר ביצים בריאות.</li>
		<li>בבוקר שלמחרת, העבירו את החדר למים רדודים והניחו את החדר בהטיה קלה. הסר את המחיצה כך שהדג יוכל להזדווג.</li>
		<li>לאסוף את הביצים על ידי לשפוך לתוך מסננת תה. להעביר את הביצים לתוך צלחת פטרי עם מי ביצה (עבור 20x ביצים מים, 6 גרם מלח ים מיידית, 1.5 g CaSO4 ו 1 L H2O; שימוש ב-1x). לקבלת היערכות טובה יותר, לאסוף את הביצים מיד לאחר ההשריץ. מניחים את העוברים בחממה 28.5 ° c.</li>
		<li>במקרה הצורך, הכנס את המספר שלבים, בשלבים של 1 עד 4 בעקבות פרוטוקול משותף7,8. הכנס mRNA לתווית ממברנה פלואורסצנטית (הגברת מצ, מmBFP1, או הגברת-מקאיטארין) עבור דימות הצינור העצבי (סעיף 5).</li>
	</ol>
</li>
	<li>
דורגון באמצעות הפרואז
	<ol>
<li>סביב 128-cell כדי 256-הבמה התא, להעביר עוברים בריאים לצלחת מזכוכית 35 מ"מ מלא במי ביצה. להסיר את כל מי ביצים ככל האפשר מן המנה.</li>
		<li>הוסף 1 מ ל של 20 מ"ג/mL בכיוון. העוברים מערבולת בעדינות סביב על ידי הזזת הצלחת ומצנקת בעדינות את הפתרון למעלה ולמטה כדי לסייע בביטול השימוש בצנרת זכוכית.</li>
		<li>כאשר מתחילים לאבד אלסטיות (בדרך כלל 1-4 דקות לאחר הוספת התכונות, בהתאם לכמות של ביצים ומים), להוסיף כמו מי ביצה הרבה ככל האפשר כדי לדלל את התכונות. להעריך את האובדן אלסטיות על ידי נגיעה בעדינות chorion עם מלקחיים; הצ צריך להחזיק את השקע. בלי לחזור מיד להעביר את הביצים לתבשיל אחר עם מי ביצה באמצעות פיפטה זכוכית (בשלב זה, רוב הורמונים לא שבורים).<ol>
<li>לחילופין, שופכים בעדינות את העוברים ממנה לתוך מיכל זכוכית 400 mL גדול ממולא במי ביצה מבלי לחשוף עוברים לאוויר. ואז, תן לעוברים להתיישב לחלוטין. להטות את הגביע כדי לאפשר לעוברים ליפול לצד אחד. לאסוף את העוברים הללו באמצעות הצינורות זכוכית ולהעביר לצלחת זכוכית חדשה 35 מ"מ מלא עם הפתרון של 1/3x צלצול.</li>
		</ol>
</li>
		<li>המתן מספר דקות עד שרוב הורמונים מאבדים גמישות מוחלטת. להסיר את שאר הורמונים מעוברים על ידי ללטף בעדינות את הביצים. הסרת עוברים פגומים והדגירה של העוברים בחממה 28.5 ° c.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. הפחתת גודל כירורגי ושחזור
<ol><li>להכין אחד נקי 35 מ"מ צלחת זכוכית. מורחים כ 0.5 mL של 2% מתיל תאית (ב 1/3x הפתרון של הצלצול, עם אדום פנול כדי לעזור להמחיש) ליד מרכז החלק התחתון של המנה הגדולה יותר באמצעות מרית פלסטיק. דק ושווה להפיץ את מתיל תאית לעובי של כ 0.5 מ"מ.</li>
	<li>יוצקים כ 30 מ ל של 1/3x הפתרון של הצלצול לצד של המנה ולאפשר להתפשט על שאר המנה, כיסוי מתיל תאית.</li>
	<li>הציבו עוברים ב256-תא-1k-תא בשלב 2% מתיל תאית. התאימו את כיוון העוברים אל הצד כדי להמחיש את התאים ואת החלמון. (איור 1)</li>
	<li>קוצצים כ 30%-40% של תאים מן הבלסטועור ליד הקוטב בעלי חיים על ידי חיתוך בניצב לציר החי-וצמחי באמצעות לולאת התיל (או מחט זכוכית) (איור 1, לוחות העליון). לאחר הסרת התאים, הקש בעדינות את הקצוות יחד כדי לסייע לתאים הנותרים להיצמד לאחור. בתוך דקות, התאים המתים צריכים. להיות מתים כשהעובר מתחיל להחלים</li>
	<li>הפוך פצע קטן לחלמון ליד הקוטב הצמחי במקום "לקצוץ" את החלמון (איור 1 לוחות הביניים). הפצע את החלמון על ידי הטלת קרום הביצה בתיל הטעון. חלמון יתרפא לכמה דקות לאחר פציעתו, ואז הפצע ירפא (איור 1 לוחות התחתון).</li>
	<li>כאשר החלמון מפסיק נוטף החוצה, להזיז את העובר באמצעות pipet מחוץ התאית מתיל באותו תבשיל כדי לאפשר להם להתאושש טוב יותר.</li>
	<li>חזור על שלבים 3.4-3.6 עבור כל העוברים. להשאיר את הצלחת יציבה 30 דקות בזמן העוברים להתאושש.</li>
	<li>
העבר את העוברים לצלחת חדשה עם הפתרון החדש של 1/3x מתחזה ולשים אותם בחממה 28.5 ° c כדי לאפשר להם להתאושש לחלוטין.
	<ol>
<li>אופציונלי אם השלב של העניין הוא השלב המוקדם מוקדם, העוברים יכולים להיות מודטים ב 20 ° c לאחר שהוא מודב 28.5 ° c עד שלב המגן, כדי להתאים את העיתוי לניסויים והדמיה.</li>
	</ol>
</li>
</ol>4. הדמיה חיה של בריידג סומאיטאוגנזה
<ol><li>הכן 100 mL של 1% הפתרון על ידי הוספת 1 גרם של agarose כדי 100 mL של מי ביצים, חימום עד התפרקה הוא הומס המלא. תנו מצננים עבור 5-10 דקות לטמפרטורה של 62-72 ° c.</li>
	<li>
הכינו הר להדמיה. הערה: מדריך זה פותחה לשימוש עם מיקרוסקופ שדה רחב הפוך.<ol>
<li>יוצקים ~ 15 מ ל של 1% התעוררה ב-100 מ"מ x 15 מ"מ צלחת פטרי פלסטיק.</li>
		<li>מניחים בעדינות תבנית כייר V1 על גבי הראש5 על החלק התחתון של צלחת פטרי. לשמור על העובש בתחתית באמצעות משקל, כגון 15 מ ל שפופרת עם מים. הערה: כך העוברים קרובים לתחתית צלחת פטרי ככל האפשר, כאשר משתמשים במיקרוסקופ הפוך. למרות העוברים מותקן מחוץ לתמונה עבור הדמיה somite, כאן מאונט V1 התמונה5 משמש מאז הוא מחזיק את העוברים טוב יותר בשלבים המוקדמים somite.</li>
		<li>תנו להתקרר עד שהוא. מתחזק לגמרי יוצקים ב ~ 30 מ ל של מי ביצה עם 0.01% tricaine, ובזהירות להסיר עובש על ידי בעדינות לחטט עם מלקחיים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
מאונט העוברים עבור הדמיה somite
	<ol>
<li>הכינו 1% התכה נמוכה בתמיסה של 1/3x (או מי ביצים) ושמור אותו ב 42 ° c. המתן עד שטמפרטורת הטמפרטורה יורדת ל-42 ° c.</li>
		<li>, תחת מיקרוסקופ לחיתוך. הציבו עובר אחד לכל הטוב פיפטה בקירוב 1 μL של התכה נמוכה בבאר כדי להתאים את גודל הבאר לגודל של עוברים בודדים המשתנים בגודל, במיוחד בין אלה עם ובלי גודל הפחתה.</li>
		<li>במהירות האוריינט העוברים לפני המסת התכה הנמוכה מתחזק כך שפני העוברים התחלפו לחלוטין למנה. לאחר לטעון עוברים, בעדינות למקם את שובר הכיסוי בהר העלה כדי להחזיק את העוברים במקומם. האוריינטציה חשובה במיוחד להדמיה ארוכת הטווח, כי העוברים צריכים להיות מורכבים בדיוק לאורך כל הגבולות הסומטים לצורך הדמיה מהירה בשלבים מאוחרים יותר.</li>
		<li>הרחק מן האזור ההרכבה ולטפל 25 מ"מ x 25 מ"מ זכוכית כיסוי כגון זה 45 מעלות היסט מכיוון כניסת הכיכר שנעשו על ידי העובש. החלק את הכיסויים על העובש בכיוון זה עד שכל פינה מונחת בצד שונה של התבנית. הערה: למרות פרוטוקול זה הוא עבור מיקרוסקופ הפוך, הצבת זכוכית כיסוי על גבי העובש הוא עדיין חשוב כך העוברים לא לזוז בעת העברת למיקרוסקופ.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
הדמיה של תהליך היווצרות התמונות
	<ol>
<li>חמם את המיקרוסקופ ל -28 ° c בחממה שנבנתה עם לוחות מוקצף ומחמם הקבינט.</li>
		<li>מניחים את צלחת פטרי עם העוברים רכוב על במת המיקרוסקופ. מצא את העובר רכוב על הטוב השמאלי העליון של הר agarose עם עדשת הגדלה נמוכה, ואז לעבור את המטרה 10x.</li>
		<li>הגדר רכישת תמונות. הערה: הוראה זו היא לשדה בהיר.</li>
		<li>מצא תנאים עבור כוח האור, זמן חשיפה, והעבה, כך שגבול somite ניתן לראות בבירור. שימוש בהגדרות z-מחסנית מגדיר את מישור ההדמיה הרצוי ביותר והגבוה ביותר. הגדר את מרווח הזמן והשעה הכולל. למצוא ולרשום את המיקומים של xy של כל העוברים רכוב כל כך העוברים מרובים ניתן לבצע תמונה בו.</li>
	</ol>
</li>
	<li>למדוד את האורכים של PSM ו מסוענים באמצעות פיג'י16.</li>
</ol>5. הדמיה של מעצבי צינור עצביים
<ol><li>הכן 100 mL של 1% הפתרון על ידי הוספת 1 גרם של agarose כדי 100 mL של מי ביצים, חימום עד התפרקה הוא הומס המלא. אפשר להתקרר עבור 5-10 דקות עד 62-72 ° c. . התאימו את טריקיין ל 0.01%</li>
	<li>
הכן מטען להדמיה. הערה: מדריך זה מפותח לשימוש עם מיקרוסקופ זריחה זקופה. עבור מיקרוסקופים הפוכה שמיכות מנות התחתונה הם נחוצים וכיוון ההרכבה בשלב 3 מתהפך.<ol>
<li>שופכים ב-~ 15 מ ל של 1% מעלה ל-100 מ"מ x 15 מ"מ בצלחת פטרי מפלסטיק. בעדינות לצוף העובש הV1 על גבי המשטח של הצמח כדי למנוע בועות אוויר. תנו להתקרר עד שהוא. מתחזק לגמרי</li>
		<li>הסר בזהירות את העובש עם מלקחיים או סכין גילוח. ממלאים את הצלחת עם מי ביצה עם 0.01% tricaine ולכסות עד השימוש.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
. עוברים לדימות הצינור העצבי
	<ol>
<li>אפשר טרנסגניים או מוזרק בגודל פלורסנט-מופחת העוברים שליטה לפתח עד השלב 20-25 somite (בערך 18-22 h לאחר הפריה). עוברים המבטאים תווית של ממברנה פלואורסצנטית (גברתמצ, גברת-mBFP1, או הגברת מקאיטרין) וכתבת טרנסגניים של הצינורית העצבית (nkx 2.2: הגברת-gfp, dbx1b: gfp, או Olig2: dsred) משמשים להדמיה.</li>
		<li>החלפת בינונית מים ביצה ב מוכן הר מוכנים עם 0.01% tricaine פתרון העבודה. בעדינות פיפטה בעוברים להיות התמונה כדי בארות של ההר הגבי.</li>
		<li>מניפולציות עוברים לכיוון הנכון, כך שהראש פונה קדימה להר והזנב מצביע לעבר העורף עם החלק האחורי הפונה לכיוון משטח המים.</li>
		<li>המזרח העובר כך הזנב הוא שוכב שטוח ולא מופנה כלפי מטה לכיוון התחתון של המנה. זה לפעמים מועיל להניח את החלק האחורי של הזנב על אדן הצד של ההרכבה היטב כדי למנוע את הזנב מטביעה בשוגג הדמיה המוח הישבן. . אני חוזר על כל עובר להיות מסוימים עם מופחתת גודל העוברים כי הם לא נופלים עמוק לתוך הבארות כדי להיות בתמונה.</li>
		<li>הרחק מן האזור להרכבה ולטפל 25 מ"מ x 25 מ"מ זכוכית כיסוי כגון זה הוא 45 ° היסט מכיוון הכניסה הכיכר שנעשו על ידי העובש. החלק את הכיסויים על העובש בכיוון זה עד שכל פינה מונחת בצד שונה של התבנית.</li>
		<li>סובב לאט את שמיכות הזכוכית עד שהיא תיפול בעדינות לאזור ההרכבה. בדוק כדי להיות בטוח עוברים עדיין מותקן במיקומים ובכיוונים הנכונים. אם תנועה יותר מדי נגרמת על ידי נפילת שמיכות, להסיר בעדינות ולחזור על הרכבה משלב C.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
תמונה בתלת-מימד את חוט השדרה המתפתח.
	<ol>
<li>בעדינות להעביר את המנה המכילה עוברים רכוב למיקרוסקופ קונפוקלית וקד. להדמיה לטווח ארוך, הקפידו להשתמש במיקרוסקופ מודגר. . אחרת, הטמפרטורות הנמוכות נסבלים</li>
		<li>תחת האור הברייטאלי, נווט אל העובר לתמונה ומרכז את שדה הראיה בעמדה המועדפת האחורי הקדמית. כדי לאפשר השוואה מפורטת בין עוברים, עמדה זו על כל עובר חייבת להיות עקבית.</li>
		<li>הגדר את פרמטרי ההדמיה כדי להלהיב וללכוד אות מחלבונים פלורסנט להיות בתמונה. פרמטרים ניתן לכוונן על ידי עין כדי ליצור תמונה רצויה על המדגם הראשוני. כדי לאפשר עקביות מדידה, החל הגדרות אלה על כל העוברים בערכת הנתונים. אם הרבה מערימות z נדרשים למטב את ההגדרות עבור מהירות.</li>
		<li>באמצעות הגדרות z-מחסנית, הגדר את מישור ההדמיה הרצוי ביותר והגבוה ביותר. לאיכות תמונה אופטימלית במחסנית z, הגדר את רזולוציית z לגבוהה ביותר המיטבית עבור הגדרת הצמצם. ניתן ליצור תמונות טובות עם מרווח של 1 יקרומטר.</li>
	</ol>
</li>
	<li>ניתוח נתוני הדמיה לפי כל שיטה מועדפת. הערה: במקרה זה, הניתוח בוצע עם סקריפטים MATLAB מותאמים אישית המאפשרים פילוח פשוט של החלקים העצביים של תמונה וכימות של אות הדמיה.</li>
</ol>

<ol><li>Cooke, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scale+of+body+pattern+adjusts+to+available+cell+number+in+amphibian+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Scale of body pattern adjusts to available cell number in amphibian embryos.</a> Nature. 290, 775-778 (1981).</li>
<li>Driesch, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Entwicklungsmechanische+Studien%3A+I.+Der+Werthe+der+beiden+ersten+Furchungszellen+in+der+Echinogdermenentwicklung.+Experimentelle+Erzeugung+von+Theil-+und+Doppelbildungen%5BTitle%5D)+AND+%22Zeitschrift+fur+wissenschaftliche+Zoologie%22%5BJournal%5D)">Entwicklungsmechanische Studien: I. Der Werthe der beiden ersten Furchungszellen in der Echinogdermenentwicklung. Experimentelle Erzeugung von Theil- und Doppelbildungen.</a> Zeitschrift fur wissenschaftliche Zoologie. , (1892).</li>
<li>Morgan, T. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Half+embryos+and+whole+embryos+from+one+of+the+first+two+blastomeres%5BTitle%5D)+AND+%22Anatomischer+Anzeiger%22%5BJournal%5D)">Half embryos and whole embryos from one of the first two blastomeres.</a> Anatomischer Anzeiger. 10, 623-638 (1895).</li>
<li>Ishimatsu, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Size-reduced+embryos+reveal+a+gradient+scaling-based+mechanism+for+zebrafish+somite+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Size-reduced embryos reveal a gradient scaling-based mechanism for zebrafish somite formation.</a> Development. 145, (2018).</li>
<li>Megason, S. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+toto+imaging+of+embryogenesis+with+confocal+time-lapse+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">In toto imaging of embryogenesis with confocal time-lapse microscopy.</a> Methods in Molecular Biology. 546, 317-332 (2009).</li>
<li>Graeden, E., Sive, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+imaging+of+the+zebrafish+embryonic+brain+by+confocal+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Live imaging of the zebrafish embryonic brain by confocal microscopy.</a> Journal of Visualized Experiments. (26), e1217(2009).</li>
<li>Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microinjection+of+zebrafish+embryos+to+analyze+gene+function%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Microinjection of zebrafish embryos to analyze gene function.</a> Journal of Visualized Experiments. (25), e1115(2009).</li>
<li>Yuan, S., Sun, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microinjection+of+mRNA+and+morpholino+antisense+oligonucleotides+in+zebrafish+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Microinjection of mRNA and morpholino antisense oligonucleotides in zebrafish embryos.</a> Journal of Visualized Experiments. (27), e1113(2009).</li>
<li>Sorlien, E. L., Witucki, M. A., Ogas, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+Production+and+Identification+of+CRISPR%2FCas9-generated+Gene+Knockouts+in+the+Model+System+Danio+rerio%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Efficient Production and Identification of CRISPR/Cas9-generated Gene Knockouts in the Model System Danio rerio.</a> Journal of Visualized Experiments. (138), e56969(2018).</li>
<li>Kemp, H. A., Carmany-Rampey, A., Moens, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generating+chimeric+zebrafish+embryos+by+transplantation%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Generating chimeric zebrafish embryos by transplantation.</a> Journal of Visualized Experiments. (29), e1394(2009).</li>
<li>Mizuno, T., Shinya, M., Takeda, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+and+tissue+transplantation+in+zebrafish+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell and tissue transplantation in zebrafish embryos.</a> Methods in Molecular Biology. 127, 15-28 (1999).</li>
<li>Cooke, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Control+of+somite+number+during+morphogenesis+of+a+vertebrate%2C+Xenopus+laevis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Control of somite number during morphogenesis of a vertebrate, Xenopus laevis.</a> Nature. 254, 196-199 (1975).</li>
<li>Inomata, H., Shibata, T., Haraguchi, T., Sasai, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scaling+of+dorsal-ventral+patterning+by+embryo+size-dependent+degradation+of+Spemann%27s+organizer+signals%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Scaling of dorsal-ventral patterning by embryo size-dependent degradation of Spemann's organizer signals.</a> Cell. 153, 1296-1311 (2013).</li>
<li>Gomez, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Control+of+segment+number+in+vertebrate+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Control of segment number in vertebrate embryos.</a> Nature. 454, 335-339 (2008).</li>
<li>Lauschke, V. M., Tsiairis, C. D., Francois, P., Aulehla, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scaling+of+embryonic+patterning+based+on+phase-gradient+encoding%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Scaling of embryonic patterning based on phase-gradient encoding.</a> Nature. 493, 101-105 (2013).</li>
<li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiji%3A+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nature Methods. 9, 676-682 (2012).</li>
<li>Almuedo-Castillo, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scale-invariant+patterning+by+size-dependent+inhibition+of+Nodal+signalling%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Scale-invariant patterning by size-dependent inhibition of Nodal signalling.</a> Nature Cell Biology. 20, 1032-1042 (2018).</li>
<li>Koos, D. S., Ho, R. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+nieuwkoid+gene+characterizes+and+mediates+a+Nieuwkoop-center-like+activity+in+the+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">The nieuwkoid gene characterizes and mediates a Nieuwkoop-center-like activity in the zebrafish.</a> Current Biology. 8, 1199-1206 (1998).</li>
<li>Yamanaka, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+homeobox+gene%2C+dharma%2C+can+induce+the+organizer+in+a+non-cell-autonomous+manner%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+and+Development%22%5BJournal%5D)">A novel homeobox gene, dharma, can induce the organizer in a non-cell-autonomous manner.</a> Genes and Development. 12, 2345-2353 (1998).</li>
<li>Jesuthasan, S., Stahle, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+microtubules+and+specification+of+the+zebrafish+embryonic+axis%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Dynamic microtubules and specification of the zebrafish embryonic axis.</a> Current Biology. 7, 31-42 (1997).</li>
<li>Schier, A. F., Talbot, W. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+zebrafish+organizer%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Genetics+and+Development%22%5BJournal%5D)">The zebrafish organizer.</a> Current Opinion in Genetics and Development. 8, 464-471 (1998).</li>
</ol>

המחברים לא מצהירים על אינטרסים כלכליים או מתחרים.

היסטורית, בין בעלי חוליות, הפחתת גודל מבוצעת בעיקר באמצעות עוברי אמפיבי, על ידי ביצוע העוברים לאורך ציר החי-צמחי בשלב blastula12. עם זאת, ישנם בעיקר שני הבדלים בין הצפרדע לעוברים עוברי דגים כאשר אנו ביסעי עוברים. ראשון, על הבמה כאשר העוברים משתדגים להיות סובלני של ביסען (blastula stage), המארגן ממוקם באזור מוגבל של blastula שוליים18,19,20,21....

מדענים ידועים זמן רב כי עוברים יש יכולת יוצאת דופן ליצור פרופורציות גוף קבוע למרות גודל העובר יכול להשתנות במידה רבה בתנאים טבעיים וניסיוניים1,2,3. למרות עשורים של מחקרים תיאורטיים וניסיוניים, החוסן הזה לשינוי גודל, נקרא שינוי קנה מידה, והמנגנונים הבסיסיים שלהם נשארים בלתי ידועים ברקמות ובאיברים רבים. על מנת ללכוד באופן ישיר את הדינמיקה של המערכת המתפתחת, הקמנו טכניקה הפחתת גודל פשוט של הפחתה ב-דג זברה4, אשר יש את היתרון הגדול ב vivo live הדמיה5.
זברפיש שימש כבעל חוליות מודל לחקר דיסציפלינות מרובות של ביולוגיה, כולל ביולוגיה התפתחותית. בפרט, דג דג זברה הוא אידיאלי עבור vivo live הדמיה6 כי 1) הפיתוח יכול להמשיך בדרך כלל מחוץ לאם ואת קליפת הביצה, ו 2) העוברים שקופים. בנוסף, העוברים יכולים לעמוד בטמפרטורה ובתנודות סביבתיות, המאפשרים להם ללמוד בתנאי מעבדה. כמו כן, בנוסף הביטוי הגן הקונבנציונלי הפרטורציה על ידי הזרקת גוורסטינו ו mrna הזרקה7,8, ההתפתחויות האחרונות בטכנולוגיית crispr/Cas9 עשה גנטיקה הפוכה ב-דג זברה יעיל מאוד9. יתר על כן, טכניקות קלאסיות רבות ב אמבריולוגיה, כגון השתלת תאים או ניתוח רקמות ניתן להחיל4,10,11.
הפחתת גודל טכניקות פותחו במקור בעלי חיים שאינם בעלי חוליות12. לדוגמה, ב- xenopus זריזה, עוד מודל פופולרי בעלי חוליות בעלי החיים, החצייה לאורך ציר החי-ווגטל בשלב blastula, יכולים לייצר עוברים מופחתים בגודל12,13. עם זאת, בידינו זו גישה צעד אחד תוצאות העוברים מאואמים או מונאמים ב-zebrafish, ככל הנראה משום שהדטרמיניזם הדו מופץ ללא שינוי ואין לדעת את הלוקליזציה שלהם מתוך המבנה של העוברים. כאן אנו להדגים טכניקה חלופית דו-שלבים לחיתוך באמצעות הדגים המייצרת בדרך כלל אך עוברים קטנים יותר. עם טכניקה זו, תאים מוסרים לראשונה מן הקוטב חיה, אזור של תאים תמימים חסר פעילות ארגונית. כדי לאזן את כמות החלמון והתאים, שהוא חשוב עבור epiboly והבאים מורפוגנזה, חלמון מוסר לאחר מכן. כאן, אנו מפרטים פרוטוקול זה ולספק שתי דוגמאות של קבוע גודל במבנה תבנית; היווצרות הצינור העצבי הגחון. בשילוב עם הדמיה כמותית, אנו משתמשים בטכניקת הפחתת גודל כדי לבחון את האופן שבו גדלים של שפופרת העצבים והצינורית העצבית מושפעים מהעוברים מופחתים בגודל.

<table><tbody><tr><td>צלחת פטרי פיירקס 60 מ"מ</td><td>CORNING&</td><td>nbsp; 3160-60</td><td></td></tr><tr><td>Agarose</td><td>affymetrix</td><td>75817</td><td>להכנת תושבת להדמיה חיה</td></tr><tr><td>Agarose, טמפרטורת ג'ל נמוכה מסוג VII-A</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>A0701-25G</td><td></td></tr><tr><td>CaCl2</td><td>EMD</td><td>CX0130-1</td><td>עבור 1/3 תמיסת רינגר</td></tr><tr><td>CaSO4</td><td></td><td></td><td>למי ביצים</td></tr><tr><td>תלוש כיסוי (25 מ"מ x 25 מ"מ, עובי 1)</td> <td>CORNING</td><td>2845-25</td><td></td></tr><tr><td>מרית חד פעמית</td><td>VWR&nbsp;</td><td>80081-188</td><td></td></tr><tr><td>לוח קצף</td><td>ELMER'S</td><td>951300</td><td>לחממת מיקרוסקופ</td></tr><tr><td>Forcept (No 55)</td> <td>FST</td><td>11255-20</td><td></td></tr><tr><td>פיפטת זכוכית</td><td>VWR</td><td>14673-043</td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>SIGMA Life Science</td><td>H4034</td><td>עבור 1/3 הפתרון של רינגר</td></tr><tr><td>INCUKIT XL לחממות ארונות</td><td>Warehouse.com</td><td></td><td>עבור חממת מיקרוסקופ</td></tr><tr><td>מלח ים מיידי</td><td>אוקיינוס מיידי</td><td>138510</td><td>עבור מי ביצה</td></tr><tr><td>KCl</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>P4504</td><td>עבור 1/3 תמיסת רינגר</td></tr><tr><td>מתיל תאית</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>M0387-100G</td><td></td></tr><tr><td>NaCl</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>S7653</td><td>עבור 1/3 הפתרון של רינגר</td></tr><tr><td>צלחת פטרי</td><td>פלקון</td><td>351029</td><td>עבור הכנת תושבת להדמיה חיה</td></tr><tr><td>פנול אדום</td><td>SIGMA מדעי החיים</td><td>P0290</td><td></td></tr><tr><td>משאבת פיפטה</td><td>BEL-ART PRODUCTS</td><td>F37898</td><td></td></tr><tr><td>Pronase</td><td>EMD Millipore Corp</td><td>53702-250KU</td><td></td></tr><tr><td>Tricaine-S (MS222)</td> <td>WESTERN CHEMICAL INC</td><td></td><td></td></tr> NC0135573 <tr><td>דק במיוחד בהיר מחוסל 316L קוטר 0.035 מ"מ חוטי אריגה מנירוסטה</td><td>סנדרה</td><td></td><td>החוט בו השתמשנו הושג לפני ~20 שנה ולא הצלחנו למצוא בדיוק את אותו אחד. למוצר זה יש את אותו חומר וקוטר כמו זה שבו אנו משתמשים.</td></tr></tbody></table>

הפחתת גודל כירורגי של דג zebrafish לחקר שינוי גודל של תבנית עובריים

Surgical Size Reduction of Zebrafish for the Study of Embryonic Pattern Scaling

בתהליך ההתפתחותי, עוברים מייצגים יכולת יוצאת דופן להתאים את דפוס הגוף שלהם לגודל גופם; פרופורציה הגוף שלהם נשמרת גם בעוברים גדולים או קטנים יותר, בגבולות מסוימים. למרות שתופעה זו של שינוי קנה מידה משכה תשומת לב במשך יותר ממאה שנה, הבנת המנגנונים הבסיסיים הוגבלה, בשל היעדר תיאור כמותי של הדינמיקה ההתפתחותית בעוברים בגדלים מגוונים. כדי להתגבר על מגבלה זו, פיתחנו טכניקה חדשה בניתוח להפחית את הגודל של עוברי הדגים, אשר יש יתרונות גדולים עבור vivo live הדמיה. אנו מדגימים כי לאחר ההסרה מאוזנת של תאים וחלמון בשלב blastula בשלבים נפרדים, העוברים יכולים במהירות להתאושש תחת התנאים הנכונים ולהתפתח קטן יותר אך בדרך כלל נורמלי העוברים. מאחר שטכניקה זו אינה דורשת ציוד מיוחד, היא ניתנת להתאמה בקלות, וניתן להשתמש בה כדי ללמוד מגוון רחב של בעיות בקנה מידה, כולל החוסן של בתיווך מורפוגן.

הפחתת נפח חלמון חשוב עבור מורפולוגיה נורמלית כפי שמתואר לאחרונה באלמואדו-קסטיליו ואח '.17, הפחתת גודל העוברים יכולה להיות מושגת ללא צמצום נפח החלמון. כדי להשוות עם וללא הפחתת נפח החלמון, בוצעו שני שלבים חיתוך (הן blastula וחלמון) ו blastula בלבד חיתוך (איור 2 ו המשלים סרט 1). שני צעדים קצוצים עוברים הראו מורפולוגיה כללית נורמלית לכאורה לעומת השליטה (בלבד) עוברים, מלבד הבדל גודל, לאורך השלבים ההתפתחותיים (ראה לוחות העליון והאמצעי <s...

כאן, אנו מתארים שיטה להפחתת הגודל של עוברי דגים מבלי להפריע תהליכים התפתחותיים נורמליים. טכניקה זו מאפשרת לימוד שינוי קנה מידה וחוסן התפתחותי נגד שינוי גודל.

הפחתת גודל כירורגי של דג Zebrafish לחקר שינוי גודל של תבנית עובריים

In the developmental process, embryos exhibit a remarkable ability to match their body pattern to their body size; their body proportion is maintained ...

למרות קנה המידה הוא אחד התכונות האוניברסליות והבסיסיות של מערכות התפתחותיות, המנגנונים הבסיסיים לא הובנו באיברים ורקמות רבים. טכניקת הפחתת הגודל של דג הזברה המוצגת בסרטון זה תקדם את הבנתכם את המנגנונים שבבסיס תהליכי שינוי קנה המידה הדינמיים. היתרונות בעבודה עם דגי זברה הם שקל לבצע הדמיה חיה, גנטיקה וניתוח כמותי.הטכניקה שלנו היא גם פשוטה מאוד וקל ליישם ללא כל ציוד מיוחד או אימון אינטנסיבי. בריאות העוברים היא המפתח להצלחה בטכניקה זו. השתמש דגים צעירים כהורים להיזהר למזער את הנזק על ידי הסרת chorions.וגם לשחק סביב בגודל של הפצע על החלמון, וכמה תאים מוסרים. כמו העוברים אנו משתמשים הם צעירים מאוד שביר, הם צריכים להיות מטופלים בזהירות רבה בעת העברה וחיתוך. יחד עם זאת, זה צריך להיות מהיר כך ההליך יכול להיעשות בחלון הזמן הנכון של הפיתוח.הדגמה חזותית יכולה לתת תחושה טובה של איך לייצר עוברים קטנים יותר ביעילות. כדי ליצור לולאת תיל לחיתוך עוברים, הזינו חוט נירוסטה נוקשה באורך 20 ס"מ ולא קורוזיבי דרך נימי זכוכית, מה שהופך לולאה קטנה באורך מילימטר אחד בחלק העליון. מניחים טיפה קטנה של לק ברור על קצה נימי הכיתה, בין נימי לולאת חוט להחזיק אותו במקום, הקפדה לא לקבל כל לק על חלק הלולאה, כפי שהוא עלול לפגוע בעוברים.ואז תן לו להתייבש. השתמשו בקלטת מעבדה כדי לחבר את נימי הזכוכית עם הלולאה על מקל אכילה מעץ, והשאירו כשני סנטימטרים וחצי של נימי הזכוכית המשתרעים מעבר למקל האכילה, כך שחלק מקל האכילה של הכלי לא טובל במים מאוחר יותר. בצלחת פטרי מזכוכית 100 מילימטר עם מרית פלסטיק, להפיץ כ 0.5 מיליליטר של תאית מתיל 2% ליד מרכז התחתון דק באופן שווה לעובי של כ 0.5 מילימטרים.יוצקים כ-30 מיליליטר של שליש מהתספוס של רינגר לצד המנה, ומאפשרים לה להתפשט לשאר המנה ולכסות את תאית המתיל. מניחים בעבר עוברים de-chorionated בתא 256 לשלב תא K אחד על 2%מתיל תאית, לוודא העוברים מכוונים על הצד שלהם. כדי לקצוץ את בלסטולה, השתמש בלולאת התיל כדי לחתוך ליד מוט החיות, בניצב לציר הצמחייה של בעלי החיים ולנתק כ -30 עד 40% מתאים blastoderm.לאחר מכן הקישו בעדינות על הקצוות יחד כדי לעזור לתאים הנותרים להידבק לאחור. עבור חלמון, להשתמש בחוט רכוב לעשות פצע קטן ליד מוט צמחי על ידי ניקס קרום הביצה, אשר יגרום החלמון לטפטף החוצה במשך כמה דקות, ולאחר מכן לרפא. כאשר החלמון מפסיק לטפטף החוצה, להשתמש פיפטה כדי להזיז את העובר מחוץ תאית מתיל באותה מנה להתאוששות.חזור blastula וחיתוך חלמון עבור כל העוברים, ולאחר מכן להשאיר את המנה באין מפריע במשך 30 דקות בעוד העוברים להתאושש. לאחר מכן, השתמש פיפטה זכוכית להעביר את העוברים לצלחת זכוכית 35 מילימטר שהוכן בעבר המכיל פתרון טרי שליש רינגר ולמקום אותם 28.5 מעלות צלזיוס אינקובטור כדי לאפשר התאוששות מלאה לפני שתמשיך עם הדמיה. לאחר ביצוע שני שלבים חיתוך עם blastula וחלמון, עוברים הראו מורפולוגיה הכוללת נורמלי לכאורה לאורך כל השלבים ההתפתחותיים לעומת עוברי הבקרה, מלבד הבדל גודל.מצד שני, עוברים קצוצים בלבד הראו מורפולוגיה מוזרה, במיוחד בשלבים מוקדמים יותר. במהלך האפיבולי, לעוברים היה מראה מכווץ ומוסט פנימה. בשלב הסופי הבא, מבנים קוויים בינוניים נמצאו שטוחים ברמות אקסיאליות רבות.בשלבים מאוחרים יותר, מבני הגוף הסמוכים לחלמון, כגון האמצע וההידברבריין עדיין הראו צורה שטוחה יחסית, אולי בשל מתח מוגבר מהחלמון הגדול יחסית. דימות זמן לשגות של היווצרות somite הראה כי הן בשליטה עוברים קצוצים, הגדלים של somites שנוצרו בשלבים מאוחרים יותר היו קטנים יותר בהשוואה לאלה של שלבים קודמים. כמו כן, לאורך כל שלבי היווצרות somite, עוברים קצוצים היו somites קטן יותר מאשר אלה בעוברים שליטה.כאשר טכניקת החיתוך הדו-שלבית בוצעה על קרום mCherry הזריק עוברים, הדמיה של חוטי השדרה שלהם ב 20 שעות לאחר ההפריה הראה ירידה בגבהים צינור עצבי עקב הפחתת גודל. חיתוך שני שלבים חשוב מאוד להשיג עוברים קטנים יותר אך נורמליים אחרת ביעילות גבוהה. חשוב לזכור לא לקצוץ את החלמון תוך חיתוך תאים מהברסטולה.עבור חלמון, לעשות פצע זעיר על זה עבור התוכן לטפטף החוצה. וממברנה החלמון תחלים באופן טבעי במאגר הנכון. מכיוון שניתן לשחזר את העוברים הקצוצים במהירות, ניתן ליישם כל שיטה או ניתוח לעוברים רגילים בשיטת הפחתת הגודל.הפשטות והרבגוניות של טכניקה זו היא חזקה מאוד כמו כל אחד יכול להציג טכניקה זו כדי ללמוד בעיה קנה מידה בכל רקמה או איבר זברה. אנו מאמינים שבטכניקה זו חוקרים יכולים להתמודד עם בעיות קנה מידה במגוון מערכות שלא נגעו בהן בעבר. כבר עשינו תגליות חשובות בהרחבה של דפוסי צינורות עלובים ונוירונים.

surgical-size-reduction-zebrafish-for-study-embryonic-pattern

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

ביולוגיה התפתחותית

תהליכים התפתחותיים כגון התפשטות, דפוסים, בידול, והדרכה האקסון יכולים להיות מודל בקלות בחוט השדרה דג הזברה. במאמר זה, אנו מתארים הליך הרכבה לעוברי דג הזברה, אשר מייעל את ההדמיה של אירועים אלה.

נתיחה והרכבה לרוחב של עוברי דג הזברה: ניתוח התפתחות חוט השדרה

לאחר חיתוך רוחב השדרה, יש דג הזברה מבוגר התאוששות תפקודית על ידי שישה שבועות לאחר פציעה. כדי לנצל את שקיפות זחל והתאוששות מהירה יותר, אנו מציגים שיטה לtransecting חוט השדרה הזחל. לאחר חיתוך רוחב, אנו צופים התאוששות חושית מתחילים ב 2 ימים שלאחר פציעה, ותנועת C-עיקול על ידי 3 ימים לאחר פציעה.

חיתוך רוחב חוט השדרה בדג הזברה הזחל

דג הזברה הוא מערכת מודל מצוינת למחקרים גנטיים והתפתחותיים. השתלת חרוזים היא טכניקה חשובה למניפולציה של רקמות שניתן להשתמש בה כדי לחקור מנגנוני התפתחות על ידי הכנסת שינויים בסביבות תאיות מקומיות. פרוטוקול זה מתאר כיצד לבצע השתלת מיקרו-חרוזים בעובר דג הזברה.

Microbead השרשה בעובר דג הזברה

Microinjection של דג זברה עוברי וזחלים היא טכניקה חיונית ומאתגרת המשמשים דגמים רבים של דג זברה. כאן, אנו מציגים מגוון רחב של כלים microscale כדי לסייע ייצוב והכיוון של דג זברה הן microinjection והן הדמיה.

Microstructured מכשירי Microinjection אופטימיזציה והדימות של הזחלים דג זברה

כאן אנו להפגין שיטה לכמת את גודל הכבד בזחל zebrafish, מתן דרך להעריך את ההשפעות של מניפולציות גנטיות ופרמקולוגית על גידול בכבד ופיתוח.

בדיקת גודל הכבד בזחל זברה באמצעות מיקרוסקופ ברייטפילד

כאן, אנו מציגים את הפרוטוקול לתרבות רקמות תלת-ממדית של ציר הגוף האחורי של דג הזברה, המאפשר מחקר חי של פילוח בעלי חוליות. מודל הסבר זה מספק שליטה על התארכות הציר, שינוי מקורות מורפוגן והדמיה חיה ברמת הרקמה בתת-תאיות.

תרבות הסבר זנב תלת-ממדית לחקר פילוח בעלי חוליות בזברהפיש

מניפולציות עובריות כגון סילוק והשתלת תאים הן כלים חשובים לחקר ההתפתחות המוקדמת. פרוטוקול זה מתאר מכשיר השתלה פשוט ויעיל לביצוע מניפולציות אלה בעוברי דגי זברה.

מכשיר השתלה פשוט ויעיל לעוברי דגי זברה

בהירות אופטית היא יתרון משמעותי לעבודה הביולוגית והפיזיולוגית של התא בדגי זברה. מתוארות שיטות חזקות למדידת צמיחת תאים בבעלי חיים בודדים המאפשרות תובנות חדשות על האופן שבו צמיחת שרירי השלד והרקמות השכנות משולבת עם צמיחת כל הגוף.

מדידה בזמן אמת וחוזרת ונשנית של גדילת שרירי השלד אצל דגי זברה חיים בודדים הנתונים לשינויים בפעילות החשמלית

פרוטוקול זה מתאר את הקציר וההדמיה של קשקשים אלסמואידים של דגי זברה במהלך התחדשות in vivo . בנוסף, תרבות ex vivo של קשקשים אלה עד 7 ימים לאחר הקציר מוצג.

התחדשות סולם דגי זברה בתרבות הקשקשים של טוטו ואקס ויוו

פרוטוקול זה מציע שיטה לחקר דינמיקה תאית באמצעות טכניקה פשוטה של תרבית חוץ גופית . הוא מספק הזדמנות לחוקרי דגי זברה ולמחנכים לחקור תהליכים תאיים, כגון אלה הקשורים להומאוסטזיס עצם ולביולוגיה בסיסית של התא, על ידי הדמיה של גרעינים פלואורסצנטיים ותאים אפופטוטיים בתוך הקשקשים.

טכניקת תרבית חוץ גופית לחקר דינמיקה תאית בסקאלות דגי זברה

עבודה זו מתארת פרוטוקול לכימות צורת הסחוס הקרניופציאלי באמצעות תוכנה חופשית (tpsDigs2, MorphoJ ו-PAST) למדידת שינויים במבנה הפנים של זחלי דגי זברה.

ניתוחים מורפומטריים של צורה: ארגז כלים לתוכנת ניתוח לכימות צורת קרניופנים בדגי זברה

למד טכניקת הפחתת גודל כירורגי בזברה-דג לחקר תהליכי סקיילינג עובריים. השיטה מאפשרת צפייה בזמן אמת וניתוח כמותי של חוסן התפתחותי מבלי להפריע לתהליכים נורמליים.

הפחתת גודל כירורגי של דג Zebrafish לחקר שינוי גודל של תבנית עובריים

גלה סרטונים נוספים