מידול מבנה רבעוני באמצעות ספקטרומטריית מסה מצטלבת כימית: הרחבת דוחות TX-MS Jupyter

2.5K צפיות

צוטט 2 פעמים

05:18 דק׳

20 באוקטובר 2021

10.3791/60311-v

20 באוקטובר 2021

2.5K צפיות

Hamed Khakzad¹^,² , Swen Vermeul³ , Lars Malmström⁴^,⁵^,⁶

¹Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes, Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, ²Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, ³Scientific IT Services, ETH Zurich, ⁴Institute for Computational Science, University of Zurich, ⁵S3IT, University of Zurich, ⁶Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine, Lund University

ספקטרומטריית מסה חוצה-קישור ממוקדת יוצרת מודלים של מבנה חלבונים רבעוניים באמצעות נתוני ספקטרומטריית מסה שנרכשו באמצעות עד שלושה פרוטוקולי רכישה שונים. כאשר התוצאות מבוצעות כזרימת עבודה פשוטה יותר בשרת האינטרנט של צ'יטה-MS, התוצאות מדווחות במחברת Jupyter. כאן, אנו מדגימים את ההיבטים הטכניים של האופן שבו ניתן להרחיב את מחברת Jupyter לניתוח מעמיק יותר.