Name: המסה ספקטרומטר מודרמטריה מונחה הגנום ככלי לחשוף מוצרים טבעיים הרומן (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-03-12T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 13 s
Description: למד שיטת כריית גנום מונחית ספקטרומטריית מסה לזיהוי מולקולות ביואקטיביות מתמציות מיקרוביאליות וצמחיות. הפרוטוקול משלב ריצוף גנום, LC-MS/MS ורשתות מולקולריות לגילוי יעיל של תרכובות טבעיות חדשות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

התמיכה הפיננסית עבור מחקר זה סופק על ידי הקרן סאו פאולו מחקר-FAPESP (2019/10564-5, 2014/12727-5 ו 2014/50249-8 ל-L. G. O; 2013/12598-8 ו 2015/01013-4 כדי R.S.; ו 2019/08853-9 ל-C. f. F. A). B. S. P, C.F.F.A., ו L.G.O. קיבל מלגות מן המועצה הלאומית לפיתוח טכנולוגי מדעי-CNPq (205729/2018-5, 162191/2015-4, ו 313492/2017-4). L.G.O. הוא גם אסיר תודה על התמיכה המענק שסופקו על ידי התוכנית עבור נשים במדע (2008, הברזילאי Edition). כל המחברים מכירים בגלימות (תאום לשיפור אנשי ההשכלה הגבוהה) לתמיכה בתוכניות שלאחר הסיום בברזיל.

. למחברים אין מה לגלות

היתרון החזק ביותר של פרוטוקול זה הוא היכולת שלה במהירות dereplicate פרופילים מטבוליים וגשר מידע גנומי עם נתוני MS כדי להבהיר את המבנים של מולקולות חדשות, במיוחד אנלוגיות מבניים2. מבוסס על מידע גנומי, כימוכ מוצרים טבעיים שונים ניתן לחקור, כגון polyketides (PK), פפטידים לא ריבוזומבית (NRP), ומוצרים טבעיים הגליסיטיים (התוצר הטבעי), כמו גם מוזר BGCs. Metabolomic הקרנת הראיות של פרופילי BGC הופעל מגוון כימי המיוצר על ידי לפיכך, BGC ניתן לשכפל לייצור ישיר של תרכובת חדשה או אנלוגית לא ידוע הקשורים BGC יד...

חקירת חילוף החומרים המשני מורכבת לעתים קרובות מסינון תמציות גולמי לפעילות ביולוגית מסוימת ולאחריה טיהור, זיהוי ואפיון של המרכיבים השייכים לשברים פעילים. תהליך זה הוכיח כיעיל, ומקדם את הבידוד של מספר ישויות כימיות. עם זאת, כיום זה נראה בלתי אפשרי, בעיקר בשל שיעור גבוה של גילוי מחדש. כמו תעשיית התרופות מהפכה ללא ידיעת תפקידים ופונקציות של מטבוליטים מיוחדים, הזיהוי שלהם בוצע בתנאי מעבדה שלא מייצגים במדויק את הטבע1. כיום, יש הבנה טובה יותר של השפעות האיתות הטבעי, הפרשה, ואת הנוכחות של רוב היעדים בריכוזים נמוכים באופן בלתי סביר. בנוסף, התקנת התהליך תסייע לקהילה האקדמית ולתעשייה הפרמצבטית לנצל את הידע הזה. זה יהיה גם ליהנות מחקר הכרוך בבידוד ישיר של מטבוליטים הקשורים אשכולות גנים ביולוגיים שקטים (BGCs)2.
בהקשר זה, ההתקדמות ברצף גנומית יש עניין מחודש בהקרנה מיקרואורגניזם מטבוליטים. זה בגלל ניתוח מידע גנומי של אשכולות ביולוגיים חשף יכול לחשוף גנים קידוד תרכובות הרומן לא נצפתה או מופק בתנאי מעבדה. פרויקטים רבים של הגנום מחיידקים או טיוטות זמינים היום, ואת המספר גדל מדי שנה, מתן סיכויים מסיבי לגילוי מולקולות אקטיביים הרומן דרך כריית3הגנום 3,4.
האטלס של ביוסינתטי אשכולות גנים הוא האוסף הנוכחי הגדול ביותר של כבוש באופן אוטומטי אשכולות גנים כרכיב של פלטפורמת חיידקים משולבים Genomes של הגנום משותף המכון (JGI IMG-ABC)2. לאחרונה, את המידע המינימלי עבור אשכולות גנים Biosynthetic (MIBiG) היוזמה לקדם את הביאור הידני של BGCs, מתן התייחסות באופן מאוד משמעותי לערכת נתונים5. כיום, שפע של כלים זמינים כדי לאפשר כרייה חישובית של נתונים גנטיים ואת הקשר שלהם הידוע מטבוליטים משני. אסטרטגיות שונות פותחו גם כדי גישה מוצרים טבעיים אקטיביים החדש (כלומר, ביטוי הטרוולוגי, מחיקת גנים היעד, באופן מתורבת החוקה, רצף גנומית, איזוטופ מונחה ההקרנה [genomisotopic גישה], מניפולציה של ורגולטורים מקומיים וגלובליים, התנגדות מבוסס היעד הכרייה, תרבות הכרייה עצמאית, ו, לאחרונה, MS-מונחה/קוד גישות2,6,7,8,9, 10,11,12,13,14,15).
כריית הגנום כאסטרטגיה יחיד דורש מאמצים כדי להוסיף קבוצה אחת או קטנה של מולקולות; לפיכך, הפערים בתהליך נותרים, בהם תרכובות חדשות מעדיפות לבידוד ומבנה. בעיקרון, גישות אלה מתמקדות רק מסלול ביו-סינתטי אחד לכל ניסוי, ובכך התוצאה היא שיעור גילוי איטי. במובן זה, שימוש ב-GM יחד עם גישה לרשת מולקולרית מייצג מקדמה חשובה עבור מחקר המוצר הטבעי14,15.
רב-תכליתיות, דיוק, ורגישות גבוהה של הספקטרומטר כרומטוגרפיה נוזלי (LC-MS) להפוך אותו שיטה טובה לזיהוי מורכב. כיום, מספר פלטפורמות השקיעו אלגוריתמים וחבילות תוכנה עבור טבולומיקס ממוקדות16,17,18,19,20. הליבה של תוכניות אלה כוללת זיהוי תכונות (שיא איסוף)21 ויישור שיא, אשר מאפשר התאמה של תכונות זהות על גבי קבוצה של דגימות וחיפוש דפוסים. MS מבוססי דפוס אלגוריתמים22, 23 להשוות23 דפוסי פיצול אופייני ולהתאים MS2 קווי דמיון יצירת משפחות מולקולריות שיתוף תכונות מבניות. תכונות אלה יכולים להיות מודגשים ומקובצים באשכולות, הענקת היכולת לגלות במהירות מולקולות ידועות ובלתי ידועות מתוך תמצית ביולוגית מורכבת על ידי זוגשני MS,24,25. לכן, במקביל MS היא שיטה רב-תכליתית כדי לצבור מידע מבני מספר כימוסוגים הכלולים בכמות גדולה של נתונים בו זמנית.
האלגוריתם הגלובלי של מוצרים טבעיים (GNPS)26 משתמש בעוצמה המנורמלת של יוני השבר כדי לבנות וקטורים רב-ממדיים, שבהם ההשוואה משולה באמצעות פונקציית קוסינוס. הקשר בין יוני הורים שונים מותווים בייצוג בדיאגרמה, בו כל פיצול מוגדר כצומת (עיגולים), והשוליים החוזרים של כל צומת מוגדרים על-ידי קצה (קווים). ההדמיה הגלובלית של מולקולות ממקור אחד מוגדרת כרשת מולקולרית. מולקולות מתבשמות שרסיס באופן ייחודי יוצרות את האשכול או קבוצת הכוכבים הספציפיים שלהם, ואילו מולקולות קשורות מצרר יחד. סוגי כימוא של האשכולות מאפשר חיבור היפותטי של תכונות מבניות דומות למקורות הביוסינתטיים שלהם.
שילוב הן כימוסוג-אל-גנוטיפ וגישות גנוטיפ-אל-כימוסוג היא רבת עוצמה בעת יצירת קישורים בביואינפורמטיקה בין BGCs ומוצרים קטנים שלהם מולקולה27. לכן, MS-מונחה הגנום הכרייה היא שיטה מהירה והאסטרטגיה הנמוכה צורכת חומר, והוא מסייע בגשר יוני הורים מסלולים biosynthetic שנחשף על ידי WGS של אחד או יותר זנים תחת מגוון תנאים סביבתיים מטבולית.
זרימת העבודה של פרוטוקול זה (איור 1) כוללת האכלה של נתוני wgs לתוך פלטפורמת ביאור לאשכול גנים ביוסינתטיים כגון antismash28,29,30. זה עוזר להעריך את מגוון תרכובות ומעמד של תרכובות מקודד על ידי הגנום. אסטרטגיה כדי למקד את האשכולות גנים biosynthetic קידוד ישות כימית של עניין חייב להיות מאומץ, ותמציות התרבות מתוך זן סוג פראי ו/או זן הטרוולוגי המכיל את bgc ניתן לנתח כדי ליצור יונים מקובצים בהתבסס על קווי דמיון באמצעות gnps26,31. כתוצאה מכך, ניתן לזהות מולקולות חדשות המשייכים למוקד ה-BGC המיועד ואינן זמינות במסד הנתונים (בעיקר מקבילים לא ידועים, המיוצרים לעתים בפתיתים נמוכים). זה רלוונטי לשקול כי משתמשים יכולים לתרום פלטפורמות אלה וכי הזמינות של ביואינפורמטיקה ו-MS/MS נתונים גדל במהירות, נהיגה לפיתוח קבוע ושדרוג של כלים חישוביים יעילים ואלגוריתמים כדי להנחות התקשרויות יעילות של תמציות מורכבות עם מולקולות.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/60825/60825fig1b.jpg"> איור 1: מבט כולל על זרימת העבודה כולה. מוצג הוא איור של שלבי ביוטכנולוגיה, שיבוט, והתקשורת המולקולרית מעורבים גישה מונחה הגנום MS-מודרך כדי לזהות מטבוליטים חדשים. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/60825/60825fig1blarge.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.</a>
פרוטוקול זה מתאר זרימת עבודה מהירה ויעילה כדי לשלב את כריית הגנום ואת הרשת המולקולרית כנקודת התחלה של צינור גילוי המוצר הטבעי. למרות יישומים רבים מסוגלים להמחיש את הרכב ומחדש של מולקולות לזיהוי MS ברשת אחת, מספר מאומצים כאן כדי להמחיש באופן מבנית מולקולות באשכולות דומים. באמצעות אסטרטגיה זו, מוצרים cyclodepsipeptide הרומן נצפתה בתמציות מטבולית של Streptomyces SP. CBMAI 2042 מזוהים בהצלחה. מודרך על ידי כריית הגנום, כל האשכולות גנים biosynthetic כל הקידוד עבור valinomycins הוא מוכר ומשוכפל לתוך זן המפיק Streptomyces co olor M1146. בסופו של דבר, בעקבות רשת מולקולרית המבוסס על תבנית MS, המולקולות שזוהו על ידי MS הם בקורלציה עם BGCs אחראי על biogenesis32שלהם.

<table><tbody><tr><td>אצטוניטריל</td><td>טדיה</td><td>AA1120-048</td><td>HPLC כיתה</td></tr><tr><td>אגר</td><td>אוקסואיד</td><td>LP0011</td><td>NA</td></tr><tr><td>אפרמיצין</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>A2024</td><td>NA</td></tr><tr><td>קרבניצילין</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>C9231</td><td>NA</td></tr><tr><td>צנטריפוגה</td><td>אפנדורף</td><td>NA</td><td>5804</td></tr><tr><td>כלורמפניקול</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>C3175</td><td>NA</td></tr><tr><td>טור C18</td><td>Agilent Technologies</td><td>NA</td><td>ZORBAX RRHD Extend-C18, 80&Aring;, 2.1 x 50 מ"מ, 1.8 & מיקרו; M, מגבלת לחץ של 1200 בר P/N 757700-902</td></tr><tr><td>Kanamycin</td><td>Sigma Aldrich</td><td>K1377</td><td>NA</td></tr><tr><td>Manitol P.A.- A.C.S.</td><td>Synth</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>NA מיקרוצנטריפוגה</td><td>Eppendorf</td><td>NA</td><td>5418</td></tr><tr><td>חומצה Nalidixic</td><td>Sigma Aldrich</td><td>N4382</td><td></td></tr><tr><td>NA Phusion Flash High-Fidelity PCR Master Mix</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>F548S</td><td>NA</td></tr><tr><td>Q-TOF ספקטרומטר מסה</td><td>Agilent technologies</td><td>NA</td><td>6550 iFunnel Q-TOF LC/MS</td></tr><tr><td>Sacarose P.A.- A.C.S.</td><td>Synth</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>שייקר/אינקובטור</td><td>Marconi</td><td>MA420</td><td>NA</td></tr><tr><td>נתרן כלורי</td><td>Synth</td><td>NA</td><td>P. A. - ACS</td></tr><tr><td>תמצית סויה</td><td>NA</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>NA NA Sucrose</td><td>Synth</td><td>NA</td><td>P. A. - ACS</td></tr><tr><td>מחזורים תרמיים</td><td>Eppendorf</td><td>NA</td><td>Mastercycler Nexus Gradient</td></tr><tr><td>Thiostrepton</td><td>Sigma Aldrich</td><td>T8902</td><td>NA</td></tr><tr><td>טריפטון</td><td>אוקסואיד</td><td>LP0042</td><td>NA</td></tr><tr><td>טריפטון מרק סויה</td><td>אוקסואיד</td><td>CM0129</td><td>NA</td></tr><tr><td>UPLC</td><td>Agilent Technologies</td><td>NA</td><td>1290 Infinity LC System</td></tr><tr><td>תמצית שמרים</td><td>אוקסואיד</td><td>LP0021</td><td>NA</td></tr></tbody></table>

המסה ספקטרומטר מודרמטריה מונחה הגנום ככלי לחשוף מוצרים טבעיים הרומן

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

המרחב הכימי המכוסה על-ידי מוצרים טבעיים הוא עצום ובלתי מוכר באופן נרחב. לכן, מתודולוגיות נוחות לביצוע הערכה נרחבת של התפקודים שלהם בטבע והטבות אנושיות פוטנציאליות (לדוגמה, עבור יישומים של גילוי סמים), רצוי. פרוטוקול זה מתאר את השילוב של כריית הגנום (GM) ורשת מולקולרית (MN), שתי גישות עכשוויות התואמות גנים מקודד אשכולות ביאורים כל רצף הגנום עם חתימות מבנה כימי מתמציות מטבולית גולמי. זהו הצעד הראשון לקראת גילוי של ישויות טבעיות חדשות. מושגים אלה, כאשר מיושם יחד, מוגדרים כאן כריית הגנום MS-מונחה. בשיטה זו, הרכיבים העיקריים מיועדים קודם לכן (באמצעות MN), ומועמדים חדשים הקשורים באופן מבחינה מבנית קשורים ביאורים רצף הגנום (באמצעות GM). שילוב GM ו-MN היא אסטרטגיה רווחית כדי למקד מולקולה חדשה שדרות או לקצור פרופילים מטבוליים כדי לזהות אנלוגיות מן התרכובות ידוע כבר.

הפרוטוקול בוצע בהצלחה באמצעות שילוב של כריית הגנום, ביטוי הטרוולוגי, ו-MS-מונחה קוד גישות לגשת מולקולות מיוחדות valinomycin אנלוגיות מיוחדים. תהליך הגנום למולקולה עבור היעד, valinomycin (VLM), מיוצג באיור 8. Streptomyces SP. CBMAI 2042 הגנום הטיוטה נותחו ב סיליקו, ואשכול הגן של vlm זוהה אז והועבר לפונדקאי הטרוולוגי. הטרוולוגי וזנים מסוג פראי טיפחו בטרילקאט בתנאי תסיסה נאותים, למחיצות עם אצטט אתיל, ומרוכז לייצר את התמצית גולמי. מן המוצר, MS/MS נתונים נרכש כדי ליצור פרופיל מטבוליט MS ...

פרוטוקול הכרייה ההמוני-מונחה הגנום מבוסס ומתואר כאן. הוא מבוסס על מידע רצף הגנום ו-LC-MS/MS ניתוח ומטרתו להקל על זיהוי של מולקולות מחיידקים מורכבים ותמציות צמחים.

The chemical space covered by natural products is immense and widely unrecognized. Therefore, convenient methodologies to perform wide-ranging evaluation ...

ריצוף גנום שלם, כריית גנום ורישת מולקולרית מהווים את הבסיס למדריך ספקטרומטריית המסה שפרוטוקול כריית הגנום שאנו מתארים כאן. והם הגישה העכשווית ביותר בגילוי מוצרים טבעיים. כריית גנום ורישת מולקולרית תואמות באשכול, ביאורים מקודדים ברצף גנום שלם עם חתימות ארגון מחדש כימיות מתמציות גולמיות המספקות סיכויים עצומים לחשיפת טבור על ידי מולקולות פעילות.באופן עקרוני, כריית גנום מטרות יחיד או קבוצה קטנה של מולקולות לכל ניסוי. ובכך וכתוצאה מכך קצב גילוי איטי. במובן זה, שימוש בכריית גנום יחד עם נטוורקינג מולקולרי מייצג התקדמות חשובה למחקר מוצרים טבעיים.ספקטרומטריית מסה מדריך-גנום כרייה היא שיטה רב-תכליתית אשר יכול לבנות מידע של מספר כימוטיפים הכלולים בכמות גדולה של נתונים מתמצית גולמית בו זמנית. כיום זוהי מתודולוגיה לטווח גבוה המסוגלת לחקור את רצף החיידקים, הפטריות או הצמחים. כימוטיפ לגנוטיפ וגנוטיפ לביואינפורמטיקה של כימוטיפים מקשרים בין אשכולות ביוסינתטיים והם מוצרי מולקולות קטנות.שמיעת הפרוטוקול הוכח לאפיון מעמקי מחזור טבור מוצרי פפטיד שנצפו בתמציות מטבוליות של מיני סטרפטומיצ'יס. אבל זה ישים רצף פטרייתי וצמחים ותמציות גם כן. חשוב מאוד לאצור יפה ערכת נתונים של הגנום וכיום רצפי טיוטה מקוטעים הופכים יותר ויותר על ידי נתוני רצף כמעט גמורים.כמו כן, פותחו אסטרטגיות שונות כדי לגשת למוצרים טבעיים ביו-

mass-spectrometry-guided-genome-mining-as-tool-to-uncover-novel

Research

JoVE Journal

Chemistry

כימיה

פרופיל מטבוליט לא ממוקד על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים במיוחד בשילוב עם ספקטרומטריית מסה (UPLC-MS) היא טכניקה רבת עוצמה לחקירת חילוף החומרים.  מאמר זה מתאר זרימת עבודה טיפוסית המשמשת לפרופיל מטבוליט לא ממוקד של סרום, כולל ארגון והכנת דגימות, רכישת נתונים, ניתוח נתונים, בקרת איכות וזיהוי מטבוליטים.

בקנה מידה גדול Profiling metabolomic ללא ממוקד של סרום על ידי כרומטוגרפיה נוזלית ביצועים-Mass ספקטרומטריית Ultra (UPLC-MS)

השליח השני c-di-GMP הנפוץ בכל מקום שולט בגדילה ובהתנהגות של חיידקים רבים. פיתחנו טכנולוגיה חדשה המבוססת על ספקטרומטריית מסה של תרכובת לכידה לזיהוי ואפיון ביוכימי של חלבונים קושרים c-di-GMP כמעט בכל מין חיידקים.

ספקטרומטריית מתחם מיסת לכידה - כלי רב עוצמה לזיהוי הרומן ג-di-GMP חלבונים מפעיל

כאן אנו מציגים פרוטוקול מפורט של (א) זיהוי של מוצר טבעי עם פעילות אנטיביוטית, (B) הטיהור של המתחם, (ג) את הדגם הראשון של ביוסינתזה שלה, (ד) הגנום רצף / -mining ואת ( E) אימות של אשכול גני biosynthetic.

ממוצר טבעי כדי המצרר שלו biosynthetic ג'ין: הפגנה שימוש Polyketomycin מ Streptomyces diastatochromogenes Tü6028

פרוטוקול זה מתאר תפוקת יחיד של שיטות אנליטיות, טכנולוגיות משלימים לשיאה אפיון מלא-זוגי של חומר אורגני טבעי, פרוטאומיקס מיקרוביאלית של מערכות אקולוגיות. גישה זו מאפשרת השוואות חזקים לזיהוי מסלולים מטבוליים והעתקות חשוב המתאר הפקת גז חממה, חיזוי תגובות השינוי הסביבתי.

יחיד-תפוקה משלימים שיטות אנליטיות ברזולוציה גבוהה עבור אפיון תערובות מורכבות חומר אורגני טבעי

סינון פיצול אבחון, מיושם לתוך MZmine, היא גישה אלגנטית, לאחר הרכישה למסך LC-MS/MS datasets עבור מחלקות שלמות של מוצרים טבעיים ידועים ולא ידועים. כלי זה מחפש את MS/MS ספקטרום עבור יוני מוצרים ו/או הפסדים ניטרליים כי האנליסט הגדיר כאבחון עבור המחלקה כולה של תרכובות.

גילוי מוצר טבעי עם סינון פיצול LC-MS/MS: בקשה ניתוח Microcystin

פרוטוקול זה מכסה ניתוח מפורט של הרכב פפטידוגליקן באמצעות ספקטרומטריית מסה של כרומטוגרפיה נוזלית בשילוב עם מיצוי תכונות מתקדם ותוכנת ניתוח ביואינפורמטיקה.

ניתוח כמותי למחצה של פפטידוגליקן על ידי כרומטוגרפיה נוזלית, ספקטרומטריית מסה וביואינפורמטיקה

כאן מתוארת בעיה רב-תחומית לגילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוטוקסינים נלווים. זה מאפשר זיהוי של ציאנובקטריה וציאנוקסינים הקשורים בדגימות מים ומטריצות אורגניות, כגון דגימות דו-כיווניות, תוך 24 שעות.

גילוי מוקדם של פריחות ציאנובקטריאליות וציאנוקסינים נלווים באמצעות אסטרטגיית זיהוי מהירה

אפיון ספקטרומטרי של מסה של נוירופפטידים מספק מידע על רצף, כמות ולוקליזציה. זרימת עבודה אופטימלית זו שימושית לא רק למחקרי נוירופפטידים, אלא גם לפפטידים אנדוגניים אחרים. הפרוטוקולים המובאים כאן מתארים הכנת דגימות, רכישת טרשת נפוצה, ניתוח טרשת נפוצה ויצירת מסדי נתונים של נוירופפטידים באמצעות LC-ESI-MS, איתור MALDI-MS והדמיית MALDI-MS.

חקירה ספקטרומטרית מסה רבת פנים של נוירופפטידים בקלינקטס ספידוס

בנינו זרימת עבודה מטבולית לא ממוקדת ששילבה את XY-Meta ו-metaX יחד. בפרוטוקול זה, הצגנו כיצד להשתמש ב- XY-Meta כדי ליצור ספרייה ספקטרלית מתוך הפניה לספקטרה בגישה פתוחה, ולאחר מכן ביצענו בקרת FDR והשתמשנו במטה-X כדי להגדיל את המטבוליטים לאחר זיהוי ספקטרום המטבולומיקה.

זרימת עבודה משולבת של זיהוי וכימות במטבולום לא ממוקד מבוסס בקרת FDR

אנו מציגים שיטה לביאור וסיווג מבוססי ספקטרומטריית מסה מהירה (MS)/ספקטרומטריית מסה (MS) של אלקלואידים טרופאניים, שימושית הן לשכפול ראשוני של דגימות המכילות טרופאן והן לגילוי אלקלואידים חדשים לבידוד.

יישומים של ספקטרומטריית מסה טנדם כרומטוגרפיה נוזלית במחקר מוצרים טבעיים: אלקלואידים טרופאן כמקרה בוחן

למד שיטת כריית גנום מונחית ספקטרומטריית מסה לזיהוי מולקולות ביואקטיביות מתמציות מיקרוביאליות וצמחיות. הפרוטוקול משלב ריצוף גנום, LC-MS/MS ורשתות מולקולריות לגילוי יעיל של תרכובות טבעיות חדשות.

המסה ספקטרומטר מודרמטריה מונחה הגנום ככלי לחשוף מוצרים טבעיים הרומן

גלה סרטונים נוספים