בחירה בסיוע של סמנים ביולוגיים לפי גודל אפקט ניתוח מפלה ליניארי (LEfSe) בנתוני מיקרוביום
22.1K צפיות
•
צוטט 81 פעמים
•
04:57 דק׳
•
16 במאי 2022
DOI :10.3791/61715-v
16 במאי 2022
•22.1K צפיות
1Marine Resources Research Centre, Tianjin Research Institute for Water Transport Engineering, M.O.T., 2Key Laboratory of Regional Energy Systems Optimization, Ministry of Education, College of Environmental Science and Engineering, North China Electric Power University, 3School of Environmental Science and Engineering, Huazhong University of Science and Technology
* These authors contributed equally
LEfSe (גודל אפקט LDA) הוא כלי לכריית סמנים ביולוגיים בממדים גבוהים לזיהוי תכונות גנומיות (כגון גנים, מסלולים וטקסונומיות) המאפיינות באופן משמעותי שתי קבוצות או יותר בנתוני מיקרוביום.
Chapters in this video
0:04
Introduction
0:39
Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) Native Analysis
1:49
LEfSe Online Analysis (Galaxy)
3:05
Results: Representative Microbiome LEfSe Characterization
4:21
Conclusion
Related Videos
זכויות יוצרים © 2026 MyJoVE Corporation. כל הזכויות שמורות.