הרכבה הגנום ההיברידית דה נובו לייצור גנומים שלמים של חיידקי השתן באמצעות טכנולוגיות רצף קצרות וארוכות

7.8K צפיות

צוטט 9 פעמים

12:08 דק׳

20 באוגוסט 2021

10.3791/62872-v

20 באוגוסט 2021

7.8K צפיות

פרוטוקול זה מפרט גישה מקיפה עבור כתות, רצף, ואת הרכב הגנום ההיברידי דה נובו של חיידקי השתן. הוא מספק הליך לשחזור ליצירת רצפי גנום מעגליים שלמים שימושיים בחקר יסודות גנטיים כרומוזומליים ואקסטרכרומוזומליים התורמים לקולוניזציה של שתן, פתוגנזה והפצת התנגדות מיקרוביאלית.

גלה סרטונים נוספים

Nanopore

Chapters in this video

0:04

Introduction

1:00

dsDNA Pool Cleanup and Concentration

3:25

Sequence the Genome Library

5:14

Long (MinION) Reads

6:55

Generating Hybrid Genome Assembly

8:34

Assessing Assembly Quality

9:34

Genome Annotation

10:07

Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria

11:37

Conclusion

Related Videos