Name: בסיטו הכלאה בזחלי זברה וצעירים במהלך פיתוח מסונפרוס (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-08-13T14:45:00.000+00:00
Duration: 8 min 16 s
Description: למדו פרוטוקול הכלאה בסיטו לזיהוי ביטוי גנים בזחלי זברה וצעירים במהלך פיתוח המסונפרוס. השיטה משפרת חדירת בדיקה והדמיה לחקר ביולוגיה התפתחותית.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

המימון ניתן על ידי האקדמיה למדע של פנסילבניה, וחבר העמים של פנסילבניה ביולוגים, ואוניברסיטת אינדיאנה של פנסילבניה (בית הספר ללימודים מתקדמים ומחקר, המחלקה לביולוגיה, ואת סינתיה Sushak לתואר ראשון ביולוגיה הקרן למצוינות). הקו הטרנסגני Tg (lhx1a-EGFP) סופק על ידי ד"ר ניל הוקריגה (אוניברסיטת פיטסבורג).

השימוש בזחלי דגי זברה וצעירים מאושר על ידי IUP IACUC (פרוטוקול #02-1920, #08-1920). פרטי תוכן הפתרון מפורטים ברשימת החומרים.
1. גידול זחלים
הערה: זה ייקח עד 21 ימים או יותר כדי להעלות זחלים וצעירים לשלב של עניין.
<ol><li>הקימו דגי זברה בוגרים להזדווג על ידי הוספת דג זכר אחד ונקבה במיכל הזדווגות בשעות אחר הצהריים המאוחרות לאחר הארוחה האחרונה שלהם. הערה: לא כל זוגות הדגים יתזדווגו. התחל על ידי הגדרת 20 זוגות כדי לקבוע את קצב ההזדווגות ולהתאים בהתאם בניסויים עתידיים.</li>
	<li>למחרת לאחר שהדגים סיימו להזדווג (בסביבות השעה 13:00), אוספים את העוברים עם בינוני E3 בצלחות פטרי.<ol>
<li>ודא כי אין יותר מ 30 עוברים לכל צלחת.</li>
		<li>הסר פסולת (כגון צואה) מלוחות פטרי ולהוסיף 20 מ"ל של בינוני E3.</li>
		<li>דגירה ב 28 °C (5 °F) ליום אחד.</li>
	</ol>
</li>
	<li>תחזיר את דג הזברה הבוגר למערכת הימית.</li>
	<li>ב 1 dpf, להחליף את המדיום E3 עם E3 טרי.<ol>
<li>דגירה ב 28 °C (5 °F) במשך 4 ימים נוספים עד 5 dpf.</li>
	</ol>
</li>
	<li>שים מסך 400 מיקרומטר במיכל 2.8 L ולמלא אותו עם 2 ס"מ של מי מערכת.<ol>
<li>מוסיפים את 5 זחלי dpf מצלחת אחת (עד 30 זחלים סה"כ).</li>
		<li>שים את המיכל במערכת הימית, אבל לא להתחיל את זרימת המים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>להאכיל את הזחלים 4 מ"ל של אבקת מזון פעמיים ביום עד 14 dpf.</li>
	<li>ב 6 dpf, להתחיל את זרימת המים ב 1 טפטוף לשנייה. הערה: בדוק את זרימת המים מדי יום ולהתאים בהתאם.</li>
	<li>בשעה 8 dpf, להגביר את זרימת המים לזרם איטי ויציב.</li>
	<li>ב 14 dpf, להאכיל שרימפס מי מלח חי בנוסף אבקת מזון.</li>
</ol>2. יום 1 - 2: תיקון זחלים
<ol><li>הסר מיכל של זחלים בנקודת הזמן הרצויה.</li>
	<li>מלא צלחת פטרי עם 20 מ"ל של מי מערכת.</li>
	<li>השתמשו ברשת רשת עדינה כדי לגרוף בעדינות את הזחלים ולהביא אותם אל פני המים.<ol>
<li>חותכים את קצה פיפטת ההעברה כדי לתת פתח רחב יותר ולהעביר את הזחלים לצלחת פטרי. הפה גדול יותר פיפטה מאפשר העברה של כמה זחלים קטנים או כמה גדולים בבת אחת.</li>
	</ol>
</li>
	<li>הוסף 2 מ"ל של טריקאין (2%, מניית pH 7) כדי לשתק את הזחלים.<ol>
<li>לאחר הזחלים להפסיק לנוע, להסיר את רוב המים ולהוסיף 10 מ"ל של tricaine. המתן 15 דקות עד שהזחלים יומתו.</li>
		<li>אופציונלי: עבור קטינים שאורכם עולה על 8 מ"מ, חתוך את הראשים והזנבות עם סכין גילוח (לאחר המתת חסד) תחת מיקרוסקופ מנתח כדי לשפר את החדירה של פתרון התיקון. הקפד לתעד את האורך הכולל של כל חיה לפני חיתוך הראש והזנב ולבודד כל אחד בצלחת פטרי משלו. עיין בשלב 3 למדידת בעלי החיים.</li>
	</ol>
</li>
	<li>החלף את הטריקיין בפתרון תיקון של 20 מ"ל (4% paraformaldehyde, 1% DMSO). החזירו את המכסה לצלחת הפטרי ותתנדנדו לאט במכסה אדים. הערה: חשוב להשתמש בפלטפורמת נדנדה. פלטפורמה רועדת עם תנועה מעגלית תגרום לציר החי להיות מעוקל. יש להשתמש רק בתמיסת תיקון טרייה (לא קפואה מראש). זהירות: פתרון התיקון מכיל paraformaldehyde, שהוא מסרטן סביר. השתמש מכסה המנוע אדים (או מסכה) וכפפות כדי למדוד את האבקה.</li>
	<li>לאחר 30 דקות, החלף את פתרון התיקון בפתרון תיקון טרי.<ol>
<li>לאסוף את פתרון התיקון המשומש במיכל פסולת נפרד לסילוק נאות.</li>
		<li>העבר את הזחלים לתוך צינור 50 מ"ל המכיל 25 מ"ל של פתרון תיקון טרי.</li>
		<li>ודא את הכובע הוא חזק רוק לאט ב 4 °C (5 °F) במשך 2 ימים. ניתן לדגור זמן רב יותר לנוחות.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. יום 3: מדידת זחלים
<ol><li>במכסה המנוע אדים, להחליף את פתרון התיקון עם 20 מ"ל של PBST.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים לצלחת פטרי.</li>
	<li>שים סרגל שטוח על מיקרוסקופ ניתוח ולשים את צלחת פטרי על גבי הסרגל.</li>
	<li>השתמשו במניפולטור ריסים כדי להזיז כל זחל אל הסרגל כדי למדוד את אורכו הכולל (מהחוט ועד קצה סנפיר התדהמה) (איור 1).</li>
	<li>שלבו מספר זחלים באורכים דומים (למשל, 5.0 מ"מ ו-5.1 מ"מ) ל בקבוקון זכוכית אחד של 5.5 מ"ל, עד 10 זחלים ל בקבוקון.</li>
</ol>4. יום 3 – 4: התייבשות
<ol><li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של 100% מתנול. רוק את המשחקון במשך 5 דקות בטמפרטורת החדר.</li>
	<li>החליפו את המתנול במתנול טרי וסלע למשך 5 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>לאחסן את המשחקון ב -20 °C (50 °F) במשך יומיים. ניתן לדגור זמן רב יותר לנוחות.</li>
</ol>5. יום 5: התייבשות
<ol><li>מחממים את הקרבון לטמפרטורת החדר.</li>
	<li>החלף את המתנול עם 4 מ"ל של 75% מתנול / 25% PBST. רוק במשך 5 דקות בטמפרטורת החדר.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 5.2 עם 4 מ"ל של 50% מתנול / 50% PBST וסלע במשך 5 דקות.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 5.3 עם 4 מ"ל של 25% מתנול / 75% PBST וסלע במשך 5 דקות.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 5.4 עם PBST 4 מ"ל וסלע במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
</ol>6. יום 5: תקציר פרוטאינאז K
<ol><li>החלף את PBST עם 2 מ"ל של תמיסת חלבון K (20 מיקרוגרם / מ"ל, 1% DMSO ריכוז סופי PBST) וסלע בטמפרטורת החדר במשך 30 דקות. הערה: זחלים ארוכים מ-6 מ"מ יזדקקו לזמן דגירה ארוך יותר ו/או לריכוז גבוה יותר של חלבון K. הזמן והריכוז המדויקים יצטרכו להיקבע אמפירית. התחל עם עלייה של 10 דקות בזמן הדגירה על כל 0.5 מ"מ יותר מ 6 מ"מ.</li>
	<li>החלף את תמיסת Proteinase K עם 4 מ"ל של PBST וסלע במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של פתרון תיקון טרי וסלע עבור 1 שעה. ניתן לדגור יותר ב 4 °C (5 °F) לנוחות.</li>
</ol>7. יום 5: הלבנת
<ol><li>החלף את פתרון התיקון עם 4 מ"ל של PBST וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים לצלחת של 6 בארות (עד 10 זחלים לבאר).</li>
	<li>החלף את PBST עם 3 מ"ל של פתרון להלבנה טרי.</li>
	<li>מתנדנדים בטמפרטורת החדר ומנטרים את הפיגמנטציה תחת מיקרוסקופ מנתח כל 5 דקות. חפשו את היעלמות הפיגמנטציה לאורך מסונפרוס (גב לשלפוחית השחייה ולמעיים). הערה: עבור זחלים באורך של עד 6 מ"מ, ייקח עד 20 דקות להלבין את הפיגמנטציה המקיפה את המזונפרוס. אין להלבין זמן רב מהנדרש כדי לשמור על שלמות הזחלים.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים בחזרה ל בקבוקון זכוכית.</li>
	<li>החלף את פתרון ההלבנה ב- 4 מ"ל של PBST. רוק במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של פתרון תיקון טרי וסלע עבור 1 שעה. ניתן לדגור יותר ב 4 °C (5 °F) לנוחות.</li>
</ol>8. יום 5: פרה-ברינדיזציה
הערה: עבור שלבים שבוצעו ב 70 °C (70 °F), חשוב לעבוד במהירות כדי למזער את קירור המשחקון.
<ol><li>החלף את פתרון התיקון עם 4 מ"ל של PBST וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של פתרון Hyb, וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות. זהירות: פתרונות Hyb-, Hyb+, ו- probe מכילים פורממיד, אשר יכול לגרות את העור. השתמש בכפפות כדי לטפל בפתרונות אלה.</li>
	<li>החליפו את ה- Hyb - ב-4 מ"ל של הייב טרי וסלע למשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.<ol>
<li>לאסוף את פתרונות Hyb-, Hyb+, ולבדוק במיכל פסולת נפרד לסילוק נאות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>החלף את ה- Hyb ב- 4 מ"ל של פתרון Hyb+ .</li>
	<li>לדגור את המשחקון ב 70 °C (70 °F) לילה.</li>
	<li>לדלל את גשושית EGFP-פלואורסצ'ין 1:100 ב 500 μL של Hyb + ולדגירה אותו O / N ב 70 °C (70 °F). הערה: בצע את הוראות היצרן עבור סינתזה בדיקה.</li>
</ol>9. יום 6: הכלאה בדיקה
<ol><li>החלף את תמיסת Hyb+ בבקריאל עם בדיקה מחומם מראש ודגורה ב 70 °C (70 °F) לילה. הערה: זחלים ארוכים מ 6 מ"מ צריך 2 ימים של דגירה.</li>
	<li>מחממים מראש את מאגר הכביסה, 2X SSCT ופתרונות SSCT 0.2x ב- 70 °C (70 °F) למשך הלילה.</li>
</ol>10. יום 7: שטיפת גשוש
<ol><li>החלף את הבדיקה עם 4 מ"ל של חוצץ לשטוף מחומם מראש ודגורה ב 70 °C (70 °F) במשך 30 דקות.<ol>
<li>לאסוף את הבדיקה המשמשת במיכל פסולת נפרד לסילוק נאות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>החלף את חוצץ לשטוף עם 4 מ"ל של חוצץ לשטוף טרי ודגורה ב 70 °C (70 °F) במשך 30 דקות.</li>
	<li>החלף את מאגר לשטוף עם 4 מ"ל של פתרון SSCT 2x מחומם מראש ודגרה אותו ב 70 °C (70 °F) במשך 15 דקות.</li>
	<li>הוסף 50 מ"ל של SSCT 0.2x מחומם מראש לתוך צינור 50 מ"ל.<ol>
<li>הכנס מסננת תא (100 מיקרומטר) לחלק העליון של הצינור. ודא כי מסננת התא נדחף כל הדרך למטה עד שהוא מפסיק.</li>
		<li>מעבירים את הזחלים מ בקבוקון הזכוכית למסננת התא. ודא כי הזחלים שקועים במאגר ודגרה ב 70 °C (70 °F) במשך 2 שעות.</li>
	</ol>
</li>
	<li>הכן צינור חדש המכיל 50 מ"ל של SSCT מחומם מראש 0.2x.<ol>
<li>העבר את מסננת התאים בשלב 10.4.2 לתוך הצינור החדש של 0.2x SSCT ודגרה ב 70 °C (70 °F) במשך 2 שעות.</li>
		<li>חזור על שלב 10.5 פעם נוספת.</li>
	</ol>
</li>
</ol>11. יום 7: חסימה
<ol><li>מעבירים את הזחלים ל בקבוקון זכוכית חדש ומצננים לטמפרטורת החדר.</li>
	<li>החלף את ה- SSCT 0.2x עם 4 מ"ל של 67% SSCT / 33% MABT וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 11.2 עם 4 מ"ל של 33% 0.2x SSCT / 67% MABT וסלע במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 11.3 עם 4 מ"ל של MABT וסלע במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את MABT עם 4 מ"ל של MABT טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את MABT עם 4 מ"ל של פתרון חסימה ודגורה ב 4 °C (5 °F) לילה. ניתן לדגור זמן רב יותר לנוחות.</li>
</ol>12. יום 8 – 9: דגירה נוגדנים
<ol><li>לדלל את נוגדן אנטי פלואורסצ'ין 1:5,000 ב 500 פתרון חסימת μL.</li>
	<li>החלף את פתרון החסימה עם פתרון הנוגדנים ודגרה ב 4 °C (50 °F) במשך 2 ימים. ניתן לדגור זמן רב יותר לנוחות.<ol>
<li>מערבבים את הנקניקיון פעמיים ביום כדי להרגיז את הזחלים. הערה: זחלים ארוכים יותר מ 6 מ"מ צריך 1-2 ימים נוספים של דגירה.</li>
	</ol>
</li>
</ol>13. יום 10 - 11: שטיפת נוגדנים
<ol><li>החלף את פתרון הנוגדנים עם 4 מ"ל של PBST וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים לצינור 50 מ"ל.</li>
	<li>הוסף 40 מ"ל של PBST2. מניחים את הצינור על צדו ומטלטלים ב 4 מעלות צלזיוס בלילה.</li>
	<li>החלף את PBST2 עם 40 מ"ל של PBST2 טרי וסלע ב 4 °C (55 °F) לילה. ניתן לדגור זמן רב יותר לנוחות. הערה: זחלים ארוכים מ-6 מ"מ זקוקים ל-1-2 ימים נוספים של כביסה.</li>
</ol>14. יום 12: כתמים
<ol><li>מעבירים את הזחלים לצלחת של 6 בארות.</li>
	<li>החלף את PBST2 עם 3 מ"ל של חיץ כתמים וסלע בטמפרטורת החדר במשך 5 דקות.</li>
	<li>החלף את חוצץ הכתמים עם 3 מ"ל של חיץ כתמים טרי וסלע במשך 5 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את מאגר הכתמים ב- 3 מ"ל של תמיסה הכתימה. מכסים בנייר אלומיניום ומנטרים את הכתמים בשעות הקרובות.<ol>
<li>עבור בדיקות עם אות חלש, לדגור ב 4 °C (4 °F) לילה ולהחליף את פתרון הכתמים עם פתרון כתמים טרי פעם אחת בין לבין.</li>
	</ol>
</li>
	<li>כאשר עוצמת הכתמים הרצויה מגיעה, החליפו את תמיסת הכתמים ב-3 מ"ל של פתרון העצירה והסלע למשך 30 דקות.</li>
	<li>החלף את פתרון העצירה עם 3 מ"ל של פתרון עצירה טרי וסלע במשך 30 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים ל בקבוקון זכוכית חדשים ומחליפים את פתרון העצירה ב-4 מ"ל של פתרון תיקון טרי ודגרה למשך שעה אחת בטמפרטורת החדר. ניתן לדגור יותר ב 4 °C (5 °F) לנוחות.</li>
	<li>יש לאחסן את הזחלים בתמיסת התיקון בחושך ב-4 מעלות צלזיוס למשך עד שנה.</li>
</ol>15. יום 12: הדמיה
<ol><li>החלף את פתרון התיקון עם 4 מ"ל של PBST וסלע בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.</li>
	<li>מעבירים את הזחלים לצלחת של 6 בארות.</li>
	<li>החלף את PBST עם 4 מ"ל של PBST טרי וסלע במשך 10 דקות. חזור על הפעולה עוד פעם אחת.</li>
	<li>החלף את PBST עם 3 מ"ל של 50% גליסול (ב PBST) וסלע במשך 10 דקות.</li>
	<li>החלף את הפתרון בשלב 15.4 עם 3 מ"ל של 100% גלצל ללא נדנדה במשך 10 דקות.</li>
	<li>השתמש במיקרוסקופ מנתח כדי לדמיין את הזחלים ישירות בצלחת 6-well או להעביר את הזחלים לשקופית דיכאון לתמונה תחת מיקרוסקופ מורכב. השתמש מניפולטור ריסים כדי לכוון את הזחלים.</li>
</ol>

<ol><li>Kinth, P., Mahesh, G., Panwar, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+of+zebrafish+research%3A+a+global+outlook%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">Mapping of zebrafish research: a global outlook.</a> Zebrafish. 10 (4), 510-517 (2013).</li>
<li>Grunwald, D. J., Eisen, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Headwaters+of+the+zebrafish+-+emergence+of+a+new+model+vertebrate%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews.+Genetics%22%5BJournal%5D)">Headwaters of the zebrafish - emergence of a new model vertebrate.</a> Nature Reviews. Genetics. 3 (9), 717-724 (2002).</li>
<li>Wingert, R. A., Davidson, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+zebrafish+pronephros%3A+a+model+to+study+nephron+segmentation%5BTitle%5D)+AND+%22Kidney+International%22%5BJournal%5D)">The zebrafish pronephros: a model to study nephron segmentation.</a> Kidney International. 73 (10), 1120-1127 (2008).</li>
<li>Drummond, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kidney+development+and+disease+in+the+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+the+American+Society+of+Nephrology%3A+JASN%22%5BJournal%5D)">Kidney development and disease in the zebrafish.</a> Journal of the American Society of Nephrology: JASN. 16 (2), 299-304 (2005).</li>
<li>Swanhart, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+kidney+development%3A+basic+science+to+translational+research%5BTitle%5D)+AND+%22Birth+defects+research.+Part+C%2C+Embryo+Today%3A+Reviews%22%5BJournal%5D)">Zebrafish kidney development: basic science to translational research.</a> Birth defects research. Part C, Embryo Today: Reviews. 93 (2), 141-156 (2011).</li>
<li>Dressler, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+early+kidney+specification%2C+development+and+patterning%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Advances in early kidney specification, development and patterning.</a> Development. 136 (23), 3863-3874 (2009).</li>
<li>Johnson, C. S., Holzemer, N. F., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Laser+ablation+of+the+zebrafish+pronephros+to+study+renal+epithelial+regeneration%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%3A+JoVE%22%5BJournal%5D)">Laser ablation of the zebrafish pronephros to study renal epithelial regeneration.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (54), e2845(2011).</li>
<li>Marra, A. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+gene+expression+during+zebrafish+pronephros+development+and+regeneration%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Visualizing gene expression during zebrafish pronephros development and regeneration.</a> Methods in Cell Biology. 154, 183-215 (2019).</li>
<li>McMenamin, S. K., Chandless, M. N., Parichy, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Working+with+zebrafish+at+postembryonic+stages%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Working with zebrafish at postembryonic stages.</a> Methods in Cell Biology. 134, 587-607 (2016).</li>
<li>Diep, C. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+the+zebrafish+mesonephros%5BTitle%5D)+AND+%22Genesis%22%5BJournal%5D)">Development of the zebrafish mesonephros.</a> Genesis. 53 (3-4), 257-269 (2015).</li>
<li>Zhou, W., Boucher, R. C., Bollig, F., Englert, C., Hildebrandt, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+mesonephric+development+and+regeneration+using+transgenic+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Physiology.+Renal+Physiology%22%5BJournal%5D)">Characterization of mesonephric development and regeneration using transgenic zebrafish.</a> American Journal of Physiology. Renal Physiology. 299 (5), 1040-1047 (2010).</li>
<li>Diep, C. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+adult+nephron+progenitors+capable+of+kidney+regeneration+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Identification of adult nephron progenitors capable of kidney regeneration in zebrafish.</a> Nature. 470 (7332), 95-100 (2011).</li>
<li>Diep, C. Q., Mikeasky, N., Davidson, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDiep%2C+CQ+%22The+Zebrafish+in+Biomedical+Research%3A+Biology%2C+Husbandry%2C+Diseases%2C+and+Research+Applications%22">The Zebrafish in Biomedical Research: Biology, Husbandry, Diseases, and Research Applications</a>. Cartner, S. C., et al. , Elsevier. 145-150 (2020).</li>
<li>Parichy, D., Elizondo, M., Mills, M., Gordon, T., Engeszer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Normal+table+of+postembryonic+zebrafish+development%3A+staging+by+externally+visible+anatomy+of+the+living+fish%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+dynamics%3A+An+Official+Publication+of+the+American+Association+of+Anatomists%22%5BJournal%5D)">Normal table of postembryonic zebrafish development: staging by externally visible anatomy of the living fish.</a> Developmental dynamics: An Official Publication of the American Association of Anatomists. 238 (12), 2975-3015 (2009).</li>
<li>Guo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((LIM+Homeobox+4+%28lhx4%29+regulates+retinal+neural+differentiation+and+visual+function+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Science+Reports%22%5BJournal%5D)">LIM Homeobox 4 (lhx4) regulates retinal neural differentiation and visual function in zebrafish.</a> Science Reports. 11 (1), 1977(2021).</li>
<li>Vauti, F., Stegemann, L. A., Vogele, V., Koster, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((All-age+whole+mount+in+situ+hybridization+to+reveal+larval+and+juvenile+expression+patterns+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">All-age whole mount in situ hybridization to reveal larval and juvenile expression patterns in zebrafish.</a> PloS One. 15 (8), 0237167(2020).</li>
<li>Parichy, D. M., Turner, J. M., Parker, N. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Essential+role+for+puma+in+development+of+postembryonic+neural+crest-derived+cell+lineages+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Essential role for puma in development of postembryonic neural crest-derived cell lineages in zebrafish.</a> Developmental Biology. 256 (2), 221-241 (2003).</li>
<li>Yang, H., Wanner, I. B., Roper, S. D., Chaudhari, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+method+for+in+situ+hybridization+with+signal+amplification+that+allows+the+detection+of+rare+mRNAs%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Histochemistry+%26+Cytochemistry%22%5BJournal%5D)">An optimized method for in situ hybridization with signal amplification that allows the detection of rare mRNAs.</a> The Journal of Histochemistry & Cytochemistry. 47 (4), 431-445 (1999).</li>
<li>McCampbell, K. K., Springer, K. N., Wingert, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+nephron+composition+and+function+in+the+adult+zebrafish+kidney%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%3A+JoVE%22%5BJournal%5D)">Analysis of nephron composition and function in the adult zebrafish kidney.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (90), e51644(2014).</li>
</ol>

למחברים אין ניגודי אינטרסים.

שיטת ההכלאה במקום המתוארת כאן נועדה ללמוד פיתוח מסונפרוס. עם זאת, ניתן ליישם אותו כדי לחקור את ההתפתחות של רקמות ואיברים אחרים במהלך מטמורפוזה, כגון המעיים, מערכת העצבים, קשקשים, פיגמנטציה14. בדיקות ניתן ליצור עבור גנים אנדוגניים או סמנים פלואורסצנטיים בקווים מהונדסים.
זה קריטי עבור הזחלים להישאר שלם על מנת להתבונן באיברים וברקמות בהקשר הטבעי שלהם. כדי לשמור על שלמות הרקמה, חשוב למזער את זמן הטיפול בחלבון K. חשוב לקבוע את זמן הטיפול הטוב ביותר עבור כל אצווה חדש...

עובר דג הזברה הוא מודל חשוב לחקר התפתחות הרקמות בשל גודלו הקטן, השקיפות, הכלים הזמינים וההישרדות שלו ללא הזנה עד חמישה ימים1,2. היא תרמה רבות להבנת התפתחות הכליות ולשימור בין דגי זברה ליונקים3,4,5. הכליה ממלאת תפקיד חיוני בשמירה על הומאוסטזיס נוזלי, סינון הדם והפרשת פסולת6. הנפרון, היחידה התפקודית של הכליה, כולל מסנן דם המחובר לצינור ארוך. בדגי זברה נוצרים שני מבני כליות לאורך כל חייו. הנוטה (הכליה העוברית הזמנית) נוצרת תחילה במהלך ההתפתחות המוקדמת. הוא מורכב משני נפרונים רצים לאורך הציר הקדמי-אחורי והופך לפונקציונלי בסביבות 2 ימים לאחר ההפריה (dpf). התועלת של הנוטה טמונה בפשטות שלה, שיש רק שני נפרונים כי הם בעיקר ליניארי וקל לדמיין (אם כי הצינור המפותל הפרוקסימלי מתחיל סליל בשלושה dpf)3. זה הקל לא רק על מחקרים על התפתחותה המוקדמת מן mesoderm הביניים, אלא גם את דפוס פילוח ותיקון צינורית7,8.
התועלת של דגי זברה מוגבלת לאחר חמישה dpf, כאשר החלמון פוחת והזחלים מסתמכים על האכלה במערכת הימית9. בסביבות 2 שבועות, הזחלים עוברים מטמורפוזה לקטינים, שם נוצרות רקמות חדשות ורקמות ישנות אובדות ו/או מאורגנות מחדש9. זה גם כאשר mesonephros (הכליה הבוגרת הקבועה) יוצר10,11,12. הנפרון הבוגר הראשון נוצר ליד הסומיט השישי, ומתמזג עם הצינורית המוקדמת הדיסטלית של הנוגים. נפרונים נוספים מתווספים אחוריים לעמדה זו בתחילה, אך גם לכיוון הקדמי בהמשך. הנפרונים העיקריים בגל הראשון מתמזגים לצינורות של הנוטים וחולקים לומן משותף להפקיד את הפסולת שלהם. נפרונים משניים נוצרים בגל הבא ומתמזגים לנפרונים ראשיים. תהליך חוזר זה יוצר מסונפרוס המסתעף, דומה במקצת לכליות היונקים. ככל הנראה, הנוטה בסופו של דבר מאבדת את זהות הצינור שלה והופכת לשני צינורות איסוף עיקריים שבהם כל הנפרונים מרוקנים את הפסולת שלהם13.
לפני היווצרותו של הנפרון הבוגר הראשון, תאי אבות יחידים מתחילים להופיע בזחלים ~4 מ"מ (אורך כולל) (~ 10 dpf). תאים אלה, המסומנים בקו מהונדס Tg(lhx1a-EGFP), לדבוק נוטה ונדמה להעביר לאתרים עתידיים של נפרוגנזה. התאים הבודדים מתמזגים לאשכולות, המבדילים לנפרונים חדשים12. לא ברור היכן תאים אלה שוכנים או אילו גנים הם מבטאים לפני תחילתו של mesonephrogenesis.
הבנת התפתחות מסונפרוס מספקת תובנות על כליות היונקים בדרכים שהנואפרוסים אינם יכולים. אלה כוללים היווצרות של אגרגטים נפרוגניים מתאי אבות יחידים, שילוב פונקציונלי של נפרונים חדשים עם קיימים, ומורפוגנזה מסתעפת. עם זאת, ישנן מגבלות לחקר התפתחות פוסט-מבריונית. הזחלים פחות שקופים בשל גודלם הגדול יותר ויש להם פיגמנטציה. ציר הזמן ההתפתחותי אינו סינכרוני בין בעלי חיים בודדים ותלוי מאוד בגורמים סביבתיים, כגון האכלה וצפיפות 9,14. למרות ריאגנטים נוקאאוט קיימים, הם פחות יעילים בזחלים לעומת עוברים15. בפרוטוקול זה, מתוארת שיטת הכלאה במקום לקביעת ביטוי גנים במהלך התפתחות mesonephros של דגי זברה. מספר שלבים מותאמים להגברת ההדמיה של mesonephros וחדירה ושטיפה של הבדיקה ואת הנוגדן. הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP) משמש יחד עם בדיקה עבור EGFP כדי לתייג תאים יחידים של אבות, אגרגטים נפרוגניים, ואת צינורות דיסטליים של נפרונים המתהווה. שיטה זו תספק הבנה עמוקה יותר של התפתחות mesonephros ותובנה על טיפולים רגנרטיביים.

<table><tbody><tr><td>נוגדן אנטי פלואורסצאין</td><td>Roche/Sigma-Aldrich</td><td>11426338910</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת</td><td></td><td></td> הלבנה <td>0.8% KOH, 0.9% H2O2</td></tr><tr><td>במגיב חוסם</td> PBST <td>Roche/Sigma-Aldrich</td><td>11096176001</td><td>שימוש לתמיסת חסימה, הכנה לפי הוראות היצרן</td></tr><tr><td>מסננת תאים</td><td>פישר סיינטיפיק</td><td>&nbsp; 22-363-549</td><td>100 &mu; m</td></tr><tr><td>E3 בינוני</td><td></td><td></td><td>5 מ"מ NaCl, 0.33 מ"מ CaCl2, 0.33 מ"מ MgSO4, 0.17 מ"מ KCl, 0.0001% מתילן</td></tr><tr><td>כחול מניפולטור ריסים</td><td>פישר סיינטיפיק</td><td>NC1083208</td><td>שימוש למניפולציה של זחלים תמיסת</td></tr><tr><td></td><td></td><td>קיבוע</td><td>4% פרפורמלדהיד, 1% DMSO ב-PBS; חום ב-65&deg; C תוך כדי ניעור עד שהאבקה נמסה, ואז להוסיף DMSO לאחר שהיא מתקררת</td></tr><tr><td>סינתזת בדיקה פלואורסצאין</td> בקבוקון זכוכית <td>Roche/Sigma-Aldrich</td><td>11685619910</td><td></td></tr><tr><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>03-338B</td><td></td></tr><tr><td>אנקפסולציה של Hatchfry</td> תמיסת <td>Argent</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Hyb- 50</td><td></td><td></td><td>% פורממיד, 5X SSC, 0.1% תמיסת</td></tr> <tr><td></td><td></td><td>Tween-20 Hyb+</td><td>HYB-, 5 מ"ג/מ"ל טורולה RNA, 50 ug/mL הפרין</td></tr><tr><td>MAB (10X)</td><td></td><td></td><td>1 M חומצה מאלית, 1.5 M NaCl, pH 7.5</td></tr><tr><td>MABT</td><td></td><td></td><td>1X MAB, 0.1% Tween-20</td></tr><tr><td>חומצה מאלית</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>M0375</td><td></td></tr><tr><td>פרפורמלדהיד</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>158127</td><td></td></tr><tr><td>PBS (10X)</td><td></td><td></td><td>8% NaCl, 0.2% KCl, 1.44% Na2HPO4, 0.24% KH2PO4</td></tr><tr><td>PBST</td><td></td><td></td><td>1X PBS, 0.1% Tween-20</td></tr><tr><td>PBST2</td><td></td><td></td><td>1X PBS, 0.2% Tween-20</td></tr><tr><td>אבקת מזון</td><td></td><td></td><td>מערבבים 2 גרם מכל אחד מספירולינה ואנקפסולון ב-50 מ"ל מים של מערכת הדגים ומנערים היטב</td></tr><tr><td>Proteinase K</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P5568</td><td>השתמש כדי לחלחל זחלים</td></tr><tr><td>תמיסת</td><td></td><td></td> <td>Proteinase K20&nbsp; &mu; גרם/מ"ל, ריכוז סופי של 1% DMSO</td></tr><tr><td>באבקת ספירולינה מיקרו-דקה</td><td>ארג'נט</td><td></td><td></td></tr><tr><td>SSC (20X)</td><td></td><td></td><td>3 M NaCl, 0.3 M נתרן אצטט נטול מים, pH 7, אוטוקלאב</td></tr><tr><td>SSCT (0.2X)</td><td></td><td></td> <td>מדולל מ-20X SSC, 0.1% Tween-20</td></tr><tr><td>SSCT (2X)</td><td></td><td></td><td>מדולל מ-20X SSC, 0.1% Tween-20</td></tr><tr><td>Staining buffer</td><td></td><td></td><td>100 מ"מ Tris pH 9.5, 50 מ"מ MgCl2, 100 מ"מ NaCl, 0.1%</td></tr><tr><td>תמיסת</td><td></td><td></td> צביעה Tween-20 <td>200 &mu; גרם/מ"ל יודוניטרוטרזוליום כלוריד, 200 &mu; גרם/מ"ל 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate מלח דיסודיום, במאגר מכתים</td></tr><tr><td>תמיסת</td><td></td><td></td> עצירה <td>1 מ"מ EDTA, pH 5.5, ב-PBST</td></tr><tr><td>Torula (שמרים) RNA</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>R6625</td><td></td></tr><tr><td>Tricaine</td><td>Sigma Aldrich</td><td>E10521</td><td>2%, pH 7</td></tr><tr><td>מאגר</td><td></td><td></td> כביסה <td>50% פורממיד, 2X SSC, 0.1% Tween-20</td></tr></tbody></table>

בסיטו הכלאה בזחלי זברה וצעירים במהלך פיתוח מסונפרוס

In Situ Hybridization in Zebrafish Larvae and Juveniles during Mesonephros Development

דג הזברה יוצר שני מבני כליות בחייו. הנוטה (כליה עוברית) נוצרת במהלך התפתחות עוברית ומתחילה לתפקד ביומיים לאחר ההפריה. המורכב משני נפרונים בלבד, הנוטה משמשת ככליה היחידה במהלך חיי הזחל עד שנדרשת תפקוד כליות נוסף בשל מסת הגוף ההולכת וגדלה. כדי להתמודד עם דרישה גבוהה זו, mesonephros (כליה בוגרת) מתחיל להיווצר במהלך מטמורפוזה. הנפרונים הראשיים החדשים מתמזגים לנוודים ויוצרים לומן מחובר. לאחר מכן, נפרונים משניים מתמזגים לראשונים (וכן הלאה) כדי ליצור רשת הסתעפות במסונפרוס. הרוב המכריע של המחקר מתמקד נוטה בשל הקלות של שימוש בעוברים. לכן, יש צורך לפתח טכניקות ללמוד זחלים מבוגרים וגדולים יותר ודגים צעירים כדי להבין טוב יותר את התפתחות mesonephros. כאן, פרוטוקול הכלאה במקום לניתוח ביטוי גנים מותאם לחדירת בדיקה, שטיפת בדיקות ונוגדנים, והלבנת פיגמנטים כדי לדמיין טוב יותר את mesonephros. הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP) משמש לתיוג תאי אבות ואת הצינורות הדיסטליים של נפרונים המתהווים. פרוטוקול זה ממלא פער במחקר mesonephros. זהו מודל חיוני להבנת האופן שבו רקמות כליות חדשות נוצרות ומשתלבות עם נפרונים קיימים ומספקות תובנות על טיפולים רגנרטיביים.

באמצעות הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP), הוכח כי זה בפרוטוקול הכלאה במקום יעיל בתיוג תאי צאצא כליות ומבנים שונים של נפרון במהלך פיתוח mesonephros. כצפוי, מערכת העצבים המרכזית מסומנת גם בקו מהונדס זה (לא מוצג). הנפרון המסונפירי הראשוני נוצר במהירות של כ-5.2 מ"מ, גב לנטייה (איור 2A), והצינור הדיסטלי של הנפרון הזה מסומן על ידי EGFP10,12. אשכולות אבות קיימים בשלב זה ובהמשך (איור 2A-B</st...

דג הזברה הוא מודל חשוב להבנת התפתחות הכליות. כאן, פרוטוקול הכלאה במקום מותאם כדי לזהות ביטוי גנים בזחלי דגי זברה וצעירים במהלך פיתוח mesonephros.

The zebrafish forms two kidney structures in its lifetime. The pronephros (embryonic kidney) forms during embryonic development and begins to function at ...

פרוטוקול זה הוא משמעותי משום שהוא מאפשר קביעת ביטוי גנים בזחלי דגי זברה ישנים וצעירים במהלך מטמורפוזה. היתרון של טכניקה זו הוא כי כמה שלבים כבר אופטימיזציה עבור חדירת בדיקה ויזואליזציה של הכליה. כדי להתחיל, הקם דגי זברה בוגרים להזדווג על ידי הוספת זכר אחד ונקבה אחת במיכל הזדווגות בשעות אחר הצהריים המאוחרות לאחר הארוחה האחרונה שלהם.למחרת, לאסוף את העוברים בצלחות פטרי המכילים E3 בינוני. חמישה ימים לאחר ההפריה, הניחו מסך 400 מיקרומטר במיכל 2.8 ליטר ומלאו אותו ב-2 ס"מ של מי מערכת. לאחר מכן מוסיפים את הזחל מצלחת פטרי אחת.כדי לתקן את הזחל, להסיר מיכל של זחל בנקודת הזמן הרצויה, ולאחר מכן, באמצעות רשת ולהעביר pipette עם קצה שלה מנותק, להעביר את הזחל לצלחת פטרי. לאחר מכן, להוסיף שני מיליליטר של 2% tricaine כדי לשתק את הזחל. לאחר אימוביליזציה, להחליף את tricaine עם 20 מיליליטר של פתרון תיקון.לאחר 30 דקות, להעביר את הזחל לתוך צינור 50 מיליליטר המכיל 25 מיליליטר של פתרון תיקון טרי. לאחר מכן, להבטיח כי המכסה הוא חזק, לאט לאט לטלטל את הצינור בארבע מעלות צלזיוס במשך יומיים. ביום השלישי, להחליף את פתרון התיקון עם 20 מיליליטר של PBST ולאחר מכן להעביר את הזחל לצלחת פטרי.כדי למדוד את הזחל, מניחים את צלחת הפטרי על גבי סרגל שטוח תחת מיקרוסקופ מנתח, ולאחר מכן, באמצעות מניפולטור ריסים, להזיז כל זחל על הסרגל כדי למדוד את אורכו הכולל. לאחר מדידת כל הזחלים, לשלב כמה זחלים באורכים דומים על בקבוקון זכוכית אחד 5.5 מיליליטר עם PBST. להתייבשות, להחליף את PBST ב בקבוקון זכוכית עם ארבעה מיליליטר של 100%מתנול, ולאחר מכן לאחסן את בקבוקון במינוס 20 מעלות צלזיוס במשך יומיים.עבור rehydration, להחליף את 100%מתנול עם ארבעה מיליליטר של 75% מתנול ו 25% פתרון PBST ולטלטל את המשחקון במשך חמש דקות. לאחר מכן, להחליף את פתרון מתנול ו PBST עם ארבעה מיליליטר של PBST טרי ולטלטל את המשחקון שוב במשך 10 דקות. לעיכול Proteinase K, החליפו את ה-PBST בשני מיליליטרים של תמיסת פרוטאינאז K ונענעו את הוויאל בטמפרטורת החדר למשך 30 דקות.לאחר מכן, להלבנה, להעביר את הזחל לצלחת שש טוב ולהחליף את PBST עם שלושה מיליליטר של פתרון להלבנה טרי. לאחר היעלמותו המוחלטת של פיגמנטציה לאורך mesonephros, להעביר את הזחל בחזרה לתוך בקבוקון זכוכית, להחליף את פתרון ההלבנה עם ארבעה מיליליטר של PBST, ולטלטל את בקבוקון במשך 10 דקות. עבור טרום הכלאה, להחליף את פתרון התיקון עם ארבעה מיליליטר של PBST ולטלטל את הבקינה במשך 10 דקות, ולאחר מכן, להחליף את PBST עם ארבעה מיליליטר של Hyb-פתרון וסלע במשך 10 דקות.לאחר שתי דגרות נוספות בתמיסת Hyb, החלף את הפתרון בארבעה מיליליטרים של פתרון Hyb+. בו זמנית לדלל את גשושית פלואורסצ'ין EGFP אחד עד 100 ב 500 microliters של הכלאה בתוספת פתרון, ולדגירה את הנקינה ואת הבדיקה ב 70 מעלות צלזיוס בן לילה. למחרת, כדי להכלא את הגשושית, החליפו את תמיסת Hyb+בבקריאלין בגשוש שהתחמם מראש ודגרה ב-70 מעלות צלזיוס במהלך הלילה.למחרת, להוסיף 50 מיליליטר של 0.2 פעמים SSCT מחומם מראש לתוך צינור 50 מיליליטר. לאחר מכן, הכנס מסננת תא 100 מיקרומטר לחלק העליון של הצינור, להעביר את הזחל מן בקבוקון הזכוכית לתוך מסננת התא, ולהבטיח כי הזחל שקועים במאגר, לדגור על בקבוקון ב 70 מעלות צלזיוס במשך שעתיים. לאחר הדגירה, להעביר את מסננת התא לתוך צינור חדש המכיל מחומם מראש 0.2 פעמים SSCT, ודגרה שוב ב 70 מעלות צלזיוס במשך שעתיים.לאחר מכן, לחסימה, מעבירים את הזחל ל בקבוקון זכוכית חדש ומאפשרים לו להתקרר לטמפרטורת החדר. לאחר מכן, החלף את פתרון SSCT 0.2 פעמים עם ארבעה מיליליטר של 67%0.2 פעמים SSCT ו 33%MABT פתרון ולטלטל את המשחקון בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות. לאחר מכן, להחליף את פתרון SSCTT MABT עם ארבעה מיליליטר של MABT טרי, ולדגירה את המשחקון על רוקר במשך 10 דקות.לאחר מכן, להחליף את MABT עם ארבעה מיליליטר של פתרון חסימה ודגור ארבע מעלות צלזיוס בן לילה. למחרת, להחליף את פתרון החסימה עם פתרון נוגדנים ודגור בארבע מעלות צלזיוס במשך יומיים. לשטיפת נוגדנים, להעביר את הזחל לתוך צינור 50 מיליליטר, ולאחר מכן להוסיף 40 מיליליטר של PBST2, ולהניח את הצינור שוכב על צדו עבור דגירה לילה בארבע מעלות צלזיוס.ביום 12, לאחר העברת הלבה לצלחת שש בארות, להחליף את PBST2 עם שלושה מיליליטר של חוצץ כתמים. לאחר דגירה של חמש דקות על רוקר, החליפו את מאגר הכתמים בשלושה מיליליטרים של תמיסת הכתמים. כאשר עוצמת הכתמים הרצויה מגיעה, החליפו את תמיסת הכתמים בשלושה מיליליטרים של פתרון העצירה והסלע למשך 30 דקות.לאחר מכן, להעביר את הזחל ל בקבוקון זכוכית חדש, להחליף את פתרון עצירה עם ארבעה מיליליטר של פתרון תיקון טרי, ודגורה במשך שעה אחת בטמפרטורת החדר. להדמיה, החלף את פתרון התיקון בארבעה מיליליטרים של PBST טרי. לאחר דגירה של 10 דקות על רוקר, להעביר את הזחל לצלחת שש באר, ולאחר מכן להחליף את PBST עם ארבעה מיליליטר של PBST טרי לטלטל את הצלחת שוב במשך 10 דקות.לאחר מכן, להוסיף שלושה מיליליטר של 50%גליצל ב PBST וסלע במשך 10 דקות, ולאחר מכן, באמצעות מיקרוסקופ לנתח, תמונה הזחל ישירות בצלחת שש טוב. פרוטוקול הכלאה זה במקום מתייג ביעילות תאי אבות כליות ומבנים שונים של נפרון באמצעות פיתוח mesonephros. הנפרון המזונפרי הראשוני נוצר בערך 5.2 מילימטרים גב לנטייה.אשכולות של תאי אבות נמצאים במהלך התפתחות mesonephros בנוסף לתאי אבות יחיד. אצל קטינים גדולים יותר, כתמי רקע יכולים להתרחש בסמיטים. בסך הכל, שיטה זו יכולה לשמש כדי ללמוד רקמות אחרות שנוצרו במהלך מטמורפוזה, בנוסף לאיברים בוגרים ניתחו.

in-situ-hybridization-zebrafish-larvae-juveniles-during-mesonephros

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

ביולוגיה התפתחותית

הר שלמים הכלאה באתרו היא אחת הטכניקות הנפוצה ביותר בביולוגיה התפתחותית. כאן, אנו מציגים ברזולוציה גבוהה פלורסנט כפול פרוטוקול הכלאה באתרו לניתוח דפוס הביטוי המדויק של גן יחיד לקביעת חפיפה של תחומים הביטוי של שני גנים. אנו כוללים propidium גרעיני יודיד נגד כתם להדגיש ארגון רקמות.

דג הזברה שלמים הר ברזולוציה גבוהה פעמיים פלורסנט באתרו הכלאה

שימוש הר שלם באתרו הכלאה קישור לביולוגיה מולקולרית האורגניזם

דג הזברה, דגים טרופיים קטנים, הפכה לדגם פופולרי ללימוד תפקוד גן במהלך התפתחות מחלה וחוליות. הביטוי של הזמן ומרחב של גני המטרה יכול להיקבע על...

הר שלם ברזולוציה גבוהה<em&gt; באתרו</em&gt; הכלאה בתוך עוברי דג הזברה לחקר ביטוי גנים ותפקוד

תהליכים התפתחותיים כגון התפשטות, דפוסים, בידול, והדרכה האקסון יכולים להיות מודל בקלות בחוט השדרה דג הזברה. במאמר זה, אנו מתארים הליך הרכבה לעוברי דג הזברה, אשר מייעל את ההדמיה של אירועים אלה.

נתיחה והרכבה לרוחב של עוברי דג הזברה: ניתוח התפתחות חוט השדרה

עובר דג הזברה הוא מודל מצוין למחקר בביולוגיה התפתחותית. במהלך עובר, דג הזברה מתפתחת עם מסת חלמון, אשר מציבה אתגרים תלת ממדים לתצפית מדגם וניתוח. פרוטוקול זה מתאר כיצד ליצור הכנות הר שטוחות דו ממדים של הר שלם באתרם דגימות (לוואי) מוכתמות דג הזברה עובר.

הר הכנה שטוחה לתצפית וניתוח של עובר דג הזברה דוגמאות ויטראז בהר שלם<em&gt; באתרו</em&gt; הכלאה

דג הזברה הוא מערכת מודל רבת עוצמה לביולוגיה התפתחותית וחקר מחלות אנושיות בשל הדמיון הגנטי שלהם עם בעלי חוליות גבוהים יותר. פרוטוקול זה מתאר מתודולוגיה ליצירת עוברי דג זברה הפלואידים שניתן להשתמש בהם לאסטרטגיות מסך קדימה לזיהוי מוטציות רצסיביות בגנים החיוניים לאמבריוגנזה מוקדמת.

ייצור של הפלואידים עוברי דג הזברה על ידי<em&gt; במבחנה</em&gt; הפריה

טכניקות מתוארים כדי immunostain-אפיטופים phospho כולן עוברי דג הזברה ולאחר מכן לנהל לוקליזציה confocal ניאון בשני צבעים במבנים הסלולר קטן כמו cilia העיקרי. טכניקות לתיקון והדמיה יכול להגדיר את המיקום ואת קינטיקה של המראה או הפעלה של חלבונים ספציפיים.

Phospho-אפיטופים Immunostaining באיברים ריסי של עוברי דג הזברה שלמים הר

השיטה המתוארת כאן מאפשר ניתוח זמן לשגות של פיתוח איבר עוברי דג הזברה באמצעות הקרינה מיקרוסקופ לנתח מסוגל לבצע חתך אופטיים אסטרטגיות פשוטות של הסתגלות לתקן להיסחף מוקדי מישוריים.

ניתוח של פיתוח כליה דג הזברה עם זמן לשגות הדמיה באמצעות מיקרוסקופ לנתח מצויד עבור חתך אופטי

פיתוח cilia חיוני organogenesis נכונה. פרוטוקול זה מתאר שיטת אופטימיזציה תווית, דמיינו תאים ciliated של דג זברה.

להמחיש Multiciliated בתאים דג זברה באמצעות פרוטוקול משולב של פלורסנט הר שלמה בחיי עיר הכלאה, Immunofluorescence

כאן, אנו מציגים פרוטוקול עבור נוגדן הפלורסנט בתיווך זיהוי של חלבונים בהכנות שלמות של עוברי הדגים והזחלים.

כל הר אימונוהיסטוכימיה בזיבפיש עוברים וזחלים

פרוטוקול זה מתאר כיצד להשיג תמונות על ידי שילוב הכלאה באתרו ואימונוהיסטוכימיה של חלקים עובריים של דגי זברה. הכלאה באתרו בוצעה לפני הקפאה, ואחריה הכתמת נוגדנים. כדאי לזהות את דפוסי הביטוי של שני גנים בדגי זברה אם יש מיעוט נוגדנים.

ב Situ הכלאה בשילוב עם אימונוהיסטוכימיה בעוברי דגי זברה Cryosectioned

למדו פרוטוקול הכלאה בסיטו לזיהוי ביטוי גנים בזחלי זברה וצעירים במהלך פיתוח המסונפרוס. השיטה משפרת חדירת בדיקה והדמיה לחקר ביולוגיה התפתחותית.

בסיטו הכלאה בזחלי זברה וצעירים במהלך פיתוח מסונפרוס

גלה סרטונים נוספים