חקירת שיתוף פעולה מיקרוביאלי באמצעות ניתוח ספקטרומטריית מסות הדמיה של מושבות חיידקים הגדלות על אגר וברקמות במהלך זיהום

הפרוטוקול שלנו מאפשר הדמיה של חילוף חומרים מרחבי של אינטראקציות מיקרוביאליות המתרחשות במהלך זיהום. פיתחנו תהליך עבודה זה של ספקטרומטריית מסות הדמיה עבור תרביות משותפות של חיידקים הגדלים על מודלים של אגר ורקמות. ניתוח מצעים לא מסורתיים כגון תרביות חיידקים הגדלים על אגר מציב אתגרים רבים.

באמצעות הפרוטוקול שלנו, ניתן לייבש דגימות חיידקים כראוי כדי להקל על יישום מטריצת MALDI בניתוח ספקטרומטריית מסות הדמיה עוקבת. שיטה זו ישימה באופן נרחב למגוון מטבוליטים, פתוגנים מיקרוביאליים או מחלות, וסוגי דגימות שבהם נדרשת מדידה מרחבית של ביוכימיה תאית או רקמתית, במיוחד כאשר בוחנים סוגי דגימות הדורשים התייבשות לפני ניתוח. לאחר הכנת המקרו-מושבות של תרביות החיידקים, הסירו את מושבות חיידקי האגרוז המותקנות על שקופיות מיקרוסקופ מצופות ITO מחומר האריזה.