שימוש ב-R, Seurat ו-CellChat כדי לנתח מערך נתונים של טרנסקריפטומיקה של תא בודד של ריפוי פצעי עור של עכבר

5.3K צפיות

צוטט 1 פעמים

08:58 דק׳

1 באוגוסט 2025

10.3791/67266-v

1 באוגוסט 2025

5.3K צפיות

Shalyn Keiser¹ , Nichole Botello¹ , Ethan Cruz¹ , Mateusz S. Wietecha¹

¹Department of Oral Biology, College of Dentistry, University of Illinois Chicago

כאן, אנו מציגים זרימת עבודה ויזואלית שלב אחר שלב לניתוח מערך נתונים של תעתיק מהלך זמן של תא יחיד של ריפוי פצעי עור עכבר באמצעות R. הפרוטוקול כולל צינור סטנדרטי להורדת מערכי נתונים, בקרת איכות, הדמיות והערות סוג תא באמצעות Seurat, וניתוח אינטראקציה בין תא לתא באמצעות CellChat.