ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Wein, T., Hülter, N. F., Mizrahi, I., Dagan, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Emergence+of+plasmid+stability+under+non-selective+conditions+maintains+antibiotic+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Emergence of plasmid stability under non-selective conditions maintains antibiotic resistance.</a> Nat Commun. 10 (1), 2595(2019).</li>
<li>Rodríguez-Beltrán, J., DelaFuente, J., León-Sampedro, R., MacLean, R. C., Millán, ÁS. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Beyond+horizontal+gene+transfer%3A+The+role+of+plasmids+in+bacterial+evolution%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Beyond horizontal gene transfer: The role of plasmids in bacterial evolution.</a> Nat Rev Microbiol. 19 (6), 347(2021).</li>
<li>Wein, T., Dagan, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plasmid+evolution%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Plasmid evolution.</a> Curr Biol. 30 (19), R1158-R1163 (2020).</li>
<li>Chen, S., Larsson, M., Robinson, R. C., Chen, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+and+convenient+measurement+of+plasmid+stability+in+lab+and+clinical+isolates+of+E.+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Direct and convenient measurement of plasmid stability in lab and clinical isolates of E. coli.</a> Sci Rep. 7 (1), 4788(2017).</li>
<li>Rouches, M. V., Xu, Y., Cortes, L. B. G., Lambert, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+plasmid+system+with+tunable+copy+number%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">A plasmid system with tunable copy number.</a> Nat Commun. 13 (1), 3908(2022).</li>
<li>Silva, F., Queiroz, J. A., Domingues, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluating+metabolic+stress+and+plasmid+stability+in+plasmid+DNA+production+by+Escherichia+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Adv%22%5BJournal%5D)">Evaluating metabolic stress and plasmid stability in plasmid DNA production by Escherichia coli.</a> Biotechnol Adv. 30 (3), 691-708 (2012).</li>
<li>Wang, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Construction+of+novel+pJRD215-derived+plasmids+using+chloramphenicol+acetyltransferase+%28cat%29+gene+as+a+selection+marker+for+Acidithiobacillus+caldus%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Construction of novel pJRD215-derived plasmids using chloramphenicol acetyltransferase (cat) gene as a selection marker for Acidithiobacillus caldus.</a> PLoS ONE. 12 (8), e0183307(2017).</li>
<li>Moragues, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Droplet-based+microfluidics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Methods+Primers%22%5BJournal%5D)">Droplet-based microfluidics.</a> Nat Rev Methods Primers. 3 (1), 32(2023).</li>
<li>Vitalis, C., Wenzel, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Leveraging+interactions+in+microfluidic+droplets+for+enhanced+biotechnology+screens%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Leveraging interactions in microfluidic droplets for enhanced biotechnology screens.</a> Current Opinion in Biotechnology. 82, 102966(2023).</li>
<li>Sinha, N., Subedi, N., Wimmers, F., Soennichsen, M., Tel, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+pipette-tip+based+method+for+seeding+cells+to+droplet+microfluidic+platforms%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">A pipette-tip based method for seeding cells to droplet microfluidic platforms.</a> J Vis Exp. (144), e57848(2019).</li>
<li>Wenzel, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Open+hardware%3A+From+DIY+trend+to+global+transformation+in+access+to+laboratory+equipment%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+Biol%22%5BJournal%5D)">Open hardware: From DIY trend to global transformation in access to laboratory equipment.</a> PLOS Biol. 21 (1), e3001931(2023).</li>
<li>Murillo, L. F. R., Wenzel, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Welcome+to+the+journal+of+open+hardware%5BTitle%5D)+AND+%22J+Open+Hardware%22%5BJournal%5D)">Welcome to the journal of open hardware.</a> J Open Hardware. 1 (1), (2017).</li>
<li>Shin, J. H., Choi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Open-source+and+do-it-yourself+microfluidics%5BTitle%5D)+AND+%22Sens+Actuators+B+Chem%22%5BJournal%5D)">Open-source and do-it-yourself microfluidics.</a> Sens Actuators B Chem. 347, 130624(2021).</li>
<li>Pryszlak, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Enrichment+of+gut+microbiome+strains+for+cultivation-free+genome+sequencing+using+droplet+microfluidics%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep+Methods%22%5BJournal%5D)">Enrichment of gut microbiome strains for cultivation-free genome sequencing using droplet microfluidics.</a> Cell Rep Methods. 2 (1), 100137(2021).</li>
<li>Pollak, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Universal+loop+assembly%3A+open%2C+efficient+and+cross-kingdom+DNA+fabrication%5BTitle%5D)+AND+%22Biology%22%5BJournal%5D)">Universal loop assembly: open, efficient and cross-kingdom DNA fabrication.</a> Biology. 5 (1), (2020).</li>
<li>Volkmer, B., Heinemann, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Condition-dependent+cell+volume+and+concentration+of+Escherichia+coli+to+facilitate+data+conversion+for+systems+biology+modeling%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Condition-dependent cell volume and concentration of Escherichia coli to facilitate data conversion for systems biology modeling.</a> PLoS ONE. 6 (7), e23126(2011).</li>
<li>Li, H., et al. Squid: Simplifying quantitative imaging platform development and deployment. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLi%2C+H+%22bioRxiv%22">bioRxiv</a>. , (2020).</li>
<li>Abate, A. R., Weitz, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Faster+multiple+emulsification+with+drop+splitting%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Faster multiple emulsification with drop splitting.</a> Lab Chip. 11 (11), 1911-1915 (2011).</li>
<li>Lau, B. T. C., Malkus, P., Paulsson, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+quantitative+methods+for+measuring+plasmid+loss+rates+reveal+unexpected+stability%5BTitle%5D)+AND+%22Plasmid%22%5BJournal%5D)">New quantitative methods for measuring plasmid loss rates reveal unexpected stability.</a> Plasmid. 70 (3), 353-361 (2013).</li>
<li>Oellermann, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Open+hardware+in+science%3A+The+benefits+of+open+electronics%5BTitle%5D)+AND+%22Integr+Comp+Biol%22%5BJournal%5D)">Open hardware in science: The benefits of open electronics.</a> Integr Comp Biol. 62 (4), 1061-1075 (2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1H,1H,2H,2H-Perfluoro-1-octanol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>370533-25G</td><td>לשבירת תחליב</td></tr><tr><td>70% אתנול</td><td></td><td></td><td>לחדירות תאים</td></tr><tr><td>Agar-Agar</td><td>Winkler</td><td>9002-18-0</td><td></td></tr><tr><td>ביופסיה אגר אגר</td><td></td><td></td><td>0.75 מ"מ ו-1.8 מ"מ</td></tr><tr><td>כחול LED Transilluminator</td><td>IO Rodeo</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Culture צינור</td><td></td><td></td><td>מייבש</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td> 15 מ"ל <td>עם משאבת ואקום</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td> חד פעמית <td>לערבוב PDMS</td></tr><tr><td>מזלג</td><td></td><td></td> חד פעמי <td>לערבוב PDMS</td></tr><tr><td>E. coli TOP10 זן</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>מיקרוסקופ FluoPi</td><td>https://github.com/wenzel-lab/FluoPi</td><td></td><td>מערכת הדמיה פלואורסצנטית ירוקה לניתוח צלחות</td></tr><tr><td>שמן פלואור</td><td>3M</td><td></td><td>Novec 7500</td></tr><tr><td>מחמם שקופיות זכוכית</td><td>https://github.com/wenzel-lab/modular-microfluidics-workstation-controller/tree/master/module-heating-and-stirring</td><td></td><td>לשליטה בטמפרטורה ב-40 מעלות; C של שבב מיקרופלואידי</td></tr><tr><td>זכוכית שקופיות פלטות</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>חמות</td><td>מכונאי</td><td></td><td>לאידוי Aquapel</td></tr><tr><td>תוכנת ניתוח תמונה</td><td>Fiji/ImageJ</td><td></td><td>2.14.0/1.54f</td></tr><tr><td>Incubator</td><td>Mundo Lab</td><td></td><td>MLAB Scientific / לדגירה של צלחות ומיקרוג'לים&nbsp;</td></tr><tr><td>איזופרופנול</td><td></td><td></td><td>לניקוי זכוכית שקופיות</td></tr><tr><td>Kanamycin</td><td></td><td></td><td>100 ug/mL ריכוז</td></tr><tr><td>בצורת L מפזר</td><td></td><td></td><td>להפצת חיידקים על צלחות אגר</td></tr><tr><td>מאסטר עובש</td><td></td><td></td><td>עיצוב שבב על סיליקון או זכוכית</td></tr><tr><td>פרוסות Microtubes</td><td></td><td></td><td>2 מ"ל</td></tr><tr><td>תמיסת</td><td></td><td></td> NaCl <td>נתרן כלוריד 0.9% w/v</td></tr><tr><td>חומרה בקוד פתוח הבהוב משופר מיקרוסקופיה שלב</td><td>https://github.com/wenzel-lab/flow-microscopy-platform</td><td></td><td>למיקרוסקופיה בשדה בהיר</td></tr><tr><td>צלחת פטרי</td><td>Citotest</td><td>2303-1090</td><td>90 x 15 מ"מ</td></tr><tr><td>מחמם קצה פיפטה</td><td>https://github.com/wenzel-lab/modular-microfluidics-workstation-controller/tree/master/module-heating-and-stirring</td><td></td><td>לשליטה בטמפרטורה ב-40 מעלות; C של קצה פיפטה</td></tr><tr><td>מנקה פלזמה</td><td>Diener אלקטרוני</td><td></td><td>117056 להדבקת PDMS עם שקופית זכוכית</td></tr><tr><td>pCA_Odd1</td><td></td><td></td> פלסמיד <td>מקודד sfGFP ועמידות לקנמיצין</td></tr><tr><td>צינורות פוליטטרפלואורואתילן (PTFE) Adtech</td><td>הנדסת פולימרים בע"מ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>מעורבב מראש Luria Bertoni בינוני</td><td>ארה"ב מדעי החיים הביולוגיים</td><td>L1520</td><td></td></tr><tr><td>Propidium יודיד (PI)</td><td></td><td></td> <td>לצביעה</td></tr><tr><td>מערכת בקר לחץ וזרימה מבוססת Raspberry Pi</td><td>https://github.com/wenzel-lab/modular-microfluidics-workstation-controller</td><td></td><td>לבקרת לחץ וקצבי זרימה</td></tr><tr>בסיס<td>אלסטומר סיליקון</td><td>ערכת PDMS Sylgard - 184 ערכת אלסטומר סיליקון</td><td></td> חומר ריפוי אלסטומר סיליקון ערכת PDMS Sylgard - 184 <td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td> ערכת אלסטומר סיליקון</td></tr><tr><td>ספקטרופוטומטר</td><td></td><td></td><td>למדידת ספיגה</td></tr><tr><td>מיקרוסקופ דיונון</td><td>https://github.com/wenzel-lab/SQUID-bioimaging-platform</td><td></td><td>מערכת הדמיה רב-פלואורסצנטית לניתוח תאים מוכתמים</td></tr><tr><td>לולאה</td><td></td><td></td> סטרילית <td>לבחירת מושבה וציפוי פסים</td></tr> כדור פעילי שטח <tr><td></td><td>Fluidics</td><td></td><td>Pico-Surf</td></tr><tr><td>מזרקים</td><td>NIPRO</td><td></td><td>עם פילטרים וצינורות</td></tr><tr><td>שייקר מבוקר טמפרטורה</td><td>Mundo Lab</td><td></td><td>DLAB HCM100-Pro</td></tr><tr><td>פינצטה</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>טמפרטורת ג'ל נמוכה במיוחד אגרוז</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>A2576-5G</td><td>לייצור חרוזי הידרוג'ל</td></tr><tr><td>תמיסה דוחה מים (פלואורואלקיל סילאן)</td> <td>Aquapel</td><td></td><td>לטיפול מיקרו-ערוצים של מכשיר PDMS</td></tr></tbody></table>

ניתוח יציבות פלסמיד עם מיקרופלואידיקה טיפתית בקוד פתוח

Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics

אימות אנקפסולציה של תאים והיווצרות מיקרו-מושבה
ניתן לאשר חזותית את עטיפת התא על ידי ביצוע מיקרוסקופ שדה בהיר על מיקרו-טיפות הג'ל לפני שבירת האמולסיה ושטיפת המיקרוג'לים. תוצאה מייצגת של האמולסיה בשלב זה מוצגת באיור 4.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67659/67659fig4.jpg"> 
איור 4: קטע של תמונת שכבת-על של מיקרוסקופיה פלואורסצנטית. לאחר דגירה של לילה, מיקרו-מושבות מייצגות של sfGFP המבטאות מושבות E. coli בתוך מיקרו-טיפות ג'ל. נעשה שימוש באובייקט מיקרוסקופ עם הגדלה של פי 10 ו-NA של 0.30. סרגל קנה מידה: 100 מיקרומטר. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67659/67659fig4large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.</a>
תוצאות ניתוח תמונות
ברגע שמיקרוג'לים מוכתמים ושדה בהיר, כמו גם תעלות פלואורסצנטיות שנרכשות בכמה מיקומים, ניתן לדמיין את המושבות שזוהו כשליליות בתמונות המקוריות (ראו איור 5A). ניתן לשרטט נתונים שחולצו מכל התמונות של ניסוי אחד כדי להראות את יחס הקרינה של מושבות שונות, תוך הדגשת אלה שאיבדו את הקרינה המקודדת בפלסמיד (ראה איור 5B). התוצאות מצביעות על כך ש-100 מושבות איבדו את פונקציונליות הפלסמיד או הפלסמיד שלהן מתוך סך של 2785 מיקרו-מושבות שנותחו, המקבילות ל-3.6%.
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67659/67659fig5.jpg"> 
איור 5: כימות של מיקרו-מושבות שליליות. (A) קטע של תמונת כיסוי של מיקרוסקופיה פלואורסצנטית. לאחר הסרת שמן וצביעה, מושבות מייצגות במיקרוג'לים המבטאים sfGFP ושתי מושבות שליליות הראו את הקרינה האדומה של כתם ה-DNA (מוקף בעיגול בשחור). סרגל קנה מידה: 100 מיקרומטר. (B) תרשים פיזור של ערכי הקרינה של מיקרו-מושבות בודדות שחולצו מ-16 תמונות מיקרוסקופיה רב-ערוציות. מושבות ללא כל פלואורסצנטיות ירוקה נספרו כשליליות, כפי שמצוין באדום בגרף. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67659/67659fig5large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.</a>
כימות לוחית אגר
תמונות של הלוחות המשולשים מוצגות באיור 6, עם מושבות לא פלואורסצנטיות המסומנות על ידי חיצים לבנים. הלוח הראשון (איור 6A) הציג בסך הכל 213 מושבות, מתוכן 1 לא היה פלואורסצנטי. בלוח השני (איור 6B) היו בסך הכול 49 מושבות, ללא מושבות שאינן פלואורסצנטיות. הלוח השלישי (איור 6C) הראה בסך הכל 252 מושבות, שש מהן לא היו פלואורסצנטיות. תוצאות אלו תואמות לשיעור אובדן פלסמיד מושבה ממוצע של 2.3%, עם סטיית תקן גדולה של 3.2.
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/67659/67659fig6.jpg"> 
איור 6: זיהוי מושבות שליליות על צלחות. (א-ג) מושבות E. coli פלואורסצנטיות ולא פלואורסצנטיות על לוחות LB-agar (קוטר: 90 מ"מ, גובה: 15 מ"מ). החיסון, שמקורו ב-E. coli עם sfGFP ממאגר של -80 מעלות צלזיוס, היה מפוספס ביום הראשון, תורבת באנטיביוטיקה ביום השני, ודולל 1:100 מדי יום מהיום השלישי עד השישי כדי לאפשר אובדן פלסמיד. המושבות הודגרו בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס למשך 24 שעות וצולמו בתא FluoPi. מושבות שאינן פלואורסצנטיות שופרו עם GIMP וסומנו בחיצים לבנים. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/67659/67659fig6large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.</a>

Plasmids play a vital role in synthetic biology by enabling the introduction and expression of foreign genes in various organisms, thereby facilitating ...

plasmid-stability-analysis-with-open-source-droplet-microfluidics

Research

JoVE Journal

Bioengineering

הנדסה ביולוגית

מכשירים microfluidic יכול לשמש כדי לחזות תהליכים טבעיים מורכבים בזמן אמת על המאזניים פיזי המתאים. פיתחנו מכשיר microfluidic פשוט המחקה התכונות העיקריות של התקשורת נקבובי טבעי ללימוד הצמיחה הובלה של חיידקים מתחת לפני הקרקע.

חלון על המיקרו: מערכות Microfluidic פשוט לחקר התחבורה מיקרוביאלית בתווך נקבובי

Droplet מבוססי פלטפורמות microfluidic הם המועמדים המבטיחים לניסויים תפוקה גבוהה שכן הם מסוגלים להפיק, picoliter עצמית מידור כלי ובזול בשיעורים קילוהרץ. באמצעות שילוב עם מהירות, רגישות גבוהה שיטות ספקטרוסקופיות ברזולוציה פלואורסצנטי, כמויות גדולות של מידע שנוצר בתוך מערכות אלה ניתן לחלץ ביעילות, לרתום ולנצל אותו.

שיטות גילוי הקרינה לפלטפורמות אגל microfluidic

אנו מציגים שיטה פשוטה לייצר מכשירים המסוגלים החלת תנאים דינמיים דומים לזנים שונים מרובים microfluidic, ללא צורך בחדר נקי או ליתוגרפיה הרכה.

מכשיר microfluidic ללימוד זני Distinct מרובים

מקור: המריך, ג'. ואחרים. פרוטוקול לאופטימיזציה של ייצור חלבונים הטרולוגיים באמצעות טכנולוגיית מיקרוביוריאקטור אוטומטית. J. Vis. Exp. (2017).הסרטון הזה מדגים את השימוש במיקרוביוריאקטור אוטומטי לניטור צמיחת חיידקים והפרשת חלבון פלואורסצנטי בתגובה לפורמולות מדיה משתנות. חיידק מהונדס גנטית המבטא חלבון פלואורסצנטי מהפריש מתרבתים תחת ברירה אנטיביוטית ומחוסן לבארות מגוונות מבחינת תזונה. מדידות אופטיות בזמן אמת של צפיפות תאים ופלואורסצנציה מאפשרות ניתוח השוואתי של ייצור חלבונים בתנאי גדילה שונים.

ניטור צמיחת חיידקים בנוסחאות מדיה נפרדת באמצעות מיקרוביוריאקטור אוטומטי

בפרוטוקול זה מוצג הייצור, ההתקנה והתפעול הבסיסי של ביו-ריאקטור פיקוליטר מיקרופלואידי (PLBR) לניתוח תאים בודדים של מיקרואורגניזמים פרוקריוטיים. מיקרואורגניזמים רלוונטיים מבחינה תעשייתית נותחו כהוכחה עקרונית המאפשרת תובנות לגבי קצב גדילה, מורפולוגיה והטרוגניות פנוטיפית על פני תקופות זמן מסוימות, בקושי אפשרי בשיטות קונבנציונליות.

ביו-ריאקטור מיקרו-נוזלי פיקוליטר לניתוח מיקרוביאלי של תאים בודדים: ייצור, הגדרת מערכת ותפעול

אנו מתארים בדיקה דיגיטלית של נקודת קצה לכימות חומצות גרעין עם קריאה פשוטה (אנלוגית). אנו מודדים פלואורסצנטיות בתפזורת של בדיקות דיגיטליות מבוססות טיפות באמצעות מכונת qPCR סטנדרטית במקום מכשור מיוחד ומאשרים את התוצאות שלנו במיקרוסקופיה.

Readout גורף פשוט של דיגיטלי מבחני כימות חומצות גרעין

עבודה זו מספקת שיטה הזיוף של פלטפורמות מבוססות-droplet microfluidic לבין היישום של microspheres לזיהוי עבור הגברה ננו-ספירה-PCR. שיטת ננו-ספירה-PCR מאפשר לקבל חד גדילי DNA amplicons מבלי המפריד בין שני גדילי ה-DNA.

גישה Microfluidic המבוססות על Droplet ו ננו-ספירה-PCR הגברה עבור חד גדילי DNA Amplicons

הגישה הניסיונית שלנו מספקת אסטרטגיה לעקוב אחר שפע ועמידות לאנטיביוטיקה לאורך זמן באוכלוסיות חיידקית.

קוונפיקציה של פלמיד בתיווך עמידות לאנטיביוטיקה בגישת אבולוציה ניסויית

המטרה הכוללת של הפרוטוקול היא להכין מעל 1,000,000 הורה, אחיד, יציב, ותואם ביולוגי טיפות של ליטר על 1 ס מ2 מצע מישורי שניתן להשתמש בו עבור סינתזה של חלבון תא ללא.

מערך מערכת Droplet ליטר ליצירת חלבון מקבילי בנפט ממולקולות דנ א יחיד

הייצור של התקן דו-שכבתי מבוסס פולידימתילסילוקסאן (PDMS) לייצור ספריות קומבינטוריות בתחליבים של מים בשמן (תקעים) מוצג כאן. החומרה והתוכנה הדרושים לאוטומציה של ייצור תקעים מפורטים בפרוטוקול, ומודגם גם ייצור ספרייה כמותית של תקעים פלואורסצנטיים.

התקן מיקרופלואידי דו-שכבתי לייצור תקע קומבינטורי

פרוטוקול זה מציג תהליך סינון סטנדרטי עם תפוקה גבוהה עבור מיקרואורגניזמים תעשייתיים. הוא כולל בניית ספריית מוטנטים באמצעות מוטגנזה של ARTP, ביצוע סקר חיובי לטיפות באמצעות מיקרופלואידיקה אוטומטית, ולאחר מכן אימות התוצאות. אמינות זרימת העבודה אושרה על ידי סינון זני B. coagulans בעלי תפוקה גבוהה.

סקר מהיר של מוטנטים של חיידקים קואגולנס המופרזים בחומצה L-לקטית באמצעות פלטפורמה מיקרופלואידית אוטומטית של טיפות

למדו שיטת מיקרופלואידיקה בקוד פתוח לניתוח יציבות פלסמידים בחיידקים באמצעות מיקרוסקופיית פלואורסצנציה. השיטה מאפשרת כימות מדויק של שימור פלסמידים במושבות תאים בודדים בתוך טיפות ג'ל, ומציעה חלופה נגישה ויעילה לשיטות מסורתיות.

ניתוח יציבות פלסמיד עם מיקרופלואידיקה טיפתית בקוד פתוח

גלה סרטונים נוספים