Name: שיטה בעלת תפוקה גבוהה להתבוננות בפנוטיפים של תנועתיות ב-Pseudomonas aeruginosa (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-20T12:30:00.000+00:00
Duration: 7 min 23 s
Description: חקור שיטה בעלת תפוקה גבוהה לניתוח תנועתיות ב-Pseudomonas aeruginosa באמצעות ספריית מוטנטים טרנספוזון. זיהוי גורמים גנטיים המשפיעים על התנהגות חיידקית ועל פיתוח אנטיביוטיקה חדשה.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Burrows, L. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+twitching+motility%3A+type+IV+pili+in+action%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa twitching motility: type IV pili in action.</a> Annu Rev Microbiol. 66, 493-520 (2012).</li>
<li>Khan, F., Pham, D. T. N., Oloketuyi, S. F., Kim, Y. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+and+controlling+the+motility+properties+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Regulation and controlling the motility properties of Pseudomonas aeruginosa.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 104 (1), 33-49 (2020).</li>
<li>Gellatly, S. L., Hancock, R. E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+new+insights+into+pathogenesis+and+host+defenses%5BTitle%5D)+AND+%22Pathog+Dis%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa new insights into pathogenesis and host defenses.</a> Pathog Dis. 67 (3), 159-173 (2013).</li>
<li>Ribbe, J., Baker, A. E., Euler, S., O'Toole, G. A., Maier, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Role+of+cyclic+Di-GMP+and+exopolysaccharide+in+type+IV+pilus+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Role of cyclic Di-GMP and exopolysaccharide in type IV pilus dynamics.</a> J Bacteriol. 199, e00859-e00916 (2017).</li>
<li>Arora, S. K., Neely, A. N., Blair, B., Lory, S., Ramphal, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Role+of+motility+and+flagellin+glycosylation+in+the+pathogenesis+of+Pseudomonas+aeruginosa+burn+wound+infections%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Role of motility and flagellin glycosylation in the pathogenesis of Pseudomonas aeruginosa burn wound infections.</a> Infect Immun. 73 (7), 4395-4398 (2005).</li>
<li>Kearns, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+field+guide+to+bacterial+swarming+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A field guide to bacterial swarming motility.</a> Nat Rev Microbiol. 8 (9), 634-644 (2010).</li>
<li>Limoli, D. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interspecies+interactions+induce+exploratory+motility+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Interspecies interactions induce exploratory motility in Pseudomonas aeruginosa.</a> eLife. 8, e47365(2019).</li>
<li>Breidenstein, E. B. M., Fuente-Núñez, C., de la Hancock, R. E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa%3A+all+roads+lead+to+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa: all roads lead to resistance.</a> Trends Microbiol. 19 (8), 419-426 (2011).</li>
<li>Toutain, C. M., Zegans, M. E., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+two+flagellar+stators+and+their+role+in+the+motility+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Evidence for two flagellar stators and their role in the motility of Pseudomonas aeruginosa.</a> J Bacteriol. 187 (2), 771-777 (2005).</li>
<li>Köhler, T., Curty, L. K., Barja, F., van Delden, C., Pechère, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Swarming+of+Pseudomonas+aeruginosa+is+dependent+on+cell-to-cell+signaling+and+requires+flagella+and+requires+flagella+and+pili%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Swarming of Pseudomonas aeruginosa is dependent on cell-to-cell signaling and requires flagella and requires flagella and pili.</a> J Bacteriol. 182 (21), 5990-5996 (2000).</li>
<li>Tremblay, J., Richardson, A. P., Lépine, F., Déziel, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Self-produced+extracellular+stimuli+modulate+the+Pseudomonas+aeruginosa+swarming+motility+behaviour%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Self-produced extracellular stimuli modulate the Pseudomonas aeruginosa swarming motility behaviour.</a> Environ Microbiol. 9 (10), 2622-2630 (2007).</li>
<li>Kühn, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanotaxis+directs+Pseudomonas+aeruginosa+twitching+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Mechanotaxis directs Pseudomonas aeruginosa twitching motility.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 118 (30), e2101759118(2021).</li>
<li>Talà, L., Fineberg, A., Kukura, P., Persat, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa+orchestrates+twitching+motility+by+sequential+control+of+type+IV+pili+movements%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa orchestrates twitching motility by sequential control of type IV pili movements.</a> Nat Microbiol. 4 (5), 774-780 (2019).</li>
<li>Tittsler, R. P., Sandholzer, L. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+semi-solid+agar+for+the+detection+of+bacterial+motility%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">The use of semi-solid agar for the detection of bacterial motility.</a> J Bacteriol. 31 (6), 575-580 (1936).</li>
<li>Turnbull, L., Whitchurch, C. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Motility+assay%3A+Twitching+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Motility assay: Twitching motility.</a> Methods Mol Biol. 1149, 73-86 (2014).</li>
<li>Ha, D. -G., Kuchma, S. L., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plate-based+assay+for+swarming+motility+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Plate-based assay for swarming motility in Pseudomonas aeruginosa.</a> Methods Mol Biol. 1149, 67-72 (2014).</li>
<li>Semmler, A. B. T., Whitchurch, C. B., Mattick, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+re-examination+of+twitching+motility+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">A re-examination of twitching motility in Pseudomonas aeruginosa.</a> Microbiology. 145 (Pt 10), 2863-2873 (1999).</li>
<li>Henrichsen, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Twitching+Motility%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Twitching Motility.</a> Annu Rev Microbiol. 37, 81-93 (1983).</li>
<li>Nolan, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+global+genomic+approach+uncovers+novel+components+for+twitching+motility-mediated+biofilm+expansion+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Genom%22%5BJournal%5D)">A global genomic approach uncovers novel components for twitching motility-mediated biofilm expansion in Pseudomonas aeruginosa.</a> Microb Genom. 4 (11), e000229(2018).</li>
<li>Overhage, J., Lewenza, S., Marr, A. K., Hancock, R. E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+genes+involved+in+swarming+motility+using+a+Pseudomonas+aeruginosa+PAO1+mini-Tn5-lux+mutant+library%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Identification of genes involved in swarming motility using a Pseudomonas aeruginosa PAO1 mini-Tn5-lux mutant library.</a> J Bacteriol. 189 (5), 2164-2169 (2007).</li>
<li>De Bleeckere, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+throughput+determination+of+the+biofilm+prevention+concentration+for+Pseudomonas+aeruginosa+biofilms+using+a+synthetic+cystic+fibrosis+sputum+medium%5BTitle%5D)+AND+%22Biofilm%22%5BJournal%5D)">High throughput determination of the biofilm prevention concentration for Pseudomonas aeruginosa biofilms using a synthetic cystic fibrosis sputum medium.</a> Biofilm. 5, 100106(2023).</li>
<li>Brochado, A. R., Typas, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+approaches+to+understanding+gene+function+and+mapping+network+architecture+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">High-throughput approaches to understanding gene function and mapping network architecture in bacteria.</a> Curr Opin Microbiol. 16 (2), 199-206 (2013).</li>
<li>Hertzberg, R. P., Pope, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+screening%3A+new+technology+for+the+21st+century%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">High-throughput screening: new technology for the 21st century.</a> Curr Opin Chem Biol. 4 (4), 445-451 (2000).</li>
<li>Baba, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Construction+of+Escherichia+coli+K-12+in-frame%2C+single-gene+knockout+mutants%3A+the+Keio+collection%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Syst+Biol%22%5BJournal%5D)">Construction of Escherichia coli K-12 in-frame, single-gene knockout mutants: the Keio collection.</a> Mol Syst Biol. 2, 2006.0008(2006).</li>
<li>Tong, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+dispensability+in+Escherichia+coli+grown+in+thirty+different+carbon+environments%5BTitle%5D)+AND+%22mBio%22%5BJournal%5D)">Gene dispensability in Escherichia coli grown in thirty different carbon environments.</a> mBio. 11 (6), e02259-e02320 (2020).</li>
<li>French, S., Côté, J. P., Stokes, J. M., Truant, R., Brown, E. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacteria+getting+into+shape%3A+genetic+determinants+of+E.+coli+morphology%5BTitle%5D)+AND+%22mBio%22%5BJournal%5D)">Bacteria getting into shape: genetic determinants of E. coli morphology.</a> mBio. 8, e01977-e02016 (2017).</li>
<li>Porwollik, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Defined+single-gene+and+multi-gene+deletion+mutant+collections+in+Salmonella+enterica+sv+Typhimurium%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Defined single-gene and multi-gene deletion mutant collections in Salmonella enterica sv Typhimurium.</a> PLoS One. 9 (7), e99820(2014).</li>
<li>Koo, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Construction+and+analysis+of+two+genome-scale+deletion+libraries+for+Bacillus+subtilis%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Syst%22%5BJournal%5D)">Construction and analysis of two genome-scale deletion libraries for Bacillus subtilis.</a> Cell Syst. 4 (3), 291-305.e7 (2017).</li>
<li>Liberati, N. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+ordered%2C+nonredundant+library+of+Pseudomonas+aeruginosa+strain+PA14+transposon+insertion+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">An ordered, nonredundant library of Pseudomonas aeruginosa strain PA14 transposon insertion mutants.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (8), 2833-2838 (2006).</li>
<li>French, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+robust+platform+for+chemical+genomics+in+bacterial+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">A robust platform for chemical genomics in bacterial systems.</a> Mol Biol Cell. 27 (6), 1015-1025 (2016).</li>
<li>French, S., Guo, A. B. Y., Brown, E. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+guide+to+dynamic+analysis+of+microbial+gene+expression+using+the+3D-printed+PFIbox+and+a+fluorescent+reporter+library%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">A comprehensive guide to dynamic analysis of microbial gene expression using the 3D-printed PFIbox and a fluorescent reporter library.</a> Nat Protoc. 15 (2), 575-603 (2020).</li>
<li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NIH+Image+to+ImageJ%3A+25+years+of+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nat Methods. 9 (7), 671-675 (2012).</li>
<li>Haley, C. L., Kruczek, C., Qaisar, U., Colmer-Hamood, J. A., Hamood, A. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mucin+inhibits+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+formation+by+significantly+enhancing+twitching+motility%5BTitle%5D)+AND+%22Can+J+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Mucin inhibits Pseudomonas aeruginosa biofilm formation by significantly enhancing twitching motility.</a> Can J Microbiol. 60 (3), 155-166 (2014).</li>
<li>Déziel, E., Comeau, Y., Villemur, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Initiation+of+biofilm+formation+by+Pseudomonas+aeruginosa+57RP+correlates+with+emergence+of+hyperpiliated+and+highly+adherent+phenotypic+variants+deficient+in+swimming%2C+swarming%2C+and+twitching+motilities%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Initiation of biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa 57RP correlates with emergence of hyperpiliated and highly adherent phenotypic variants deficient in swimming, swarming, and twitching motilities.</a> J Bacteriol. 183 (4), 1195-1204 (2001).</li>
<li>Gao, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((oprC+impairs+host+defense+by+increasing+the+quorum-sensing-mediated+virulence+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Immunol%22%5BJournal%5D)">oprC impairs host defense by increasing the quorum-sensing-mediated virulence of Pseudomonas aeruginosa.</a> Front Immunol. 11, 1696(2020).</li>
<li>Rosenau, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lipase+LipC+affects+motility%2C+biofilm+formation+and+rhamnolipid+production+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol+Lett%22%5BJournal%5D)">Lipase LipC affects motility, biofilm formation and rhamnolipid production in Pseudomonas aeruginosa.</a> FEMS Microbiol Lett. 309 (1), 25-34 (2010).</li>
<li>Anyan, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Type+IV+pili+interactions+promote+intercellular+association+and+moderate+swarming+of+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Type IV pili interactions promote intercellular association and moderate swarming of Pseudomonas aeruginosa.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (50), 18013-18018 (2014).</li>
<li>Burdman, S., Bahar, O., Parker, J. K., De La Fuente, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Involvement+of+type+IV+pili+in+pathogenicity+of+plant+pathogenic+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Genes%22%5BJournal%5D)">Involvement of type IV pili in pathogenicity of plant pathogenic bacteria.</a> Genes. 2 (4), 706-735 (2011).</li>
<li>Lewis, K. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonmotile+subpopulations+of+Pseudomonas+aeruginosa+repress+flagellar+motility+in+motile+cells+through+a+type+IV+pilus-+and+pel-dependent+mechanism%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Nonmotile subpopulations of Pseudomonas aeruginosa repress flagellar motility in motile cells through a type IV pilus- and pel-dependent mechanism.</a> J Bacteriol. 204 (5), e00528-e00621 (2022).</li>
<li>Chang, C. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Surface+sensing+for+biofilm+formation+in+Pseudomonas+aeruginosa%5BTitle%5D)+AND+%22Front.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Surface sensing for biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa.</a> Front. Microbiol. 8, 2671(2018).</li>
<li>Zegadło, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+motility+and+its+role+in+skin+and+wound+infections%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Bacterial motility and its role in skin and wound infections.</a> Int J Mol Sci. 24 (2), 1707(2023).</li>
<li>Jurado-Martín, I., Sainz-Mejías, M., McClean, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa%3A+An+audacious+pathogen+with+an+adaptable+arsenal+of+virulence+factors%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa: An audacious pathogen with an adaptable arsenal of virulence factors.</a> Int J Mol Sci. 22 (6), 3128(2021).</li>
<li>Qin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pseudomonas+aeruginosa%3A+pathogenesis%2C+virulence+factors%2C+antibiotic+resistance%2C+interaction+with+host%2C+technology+advances+and+emerging+therapeutics%5BTitle%5D)+AND+%22Sig+Transduct+Target+Ther%22%5BJournal%5D)">Pseudomonas aeruginosa: pathogenesis, virulence factors, antibiotic resistance, interaction with host, technology advances and emerging therapeutics.</a> Sig Transduct Target Ther. 7 (1), 199(2022).</li>
<li>Piskovsky, V., Oliveira, N. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+motility+can+govern+the+dynamics+of+antibiotic+resistance+evolution%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Bacterial motility can govern the dynamics of antibiotic resistance evolution.</a> Nat Commun. 14 (1), 5584(2023).</li>
<li>Xu, J., Koizumi, N., Nakamura, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crawling+motility+on+the+host+tissue+surfaces+is+associated+with+the+pathogenicity+of+the+zoonotic+spirochete+Leptospira%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Crawling motility on the host tissue surfaces is associated with the pathogenicity of the zoonotic spirochete Leptospira.</a> Front Microbiol. 11, 1886(2020).</li>
<li>Rasmussen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high-throughput+screening+assay+for+inhibitors+of+bacterial+motility+identifies+a+novel+inhibitor+of+the+Na%2B-driven+flagellar+motor+and+virulence+gene+expression+in+Vibrio+cholerae%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">A high-throughput screening assay for inhibitors of bacterial motility identifies a novel inhibitor of the Na+-driven flagellar motor and virulence gene expression in Vibrio cholerae.</a> Antimicrob Agents Chemother. 55 (9), 4134-4143 (2011).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>96 לוחות באר&nbsp; &nbsp;</td><td>קורנינג&nbsp; &nbsp;</td><td>3701&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>אגר&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp; &nbsp;</td><td>BP1423-2&nbsp;</td><td>ריכוז סופי של 0.5% לתנועתיות הלהקה או 1% לתנועתיות מתנדנדת בהתאמה.</td></tr><tr><td>חומצות קזאמינו &nbsp; &nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp; &nbsp;</td><td>223050&nbsp;</td><td>הכין מלאי של 20% מים. מסנן מחטא עם 0.22 & mu; m מסנן ומאוחסן ב-4 &מעלות צלזיוס. ריכוז סופי 0.5% ב-M9 מינימום בדיוק.</td></tr><tr><td>קריסטל ויולט &nbsp;</td><td>ביולוגיה בסיסית &nbsp; &nbsp;</td><td>CB0331</td><td>הכינו תמיסה של 1% במים.</td></tr><tr><td>D-Glucose&nbsp; &nbsp;</td><td>ביולוגיה בסיסית &nbsp; &nbsp;</td><td>GB0219&nbsp;</td><td>הכינו מלאי של 20% (1.1 מ') במים ועקרו על ידי אוטוקלב. ריכוז סופי 0.2% במדיום מינימלי M9.&nbsp;</td></tr><tr><td>פילטרופור S 0.2&nbsp;</td><td>סארשטד&nbsp;</td><td>83.1826.001</td><td></td></tr><tr><td>גנטמיצין סולפט&nbsp; &nbsp;</td><td>ביולוגיה בסיסית &nbsp; &nbsp;</td><td>GB0217&nbsp;</td><td>הכינו ציר של 30 מ"ג/מ"ל במים. מסנן מחטא עם 0.22 & mu; M מסנן ואחסן ב-4 &deg; C & ndash; ריכוז סופי בלוחות 15 ומיקרו; ג/מ.. &nbsp; &nbsp;</td></tr><tr><td>לולאת חיסון ומחט&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>22363597</td><td></td></tr><tr><td>M9 Minimal Salts, 5X&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>248510</td><td>הכינו מלאי של 1 מטר במים ועקרו באמצעות אוטוקלאב. ריכוז סופי 1 מ״מ במדיום המינימלי M9. &nbsp; &nbsp;</td></tr><tr><td>מגנזיום סולפט (MgSO4)&nbsp; &nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>M63-500</td><td>&nbsp; הכינו מלאי של 1 מטר MgSO4 במים. מסנן מחטא עם 0.22 & mu; מסנן M ואחסן בטמפרטורת החדר. ריכוז סופי &nbsp;</td></tr><tr><td>ספריית מוטנטים להחדרת טרנספוזונים PA14&nbsp; &nbsp;</td><td></td><td>ליברטי ואח', 2006 (ראו רפרנס 29)</td><td>59 לוחות עם 96 בארות לכל האוסף. כל באר מכילה מוטנט יחיד ב-LB עם 25% גליצרול.</td></tr><tr><td>צלחת פטרי 92x16mm&nbsp;</td><td>סארשטד&nbsp;</td><td>82.1473.001</td><td></td></tr><tr><td>PhenoBooth+&nbsp;</td><td>Singer Instruments&nbsp;</td><td>https://www.singerinstruments.com/solution/phenobooth/specification/&nbsp;</td><td>המיס 11.3 גרם מהאבקה ב-200 מ"ל מים מטוהרים. אוטוקלאב ב-121 & דרג; C ל-15 דקות&nbsp;</td></tr><tr><td>מזרק פלסטיק 10 מ"ל&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>14955459</td><td></td></tr><tr><td>Rotor+&nbsp; &nbsp; &nbsp;</td><td>Singer Instruments&nbsp;</td><td>https://www.singerinstruments.com/resource/rotor-had/&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Short pin RePads 384 צפיפויות &nbsp;</td><td>Singer Instruments&nbsp; &nbsp;</td><td>REP-004&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>פינים קצרים RePads 96 צפיפויות &nbsp; &nbsp;</td><td>Singer Instruments&nbsp; &nbsp;</td><td>REP-002&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>נתרן כלוריד (NaCl)&nbsp; &nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>BP358-212&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>משכפל 96 פינים עם קפיץ</td><td>EnzyScreen&nbsp; &nbsp;</td><td>CR1000&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>להב ניתוח מנירוסטה מס' 25&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>08-918-5F</td><td></td></tr><tr><td>Tryptone&nbsp;</td><td>Oxoid&nbsp; &nbsp;</td><td>LP0042B&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>לוחות יוניוול</td><td>Singer Instruments&nbsp; &nbsp;</td><td>פלוסטס: PLU-003&nbsp; &nbsp;</td><td>מימד הלוח: 54 פעמים; 34 & פעמים; 38 ס"מ - ללא קירות פנימיים, שמספקים מידות פנימיות גדולות יותר.&nbsp;</td></tr><tr><td>לוחות יוניוול</td><td>VWR</td><td>לוחות תרבית רקמה לבאר אחת: 75780-348</td><td>אותם מידות כמו ה-PlusPlates.</td></tr><tr><td>תמצית שמרים&nbsp;</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>248510&nbsp;</td><td></td></tr></tbody></table>

שיטה בעלת תפוקה גבוהה להתבוננות בפנוטיפים של תנועתיות ב-pseudomonas aeruginosa

High-throughput Method for Observing Motility Phenotypes in Pseudomonas aeruginosa

שיטה בעלת תפוקה גבוהה להתבוננות בפנוטיפים של תנועתיות ב-Pseudomonas aeruginosa

Motility behaviors often play a significant role in the ability of a bacterium to exploit the resources available in its environment. This is particularly ...

high-throughput-method-for-observing-motility-phenotypes-pseudomonas

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

אימונולוגיה וזיהומים

פרוטוקול זה מתאר את הפיתוח של המכשיר microfluidic לחקירת chemotaxis חיידקים הדרגתיים ריכוז יציב של chemoeffectors.

מכשיר microfluidic לכימות Chemotaxis חיידקים Gradients ריכוז אורווה

מקור: Morales-Soto, N. et al., הכנה, הדמיה וכימות של מבחני תנועתיות פני השטח של חיידקים. J. Vis. Exp. (2015)סרטון זה מדגים בדיקת נחיל באמצעות חיידקים המבטאים חלבון פלואורסצנטי ירוק כדי לצפות בתנועתיות פני השטח על אגר רך. הדמיית זמן-lapse לוכדת התרחבות מתואמת והיווצרות קנוקנות, ומדגישה את תנועתיות פני השטח של החיידקים.

בדיקת נחיל להמחשת תנועתיות פני השטח של חיידקים

מקור: Chu, W., and Zhuang, X. הדמיית תנועתיות חיידקים על סמך תגובת צבע. J. Vis. Exp. (2022)סרטון זה מדגים בדיקת אגר חצי מוצקה מבוססת צבע חיזור להערכת תנועתיות חיידקים על ידי הבחנה חזותית בין זנים נעים ולא תנועתיים.

הדמיה של תנועתיות חיידקים באמצעות מדיום חצי מוצק בתוספת צבע חיזור

מקור: שיידוויילר, ד., ואחרים. שילוב מכשירים נוזליים עם מיקרוסקופיה וציטומטריית זרימה לחקר הובלה מיקרוביאלית במדיה נקבובית בקנה מידה מרחבי. J. Vis. Exp. (2020).הסרטון הזה מדגים את השימוש במכשיר מיקרופלואידי לכימות תנועתיות חיידקית באמצעות מטריצה נקבובית המורכבת מעמודים מסודרים באקראי. חיידקים מסומנים פלואורסצנטית מוכנסים למכשיר, מצולמים במיקרוסקופיה כשהם נעים דרך המטריצה הנקבובית אל ערוץ התצפית, ומנותחים ליצירת עקומת פריצת דרך (BTC).

הערכת תנועתיות חיידקית באמצעות מכשיר מיקרופלואידי

תנועתיות הנחיל מושפעת מגורמים פיזיקליים וסביבתיים. אנו מתארים פרוטוקול דו-שלבי והנחיות לעקיפת האתגרים הקשורים בדרך כלל להכנת בדיקת נחילים ואיסוף נתונים. נעשה שימוש בטכניקת הדמיה מקרוסקופית כדי לקבל מידע מפורט על התנהגות נחיל שאינו מסופק על ידי טכניקות הניתוח הנוכחיות.

הכנה, הדמיה, וכימות של מבחני תנועתיות Surface בקטריאלי

במחקר זה, תא זרימת ננו-microfluidic הועסק לדמיין והן מבחינה תפקודית לאפיין את תנועתיות והמרטיטה של Xylella fastidiosa, חיידק הגורם למחלה של פירס גפן.

ויזואליזציה של תנועתיות מפרכסים אפיון תפקידו של<em&gt; PilG</em&gt; ב<em&gt; Fastidiosa Xylella</em

מאמר זה מתאר את assay התפוקה גבוהה כי כבר נקבע בהצלחה למסך ספריות גדולות של מולקולות קטנות עבור היכולת הפוטנציאלית שלהם לתפעל רמות סלולריות של di-GMP המחזורי Pseudomonas aeruginosa, מתן כלי רב עצמה חדש לגילוי סמים אנטיבקטריאלי ובדיקה מתחמת.

הקמת הגדרת תפוקה גבוהה להקרנה מולקולות קטנות לווסת ג-di-GMP איתות<em&gt; Pseudomonas aeruginosa</em

חיידקים רבים משתמשים בתנועתיות המונעת על ידי פלאגלה כדי לנווט בסביבתם וליישב סביבה נוחה הן בנפרד והן כקולקטיב. הוכח כאן הוא השימוש בשלוש שיטות מבוססות המנצלות תנועתיות ככלי בחירה לזיהוי רכיבים / מסלולים התורמים לשחייה ותנועתיות נחיל.

חקירת תנועתיות מונחית פלאגלה באשריצ'יה קולי על ידי יישום שלוש טכניקות מבוססות בסדרה

כאן, אנו מתארים את הבנייה של מוטציות ריקות של אירומונס בגליקוזילטרנספראזות ספציפיות או באזורים המכילים גליקוזילטרנספראזות, מבחני תנועתיות וטיהור פלגלה שבוצעו כדי לבסס את המעורבות והתפקוד של האנזימים המקודדים שלהם בביוסינתזה של גליקאן, כמו גם את תפקידו של גליקאן זה בפתוגנזה חיידקית.

יצירת מוטציות ריקות כדי להבהיר את תפקידם של גליקוזילטרנספראזות חיידקיות בתנועתיות חיידקית

כאן, אנו מציגים פרוטוקול לזיהוי תנועתיות חיידקים בהתבסס על תגובת צבע. היתרונות העיקריים של שיטה זו הם כי קל להעריך ומדויק יותר, ואינו דורש ציוד מיוחד.

המחשת תנועתיות חיידקים בהתבסס על תגובת צבע

בכתב יד זה, אנו מספקים פרוטוקול מקיף להערכת הישרדות אנטיביוטיקה עבור Pseudomonas aeruginosa ו - Staphylococcus aureus, הפיכת פלסמידים ל - P. aeruginosa ו- S. aureus כדי ליצור זני כתב ולדמיין וריאנטים פנוטיפיים, כגון מתמידים, על ידי מיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי בהילוך מהיר.

הדמיית מיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי בהילוך מהיר של Pseudomonas aeruginosa ו - Staphylococcus aureus פנוטיפים הטרוגניים

חקור שיטה בעלת תפוקה גבוהה לניתוח תנועתיות ב-Pseudomonas aeruginosa באמצעות ספריית מוטנטים טרנספוזון. זיהוי גורמים גנטיים המשפיעים על התנהגות חיידקית ועל פיתוח אנטיביוטיקה חדשה.

שיטה בעלת תפוקה גבוהה להתבוננות בפנוטיפים של תנועתיות ב-Pseudomonas aeruginosa

גלה סרטונים נוספים