Name: תדירות והתפלגות של הצלבות במיוזה Caenorhabditis elegans על ידי גנוטיפ SNP באמצעות PCR בזמן אמת (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-07-11T15:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 18 s
Description: למדו שיטת qPCR לזיהוי צלבות במיוזה ב-Caenorhabditis elegans באמצעות גנוטיפ SNP. השיטה מפשטת את הזיהוי הגנטי ומאפשרת מדידה מדויקת של תדירות ותפלגות הצלבות בכרומוזומים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Jones, G., Kleckner, N., Zickler, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiosis+through+three+centuries%5BTitle%5D)+AND+%22Chromosoma%22%5BJournal%5D)">Meiosis through three centuries.</a> Chromosoma. 133 (2), 93-115 (2024).</li>
<li>Hassold, T. J., Hunt, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Missed+connections%3A+Recombination+and+human+aneuploidy%5BTitle%5D)+AND+%22Prenat+Diagn%22%5BJournal%5D)">Missed connections: Recombination and human aneuploidy.</a> Prenat Diagn. 41 (5), 584-590 (2021).</li>
<li>Barnes, T. M., Kohara, Y., Coulson, A., Hekimi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+recombination%2C+noncoding+DNA+and+genomic+organization+in+caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Meiotic recombination, noncoding DNA and genomic organization in caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 141 (1), 159-179 (1995).</li>
<li>Lim, J. G., Stine, R. R., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Domain-specific+regulation+of+recombination+in+Caenorhabditis+elegans+in+response+to+temperature%2C+age%2C+and+sex%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Domain-specific regulation of recombination in Caenorhabditis elegans in response to temperature, age, and sex.</a> Genetics. 180 (2), 715-726 (2008).</li>
<li>Rockman, M. V., Kruglyak, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recombinational+landscape+and+population+genomics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Recombinational landscape and population genomics of Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 5 (3), e1000419(2009).</li>
<li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77 (1), 71-94 (1974).</li>
<li>Li, W., Yanowitz, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Atm+and+atr+influence+meiotic+crossover+formation+through+antagonistic+and+overlapping+functions+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Atm and atr influence meiotic crossover formation through antagonistic and overlapping functions in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 212 (2), 431-443 (2019).</li>
<li>Rose, A. M., Baillie, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+effect+of+temperature+and+parental+age+on+recombination+and+nondisjunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The effect of temperature and parental age on recombination and nondisjunction in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 92 (2), 409-418 (1979).</li>
<li>Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cis-acting+locus+that+promotes+crossing+over+between+X+chromosomes+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A cis-acting locus that promotes crossing over between X chromosomes in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 136 (3), 887-902 (1994).</li>
<li>Youds, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rtel-1+enforces+meiotic+crossover+interference+and+homeostasis%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Rtel-1 enforces meiotic crossover interference and homeostasis.</a> Science. 327 (5970), 1254-1258 (2010).</li>
<li>Emmons, S. W., Yesner, L., Ruan, K. S., Katzenberg, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+a+transposon+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Evidence for a transposon in Caenorhabditis elegans.</a> Cell. 32 (1), 55-65 (1983).</li>
<li>Williams, B. D., Schrank, B., Huynh, C., Shownkeen, R., Waterston, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genetic+mapping+system+in+Caenorhabditis+elegans+based+on+polymorphic+sequence-tagged+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">A genetic mapping system in Caenorhabditis elegans based on polymorphic sequence-tagged sites.</a> Genetics. 131 (3), 609-624 (1992).</li>
<li>Hillers, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+control+of+meiotic+crossing+over+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide control of meiotic crossing over in C. elegans.</a> Curr Biol. 13 (18), 1641-1647 (2003).</li>
<li>Wicks, S. R., Yeh, R. T., Gish, W. R., Waterston, R. H., Plasterk, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+gene+mapping+in+Caenorhabditis+elegans+using+a+high-density+polymorphism+map%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Rapid gene mapping in Caenorhabditis elegans using a high-density polymorphism map.</a> Nat Genet. 28 (2), 160-164 (2001).</li>
<li>Campos, T. L., Korhonen, P. K., Sternberg, P. W., Gasser, R. B., Young, N. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Predicting+gene+essentiality+in+Caenorhabditis+elegans+by+feature+engineering+and+machine-learning%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Predicting gene essentiality in Caenorhabditis elegans by feature engineering and machine-learning.</a> Comput Struct Biotechnol J. 18, 1093-1102 (2020).</li>
<li>Fay, D., Bender, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Snps%3A+Introduction+and+two-point+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Snps: Introduction and two-point mapping.</a> WormBook. , (2008).</li>
<li>Hwang, H. Y., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+genetic+mapping+using+insertion-deletion+polymorphisms+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Fast genetic mapping using insertion-deletion polymorphisms in Caenorhabditis elegans.</a> Sci Rep. 11 (1), 11017(2021).</li>
<li>Davis, M. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+single+nucleotide+polymorphism+mapping+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Rapid single nucleotide polymorphism mapping in C. elegans.</a> BMC Genomics. 6, 118(2005).</li>
<li>Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Allelic+discrimination+using+fluorogenic+probes+and+the+5%27+nuclease+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Genet+Anal%22%5BJournal%5D)">Allelic discrimination using fluorogenic probes and the 5' nuclease assay.</a> Genet Anal. 14 (5-6), 143-149 (1999).</li>
<li>Li, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tumor+suppressor+BRCA1-BARD1+complex+localizes+to+the+synaptonemal+complex+and+regulates+recombination+under+meiotic+dysfunction+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">The tumor suppressor BRCA1-BARD1 complex localizes to the synaptonemal complex and regulates recombination under meiotic dysfunction in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genet. 14 (11), e1007701(2018).</li>
<li>Saito, T. T., Lui, D. Y., Kim, H. M., Meyer, K., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interplay+between+structure-specific+endonucleases+for+crossover+control+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Interplay between structure-specific endonucleases for crossover control during Caenorhabditis elegans meiosis.</a> PLoS Genet. 9 (7), e1003586(2013).</li>
<li>Saito, T. T., Youds, J. L., Boulton, S. J., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+him-18%2Fslx-4+interacts+with+slx-1+and+xpf-1+and+maintains+genomic+integrity+in+the+germline+by+processing+recombination+intermediates%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans him-18/slx-4 interacts with slx-1 and xpf-1 and maintains genomic integrity in the germline by processing recombination intermediates.</a> PLoS Genet. 5 (11), e1000735(2009).</li>
<li>Longo, M. C., Berninger, M. S., Hartley, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+uracil+DNA+glycosylase+to+control+carry-over+contamination+in+polymerase+chain+reactions%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">Use of uracil DNA glycosylase to control carry-over contamination in polymerase chain reactions.</a> Gene. 93 (1), 125-128 (1990).</li>
<li>Kutyavin, I. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3%27-minor+groove+binder-DNA+probes+increase+sequence+specificity+at+pcr+extension+temperatures%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">3'-minor groove binder-DNA probes increase sequence specificity at pcr extension temperatures.</a> Nucleic Acids Res. 28 (2), 655-661 (2000).</li>
<li>Hammarlund, M., Davis, M. W., Nguyen, H., Dayton, D., Jorgensen, E. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heterozygous+insertions+alter+crossover+distribution+but+allow+crossover+interference+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Heterozygous insertions alter crossover distribution but allow crossover interference in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 171 (3), 1047-1056 (2005).</li>
<li>Hodgkin, J., Horvitz, H. R., Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nondisjunction+mutants+of+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Nondisjunction mutants of the nematode Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 91 (1), 67-94 (1979).</li>
<li>Meneely, P. M., Farago, A. F., Kauffman, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossover+distribution+and+high+interference+for+both+the+X+chromosome+and+an+autosome+during+oogenesis+and+spermatogenesis+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossover distribution and high interference for both the X chromosome and an autosome during oogenesis and spermatogenesis in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 162 (3), 1169-1177 (2002).</li>
<li>Nabeshima, K., Villeneuve, A. M., Hillers, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome-wide+regulation+of+meiotic+crossover+formation+in+Caenorhabditis+elegans+requires+properly+assembled+chromosome+axes%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome-wide regulation of meiotic crossover formation in Caenorhabditis elegans requires properly assembled chromosome axes.</a> Genetics. 168 (3), 1275-1292 (2004).</li>
<li>Phillips, C. M., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+family+of+zinc-finger+proteins+is+required+for+chromosome-specific+pairing+and+synapsis+during+meiosis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Cell%22%5BJournal%5D)">A family of zinc-finger proteins is required for chromosome-specific pairing and synapsis during meiosis in C. elegans.</a> Dev Cell. 11 (6), 817-829 (2006).</li>
<li>Mancera, E., Bourgon, R., Brozzi, A., Huber, W., Steinmetz, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-resolution+mapping+of+meiotic+crossovers+and+non-crossovers+in+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">High-resolution mapping of meiotic crossovers and non-crossovers in yeast.</a> Nature. 454 (7203), 479-485 (2008).</li>
<li>Qi, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+meiotic+crossovers+and+gene+conversion+by+whole-genome+sequencing+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Characterization of meiotic crossovers and gene conversion by whole-genome sequencing in Saccharomyces cerevisiae.</a> BMC Genomics. 10, 475(2009).</li>
<li>Miller, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+whole-chromosome+analysis+of+meiotic+recombination+in+Drosophila+melanogaster%5BTitle%5D)+AND+%22G3+%28Bethesda%29%22%5BJournal%5D)">A whole-chromosome analysis of meiotic recombination in Drosophila melanogaster.</a> G3 (Bethesda). 2 (2), 249-260 (2012).</li>
<li>Carlton, P. M., Farruggio, A. P., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+link+between+meiotic+prophase+progression+and+crossover+control%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">A link between meiotic prophase progression and crossover control.</a> PLoS Genet. 2 (2), e12(2006).</li>
<li>Tsai, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+crossover+number+and+distribution+are+regulated+by+a+dosage+compensation+protein+that+resembles+a+condensin+subunit%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Meiotic crossover number and distribution are regulated by a dosage compensation protein that resembles a condensin subunit.</a> Genes Dev. 22 (2), 194-211 (2008).</li>
<li>Bhalla, N., Wynne, D. J., Jantsch, V., Dernburg, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zhp-3+acts+at+crossovers+to+couple+meiotic+recombination+with+synaptonemal+complex+disassembly+and+bivalent+formation+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Zhp-3 acts at crossovers to couple meiotic recombination with synaptonemal complex disassembly and bivalent formation in C. elegans.</a> PLoS Genet. 4 (10), e1000235(2008).</li>
<li>Yokoo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cosa-1+reveals+robust+homeostasis+and+separable+licensing+and+reinforcement+steps+governing+meiotic+crossovers%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cosa-1 reveals robust homeostasis and separable licensing and reinforcement steps governing meiotic crossovers.</a> Cell. 149 (1), 75-87 (2012).</li>
<li>Almanzar, D. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Meiotic+DNA+exchanges+in+C.+elegans+are+promoted+by+proximity+to+the+synaptonemal+complex%5BTitle%5D)+AND+%22Life+Sci+Alliance%22%5BJournal%5D)">Meiotic DNA exchanges in C. elegans are promoted by proximity to the synaptonemal complex.</a> Life Sci Alliance. 6 (4), e202301906(2023).</li>
<li>De Los Santos, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mus81%2Fmms4+endonuclease+acts+independently+of+double-holliday+junction+resolution+to+promote+a+distinct+subset+of+crossovers+during+meiosis+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The mus81/mms4 endonuclease acts independently of double-holliday junction resolution to promote a distinct subset of crossovers during meiosis in budding yeast.</a> Genetics. 164 (1), 81-94 (2003).</li>
<li>Saito, T. T., Colaiacovo, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+crossover+frequency+and+distribution+during+meiotic+recombination%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harb+Symp+Quant+Biol%22%5BJournal%5D)">Regulation of crossover frequency and distribution during meiotic recombination.</a> Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 82, 223-234 (2017).</li>
<li>Zalevsky, J., Macqueen, A. J., Duffy, J. B., Kemphues, K. J., Villeneuve, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crossing+over+during+Caenorhabditis+elegans+meiosis+requires+a+conserved+mutS-based+pathway+that+is+partially+dispensable+in+budding+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Crossing over during Caenorhabditis elegans meiosis requires a conserved mutS-based pathway that is partially dispensable in budding yeast.</a> Genetics. 153 (3), 1271-1283 (1999).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>101-1000&mu; l קצה פיפטה</td><td>QSP</td><td>111-נ-קיו</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת 0.5mol/I-EDTA (pH 8.0)</td><td>נקלאי טסקה</td><td>14347-21</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת נתרן הידרוקסיד 10mol/I</td><td>נקלאי טסקה</td><td>94611-45</td><td></td></tr><tr><td>10X מאגר ירוק DreamTaq</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>10&mu; L, קצה ארוך, מוגדלת</td><td>FUKAEKASEI, ווטסון</td><td>110-207 מעלות צלזיוס</td><td></td></tr><tr><td>200&mu; L, קצה סטנדרטי, מדורג</td><td>FUKAEKASEI, ווטסון</td><td>110-705 מעלות צלזיוס</td><td></td></tr><tr><td>אבקת אגר</td><td>נקלאי טסקה</td><td>01028-14</td><td></td></tr><tr><td>אגרוז</td><td>PH, יפן</td><td>PH108</td><td></td></tr><tr><td>אוטוקלאב TOMY דגם ES-215 מעקר קיטור בלחץ גבוה</td><td>טומי סייקו</td><td>ES-215</td><td></td></tr><tr><td>Bacto Peptone עיכול אנזימטי של חלבון</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>211677</td><td></td></tr><tr><td>חומצה בורית</td><td>נקלאי טסקה</td><td>05215-05</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans בריסטול סוג פראי&nbsp;</td><td>המרכז לגנטיקה של Caenorhabditis</td><td>נ2</td><td></td></tr><tr><td>Caenorhabditis elegans סוג בר הוואי</td><td>המרכז לגנטיקה של Caenorhabditis</td><td>סי.בי.4856</td><td></td></tr><tr><td>סידן כלורי</td><td>נקלאי טסקה</td><td>06729-55</td><td></td></tr><tr><td>ccIs4251 [(pSAK2) myo-3p::GFP::LacZ::NLS + (pSAK4) myo-3p::GFP מיטוכונדריאלי + dpy-20(+)] I</td><td>מעבדת סאיטו</td><td>TTS24</td><td>במקור מ-PD4251</td></tr><tr><td>כולסטרול</td><td>נקלאי טסקה</td><td>08721-62</td><td></td></tr><tr><td>מבחני גנוטיפ מותאמים אישית של TaqMan SNP</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>4332077</td><td></td></tr><tr><td>תערובת תמיסות דאוקסינוקלאוטיד (dNTP).</td><td>מעבדות ביולוגיות של ניו אינגלנד</td><td>N04470</td><td></td></tr><tr><td>DigPrint Doc Tablet DP-T130z</td><td>ביו טולס</td><td>DP-T130z</td><td></td></tr><tr><td>די-אשלגן הידרוגנפוספט</td><td>נקלאי טסקה</td><td>28726-05</td><td></td></tr><tr><td>ניתוח מיקרוסקופ</td><td>ניקון</td><td>SMZ-745 C-DS</td><td></td></tr><tr><td>חלום טאק DNA פולימראז</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>EP0713</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת אתידיום ברומיד</td><td>נקלאי טסקה</td><td>14631-94</td><td></td></tr><tr><td>פריימר קדימה עבור WBVar01973670</td><td>IDT</td><td>103988736</td><td>atgtctcacccaaggttgaa</td></tr><tr><td>ג'לטין</td><td>נקלאי טסקה</td><td>166-31</td><td></td></tr><tr><td>גילסון פיפטמן פיפטמן קלאסי</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td></td><td></td></tr><tr><td>IGEPAL CA-630</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>18896</td><td></td></tr><tr><td>מגנזיום גופרתי הפטהידרט</td><td>נקלאי טסקה</td><td>21003-75</td><td></td></tr><tr><td>מיקרו-אמפ אופטי 96 בארות צלחת ריאקטון</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>N8010560</td><td></td></tr><tr><td>סרט אדדיב אופטי מיקרו-אמפר</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>4311971</td><td></td></tr><tr><td>מיני-Amp&nbsp; מחזור תרמי</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>מיני-אמפר</td><td></td></tr><tr><td>Mini-Sub Cell GT מערכת אלקטרופורזה אופקית, מגש בגודל 7 x 10 ס"מ</td><td>מעבדות ביו-ראד</td><td>1704466</td><td></td></tr><tr><td>Nichipet EXII</td><td>ניצ'יריו</td><td>00-NPX2-2</td><td></td></tr><tr><td>ניצ'יפט EXII מולטי</td><td>ניצ'יריו</td><td>00-NPM-12VP</td><td></td></tr><tr><td>פיפט מאטה NEO</td><td>ניצ'יריו</td><td>00-PMNEO</td><td></td></tr><tr><td>אשלגן כלורי</td><td>נקלאי טסקה</td><td>285-38</td><td></td></tr><tr><td>אשלגן דיהידרוגנפוספט</td><td>נקלאי טסקה</td><td>28720-65</td><td></td></tr><tr><td>פרוטאינאז K</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>EO0491</td><td></td></tr><tr><td>מערכת PCR בזמן אמת QuantStudio 1, 96 בארות, 0.2 מ"ל</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>א40426</td><td></td></tr><tr><td>טעינה מהירה סגול 1kb פלוס סולם DNA</td><td>מעבדות ביולוגיות של ניו אינגלנד</td><td>N0550S</td><td></td></tr><tr><td>פריימר הפוך עבור WBVar01973670</td><td>IDT</td><td>103988737</td><td>tggctactcctagtcactga</td></tr><tr><td>נתרן כלורידים</td><td>נקלאי טסקה</td><td>31319-45</td><td></td></tr><tr><td>TaqPath ProAmp מאסטר מיקס</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>א30866</td><td></td></tr><tr><td>צלחת TC 35, סטנדרטית</td><td>סרשטדט</td><td>83.3900</td><td></td></tr><tr><td>טריס (הידרוקסימתיל) אמינומתאן</td><td>נקלאי טסקה</td><td>35406-75</td><td></td></tr><tr><td>בסיס טריזמה</td><td>סיגמא-אולדריץ'</td><td>&nbsp; T1503-1 ק"ג</td><td></td></tr><tr><td>טווין 20</td><td>ריאגנט יוניאמה</td><td>03706</td><td></td></tr><tr><td>WormStuff בחירת תולעת</td><td>ג'נסי סיינטיפיק</td><td>59-AWP</td><td></td></tr><tr><td>טיפים לבחירת תולעת WormStuff (90/10% pt/ir, 30 מד)</td><td>ג'נסי סיינטיפיק</td><td>59-30PI36</td><td></td></tr></tbody></table>

תדירות והתפלגות של הצלבות במיוזה caenorhabditis elegans על ידי גנוטיפ snp באמצעות pcr בזמן אמת

Frequency and Distribution of Crossovers in Caenorhabditis elegans Meiosis by SNP Genotyping using Real-time PCR

זיהינו את ארבעת אתרי ה-SNP בכרומוזום II ב-C. elegans על ידי בדיקת גנוטיפ SNP כדי לכמת היווצרות הצלבה לכל אורך הכרומוזום, בזרוע שמאל, באזור המרכזי ובזרוע ימין. איתור SNPs מתבצע על פי הוראות היצרן. תערובת המאסטר מכילה Taq DNA Polymerase, Heat-labile uracil-N-glycosylase (UNG), dNTP עם dUTP וצבע ROX ייחוס פסיבי. Taq DNA פולימראז מופעל ב-95 מעלות צלזיוס, ומאפשר עיכוב של הגברה לא ספציפית בטמפרטורות נמוכות. UNG ו-dUTP מאפשרים פירוק של מוצרי PCR מוגברים בעבר, ומונעים זיהום העברה ותוצאות חיוביות כוזבות פוטנציאליות<sup c...

תדירות והתפלגות של הצלבות במיוזה Caenorhabditis elegans על ידי גנוטיפ SNP באמצעות PCR בזמן אמת

Caenorhabditis elegans is an excellent model organism for studying meiosis. In addition to general advantages, such as a short reproductive cycle, many ...

frequency-distribution-crossovers-caenorhabditis-elegans-meiosis-snp

Research

JoVE Journal

Genetics

גנטיקה

סרטון זה מתאר טכניקה לסינון מהיר של נמטודה בודדת לאיתור סמן גנטי על ידי בדיקת PCR. בפרוטוקול לדוגמה, אנו בודקים עריכת גנום מבוססת קריספר.

PCR תולעת יחידה: שיטה לחלץ ולהגביר DNA גנומי

פרוטוקול זה מתאר הליך מהיר וצריכת חומר נמוך לשילוב של מערכים חוץ-כרומוזומליים טרנסגניים בגנום Caenorhabditis elegans באמצעות קרינה אולטרה סגולה (UV). יתר על כן, פרוטוקול זה מתאים במיוחד לקווים טרנסגניים המשדרים מערכים חוץ-כרומוזומליים בקצב גבוה.

פרוטוקול מהיר לשילוב מערכים חוץ-כרומוזומליים עם קצב העברה גבוה לגנום C. elegans

גנטי בקידוד היסטון-miniSOG גורם מוטציות תורשתי הגנום כולו באופן אור תלוי כחול. שיטת mutagenesis זה היא פשוטה, מהירה, ללא כימיקלים רעילים, מתאים היטב סריקה גנטית קדימה ואינטגרציה transgene.

Optogenetic mutagenesis אקראי באמצעות היסטון-miniSOG ב<em&gt; C. elegans</em

שיטה זו מאפשרת לדור של נמטודות Caenorhabditis tetraploid ו- triploid של כל זן דיפלואידי. זני polyploid שנוצר על ידי שיטה זו השתמשו ללמוד אינטראקציות כרומוזום ב- meiotic prophase, שיטה זו שימושית לבחינת שאלות בסיסיות חשובות תא, התפתחותית, אבולוציונית, וביולוגיה סרטן.

מניפולציה של פלואידיות ב Caenorhabditis elegans

כאן, אנו מציגים שיטה להנדס את הגנום של C. elegans שימוש CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins ותבניות תיקון התלויים הומולוגיה.

מהירה עם צינור נתיישב עבור יצירת מוטציות נקודה גנומית ב- C. elegans באמצעות CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

כאן, אנו מציגים פרוטוקול מפורט לזיהוי רקומבינציה הומולוגית אירועים שהתרחשו במהלך בתאי גזע עובריים בעכבר באמצעות סופג בדרום ו/או ה-PCR. שיטה זו היא כשניסחתי את הדור של nonmuscle צולבות הקישור חוטים שרירן II גנטי החלפת העכבר מודלים בטכנולוגיה המסורתית עובריים מבוססי תאי גזע הומולוגי בתיווך רקומבינציה מיקוד.

זיהוי של אירועי רקומבינציה הומולוגית בתאי גזע עובריים בעכבר באמצעות סופג הדרומי ואת תגובת שרשרת פולימראזית

במאמר זה פרוטוקול תפוקה גבוהה עבור קביעה מהירה ואמינה של רמות ביטוי גנים בדגימות C. elegans יחיד או בתפזורת מתואר. פרוטוקול זה אינו דורש בידוד RNA ומייצר cDNA ישירות מדגימות. ניתן להשתמש בו יחד עם פלטפורמות qPCR ננופלואידיות מרובות תפוקה גבוהה בזמן אמת.

RT-PCR כמותי בעל תפוקה גבוהה בדגימות סי.

פרוטוקול זה יכול לשמש לביצוע סקרים אקולוגיים בקנה מידה גדול של נמטודות Caenorhabditis עצמית. היתרון העיקרי של שיטה זו הוא ארגון יעיל וניתוח של נתונים אקולוגיים ומולקולריים הקשורים לנמטודות שנאספו מהטבע.

גישה מדרגית מאוד לביצוע סקרים אקולוגיים של נמטודות קאנורהבדיטיס Selfing

מתואר פרוטוקול המשתמש במיקרו-דיסקציה של לייזר כדי לבודד רקמות נמטודה בודדות לריצוף RNA. הפרוטוקול אינו דורש ערכות כלים גנטיות ספציפיות למינים, מה שמאפשר להשוות פרופילי ביטוי גנים בין מינים שונים ברמה של דגימות של רקמה אחת.

מיקרו-דיסקציה של לייזר עבור יישומים של רקמה אחת אגנוסטית של מינים

זוהי שיטה נפוצה עבור דיסקציה של גונאד C. elegans ואחריה סדק הקפאה, אשר מייצרת דגימות germline עבור immunofluorescence באמצעות צביעת נוגדנים, או עבור צביעת DAPI פשוטה כדי לדמיין DNA. פרוטוקול זה זכה להצלחה עבור סטודנטים לתואר ראשון במעבדת מחקר ובהתנסות מחקרית לתואר ראשון מבוססת קורסים.

ג. אלגנס גונד דיסקציה והקפאת סדק לאימונופלואורסצנציה וצביעת DAPI

כאן, אנו מציגים פרוטוקול ATAC-seq מהיר ופשוט שיושם בתולעת שלמה בשלב L4 Caenorhabditis elegans באמצעות 30 מיקרו-ליטר של כדור תולעת בלבד.

פרופיל נגישות כרומטין בזחלים שלמים של Caenorhabditis elegans L4

למדו שיטת qPCR לזיהוי צלבות במיוזה ב-Caenorhabditis elegans באמצעות גנוטיפ SNP. השיטה מפשטת את הזיהוי הגנטי ומאפשרת מדידה מדויקת של תדירות ותפלגות הצלבות בכרומוזומים.

תדירות והתפלגות של הצלבות במיוזה Caenorhabditis elegans על ידי גנוטיפ SNP באמצעות PCR בזמן אמת

גלה סרטונים נוספים