Name: ריצוף Amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-29T13:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: חקור ריצוף amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה לזיהוי עמידות לתרופות בשחפת. שיטה זו מספקת תוצאות מדויקות בזמן קצר יותר משיטות מסורתיות בסביבות משאבים מוגבלים.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Tuberculosis report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Baltimore+Health+News%22">Baltimore Health News</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>WHO Malaria Department report. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Report+20-23%22">Report 20-23</a>. , WHO. (2023).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22The+End+Strategy+TB%22">The End Strategy TB</a>. 53 (1), WHO. 1689-1699 (2015).</li>
<li>Cabibbe, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+targeted+nextgeneration+sequencing+assay+on+a+portable+sequencing+platform+for+culturefree+detection+of+drugresistant+tuberculosis+from+clinical+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Application of targeted nextgeneration sequencing assay on a portable sequencing platform for culturefree detection of drugresistant tuberculosis from clinical samples.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0063220(2020).</li>
<li>Jouet, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deep+amplicon+sequencing+for+culturefree+prediction+of+susceptibility+or+resistance+to+13+antituberculous+drugs%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Deep amplicon sequencing for culturefree prediction of susceptibility or resistance to 13 antituberculous drugs.</a> Eur Respir J. 57 (3), 2002338(2021).</li>
<li>NG, K. C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+well+do+routine+molecular+diagnostics+detect+Rifampin%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">How well do routine molecular diagnostics detect Rifampin.</a> J Clin Microbiol. 57 (1), e0128723(2019).</li>
<li>MacLean, E., Kohli, M., Weber, S. F., Suresh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+molecular+diagnosis+of+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Advances in molecular diagnosis of tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 58 (10), e0158219(2020).</li>
<li>Sibandze, D. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+diagnostics+of+tuberculosis+resistance+by+targeted+stool+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Med%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular diagnostics of tuberculosis resistance by targeted stool sequencing.</a> Genome Med. 14 (1), 42(2022).</li>
<li>Shah, M., Chihota, V., Coetzee, G., Churchyard, G., Dorman, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+laboratory+costs+of+rapid+molecular+tests+and+conventional+diagnostics+for+detection+of+tuberculosis+and+drugresistant+tuberculosis+in+South+Africa%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparison of laboratory costs of rapid molecular tests and conventional diagnostics for detection of tuberculosis and drugresistant tuberculosis in South Africa.</a> BMC Infect. Dis. 13 (1), 352(2013).</li>
<li>Hu, T., Chitnis, N., Monos, D., Dinh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nextgeneration+sequencing+technologies%3A+An+overview%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Immunol%22%5BJournal%5D)">Nextgeneration sequencing technologies: An overview.</a> Hum Immunol. 82 (10), 801-811 (2021).</li>
<li>Pervez, M. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+review+of+performance+of+nextgeneration+sequencing+platforms%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Res+Int%22%5BJournal%5D)">A comprehensive review of performance of nextgeneration sequencing platforms.</a> Biomed Res Int. 2022, 3457806(2022).</li>
<li>Tafess, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targetedsequencing+workflows+for+comprehensive+drug+resistance+profiling+of+Mycobacterium+tuberculosis+cultures+using+two+commercial+sequencing+platforms%3A+Comparison+of+analytical+and+diagnostic+performance%2C+turnaround+time%2C+and+cost%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Targetedsequencing workflows for comprehensive drug resistance profiling of Mycobacterium tuberculosis cultures using two commercial sequencing platforms: Comparison of analytical and diagnostic performance, turnaround time, and cost.</a> Clin Chem. 66 (6), 809-820 (2020).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+rapid+communication%22">WHO rapid communication</a>. , WHO. https://www.who.int/publications/i/item/9789240076372 (2023).</li>
<li>Hazra, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+wholegenome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis+on+treatment+outcomes+for+MDRTB%2FXDRTB%3A+A+systematic+review%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmaceutics%22%5BJournal%5D)">Impact of wholegenome sequencing of Mycobacterium tuberculosis on treatment outcomes for MDRTB/XDRTB: A systematic review.</a> Pharmaceutics. 15 (6), 1408(2023).</li>
<li>Shea, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+wholegenome+sequencing+and+reporting+of+drug+resistance+profiles+on+clinical+cases+of+Mycobacterium+tuberculosis+in+New+York+State%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Comprehensive wholegenome sequencing and reporting of drug resistance profiles on clinical cases of Mycobacterium tuberculosis in New York State.</a> J Clin Microbiol. 55 (6), 1871-1882 (2017).</li>
<li>Meehan, C. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole+genome+sequencing+of+Mycobacterium+tuberculosis%3A+Current+standards+and+open+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis: Current standards and open issues.</a> Nat Rev Microbiol. 17 (10), 533-545 (2019).</li>
<li>Heupink, T. H., Verboven, L., Warren, R. M., Van Rie, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+and+accurate+genetic+variant+identification+from+contaminated+and+lowcoverage+Mycobacterium+tuberculosis+whole+genome+sequencing+data%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Genom%22%5BJournal%5D)">Comprehensive and accurate genetic variant identification from contaminated and lowcoverage Mycobacterium tuberculosis whole genome sequencing data.</a> Microb Genom. 7 (1), e000555(2021).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interpretation+of+the+third+edition+of+WHO+consolidated+guidelines+on+tuberculosis%3A+Module+3%3A+Diagnosis%3A+Rapid+diagnostics+for+tuberculosis+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Chin+J+Antituberc%22%5BJournal%5D)">Interpretation of the third edition of WHO consolidated guidelines on tuberculosis: Module 3: Diagnosis: Rapid diagnostics for tuberculosis detection.</a> Chin J Antituberc. 46 (2), 120-130 (2024).</li>
<li>Kambli, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+nextgeneration+sequencing+directly+from+sputum+for+comprehensive+genetic+information+on+drugresistant+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">Targeted nextgeneration sequencing directly from sputum for comprehensive genetic information on drugresistant Mycobacterium tuberculosis.</a> Tuberculosis. 127 (1), 102051(2021).</li>
<li>Use of targeted nextgeneration sequencing to detect drugresistant tuberculosis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Rapid+Communication%22">Rapid Communication</a>. , WHO. 1-8 (2023).</li>
<li>Nandlal, L., Perumal, R., Naidoo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+molecular+assays+for+the+diagnosis+of+drugresistant+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Drug+Resist%22%5BJournal%5D)">Rapid molecular assays for the diagnosis of drugresistant tuberculosis.</a> Infect Drug Resist. 15 (1), 4971-4984 (2022).</li>
<li>Dippenaar, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanopore+sequencing+for+Mycobacterium+tuberculosis%3A+A+critical+review+of+the+literature%2C+new+developments%2C+and+future+opportunities%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Nanopore sequencing for Mycobacterium tuberculosis: A critical review of the literature, new developments, and future opportunities.</a> J Clin Microbiol. 60 (5), e0123422(2022).</li>
<li>Chan, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+economical+drug+resistance+profiling+with+nanopore+MinION+for+clinical+specimens+with+low+bacillary+burden+of+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Res+Notes%22%5BJournal%5D)">Rapid and economical drug resistance profiling with nanopore MinION for clinical specimens with low bacillary burden of Mycobacterium tuberculosis.</a> BMC Res Notes. 13 (1), 123(2020).</li>
<li>Feuerriegel, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+genomic+first+and+secondline+drug+resistance+prediction+from+clinical+Mycobacterium+tuberculosis+specimens+using+DeeplexMycTB%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+Respir+J%22%5BJournal%5D)">Rapid genomic first and secondline drug resistance prediction from clinical Mycobacterium tuberculosis specimens using DeeplexMycTB.</a> Eur Respir J. 57 (4), 2004784(2021).</li>
<li>GenoScreen product brochure. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Deeplex+MycTB%22">Deeplex MycTB</a>. , GenoScreen. (2023).</li>
<li>Mtafya, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+practical+approach+to+render+tuberculosis+samples+safe+for+application+of+tuberculosis+molecular+bacterial+load+assay+in+clinical+settings+without+a+biosafety+level+3+laboratory%5BTitle%5D)+AND+%22Tuberculosis%22%5BJournal%5D)">A practical approach to render tuberculosis samples safe for application of tuberculosis molecular bacterial load assay in clinical settings without a biosafety level 3 laboratory.</a> Tuberculosis. 138 (1), 102194(2023).</li>
<li>Suganthi, P., Usharani, B., Venkateswari, R., Muthuraj, M. Biosafety practices in mycobacteriology laboratory. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSuganthi%2C+P+%22Research+Advances+in+Microbiology+and+Biotechnology%22">Research Advances in Microbiology and Biotechnology</a>. 3, B P International (a part of SCIENCEDOMAIN International). Chennai. 1-39 (2023).</li>
<li>consolidated guidelines on tuberculosis. Module 4: Treatment and care. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22WHO+guideline%22">WHO guideline</a>. , WHO. (2022).</li>
<li>Williams, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrixbased+DNA+extraction+for+targeted+nextgeneration+sequencing+on+decontaminated+sputum+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Matrixbased DNA extraction for targeted nextgeneration sequencing on decontaminated sputum samples.</a> J Vis Exp. (181), e68147(2025).</li>
<li>Delahaye, C., Nicolas, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequencing+DNA+with+nanopores%3A+Troubles+and+biases%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Sequencing DNA with nanopores: Troubles and biases.</a> PLoS One. 16 (2), e0245534(2021).</li>
<li>Zhao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+drugresistant+tuberculosis+genes+using+direct+PCR+amplification+and+Oxford+Nanopore+Technology+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Can+J+Infect+Dis+Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of drugresistant tuberculosis genes using direct PCR amplification and Oxford Nanopore Technology sequencing.</a> Can J Infect Dis Med Microbiol. 2022, 8845672(2022).</li>
<li>Tagliani, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Culture+and+nextgeneration+sequencingbased+drug+susceptibility+testing+unveil+high+levels+of+drugresistantTB+in+Djibouti%3A+Results+from+the+first+national+survey%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Culture and nextgeneration sequencingbased drug susceptibility testing unveil high levels of drugresistantTB in Djibouti: Results from the first national survey.</a> Sci Rep. 7 (1), 15076(2017).</li>
<li>Smith, C., Halse, T. A., Shea, J., Modestil, H., Fowler, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessing+nanopore+sequencing+for+clinical+diagnostics%3A+For+Mycobacterium+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Assessing nanopore sequencing for clinical diagnostics: For Mycobacterium tuberculosis.</a> J Clin Microbiol. 59 (7), e0123421(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>15 מ"ל & שפופרות קשירת לואו בנפח 1.5 מ"ל או 2 מ"ל</td><td>אפנדורף</td><td>EP0030108051-250EA</td><td></td></tr><tr><td>סולם 1kb</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>SM0311</td><td></td></tr><tr><td>צינורות עם מכסה בורג 2 מ"ל</td><td>Scientific Specialties Inc</td><td>P2TUB056C-0001.5ST</td><td></td></tr><tr><td>חרוזי זכוכית סטריליים בקוטר 2 מ"מ</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>Z273627-1EA</td><td></td></tr><tr><td>חרוז AMPure XP</td><td>בקמן קולטר</td><td>A63881</td><td></td></tr><tr><td>Deeplex Myc-TB&nbsp;</td><td>ג'נוסקרין</td><td>20090205</td><td></td></tr><tr><td>תא אלקטרופורזה</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>A25977</td><td></td></tr><tr><td>אלכוהול אתיל, טהור</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>E7023-500ML</td><td></td></tr><tr><td>הומוגנייזר FastPrep</td><td>ביומדיקל MP</td><td>116005500</td><td></td></tr><tr><td>קצות פיפטות מסנן (10 ומיקרו; L)&nbsp;</td><td>ביו-סמארט סיינטי</td><td>FT-10-R</td><td></td></tr><tr><td>קצות פיפטות פילטר (1000 ומיקרו; L)&nbsp;</td><td>ביו-סמארט סיינטי</td><td>FT-1000-R</td><td></td></tr><tr><td>קצות פיפטת פילטר (20 ומיקרו; L)&nbsp;</td><td>ביו-סמארט סיינטי</td><td>FT-20-R</td><td></td></tr><tr><td>קצות פיפטת פילטר (200 ומיקרו; L)&nbsp;</td><td>ביו-סמארט סיינטי</td><td>FT-200-R</td><td></td></tr><tr><td>Flow-cell&nbsp;</td><td>אוקספורד ננופור טכנולוגיות</td><td>FLO-MIN114</td><td></td></tr><tr><td>בלוק חימום</td><td>אפנדורף</td><td>5382000031</td><td></td></tr><tr><td>מטריצת InstaGene</td><td>ביו-ראד</td><td>BBRD7326030</td><td></td></tr><tr><td>Magnetic Rack&nbsp;</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק&nbsp;</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>מיקרוצנטריפוגה</td><td>אפנדורף&nbsp;</td><td>5406000046</td><td></td></tr><tr><td>מיניון</td><td>אוקספורד ננופור טכנולוגיות</td><td>MK1B</td><td></td></tr><tr><td>ערכת ברקודינג מקורית V14&nbsp;</td><td>אוקספורד ננופור טכנולוגיות</td><td>SQK-NBD114.24</td><td></td></tr><tr><td>NEB Blunt/TA Ligase Master Mix</td><td>NEB</td><td>M0367</td><td></td></tr><tr><td>מודול ליגציה מהירה NEBNext</td><td>NEB</td><td>E6056</td><td></td></tr><tr><td>מודול תיקון/זנב dA של NEBNext Ultra II End</td><td>NEB</td><td>E7546</td><td></td></tr><tr><td>מים ללא נוקלאז (NFW)</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>AM9937</td><td></td></tr><tr><td>פיפטות (P10, P20, P200 ו-P1000)</td><td>אפנדורף</td><td>EP3123000918-1EA</td><td></td></tr><tr><td>צינורות בדיקת קיוביט</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>Q32856</td><td></td></tr><tr><td>ערכת בדיקת HS של קיוביט dsDNA</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>Q33231</td><td></td></tr><tr><td>פלואורומטרי קיוביט</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>Q33226</td><td></td></tr><tr><td>זן ג'ל SYBR Safe DNA</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>S33102</td><td></td></tr><tr><td>אולטרהפיור אגרוז</td><td>תרמו פישר סיינטיפיק</td><td>17852</td><td></td></tr><tr><td>Universal Hood III טרנסלומיימייטור (מערכת Molecular Imager Gel Doc XR)</td><td>ביו-ראד</td><td>170-8170</td><td></td></tr><tr><td>מערבל מערבולת</td><td>Lasec</td><td>WMBB0L0E0216</td><td></td></tr></tbody></table>

ריצוף amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה

Amplicon Sequencing using the Long-Read Sequencing Technologies

ריצוף Amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה

The World Health Organization (WHO) continues to emphasize the urgent need for a rapid, cost-effective, and user-friendly diagnostic method for ...

amplicon-sequencing-using-the-long-read-sequencing-technologies

Research

JoVE Journal

Biochemistry

ביוכימיה

כאן אנו מתארים שיטה להכנת שני יחיד לקרוא לזווג Illumina סוף mRNA-Seq ספריות לניתוח רצפי גנים הביטוי מבוסס על הגברה T7-RNA ליניארי. פרוטוקול זה דורש רק 10 ננוגרם של רנ"א הכל החל ומייצר ספריות עקבי מאוד המייצגים תמלילי כולו.

יחיד קרא מותאמים mRNA-Seq סוף Illumina ספריות מ -10 ננוגרם RNA סך הכל

אפיון הקהילה המיקרוביאלית היה מטרה ארוכת שנים במיקרוביולוגיה סביבתית. שיטות ריצוף מהדור הבא מאפשרות כעת אפיון של קהילות מיקרוביאליות בעומק חסר תקדים עם עלות ועבודה מינימליות. אנו מפרטים כאן את הגישה שלנו לרצף גנים של RNA ריבוזומלי חיידקי 16S באמצעות רצף שולחני.

רצף של הדור הבא של 16S ריבוזומלי amplicons ג&#39;ין RNA

פרוטוקול זה מתאר שיטת ה-pre-mRNA מיפוי 3' עיבוד אתרי קצה.

3' סיום רצף ספריית הכנה עם א-seq2

רצף proviral בודדים באורך מלא (היפוך) מספקת שיטה יעילה, תפוקה גבוהה עבור הגברה רצף של יחיד, ליד באורך מלא (שלמים ולא פגומה) HIV-1 הפרו-וירוס והיא מאפשרת קביעה של הפוטנציאל שלהם שכפול-כשירות. סלטות מתגבר על המגבלות של מבחני הקודם שנועדה רצף המאגר HIV-1 סמויה.

הגברה של יד באורך מלא הפרו-וירוס HIV-1 עבור הדור הבא רצפי

רצפי זמן-קריאה מאוד להקל על ההרכבה של הגנום מורכבים ואפיון של וריאציה מבנית. אנו מתארים שיטה כדי ליצור רצפים ארוכים במיוחד על ידי רצף nanopore מבוססי פלטפורמות. הגישה מאמצת הוצאה DNA ממוטבת ואחריו ההכנות ספריית ששונה כדי להפיק מאות קריאות kilobase עם כיסוי מתון של תאים אנושיים.

רצף קריאה ארוכים במיוחד עבור ניתוח הדנ א הגנומי לגמרי

רצף Nanopore הוא טכנולוגיה חדשנית המאפשרת רצפי בעלות חסכונית במיקומים מרוחקים והגדרות משאב-עני. כאן, אנו מציגים פרוטוקול עבור רצף של mRNAs מתוך דם שלם התואם לתנאים כאלה.

רצף של mRNA מתוך דם שלם באמצעות רצפי Nanopore

פרוטוקול זה מתאר זרימת עבודה מתרביות תאים ex vivo או in vitro לעיבוד מקדים של נתוני תמלול לסינון תרופות מבוסס תמלול חסכוני.

בדיקת תרופות מבוססת תמלול חסכונית

המחקר הנוכחי מתאר תהליך ריצוף ננו-נקבוביות של פלסמידים כאשר רצף הכרומוזומים כבר ידוע או אינו מעניין. שלב העשרת DNA בפלסמיד מבטיח עומק אופטימלי של רצף הפלסמידים וממקסם את מספר הדגימות שניתן לרצף בכל תא זרימה.

ריצוף והרכבה של פלסמידים לקריאה ארוכה באמצעות זרימות עבודה מבוססות ריצוף ננופורי

המחקר הנוכחי מתאר שיטה פשוטה של גילוי רמות אנדוגני של זרחון Rab10 על ידי לאוצין-עשיר אני חוזר קינאז 2.

Rab10 זיהוי זרחון על-ידי פעילות LRRK2 באמצעות מרחביות-דף עם תג מחייב פוספט

אחד התנאים המאתגרים ביותר מתח כי אורגניזמים נתקלים במהלך חייהם כרוכה ההצטברות של חמצון. במהלך סטרס חמצוני, תאים בכבדות להסתמך על מלווים מולקולרית. כאן, אנו מציגים שיטות השתמשו כדי לחקור את מוסדר חמצון-חיזור צבירת נגד הפעילות, כמו גם כדי לעקוב אחר שינויים מבניים המסדירים את הפונקציה המלווה באמצעות HDX-MS.

הגדרת פעילות מוסדר חמצון-חיזור המלווה של Hsp33 ומיפוי השינויים הסתגלותי על Hsp33 באמצעות ספקטרומטר מסה של המרת מימן-דאוטריום

חקור ריצוף amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה לזיהוי עמידות לתרופות בשחפת. שיטה זו מספקת תוצאות מדויקות בזמן קצר יותר משיטות מסורתיות בסביבות משאבים מוגבלים.

ריצוף Amplicon באמצעות טכנולוגיות ריצוף לקריאה ארוכה

גלה סרטונים נוספים