Exploring Protein-Glycan Interactions: Advances in Nuclear Magnetic Resonance

Fabio C. L. Almeida; Francisco Felipe Bezerra; Ariana  A. Vasconcelos

doi:10.3791/68674

חקר אינטראקציות חלבון-גליקן: התקדמות בתהודה מגנטית גרעינית

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Exploring Protein-Glycan Interactions: Advances in Nuclear Magnetic Resonance

חקר אינטראקציות חלבון-גליקן: התקדמות בתהודה מגנטית גרעינית

Full Text

587 Views

10:07 min

August 26, 2025

DOI: 10.3791/68674-v

Fabio C. L. Almeida^1,2, Francisco Felipe Bezerra^1,3, Ariana A. Vasconcelos^1,2

¹Institute of Medical Biochemistry Leopoldo de Meis (IBqM),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), ²National Center for Structural Biology and Bioimaging (CENABIO),Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), ³Laboratory of Connective Tissue,Clementino Fraga Filho University Hospital

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

פרוטוקול מבוסס NMR זה חוקר אינטראקציות חלבון-גליקן חלשות באמצעות ציאנובירין-N ו-D-מאנוז. בשילוב שיטות זיהוי ליגנד וחלבון, הוא ממפה אתרי קשירה, מזהה השפעות אלוסטריות ומזהה קומפלקסים של מפגשים. הגישה מתארת הכנת דגימה וניתוח נתונים, ומציעה תובנות מבניות ודינמיות בעלות ערך עבור מנגנוני אבחון וזיהוי ספציפיים לגליקן.

אנו חוקרים אינטראקציות חלבון-חלבון וחלבון-גליקן, תוך התמקדות בקומפלקס אינטגרין-דיסינטגרין. המודל שלנו בוחן דינמיקה מבנית ומדגיש את תפקידו של כוח פני השטח בתיווך היווצרות מורכבת ויציבות אינטראקציה. הקבוצה שלנו מוקדשת לחקר תפקידם של כוחות פני השטח בזיהוי מולקולרי ואבולוציה של אתרי קשירה על ידי חקר צבירים הידרופוביים על פני השטח הקיימים בחלבונים.

פתרון NMR מאפשר זיהוי אינטראקציות חלבון. אף על פי שאינטראקציות חלשות חיוניות לחיים, קיימת הטיה לכיוון קומפלקסים בעלי זיקה גבוהה, אף על פי שהם קיימים בתפקודים ביולוגיים חשובים רבים. הקבוצה שלנו מתמקדת בשימוש בגישות ביולוגיה מבנית אינטגרטיבית כדי לחקור קומפלקס חלבונים גדול.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos