Name: הדמיה מולקולרית מרחבית של הגליקום באמצעות ספקטרומטריית מסה (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-11-28T12:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 52 s
Description: למד הדמיית ספקטרומטריית מסה לניתוח גליקוגן וגליקנים מקושרים ל-N ברקמת כבד. פרוטוקול זה מאפשר מיפוי מרחבי מדויק של תפוצת ביומולקולות בביולוגיה מרחבית.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Caprioli, R. M., Farmer, T. B., Gile, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+biological+samples%3A+Localization+of+peptides+and+proteins+using+MALDI-TOF+MS%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of biological samples: Localization of peptides and proteins using MALDI-TOF MS.</a> Anal Chem. 69 (23), 4751-4760 (1997).</li>
<li>Buchberger, A. R., Delaney, K., Johnson, J., Li, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+spectrometry+imaging%3A+A+review+of+emerging+advancements+and+future+insights%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Mass spectrometry imaging: A review of emerging advancements and future insights.</a> Anal Chem. 90 (1), 240-265 (2018).</li>
<li>Ouedraogo, R., Daumas, A., Capo, C., Mege, J. L., Textoris, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Whole-cell+MALDI-TOF+mass+spectrometry+is+an+accurate+and+rapid+method+to+analyze+different+modes+of+macrophage+activation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry is an accurate and rapid method to analyze different modes of macrophage activation.</a> J Vis Exp. 82, e50926(2013).</li>
<li>Khalil, S. M., Cappuccio, G., Li, F., Maletic-Savatic, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+human+brain+organoids+using+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of human brain organoids using mass spectrometry.</a> J Vis Exp. 211, e66997(2024).</li>
<li>Sun, R. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Brain+glycogen+serves+as+a+critical+glucosamine+cache+required+for+protein+glycosylation%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Metab%22%5BJournal%5D)">Brain glycogen serves as a critical glucosamine cache required for protein glycosylation.</a> Cell Metab. 33 (7), 1404-1417 (2021).</li>
<li>Aichler, M., Walch, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+imaging+mass+spectrometry%3A+Current+frontiers+and+perspectives+in+pathology+research+and+practice%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Invest%22%5BJournal%5D)">Maldi imaging mass spectrometry: Current frontiers and perspectives in pathology research and practice.</a> Lab Invest. 95 (4), 422-431 (2015).</li>
<li>Conroy, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-dimensionality+reduction+clustering+of+complex+carbohydrates+to+study+lung+cancer+metabolic+heterogeneity%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Cancer+Res%22%5BJournal%5D)">High-dimensionality reduction clustering of complex carbohydrates to study lung cancer metabolic heterogeneity.</a> Adv Cancer Res. 154, 227-251 (2022).</li>
<li>Seeley, E. H., Caprioli, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+imaging+of+proteins+in+tissues+by+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Molecular imaging of proteins in tissues by mass spectrometry.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (47), 18126-18131 (2008).</li>
<li>Powers, T. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix-assisted+laser+desorption+ionization+imaging+mass+spectrometry+workflow+for+spatial+profiling+analysis+of+N-linked+glycan+expression+in+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Matrix-assisted laser desorption ionization imaging mass spectrometry workflow for spatial profiling analysis of N-linked glycan expression in tissues.</a> Anal Chem. 85 (20), 9799-9806 (2013).</li>
<li>Drake, R. R., Powers, T. W., Norris-Caneda, K., Mehta, A. S., Angel, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+imaging+of+N-glycans+by+MALDI+imaging+mass+spectrometry+of+fresh+or+formalin-fixed+paraffin-embedded+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Protein+Sci%22%5BJournal%5D)">In situ imaging of N-glycans by MALDI imaging mass spectrometry of fresh or formalin-fixed paraffin-embedded tissue.</a> Curr Protoc Protein Sci. 94 (1), e68(2018).</li>
<li>Stanback, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regional+n-glycan+and+lipid+analysis+from+tissues+using+MALDI-MS+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Regional n-glycan and lipid analysis from tissues using MALDI-MS imaging.</a> STAR Protoc. 2 (1), 100304(2021).</li>
<li>Hawkinson, T. R., Sun, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Matrix-assisted+laser+desorption%2Fionization+mass+spectrometry+imaging+of+glycogen+in+situ%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging of glycogen in situ.</a> Methods Mol Biol. 2437, 215-228 (2022).</li>
<li>Young, L. E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+mass+spectrometry+imaging+reveals+heterogeneous+glycogen+stores+in+human+normal+and+cancerous+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+Mol+Med%22%5BJournal%5D)">In situ mass spectrometry imaging reveals heterogeneous glycogen stores in human normal and cancerous tissues.</a> EMBO Mol Med. 14 (11), e16029(2022).</li>
<li>Conroy, L. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+metabolomics+reveals+glycogen+as+an+actionable+target+for+pulmonary+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Spatial metabolomics reveals glycogen as an actionable target for pulmonary fibrosis.</a> Nat Commun. 14 (1), 2759(2023).</li>
<li>Clarke, H. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glycogen+drives+tumor+initiation+and+progression+in+lung+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Metab%22%5BJournal%5D)">Glycogen drives tumor initiation and progression in lung adenocarcinoma.</a> Nat Metab. 7 (5), 952-965 (2025).</li>
<li>Wallace, E. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+N-glycome+tissue+atlas+of+15+human+normal+and+cancer+tissue+types+determined+by+MALDI+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">An N-glycome tissue atlas of 15 human normal and cancer tissue types determined by MALDI imaging mass spectrometry.</a> Sci Rep. 14 (1), 489(2024).</li>
<li>Veerasammy, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sample+preparation+for+metabolic+profiling+using+MALDI+mass+spectrometry+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Sample preparation for metabolic profiling using MALDI mass spectrometry imaging.</a> J Vis Exp. 166, e62008(2020).</li>
<li>Mcdowell, C. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+mass+spectrometry+and+lectin+analysis+of+N-linked+glycans+in+carbohydrate+antigen-defined+pancreatic+cancer+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Imaging mass spectrometry and lectin analysis of N-linked glycans in carbohydrate antigen-defined pancreatic cancer tissues.</a> Mol Cell Proteomics. 20, 100012(2021).</li>
<li>Palmer, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FDR-controlled+metabolite+annotation+for+high-resolution+imaging+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">FDR-controlled metabolite annotation for high-resolution imaging mass spectrometry.</a> Nat Methods. 14 (1), 57-60 (2017).</li>
<li>Colpaert, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Neurological+glycogen+storage+diseases+and+emerging+therapeutics%5BTitle%5D)+AND+%22Neurotherapeutics%22%5BJournal%5D)">Neurological glycogen storage diseases and emerging therapeutics.</a> Neurotherapeutics. 21 (5), e00446(2024).</li>
<li>Taylor, M. J., Lukowski, J. K., Anderton, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatially+resolved+mass+spectrometry+at+the+single+cell%3A+Recent+innovations+in+proteomics+and+metabolomics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Spatially resolved mass spectrometry at the single cell: Recent innovations in proteomics and metabolomics.</a> J Am Soc Mass Spectrom. 32 (4), 872-894 (2021).</li>
<li>Chan, Y. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gel-assisted+mass+spectrometry+imaging+enables+sub-micrometer+spatial+lipidomics%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Gel-assisted mass spectrometry imaging enables sub-micrometer spatial lipidomics.</a> Nat Commun. 15 (1), 5036(2024).</li>
<li>Lim, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+Hiplex-IC%3A+Multiomic+and+multimodal+imaging+of+targeted+intact+proteins+in+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Chem%22%5BJournal%5D)">Maldi Hiplex-IC: Multiomic and multimodal imaging of targeted intact proteins in tissues.</a> Front Chem. 11, 1182404(2023).</li>
<li>Hankin, J. A., Barkley, R. M., Murphy, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sublimation+as+a+method+of+matrix+application+for+mass+spectrometric+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Soc+Mass+Spectrom%22%5BJournal%5D)">Sublimation as a method of matrix application for mass spectrometric imaging.</a> J Am Soc Mass Spectrom. 18 (9), 1646-1652 (2007).</li>
<li>Rappez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spacem+reveals+metabolic+states+of+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Spacem reveals metabolic states of single cells.</a> Nat Methods. 18 (7), 799-805 (2021).</li>
<li>Grgic, A., Cuypers, E., Dubois, L. J., Ellis, S. R., Heeren, R. M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maldi+MSI+protocol+for+spatial+bottom-up+proteomics+at+single-cell+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22J+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">Maldi MSI protocol for spatial bottom-up proteomics at single-cell resolution.</a> J Proteome Res. 23 (12), 5372-5379 (2024).</li>
<li>Dressman, J. W., Bayram, M. F., Angel, P. M., Drake, R. R., Mehta, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+multiomic+MALDI-MSI+analysis+of+lipids+and+N-glycans+through+affinity+array+capture%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Single-cell multiomic MALDI-MSI analysis of lipids and N-glycans through affinity array capture.</a> Anal Chem. 97 (24), 12493-12502 (2025).</li>
<li>Clarke, H. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+mapping+of+the+brain+metabolome%2C+lipidome%2C+and+glycome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Spatial mapping of the brain metabolome, lipidome, and glycome.</a> Nat Commun. 16 (1), 4373(2025).</li>
<li>Juras, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+microwave+fixation+provides+an+instantaneous+snapshot+of+the+brain+metabolome%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Rep+Methods%22%5BJournal%5D)">In situ microwave fixation provides an instantaneous snapshot of the brain metabolome.</a> Cell Rep Methods. 3 (4), 100455(2023).</li>
<li>Cantrell, A. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+high-power%2C+brain-focused+microwave+fixation+to+define+rodent+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for high-power, brain-focused microwave fixation to define rodent metabolism.</a> STAR Protoc. 6 (2), 103794(2025).</li>
<li>Ma, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+AI-driven+framework+to+map+the+brain+metabolome+in+three+dimensions%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Metab%22%5BJournal%5D)">An AI-driven framework to map the brain metabolome in three dimensions.</a> Nat Metab. 7 (4), 842-853 (2025).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>רפידת תחתית סופגת</td><td>דנוויל סיינטיפיק</td><td>B1623</td><td></td></tr><tr><td>אצטוניטריל (ACN)</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>34851-4X4L</td><td></td></tr><tr><td>נייר אלומיניום</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>15078292</td><td></td></tr><tr><td>אנידריקון ציטראקוני</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>125318</td><td></td></tr><tr><td>צינור קוני (15 מ"ל)</td><td>אלקלי סיינטי</td><td>CW5600</td><td></td></tr><tr><td>צנצנות קופלין</td><td>DWK מדעי החיים</td><td>900570</td><td></td></tr><tr><td>Cryostat&nbsp;</td><td>לייקה</td><td>CM1860</td><td></td></tr><tr><td>צ'אק קריוסטאט</td><td>לייקה</td><td>14041926491</td><td></td></tr><tr><td>דסיקטור</td><td>בל ארט</td><td>F424004131</td><td></td></tr><tr><td>דיאליזה</td><td>תרמו פישר</td><td>88400</td><td></td></tr><tr><td>אתנול</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>22032601</td><td></td></tr><tr><td>מאדים למזון</td><td>Rival&nbsp;</td><td>CKRVSTLM21&nbsp; &nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>תוספת זכוכית (70 מ"מ)</td><td>חברת ג'ל</td><td>LGI50</td><td></td></tr><tr><td>גליקוגן</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>G8876</td><td>סטנדרט</td></tr><tr><td>פרוקסידאז חזרת (HRP)</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>P8125</td><td>סטנדרט</td></tr><tr><td>מים ב-HPLC</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>270733-4X4L</td><td></td></tr><tr><td>מרסס HTX</td><td>HTX טכנולוגיות</td><td>M5</td><td></td></tr><tr><td>חומצה הידרוכלורית</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>A144-500</td><td></td></tr><tr><td>איזואמילאז</td><td>מגאזיים</td><td>אי-איסמי</td><td></td></tr><tr><td>משאבת קנאואר</td><td>קנאואר</td><td>P 4.1 S</td><td></td></tr><tr><td>להב פרופיל נמוך</td><td>מדעי מיקרוסקופיית אלקטרונים</td><td>63059-01</td><td></td></tr><tr><td>מדיום הרכבה M1</td><td>אפרדיה</td><td>1310</td><td></td></tr><tr><td>ספקטרומטר מסה</td><td>ברוקר דלטוניקס</td><td>timsTOF fleX</td><td></td></tr><tr><td>צינור מיקרופוג' (1.5 מ"ל)</td><td>אלקלי סיינטי</td><td>CN3016</td><td></td></tr><tr><td>מחט</td><td>BD</td><td>305109</td><td></td></tr><tr><td>פורמלין נייטרלי עם בופר NBF</td><td>מיליפור סיגמא</td><td>HT501128-4L</td><td></td></tr><tr><td>גז חנקן</td><td>איירגז</td><td>NIUHP300</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>SH30256. FS</td><td></td></tr><tr><td>צינורות PCR</td><td>שותפי MedSupply</td><td>62-1091-1</td><td></td></tr><tr><td>PNGase F PRIME-LY ULTRA&nbsp;</td><td>ביוגרפיה של בולדוג</td><td>NZPULT10LY</td><td></td></tr><tr><td>מעבדת SCiLS</td><td>ברוקר דלטוניקס</td><td>1889000</td><td></td></tr><tr><td>שייקר</td><td>תרמו-סיינטיפיק</td><td>88882007</td><td></td></tr><tr><td>Slide&nbsp; &nbsp;</td><td>מדעי מיקרוסקופ אלקטרוני</td><td>71873-02</td><td></td></tr><tr><td>שקופית דואר</td><td>מוצרי RPI</td><td>212620A</td><td></td></tr><tr><td>סוניקטור (ביורופטור פיקו)</td><td>דיאגנוד</td><td>B01080010</td><td></td></tr><tr><td>מלקחיים סטריליים</td><td>DR Instruments</td><td>S08098</td><td></td></tr><tr><td>סכין סטרילית</td><td>WPI</td><td>WPI-500240</td><td></td></tr><tr><td>מספריים סטריליים</td><td>כלי המדע המדויק</td><td>14084-08</td><td></td></tr><tr><td>מזרק &nbsp; &nbsp;</td><td>גריינג'ר</td><td>19G342</td><td></td></tr><tr><td>משאבת מזרק</td><td>עידן חדש</td><td>NE-300</td><td></td></tr><tr><td>קלטת</td><td>פישר סיינטיפיק &nbsp;</td><td>15-901-R</td><td></td></tr><tr><td>מברשת צבע דקה</td><td>אנזוס</td><td>#00</td><td></td></tr><tr><td>חומצה טריפלואורואצטית</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>T6508-1L</td><td></td></tr><tr><td>מיקס טיון, ESI ריכוז נמוך</td><td>אג'ילנט</td><td>G1969-85000</td><td></td></tr><tr><td>סירות משקולת</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>HS120882</td><td></td></tr><tr><td>קסילן</td><td>סיגמא-אלדריץ'</td><td>534056</td><td></td></tr><tr><td>&alpha;-ציאנו-4-חומצה הידרוקסיצינמית (CHCA)</td><td>חברת קיימן כימיקלים</td><td>15254</td><td></td></tr></tbody></table>

הדמיה מולקולרית מרחבית של הגליקום באמצעות ספקטרומטריית מסה

Spatial Molecular Imaging of the Glycome Using Mass Spectrometry

The spatial organization of the glycome within tissues is key to the molecular basis for physiological function. The diverse and dynamic glycome is ...

spatial-molecular-imaging-of-the-glycome-using-mass-spectrometry

Research

JoVE Journal

Biochemistry

ביוכימיה

הדרך המהירה מתואר להשיג תובנות מבנה סוכרים מטריקס תאיים. השיטה מנצלת את הייחודיות של glycosylhydrolases ואת הרגישות של ספקטרומטריית מסה המאפשר כמויות זעירות של חומרים כדי להיות מנותח. טכניקה זו ניתנת להתאמה כדי לשמש ישירות על הרקמה עצמה.

אוליגו פרופיל המוניים (OLIMP) של סוכרים תאית

שיטה ספציפית ורגישה לגיבוש תובנה לפרופיל הביטוי של אנטיגנים glycosphingolipid באיברים ותאי חיסון מתוארת. השיטה מנצלת את ספקטרומטריית מסות מלכודת היונים המאפשר פיצול צעד חכם של מולקולות glycosphingolipid לניתוח מבני בהשוואה לסטנדרטים מסונתזים כימי.

ניתוח ספקטרומטריה של אנטיגנים Glycosphingolipid

מאמר זה מציג צורה משופרת של טכניקת גליקומיקה חדשה מלמטה למעלה שנועדה לנתח את פרופיל ההרכב המאוגד של גליקנים בנוזלים ביולוגיים לא מפוצלים באמצעות פירוק כימי של גליקנים לחד-סוכרים ספציפיים לקישור המרכיב אותם לזיהוי על ידי GC-MS. יישומים פוטנציאליים כוללים גילוי מוקדם של סרטן והפרעות אחרות הנוגעות לגליקן.

ניתוח צומת glycan: גישה מלמטה למעלה כדי glycomics

מאמר זה מתאר מתודולוגיה להכין דגימות רקמות וכלי דם לצורך ניתוח MS המאפשרת (1) ניתוח של הרכב החלבון ECM, (2) זיהוי של אתרי glycosylation, ו (3) אפיון ההלחנה של צורות glycan. מתודולוגיה זו יכולה להיות מיושמת, עם שינויים קלים, כדי המחקר של ECM ברקמות אחרות.

Glycoproteomics של מטריקס: שיטה Intact ניתוח Glycopeptide באמצעות ספקטרומטריית מסה

שיטה של הכנת הדוגמא פותחה כדי להתאים coculture תאים ורקמות לזהות מולקולה קטנה exchange באמצעות ספקטרומטר מסה הדמיה.

לכידת תקשורת מולקולה קטנה בין רקמות ותאים באמצעות הדמיה ספקטרומטר מסה

פרוטוקול זה מפרט את שיטת הגליקופרוטאומיקה מונחית הגליקומיקה, טכנולוגיית אומיקס משולבת המציעה תובנות מקיפות על הגליקופרוטאום ההטרוגני במיקרו-סביבות גידוליות מורכבות הדרושות להבנה טובה יותר של הגליקוביולוגיה של סרטן.

גליקופרוטאומיקה מונחית גליקומיקס מאפשרת יצירת פרופיל מקיפה של הגליקופרוטאום במיקרו-סביבות גידוליות מורכבות 

כאן, אנו מציגים פרוטוקול מפורט לשחרור O-גליקנים ממוצין, והתפלה, פרמתילציה וניתוח לאחר מכן באמצעות ספקטרומטריית מסה MALDI-TOF.

פרופיל של מוצין O-גליקנים פרמתילציה באמצעות ספקטרומטריית מסה של זמן טיסה בלייזר בעזרת מטריצה

פותח פרוטוקול להכנת מיטוכונדריה מטוהרת מתאי מיקרוגליה, בידוד חלבונים מיטוכונדריאלים לשחרור N-גליקן, וזיהוי מהיר של גליקנים תת-תאיים, מיטוכונדריאלים באמצעות יינון אלקטרו-ספריי לייזר בעזרת מטריצת אינפרא אדום יחד עם ספקטרומטריית מסה מדויקת ברזולוציה גבוהה.

הכנה מיטוכונדריאלית ממיקרוגליה לניתוח גליקן

גמישות קונפורמציה משחקת תפקיד קריטי בתפקוד חלבון. בזאת, אנו מתארים את השימוש של ספקטרומטריית מסת electrospray יינון הזמן לפתור מצמידה את חילופי המימן-דאוטריום חיטוט השינויים המבניים המהירים שמניעים פונקצית חלבוני הורה אי סדר.

המרת מימן-דאוטריום electrospray יינון זמן נפתרה ספקטרומטריית מסה לימוד מבנה החלבון Dynamics

כאן אנו מציגים פרוטוקולים לטיהור זיקה של קומפלקסי חלבונים והפרדה שלהם לפי דף ילידי כחול, ואחריו פרופיל מתאם חלבון באמצעות ספקטרומטריית מסה כמותית בחינם תווית. שיטה זו שימושית כדי לפתור interactomes לתוך מתחמי חלבון ברורים.

פתרון מתחמי פרוטאין טהור זיקה לפי דף Native הכחול פרופיל מתאם חלבון

למד הדמיית ספקטרומטריית מסה לניתוח גליקוגן וגליקנים מקושרים ל-N ברקמת כבד. פרוטוקול זה מאפשר מיפוי מרחבי מדויק של תפוצת ביומולקולות בביולוגיה מרחבית.

הדמיה מולקולרית מרחבית של הגליקום באמצעות ספקטרומטריית מסה

גלה סרטונים נוספים