Name: כימות שיעור המוות העוברי ב-Caenorhabditis elegans (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-06-12T15:15:00.000+00:00
Duration: 11 min 35 s
Description: למדו שיטה פשוטה וזולה לכימות שיעור המוות העוברי ב-Caenorhabditis elegans ללא ציוד מיוחד. הפרוטוקול נגיש למתחילים ומאפשר מדידה מדויקת של פגמים התפתחותיים בביולוגיה התפתחותית.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol>
	<li>Corsi A. K., Wightman B., Chalfie M. A Transparent window into biology: A primer on Caenorhabditis elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2015; doi/10.1895/wormbook.1.177.1.</li>
	<li>Kwah J. K., Jaramillo-Lambert A. Measuring Embryonic viability and brood size in Caenorhabditis elegans. J Vis Exp. 2023;192:e65064.</li>
	<li>Harlow P. H. et al. The nematode Caenorhabditis elegans. as a tool to predict chemical activity on mammalian development and identify mechanisms influencing toxicological outcome. Sci Rep. 2016;6:22965.</li>
	<li>Wang S. et al. A high-content imaging approach to profile C. elegans. embryonic development. Development. 2019;146(7):dev174029.</li>
	<li>Mendoza A. D., Woodruff T. K., Wignall S. M., O&#8217;Halloran T. V. Zinc availability during germline development impacts embryo viability in Caenorhabditis elegans. Comp Biochem Physiol Toxicol Pharmacol CBP. 2017;191:194&#8211;202.</li>
	<li>Baris Atakan H., Alkanat T., Cornaglia M., Trouillon R., Gijs M. A. M. Automated phenotyping of Caenorhabditis elegans. embryos with a high-throughput-screening microfluidic platform. Microsyst Nanoeng. 2020;6:24.</li>
	<li>Guan G., Zhao Z., Tang C. Delineating the mechanisms and design principles of Caenorhabditis elegans. embryogenesis using in toto high-resolution imaging data and computational modeling. Comput Struct Biotechnol J. 2022;20:5500&#8211;15.</li>
	<li>Zipperlen P., Fraser A. G., Kamath R. S., Martinez-Campos M., Ahringer J. Roles for 147 embryonic lethal genes on C. elegans. chromosome I identified by RNA interference and video microscopy. EMBO J. 2001;20(15):3984&#8211;92.</li>
	<li>Kamath R. S. et al. Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans. genome using RNAi. Nature. 2003;421(6920):231&#8211;7.</li>
	<li>Bergwell M. et al. A primary microcephaly-associated sas-6 mutation perturbs centrosome duplication, dendrite morphogenesis, and ciliogenesis in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2023;224(4):iyad105.</li>
	<li>Stiernagle T. Maintenance of C. elegans. WormBook Online Rev C Elegans. Biol. 2006;1&#8211;1.</li>
	<li>S&#246;nnichsen B. et al. Full-genome RNAi profiling of early embryogenesis in Caenorhabditis elegans. Nature. 2005;434(7032):462&#8211;9.</li>
	<li>Bolker, B. M. Ecological models and data in R. Princeton University Press. Princeton, NJ (2008); ISBN9780691125220.</li>
	<li>Sulston J. E., Schierenberg E., White J. G., Thomson J. N. The embryonic cell lineage of the nematode Caenorhabditis elegans. Dev Biol. 1983;100(1):64&#8211;119.</li>
	<li>Giunti S., Blanco M. G., De Rosa M. J., Rayes D. The ketone body &#946;-hydroxybutyrate ameliorates neurodevelopmental deficits in the GABAergic system of daf-18/PTEN Caenorhabditis elegans. mutants. eLife. 2024;13:RP94520.</li>
	<li>Choi B., Kang J., Park Y. S., Lee J., Cho N. J. A possible role for FRM-1, a C. elegans. FERM family protein, in embryonic development. Mol Cells. 2011;31(5):455&#8211;9.</li>
	<li>Wong A., Boutis P., Hekimi S. Mutations in the clk-1 gene of Caenorhabditis elegans. affect developmental and behavioral timing. Genetics. 1995;139(3):1247&#8211;59.</li>
	<li>Libina N., Berman J. R., Kenyon C. Tissue-specific activities of C. elegans. DAF-16 in the regulation of lifespan. Cell. 2003 Nov;115(4):489&#8211;502.</li>
	<li>Bayer E. A. et al. Insulin signaling and osmotic stress response regulate arousal and developmental progression of C. elegans. at hatching. Genetics. 2022;220(1):iyab202.</li>
	<li>Muschiol D., Schroeder F., Traunspurger W. Life cycle and population growth rate of Caenorhabditis elegans. studied by a new method. BMC Ecol. 2009;9:14.</li>
	<li>Geens E. et al. Yolk-deprived Caenorhabditis elegans. secure brood size at the expense of competitive fitness. Life Sci Alliance. 2023 Jun;6(6):e202201675.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. A D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase mutant reveals a critical role for ketone body metabolism in Caenorhabditis elegans. development. PLoS Biol. 2023;21(4):e3002057.</li>
	<li>Ponomarova O. et al. idh-1 neomorphic mutation confers sensitivity to vitamin B12 in Caenorhabditis elegans. Life Sci Alliance. 2024;7(10):e202402924.</li>
	<li>Kamath R. S., Ahringer J. Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans. Methods. 2003;30(4):313&#8211;21.</li>
	<li>Zhou X. et al. Nuclear RNAi contributes to the silencing of off-target genes and repetitive sequences in Caenorhabditis elegans. Genetics. 2014;197(1):121&#8211;32.</li>
	<li>De-Souza E. A. et al. RNA interference may result in unexpected phenotypes in Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res. 2019;47(8):3957&#8211;69.</li>
	<li>Perez M. F., Francesconi M., Hidalgo-Carcedo C., Lehner B. Maternal age generates phenotypic variation in Caenorhabditis elegans. Nature. 2017;552(7683):106&#8211;9.</li>
	<li>Lanier V. J., White A. M., Faumont S., Lockery S. R. Theory and practice of using cell strainers to sort Caenorhabditis elegans. by size. PloS One. 2023;18(2):e0280999.</li>
	<li>Bai X. et al. Loss of the seipin gene perturbs eggshell formation in Caenorhabditis elegans. Development. 2020;147(20):dev192997.</li>
	<li>Green R. A. et al. Automated profiling of gene function during embryonic development. Cell. 2024;187(12):3141-3160.e23.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>מלח נתרן אמפיצילין</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9518</td><td></td></tr><tr><td>פפטון בקטריולוגי</td><td>Fischer Scientific</td><td>DF0118-17-0</td><td></td></tr><tr><td>C. elegans N2</td><td>מרכז הגנטיקה של Caenorhabditis</td><td>N2</td><td>סוג פראי</td></tr><tr><td>C. elegans NL2099</td><td>מרכז הגנטיקה של Caenorhabditis</td><td>NL2099</td><td>rrf-3(pk1426) II. רגישות יתר ל- RNAi</td></tr><tr><td>סידן כלוריד, ללא מים</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>746495</td><td></td></tr><tr><td>כולסטרול</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3045</td><td></td></tr><tr><td>צינורות חרוטיים, 15 מ"ל</td><td>VWR</td><td>60818-725</td><td></td></tr><tr><td>צינורות תרבית, 14 מ"ל</td><td>VWR</td><td>470150-966</td><td></td></tr><tr><td>משאבת ואקום דיאפרגמה</td><td>Amazon</td><td>TC-100</td><td></td></tr><tr><td>מיקרוסקופ ניתוח</td><td>AmScope&nbsp;</td><td>SM-2</td><td></td></tr><tr><td>Escherichia coli HT115</td><td>מרכז הגנטיקה של Caenorhabditis</td><td></td><td>חסר RNAse III, המשמש לניסויי RNAi על ידי הזנה</td></tr><tr><td>Escherichia coli OP50</td><td>מרכז הגנטיקה של Caenorhabditis</td><td></td><td></td></tr><tr><td>אגר מגורען</td><td>Fischer Scientific</td><td>BP97445</td><td></td></tr><tr><td>מונה מניין ידני</td><td>LabDepot</td><td>HTCP01</td><td></td></tr><tr><td>IPTG, ללא דיוקסאן (איזופרופיל-b-D-תיאוגלקטוזיד)</td><td>US Biological</td><td>I8500</td><td></td></tr><tr><td>LB Broth (Miller)</td><td>US Biological</td><td>L1520</td><td>להכנת מדיום LB יש להמיס 25 גרם של אבקת LB ב- 1 ליטר מים מזוקקים. לחטא באוטולב למשך 20 דקות ב- 121.1 &deg;C.</td></tr><tr><td>מזרק Luer Lok חד פעמי</td><td>BH Supplies</td><td>BH20LL</td><td></td></tr><tr><td>מגנזיום סולפט</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2643</td><td></td></tr><tr><td>שקופיות מיקרוסקופ</td><td>Sail Brand</td><td>7101</td><td></td></tr><tr><td>צלחות פטרי, 100 מ"מ</td><td>Tritech Research</td><td>T3371</td><td></td></tr><tr><td>צלחות פטרי, 35 מ"מ</td><td>Tritech Research</td><td>T3501</td><td></td></tr><tr><td>מאגר פוספט אשלגן (PPB)</td><td></td><td></td><td>להכנת מאגר פוספט אשלגן (1 M), יש להמיס 98 גרם של פוספט אשלגן מונו-בסיסי ו- 48 גרם של פוספט אשלגן דו-בסיסי ב- 1 ליטר מים מזוקקים. להתאים את ה- pH ל- 6. לחטא באוטולב למשך 20 דקות ב- 121 &deg;C.</td></tr><tr><td>פוספט אשלגן דו-בסיסי</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>795496</td><td></td></tr><tr><td>פוספט אשלגן מונו-בסיסי</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>529568</td><td></td></tr><tr><td>נענע (מנער מתנודד)</td><td>Corning LSE</td><td>6720</td><td></td></tr><tr><td>פיפטות סרולוגיות, 25 מ"ל&nbsp;</td><td>Corning</td><td>4489</td><td></td></tr><tr><td>פיפטות סרולוגיות, 5 מ"ל&nbsp;</td><td>Celltreat</td><td>229235</td><td></td></tr><tr><td>חממה רועדת Infors Multitron</td><td>INFORS HT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>נתרן כלוריד</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9888</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת נתרן הידרוקסיד, 5 N</td><td>Fisher Scientific</td><td>&nbsp;SS256-500</td><td></td></tr><tr><td>נתרן היפוכלוריט, 5%</td><td>LabDepot</td><td>LC246302</td><td></td></tr><tr><td>נתרן פוספט דו-בסיסי</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9763</td><td></td></tr><tr><td>צנטריפוגה Sorvall ST1 Plus</td><td>Thermo Scientific</td><td>75016030</td><td></td></tr><tr><td>לוח ערבוב</td><td>&nbsp;ONilab</td><td>ONi28-S</td><td></td></tr><tr><td>פילטרים למזרק</td><td>Semmerfeld</td><td>JQP033022QE1</td><td></td></tr><tr><td>אמבט מים</td><td>FOUR E's Scientific</td><td>WB401</td><td></td></tr></tbody></table>

כימות שיעור המוות העוברי ב-caenorhabditis elegans

Quantifying Embryonic Lethality Rate in Caenorhabditis elegans

כימות שיעור המוות העוברי ב-Caenorhabditis elegans

Embryonic lethality is a cornerstone phenotype used in Caenorhabditis elegans research to characterize developmental defects arising from factors such as ...

Our research focuses on measuring embryonic lethality in Caenorhabditis elegans and determining how strongly a perturbation affects development. This protocol can be applied to assess embryonic lethality caused by genetic mutations, RNAi knockdowns, drug treatment, nutritional supplementation, or environmental perturbations.To begin, gather the required reagents. Prepare 1 liter of nematode growth medium or NGM in a 2-liter bottle. Allow the medium to cool to 55 degrees Celsius in a water bath. After placing the bottle on a stir plate, aseptically add the required reagents. Pour approximately 25 milliliters of medium into each 100-milliliter plate. Inoculate 200 milliliters of LB medium with a single E. coli OP50 colony using a sterile inoculation loop. Place the flask on an orbital shaker at 200 revolutions per minute, and incubate overnight at 37 degrees Celsius. Transfer the E. coli OP50 culture into autoclaved centrifuge bottles. After centrifugation, resuspend the bacterial pellet in 1/20th of the original volume. Seed each 100-millimeter NGM plate with one to 1.5 milliliters of the concentrated culture, and incubate overnight at room temperature to allow the bacteria to grow.

quantifying-embryonic-lethality-rate-in-caenorhabditis-elegans

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

ביולוגיה התפתחותית

סרטון זה מתאר שיטה מסורתית מבוססת לוחות למדידת תוחלת החיים של C. elegans. הפרוטוקול לדוגמה מודד את תוחלת החיים של תולעים שטופלו ב-RNAi.

ניתוח תוחלת חיים: מדידת אריכות ימים של C. elegans

C. התנהגות הטלת ביצים של elegans יכולה לספק מידע חשוב במחקרים התפתחותיים, פוריותיים ואנטומיים. סרטון זה מציג את השלבים החשובים של בדיקת הטלת ביצים ומציג ניסוי לדוגמה שבו תרופה נבדקת לרעילות רבייה.

בדיקת הטלת ביצים: שיטה לכימות התנהגות הטלת הביצים של C. elegans

מקור: Anderson, Q. L., et al. C. elegans Pathosystem בעל תפוקה גבוהה, תכולה גבוהה, מבוסס נוזל. J. Vis. Exp. (2018)הסרטון מדגים בדיקה מבוססת נוזל שבה זחלי C. elegans מהונדסים גנטית נחשפים לחיידקים פתוגניים במיקרו-צלחת. רעלנים חיידקיים המופרשים למדיום גורמים ללחץ ולמוות של המארח. צבע פלואורסצנטי מכתים תולעים מתות, ומאפשר כימות מבוסס הדמיה של התמותה כדי להעריך את הרגישות או העמידות הגנטית.

הערכת תמותה הנגרמת על ידי חיידקים פתוגניים בזחלי C. elegans

ביצה בתולעת assay (EIW) הוא שיטה יעילה לכמת-הטלת התנהגות. שינויים בנחת ביצה יכולים להיות תגובה התנהגותית של האורגניזם...

מדידת ההשפעות של חיידקים על<em&gt; ג Elegans</em&gt; התנהגות באמצעות Assay שימור ביצה

אנו מתארים את השלבים המפורטים של בדיקה כימית בעלת תפוקה גבוהה בנמטודה Caenorhabditis elegans המשמשת להערכת רעילות קו הנבט. בבדיקה זו, הפרעה בתפקוד קו הנבט בעקבות חשיפה לכימיקלים מנוטרת באמצעות מדווח פלואורסצנטי ספציפי לעוברים אנופלואידים.

הערכה מקיפה של תאי מין כימי רעילות שימוש נמטודות<em&gt; Elegans Caenorhabditis</em

כאן אנו מפרטים פרוטוקולים שתוכננו במיוחד לניטור פגמים מורפוגניים המתרחשים בשלבים מוקדמים ומאוחרים של התארכות עוברית של הנמטודה Caenorhabditis elegans. בסופו של דבר, פרוטוקולים אלה נועדו לזהות גנים המווסתים את השלבים הללו ולאפיין את הדרישות הדיפרנציאליות שלהם לאורך הציר הקדמי-אחורי של העובר.

מדדי רומן לאפיון התארכות עוברית של נמטודות<em&gt; Elegans Caenorhabditis</em

כאן נתאר שיטת עותקים משוכפלים, גישה באופן כמותי מודדים C. elegans תוחלת החיים/הישרדות, healthspan באופן תפוקה גבוהה וחזק, ובכך לאפשר הקרנה של מצבים רבים מבלי להתפשר על איכות הנתונים. פרוטוקול זה מפרט את האסטרטגיה, ומספק כלי תוכנה לניתוח של נתונים המשוכפלים.

השיטה קבע עותק משוכפל: בגישה תפוקה גבוהה באופן כמותי מידה Caenorhabditis elegans תוחלת החיים

עבודה זו מתארת פרוטוקול של תפוקה חצי-גבוהה המאפשרת הדמיה בו של embryogenesis בזמן בו במהירות של 80-100 ס מ עוברים בריצה אחת ללילה. בנוסף, כלי עיבוד תמונה ופריטים חזותיים נכללים כדי לייעל את ניתוח הנתונים. השילוב של שיטות אלה עם זני כתבת מותאמים אישית מאפשר ניטור מפורט של embryogenesis.

שיטת דימות למחצה של תפוקה גבוהה וערכת כלי הדמיה של נתונים כדי לנתח את הפיתוח העובריים של ס. אלאנס

כדי לחקור אינטראקציות מלווה מלווה מלווה-מצע, אנו מבצעים מסכי אינטראקציה סינתטית ב elegans Caenorhabditis באמצעות הפרעות RNA בשילוב עם מוטציות קלות או ביטוי יתר של מלווים ולנטר תפקוד לקוי של חלבון ספציפי לרקמות ברמה האורגנית.

שימוש באלגנים של Caenorhabditis למסך עבור אינטראקציות ממלווים ספציפיות לרקמות

כאן, אנו מציגים שיטה כללית לקביעת הכדאיות העוברית והמספר הכולל של עוברים המיוצרים (brood) באמצעות אורגניזם המודל C. elegans.

מדידת כדאיות עוברית וגודל הברוד ב- Caenorhabditis elegans

למדו שיטה פשוטה וזולה לכימות שיעור המוות העוברי ב-Caenorhabditis elegans ללא ציוד מיוחד. הפרוטוקול נגיש למתחילים ומאפשר מדידה מדויקת של פגמים התפתחותיים בביולוגיה התפתחותית.

כימות שיעור המוות העוברי ב-Caenorhabditis elegans

גלה סרטונים נוספים