ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol>
	<li>Zeng H, Sanes JR. Neuronal cell-type classification: challenges, opportunities and the path forward. Nat Rev Neurosci. 2017;18(9):530-46.</li>
	<li>Macosko EZ, Basu A, Satija R, Nemesh J, Shekhar K, Goldman M, et al. Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell. 2015;161(5):1202-14.</li>
	<li>Brand AH, Perrimon N. Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes. Development. 1993;118(2):401-15.</li>
	<li>Coons AH, Kaplan MH. Localization of antigen in tissue cells: improvements in a method for the detection of antigen by means of fluorescent antibody. J Exp Med. 1950;91(1):1-13.</li>
	<li>Pardue ML, Gall JG. Chromosomal localization of mouse satellite DNA. Science. 1970;168(3937):1356-8.</li>
	<li>Gall JG, Pardue ML. Formation and detection of RNA-DNA hybrid molecules in cytological preparations. Proc Natl Acad Sci U S A. 1969;63(2):378-85.</li>
	<li>Singer RH, Ward DC. Actin gene expression visualized in chicken muscle tissue culture by using in situ. hybridization with a biotinylated nucleotide analog. Proc Natl Acad Sci U S A. 1982;79(23):7331-5.</li>
	<li>Bauman JG, Wiegant J, Borst P, van Duijn P. A new method for fluorescence microscopical localization of specific DNA sequences by in situ. hybridization of fluorochrome-labelled RNA. Exp Cell Res. 1980;128(2):485-90.</li>
	<li>Herrington CS, Burns J, Graham AK, Evans M, McGee JO. Interphase cytogenetics using biotin- and digoxigenin-labelled probes. I. Relative sensitivity of both reporter molecules for detection of HPV16 in CaSki cells. J Clin Pathol. 1989;42(6):592-600.</li>
	<li>Tautz D, Pfeifle C. A non-radioactive in situ hybridization method for the localization of specific RNAs in Drosophila. embryos reveals translational control of the segmentation gene hunchback. Chromosoma. 1989;98(2):81-5.</li>
	<li>Rudkin GT, Stollar BD. High-resolution detection of DNA-RNA hybrids in situ. by indirect immunofluorescence. Nature. 1977;265(5593):472-3.</li>
	<li>van de Corput MP, Dirks RW, van Gijlswijk RP, van de Rijke FM, Raap AK. Fluorescence in situ. hybridization using horseradish peroxidase-labeled oligodeoxynucleotides and tyramide signal amplification for sensitive DNA and mRNA detection. Histochem Cell Biol. 1998;110(4):431-7.</li>
	<li>Schr&#246;der C, Tautz D, Seifert E, J&#228;ckle H. Differential regulation of the two transcripts from the Drosophila. gap segmentation gene hunchback. EMBO J. 1988;7(9):2881-7.</li>
	<li>Dirks RM, Pierce NA. Triggered amplification by hybridization chain reaction. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004;101(43):15275-8.</li>
	<li>Choi HMT, Chang JY, Trinh LA, Padilla JE, Fraser SE, Pierce NA. Programmable in situ. amplification for multiplexed imaging of mRNA expression. Nat Biotechnol. 2010;28(11):1208-12.</li>
	<li>Femino AM, Fay FS, Fogarty K, Singer RH. Visualization of single RNA transcripts in situ. Science. 1998;280(5363):585-90.</li>
	<li>Trivedi V, Choi HMT, Fraser SE, Pierce NA. Multidimensional quantitative analysis of mRNA expression within intact vertebrate embryos. Development. 2018;145(1):dev156869.</li>
	<li>Choi HMT, Schwarzkopf M, Fornace ME, Acharya A, Artavanis G, Stegmaier J, et al. Third-generation in situ. hybridization chain reaction: multiplexed, quantitative, sensitive, versatile, robust. Development. 2018;145(12):dev165753.</li>
	<li>Schulte SJ, Fornace ME, Hall JK, Shin GJ, Pierce NA. HCR spectral imaging: 10-plex, quantitative, high-resolution RNA and protein imaging in highly autofluorescent samples. Development. 2024;151(4):dev202159.</li>
	<li>Schwarzkopf M, Liu MC, Schulte SJ, Ives R, Husain N, Choi HMT, et al. Hybridization chain reaction enables a unified approach to multiplexed, quantitative, high-resolution immunohistochemistry and in situ. hybridization. Development. 2021;148(22):dev199847.</li>
	<li>Ferreira AAG, Cordoba S, Rajesh R, Choi BJ, Desplan C. A developmental single-cell atlas of the Drosophila. visual system glia reveals cell type diversification and subcellular mRNA compartmentalization. bioRxiv. 2023. Available from: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.08.06.552169v2</li>
	<li>Herre M, Goldman OV, Lu TC, Caballero-Vidal G, Qi Y, Gilbert ZN, et al. Non-canonical odor coding in the mosquito. Cell. 2022;185(17):3104-23.e28.</li>
	<li>Olivares-Abril J, Joha J, Lee JY, Davis I. Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila. larvae. Fly (Austin). 2024;18(1):2409968.</li>
	<li>Burge S, Parkinson GN, Hazel P, Todd AK, Neidle S. Quadruplex DNA: sequence, topology and structure. Nucleic Acids Res. 2006;34(19):5402-15.</li>
	<li>Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403-10.</li>
	<li>Lovely AM, Duerr TJ, Stein DF, Mun ET, Monaghan JR. Hybridization chain reaction fluorescence in situ. hybridization (HCR-FISH) in Ambystoma mexicanum tissue. Methods Mol Biol. 2023;2562:109-22.</li>
	<li>Kuehn E, Clausen DS, Null RW, Metzger BM, Willis AD, Ozpolat BD. Segment number threshold determines juvenile onset of germline cluster expansion in Platynereis dumerilii. J Exp Zool B Mol Dev Evol. 2022;338(4):225-40.</li>
	<li>Hofbauer A, Campos-Ortega JA. Proliferation pattern and early differentiation of the optic lobes in Drosophila. melanogaster. Roux Arch Dev Biol. 1990;198(5):264-74.</li>
	<li>Li X, Erclik T, Bertet C, Chen Z, Voutev R, Venkatesh S, et al. Temporal patterning of Drosophila. medulla neuroblasts controls neural fates. Nature. 2013;498(7455):456-62.</li>
	<li>Hasegawa E, Kitada Y, Kaido M, Takayama R, Awasaki T, Tabata T, et al. Concentric zones, cell migration and neuronal circuits in the Drosophila. visual center. Development. 2011;138(5):983-93.</li>
	<li>Suzuki T, Kaido M, Takayama R, Sato M. A temporal mechanism that produces neuronal diversity in the Drosophila. visual center. Dev Biol. 2013;380(1):12-24.</li>
	<li>Zhu H, Zhao SD, Ray A, Zhang Y, Li X. A comprehensive temporal patterning gene network in Drosophila. medulla neuroblasts revealed by single-cell RNA sequencing. Nat Commun. 2022;13(1):1247.</li>
	<li>Konstantinides N, Holguera I, Rossi AM, Escobar A, Dudragne L, Chen YC, et al. A complete temporal transcription factor series in the fly visual system. Nature. 2022;604(7905):316-22.</li>
	<li>Konstantinides N, Kapuralin K, Fadil C, Barboza L, Satija R, Desplan C. Phenotypic convergence: distinct transcription factors regulate common terminal features. Cell. 2018;174(3):622-35.e13.</li>
	<li>Garcia-Alonso L, VanBerkum MF, Grenningloh G, Schuster C, Goodman CS. Fasciclin II controls proneural gene expression in Drosophila. Proc Natl Acad Sci U S A. 1995;92(23):10501-5.</li>
	<li>Simon F, Holguera I, Chen YC, Malin J, Valentino P, Njoo-Deplante C, et al. Spatial, temporal and Notch determination of terminal selector expression controls neuronal cell fate in the Drosophila. optic lobe. Nat Neurosci. 2026;29(5):1068-78.</li>
	<li>Malin JA, Chen YC, Simon F, Keefer E, Desplan C. Spatial patterning controls neuron numbers in the Drosophila. visual system. Dev Cell. 2024;59(9):1132-45.e6.</li>
	<li>Pinto-Teixeira F, Koo C, Rossi AM, Neriec N, Bertet C, Li X, et al. Development of concurrent retinotopic maps in the fly motion detection circuit. Cell. 2018;173(2):485-98.</li>
	<li>Erclik T, Li X, Courgeon M, Bertet C, Chen Z, Baumert R, et al. Integration of temporal and spatial patterning generates neural diversity. Nature. 2017;541(7637):365-70.</li>
	<li>&#214;zel MN, Simon F, Jafari S, Holguera I, Chen YC, Benhra N, et al. Neuronal diversity and convergence in a visual system developmental atlas. Nature. 2021;589(7840):88-95.</li>
	<li>Marques GS, Teles-Reis J, Konstantinides N, Brito PH, Homem CCF. Asynchronous transcription and translation of neurotransmitter-related genes characterize the initial stages of neuronal maturation in Drosophila. PLoS Biol. 2023;21(5):e3002115.</li>
	<li>Pan Y, Rauskolb C, Irvine KD. Near-infrared nuclear markers for Drosophila. imaging. microPublication Biol. 2022;2022. Available from: https://www.micropublication.org/journals/biology/micropub-biology-000639</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>10% Tween-20</td><td>Bio-Rad Laboratories</td><td>1662404</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>20x PBS, pH7.4</td><td>Growcells.com</td><td>MRGF-6396</td><td>2.74M NaCl, 53.7 mM KCl, 20.3 mM Na2HPO4, 29.4 mM KH2PO4 </td></tr><tr><td>20x SSC</td><td>Quality Biological</td><td>351-003-131</td><td>3M NaCl, 0.3M Sodium Citrate</td></tr><tr><td>37 &deg;C incubator</td><td>Fisher Scientific (Isotemp)</td><td>15-015-2633</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>37 &deg;C water bath</td><td>Fisher Scientific</td><td>FSGPD15D</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Aluminum foil</td><td>Reynolds Wrap/Fisher Brand</td><td>15-078-291</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Antibody: Mouse-anti-Abrupt</td><td>DSHB</td><td>Abrupt; RRID: AB_528344 </td><td>Dilution: 1:20</td></tr><tr><td>Antibody: Chicken anti-GFP</td><td>Millipore Sigma</td><td>Catalog# 06-896; RRID: AB-619712</td><td>Dilution: 1:500</td></tr><tr><td>Antibody: Rabbit anti-GFP</td><td>Life Technologies</td><td>#11122; RRID: AB_221569</td><td>Dilution: 1:500</td></tr><tr><td>Antibody: Rabbit anti-Dll</td><td>Genscript/Desplan lab</td><td>-</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Rat anti-NCadherin</td><td>DSHB</td><td>DN-Ex #8, RRID: AB_528121</td><td>Dilution: 1:50</td></tr><tr><td>Antibody: Rabbit anti-SoxN</td><td>Genscript/Desplan lab</td><td>-</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Guinea Pig anti-Traffic jam</td><td>Gift from D. Godt</td><td>-</td><td>Dilution: 1:2,000</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Rat 405</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code # 712-475-150; RRID: AB_2340680</td><td>Dilution: 1:100</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Chicken 488</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #703-545-155; RRID: AB_2340375</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Mouse 488</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #715-545-151; RRID: AB_2341099</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Rabbit 488</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #711-545-152; RRID: AB_2313584</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Rabbit A555</td><td>Thermo Scientific</td><td>Catalog #A-31572; RRID: AB_162543</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Rat Cy3</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #712-165-153; RRID: AB_2340667</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Guinea Pig 647</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #706-605-148; RRID: AB_2340476</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antibody: Donkey anti-Rat 647</td><td>Jackson ImmunoResearch</td><td>Code #712-605-153; RRID: AB_2340694</td><td>Dilution: 1:200</td></tr><tr><td>Antifade mountant</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>S36940 (SlowFade Gold Antifade Mountant)</td><td>Other slowfades will work as well, including ones with DAPI (S36936)</td></tr><tr><td>Confocal Microscope</td><td>Zeiss</td><td>LSM-880</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Cover slips (22 x 30)</td><td>VWR</td><td>16004-332</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: ab-GFP-FLAG</td><td>BDSC</td><td>38626; RRID: BDSC_38626</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: Canton S</td><td>BDSC</td><td>64349; RRID: BDSC_64349</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: dpp-Gal4</td><td>BDSC</td><td>1553; RRID: BDSC_1553</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: ham-GFP.FPTB</td><td>BDSC</td><td>83660; RRID: BDSC_83660</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: yw; 10xUAS-myr-GFP;</td><td>BDSC</td><td>32198; RRID: BDSC_32198</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster: UAS-Stinger</td><td>BDSC</td><td>84277; RRID: BDSC_84277</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Fly: D. melanogaster:&nbsp; wit-KO-Gal4</td><td>BDSC</td><td>600136; RRID: BDSC_600136</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Forceps</td><td>Dumont</td><td>#5 or #55s</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Glass slides</td><td>VWR</td><td>16005-106</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Glycine</td><td>Millipore Sigma</td><td>G7126-10MG</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>HCR Amplification buffer</td><td>Molecular Instruments</td><td>HCR Gold RNA-FISH Kit</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>HCR-Gold Amplifiers</td><td>Molecular Instruments</td><td>HCR Gold RNA-FISH Kit</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>HCR HiFi Probes</td><td>Molecular Instruments</td><td>HCR Gold RNA-FISH Kit</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>HCR Probe Hybridization Buffer</td><td>Molecular Instruments</td><td>HCR Gold RNA-FISH Kit</td><td>Contains formamide</td></tr><tr><td>HCR Probe Wash Buffer</td><td>Molecular Instruments</td><td>HCR Gold RNA-FISH Kit</td><td>Contains formamide</td></tr><tr><td>Nail polish (clear)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>72180</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Nuclease-free water (not DEPC-treated)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AM9937</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Nutating mixer</td><td>Corning/Fisher Scientific</td><td>10-320-100</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Paraformaldehyde, 16% (w/v)</td><td>Electron Microscopy Sciences</td><td>15710</td><td>רעיל</td></tr><tr><td>PCR Machine/Thermal Cycler</td><td>Bio-Rad</td><td>1851148 (C1000 Touch Thermal Cycler)</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>PCR pull-apart tube strips with dome cap strips (0.2 mL) </td><td>USA Scientific</td><td>#1402-2400</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Petri dishes (150 x 15 mm; for making dissecting dishes)</td><td>Fisher Scientific</td><td>FB0875714</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>RNase ZAP</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>AM9780</td><td>לא חל</td></tr><tr><td>Slide spacer stickers</td><td>SUNJin</td><td>IS016 (iSpacer stickers (0.2 mm deep))

תגובת שרשרת היברידיזציה fish באונה האופטית המתפתחת של דרוזופילה

Hybridization Chain Reaction FISH in the Developing Drosophila Optic Lobe

תגובת שרשרת היברידיזציה FISH באונה האופטית המתפתחת של דרוזופילה

Understanding neural development requires precise characterization of when and where genes are expressed. Techniques such as in situ hybridization have ...

hybridization-chain-reaction-fish-developing-drosophila-optic

Research

JoVE Journal

Neuroscience

מדעי המוח

שימוש הר שלם באתרו הכלאה קישור לביולוגיה מולקולרית האורגניזם

Arborization הנוירונים הדנדריטים חושית...

ניתוח מורפולוגי של תסיסנית הזחל היקפיים Neuron דנדריטים חושי האקסונים באמצעות פסיפסים גנטי

כאן אנו מתארים שלם הר...

הר כולו RNA פלורסנט<em&gt; באתר</em&gt; הכלאה של<em&gt; דרוזופילה</em&gt; עוברים

דג הזברה, דגים טרופיים קטנים, הפכה לדגם פופולרי ללימוד תפקוד גן במהלך התפתחות מחלה וחוליות. הביטוי של הזמן ומרחב של גני המטרה יכול להיקבע על...

הר שלם ברזולוציה גבוהה<em&gt; באתרו</em&gt; הכלאה בתוך עוברי דג הזברה לחקר ביטוי גנים ותפקוד

צביעה חיסונית היא טכניקה יעילה להמחשת סוגי תאים וחלבונים ספציפיים בתוך רקמות. על ידי שימוש בסוניקציה, הפרוטוקול המתואר כאן מקל על הצורך לנתח רקמות Drosophila melanogaster מעוברים וזחלים בשלב מאוחר לפני צביעה חיסונית. אנו מספקים מתודולוגיה יעילה לצביעה חיסונית של זחלי הר שלמים קבועים בפורמלדהיד.

הקל Sonication Immunofluorescence הכתמה של שלב מאוחר עוברי וזחל<em&gt; דרוזופילה</em&gt; רקמות<em&gt; באתר</em

אנו מתארים הליך רב-יעד chromogenic כל הר הכלאה באתר (MC-תרצה) בעוברים שלמים תסיסנית מאפשרים זיהוי סימולטני וספציפי של שלושה דפוסי הפצת mRNA שונים על ידי מנוגד משקעים צבע.

רב-יעד Chromogenic כל הר<em&gt; באתר</em&gt; הכלאה להשוואת תחומים ביטוי גנים ב<em&gt; דרוזופילה</em&gt; עוברים

המתואר RNA בחיי עיר הכלאה פרוטוקול מאפשרת הגילוי של RNA כל עוברי דרוזופילה או רקמות גזור. באמצעות לוחות 96-ובכן microtiter tyramide אות הגברה, תעתיקים שניתן לאתר ברזולוציה גבוהה, רגישות, ואת התפוקה, בעלות נמוכה יחסית.

ברזולוציה גבוהה פלורסנט בחיי עיר הכלאה של עוברי דרוזופילה ורקמות באמצעות הגברה Tyramide אות

כתב יד זה מציג שיטה מפורטת ליצירת X-כרומוזום הזרוע המחקרים וכל ביצוע קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים) לבדוק את מצבה של אחותך כרומטידה לכידות ב- prometaphase, מפה של עצרתי  דרוזופילה oocytes. פרוטוקול זה מתאים לקביעת אם הזרוע meiotic לכידות הוא שלם או קטועים ב שונים אחרים.

באמצעות קרינה פלואורסצנטית בחיי עיר הכלאה (דגים) כדי לנטר את מצב היד לכידות ב- Prometaphase, מפה של אני דרוזופילה Oocytes

המאמר מתאר את השיטות והריאגנטים הדרושים לביצוע הכלאה של תגובת שרשרת RNA, הכלאה פלואורסצנטית באתרה (HCR RNA, WM-FISH) כדי לחשוף תובנות לגבי הרזולוציה המרחבית והתאית של גנים קולטנים כימו-סנסוריים באנטנת היתושים ובמישוש המקסילרי.

תגובת שרשרת הכלאה RNA פלואורסצנטיות מלאה באתרה הכלאה של גנים כימו-סנסוריים בתוספות ריח יתושים

Expand-Assisted Fluorative Fluorescence In Situ Hybridization (EASI-FISH) היא טכניקה חזקה המשלבת מיקרוסקופ הרחבה עם הכלאה פלואורסצנטית באתרה (FISH) כדי לזהות ביטוי של גנים מרובים ברקמה עבה. פרוטוקול זה מתאר את ההתקדמות האחרונה בשיטה ואת התאמתה לתיוג מערכת העצבים המרכזית של דרוזופילה השלמה.

זיהוי מולטיפלקס של ביטוי גנים במוח הדרוזופילה השלם באמצעות פלואורסצנציה איטרטיבית בסיוע הרחבה בהכלאה באתרה

New York University.  פרוטוקול זה מתאר את השלבים הנדרשים לביצוע היברידיזציה פלואורסצנטית במיקום (HCR-FISH) באונות האופטיות של זחל Drosophila melanogaster . הנהלים לתכנון גשושים, היברידיזציה, הגברה והרכבת רקמות מפורטים כדי להקל על המחשה של האונה האופטית המתפתחת.

תגובת שרשרת היברידיזציה FISH באונה האופטית המתפתחת של דרוזופילה

גלה סרטונים נוספים