ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol>
	<li>Wishart DS. Metabolomics for Investigating Physiological and Pathophysiological Processes. Physiol Rev. 2019;99:1819-75.</li>
	<li>Ma B, et al. Spatially resolved&#160;visualization of reprogrammed metabolism in hepatocellular carcinoma by mass spectrometry imaging. Cancer Cell Int. 2023;23:177.</li>
	<li>Kelley AR. Mass Spectrometry-Based Analysis of Lipid Involvement in Alzheimer&#8217;s Disease Pathology&#8212;A Review. Metabolites. 2022;12:510.</li>
	<li>Krestensen KK, Heeren RMA, Balluff B. State-of-the-art mass spectrometry imaging applications in biomedical research. Analyst. 2023;148:6161-87.</li>
	<li>Wije Munige S, et al. Developing a Cell Quenching Method to Facilitate Single Cell Mass Spectrometry Metabolomics Studies. JACS Au. 2025;5:2379-87.</li>
	<li>R&#246;mpp A, Spengler B. Mass spectrometry imaging with high resolution in mass and space. Histochem Cell Biol. 2013;139:759-83.</li>
	<li>McDonnell LA, Heeren RMA. Imaging mass spectrometry. Mass Spectrom Rev. 2007;26:606-43.</li>
	<li>Bhusal D, Wije Munige S, Peng Z, Yang Z. Exploring Single-Probe Single-Cell Mass Spectrometry: Current Trends and Future Directions. Anal Chem. 2025;97:4750-62.</li>
	<li>Lan Y, Zou Z, Yang Z. Single Cell mass spectrometry: Towards quantification of small molecules in individual cells. Trends Anal Chem. 2024;174:117657.</li>
	<li>Liu R, Yang Z. Single cell metabolomics using mass spectrometry: Techniques and data analysis. Anal Chim Acta. 2021;1143:124-34.</li>
	<li>Shen X, et al. Advances in Sampling and Analytical Techniques for Single-Cell Metabolomics: Exploring Cellular Heterogeneity. Rapid Commun Mass Spectrom. 2025;39:e10045.</li>
	<li>Chen D, Colwell N, Yang Z. Ambient high-spatial-resolution mass spectrometry imaging: recent advances in technologies and metabolomics studies. Trends Anal Chem. 2026;198:118767.</li>
	<li>Bodzon-Kulakowska A, Suder P. Imaging mass spectrometry: Instrumentation, applications, and combination with other visualization techniques. Mass Spectrom Rev. 2016;35:147-69.</li>
	<li>Zhang H, et al. Single-cell mass spectrometry imaging: emerging advancements and future insights. Anal Chim Acta. 2026;1382:344825.</li>
	<li>Mondal S, et al. Mass Spectrometry Imaging of Lumpectomy Specimens Deciphers Diacylglycerols as Potent Biomarkers for the Diagnosis of Breast Cancer. Anal Chem. 2023;95:8054-62.</li>
	<li>Ajith A, et al. Mass Spectrometry Imaging Deciphers Dysregulated Lipid Metabolism in the Human Hippocampus Affected by Temporal Lobe Epilepsy. ACS Chem Neurosci. 2021;12:4187-94.</li>
	<li>Mondal S, et al. Mass Spectrometric Imaging of Anionic Phospholipids Desorbed from Human Hippocampal Sections: Discrimination between Temporal and Nontemporal Lobe Epilepsies. ACS Chem Neurosci. 2024;15:983-93.</li>
	<li>Banerjee S, et al. Early detection of unilateral ureteral obstruction by desorption electrospray ionization mass spectrometry. Sci Rep. 2019;9:11007.</li>
	<li>Wheeler K, et al. Frontiers in mass spectrometry-based spatial metabolomics: Current applications and challenges in the context of biomedical research. Trends Anal Chem. 2024;175:117713.</li>
	<li>Colwell N, et al. Achieving Single-Cell Resolution via Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry Imaging (DESI-MSI) on Different Platforms. Anal Chem. 2026;98:10629-38.</li>
	<li>Bergman H-M, Lanekoff I. Profiling and quantifying endogenous molecules in single cells using nano-DESI MS. Analyst. 2017;142:3639-47.</li>
	<li>Pan N, Yang Z, Rao W. Single-Cell MS and High-Spatial-Resolution MS Imaging Under Ambient Conditions Using a Novel Sampling Device. LCGC North Am. 2015;33:414-19.</li>
	<li>Cairns JL, et al. Mass-Guided Single-Cell MALDI Imaging of Low-Mass Metabolites Reveals Cellular Activation Markers. Adv Sci. 2025;12:2410506.</li>
	<li>Keller C, et al. Comparison of Vacuum MALDI and AP-MALDI Platforms for the Mass Spectrometry Imaging of Metabolites Involved in Salt Stress in Medicago truncatula. Front Plant Sci. 2018;9:1238.</li>
	<li>Krestensen KK, et al. Molecular Profiling of Glioblastoma Patient-Derived Single Cells Using Combined MALDI-MSI and MALDI-IHC. Anal Chem. 2025;97:3846-54.</li>
	<li>Zhu X, Xu T, Peng C, Wu S. Advances in MALDI Mass Spectrometry Imaging Single Cell and Tissues. Front Chem. 2022;9:782432.</li>
	<li>Solon EG, Schweitzer A, Stoeckli M, Prideaux B. Autoradiography, MALDI-MS, and SIMS-MS Imaging in Pharmaceutical Discovery and Development. AAPS J. 2009;12:11-26.</li>
	<li>Zhang H, Shi X, Lu H, Li L. Delineation of Subcellular Molecular Heterogeneity in Single Cells via Ultra-low Flow Rate Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry (u-DESI-MS). Anal Chem. 2025;97:9985-91.</li>
	<li>Marques C, et al. Global and Spatial Metabolomics of Individual Cells Using a Tapered Pneumatically Assisted nano-DESI Probe. J Am Soc Mass Spectrom. 2023;34:2518-24.</li>
	<li>Pan N, et al. The Single-Probe: A Miniaturized Multifunctional Device for Single Cell Mass Spectrometry Analysis. Anal Chem. 2014;86:9376-80.</li>
	<li>Zhu Y, Liu R, Yang Z. Redesigning the T-probe for Mass Spectrometry Analysis of Online Lysis of Non-adherent Single Cells. Anal Chim Acta. 2019;1084:53-59.</li>
	<li>Nguyen TD, et al. Single-Cell Mass Spectrometry Enables Insight into Heterogeneity in Infectious Disease. Anal Chem. 2022;94:10567-72.</li>
	<li>Sun M, Tian X, Yang Z. Microscale Mass Spectrometry Analysis of Extracellular Metabolites in Live Multicellular Tumor Spheroids. Anal Chem. 2017;89:9069-76.</li>
	<li>Rao W, Pan N, Yang Z. High Resolution Tissue Imaging Using the Single-probe Mass Spectrometry under Ambient Conditions. J Am Soc Mass Spectrom. 2015;26:986-93.</li>
	<li>Rao W, Pan N, Yang Z. Applications of the Single-probe: Mass Spectrometry Imaging and Single Cell Analysis under Ambient Conditions. J Vis Exp. 2016;(112):e53911.</li>
	<li>Cooks RG, Ouyang Z, Takats Z, Wiseman JM. Ambient Mass Spectrometry. Science. 2006;311:1566-70.</li>
	<li>Green FM, et al. The effect of electrospray solvent composition on desorption electrospray ionisation (DESI) efficiency and spatial resolution. Analyst. 2010;135:731-37.</li>
	<li>Eberlin LS, et al. Desorption electrospray ionization mass spectrometry for lipid characterization and biological tissue imaging. Biochim Biophys Acta. 2011;1811:946-60.</li>
	<li>Wu V, et al. High Resolution Ambient MS Imaging of Biological Samples by Desorption Electro-Flow Focussing Ionization. Anal Chem. 2022;94:10035-44.</li>
	<li>Towers MW, et al. Development of Low-Flow High-Resolution Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry Imaging. J Am Soc Mass Spectrom. 2026;37:152-62.</li>
	<li>Forbes TP, Brewer TM, Gillen G. Desorption Electro-Flow Focusing Ionization of Explosives and Narcotics for Ambient Pressure Mass Spectrometry. Analyst. 2013;138:5665-73.</li>
	<li>Hansen CFM, Dobrovolskis L, Janfelt C. Design and Implementation of a Desorption Electro-flow Focusing Sprayer on an Orbitrap Mass Spectrometer for DESI Mass Spectrometry Imaging at High Spatial Resolution and at High Speed. J Am Soc Mass Spectrom. 2025;36:473-82.</li>
	<li>Eliuk S, Makarov A. Evolution of Orbitrap Mass Spectrometry Instrumentation. Annu Rev Anal Chem. 2015;8:61-80.</li>
	<li>Perry RH, Cooks RG, Noll RJ. Orbitrap mass spectrometry: instrumentation, ion motion and applications. Mass Spectrom Rev. 2008;27:661-99.</li>
	<li>Zhang X-C, et al. Combination of Droplet Extraction and Pico-ESI-MS Allows the Identification of Metabolites from Single Cancer Cells. Anal Chem. 2018;90:9897-903.</li>
	<li>Lanekoff IT, et al. An Automated Platform for High-Resolution Tissue Imaging Using Nanospray Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry. Anal Chem. 2012;84:8351-56.</li>
	<li>Tian Y, Wei R, Meng Y, Zare RN. Comparison of Mass Spectrometry Imaging by Desorption Electrospray Ionization (DESI) and Desorption Electro-Flow Focusing Ionization (DEFFI). Metabolites. 2026;16:219.</li>
	<li>Chambers MC, et al. A cross-platform toolkit for mass spectrometry and proteomics. Nat Biotechnol. 2012;30:918-20.</li>
	<li>Race AM, Styles IB, Bunch J. Inclusive sharing of mass spectrometry imaging data requires a converter for all. J Proteomics. 2012;75:5111-12.</li>
	<li>Palmer A, et al. FDR-controlled metabolite annotation for high-resolution imaging mass spectrometry. Nat Methods. 2017;14:57-60.</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&minus;80 &deg;C freezer</td><td>Eppendorf New Brunswick</td><td>U700</td><td>Storage of biological samples before preparation.</td></tr><tr><td>6" vertical bracket for breadboards, 1/4"-20 holes (2 pieces)</td><td>Millipore Sigma</td><td>VB01A</td><td>Mechanical support and stabilization of the custom sprayer-mount assembly</td></tr><tr><td>Acetonitrile</td><td>Fisher Chemical</td><td>240744</td><td>Organic solvent for DESI-compatible solvent preparation and optimization</td></tr><tr><td>Ammonium formate</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>401152500</td><td>Preparation of isotonic ammonium formate wash buffer for cell washing prior to DESI&ndash;MSI</td></tr><tr><td>Brightfield microscope</td><td>Fisher Scientific</td><td>12575252</td><td>Optical imaging and visualization of adherent cells before DESI&ndash;MSI acquisition</td></tr><tr><td>C18 column</td><td>Waters</td><td>186009259</td><td>In-line backpressure generation for stable nano-flow DESI spray formation</td></tr><tr><td>Copper wire</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Electrical connection and grounding during sprayer-mount fabrication</td></tr><tr><td>DESI XS sprayer</td><td>Waters</td><td>700014033</td><td>Ambient DESI ionization source for single-cell DESI&ndash;MSI experiments</td></tr><tr><td>Epoxy resin</td><td>Devcon</td><td>20945</td><td>Mechanical stabilization and fixation of custom sprayer-mount components</td></tr><tr><td>FAIMS Pro electrode ion source housing adaptor</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>98100-20046</td><td>Modification and fabrication of the custom Orbitrap-compatible DESI interface</td></tr><tr><td>Formic acid</td><td>Ward&rsquo;s Science</td><td>470301-120</td><td>Acid modifier for DESI spray solvent preparation</td></tr><tr><td>Methanol</td><td>Fisher Chemical</td><td>A456-4 Optima</td><td>Organic solvent for DESI spray solvent preparation</td></tr><tr><td>Gas regulator</td><td>Millipore Sigma</td><td>23831-U</td><td>Regulation of nitrogen sheath-gas pressure during DESI operation</td></tr><tr><td>Gridded glass coverslip</td><td>Ibidi</td><td>10817</td><td>Cell culture substrate and positional reference for optical-to-MS image registration</td></tr><tr><td>Grounding wire</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Electrical grounding connection for DESI sprayer and interface assembly</td></tr><tr><td>Incubator</td><td>HeraCell</td><td>51026282</td><td>Maintenance of mammalian cell cultures under controlled temperature and CO2 conditions</td></tr><tr><td>LC/MS-grade water</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>W6500</td><td>Preparation of ammonium formate wash buffer and DESI spray solvent</td></tr><tr><td>METASPACE platform</td><td>METASPACE</td><td>https://metaspace2020.eu</td><td>Cloud-based MS image visualization and spatial metabolomics data analysis</td></tr><tr><td>Modified FAIMS interface</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>98100-20046</td><td>Customized interface for coupling the DESI sprayer with Orbitrap mass spectrometers</td></tr><tr><td>Motorized XYZ stage</td><td>Newport Corporation</td><td>CONEX-MFACC</td><td>Controlled raster-stage movement during DESI&ndash;MSI acquisition</td></tr><tr><td>MycoAlert PLUS mycoplasma detection kit</td><td>Lonza</td><td>LT07-703</td><td>Routine monitoring of mycoplasma contamination in cultured cells</td></tr><tr><td>Nano-liquid chromatography system</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>5200.0355</td><td>Nano-flow solvent delivery system for DESI spray generation</td></tr><tr><td>Optical breadboard</td><td>Thorlabs</td><td>MB1012</td><td>Mechanical support platform for DESI sprayer and modified interface assembly</td></tr><tr><td>Orbitrap Fusion Lumos mass spectrometer</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>UVPD</td><td>High-resolution Orbitrap mass spectrometer for DESI&ndash;MSI data acquisition</td></tr><tr><td>PEEK tubing</td><td>IDEX</td><td>1535</td><td>Solvent-line connection between nano-LC system and DESI sprayer</td></tr><tr><td>Penicillin&ndash;streptomycin</td><td>Gibco</td><td>15140-122</td><td>Antibiotic supplement for mammalian cell culture medium</td></tr><tr><td>Phosphate-buffered saline (PBS)</td><td>VWR</td><td>0780-50L</td><td>Washing solution for cultured cells during passaging</td></tr><tr><td>RPMI-1640 medium</td><td>Gibco</td><td>11875093</td><td>Mammalian cell culture medium for maintenance of OVCAR-8 cells</td></tr><tr><td>Stage-control software</td><td>Lasken Group</td><td>Version 6</td><td>Software control of raster scanning, stage movement, and imaging acquisition parameters</td></tr><tr><td>Stainless steel tubing</td><td>MicroGroup</td><td>316H16H</td><td>Custom-fabricated ion transfer tubing (1/16" OD, 0.033" ID) for Orbitrap interface integration</td></tr><tr><td>Syringe, 250 &micro;L</td><td>Hamilton</td><td>1725LTN250UL</td><td>Solvent loading and nano-flow solvent delivery</td></tr><tr><td>Synthetic fetal bovine serum (FBS)</td><td>HyClone</td><td>SH3006603</td><td>Serum supplement for preparation of complete mammalian cell culture medium</td></tr><tr><td>TC20 Automated Cell Counter</td><td>Bio-Rad Laboratories</td><td>1450102EDU</td><td>Automated counting of cultured cells before seeding on coverslips</td></tr><tr><td>Tissue culture dish, 100 mm</td><td>Fisher Scientific</td><td>FB012924</td><td>Expansion and maintenance of adherent OVCAR-8 cell cultures</td></tr><tr><td>Trypsin-EDTA</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>25200-072</td><td>Enzymatic detachment of adherent cells during passaging</td></tr><tr><td>UV-curing resin</td><td>Prime Dental</td><td>6.03</td><td>Fabrication and stabilization of custom DESI sprayer-mount components</td></tr><tr><td>Xcalibur software</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>4.7</td><td>Instrument control, Orbitrap method setup, and mass spectral data acquisition</td></tr></tbody></table>

הדמיית ספקטרומטריית מסה חד-תאית באמצעות יינון אלקטרוספריי בדסורפציה המשולבת לספקטרומטרי מסה של orbitrap

Single-Cell Mass Spectrometry Imaging Using Desorption Electrospray Ionization Coupled To Orbitrap Mass Spectrometers

הדמיית ספקטרומטריית מסה חד-תאית באמצעות יינון אלקטרוספריי בדסורפציה המשולבת לספקטרומטרי מסה של Orbitrap

Desorption electrospray ionization&#8211;mass spectrometry imaging (DESI&#8211;MSI) enables ambient, matrix-free molecular imaging with minimal sample ...

single-cell-mass-spectrometry-imaging-using-desorption-electrospray

Research

JoVE Journal

Chemistry

כימיה

Desorption electrospray יינון ספקטרומטריית מסה (דסי-MS) היא שיטה שבאמצעותו דגימות סביבה, כולל רקמות ביולוגיות, יכולות להיות צילמו עם הכנת מדגם מינימאלית. על ידי rastering המדגם מתחת לחללית היינון, טכניקה מבוססת ספריי זה מספקת רזולוציה מרחבית מספיק כדי להבחין במאפיינים מולקולריים של עניין בתוך סעיפי רקמות.

הדמיה של רקמות ביולוגיות על ידי Desorption electrospray יינון המוני ספקטרומטריית

ניתן לגדל שורות תאי סרטן הונצחו כתרביות תאי 3D, מודל רב-ערך למחקר ביולוגי. פרוטוקול זה מתאר הדמיה ספקטרומטר מסה של תרביות תאי 3D, כולל שיפורים בפלטפורמת הכנת מדגם. המטרה של פרוטוקול זה היא להנחות את המשתמשים כדי להכין תרביות תאי 3D לניתוח הדמיה ספקטרומטר מסה.

לדוגמא הכנת אסטרטגיות להדמית ספקטרומטריית המסה של מודלי תרבית תאי 3D

כאן, אנו מציגים פרוטוקולים לביצוע הדמיית ספקטרומטריית מסה סביבתית (MSI) של רקמות וניתוח MS של תא יחיד (SCMS) באתרו באמצעות בדיקה יחידה, שהיא מכשיר רב תכליתי ממוזער לניתוח טרשת נפוצה.

יישומים של-הבדיקה הבודדה: הדמיה ספקטרומטריית מסה וניתוח תא יחיד בתנאי הסביבה

מקור הדמיית ספקטרומטריית מסה (MSI) המופעל בלחץ אטמוספרי פותח על ידי צימוד ספיגת לייזר אינפרא אדום בינוני ופוסט-יינון אלקטרוספריי. מטריצת קרח אקסוגנית שימשה כמטריצה סופגת אנרגיה כדי להקל על ספיגה תהודה של חומר הקשור לרקמות. כתב יד זה מספק פרוטוקול שלב אחר שלב לביצוע IR-MALDESI MSI של עכבר יילוד בכל הגוף.

הדמיה של כל הגוף ספקטרומטריית מסה על ידי אינפרא אדום מטריקס בסיוע לייזר Desorption electrospray יינון (IR-MALDESI)

פרוטאום אפיון של מיטות microvascular עינית היא גורלית להבנה מעמיקה של פתולוגיות עינית רבים בבני אדם. מחקר זה מדגים שיטה יעילה, מהירה, חזקה עבור חילוץ חלבון, הכנת הדוגמא של כלי דם קטנים העסקת חזירי קצר האחורי ciliary העורקים ככלים מודל עבור פרוטאומיקס מסה ספקטרומטר מבוססת על ניתוח.

הכנת הדוגמא מסה ספקטרומטר מבוססת על ניתוח פרוטאומיקס של עינית Microvessels

פלטפורמת מניפולציה משולבת תא מפותחת לשימוש בשילוב עם התקנה בודדת המסה בדיקה מאסיבית עבור ניתוח מקוון של תאים ההשעיה בודדים תחת תנאי הסביבה.

משולב תאים מניפולציה פלטפורמה ביחד עם יחיד-בדיקה עבור ניתוח ספקטרומטר המסה של תרופות מטבוליטים בתאים ההשעיה יחיד

מאמר זה מציג שיטות הכנה לדוגמה עבור שיטה אנליטית ייחודית בזמן אמת המבוססת על ספקטרומטר מסה סביבתי. שיטה זו מאפשרת לנו לבצע ניתוח בזמן אמת של המולקולות הביולוגית בvivo ללא כל טיפול מיוחד.

הכנה לדוגמא לתרסיס אלקטרונון מהמוני ספקטרומטר מונמטריה

ספקטרומטריית ניידות יונים (IMS) היא השלמה מעניינת לספקטרומטריית מסה לאפיון ביומולקולות, בעיקר משום שהיא רגישה לאיזומריזם. פרוטוקול זה מתאר ניסוי IMS (IMS/IMS) דו-מושבי, המאפשר בידוד של מולקולה ויצירת פרופילי הניידות של שבריה.

שימוש בספקטרומטר ניידות יונים מחזורי לניסויי ניידות יון דו-מושבית

כאן אנו מתארים אפיון פרוטאומי מבוסס ספקטרומטריית מסות של שושלות תאים עם גורלות רקמות ידועים בעובר בעל חוליות Xenopus laevis .

ספקטרומטריית מסה מונחית שושלת תאים פרוטאומיקה בעובר המתפתח (צפרדע)

פרוטוקול זה מתאר את השימוש במיקרוMS לספקטרומטריית מסה MALDI-2 חד-תאית מונחית פלואורסצנטית, המאפשרת פרופיל מולקולרי משופר של תאי עצב ראשוניים של חולדות.

ספיגה/יינון לייזר בסיוע מטריצה פלואורסצנטית עם ספקטרומטריית מסה פוסטיוניזציה המושרה בלייזר של תאים עצביים בודדים של חולדה

פרוטוקול זה נועד לשמר מטבוליטים של תאים עבור ספקטרומטריית מסה של תא בודד (SCMS) על ידי שילוב של שטיפת תמיסת מלח נדיפה, מרווה חנקן נוזלי מהיר, ייבוש בהקפאה ואחסון של -8 מעלות צלזיוס. הוא מדגים כי כיבוי חנקן נוזלי חיוני לשמירה על פרופילי מטבוליטים, בעוד שיש למזער אחסון קר ממושך כדי למנוע שינויים מטבוליים.

הכנת מדגם למחקרי מטבולומיקה של ספקטרומטריית מסה של תא בודד: שטיפת תאים משולבת, מרווה, ייבוש ואחסון

University of Oklahoma.  פרוטוקול זה מתאר הדמיית ספקטרומטריית מסה חד-תאית של תאי OVCAR-8 באמצעות יינון אלקטרוספריי דספורפציה המחובר לספקטרומטרי מסה Orbitrap לניתוח מטבולומי ברזולוציה מרחבית גבוהה.

הדמיית ספקטרומטריית מסה חד-תאית באמצעות יינון אלקטרוספריי בדסורפציה המשולבת לספקטרומטרי מסה של Orbitrap

גלה סרטונים נוספים