Reti proteiche

Un singolo organismo può contenere migliaia di proteine differenti, e la maggior parte di queste proteine deve interagiscono con altre proteine per svolgere le loro funzioni. Molte proteine hanno partner leganti multipli, ciò risulta in una rete complessa di interazioni proteiche. Varie tecniche di laboratorio, tra cui la biochimica e metodi computazionali, aiutano gli scienziati a comprendere queste complesse reti proteiche.

Il tag di affinità è un metodo spesso usato per isolare una proteina da una qualsiasi altra molecola interagente. Un tag di affinità è un modello amminoacidico che è geneticamente aggiunto alla proteina di interesse. Questo tag può essere utilizzato per isolare la proteina bersaglio e per altre proteine ad essa associate.

Le proteine che interagiscono con la proteina marcata possono essere analizzate per determinare la loro identità e nuove interazioni;un metodo di analisi di queste interazioni proteiche sconosciute consiste nel suddividere le proteine in segmenti brevi e analizzarle con uno spettrometro di massa per determinare le sequenze amminoacidiche. Queste sequenze possono essere confrontate con le sequenze proteiche esistenti per identificare le proteine